3IPZA

Crystal structure of arabidopsis monothiol glutaredoxin atgrxcp
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
b'SALTPQLKDTLEKLVNSEKVVLFMKGTRDFPMCGFSNTVVQILKNLNVPFEDVNILENEMLRQGLKEYSNWPTFPQLYIGGEFFGGCDITLEAFKTGELQEEVEKAMCS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of Arabidopsis chloroplastic monothiol glutaredoxin AtGRXcp.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Monothiol glutaredoxin-S14, chloroplastic
source organism Arabidopsis thaliana
molecule tags Electron transport, oxidoreductase
total genus 35
structure length 109
sequence length 109
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ipzA01
3ME8A 3EMXA 3FR9A 3FZ9A 3RHCA 3TKSA 2VCXA 2DSAA 4XRDA 5DALB 3VWWA 2J9HA 3VK9A 1PX7A 5CAXA 1VF4A 2JZSA 3TGZA 1B4QA 1SKRB 3P2AA 4V2NA 1WP0A 4IQAA 5CYYA 2CVDA 1TXXA 4F0CA 1XOBA 5JCGA 2H0HA 3HD5A 1Z7PA 2N5FA 4POKA 3CMIA 1BG5A 1TP9A 1SL0B 2AHEA 4V1Ap 2OBIA 1EOGA 2C3TA 1FVKA 4O7HA 4PUAA 1XVWA 2KOKA 3P90A 6GSXA 1ON4A 1Z3EA 4D73A 5G2ZA 3EINA 5B8BA 3KMOA 2GSTA 1BQ7A 1SU9A 3GX8A 2OE3A 2RM5A 2VAFA 2LUSA 5DVBA 1F3BA 1YQ1A 4GRFA 2YV9A 3ZVJD 4BVXA 5ENUA 1M2DA 3KJYA 1PKZA 1R7HA 5G5FA 4EXJA 5IPGA 1F37A 5F07A 4EUYA 3UEMA 2CVKA 1RK4A 2YWMA 1QXHA 2DJJA 1V58A 2R37A 4MP4A 1XZOA 1T7PB 1FW1A 3EE2A 4HZ4A 4HOJA 1O85A 2YNXA 3IOSA 3BCKA 3D5JA 16GSA 2VCWA 3ZLPA 4HJMA 5KN1A 1U87A 6GSWA 1TU8A 2HZEB 3IDVA 5C00A 1J9BA 2XBQA 4KH7A 1U6TA 1BEDA 1T00A 4V1Ag 3TCOA 1OYJA 4WXTA 4IVFA 2GQKA 1O73A 4KSMA 5G5EA 1PL2A 4MF7A 2LSTA 2X8GA 2NBSA 5DQYA 4KCEA 5CRWA 1ZOFA 4HDEA 3GSTA 3WT1A 2OA7A 1AQVA 1TRSA 3DGQA 1HD2A 1GTUA 5AN1A 1JZWA 5DCHA 8GSSA 3ZRDA 5KEJA 4GLTA 4ZB9A 3HZ8A 2RM6A 1JFUA 4IW9A 3GMFA 4K7NA 3QCPA 4G2EA 4FYUA 4D73B 5FWGA 3MAKA 3ZIVA 3W8JA 3WT2A 3VLNA 2DIYA 3LQ7A 3HKRA 4WR5A 3F63A 3P8WA 4IN0A 1Z6NA 2L4CA 4EF0A 5D9XA 2K8SA 3HJMA 4BL7A 1FOVA 4KX4A 5EL8A 1FB6A 3IBHA 2X64A 2OJLA 1M0UA 2ES7A 4MH3A 2H19A 4JEDA 1YY7A 3CRTA 4ZXGA 4QL7A 2WS2A 1SYXA 1NW2A 4Q5QA 4P3YB 4OFTA 5B8AA 4OMVA 5ELGA 1TRUA 3ZL5A 3F3RA 1T4ZA 3HCZA 