1ZYEA

Crystal strucutre analysis of bovine mitochondrial peroxiredoxin iii
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
PAVTQHAPYFKGTAVVSGEFKEISLDDFKGKYLVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDKASEFHDVNCEVVAVSVDSHFSHLAWINTPRKNGGLGHMNIALLSDLTKQISRDYGVLLEGPGLALRGLFIIDPNGVIKHLSVNDLPVGRSVEETLRLVKAFQFVEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Bos taurus
publication title Bovine Mitochondrial Peroxiredoxin III Forms a Two-Ring Catenane
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin-dependent peroxide reductase
total genus 49
structure length 162
sequence length 162
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2005-06-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1zyeA00
3OR5A 2CZ2A 4EUYA 1HYUA 1GSUA 2OE1A 1SD9A 2HFDA 1TXXA 1K3YA 4EXJA 5JWRB 1A23A 2DIYA 1AW9A 1WWJA 1XFLA 2H19A 1V57A 1ZGNA 3F3RA 5ELGA 2YWNA 1E6BA 2FWEA 3LQ7A 1XWKA 4L5LA 4FYCA 4DSRA 3D4TA 2EIOA 1SU9A 2MMAA 2MMZA 3FEUA 1LJRA 3JCML 4K8MA 2B5XA 1TK8B 3ME8A 2QSIA 1ML6A 1WP0A 3FYGA 4XHMA 1TI3A 2CX3A 4X43A 3UIWA 3L78A 2MMOA 1SD8A 2VM2A 3DVXA 4IKHA 1EWXA 2VCVA 2L5LA 2AYTA 3ZREA 1WE0A 3CMIA 1PL1A 3GIXA 4D73B 1GUKA 2RM6A 3EMXA 2TRXA 1GTIA 5F05A 1SYXA 2PPTA 14GSA 4EE0A 2B3SA 2IFQB 1ZOFA 5ECLB 1NHYA 2X99A 4ECCA 5DALA 4IVFA 2I1UA 1AAZA 3R2QA 2VO4A 3F4TA 1A8LA 3FZ4A 3IRAA 4G10A 2XBQA 3H1NA 3QCPA 3SBCA 1W4VA 5ECOB 2MZCA 1HNBA 1M2AA 2F8AA 5EPFA 4ZL9A 2I9HA 2G2QA 2IL3A 3TKSA 9GSSA 5KN0A 3QDNA 4YQUA 1U3IA 3UL3A 4JE1A 5A4WA 1ZCPA 1K0CA 2YWIA 3TUEA 3L9VA 4K2DA 2F51A 3K8NA 1O81A 3LYKA 4TR1B 4K0NA 3VLNA 2DJ0A 4PNFA 3VPQA 4EVMA 1G0TA 1YEPA 5IOXA 2JZTA 1MD4A 4RI6A 4WF5A 4N30A 4LL4B 1KNGA 1XW9A 1Q4JA 2M80A 1NW2A 4MZCA 2OADA 2YJHA 3GH9A 3UAPA 5ABRA 4POKA 3CSHA 2WJUA 1ERTA 3IAS2 2C3NA 1YQ1A 1I5GA 3DEXA 2ZCTA 4TRXA 4OMVA 5CREA 1XZOA 2FWFA 1V58A 3VWVA 1NSWA 3A2XA 5G1KA 1T3BA 2L5OA 1TW9A 1XVQA 2L59A 13GSA 5B8AA 2VLUA 4KCEA 4YAVA 2HYXA 5GSSA 1M9AA 2GZPA 1EOGA 16GSA 3G7YA 4NXIA 1F37A 1QFNA 1X9MB 2KHPA 2HRNA 2XPDA 3HJPA 1SENA 1F9MA 1EV9A 