1ZYEA

Crystal strucutre analysis of bovine mitochondrial peroxiredoxin iii
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
PAVTQHAPYFKGTAVVSGEFKEISLDDFKGKYLVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDKASEFHDVNCEVVAVSVDSHFSHLAWINTPRKNGGLGHMNIALLSDLTKQISRDYGVLLEGPGLALRGLFIIDPNGVIKHLSVNDLPVGRSVEETLRLVKAFQFVEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Thioredoxin-dependent peroxide reductase
publication title Bovine Mitochondrial Peroxiredoxin III Forms a Two-Ring Catenane
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
molecule tags Oxidoreductase
total genus 49
structure length 162
sequence length 162
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2005-06-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1zyeA00
4RQXA 2H0IA 2EIRA 1K3YA 2YV9A 4GSTA 4TVEA 3F4SA 1K0OA 1TOFA 5ELAA 1B48A 2CVDA 3C8EA 1GNWA 4FIWA 1PGTA 3CSHA 3MSZA 5J5NA 5GSTA 3V1WA 1M9BA 2B6MA 2K8SA 4BWQA 2VCXA 3PR8A 4XS6A 2AV4A 1GLQA 3DIEA 3C7MA 3RDWA 1LBKA 2V6OA 4YQVA 3Q19A 2DJKA 1U87A 2F9SA 5CO3A 3TOUA 4I2UA 2XC2A 1K0NA 2EC4A 5KEJA 3L78A 3HKRA 4Q5FA 2C0EA 4G2EA 3UBLA 2C3QA 4GSNA 4N0ZA 4EUYA 2XPDA 4IHUA 3IXRA 1XZOA 5B8BA 3M9JA 1ZMAA 3F3QA 4MJBA 1YEXA 2HXKA 1XWCA 4YAVA 1SD8A 5DJLA 3HHVA 2FHEA 3P8WA 5IO2A 4WBRD 3TCOA 3GURA 4ML1A 2CV4A 2L6DA 3CRUA 4IVFA 3QMXA 1H75A 4TOPA 5IOWA 1I5GA 4PQ1A 1THXA 2B1KA 1BQ7A 2LQQA 4HU7A 4EF0A 4Q5QA 3EVIA 3KZQA 4NXIA 1YY7A 1V57A 1K0AA 4V2MA 3HVSA 4GRFA 1JHBA 3LEFA 1MD3A 1U6TA 1B9XC 5J4UA 4EDZA 2O85A 2LRCA 3P2AA 5ELGA 4J57E 1HNCA 3TJGA 2FWGA 1YDKA 3W6GA 4D73A 1TRSA 2IFQB 1YF0A 3APOA 1A2LA 3HZ4A 3UAPA 3WD6A 3ZMLA 1W89A 2DIZA 4K9ZA 3HYPA 3ZVJA 4ECIA 4YH2A 2V1MA 3MDKA 1RW1A 2P5QA 3TOTA 3UL3A 3W8JA 1SJZA 1X5EA 4KA0A 2OACA 3GTUA 1SJ6A 4BL7A 5HFGA 2H0HA 6GSWA 2WB9A 1GRXA 1ST9A 3FKFA 3FEUA 5ENUA 1PKZA 2GSTA 3IC4A 6GSYA 1YQ1A 3D5JA 3QCPA 5GSSA 5ABRA 3ZREA 3L4NA 1EOGA 3SBCA 2YWNA 1HQOA 1R5PA 5AIVA 5FT3A 1GTAA 2HRFA 3LYPA 4MMMA 5DJMA 1F37A 4BPYA 2L57A 4CHSA 2V2GA 1EEJA 3A5WA 4XS1A 4TR3A 3CSIA 1X0RA 3U5RE 5HR3A 3DWVA 