1ZYEA

Crystal strucutre analysis of bovine mitochondrial peroxiredoxin iii
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
PAVTQHAPYFKGTAVVSGEFKEISLDDFKGKYLVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDKASEFHDVNCEVVAVSVDSHFSHLAWINTPRKNGGLGHMNIALLSDLTKQISRDYGVLLEGPGLALRGLFIIDPNGVIKHLSVNDLPVGRSVEETLRLVKAFQFVEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Thioredoxin-dependent peroxide reductase
publication title Bovine Mitochondrial Peroxiredoxin III Forms a Two-Ring Catenane
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
molecule tags Oxidoreductase
total genus 49
structure length 162
sequence length 162
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2005-06-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1zyeA00
4EUYA 3ISOA 3ZFLA 3C7MA 2NVLA 5ECMB 1JZDA 1BQ7A 3ZFBA 2HT9A 2AJQB 2YANA 2V6OA 1BAYA 3IXRA 3NZNA 14GSA 2LJKA 4ILFA 1SU9A 4XRDA 3O6TA 3FR9A 1XWBA 2LJRA 1JZRA 1YQ1A 2JSZA 1PKWA 1MDIA 2H75A 3HY2A 3CSJA 2PU9C 3IPZA 2H30A 4DEJA 3DVXA 4QL9A 3KM6A 8GSSA 2EC4A 5ABRA 2VUPA 3DMLA 5INYA 2PWJA 5ELAA 2JZSA 18GSA 4KB3A 3Q6OA 5E4WA 6GSXA 3G7IA 3DKSA 2IMDA 1ZYQB 4BL7A 3ZL5A 3TGZA 3ZYWA 1ML6A 1TRSA 4OFNA 5ENUA 5H5RA 3F6FA 3GKKA 2I81A 4DVCA 1AQWA 4GRFA 4KUNA 1A2MA 4DSQA 2DJ2A 2GQMA 4E8HA 1XWKA 1GWCA 2GGTA 2VCTA 4F9ZA 2LS5A 3PINA 2E7PA 4RQXA 2JL4A 1B9XC 3KGKA 4V2NA 1FO5A 3BOAA 4HI7A 4I2UA 2NPBA 4ZBDA 3MSZA 1XPVA 5DALB 1ERVA 3QD9A 3GMFA 2B7JA 3APQA 4AJ8A 3BCKA 1MDKA 2D2ZA 4ZIJA 11GSA 5F06A 3HJMA 1S3CA 3IK7A 2M46A 1PKZA 4TXOA 1AW9A 2HYXA 2Z9SA 4TRXA 1OE7A 1OC3A 3VWVA 1CQHA 2HZFA 3DIEA 1F3BA 2B5XA 2E0QA 4K1FA 1H4OA 2YZHA 4V2LA 1FOVA 3CSHA 4ZB8A 4NV5A 2DIYA 1JZWA 4RUVA 12GSA 1QUWA 1S3AA 2FA4A 3I6AA 4YQMA 3UARA 2OE3A 5CRDA 2MZCA 19GSA 1E2YA 4XS4B 1AUCA 3OR5A 3FZAA 2I4AA 3TOUA 3E3EA 4LMVA 1WP0A 3D21A 4MPFA 4MJCA 1RQMA 2V32A 3IAM2 2HNLA 2XC2A 5G1KA 2JSYA 2YWIA 5ECRB 3UEMA 5COHA 2HE3A 1TJDA 2LTKA 1YEPA 2H6ZA 1QK8A 4KX4A 2PPTA 2MBTA 3F63A 3I43A 3TRPA 5IPHA 1SJ6A 4BVYA 4G10A 2FCHA 1N2AA 2FA8A 4HEA2 4CW9A 1EGRA 3WD6A 1M2DA 2F51A 2O8VB 