5ABR | Genus

Total Genus 29

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	29
sequence length	104
structure length	104
Chain Sequence	b'PEFHIFICAQNRPAGHPRGSCGAKGAEGVYNAFAQVLIQKNLTNRIALTTTGCLGPCQAGANVLIYPGAVMYSWVEPADAAIIVEQHLLGGEPYADKLTPAEIW'

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure of Fesi Protein from Azotobacter Vinelandii rcsb
molecule keywords	FERREDOXIN, 2FE-2S
source organism	Azotobacter vinelandii
molecule tags	Electron transport
total genus	29
structure length	104
sequence length	104
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2015-08-07

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	5abrA00

1KBNA 4KB3A 5L71A 4PURA 4WBRD 2GZPA 3KTBA 1PX7A 3DYRA 2ON5A 1S3DA 1TK0B 4DEJA 2XBIA 2FCHA 4DSSA 1GUMA 2QC7A 4NWYA 2ON7A 1K0OA 2JSYA 4ZBAA 2FA4A 2I1UA 2REMA 3GHAA 4HZ4A 1YKAA 2F51A 3RBTA 1K3LA 3CTGA 4F0BA 2L59A 1OYJA 1F3AA 3AY8A 3IXRA 2H0GA 3P8WA 3HZ8A 1AC1A 3O6TA 1YEXA 4MF6A 2YN1A 2TIRA 1DE2A 5IO2A 4I2UA 1FOVA 2VL3A 3UEMA 2DJJA 2VM1A 3APOA 2PMTA 1EOHA 4WF5A 3GV1A 2R3XA 3F6DA 3FEUA 1O73A 3F8UA 4IS0A 2PUKC 5HR3A 1YF1A 4F0CA 1M9AA 2H1BA 3TJJA 3L9SA 4GWRA 1WMJA 4J2FA 5EPFA 5G2ZA 1BJXA 2EC4A 2V2GA 4HQSA 2R2JA 5IPGA 1M2DA 4GQCA 3KGKA 1YDKA 3ZLPA 3WYWA 2E0QA 4ML6A 1AAZA 4OCEA 2H1GA 11GSA 4IELA 5ID2A 4L5OA 4TXVA 4F82A 2GQMA 5IMCA 3IR4A 3APQA 2B7KA 5HR2A 5H5RA 1WRYA 1FHEA 3W8JA 4CDOA 4PGTA 5DQYA 4XRAA 2FA8A 3ZZXA 1PKZA 3NOFA 2OADA 2CT6A 2OJLA 5G31A 1FW1A 1YJ6A 5HFKA 1ML6A 5HFIA 4HZ2A 5DBQA 1ZZYA 4IW9A 5JWQB 3K8NA 2N5AA 2R37A 3CBUA 5IMDA 4OFNA 4GF0A 1GULA 1VRSD 3HKRA 3IBHA 4IBPA 4ECJA 4EL1A 2FHEA 3FR3A 1MD3A 3F3QA 2C8UA 1GTIA 3KEBA 1PL1A 4NMUA 1MEKA 1XWBA 3TRPA 3TUEA 4CW9A 2IN3A 1XIYA 4RUVA 3GKNA 