2IL3A 2GSQA 4HU9A 1ACVA 4DSSA 1A2MA 2H1BA 4IGJA 2OE3A 1X9MB 2WJUA 1ERTA 3LFLA 2H70A 2YOIA 4OO5A 4KCAA 1SL0B 1GWCA 1N2AA 2C3NA 4MPGA 3CRTA 4PXOA 2FD3A 16GSA 5CRGA 3DVXA 5ECHB 4O5RA 3H8QA 3QAVA 4OFNA 2FUG2 4EE0A 4HZ2A 1ZYEA 5A4VA 2R2JA 5A4WA 1Z5YE 1B8XA 5DBQA 1OC3A 1G6WA 1TXXA 3TKSE 3P7XA 4EXJA 1OE7A 1Z7PA 6GSXA 4G10A 2CA8A 2IWTA 4MZBA 2HSYA 4WR4A 2HZEA 4GXZA 4DSQA 1XOAA 2YJ7A 1O6JA 5FHIA 6GSUA 1TRUA 4MPFA 1TU7A 5J9CA 2C8UA 2DMMA 4ZXGA 1TRVA 4ID0A 1UN2A 1SKWB 3GKNA 4FYBA 3O3TA 1G7EA 5KN3A 3DEXA 3GX8A 2IMIA 5IO0A 5E59A 2YZHA 2C0GA 2FCHA 2G2QA 1OYJA 2F3MA 3IHQA 4HQSA 1J9BA 2HYXA 3ERFA 3GSSA 18GSA 2F8FA 5GZZB 2M80A 1JLVA 4WEYA 2O87A 3KH9A 3KEBA 3TRQA 3F3RA 3EU4A 1YEPA 3VWVA 3VFIA 2V41A 2VCQA 3LWAA 3ZYWA 5ECPB 7GSSA 1GSDA 3UIWA 2VCZA 3RBTA 4Z7XA 4XHMA 3S9FA 1BJXA 2X99A 4IQ1A 3L0HA 2Z9SA 5EL8A 3KD0A 3UARA 5DALB 2REMA 2PMTA 5FWGA 4MCUA 2VLUA 4JR4A 2PU9C 1O8WA 1B9YC 1GSYA 1T8EB 3ERWA 4RI7A 1TTZA 3FZ4A 3KCMA 2AHEA 3QAGA 5G2ZA 1M99A 1GSFA 4YQUA 3TJFA 2YZUA 2KOKA 5IIZA 3VWUA 2YWOA 3W8SA 3HJMA 2CVKA 4ZBBA 4POMA 1PN9A 4ML6A 5CRHA 2H30A 4HDEA 3LXZA 1T00A 1V98A 3F6DA 3FZAA 3BBYA 1PL1A 2TRCP 3ZIJA 3F63A 1GSUA 1I9DA 4I6XA 1SL2B 3KJYA 4PGTA 1PX6A 5ECRB 4IP1A 1T1VA 4NWYA 2B1LA 1IYIA 2ON5A 3F6FA 4BVYA 4GWRA 2LRTA 3IAS2 2MMNA 5AISA 3M3MA 1PSQA 3TRXA 1SK0A 1OC9B 3FRCA 2AUVA 4O92A 2M46A 1XBSA 2FWFA 3GFKA 3LYKA 5KN0A 1JZDA 2O7KA 3M1GA 1AC1A 4GF0A 3QR6A 2G0FA 4P3YB 4AJ6A 3O76A 3A2WA 5J41A 4N0VA 2H01A 1A0FA 1FB0A 4E8EA 5HR0A 4TXVA 2K8VA 5F0GA 4MA9A 2DSAA 1ERWA 3UEMA 2PERA 1FW1A 1RK4A 3ZFBA 2L5OA 3EWLA 3G9BA 4F82A 3GKXA 3TRPA 3WT2A 1XW5A 1S3AA 1ZZYA 4TRXA 3A3TA 2OE0A 2WULA 3QD9A 4LMVA 1WPIA 2VOCA 3P90A 2IFQA 2VCWA 1OAZA 2RLIA 3UBKA 2O89A 3TGZA 2VL2C 1AAZA 2L6CA 2OBIA 3E0UA 5IMVA 3A2VA 2E7PA 4IP6A 4HUAA 4I5QA 4K0GA 2I1UA 2XBIA 3R2QA 5J9BA 3PH9A 1NM3A 4ZL7A 1KNGA 3ME7A 4IELA 14GSA 2CT6A 3ZITA 4OMVA 2WS2A 2YNXA 2F51A 5ECMB 3GL3A 4KE3A 1KTEA 2HE3A 3APQA 5DAKB 3IA1A 2ZNMA 4L5OA 4KDXA 1R26A 2H0GA 1PX7A 4MLYA 2CZ3A 3VWWA 2K9FA 5H5SA 2IMEA 2B7JA 2B5YA 6GSSA 2AAWA 