4K1FA 1GUMA 3BD2A 3FRCA 4F2IA 1PN9A 1GSSA 4NV2A 1SJ6A 4KSMA 3FHKA 3VK9A 1HNAA 1W89A 1CQGA 4XRAA 4AJ8A 3QPMA 3GH6A 4NWYA 1JFUA 4TR3A 4JRRA 1XWGA 3G7JA 2HNLA 3LXZA 2X8CA 2FGXA 5H5RA 5IMFA 5CRHA 5IO0A 1NM3A 2H8LA 3DMLA 1MDIA 5DJLA 1BX9A 1THOA 3LORA 4Q5FA 5AN1A 4K7IA 3WYWA 3VPTA 3WD6A 5F0GA 5LCZA 3VFIA 2LRTA 1GLQA 1JLWA 1OC9A 4MLYA 4MZBA 3HDCA 3QD9A 1BAYA 2H1DA 2O7KA 3GA4A 4BVYA 5HR1A 3TOTA 2QC7A 1O8XA 5EVOA 3UARA 1YJ6A 2HZEB 3QAVA 3EU3A 2MMNA 3DRNA 4NHWA 4ZBAA 4J56E 3PR8A 1GTAA 2YNXA 1QUWA 1Z7PA 5INYA 3P90A 2LRCA 3KMNA 4F0BA 3LFLA 1T00A 5DAKB 3BJ5A 1BG5A 3ZLPA 1F2EA 4JU5A 4WETA 3KMOA 2ZUPA 1FO5A 2H72A 3AY8A 1OE8A 3Q6OA 3UJ1A 2HZFA 3ZL5A 4YQVA 1EOHA 1A0FA 2C4JA 1ABAA 1EGRA 3H8QA 2KLXA 3ZMLA 2PUKC 1PRXA 2J9HA 1DE2A 2GT5A 4IP6A 2VLTA 4V1Ag 1URMA 3GKKA 1MEKA 3BCIA 1I9DA 5HR0A 2NDOA 3EC3A 2YCDA 4J2FA 2QGVA 2N5FA 3DWVA 3QMXA 1JZRA 3G9BA 1X5EA 1B9XC 1THXA 4XCSA 5G2ZA 2VL2A 3KD0A 1A2MA 1U88A 1YEXA 2CX4A 1B4QA 2OBKA 1BYEA 1F3BA 2YV7A 4NPBA 3TKRA 2K8VA 2FCHA 1WRYA 4TOPA 3L4NA 3CRUA 3EMPA 4AF2A 1XXUA 2REMA 4PQHA 4WBJA 3IBHA 1O7UA 4D73A 1GNEA 1M99A 1ACVA 4I97A 3L9UA 2AJQB 2KP2A 5G31A 5HFIA 2IFQA 4GF0A 3D0ZA 2F9SA 4GCIA 2L4QA 5IMDA 1TTZA 1KTEA 2JACA 5COHA 3BBYA 4NMUA 4EO3A 1X5DA 4E8HA 3IE3A 1ERUA 4TXOB 3F63A 3UEMA 3GL3A 3GYKA 1PA3A 3UMAA 4IELA 2LQOA 2GZYA 1X9SB 1X5CA 4G2EA 1E2YA 2AB6A 4ML1A 3TKSE 2CQ9A 4JZQA 2LEGA 12GSA 4GLTA 1WPIA 5HFKA 3ZFBA 3O76A 3EWLA 5IMCA 2FLSA 1PKZA 2HSHA 4TW5A 1ERWA 3LEFA 1PSQA 5D96A 2GVPA 4AJ6A 4ZL7A 2CAQA 4GSSA 4HU7A 5G5EA 1G6YA 1SJIA 4TR1A 1VF4A 3D4MA 4BL7A 1XWAA 5D9WA 3F6FA 5DBQA 1IYHA 4MF6A 3M3MA 1PQNA 3QAGA 2OE0A 4GQCA 1SJZA 2H1AA 1F6MC 2GSSA 4TXVA 3GSSA 3ZZXA 22GSA 4ILFA 1XVWA 4HEA2 4PUFC 3E3EA 2MBTA 5H5QA 4G19A 1XPVA 1PGTA 3IDVA 2B5YA 3FR3A 4N0ZA 3HVXA 2IMDA 3GURA 3KP9A 3MAKA 5KN1A 4FH8A 10GSA 1VGLA 4HS1A 2R37A 3QFBC 2R5GA 3IOSA 3TB2A 2R2JA 5D93A 4RI7A 3TOUA 5F07A 2ON7A 3E9JB 2B5EA 5IM9A 1XWBA 4XS6A 1HNCA 3I43A 1UC7A 3IXRA 5GSTA 2YV9A 4MJCA 2C3TA 1Z9HA 2WZ9A 5J4UA 2DIZA 1WIKA 3QR6A 2GT6A 3UOMA 3J7Yk 2KP1A 5ECSA 