4QL9A 1XBSA 1GSDA 4ISDA 4POLA 3IC4A 3H93A 2H1DA 1GTAA 3DD3A 1ST9A 1E2YA 3VI5A 4J57E 1ZYEA 14GSA 1A24A 1RQMA 1W4VA 3ZMKA 4O32A 6GSTA 5G5EA 1XZOA 1E6BA 4I2TA 1AIUA 3QOUA 3WGEA 1S3AA 2B5XA 3E9JB 2MMNA 3KIJA 2YWNA 2DJ3A 5GSTA 5ECSA 3QFBC 2DJ0A 22GSA 2IL3A 2L5LA 3DMLA 1O8XA 2CVKA 4TKYA 4IJIA 2GSSA 1SU9A 19GSA 5GZZB 3KJYA 1O81A 2DIYA 2GSQA 2DMMA 5DDLA 4K6XA 1SL1B 3UBLA 5ECNB 3GFKA 2R6KA 4V2LA 4IGJA 1TU8A 5D9WA 1TRUA 3GRXA 1PX6A 1XWKA 3M8NA 4RI7A 5AIVA 10GSA 4TXOA 4MH2A 5GAPD 1BG5A 5D9XA 1I9DA 3FZ4A 3H1NA 1TRSA 4DVCA 5J4UA 1TI1A 1USBA 5HR1A 1YY7A 1TTZA 3QMXA 3TJFA 1XW5A 3GSTA 2LNSA 3DGQA 2LQOA 4TR3A 1OKDA 3ZMLA 2H76A 5FHIA 5IIZA 3RPNA 1N2AA 4XHMA 3HDCA 1B9YC 2P0GA 2PBJA 4MJAA 1URMA 2BMXA 2CAQA 2IFQB 4JU5A 1SD9A 2HI7A 2GZZA 4WXTA 1XVQA 4GTUA 4V1Ap 5KN1A 1G6WA 4N0ZA 1J9BA 1J08A 1F2EA 1U87A 3IA1A 3BBYA 4MJCA 5J9BA 5B6NA 3F63A 3C8EA 2JACA 1SL0B 3KMNA 3M9JA 3W6GA 3ZVJD 2LRCA 1R5AA 3D5JA 5KN0A 1GSYA 1T4ZA 3DEXA 2MBSA 2GZYA 1SKSB 3Q19A 3TKSE 3UVHA 5A4UA 4RQRA 12GSA 3DIEA 4I5QA 4MF7A 1YZXA 1PKWA 1B8XA 1OC9A 3FHKA 5DQSA 3HVXA 5C00A 3L9UA 2YJ7A 1V57A 3LXTA 1PSQA 4X43A 1XOBA 3LFLA 2IMEA 4L0WA 1EWXA 2L6DA 1HNCA 2CA8A 2HSHA 2NTOA 2PERA 4K0GA 2VIMA 4IQ1A 1K0AA 6GSSA 5KN2A 4BWQA 3ZRDA 3GTUA 3RHCA 1U6TA 2XPDA 5E4WA 4IKHA 4XS6A 3TOTA 2H8LA 2MZCA 2PVQA 4MMMA 2AV4A 3GL5A 2KUCA 3SBCA 4G2EA 2VCWA 2MMZA 1T1VA 3LWAA 4O92A 3QAVA 4WR4A 4ZL7A 5DAKA 1T3BA 2CZ3A 2GDRA 2CZ2A 1F9MA 2YANA 1LBKA 4IQAA 3GH6A 4KGIA 3DKSA 1H4OA 1UC7A 4Q5FA 4TN8A 3C73A 3KH7A 3HXSA 3Q6OA 1TI3A 3GX0A 2H6ZA 4EF0A 4EDZA 2DJ1A 3F9UA 4LLRA 4HJ2A 1DE1A 4NV2A 5IOWA 3IV4A 3KP9A 4ZL9A 1GNEA 3L9VA 4IP1A 4IVFA 3HHVA 4MF5A 4WEYA 3EINA 5ECRB 1M2BA 1WPIA 3GIXA 5J3RA 3EC3A 3TRXA 2VCQA 5AGYA 2VOCA 