3IPZA

Crystal structure of arabidopsis monothiol glutaredoxin atgrxcp
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
SALTPQLKDTLEKLVNSEKVVLFMKGTRDFPMCGFSNTVVQILKNLNVPFEDVNILENEMLRQGLKEYSNWPTFPQLYIGGEFFGGCDITLEAFKTGELQEEVEKAMCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Electron transport, oxidoreductase
source organism Arabidopsis thaliana
publication title Structure of Arabidopsis chloroplastic monothiol glutaredoxin AtGRXcp.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Monothiol glutaredoxin-S14, chloroplastic
total genus 35
structure length 109
sequence length 109
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ipzA01
3E3EA 1OAZA 1JFUA 3I9V2 4JR6A 2JZRA 2WJUA 2MMNA 3FR6A 1O81A 4JEDA 2C1YA 4H86A 3RPPA 4BWSA 2KP1A 2AB6A 2H1DA 2E7PA 5CRDA 2N5BA 3A2WA 1VRSD 1QGVA 3ME8A 4ZL7A 3LORA 3GA4A 5CRHA 3QOUA 1TTZA 1K0NA 4DSRA 5JCWA 4MH2A 3R2QA 2D2ZA 3QFBC 4CW9A 3IA1A 5CREA 2DJ0A 22GSA 2HT9A 3LWAA 5C00A 1ERTA 2RM6A 4PUFC 3KP8A 2F51A 2PERA 3F3QA 2OE3A 5DALB 2JZTA 12GSA 4WXTA 4DSSA 1EV9A 3O3TA 5F8BA 2VCZA 1SK1A 2X8HA 1USBA 2IN3A 2GQLA 4LL4B 4TRXA 1XFLA 2REMA 1YF1A 5DCHA 3D0ZA 4EO3A 3HD5A 2Z9SA 2XC2A 4EDZA 2JACA 2YNXA 3P90A 4PXOA 1B9YC 4ZXGA 3D22A 1RK4A 3D4MA 1DE2A 2KLXA 4KCEA 4RQRA 3GH6A 3MDKA 4OFNA 2VD1A 2FHEA 2R5GA 3Q6OA 3M0FA 1H75A 4ZL9A 3ED3A 1VF1A 2G2QA 4OCFA 1XOBA 2HSHA 3TRQA 3P8WA 3IBHA 1X9SB 5DVBA 3WYWA 1ZOFA 19GSA 2J9HA 4ZILA 3KTLA 4MJCA 1EV4A 2M72A 3GYKA 3H1NA 3D5JA 1E6BA 4HI7A 1Q4JA 3TKQA 3DD3A 5ID2A 3VLNA 4ZB6A 2ZUPA 3TRPA 3QCPA 1WOUA 1MD3A 4L5OA 4KGIA 4OD7A 4MMMA 3H8QA 2B1KA 1OC8A 2MMZA 2L5OA 3DKSA 3VI7A 2WZ9A 5DQSA 2L57A 4GQFA 4IGJA 1M7TA 4HU7A 3BCKA 5G31A 1GRXA 3N5OA 3TJBA 4MZWA 1G6YA 3GHAA 4XS4B 1FW1A 2DJKA 7GSSA 2GQKA 3MAKA 1T4ZA 5KN1A 5J5NA 2FNOA 1X5EA 3GMFA 1KNGA 5ECSA 4ML1A 3H79A 1UA5A 1NSWA 5J41A 1LJRA 3TJJA 4AF2A 2LKUA 3KTBA 3LEFA 2H30A 1HD2A 1QXHA 4G2EA 4YAVA 3HVVA 2V2GA 1RQMA 5AISA 2PMTA 3M3MA 2H6YA 2ZNMA 3GTUA 1CQGA 3EYTA 2PN8A 4JZQA 4OFMA 4WEYA 5GAND 4FYUA 4G9HA 2VUPA 4MH3A 