2C3QA 2IMKA 1FHEA 4PGTA 3GKMA 1K0BA 1RK4A 3KEBA 1QQ2A 1PMTA 2K9FA 3LXTA 1QMVA 2NTOA 5JWQB 4BPYA 3O6TA 1QK8A 1ZL9A 3FZ5A 4MP4A 1GL8A 4BWQA 4KW6A 3W8SA 4I2UA 3ED3A 1J9BA 4K0GA 5A4VA 2YPMA 2H75A 1AUCA 4EDZA 3M0FA 1OAZA 2H6YA 4GSNA 3WGEA 4IP1A 1ILOA 2F3MA 2V6OA 1VF3A 2MYGA 3HJMA 2HZEA 1GP1A 2I3YA 2FWHA 2CA8A 4EC0A 2YP6A 2GQLA 4IGJA 3D21A 2E7PA 5ECHB 4V1Ap 2H1BA 5IPGA 5DAKA 2VD0A 3V1WA 4EDYA 1HQOA 4ISDA 4OCFA 2OBIA 4I6XA 4ZILA 2DMMA 4ZBBA 3RHCA 1ZYEA 4XS1A 2FD3A 1R26A 3CTGA 3KTBA 4MJEA 4Q5QA 1EEMA 3ZTLA 2PWJA 4KGIA 2H73A 2NBSA 3DKSA 4WR5A 1HD2A 1TRVA 4K7NA 1CQHA 4GXZA 1QGVA 4HUAA 4KB3A 3IV4A 1SKSB 3GHAA 2IMFA 1AQXA 4K9ZA 3J7Yb 3WT1A 1RW1A 2O89A 3IC4A 3C1SA 2BJXA 3F8UA 4KAEA 4MPFA 2HLSA 3D6IA 5AISA 3TGZA 4LLRA 2H0GA 2KOKA 3TRQA 1SK2A 2WS2A 5D9XA 1GLPA 5KN2A 1G7EA 20GSA 4L0UA 1R7HA 1S3CA 1JZWA 4HQZA 2VCXA 1GSDA 1YF0A 5DCHA 2JZRA 1ST9A 2C80A 1GRXA 1VF1A 5IOWA 3ISOA 2D2ZA 3DXBA 3TJFA 6GSTA 2DJJA 2P5RA 2WGRA 1XOBA 3RPNA 2VCQA 1AIUA 2FA4A 1XCCA 3UVTA 3A3TA 4HI7A 2I4AA 4RUVA 1FW1A 3CRTA 2VIMA 4ZB6A 2LV3A 5B6NA 2DMLA 4PX1A 4TXOA 2H0IA 1TU7A 3HHVA 4ECJA 1K0DA 3A2VA 3DVWA 1K0AA 2BMXA 2P0GA 3IHQA 2A2RA 2J23A 3BCKA 4WEYA 1IYIA 4FYBA 2ALBA 2GSTA 5GZZB 3I69A 4X1UA 1EP8A 3H93A 1FVJA 4OWYA 5ENUA 1TOFA 3E0UA 3RBTA 3FR6A 2LKUA 5HFGA 3C71A 3GSTA 1AQVA 3DYRA 4NAXA 3EINA 2FNOA 4HDEA 4DSQA 3F4SA 4V2NA 3TJGA 3ZIVA 5ECQB 1FB6A 3W8JA 1ON4A 4JR4A 3VWWA 2EC4A 2H76A 2PMTA 4IBPA 3LG6A 4AJ7A 1Y25A 1DBYA 1DE1A 4I5QA 3KTLA 3FK8A 5B7CA 4HOJA 4WXTA 1A0RP 4N0VA 1XW5A 3IR4A 2IIYA 2YWOA 3LSZA 2DLXA 2B7KA 4IJIA 2AUVA 3A2WA 2VOCA 5G5FA 4MPGA 2WRTA 6GSUA 2B1LA 2H66A 3PH9A 1Z7RA 1TJDA 2XHFA 3APOA 3S9FA 4MCUA 3TDGA 2X8GA 1YDKA 1A2LA 5ID2B 2PBJA 4EKZA 1XBSA 5CP1A 2LNTA 1BJXA 1XIYA 4GTUA 1H75A 1J0FA 4BA7A 6GSXA 5F8BA 2HRFA 3L0HA 1SKWB 1OC8A 1GTBA 3KCMA 2X64A 1O6JA 2YJ7A 1UVZA 4V2MA 1AC1A 1TDIA 4O7HA 3F4RA 3GX0A 5L71A 3KH7A 1U6TA 2E2GA 1K0MA 5HQPA 1Z6NA 4OO5A 1FOVA 3TKQA 2LJAA 5FWGA 3UBLA 1R5PA 5G1LA 1UN2A 3MSZA 1SL1B 1GSEA 3CBUA 4IJ3A 4MF5A 3LGCA 5H5SA 3O3TA 2GGTA 1B9YC 4CHSA 