4LMVA 3IRAA 4AF2A 3BJ5A 2DJKA 1O6JA 3S9FA 1AW9A 4KAEA 1X5CA 1Z6NA 2L4CA 3TKQA 3LG6A 2VLTA 2LTKA 3ZYWA 1OC9B 5CRDA 2YV9A 4K9ZA 4X1UA 5ABRA 4K0NA 2WCIA 3FR9A 2WDUA 1JHBA 1ZOFA 3P90A 5CO3A 2DC5A 1DSBA 1GLPA 2VL2C 2V41A 3F4TA 4KE3A 3ED3A 1V2AA 4LA1A 1EEJA 1TK8B 3MAKA 1FVJA 3OR5A 2YCDA 2YPMA 2JZSA 1I5GA 2K8VA 2OBKA 3P7XA 5ECIB 1X5DA 2B5EA 5A5KA 1GP1A 1B48A 5D9VA 4AJ6A 3IDVA 3QFAC 1U88A 1M7TA 2B3SA 4QQ7A 4TW5A 4G9HA 3GUSA 1ERTA 4GLTA 1JZDA 4V2NA 3A3TA 5ELAA 2V32A 3KZQA 4IP6A 3G7IA 1WJKA 2I81A 2C3QA 2C3NA 1Z7PA 1TRVA 3GA4A 3CMIA 3M3MA 4LMWA 3D4MA 3TKPA 2LJRA 4F03A 2HE3A 2ZNMA 1K3OA 1XWCA 4YQVA 3F3RA 3GURA 5CNWA 3N5OA 2L6CA 1JZWA 3SWLA 1YEPA 4GSNA 4HOJA 1A2JA 5AISA 3QAGA 5CREA 1EP7A 3KMOA 4ZILA 1GSUA 4YAPA 5GAND 5DJMA 1EGRA 2GSTA 3VWVA 4O5RA 4F9ZA 4KDXA 4OO5A 5ECHB 1BEDA 3VURA 4F2IA 3F6FA 1X5EA 5ELGA 3IPZA 5B7CA 3HZ4A 2XC2A 1K3YA 1ZCPA 3UAPA 4BPYA 2C0EA 2H70A 6GSXA 2FWFA 4IN0A 1V9WA 3UBKA 2EIQA 3ZIJA 4LL4B 2RM5A 2LQQA 2HLSA 2FUG2 2X99A 3WT2A 1CQGA 4V1Ag 3US3A 1F6MC 2FWEA 9GSSA 2H01A 1TP9A 1PN9A 3FY7A 4K1FA 3TRQA 3F4RA 1YKCA 3E3EA 2H71A 1H75A 3CSHA 2P31A 2IMKA 2H75A 4XRDA 4HU7A 2CVBA 3IK7A 4TR4A 5HFGA 1OKTA 2F9SA 3FZ5A 2GT6A 3ZITA 2QKEA 4I97A 2B1KA 4DSSB 1J0FA 1VGLA 3VPQA 1JLWA 2A2SA 3EE2A 3ZTLA 1QUWA 1X9WB 2O7KA 5CRWA 1X9MB 4EDYA 1PRXA 2VCZA 4PUFC 3FYGA 2WB9A 4MP4A 3MNGA 4XS4A 1F37A 2VLUA 2J23A 1WE0A 5J5NA 7GSSA 4FIWA 4WBJA 3GKMA 2XHFA 5A4WA 3ME7A 3LYKA 1RK4A 2JZRA 1Q98A 4PXOA 4Z7XA 4POMA 2LNTA 2A2RA 1V98A 1PQNA 5CRGA 2BJXA 2OBIA 1NHOA 3PGTA 5H5SA 1QXHA 1O85A 5JCGA 3ERGA 2H0IA 5ECLB 4MH3A 4G19A 2GS3A 1PMTA 2HRNA 13GSA 4GQFA 1ERWA 1M2AA 4ZIJA 1ILOA 5AIXA 5J9CA 3RDWA 4NAXA 3DVXA 4YH2A 1XWAA 2CAIA 2B5YA 1Z6MA 3FW2A 1UA5A 2O8VB 5IMZA 4K7IA 