4TR1A

Crystal structure of gsh-bound cgrx2/c15s
Total Genus 27
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
27
sequence length
92
structure length
91
Chain Sequence
b'MKNITIYTKNYCPYSKKAVSLLSSKGVDFKEVDVTHDSKAFEDVMAKTGWDTVPQVFVDEEFLGGDDIHALDRQGILDKKLGLKLEHHHHH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The GSH- and GSSG-bound structures of glutaredoxin from Clostridium oremlandii.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutaredoxin 3
source organism Alkaliphilus oremlandii
molecule tags Oxidoreductase
total genus 27
structure length 91
sequence length 92
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-06-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4tr1A00
3W8SA 1LJRA 4ILFA 2TIRA 4H86A 3HCZA 1SJIA 1TKDB 1WWJA 1LU4A 3L0HA 2C4JA 4OFTA 2GDRA 2JSZA 2JZSA 2B1KA 17GSA 3VWVA 3FR6A 1XOAA 4JRRA 1DE2A 1TP9A 1E2YA 5ECOB 5F05A 4NHWA 3A2VA 4KDUA 3APSA 4IS0A 2V6OA 3OR5A 2CX4A 1A2MA 1PRXA 3KM6A 1F3BA 1Q98A 3FHKA 5FHIA 1S3AA 4HU9A 3QAWA 1V9WA 1DBYA 2VCVA 4MPFA 4XIHA 3IBHA 3DGQA 4MZBA 3C8EA 5CP1A 3VWUA 4FIWA 3HXSA 4TKYA 3UEMA 2B6MA 1ZMAA 5INYA 5E4WA 3C1RA 1TI3A 2AB6A 5D9WA 3RPPA 4O92A 4D73A 2IMIA 3ISOA 1MDIA 4OO5A 3KTBA 3EC3A 2AAWA 1U88A 3FR9A 4TR1A 3ERFA 4F0CA 2PVOC 3MDKA 1VF1A 4IHUA 1XBSA 2VCWA 1G7OA 1PL1A 4ECBA 4HI7A 3C7MA 5IQYA 1M0UA 3UAPA 3VURA 4EC0A 4D73B 5IMDA 3GX0A 3U6VA 5LNKe 1K0MA 5G30A 2LS5A 4JR6A 2DLXA 3A3TA 1H4OA 2IJYA 1V98A 1OC3A 1SKSB 4TR1B 3FZ5A 5J9BA 1TK8B 4XRAA 3TOUA 2PMTA 1AAZA 3UOMA 4GSNA 1GSUA 4NPBA 1ZOFA 2PU9C 4OFMA 2LUSA 4NV5A 1JLVA 4KDYA 1IYIA 2K8VA 4ZBBA 1WJKA 2YPMA 2VL2C 1HNAA 1X0RA 4GLTA 2YOIA 1GSFA 4I2UA 1UN2A 2PPTA 1GTBA 1TRUA 2HLSA 5B7CA 2C3NA 3M9KA 3TDGA 3BCIA 4IJ3A 4X43A 4AJ8A 2IN3A 3UVTA 2ON7A 2LJAA 3F6DA 3QD9A 4XCSA 5JWOB 3GH9A 1PX7A 1CQGA 4KGIA 3Q74A 4DSQA 1A2LA 4EL1A 5AGYA 4XS4A 2HNLA 1V2AA 1U3IA 4N0ZA 2VD0A 4PXOA 2JZTA 1BYEA 3RHBA 1XWAA 3A5WA 3F0IA 5DQYA 2WFCA 2HRFA 3TRPA 1GTIA 3CXGA 1EP8A 1ST9A 5IM9A 1BG5A 1JZDA 2H71A 1ABAA 4XTSA 1BX9A 5HR2A 4Q5FA 3KH7A 4XS4B 