5G31A 3LSZA 3BOAA 4K7NA 1AXDA 5AIXA 4X43A 4TXOA 1RQMA 4TR4A 3VPTA 1NHYA 2A2RA 5JCGA 1TI1A 4ZB9A 4KDYA 1TW9A 3KP9A 1FOVA 2WCIA 5DCGA 1ZOFA 4BA7A 1TP9A 4K6XA 1GLPA 2H66A 1QFNA 1UVZA 2N5FA 3FR9A 4LMWA 2KUCA 3N9JA 3VPQA 4XS4B 3GH6A 2IJYA 4EVMA 3LGCA 3CBUA 1MD4A 2IMKA 1OKDA 3IDVA 2GS3A 1ON4A 1XFLA 4AF2A 3I6AA 1R5AA 1U3AA 2VIMA 4GLTA 5LD0A 4IBPA 1CQHA 5HFKA 5B6MA 2LQOA 4K7OA 2FA4A 3KIJA 4OWYA 4IKHA 3TJKA 4MH3A 5G1LA 2LTKA 3C1RA 1VF4A 2QKEA 1BX9A 5HR1A 4MF7A 5IMFA 4DVCA 2VM2A 4IN0A 2FNOA 2H1DA 1O81A 3I43A 2GQKA 2H74A 2GSRA 3FR3A 5C00A 4NPBA 3O6TA 2M72A 3ZVJD 5LNKe 4HQZA 3RPNA 2X8CA 3GUSA 2VL9A 3ZRDA 4GTUA 4O7HA 1XPVA 3G7IA 3ZTLA 1R7HA 4K8MA 2LJRA 2E0QA 2H75A 3ZL5A 1HNAA 4EL1A 3ZLPA 3DD3A 2GQLA 2ES7A 4Q5RA 1Y25A 4RUVA 3MWHA 5DQSA 1AIUA 2JL4A 3IV4A 3ERGA 4JR6A 4JRRA 2MMZA 4WF4A 1EP8A 5C04A 1JLWA 12GSA 4DEJA 3FHKA 2YWMA 3HJPA 4K1FA 2WZ9A 5ECQB 4E8HA 5DALA 5IPHA 3DMLA 5ID2B 3VURA 2I3YA 1XVWA 2DBCA 10GSA 1T4ZA 1TDIA 5D96A 1PKWA 2VLVA 2H1GA 5ECSA 3IRAA 1VF3A 4NHWA 3Q6OA 3H93A 1Z6MA 1TU8A 4TR0A 1T3BA 3QFAC 2PGTA 3IPZA 2YWIA 1Z6NA 2K18A 4MJAA 1KEBA 3E9JB 1YF1A 3EMXA 2RUEA 4KCEA 4I2TA 3FZ9A 4ZL9A 4TR1B 4MH2A 3CMIA 2WGRA 2JSYA 1Z7RA 3QFBC 4G19A 3MNGA 4I8BA 1GULA 5LCZA 2A2SA 3M0FA 5DVBA 2C4JA 1EV4A 1M0UA 1B4QA 2VO4A 1YZXA 3GRXA 5D73A 3GNJA 2FA8A 9GSSA 4BWSA 3U6VA 3LORA 3M9KA 1V2AA 2DC5A 2DIYA 2DJJA 1CQGA 4ZBDA 2H6XA 2PUKC 2H72A 1GL8A 1SYRA 3KXOA 1XWAA 1X9SB 5F07A 3TKRA 4JEDA 4TN8A 5G5FA 5HQPA 3IAM2 1AQWA 2DLXA 3LJRA 3GKKA 2R6KA 5JWQB 3HA9A 2AYTA 2GGTA 4F0BA 2GDRA 5JCUA 4ZB8A 2BMXA 1BAYA 1GNEA 2IN3A 5JWOB 3C73A 1JZOA 2HI7A 4MP4A 2NBSA 2KHPA 3G7JA 3GV1A 3TJJA 4ECBA 13GSA 4N30A 1GSSA 1NSWA 1X9WB 3D4MA 2MZCA 5ECIB 3I9V2 4D73B 4FYCA 3FYGA 2HNLA 5EPFA 5INYA 4HOJA 5CREA 5JCWA 3VWXA 3OR5A 1URMA 1M2DA 1VF2A 2LNSA 3HDCA 2LNTA 4OCFA 3WGEA 2P31A 1XWBA 2YN1A 2RIIA 3NZNA 2NVLA 3KP8A 1U3IA 2N5AA 3I69A 1MTCA 3IE3A 5DAKA 5CP1A 3GTUB 3UOMA 1DUGA 1VF1A 1JFUA 2CZ2A 2YCDA 3ZMKA 3HY2A 3IBHA 2EIQA 2JZRA 1PL2A 2I4AA 4WBJA 3EURA 1ZCPA 1PD21 1LU4A 2HLSA 4LA1A 4NV2A 3GHAA 3TKSC 