1O8WA 3U5RE 4V1Ap 3M9KA 2O7KA 1EWXA 2IL3A 2HI7A 1THOA 4JBBA 1EGRA 3KP9A 4HJ2A 3IK9A 2C8UA 2IPAA 3DXBA 1PSQA 2YOIA 2GLRA 3TJGA 2NTOA 5INYA 2H0GA 2GVPA 3K8NA 4IELA 4ECCA 4KDXA 1TK5B 3C1SA 1F9MA 3OR5A 4KH7A 3C71A 3QDNA 4YAPA 2O8VB 4PQHA 3CBUA 4LLRA 1F3BA 4I8BA 3IDVA 2YWMA 5E4WA 1SJZA 4LMVA 4EVMA 1MD4A 3UARA 4QQ7A 4Q5NA 3TJFA 5IMAA 3F9UA 1MDJA 2FCHA 3HDCA 2WULA 11GSA 1IYHA 2O85A 4TR4A 2H8LA 4PURA 2V41A 4I2TA 3CXGA 4ZB9A 1A2LA 3LGCA 1NHOA 5AGYA 4GSTA 3HYPA 2CX4A 2MZCA 3MNGA 3LG6A 1G7OA 3FR9A 3WT1A 2WCIA 1SU9A 2H71A 1R5AA 1HNAA 3C1RA 3RAZA 4K8MA 3HZ8A 2A2RA 2H72A 1HYUA 4ZB8A 4F2IA 5DAKB 1UN2A 3ZZXA 4I6XA 3RHBA 1YDKA 1TDIA 1AQWA 4MJEA 2YCDA 1GLPA 2B5EA 3P2AA 6GSUA 4ECIA 2EIRA 5ECLB 4MPGA 3GL3A 8GSSA 3C73A 2LNSA 4BL7A 2C3NA 6GSXA 3ZMLA 1TK8B 1WMJA 4FH8A 3HY2A 5GZZB 4MF5A 4NV5A 3HJOA 2O89A 1K0BA 5D96A 5CAXA 2LSTA 1FB0A 3TRXA 5A5KA 5HQPA 4OWYA 1PQNA 1H4OA 1VF2A 1JZRA 3TDGA 1SD8A 2IJYA 4FIWA 5HFGA 1FG4A 1GTIA 1GUMA 3GURA 3UBKA 4GLTA 3TUEA 2OBIA 2IFQA 3CRTA 3I6AA 2DLXA 1JHBA 3HHVA 4NHZA 4X43A 3GL5A 3ME7A 1ZYEA 2IMFA 4YQVA 2OE0A 3TKSC 1RW1A 5B8BA 3V1WA 3KZQA 2C3QA 4NAXA 1GP1A 2GZPA 5IO0A 3LYKA 3LFLA 3FYGA 1X9WB 4GSNA 1PL1A 3IK7A 4POKA 4JRRA 1THXA 5DCGA 2WS2A 3F0IA 4N11A 1BAYA 3FK8A 1X0RA 3E9JB 4WF5A 1SENA 2CAQA 2NVLA 6GSSA 2CV4A 2DJ1A 2C0GA 4HUAA 2L6CA 3BOAA 3IOSA 1Z9HA 2VO4A 4MPFA 5GSTA 2H0IA 6GSVA 1X9MB 3O76A 3L9UA 1YZXA 2HZEB 1TXXA 2VLUA 3EU3A 3VWWA 4XS6A 3D21A 1K0DA 1TOFA 4I5QA 1SK0A 4KDYA 3F6DA 2K18A 4TN8A 4BPYA 5L71A 2JU5A 5IMZA 1M2AA 1BEDA 1GNEA 2GSQA 5IPGA 5LD0A 4X0XA 3RBTA 1GL8A 2VAFA 3GN3A 2C0EA 2ON7A 2C0DA 2YJ7A 3GKNA 6GSWA 1DE1A 5AN1A 1XWAA 1XOAA 3ZRDA 2H19A 4XTSA 1BQ7A 2GQMA 1EEMA 5D9WA 1OC9B 2LTKA 1ACVA 4K1FA 3ZYWA 1T7PB 5EL8A 4HQSA 3S9FA 1M99A 1SL1B 5C04A 1ABAA 1NW2A 4HQZA 4WR5A 1XCCA 3KJYA 3EURA 3GFKA 1JZWA 2P0GA 2F8AA 2R37A 3UEMA 2PGTA 5HR1A 3PGTA 3EINA 4NWYA 4L8EA 2YANA 4ZBDA 1BG5A 2YWNA 3IC4A 4IJIA 4MK3A 3L4NA 4NPBA 3GH9A 1ZYQB 1XWGA 2YV9A 2OA7A 2GGTA 4XS1A 4CDOA 3UAPA 1T8EB 5ECIB 4K6XA 1OYJA 2FWEA 2XBQA 