1ZYQB 2AAWA 3CSJA 1S3DA 3GKNA 4POLA 5DDLA 4CDOA 4QQ7A 4LL1B 4ZB8A 4AGSA 1PX6A 5IQYA 1SKRB 2G0FA 2K8SA 1M0UA 2VCTA 1ZMAA 4QL9A 2DJ3A 5ECMB 2VUPA 2KUCA 4KDXA 3TKSC 3VI5A 1GUHA 5IMZA 3TRPA 5ECKB 4KSOA 4Q5NA 3HVSA 3GMFA 4POMA 1O73A 1A2JA 1KEBA 1V9WA 1WJKA 1FVKA 17GSA 2R3XA 3PGTA 4KDUA 5IMAA 3SWLA 3Q19A 2H0HA 2JSZA 3ERGA 4LMWA 4E8EA 1VF2A 19GSA 2LSTA 5A5KA 2GQMA 3EU4A 3VI7A 1EEJA 4OO4A 3WGDA 4PXOA 1K3OA 2C0DA 2B1KA 1OKTA 2R6KA 2JL4A 3CTFA 4K7OA 4TR0A 3MDKA 4IW9A 1PD21 1NHOA 1PX7A 5J41A 2OKAA 2JU5A 3ERFA 2XPEA 2RUEA 1Z5YE 2LNSA 4NHZA 3DIEA 3D5JA 1OC3A 3GRXA 6GSWA 3QAWA 1KBNA 3ZMKA 3EVIA 3HY2A 5ECIB 2LTKA 2AV4A 1EZKA 1V40A 4I8BA 4POBA 3H4KA 2PVOC 2E2MA 2DJ2A 1MTCA 4MH2A 4MH3A 3IK9A 2P5QA 3GTUB 2TIRA 4O32A 2X8HA 1USBA 2LS5A 1Y6EA 2QKEA 3P8WA 4HQSA 4YAPA 2GZZA 3U6VA 1K0NA 4WKWA 5A4UA 1OKDA 4OD7A 5E4WA 2H70A 2GLRA 3C7MA 3M9JA 1OYJA 3DGQA 4PUAA 1MDJA 2YN1A 6GSYA 2VCZA 3D22A 1C72A 3VWUA 5CAXA 2OACA 3KM6A 4N11A 2JSYA 5AGYA 4NV5A 5AIVA 3ZVJD 2VLVA 4XS4B 2LJRA 4DVCA 1OE7A 3GN3A 5B8BA 5CRWA 4WF4A 3GKXA 5CRDA 1S3AA 4MK3A 5IPHA 2H1GA 4HZ4A 2CT6A 1PKWA 3HZ8A 1JHBA 2O85A 1GULA 2ES7A 1TKDB 5HR3A 2RIIA 3F6DA 2VAFA 3ZFLA 5IO2A 2V2GA 1YKCA 3FW2A 4Z7XA 1JZDA 4G9HA 5FT3A 3TJJA 4KX4A 2H6ZA 5DVBA 2HE3A 4L0WA 3NOFA 3ME7A 2OJLA 1AXDA 4OFNA 4H86A 2IMIA 1X9WB 1N8JA 3KXOA 6GSSA 4F82A 2V32A 1XWCA 4EL1A 1M9BA 2LJKA 4KCAA 5EY6A 5GAPD 1K3LA 1V98A 4F9ZA 1YY7A 2PU9C 1BQ7A 4ZB9A 3H79A 1GSFA 5D9VA 2CVKA 2RUFA 3FKFA 2JADA 2R4VA 2YWMA 3N9JA 3FY7A 11GSA 3ZIJA 1JLVA 1G7OA 1T7PB 1DSBA 5DJMA 3F3QA 2E0QA 1X0RA 1M2DA 4YQMA 2LQQA 5JCWA 2YOIA 3TKPA 3EE2A 1GWCA 2HT9A 2GQKA 1SL2B 1A8YA 5IIZA 5AIXA 5GAND 3M9KA 4JEDA 1K0OA 4PQIA 5F06A 3Q18A 1JZOA 4L8EA 4DSSB 5J3RA 1MD3A 4X0XA 4F0CA 2H71A 4TN8A 2H30A 3GX8A 5G30A 4OFTA 1YZXA 1TK0B 2VL2C 5ID2A 4BWSA 3PINA 1GSYA 3M8NA 2IMEA 1M7TA 1N2AA 2DJ1A 2CVDA 3KH9A 6GSVA 1XW6A 3ERWA 5LD0A 2ON5A 1A24A 3LJRA 2K18A 4ZXGA 2YANA 2VL9A 2NVLA 3ZYWA 3F0IA 5E59A 5ECPB 2PN8A 2TRCP 3UVHA 4J57E 3KJYA 1GTUA 4HJ2A 4I2TA 2DSAA 2MBSA 5DCGA 3C1RA 5JCUA 2I81A 4XRDA 