4ZB6A 4MF6A 3HDCA 1XWKA 4I5QA 3ERWA 2XHFA 3UBLA 3C73A 3VFIA 4ZBDA 4XHMA 2AHEA 1U87A 3F63A 4PNFA 2LNTA 4G19A 1H75A 2KLXA 1K3OA 3HKRA 3QOUA 4HOJA 1OAZA 4ULXA 1WP0A 3NIVA 2HRNA 1T1VA 3D4TA 1O8XA 1R26A 3LEFA 2KOKA 1F6MC 1FW1A 4MP4A 3RDWA 2YWOA 4LL1B 4OCFA 4MMMA 2WGRA 2VAFA 3ZREA 2CVDA 1SL1B 19GSA 5D96A 4F0BA 4POMA 1T3BA 1MDKA 4WXTA 2VOCA 2DMMA 2P31A 2FA4A 4RI7A 4POKA 5CRDA 3EVIA 2WZ9A 3F8UA 1XW5A 4RQRA 1K0CA 3G9BA 3TJFA 3QCPA 2F8FA 5G5EA 5AISA 4JU5A 1G6YA 1TTZA 2DJ2A 3FKFA 1ZGNA 3ZVJD 2VLTA 5B6MA 1W4VA 5ECKB 3U5RE 1G6WA 1M7TA 4EO3A 1VGLA 2CX3A 2HZEA 1M9BA 3FZ4A 4RUVA 2V1MA 2R4VA 3L9SA 2MZCA 3BD2A 2DSAA 1PD21 3IPZA 3IRAA 4ECJA 4KW6A 2LSTA 4PUFC 4GTUA 4JE1A 4E8EA 1K0OA 3WGXA 2QKEA 2C0FA 5ENUA 1GSSA 3QAGA 2L59A 1G7EA 1XW6A 2HZEB 3KP9A 4ZIJA 5D93A 1FG4A 1THOA 3UARA 1THXA 6GSVA 4NHZA 3VK9A 2PGTA 1XWBA 2H19A 3D0ZA 2PVQA 1GTAA 1V58A 4KE3A 4HS1A 2XC2A 3EURA 2JACA 4ZL9A 2FCHA 3TUEA 1XIYA 4JZQA 3VPTA 1W89A 1O6JA 1ZCPA 5JWQB 1AW9A 1ERTA 1YY7A 1A23A 4EKZA 4KCAA 2GQLA 2XBQA 1EEJA 1Q4JA 2HI7A 3QAVA 3HJPA 4TXVA 1QMVA 1UVZA 4TR4A 4I8BA 1OE8A 4MJEA 5G2ZA 2O87A 4KAEA 3ZRDA 3M3MA 1B9YC 2C8UA 2VLUA 5CRGA 2H76A 2RM6A 2H6ZA 5DDLA 3WYWA 1TW9A 3P8WA 4GSSA 4OCEA 3GKMA 1X9SB 3ZZXA 1B8XA 1N8JA 2H8LA 3D21A 5HR0A 2OACA 2H73A 4WETA 3TKSC 5A4VA 1SL2B 1SJZA 5IMZA 3DVWA 1FOVA 2JADA 3F4TA 2LEGA 4ZILA 3MNGA 1A0RP 4AJ7A 3KP8A 2K9FA 1M2DA 3ZYWA 1S3CA 2GVPA 1FHEA 1OKDA 1GL8A 2L5LA 2F9SA 4K0NA 4K6XA 4F9ZA 2ZNMA 2H01A 2B1LA 3GYKA 3LFLA 3GSTA 4HZ2A 3KMNA 3F6FA 4NMUA 2XBIA 4YQUA 2Z9SA 2L5OA 4Q5NA 2OE3A 1G0TA 4OO4A 3ZIJA 5IMFA 3HJMA 2QSIA 1TU8A 5F8BA 1YDKA 1XOBA 4L8EA 4WR4A 1EEMA 1GSYA 1R7HA 3HHVA 2J23A 3EINA 3EMPA 4OMVA 4AJ6A 4PURA 3H8QA 1B4PA 4IBPA 2VM2A 1FVKA 2C80A 5ECMB 3GFKA 2P0GA 4V2LA 5J5NA 4LA1A 2O7KA 4HEA2 3WGDA 4G10A 2B5EA 4MH2A 3KGKA 2O8VB 4JR4A 3W6GA 3GKNA 4KX4A 2GQMA 4HUAA 1YJ6A 1WMJA 3GH6A 5HFGA 1NHYA 2G2QA 2DIYA 1QFNA 3QR6A 4IP1A 2MMOA 2QC7A 4PGTA 3D6IA 2XPDA 2DMLA 2MYGA 2C1YA 2WJUA 1F2EA 3IK9A 3ZMLA 2BTOT 1FVJA 1J9BA 4YQVA 2H1DA 1AQWA 1PMTA 4HU7A 4HJ2A 