3KXOA 1W89A 2X8HA 3BD2A 1JZOA 5ID2B 1EV9A 4ML1A 1T4YA 1GTBA 4OFMA 2AYTA 2KP2A 1SJ6A 5IO0A 2J9HA 2LS5A 5H5QA 1R4WA 4ZB9A 3DVWA 2ZCTA 5LD0A 4J56E 5G5FA 2O87A 3RAZA 2WJUA 3E0UA 3CSJA 1GH2A 4ZBBA 1Y25A 1A8YA 2NVLA 2CVDA 3TKSC 5DCHA 2M80A 2BTOT 2R4VA 3EU4A 2K18A 1THOA 4G10A 1QMVA 16GSA 1SKRB 2YP6A 2HSYA 5F05A 1SK2A 5FT3A 4AJ7A 1GNWA 1Y6EA 3L0HA 4ZB6A 8GSSA 5IOXA 4OD7A 2F8AA 5HQPA 1FB6A 1VF3A 2H6XA 1IYHA 4X0XA 1QFNA 1GSSA 4ECIA 2R5GA 2HFDA 2YZHA 1SKWB 4KW6A 1AQWA 2DBCA 1TDIA 2VL9A 1TW9A 3QAWA 2OA7A 3LYPA 1ABAA 2LSTA 1Z5YE 2IPAA 1JZRA 2NDOA 1A23A 2OE1A 1PGTA 1T8EB 3GKXA 3FKFA 4MLYA 4LL1B 2FGXA 4IJ3A 18GSA 1A8LA 1GSEA 2OKAA 3ZFLA 1HNAA 4ID0A 1VF4A 4KUNA 3EURA 3ZIVA 3TOUA 2P5QA 4KH7A 4KDYA 1K0NA 3PH9A 3IAS2 1G6YA 1M99A 1U3IA 4KSMA 3H8QA 3TJBA 4AGSA 1TU7A 2LEGA 5IM9A 4NHZA 3DWVA 4K8MA 2LV3A 3KTLA 3F0IA 2CX3A 4L8EA 2IJYA 2ZUPA 2O85A 2HXKA 3WD6A 3BCKA 4YAVA 5ECKB 3WGDA 3VLNA 2VCXA 4MJEA 3HJOA 1MTCA 3MDKA 3UMAA 2PWJA 4JZQA 5COHA 4FYCA 2GTUA 2C0FA 1YQ1A 4ILFA 1K0CA 1O8WA 4JRRA 2ES7A 2CQ9A 3CXGA 4TXOB 3CRTA 3NIVA 2IMIA 4PQHA 2YWIA 6GSVA 5ECOB 1R7HA 4NXIA 3GKKA 4JR6A 3QR6A 4ZBDA 1SYXA 3EU3A 4WR5A 3BOAA 2LJAA 5D93A 5C04A 3TCOA 4L5LA 4K2DA 1G0TA 2WGRA 2PU9C 3VI7A 3IK9A 3UJ1A 4HU9A 3A5WA 5G1KA 3ZFBA 3GN3A 3TB2A 3H79A 3P2AA 2H1AA 3Q18A 3M0FA 1XWGA 2QGVA 4BL7A 17GSA 1VF1A 3LEFA 5J41A 5INYA 6GSWA 5E59A 4OWYA 2WFCA 4OCFA 2F8FA 2C4JA 3ZVJA 1EP8A 2FWHA 2MMAA 2RM6A 1ZL9A 2YWOA 2JL4A 1KEBA 3VWXA 1HNBA 3LJRA 4P3YB 1YF0A 2RLIA 1G7OA 2H0HA 5ECMB 1OC3A 2E2MA 2AAWA 2YOIA 3TJKA 2I9HA 5ECQB 4O7HA 2H72A 1PL2A 2AHEA 2JADA 4FH8A 5FWGA 3TKSA 3KP8A 2VO4A 4GSTA 4JR4A 2GLRA 1SK1A 5F0GA 2VD1A 4TR1A 3GTUB 2PPTA 1SK0A 5B6MA 1WWJA 1LJRA 3IOSA 4ZXGA 2HRFA 2VM2A 4JBBA 