2F8AA 4I6XA 1M0UA 5AIVA 3KCMA 3FZ5A 4RQRA 4HUAA 2YOIA 1B4PA 2FY6A 2VL2A 3TB2A 4MH2A 3GTUB 4BVXA 1YDKA 3MDKA 1CQGA 3RPPA 1GNEA 2OA7A 2WB9A 2PUKC 3GHAA 3TKRA 5E59A 3KZQA 4N30A 1HNCA 3GURA 3LXTA 2XHFA 4IQAA 4HDEA 1WE0A 3MWHA 1GP1A 3C8EA 3H4KA 1SK0A 1ABAA 4WR5A 1A2LA 6GSUA 3CYNA 4J56E 1VF2A 17GSA 1E6BA 3FHKA 4WF4A 3GSSA 2K18A 1XW6A 2L6DA 2KP1A 1PQNA 1U3IA 1MDJA 2K6VA 1JZOA 4KDYA 1M2BA 2H1GA 2AAWA 1KNGA 3PR8A 2LUSA 4MPGA 1T4YA 2IL3A 2WCIA 5D73A 3U6VA 4L0WA 5JWQB 3A2VA 1TDIA 4MA9A 2VOCA 1XW9A 4GF0A 2HI7A 4AGSA 2B5EA 3BBYA 1WJKA 1XWAA 2VCQA 4TN8A 4EL1A 4MCUA 1Z7RA 4KAEA 1I5GA 3PH9A 5DALA 2A4VA 4WF5A 3TKSC 1FVKA 5ECKB 1BEDA 4NHZA 4K7IA 4EVMA 2O85A 1N8JA 4KA0A 3AY8A 1X0RA 3UBLA 1R26A 4K6XA 4K7OA 2PVOC 2CVKA 3ERGA 2REMA 2RM6A 2V41A 1WIKA 3H79A 3CXGA 2MYGA 2VLTA 2XBIA 3W6GA 2JACA 1YJ6A 4TR4A 4GSTA 3GX8A 4ZBAA 4HU7A 2F9SA 5KN1A 4PNFA 5EPFA 1GSYA 2WS2A 6GSWA 3ZREA 2PERA 4PXOA 1XXUA 1UVZA 2R2JA 4YAPA 1Z9HA 1QFNA 1X5EA 2OJLA 2EIQA 3GFKA 3TUEA 1C72A 3EU4A 3E0UA 3M9KA 4PUFC 2GQKA 1O81A 2VO4A 2RM5A 5ECPB 2YN1A 1Q4JA 5B6MA 4HJ2A 4AJ6A 2K8VA 4KSOA 4LA1A 4ZB9A 2AUVA 1ZMAA 1SJIA 1TI3A 4Z7XA 2MMOA 3VURA 1K3YA 1GSUA 3GKMA 4MP4A 3F4TA 1EV4A 1SD8A 4OO4A 3GKNA 3GTUA 1UA5A 2JU5A 3ZZXA 1F2EA 4CHSA 3FRCA 1KEBA 3LWAA 1F37A 3NOFA 1VF4A 3H8QA 1MTCA 1XVWA 3HJPA 4I2TA 4ACSA 3GIXA 4AJ7A 1G0TA 4GCIA 2BTOT 4I97A 3QAWA 5J9CA 1Q98A 3HYPA 4KSMA 2HZEB 3F8UA 2YP6A 3A2XA 1Z5YE 2YWNA 2VL2C 5F0GA 2CAQA 2FWHA 1PA3A 2I9HA 2KHPA 3FR6A 4QQ7A 3TKPA 2LQQA 5G1LA 1K0CA 5ID2B 5IO0A 4XTSA 1A23A 2XPEA 4IS0A 5IMDA 16GSA 5KN0A 4ZL7A 1T8EB 3QOUA 4PURA 2H70A 1A8LA 2KLXA 1EOHA 1PX6A 4I5QA 2O87A 2DSAA 2C3NA 2CQ9A 2OKAA 3LEFA 4DSRA 2HFDA 5FHIA 2R3XA 3GN3A 2EIOA 5G5FA 9GSSA 4KCAA 1XW5A 4MJAA 2H73A 4K9ZA 4X1UA 2OE1A 3P2AA 5IMZA 3W8SA 5F05A 1R7HA 2XBQA 3GV1A 3ME7A 4TOPA 2C8UA 4ID0A 3C71A 1GLQA 2C80A 1EWXA 1K3OA 2H19A 1GSDA 5GAND 2IJYA 2ON5A 4NAXA 1V40A 3LYKA 4L5LA 4TXVA 3IE3A 4E8EA 1IYHA 4OFMA 1GTUA 1TRVA 5G31A 2YNXA 3DD3A 3IHQA 1K0BA 1SKWB 1ACVA 1JLWA 7GSSA 3ME8A 1EEJA 4FO5A 3KP9A 4BA7A 3LG6A 3VLNA 5A4VA 2LSTA 2LJAA 