4BWSA 4NWYA 2DJ0A 3RAZA 5J3RA 1U6TA 1C72A 2GQKA 2M46A 3QDNA 3PR8A 5FT3A 3UIWA 5IO0A 1YKAA 1I5GA 4MDCA 4MJBA 4KNDA 1SD9A 3LJRA 2IFQA 1N2AA 3TKQA 4FYCA 2HSHA 5IPGA 4HZ4A 1K0NA 1Z5YE 4HJMA 4MABA 4K7IA 2IWTA 3CTGA 1GSEA 2CV4A 5JCWA 4IKHA 5IMAA 4I97A 1GUKA 1EGRA 4PQ1A 3ME7A 1XWCA 1ZYEA 1GUHA 3DYRA 4ISDA 2WB9A 3ZMKA 4ZB9A 3DWVA 2NPBA 4L5LA 4EDYA 4BWQA 1T8EB 8GSSA 2HSYA 3GRXA 1ERWA 3KCMA 3BOAA 1M99A 3CSJA 2ZCTA 1WRYA 3UVHA 2ZUPA 3G7YA 4OD7A 5GSSA 1LBKA 3HD5A 2EC4A 2GT6A 5EVOA 2WULA 1FAAA 4GRFA 2GSTA 3F4RA 1EOGA 1F37A 5F06A 3FR3A 3DEXA 1WIKA 1GWCA 4WKWA 2B5XA 1PGTA 1GSDA 9GSSA 3M9JA 1WPIA 2FUG2 5AIXA 3E9JB 1J08A 2C0EA 2X64A 2NTOA 4TRXA 3APOA 1B4QA 4X1UA 4P3YB 1SKRB 2WCIA 3IHQA 1A8YA 16GSA 3GV1A 3M8NA 3E0UA 2RLIA 4K9ZA 1X9WB 7GSSA 3N5OA 1Y6EA 4MPGA 1YQ1A 3FK8A 4POBA 4TXOA 4K7NA 4O32A 1ZZYA 2HFDA 5IOWA 1EGOA 3E3EA 3FEUA 1K3YA 2X99A 3I6AA 3RHCA 3O6TA 4NV2A 5A5KA 3WD6A 2FGXA 2CVKA 1VF3A 1OC8A 2AYTA 4J2FA 1NHOA 1TXXA 1A2JA 1GUMA 1HYUA 3CYNA 2H0GA 5DJMA 5H5QA 1GNWA 2GTUA 1S3DA 3TCOA 3Q6OA 1FB0A 4K1FA 2YJHA 3IXRA 2HE3A 4XS6A 2O85A 2VLVA 5B6NA 3LORA 2XPEA 5H5RA 4ACSA 2GZZA 1M9AA 1TOFA 2IIYA 3WT2A 2E2GA 1R5AA 2X8CA 5G31A 2H1BA 1BEDA 1NM3A 2YV7A 5IO2A 5LCZA 2VM1A 5ELAA 3L4NA 3GL3A 5A4UA 1T00A 1KBNA 1VF2A 4FH8A 1XZOA 1O7UA 3D4MA 2ES7A 2R2JA 3DD3A 4PX1A 4LL4B 3LYKA 5J9CA 3L9VA 1QUWA 5B8AA 1HD2A 2MBSA 1GP1A 4KUNA 3KJYA 2H74A 4DSRA 1MEKA 2A2RA 5KN3A 2N5AA 3LG6A 5A4WA 5KN2A 2TRXA 1GNEA 4O7HA 1TRWA 4F2IA 2L6CA 3CMIA 4K7OA 2OJLA 3TJJA 3GSSA 2L57A 1AQXA 1M2BA 1A8LA 3TJKA 2E2MA 4JBBA 2YZHA 4WF4A 5HR1A 1OVNA 2CA8A 5AIVA 1OC9A 5HFIA 2C3TA 1TK5B 2MMZA 4GXZA 2LRCA 4IW9A 3EU3A 4KDXA 2VCQA 2VIMA 1PA3A 3ERGA 1QQ2A 3G7JA 5DALA 4YAPA 2IMKA 5IIZA 2AV4A 1YEXA 4OWYA 4IGJA 5G1KA 1OE7A 3C71A 5AN1A 2A4VA 1T4ZA 2AUVA 2EIQA 2GSRA 3TRXA 4FO5A 6GSYA 2R3XA 3PH9A 5DALB 1R4WA 3RPNA 1X5EA 2TRCP 2VL2A 3L78A 2BJXA 4K0GA 1DUGA 3WGEA 1ERVA 3DIEA 2NDOA 2DC5A 3GURA 1HNCA 3TGZA 1T7PB 4ID0A 1JZWA 4IJIA 3MAKA 3P90A 3CBUA 1Y25A 1GSQA 3I9V2 1XWGA 1YF1A 4V2NA 5EY6A 2A2SA 18GSA 5D8IA 