2GT5A 2VLVA 1R5PA 3D4TA 6GSYA 1PA3A 5GSSA 4HS1A 5DAKB 3HYPA 2DIZA 3EYTA 2H74A 2HYXA 3KCMA 3RHBA 1IYIA 4ULXA 1GTUA 1R26A 3HVSA 4OO4A 4JEDA 1OC8A 4K7NA 2YV7A 2Z9SA 1F3BA 2EIOA 1JLVA 3C71A 2VD0A 4MA9A 2WZ9A 2K6VA 4WF4A 1EOGA 4MDCA 2VCTA 5D73A 1GUHA 5DALA 2M46A 1MDKA 2B6MA 4HQZA 5IMFA 5EVOA 3M9KA 2EIRA 3LQ7A 4MZBA 4ECCA 2I4AA 3N9JA 1HYUA 4EE0A 5G1LA 3V1WA 4GCIA 1WIKA 1DBYA 2C0DA 4MK3A 3VFIA 4IHUA 1ZGNA 1EEMA 3U5RE 4EKZA 5B8AA 1V40A 2H30A 1JFUA 4CHSA 2ALBA 2HZFA 4MCUA 4N30A 3DXBA 4GSSA 4ECBA 1M0UA 1XPVA 5JCUA 1OVNA 1WOUA 4FO5A 2YJHA 3A2XA 3PR8A 1A0FA 4TR1B 4RQXA 1ZYQB 3R2QA 2HZEA 5CYYA 1ERUA 3RPPA 2PGTA 2FLSA 1HD2A 3IE3A 3VK9A 3J7Yb 3HJPA 1GL8A 6GSUA 2IMFA 2K9FA 5B8BA 1FVKA 3I9V2 1EV4A 3CYNA 2YZUA 2A4VA 1GRXA 3I69A 3QPMA 2WRTA 1B4QA 4E8HA 4EC0A 1XFLA 3GH9A 2MBTA 4EVMA 4OMVA 2YNXA 1FAAA 2P5RA 2DJ2A 4XS1A 1SJZA 2X64A 4WKWA 2IWTA 3G7JA 4KCAA 3L4NA 2B7JA 3IHQA 5EL8A 3HY2A 5JWRB 1FB0A 5DALB 1T7PB 3UL3A 1NW2A 2X8CA 4BVXA 1OAZA 4MJBA 2AUVA 3M1GA 1XW9A 1SJIA 1BQ7A 3Q74A 2HT9A 1UN2A 4GXZA 3HD5A 1KNGA 2KLXA 5LNKe 3VWWA 1C72A 3C7MA 4E8EA 5ENUA 2FWGA 1RW1A 3APSA 4OFTA 4QL7A 3TKRA 2IMDA 4HDEA 2YWMA 1AQXA 1OE8A 2KOKA 20GSA 1AXDA 1A2LA 2H19A 1GSFA 1ERVA 3CSIA 3VPTA 1GWCA 3HA9A 5CAXA 3GX8A 1GLQA 1EZKA 2HZEB 1QK8A 3F4SA 1S3CA 4D73A 1TOFA 4WETA 4PQIA 2VL2A 1Z9HA 2AJQB 2TRCP 2OE0A 2NBSA 4PX1A 4TVEA 1G7EA 1BYEA 4MPFA 2PVOC 2OE3A 1UVZA 4H86A 3MSZA 1SD8A 1HQOA 5DJLA 5DVBA 3ERWA 3TDGA 2DLXA 2WS2A 2IFQA 4MZWA 4YQUA 2LKUA 1GUKA 3LGCA 3EMPA 1K0MA 4XIHA 2KHPA 2OACA 4AJ8A 3QD9A 2HNLA 3GL3A 1FO5A 1Z7RA 4DSQA 1TK5B 2RIIA 4POKA 3KM6A 4NV5A 4PNFA 5LCZA 3PINA 4ZL8A 3TGZA 1TRWA 2LRTA 1B4PA 1V58A 4XS4B 4N0VA 4RI6A 4K7OA 1LU4A 3IAM2 2LJKA 1CQHA 2DMLA 2CX4A 1TKDB 2G2QA 