4AJ7A 5G2ZA 5IOWA 1A0FA 4O5RA 2B6MA 2BTOT 3IPZA 4EXJA 4HZ2A 1K3YA 1SJ6A 3UBLA 3IAM2 4TW5A 1B4PA 1ERWA 3FEUA 2WRTA 5H5QA 1F2EA 4PQ1A 3A2XA 1CQHA 2F9SA 3WT2A 2VLTA 4NV2A 4J57E 1I5GA 1HNBA 1OKTA 5AIVA 4EDYA 4K0NA 4DSQA 4I97A 3I43A 3LJRA 1SL2B 4KW6A 18GSA 1EZKA 5IM9A 4MF6A 1WWJA 1ZGNA 3FZ9A 1U88A 4PX1A 4TOPA 2VCQA 2DSAA 1PX6A 2DC5A 5ECMB 2CAIA 4O7HA 2AAWA 2DJ3A 3M9JA 2F3MA 3D4TA 4KA0A 4K7IA 1WPIA 1G6WA 4FYCA 1GSQA 3GIXA 4ZL8A 2WFCA 4NXIA 3ZITA 2VCXA 2TRXA 1WE0A 3FKFA 2H01A 5IMFA 2VCTA 3F63A 4BA7A 1GULA 1XVQA 2JSYA 1O8XA 4RI7A 4MCUA 1YY7A 1PGTA 3GX0A 5IMVA 4HU9A 4E8EA 1HNCA 4OO5A 2VCVA 5D9TA 1VF4A 5HR0A 2QC7A 3Q19A 3EWLA 3P7XA 1Z6NA 3TCOA 3CTFA 3GUSA 1BX9A 1MEKA 3FHKA 2VM2A 1QMVA 4ZIJA 2I4AA 2VLVA 1DBYA 3F6FA 1R5PA 2DMMA 3HJPA 4ECBA 4EUYA 2V6OA 3AY8A 3G7JA 4IJ3A 2HRNA 1A0RP 3ERFA 1A24A 2VCWA 1TP9A 4P3YB 1K3OA 3NIVA 2X8GA 5LNKe 2TIRA 1TJDA 1X5CA 4XHMA 4KUNA 5LCZA 1GSFA 4K0GA 1FVJA 1J9BA 1FOVA 3DVWA 3F8UA 4RUVA 1ERVA 1PX7A 4KCAA 3VPQA 3VURA 4DSSB 2C4JA 2H6XA 4ZBAA 4JR4A 5JCUA 3QAVA 1M2BA 1XXUA 3A2VA 1N8JA 17GSA 3DWVA 3N9JA 3ZL5A 2NPBA 4EE0A 3EE2A 2L4CA 1GLQA 3KCMA 1XWBA 3IV4A 4BVXA 5D93A 4YQUA 1JLVA 1DSBA 1S3AA 1F3AA 3F4SA 5GSSA 4HDEA 3KH7A 4ISDA 5ECOB 3VWUA 1NHYA 2IMDA 2MBSA 4D73A 3GKKA 2CA8A 3LYPA 3U6VA 3HVXA 4I2UA 5FT3A 2DIYA 1DUGA 4DVCA 4ULXA 5JCGA 5ECRB 3HA9A 1B48A 4GXZA 2BMXA 2N5AA 4Q5QA 3ZFBA 2FWHA 2I3YA 1PD21 1G0TA 1A23A 1TI3A 2KOKA 5ECHB 1YQ1A 3ZLPA 5ID2B 4KB3A 1SK2A 3LQ7A 2NDOA 3QFAC 5G5FA 2CZ3A 4MA9A 1ILOA 1AXDA 3G7IA 2LRNA 3QMXA 1JZDA 4OCEA 2IWTA 2OJLA 1TU8A 3A5WA 2JADA 2GSTA 2YPMA 4V2LA 5EVOA 3TOTA 2CVKA 2HNLA 2FA4A 1XZOA 5IO2A 1WJKA 4FO5A 3US3A 2H74A 2AHEA 3EVIA 1K0CA 1XW6A 2LJRA 1J0FA 3ERGA 1XW9A 3D6IA 3WGXA 1W89A 3IRAA 1OKDA 3M1GA 2J23A 2YWIA 3APOA 4L5LA 4IKHA 4GCIA 2YP6A 3QR6A 1VGLA 5DJLA 1GWCA 4POMA 2NBSA 1O6JA 1FAAA 4HOJA 3A3TA 3GX8A 3KIJA 2LQOA 5COHA 4KSOA 4MZBA 3GTUB 4V2MA 3W8JA 4LL1B 4TKYA 4HJMA 4TR0A 2WGRA 5CRWA 2QGVA 2FA8A 1A8YA 1K0MA 1AW9A 4POLA 3FY7A 1ZL9A 3L9SA 5ELAA 3VWVA 1UVZA 4N0ZA 1EOGA 