3US3A 4WBJA 1XVWA 1MD4A 4PNGA 4IQAA 1EWXA 3SWLA 3G7IA 3LXZA 3CRUA 1EZKA 2L4CA 1K0BA 3EU4A 2YV9A 2CZ3A 4KSOA 2VO4A 1SKWB 3W8JA 1E6BA 1X5DA 1B9XC 3FRCA 3ME8A 1GH2A 2YCDA 1EOHA 3NOFA 3IDVA 3M1GA 3F4SA 1AQVA 3QFBC 3HA9A 4EF0A 2OA7A 3ZFLA 2I9HA 1Z7RA 3R2QA 2M72A 4DSSA 2H0IA 2M80A 5HR3A 3KD0A 4Z7XA 3CRTA 3EWLA 13GSA 2HYXA 1YF0A 2WDUA 1AUCA 1K3LA 2JL4A 1M2AA 4KSMA 1PQNA 5ECRB 1V57A 3D22A 2CQ9A 3QFAC 3V1WA 1EP7A 3IR4A 5J41A 2YWIA 3GKXA 4DSSB 5DQSA 1VRSD 6GSXA 2F51A 2GS3A 3VWWA 3KMOA 1ACVA 3DMLA 1RK4A 3MWHA 5DBQA 1PKZA 1NSWA 3P7XA 4JEDA 2FHEA 2HZFA 4J56E 2NBSA 3GHAA 3APQA 2YN1A 4QL9A 5F07A 2OBIA 3EE2A 1B48A 4LMWA 2H30A 3SBCA 4MJCA 3TRQA 2VCTA 3FZ9A 4PQIA 5DCHA 2FLSA 2QGVA 5ECHB 4G2EA 2PERA 20GSA 5COHA 4KB3A 4TR3A 5D9XA 2YP6A 4BVXA 3IV4A 1XXUA 5D9VA 5EPFA 3O3TA 3LGCA 2GLRA 1U3AA 5GAND 3N9JA 2LJRA 1TRSA 1TRVA 4PQHA 2VUPA 3J7Yb 3ZITA 1VF4A 4EE0A 3GNJA 3M0FA 4ZBAA 2LRNA 5DVBA 1SD8A 3KH9A 2H1GA 1QGVA 4GF0A 5HFKA 1Z3EA 2R37A 2I1UA 2V32A 3IAM2 3D5JA 2H1AA 2IL3A 5DAKA 2JZRA 2VCZA 2PBJA 5DJLA 3TB2A 4XRDA 3ZLPA 4IVFA 4YAVA 5ELGA 2MMAA 1BQ7A 2VD1A 4ZL7A 1PKWA 3PGTA 3HVSA 2H66A 3KTLA 4V2MA 1SU9A 2IPAA 4TVEA 5KN1A 4CW9A 2GZPA 3FY7A 1FO5A 3I43A 5DAKB 2C0DA 1PSQA 2KP1A 1SK2A 5EL8A 2E0QA 3LQ7A 4E8HA 2DJJA 3HVVA 2O89A 2LV3A 2L4QA 2NVLA 5J4UA 5CREA 2GSSA 1WOUA 5C00A 1IYHA 2LNSA 4ML6A 3GMFA 3IOSA 3LXTA 4I2TA 4EVMA 1OKTA 2IFQB 2MBTA 3I69A 4L0UA 1CQHA 4POLA 4MZCA 4WBRD 2K6VA 2CVBA 3GTUA 4YH2A 3CSIA 3GKKA 4L0WA 1QXHA 4ML1A 5DCGA 2PWJA 3HZ8A 4MZWA 3DVXA 3FYGA 1SL0B 2E7PA 3GA4A 4QL7A 2J9HA 3LYPA 4HQZA 3EMXA 4RQXA 1Z7PA 2F3MA 3VWXA 4K2DA 1XFLA 1QK8A 2OE1A 3H93A 2VL3A 4GWRA 3DKSA 2FWGA 1X5CA 2IMEA 4LMVA 3GTUB 3TKSA 1UA5A 1MD3A 5ECPB 2PN8A 2H70A 4ECIA 4V1Ag 3A2WA 2R6KA 1SK0A 3HZ4A 3A2XA 1ERUA 1GULA 2RUEA 5JWRB 3UBKA 5CYYA 1RQMA 4IN0A 1URMA 2I4AA 3TOTA 2JU5A 4EXJA 1JLWA 1JZOA 3LSZA 1KTEA 2LRTA 4TN8A 3H79A 2FY6A 3UMAA 2H72A 2CAIA 4CDOA 2F8AA 3TJGA 2R5GA 5LD0A 4DVCA 4PUAA 3FZAA 4Q5QA 3KXOA 3Q19A 1J0FA 1O85A 4EUYA 5ECIB 3TKSE 3DXBA 2GSQA 6GSSA 1SJ6A 4NAXA 