2JADA 5CP1A 4TXVA 3ED3A 1THXA 4G10A 4PQIA 1SJ6A 2R3XA 1H4OA 3MWHA 1K0AA 3KEBA 4PNFA 3NIVA 2H72A 3QAVA 3ZIJA 2YANA 5ECNB 1R5PA 5IMDA 2IFQB 4Q5FA 4RQRA 4TVEA 3J7Yb 2GZZA 1S3AA 1O81A 2VCVA 4ISDA 4PQ1A 2B6MA 2MBTA 1R5AA 2GZYA 2RUFA 2H75A 2C0EA 1EEMA 4MK3A 3MNGA 4NMUA 3GNJA 1HNBA 1Q98A 1PX6A 2B3SA 3G7YA 4ECIA 2HNLA 4N0ZA 4ECCA 3E3EA 2CAQA 2FWEA 2VM1A 3K8NA 3QR6A 4EKZA 3UBLA 2DJKA 4BA7A 2MYGA 5ECMB 1URMA 1TJDA 3F8UA 4Z7XA 2IWTA 4DSSB 2K6VA 2ZNMA 1SD8A 1O6JA 2QKEA 1B48A 1AIUA 4XCSA 3U5RE 1XBSA 4ZBAA 4MJEA 2HSHA 4LMWA 3L4NA 4N0VA 3FR6A 3FZ4A 2JZTA 4K1FA 1N2AA 2X8CA 3DWVA 1FAAA 3HDCA 3KGKA 1SK2A 3L9VA 4KA0A 3CRUA 2CQ9A 4N10A 3D0ZA 1PA3A 2IMDA 4JR6A 3TJFA 1K0BA 3WD6A 3A2XA 2K18A 3KH7A 3Q74A 1WE0A 2O89A 1ZYQB 4O92A 2B5XA 4AJ8A 1EGRA 2FWHA 3EC3A 4LL4B 3BD2A 3RBTA 1Q4JA 2VL2C 3IAM2 2FGXA 1GTIA 1Z6MA 3GTUB 3LGCA 4K6XA 4ZIJA 3FZ5A 4K0GA 4I97A 5HFKA 5D9VA 3APOA 2WFCA 3VPTA 2WDUA 4KDXA 5A5KA 4X1UA 3O76A 4GTUA 4HS1A 3JCML 2TRCP 3CXGA 1TI3A 5DALA 2HZFA 3Q19A 2F3MA 1JHBA 5IMCA 5DJMA 4AGSA 1R26A 3IK7A 4LA1A 2HE3A 1XWCA 4E8EA 2RUEA 3TRXA 3D21A 3CSJA 3PINA 4PQHA 2VL3A 1GTBA 1MD4A 2H73A 2VLVA 3VWUA 4MF5A 2VL2A 4ZILA 1QK8A 3SWLA 2MZCA 2ALBA 2GDRA 4IJIA 2C0GA 1TRVA 1MD3A 2CAIA 1SKWB 2GGTA 5EPFA 4GSTA 5LNKe 1GSDA 1FB0A 3GV1A 4TW5A 1PRXA 5H5SA 3EVIA 4TR0A 2P5QA 3I69A 5F0GA 3MDKA 4IS0A 3CSIA 4XRAA 4WR4A 5F06A 5DDLA 2PVQA 5KN2A 3BOAA 1YEPA 1O7UA 4EVMA 1TK5B 1EP8A 2AJQB 1QQ2A 2FWGA 3I6AA 3EWLA 1Y6EA 5HR2A 5DAKB 5DQSA 3ZVJA 3HVVA 2FUG2 5A4WA 1M99A 2O8VB 2DJ0A 3RPNA 3LXZA 2DMMA 1KBNA 3MSZA 3FR3A 5HFGA 2HZEA 2WGRA 1A23A 5AGYA 4PUFC 3GUSA 1DE2A 2LRTA 2KLXA 4POLA 4MH2A 5IMZA 3GH6A 1XWBA 2DMLA 1VF2A 2L5OA 4WEYA 5DBQA 2FCHA 2YZUA 3GFKA 4BWSA 2AB6A 4GSSA 2YCDA 2H6YA 3UIWA 2I3YA 3CYNA 3FW2A 4JE1A 2YV7A 1O8WA 1PD21 9GSSA 2CX3A 1SJIA 1SK0A 1VGLA 2RIIA 1KNGA 4TR1B 2MBSA 5IOWA 3KTLA 5GAND 5AIVA 3UL3A 3VWXA 2V2GA 2YJ7A 3VI5A 2QGVA 1J0FA 1A2JA 4POMA 2OBKA 4J2FA 1AC1A 1M7TA 2IMIA 2M46A 1OC8A 1S3DA 1A24A 5IPHA 4TOPA 1V40A 1WWJA 3TDGA 4G9HA 4GSNA 1GTAA 2OE0A 