2WFCA 2C4JA 1OE8A 5CAXA 4POLA 6GSVA 3VK9A 1QMVA 4EDZA 1TKDB 2RLIA 1WRYA 4FYUA 3ZIJA 3L0HA 5ECSA 4TVEA 3F4RA 2E2MA 3GNJA 4NV2A 3VI5A 4O7HA 4N0ZA 4G2EA 4MLYA 2LRNA 3FR3A 1ZYEA 1B4QA 3VI7A 2DMLA 2PMTA 5DCHA 5ECHB 3I69A 2F3MA 4WXTA 2KOKA 1Z3EA 1ZOFA 1K0DA 2VD0A 3CRTA 1OAZA 1KTEA 2RUFA 1SJZA 3F3QA 2B5YA 3TCOA 3WGDA 2CX4A 2M80A 2VL3A 3EWLA 1SKRB 5ECQB 2DJKA 4ZBBA 3HCZA 3RHBA 1AQXA 5DDLA 4MF6A 2GSRA 4KE3A 2X8HA 2CVBA 5J3RA 4KH7A 2GZZA 5D8IA 4YQVA 4ML1A 1X9MB 4XRAA 2IFQA 1GTIA 2LKUA 1EZKA 5KN2A 3D22A 2EIRA 6GSSA 5CNWA 2HZEA 2YCDA 5A4WA 4PQIA 3HZ4A 4JZQA 3EMPA 2GQLA 4L8EA 3CTGA 3UVTA 5DBQA 1LBKA 5GSSA 2IMKA 2VCXA 4HOJA 4MABA 4PUAA 2X64A 2YV7A 3CRUA 1ON4A 1RK4A 5ID2A 5AISA 3DEXA 3EU3A 2OADA 1A2JA 2O7KA 1OC9B 1TTZA 1YF1A 3VPQA 2L6CA 4GQCA 1TK0B 4FH8A 3LJRA 2HRNA 2IMEA 3QFBC 3UL3A 2H76A 5JCGA 3BCIA 3QR6A 3IR4A 4OO5A 1M7TA 5KEJA 2PBJA 4WBRD 4WKWA 1ZCPA 2GDRA 2LNSA 2ZUPA 3P8WA 3IOSA 4TR3A 1PSQA 2AB6A 4MZBA 3GSTA 2DJ0A 1PL2A 3WGEA 3D4TA 1JFUA 3M8NA 1QGVA 4K7NA 4PNGA 3KIJA 1B9YC 1AXDA 2GT5A 5IM9A 2VAFA 2H8LA 2LV3A 5C00A 5LNKe 3L9UA 2ON7A 1X9WB 1T1VA 5B6NA 5CREA 4J2FA 3ZIVA 4KGIA 4NXIA 1G6WA 5L71A 4OD7A 2TIRA 2N5AA 4F03A 1KBNA 1DSBA 4PGTA 5AIXA 2YZUA 4IGJA 3EURA 1NHOA 2X8CA 2LRTA 2TRXA 3IK9A 4EF0A 2A2SA 3UVHA 4IKHA 3E9JB 1O85A 1R5AA 2H66A 1OYJA 2PN8A 3F0IA 4X43A 2N5BA 2OE0A 4MMMA 2DJ3A 4EC0A 1AAZA 4LL4B 4V2MA 3EC3A 3NIVA 3ZVJD 2LNTA 3TJGA 3TKQA 1SYRA 3IDVA 5IMCA 1GUMA 3ZMLA 3QAGA 3G7YA 2H1AA 4RI7A 3LQ7A 4AF2A 5AGYA 2A2RA 1BX9A 1G7OA 1X5DA 4MZWA 3QAVA 3A2WA 4OMVA 5D9TA 2H0GA 2H01A 5DQSA 4LL1B 3US3A 3KJYA 1SK1A 4ZL8A 3LORA 3VWWA 4XS6A 2E2GA 5IPGA 2WJUA 4L5OA 2H6XA 1T4ZA 1QXHA 2CZ3A 5F8BA 2B3SA 1NW2A 5DJMA 2AYTA 3UAPA 5D9VA 5EY6A 3WT2A 1SL0B 1T3BA 5CRGA 3IV4A 3O3TA 1YEXA 4IN0A 3M9JA 1WMJA 4O92A 4NMUA 1USBA 2K8SA 4HQSA 1XIYA 4GSSA 1YKAA 2ALBA 1GTBA 5CYYA 2GTUA 4Q5QA 3KH7A 2QC7A 5IOXA 5H5SA 2RIIA 1O8XA 2MBSA 2IMFA 4JEDA 4OFTA 3RAZA 2RUEA 3APOA 3N5OA 1MEKA 2GZPA 1OC9A 1J08A 4Q5FA 2IN3A 4XS4A 2YJHA 4MJBA 1ZL9A 3CBUA 5J4UA 4MJEA 4N0VA 2CV4A 1SYXA 3H93A 3DWVA 1VF3A 2GVPA 1T7PB 3KXOA 