3H4KA 1OE7A 1Q4JA 2GSRA 1WP0A 3QCPA 3BCIA 3D0ZA 4BVYA 5CP1A 5JCWA 4GRFA 4I6XA 5HR0A 5D8IA 2L5OA 2FD3A 3WT1A 3MWHA 4HJMA 2V6OA 4NHWA 1ZMAA 5ECPB 3CTFA 2D2ZA 4DSRA 1T00A 4KNDA 1KTEA 3ISOA 3C1SA 1SL2B 2XBQA 2V6KA 4XTSA 5D9TA 4JE1A 1DUGA 2E2GA 4D73B 2MMOA 1B9XC 1Z3EA 2JSZA 4Q5QA 5CRHA 2RUFA 3L78A 2VCVA 3D6IA 4FYBA 2LUSA 2K8SA 2L4QA 4BA7A 5F07A 2GQKA 1AQVA 2L57A 3GMFA 2JU5A 2C80A 5KEJA 5JWOB 1SENA 2X8GA 1O7UA 3HVVA 5G30A 4EUYA 4XCSA 3KH9A 5IMAA 1K0BA 5KN3A 4EXJA 4HUAA 5DCGA 2IIYA 3I43A 4PQ1A 2XPEA 4TOPA 1N8JA 3DRNA 2PN8A 2LRNA 2VAFA 2H66A 2O89A 3G9BA 5IMVA 3NZNA 4L0UA 2C1YA 4KSOA 4HI7A 4ACSA 3W8SA 4ZB8A 3FZAA 2B1LA 2VUPA 2FY6A 1PD21 3EVIA 3D22A 1M9BA 1XXUA 2WULA 3ME8A 2H73A 1U3AA 1XVWA 2FNOA 1BX9A 1A0RP 5D96A 2GGTA 2V1MA 3FRCA 1AUCA 4PUAA 2CV4A 4KX4A 3KD0A 4N10A 3I6AA 3FR6A 5A4VA 4MZCA 2N5BA 2E7PA 1BAYA 4KDUA 3FK8A 3A2WA 3UIWA 1EGOA 3JCML 3A2VA 2KP1A 1MD4A 1TXXA 2GQLA 3ZL5A 3ZREA 4KA0A 3G7YA 4V2MA 1THXA 3GYKA 2MYGA 2DSAA 2G0FA 3UOMA 3LSZA 3LXZA 1VF2A 4KCEA 4MABA 3LORA 1SYRA 4FYUA 5AN1A 3O76A 4TRXA 3FZ9A 1X0RA 3HCZA 1ON4A 1MDJA 2QSIA 3CRUA 1ACVA 2M72A 3WGXA 5IQYA 4EO3A 3C1RA 1QGVA 1XOAA 4Q5RA 2JZTA 5EY6A 3TJGA 3O3TA 3VWUA 2I3YA 1XCCA 4YQMA 3QDNA 3UVTA 2TRXA 2C3TA 1XW6A 2C0GA 5F06A 4POBA 3EWLA 1A2MA 1TJDA 4N11A 4MPGA 1NSWA 2NPBA 3ERFA 1GSQA 4I8BA 1NM3A 3UARA 5F8BA 1NHYA 4Q5NA 2AB6A 3GSSA 3GNJA 4HEA2 5IPHA 2F3MA 2N5FA 3D21A 4NPBA 2H6YA 4BWSA 4TR0A 1X9SB 1K0DA 1QQ2A 2GVPA 1FG4A 3HJMA 2RUEA 3J7Yk 4PNGA 3U6VA 3EMXA 1MDIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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5ABRA

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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