3LFLA 3M9JA 4KW6A 1QMVA 1JZDA 1XVQA 2L5LA 2YZHA 3VI7A 4TN8A 1GP1A 2LTKA 2H76A 1GUMA 3KTBA 5KN0A 1B8XA 2VD1A 1E2YA 2YWNA 2I4AA 1X5EA 1GNEA 4L5LA 4E8HA 5HQPA 2HRNA 4LLRA 1X5CA 1DBYA 3GH9A 2VCTA 1GL8A 1A8LA 2FHEA 2WB9A 4IQ1A 5DJLA 2IFQA 4OO5A 2KHPA 1FHEA 4IELA 4IKHA 5A4VA 1VF3A 2C80A 2HT9A 5D8IA 2R6KA 4X0XA 1Z5YE 2E2GA 1MDIA 3D22A 2FNOA 3A2VA 3GA4A 1YF1A 4OD7A 4AJ7A 2J23A 3GL5A 3ZMLA 3FHKA 4FIWA 2H8LA 3EU4A 4OFMA 4BVYA 4MABA 1QUWA 1O8XA 3I43A 2HYXA 5C04A 4V2LA 5IMAA 3DEXA 5D73A 1A2MA 2F8FA 4J56E 2AAWA 4N30A 1ZGNA 3SBCA 1G6YA 1AQXA 2HXKA 2LS5A 3CTFA 2VIMA 2VCZA 4QQ7A 4TR3A 5FT3A 2PGTA 4DSSA 4ZB6A 5D96A 1B9XC 4K7IA 1OAZA 3GKMA 5CO3A 1GULA 2CVBA 1T3BA 6GSUA 3EURA 2K8VA 2XPDA 1PN9A 1ZMAA 5CRGA 4MPFA 3ZZXA 4NWYA 3QAGA 4MLYA 2L59A 2VL9A 2LJKA 4BPYA 1K3LA 5AIXA 1QGVA 1A0RP 3LJRA 4DSQA 3IK9A 4NXIA 2MMNA 4NV5A 2PVOC 1QFNA 1ERTA 2JL4A 1N8JA 2QC7A 3C1RA 3GSSA 1ZZYA 4ZBBA 1JLWA 2LNSA 1BAYA 3AY8A 1CQGA 1A8YA 1Z7RA 4JR4A 2Z9SA 1XCCA 1F9MA 2REMA 1YDKA 1GSYA 1HNCA 3F4RA 2H01A 2XHFA 1M2AA 2M72A 3ZFLA 3RHBA 4GXZA 2NDOA 3VURA 3GTUA 3QPMA 3TJKA 5ECLB 4I6XA 3TJBA 1NSWA 4ACSA 4KUNA 3LXTA 2LEGA 1XWGA 3N5OA 2PPTA 4XIHA 4KDUA 2I81A 3Q6OA 3R2QA 1E6BA 3DXBA 2A2SA 2IL3A 2HLSA 2XPEA 2PN8A 2H6XA 2V6OA 2FLSA 3D4MA 4HI7A 3GX0A 1TTZA 3HA9A 1NHYA 3HJPA 1HQOA 1ZL9A 2ON7A 5L71A 4OWYA 1WOUA 3D6IA 4WETA 5EY6A 4YQMA 2IJYA 1NM3A 4JRRA 2YPMA 2F8AA 2LJRA 2YP6A 1R4WA 3HY2A 1YZXA 1USBA 3WGEA 5B6NA 3ME7A 3F4SA 1SYRA 4Q5NA 2VO4A 20GSA 5HR1A 4G19A 2YN1A 3ERWA 1M9BA 2VUPA 2R2JA 1GLPA 2JACA 3APSA 3O6TA 3IA1A 4HQSA 4XTSA 1U3IA 2LJAA 3ZYWA 6GSVA 4TKYA 4IGJA 1F6MC 4ILFA 4Q5RA 1NHOA 1SKSB 2OACA 4NPBA 1YJ6A 2DLXA 2AV4A 3ZFBA 3L9UA 3HJOA 3LWAA 2KP2A 4TXOB 2DIZA 4MJCA 2EIQA 1OVNA 1X5DA 3IAS2 3US3A 3FEUA 4I5QA 2GSRA 1XWAA 3F9UA 4JZQA 5DAKA 3KP9A 4WF4A 4MPGA 2LQQA 1OC3A 4DVCA 5ID2B 2MMOA 4HEA2 4HU9A 4KB3A 5ECOB 10GSA 3A2WA 4MF6A 3UVTA 3QDNA 4HUAA 1XW6A 2ON5A 3KMNA 3LSZA 3L0HA 4J57E 4HZ2A 2VM2A 3APQA 2DBCA 2H30A 4NAXA 4MZBA 3RPPA 2C1YA 1ERVA 1K3YA 4I8BA 2DJ3A 2B1KA 2IIYA 