1TI1A 1TKDB 1GUKA 2X8CA 1V40A 3F3RA 1PL2A 4ILFA 4D73B 4MF7A 5D8IA 1E2YA 3RHCA 4K9ZA 1SYRA 6GSYA 1YF0A 2XPDA 2B3SA 2LRTA 3PH9A 5AIXA 20GSA 1U87A 2VIMA 2CX3A 1SKRB 3GKMA 5F05A 5A4WA 5CP1A 2A2SA 2K8SA 3QPMA 2DJ2A 2YJHA 1V58A 4OMVA 3PINA 3LXZA 2QKEA 2V6KA 1PKWA 1TU7A 3L78A 3BD2A 3APSA 4MP4A 2AYTA 3FRCA 2KHPA 4F0BA 1T4YA 1O73A 2XHFA 5A4VA 2HZFA 4J2FA 1PMTA 1ST9A 3IE3A 4EKZA 2RLIA 2C80A 4WBJA 5G1KA 2I81A 3CRUA 3ZMKA 1JZOA 1SKSB 3NOFA 4N30A 3UVHA 5F0GA 1B9XC 1U3IA 1J08A 3GNJA 2FY6A 2HLSA 1QK8A 3HKRA 3G9BA 3J7Yb 5J4UA 5B7CA 2PBJA 1O7UA 4QL9A 2B7KA 2JSZA 2E0QA 5ECPB 5DALA 2CQ9A 1OC3A 1GSSA 2R2JA 2H76A 4DEJA 2R3XA 1U6TA 3ZIVA 3MWHA 1GSUA 1S3CA 3QAGA 1GSEA 5B6MA 3MSZA 3GSSA 1A2MA 4TXVA 2LV3A 1V57A 5IQYA 3ERWA 4KDUA 3GSTA 4V2NA 2RUFA 4KE3A 4MABA 3JCML 1URMA 4N0VA 1ERUA 4V1Ag 5JWRB 2K8VA 2F8FA 3FW2A 2K6VA 3TGZA 2RIIA 5ECQB 5DBQA 1Q98A 2LQQA 2V32A 4RI6A 3CSIA 1ON4A 4YQMA 1UC7A 4XIHA 2BJXA 2IFQB 4POBA 2MMOA 2A4VA 1SJIA 2V1MA 4QL7A 1M9BA 4IP6A 2VL2A 4EF0A 4F82A 1F37A 1QUWA 2CVDA 4OFTA 4WF4A 1OE8A 2C0FA 2OBKA 4PNGA 1TW9A 1Z7PA 3EC3A 1V98A 4ZBBA 1IYIA 2E2GA 2GZYA 1OVNA 3EMXA 3GKXA 2MMAA 4ID0A 1OE7A 2OADA 3GRXA 3J7Yk 4KNDA 5J9BA 5A4UA 1AUCA 4WBRD 1V2AA 3WGEA 5DDLA 2ALBA 3DIEA 2PVOC 1U3AA 4XS4A 4IN0A 6GSTA 1FO5A 2VD0A 2CZ2A 1GTUA 4XRDA 1FHEA 4IS0A 3DYRA 1KTEA 1PA3A 1ZCPA 2VL2C 1MTCA 4IQ1A 1K0OA 2B7JA 4OO4A 3UL3A 1SYXA 2QSIA 3KXOA 1T1VA 4GQCA 2JZSA 3CMIA 4K7NA 5JWOB 1YEPA 5IPHA 3KMNA 1N2AA 2FD3A 3VWXA 3DGQA 2L59A 5IIZA 5HR3A 2M46A 4LMWA 2XBIA 2EC4A 2VM1A 1SKWB 4MLYA 3TKPA 1W4VA 3F4TA 4HS1A 1PRXA 1EP8A 2OE1A 5KEJA 2LRCA 3Q74A 2GT5A 1AQVA 2CT6A 4IQAA 1R4WA 4AGSA 4PGTA 2PWJA 3CYNA 1LU4A 2C3TA 2H70A 2DBCA 3TKSE 1C72A 14GSA 1KBNA 4XRAA 2LNTA 5J3RA 1TK0B 2MYGA 4PQIA 2DIZA 4HZ4A 4TVEA 3KEBA 5DJMA 2DJJA 1QFNA 3M8NA 5B6NA 3ZREA 2H1GA 4IW9A 2PU9C 3KM6A 3RPNA 2GSSA 13GSA 1XW5A 4J56E 2G0FA 3CTGA 1O85A 2HFDA 1K0AA 3UMAA 3F4RA 2LS5A 2RM5A 3DVXA 2WDUA 5G30A 2H1BA 3HZ4A 5ECKB 2GSRA 1Y6EA 5FHIA 3KD0A 3WGDA 5IMCA 4AJ6A 3Q18A 3ZFLA 3L0HA 5ENUA 4MDCA 