1THOA 1USBA 2C0FA 5J3RA 4IQAA 4J56E 1K0CA 3C71A 3D22A 4KW6A 6GSVA 2QC7A 4DSSB 3DRNA 4HJMA 2X8HA 2GZZA 1M2BA 1K0DA 3QDNA 1OC8A 4MDCA 5B6NA 5ECOB 2TRXA 2LRNA 4L0WA 1QGVA 3N5OA 3KTLA 5ECKB 1DE1A 3EU3A 1F2EA 3GL5A 1B4PA 3GMFA 4XS4A 17GSA 4XCSA 3BCKA 8GSSA 1YKCA 5CYYA 5CRWA 2LUSA 4ACSA 1AQVA 1QK8A 2KLXA 1TI3A 1O7UA 2CAIA 4WKWA 20GSA 4ZILA 1WJKA 2NDOA 4NAXA 3NIVA 2GT6A 2HRNA 5B8AA 3FW2A 3CXGA 2VL2A 5EY6A 2B3SA 3A2XA 5IQYA 2ON7A 1EP7A 4L8EA 4GCIA 3PGTA 4F2IA 5ECNB 2HZEB 3ISOA 5IMZA 3RAZA 1T4YA 3GN3A 2YP6A 5L71A 2NTOA 4ISDA 4OO4A 5G30A 4OD7A 2DJ0A 4IJ3A 3HCZA 2GZYA 2HZFA 3EE2A 3WT1A 2PVQA 3FR6A 4ECJA 1YJ6A 2YPMA 1GUHA 5D93A 4EO3A 4V2NA 4LL4B 3RHBA 1EOHA 2A4VA 2CVBA 1XVQA 2VD0A 1HYUA 2DMLA 1EEMA 1QQ2A 3UMAA 3ZIVA 2OE1A 3AY8A 1ZYQB 1S3DA 1MDKA 3KGKA 4MF6A 2LJAA 3GYKA 4X0XA 1ERUA 6GSTA 4G9HA 2VLTA 3BJ5A 1QMVA 1ERVA 3F4RA 2H19A 1LJRA 1XIYA 3IK7A 4AJ8A 2CAQA 4O32A 5ID2A 1X5DA 2OJLA 1GTIA 4Q5NA 4YAPA 1UA5A 3GKMA 2CX3A 2WRTA 1N8JA 3RHCA 4BVXA 1UC7A 4CDOA 3FZ5A 4OCEA 2HSHA 3UJ1A 4N10A 1PQNA 5DQYA 1O73A 3QOUA 2VL3A 2JSZA 1C72A 1K3OA 2IMFA 2QSIA 1V40A 2GZPA 4TR1A 3US3A 2K6VA 5IMAA 1TRWA 1SD9A 1NHOA 3UVHA 4KAEA 4GSSA 1K0MA 4PURA 4GQCA 1PA3A 5IMDA 2EIOA 1SU9A 2N5BA 1VGLA 4PUAA 3J7Yb 4HS1A 2QGVA 5H5RA 3WGXA 1GSQA 2L5LA 1DE2A 5KN2A 1WWJA 3L9VA 2F8AA 1U88A 1BYEA 2B5EA 5ECLB 2J9HA 4MJEA 2FLSA 3VI7A 2CX4A 5A5KA 1BEDA 1XWGA 2VAFA 4KGIA 1K0BA 2H73A 1SKSB 2BJXA 2ALBA 3G7YA 1MDJA 2AJQB 1QUWA 2ZUPA 5E4WA 1PRXA 4KDUA 4ECCA 4KX4A 1FVJA 1F9MA 1XXUA 2OBKA 4OFTA 3D0ZA 1A23A 4L0UA 1O85A 3UVTA 1F3BA 1G6YA 4JBBA 4WETA 3VK9A 4HI7A 1AUCA 4XRDA 1ZL9A 4DSRA 2H6YA 5D8IA 3APSA 1WRYA 3HXSA 1KBNA 5D9TA 3VLNA 4ZIJA 2MYGA 2JU5A 1SK1A 5EVOA 2ZCTA 3F9UA 3F4TA 5IPGA 3PINA 5CAXA 5G1KA 2LKUA 4PUFC 2I81A 5G5EA 3D21A 2R37A 2PBJA 4POLA 3ED3A 4HJ2A 3EC3A 4IS0A 3CTGA 3HD5A 5HR2A 2GVPA 5IOXA 4KB3A 3F8UA 5KN1A 1ABAA 3DYRA 1GSEA 2YJHA 2D2ZA 5IM9A 1K3LA 3JCML 2CQ9A 3FY7A 4MZCA 4QQ7A 1MEKA 1M9AA 4L5LA 2V6KA 3ZZXA 4XRAA 2JADA 1F3AA 1A0RP 3EINA 2PWJA 4WXTA 2JZSA 3D6IA 3IR4A 5D9WA 11GSA 2C1YA 4QL7A 