2XBIA 5KN3A 3IXRA 2V1MA 5G31A 1V57A 4K7OA 3TKPA 1AXDA 1WMJA 1WIKA 3E9JB 4CHSA 2VD0A 4F82A 5IQYA 1K0NA 5CRHA 3TJGA 2H6ZA 4TR1A 3TOUA 1V2AA 3KM6A 5GAPD 1TU7A 1OE8A 2A4VA 5J5NA 3NZNA 4OCEA 2G0FA 4WF5A 1LU4A 5B6MA 1GNWA 3F0IA 2GTUA 3U6VA 3IC4A 3PR8A 3A3TA 3I9V2 3C1SA 1SK1A 2TRXA 2KP1A 5ECKB 2YWOA 3HZ4A 1I5GA 3GL3A 4TRXA 3G7IA 2LV3A 4MJAA 5ABRA 4QL9A 4MJBA 1XOAA 3FZAA 3C7MA 3FRCA 2FD3A 1XIYA 3ISOA 2P31A 3RAZA 1GSUA 4MMMA 2NPBA 1MDKA 3G9BA 1G0TA 2OKAA 1X9WB 3LYPA 3TB2A 2H66A 3TKSC 5F8BA 3A5WA 2H1BA 1G7EA 4YQUA 3GRXA 2GZPA 4RI7A 2FA8A 1VF1A 2EIRA 2K9FA 3ZITA 2CA8A 4ZB8A 5HR3A 19GSA 3UJ1A 2IN3A 2I1UA 5LCZA 3IHQA 3HVSA 1BYEA 2CZ3A 1YF0A 4LL1B 1TOFA 1TKDB 4PNGA 5H5QA 2EC4A 1W89A 5IIZA 1F2EA 4ID0A 1GH2A 2R4VA 3GKNA 4X43A 2F9SA 4XS4B 2P0GA 2NTOA 1GRXA 3EYTA 3W6GA 3UVHA 2VCQA 5E4WA 2NVLA 5ECSA 4ECBA 1K0DA 2V32A 3HYPA 2WCIA 4CDOA 5JWOB 4JBBA 4DEJA 4POBA 2WJUA 1HNAA 4MCUA 5ECQB 6GSYA 4RI6A 4DSRA 5GSSA 1MDJA 1AW9A 2VOCA 5D9WA 2PWJA 2FA4A 1CQHA 3TKRA 5IO2A 1UVZA 4IP1A 4O32A 3IE3A 3M0FA 1DUGA 3WYWA 2VLTA 4O5RA 3ZTLA 3F4TA 5G30A 5IMVA 3ERGA 3DYRA 4IBPA 4YAPA 5J3RA 2H74A 18GSA 3LORA 4OO4A 1K0MA 1Z9HA 2BJXA 5ELAA 2HSYA 1GSSA 4F03A 1A0FA 1PGTA 3QFAC 3LYKA 4ML6A 1M9AA 5J9BA 3VFIA 1OC9B 2A2RA 1JLVA 4LMVA 3GURA 3WGXA 1J08A 4EO3A 1TK0B 1LJRA 1LBKA 2AYTA 1FG4A 5D93A 2VLUA 3VPQA 2L6CA 2FWFA 3TOTA 1XFLA 3TJJA 3BCIA 4EDYA 2BMXA 2GT5A 5ECIB 1TDIA 3HHVA 1PMTA 3N9JA 3ERFA 1GSQA 1U88A 3GIXA 3PH9A 3OR5A 4HQZA 2LNTA 2LRCA 3QAWA 3KZQA 3GHAA 1X9SB 2JU5A 4MZCA 4FYCA 4RQXA 1GWCA 1TRWA 5GZZB 3FYGA 2JSYA 1F3AA 1T8EB 4L8EA 1G7OA 2O7KA 5J4UA 3RDWA 3M8NA 2B7JA 5JWRB 2HFDA 3FK8A 4F2IA 4EC0A 3FKFA 2ZCTA 2O87A 4TR4A 1TW9A 2C0DA 1GSEA 2H71A 4GF0A 4ML1A 3QD9A 3G7JA 4I2UA 2GSSA 4OFNA 3GKXA 2GVPA 3ZREA 1SENA 5IM9A 3TKQA 11GSA 4WKWA 3UAPA 3O3TA 3W8SA 5HR0A 4F9ZA 4NHZA 2AUVA 4IJ3A 1UN2A 2QSIA 1W4VA 1OKDA 1V98A 1ABAA 2WULA 5F05A 4L0UA 1EV4A 2CX4A 5FHIA 2PMTA 1GUHA 1SD9A 2DJ1A 1FVJA 3GN3A 3GYKA 4N11A 1AUCA 3IRAA 3VWVA 1WRYA 4TXOA 4YAVA 1KTEA 1B4PA 4NV2A 2IPAA 1YKAA 