2OA7A 2NPBA 5CNWA 1YKAA 4MJAA 4LMVA 4MJBA 2N5AA 1MDKA 3IA1A 1SYRA 1SL0B 1WOUA 1SK1A 3GNJA 3LWAA 4MF7A 3IK7A 2FHEA 2DJKA 1FAAA 2C0EA 3HXSA 5D73A 5D8IA 2YZUA 3TJKA 2A4VA 5CYYA 3I9V2 3QOUA 3VURA 2C0FA 5J5NA 1QXHA 5DQSA 4ULXA 2PGTA 3QFAC 5FHIA 4O92A 2XBIA 1DUGA 1R5AA 2ZNMA 4IN0A 1EP7A 4FO5A 1T1VA 1TRUA 3FR9A 3NIVA 2O87A 2VCWA 3MNGA 4L5OA 4WR4A 3GV1A 3VWXA 3TCOA 4GWRA 3RPPA 2WFCA 4YH2A 1TP9A 2PERA 4V2LA 3G7IA 4EF0A 4ID0A 1TU8A 3US3A 1Z3EA 4IHUA 4ACSA 4OFMA 4MMMA 2V41A 3F9UA 3CYNA 4MA9A 1M2BA 2LUSA 3ZITA 5EL8A 5KN3A 1TI1A 4ECBA 3HJOA 3RDWA 1GH2A 8GSSA 3IPZA 1TK5B 1SK0A 5LNKe 4PURA 2GS3A 4JR6A 2PVQA 1U3AA 2VL3A 2YZHA 2WB9A 4FIWA 1AQWA 2H01A 4FYUA 4OCEA 3ZRDA 2GDRA 2C0GA 2M72A 2V6KA 5JWOB 3RAZA 5DALB 3HYPA 1VRSD 5D9TA 4IQ1A 7GSSA 3NZNA 4ZIJA 3HD5A 1T8EB 2C8UA 3P7XA 3GTUA 1B8XA 3GFKA 2GSQA 3N5OA 3IAM2 3I6AA 2DBCA 4KNDA 3KGKA 2IWTA 5IMVA 2FA8A 2F8FA 2FWGA 3TRXA 2CVBA 5J9CA 4HZ2A 1B48A 4IS0A 3GL5A 2DC5A 3C8EA 4GSTA 2LRNA 4RQRA 4WBRD 4CW9A 2WDUA 1FB0A 4PQ1A 3M1GA 2RM5A 2C1YA 3HA9A 18GSA 1EV4A 4ZBDA 4XS4A 4HJMA 2AHEA 4MDCA 3EURA 5CO3A 4TVEA 3HZ4A 3FZ9A 3LYPA 4PNGA 2P31A 4IQAA 3UBKA 2CAIA 2H6XA 5ELAA 4KH7A 2JZSA 3Q74A 4TR4A 2WULA 5C00A 2L6DA 3TJBA 3KIJA 1U87A 3C73A 4GQFA 3HKRA 2XC2A 3KZQA 4DEJA 5B6MA 2GTUA 3W6GA 2CV4A 1B4PA 1J08A 1EGOA 1ERVA 1T4YA 2WCIA 1GNWA 2O8VB 3DD3A 5J9BA 1F3AA 3HCZA 1O8WA 4MZWA 5ECNB 1LU4A 2N5BA 1GSQA 3BOAA 4HU9A 5CRGA 2CZ3A 3A5WA 3RHBA 2M46A 4P3YB 5HR2A 2L4CA 5JCGA 1R4WA 4LA1A 4F03A 1YF1A 2IJYA 2L6CA 1Z6MA 2HXKA 4KA0A 2BTOT 5ECRB 4K6XA 4GRFA 2B7JA 1RQMA 1O85A 1WMJA 3EYTA 1LBKA 4XTSA 3ZVJA 4DSSA 5C04A 3CSIA 3GUSA 2IPAA 2IN3A 3CXGA 4ECIA 3APQA 4Q5RA 2HI7A 3MWHA 1PL2A 5DQYA 1TRWA 1FG4A 2VD1A 3L9SA 1UA5A 4QL7A 2EIRA 1V2AA 2L57A 4RQXA 2H74A 1OC9B 4XIHA 2EIQA 3P2AA 2VM1A 2OE3A 4O5RA 2K6VA 2A2SA 1XOAA 2GSRA 2Z9SA 4ML6A 1TRSA 3WGXA 4KDYA 4N10A 4KE3A 3FZAA 1ZZYA 4MABA 2HSYA 4ZL8A 3APSA 1T4ZA 1OVNA 3KP8A 4BVXA 4JBBA 5KEJA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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