3VPTA 2LUSA 4WETA 2HXKA 2FWGA 2I9HA 2ZCTA 2L5LA 1T00A 1YKCA 2HRFA 3APQA 2H0HA 3FZ4A 4K7OA 5DAKA 5H5SA 2H75A 1TRWA 3TB2A 1ML6A 4PUAA 2CVBA 4XCSA 3W6GA 1M0UA 2EIQA 2PUKC 4ACSA 4O32A 1EEJA 5D9VA 4YH2A 3UVTA 4G10A 2KUCA 3TJKA 1GSYA 3H93A 1Z6MA 2FUG2 2E2MA 5KN3A 4GTUA 4TR1A 3RDWA 2N5FA 2HE3A 3C8EA 4BVYA 2L6DA 3I69A 4IHUA 3NZNA 4Z7XA 5HFKA 2H6ZA 3H4KA 4F03A 3ZVJD 5GAPD 3BJ5A 4MJBA 1K3LA 1BJXA 2VL9A 3W8SA 2OKAA 1Y25A 3SWLA 3DEXA 3FZ5A 2P5RA 5J9CA 3L9VA 3ZVJA 5CYYA 1R7HA 4RQXA 2YV7A 1AQXA 4TXOA 4KAEA 5CRGA 2IMKA 1HQOA 1B4QA 16GSA 5FWGA 2B5YA 2AV4A 5EPFA 1S3DA 2ON5A 3KGKA 2O87A 2K9FA 3DRNA 1JLWA 2AJQB 2X64A 5B8AA 1LBKA 4Q5RA 2HYXA 1ZMAA 4L0WA 2IMIA 3UOMA 5IMDA 9GSSA 1PN9A 4F0CA 1XWKA 2FWFA 2KP2A 3UIWA 1M2DA 4NMUA 1G7EA 4JE1A 4WKWA 2DMLA 2P31A 5ABRA 5D9XA 4MZCA 2HSYA 1MDKA 3IR4A 4TR3A 4IP1A 3E0UA 1WIKA 2YN1A 3IHQA 2LJAA 2HZEA 1ZZYA 3EU4A 5DQYA 5F07A 1XPVA 4X1UA 3TKSA 1GTBA 1XIYA 5EY6A 4EL1A 3C7MA 3TOUA 3GV1A 4TR1B 4GF0A 1WRYA 1EP7A 3EMPA 2YWOA 1KEBA 4L0UA 2X99A 1PKZA 2LJKA 3LSZA 2WB9A 5ELGA 1GH2A 1EOHA 4F9ZA 4KSMA 3SBCA 1TRSA 1TRVA 2B5XA 1GNWA 2AUVA 4ECJA 2R6KA 2GT6A 1TRUA 3HVSA 1EGOA 5HR2A 3QD9A 5H5RA 1AIUA 5KN2A 1FB6A 2R4VA 1Z7RA 1XWCA 5G1LA 2PPTA 2RUEA 1OC9A 2MBTA 2I1UA 1V9WA 4GRFA 1AAZA 3HJMA 1B8XA 4CHSA 4FYBA 1BYEA 2H1AA 3VFIA 3VI5A 10GSA 1X5DA 3TKRA 4EC0A 4IBPA 2L4QA 2B1LA 2H66A 4TXOB 1I9DA 4G19A 2P5QA 3ZIJA 3HXSA 4AJ8A 1Z3EA 3FZAA 2GTUA 2VOCA 3UJ1A 1YKAA 4HEA2 1SL0B 1XBSA 3PR8A 2GZZA 5G5EA 1R26A 1GTAA 4NHWA 4JU5A 3BBYA 1FVKA 1F6MC 1SD9A 2M80A 5D73A 5KN0A 3ISOA 3VK9A 5ECNB 1YEXA 4E8HA 1YJ6A 1Z5YE 5CNWA 1XVWA 4PNFA 4ML6A 5CO3A 4K2DA 2IMEA 3DMLA 3QAWA 3IAS2 5F06A 2GS3A 1T3BA 4O92A 1A8LA 3LXTA 4GSSA 3CSHA 2VL3A 2OACA 2EIOA 3ZTLA 5IOXA 1NM3A 4KX4A 1AC1A 1A2JA 2XPEA 3O6TA 2IIYA 2YZUA 1MDIA 4IVFA 5E59A 3IXRA 1M9AA 2FLSA 4LA1A 4WR4A 2JL4A 2PVQA 3KMOA 2FGXA 1VF3A 3WD6A 3HCZA 1GSDA 2GDRA 3FR3A 4BWQA 3CSJA 3BCIA 3KH9A 1GUHA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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