3D4TA 12GSA 3M9KA 4WBRD 3DKSA 3KCMA 4HU7A 2GT6A 3KP8A 5INYA 1TI1A 4AJ6A 4YH2A 3UMAA 5ID2A 2LQOA 2DC5A 2PERA 2WZ9A 1XXUA 2GLRA 3H4KA 2M80A 2EIOA 3IR4A 2JZRA 3F6DA 4H86A 3C73A 1C72A 2CV4A 2B5YA 1K0OA 3IV4A 2C3QA 5CRDA 1YKCA 4K9ZA 1YEXA 3QMXA 3J7Yk 5IO0A 1ZCPA 1TK8B 4PXOA 1EOHA 4FO5A 4FH8A 1FO5A 2E7PA 2PBJA 4ECJA 4K2DA 3L9SA 4K0NA 1SJZA 1UA5A 1SL2B 4F0BA 1PQNA 3L78A 2TIRA 2GQMA 1UC7A 4KCAA 2GS3A 4JU5A 1H75A 17GSA 2E0QA 1X9MB 1K3OA 3FY7A 2H70A 4ULXA 5JWQB 3EU3A 5LD0A 3F6FA 1ZYEA 6GSSA 4PX1A 2KUCA 4KAEA 1T4YA 2N5BA 5HFIA 1OKTA 3CBUA 2JSZA 5EVOA 1XPVA 1HYUA 2YWIA 3H1NA 2IMKA 3H79A 1KEBA 1THOA 2OE1A 1ERUA 1DE1A 2FY6A 4RUVA 1T1VA 4EE0A 3CTGA 4XS1A 1WPIA 2V41A 1ST9A 2F51A 1EP7A 1X0RA 4L0WA 4EDZA 2CT6A 4NHWA 2I9HA 5ECHB 3DMLA 3P7XA 2L4QA 3S9FA 1EEJA 3Q18A 2ZUPA 4ZL9A 2R5GA 5JCWA 1EWXA 1AAZA 1EV9A 2RLIA 2YJHA 3HXSA 1PSQA 1RW1A 13GSA 3QOUA 5E59A 4CW9A 1BJXA 1IYHA 4PURA 2O85A 3M1GA 14GSA 3TKSE 1SL1B 4BWQA 2IMEA 3H8QA 2YOIA 3LEFA 3UOMA 5B7CA 3F3QA 1ACVA 1M2BA 1XWKA 3M3MA 2N5AA 2PUKC 3EMPA 3QFBC 5GSTA 3PGTA 4XS4A 1XW9A 1JZRA 4K8MA 5COHA 4IHUA 2X99A 3KIJA 2LRNA 3KXOA 3DRNA 4EL1A 3KD0A 5G1LA 1B9YC 5JCUA 2L57A 2B5EA 1WJKA 1MEKA 4ZBDA 4GWRA 4GQFA 2L6DA 5DCGA 5J41A 1XW5A 2B1LA 1ILOA 2H1AA 2H0IA 4WBJA 3WGDA 1RQMA 3TRQA 4MDCA 1PL1A 4GCIA 1GUKA 2XC2A 2MMAA 1EGOA 2H1GA 2GQLA 3C71A 1BX9A 2WRTA 1G6WA 2C3NA 4GQCA 2D2ZA 3H93A 1ML6A 4OCFA 6GSTA 1PKWA 3UARA 1ERWA 22GSA 1GLQA 5IOXA 5ECPB 2CZ2A 3DD3A 2BTOT 3DVXA 3DIEA 4ZL8A 3CSHA 2HRFA 2H0GA 1OC9A 2X8HA 3TUEA 1AQWA 4MZWA 2DJ2A 5CREA 1A2LA 3NOFA 2C0FA 4I2TA 1U3AA 1I9DA 2MMZA 3E0UA 4HJ2A 7GSSA 5AISA 4YQVA 4XS6A 3ZMKA 1V9WA 3C8EA 3DVWA 1VRSD 3IPZA 1EZKA 1IYIA 4KSOA 1S3CA 2B7KA 2G2QA 4XHMA 3BJ5A 2C4JA 2H1DA 5H5RA 3LG6A 1OE7A 2LKUA 2OADA 1MTCA 1DSBA 2IMFA 4KE3A 5ECRB 4FYBA 2V6KA 3BBYA 4ZL7A 4PGTA 4MA9A 1K0CA 4L5OA 3V1WA 4KGIA 1JZOA 3GKKA 4KNDA 5A4UA 5G1KA 3KH9A 2C8UA 4AF2A 1GSFA 1Y25A 5CNWA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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