2V6KA 3P2AA 1TK0B 1EV9A 1KEBA 1DE1A 3IE3A 3HY2A 2GGTA 5JCGA 2B7KA 2K18A 3CTFA 3S9FA 2DJKA 1YEPA 2L6DA 3KZQA 4HDEA 3C1SA 1TU7A 4NXIA 4MF7A 1GTUA 4KCEA 4TXOB 2I81A 1O73A 4ZL8A 3BJ5A 1K0AA 2YWNA 4N30A 1AC1A 1K0DA 4DEJA 4TR0A 1A0FA 1ML6A 2HT9A 2ON5A 2WRTA 4N10A 3KIJA 4K8MA 3WT1A 5L71A 4N11A 4XS1A 5CNWA 3GUSA 2G0FA 5GAPD 2X8GA 2REMA 1HNBA 5ABRA 2OBKA 2GT5A 2RIIA 3LWAA 2V2GA 5IMVA 4BVYA 1NW2A 5ECQB 1V40A 2C0GA 1SENA 2N5FA 2V41A 4MK3A 2DIZA 3BBYA 1YZXA 2FA8A 3Q18A 3ED3A 11GSA 3ZL5A 2IMFA 3IC4A 3H4KA 6GSWA 4F03A 4F82A 2LQQA 4WEYA 5KN0A 5CRHA 5ECNB 2YNXA 3K8NA 3L9UA 3F3RA 4HQSA 1BAYA 3KEBA 2H6YA 5IMCA 4IQ1A 4ZXGA 2LQOA 1OYJA 3VI5A 4FYBA 2RUFA 1MTCA 4RI6A 3QPMA 2HXKA 2CZ2A 1HQOA 2P5QA 5D73A 1XW9A 1WE0A 2YZUA 2VL9A 5ECSA 2B5YA 4MLYA 4LLRA 1R5PA 1AIUA 1Z6NA 2D2ZA 4MJAA 3GN3A 2OADA 3TKRA 1F3AA 2WS2A 6GSUA 4EDZA 1USBA 1TJDA 1PL2A 5IOXA 5F0GA 4ZB8A 4AF2A 2H75A 5JCUA 2K8SA 2RM5A 1RW1A 4AGSA 1OC9B 5B8BA 3IK7A 2FWEA 3VLNA 3HJOA 2EIOA 3HVXA 3MSZA 2P5RA 2YANA 2H6XA 2YJ7A 4X0XA 1GRXA 1O8WA 1XPVA 5FWGA 3CSHA 4GSTA 2CAQA 2B7JA 2N5BA 3GX8A 2DBCA 2MMNA 2FD3A 4TOPA 1F9MA 1SYXA 1EV4A 1SYRA 3O76A 3NZNA 5ID2A 3AY8A 1UC7A 1GLPA 1Z6MA 2IMDA 2ALBA 2KP2A 2PUKC 3HYPA 3ZVJA 3J7Yk 1X9MB 4Q5RA 3JCML 2YWMA 2OE0A 1JHBA 4QQ7A 1JZRA 4MCUA 2VCXA 5G1LA 1Z9HA 2OKAA 2DJ3A 4WF5A 3PINA 1ZYQB 3ZFBA 5GZZB 5KEJA 2KHPA 4O5RA 3FW2A 3TJBA 4IP6A 1I9DA 2GZYA 1PX6A 2B3SA 4I6XA 2FWHA 2AJQB 4GQCA 2LTKA 4BA7A 4GQFA 5ID2B 1BJXA 1AXDA 3TKPA 4MH3A 4G9HA 2EIRA 2H0HA 4BPYA 4KH7A 3ZIVA 1SK1A 3ZTLA 2FNOA 3F3QA 3DRNA 5CAXA 2KUCA 22GSA 2CT6A 1DSBA 6GSTA 10GSA 1O81A 4V1Ap 3EYTA 2LKUA 4J57E 3QMXA 5E59A 4OFNA 4FYUA 3IA1A 5D9TA 3VPQA 1FB6A 4YQMA 5H5SA 2LJKA 3H1NA 5HQPA 3GL5A 1PN9A 5G5FA 2I3YA 1A24A 1ILOA 3RBTA 2C3QA 5ECLB 4CHSA 4IELA 4TW5A 1YKCA 4L5OA 3F9UA 1XCCA 4N0VA 1GLQA 5CRWA 5IPHA 4ECCA 4MF5A 1ON4A 3VI7A 5CO3A 2JSYA 2X8HA 1JFUA 5GSTA 4BL7A 1TI1A 1TDIA 3BCKA 5C04A 3UJ1A 14GSA 4MA9A 12GSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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