4J2FA 2C3TA 1OE8A 3HZ8A 4V2LA 1GP1A 4LLRA 4XIHA 3C1SA 1SENA 4HZ4A 4ULXA 4MF5A 2RM5A 3WYWA 3RPPA 4TXOB 4FYUA 1MDIA 1FO5A 4I97A 1GH2A 1WMJA 4MZWA 5DCHA 1ZGNA 4F9ZA 4EC0A 1OVNA 4X1UA 3GIXA 2H8LA 4YQMA 2WDUA 2PPTA 4V1Ag 3BD2A 2X8GA 2DJ1A 4N11A 5COHA 1Q98A 4RI6A 3TB2A 1HD2A 3KMOA 1F6MC 1OC9A 3H1NA 2L4CA 1BG5A 2H1AA 1J08A 2DJ3A 4KSMA 1A8LA 3DKSA 3K8NA 3TKPA 2P5RA 4JU5A 1Z9HA 1G0TA 1W4VA 3TUEA 3IOSA 3NOFA 4PQHA 2IIYA 4K2DA 4QL9A 1TKDB 5F8BA 3KMNA 2I9HA 2FWHA 2H6ZA 2PN8A 1FG4A 2AB6A 1GTBA 5GAND 1XWKA 2LSTA 1X5CA 4ILFA 1M7TA 2VD1A 3CSJA 2BTOT 1AQXA 1EV9A 1Z3EA 4FO5A 4LL1B 1Q4JA 1DSBA 4POBA 3LQ7A 3HJOA 3E3EA 1GUKA 2H71A 3TJBA 2KP2A 2VCTA 2R3XA 2HFDA 1TK8B 3GSTA 4ZB6A 2RUFA 1V9WA 2GTUA 2XBQA 4NHZA 1SK2A 3DGQA 4RQRA 2JACA 3ME8A 1EWXA 3GX0A 4MJCA 5CRDA 4EDYA 2MBTA 3Q18A 3J7Yk 2KP1A 1IYHA 2YANA 1VRSD 3L9UA 1OKTA 3TKSA 1EGOA 2JZTA 1FAAA 1WOUA 5B7CA 2NPBA 2GSSA 1SL1B 2XPEA 3QPMA 3WGDA 22GSA 5HFIA 2WFCA 2R5GA 4FH8A 5JWRB 2GT5A 1YKAA 2R4VA 2OA7A 2O8VB 4H86A 4IW9A 1EZKA 4PX1A 1XW6A 2C0DA 2J23A 4V1Ap 3HVXA 3L9SA 2FWEA 1E6BA 3LG6A 2V32A 3VI5A 2FY6A 2VUPA 2VM1A 2C80A 2GQMA 1NW2A 1WIKA 1T7PB 3ZFLA 1A2JA 2E2GA 4K7IA 3GH9A 1DBYA 2E2MA 3FK8A 3BCIA 2LJKA 2P0GA 1V58A 2XHFA 1FVKA 2DJ2A 3Q74A 1GTUA 3TKQA 1PMTA 3M8NA 4PNFA 3MAKA 5F05A 4PNGA 5AN1A 1QXHA 3EMPA 2MBSA 19GSA 3F0IA 4IJIA 2FGXA 1XOBA 2L59A 4OFMA 1WE0A 5D9XA 1M2AA 4EKZA 3SWLA 3CTFA 2H76A 2LV3A 1TK0B 3H4KA 3LXTA 5CNWA 4AJ7A 1ILOA 1R4WA 1WP0A 2OKAA 2B7KA 1JZWA 3DVWA 1FB6A 1XW9A 4KUNA 3KH7A 2LS5A 1JZRA 2MMAA 1TJDA 2RM6A 1TK5B 1E2YA 1AW9A 1XCCA 4WR5A 5AGYA 2PVOC 2IPAA 2LEGA 3HVVA 4NV5A 4WF5A 4MABA 4AGSA 4ZBAA 1SKRB 5GAPD 4XTSA 3CYNA 4ZL8A 2X64A 3D4TA 4NMUA 2B5XA 4KSOA 5H5QA 4JE1A 1S3CA 4F0CA 1H4OA 4CW9A 5DDLA 3GA4A 2YV7A 3KM6A 1A24A 2MMOA 5A4UA 4TW5A 2HT9A 4KNDA 2OADA 1GUMA 4MK3A 3H79A 4JZQA 4PQIA 1SJIA 1Y6EA 5F06A 2GLRA 4TKYA 1O8XA 5IMCA 4GQFA 1FHEA 3TDGA 4HEA2 1A8YA 2L4QA 1J0FA 1HNBA 1ML6A 3IK9A 3QAWA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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