4I8BA 4Q5RA 3QFAC 3F4SA 3J7Yb 2WRTA 2VCZA 1EGOA 3UOMA 5IIZA 1WWJA 1V98A 3KH9A 3TDGA 1U87A 4KW6A 3TRXA 3KP8A 4ECCA 3GH6A 4GQFA 3KTLA 5IQYA 1EOGA 2WZ9A 4JBBA 1Y25A 4BWSA 1TRUA 2FLSA 3WGXA 3L9SA 1XWGA 2H1DA 2QGVA 4FYBA 4G19A 5IMFA 1FHEA 5HR1A 5J41A 1ILOA 1ZZYA 4ECIA 1ERTA 1O8WA 1MD3A 1U3AA 1F3AA 1SKSB 4POKA 1HD2A 4ZXGA 5ELGA 1Z6MA 1GLPA 2GT6A 1QQ2A 4MZCA 3RDWA 3Q74A 4NHWA 2DBCA 1M9BA 4GSNA 1VF1A 1J0FA 4XHMA 5F07A 1BG5A 4WBJA 3SBCA 3HVSA 4HS1A 1GH2A 4EDYA 3DVWA 2P31A 2C0DA 5IMAA 4MH3A 1TW9A 1V9WA 3S9FA 3W8JA 3C73A 3LXZA 2LRCA 4YAVA 3RHCA 4HU9A 2OBIA 3DRNA 5A4UA 4F0BA 3HHVA 1SENA 4HZ4A 5CRWA 2J23A 1FVJA 2X8GA 4XIHA 4QL7A 2I1UA 2B1KA 1JLVA 13GSA 3FZ9A 2VL9A 4PX1A 1SD9A 5KN3A 4V1Ag 2GS3A 5HR0A 1TK8B 4RI6A 2O89A 3IRAA 5B7CA 4K2DA 3GL5A 2CT6A 1FB0A 1AC1A 2V6KA 1M2AA 4HJMA 2MMZA 1DUGA 2JADA 2IPAA 1EV9A 3TJKA 1V2AA 5GZZB 4HZ2A 1YKCA 3TJBA 5DAKB 1FG4A 3ERWA 1Z7PA 4D73B 2WULA 2F8FA 4TR1B 1M9AA 3C1SA 3D6IA 2R4VA 3DYRA 2GSQA 5ECOB 3D4MA 2C3TA 2PVQA 4ECJA 2R6KA 3DXBA 5D96A 4N11A 2QSIA 3M3MA 4MDCA 5HFKA 4TW5A 4ZILA 1F9MA 2DC5A 1OKDA 3FEUA 5HQPA 1GULA 1EP8A 2V1MA 4GLTA 3A3TA 1V58A 3P90A 3G9BA 4MF7A 4PQ1A 1FAAA 2DIZA 1O6JA 1GTAA 1URMA 1O73A 5C04A 6GSYA 1VRSD 1XCCA 2C3QA 2FWGA 3CMIA 1GSSA 1BYEA 2FNOA 2R5GA 5J5NA 4V1Ap 2BJXA 3F6DA 3GUSA 1PD21 4K0NA 1ZGNA 3GA4A 5HFIA 3SWLA 4IBPA 1JHBA 3Q18A 3KD0A 5ECIB 1PN9A 3TKSA 2AHEA 3VWXA 5CRHA 2MMNA 4ZB6A 2CA8A 2X99A 5LD0A 1TK5B 1YY7A 2L4QA 1X5CA 1LJRA 1AIUA 3F9UA 4IQ1A 2R37A 3L78A 4EO3A 2VM2A 2LQOA 2KUCA 2H1BA 4TR0A 2G2QA 1NSWA 3TJFA 4GTUA 3BD2A 3ZRDA 2H0IA 4NPBA 5DJLA 1SL2B 4IJ3A 1R4WA 1NM3A 2YPMA 4KDXA 3HVXA 1MD4A 1DE1A 1A8YA 4KDUA 4JU5A 1GUKA 2L5OA 5A5KA 3FY7A 2J9HA 4MK3A 1ST9A 2V2GA 2HXKA 2B6MA 3RPNA 5D9WA 3LGCA 5CO3A 3N9JA 1EEMA 3DGQA 1PL1A 4F2IA 1OVNA 3CTFA 3WYWA 3KTBA 1XVQA 2YWMA 4H86A 1FB6A 4GWRA 4K8MA 5JWOB 1T00A 2NTOA 3JCML 1PMTA 1DBYA 5DVBA 2YWOA 2DLXA 5DAKA 3KMOA 3HJOA 3FYGA 3UJ1A 4D73A 3EVIA 4BPYA 4TR1A 1H75A 1V57A 5ECLB 2HLSA 2NDOA 2B7KA 1WPIA 2G0FA 3I9V2 5AN1A 4JRRA 3GX0A 1FW1A 1J9BA 5G30A 4XS1A 4ZL9A 1I9DA 2ZCTA 3F3RA 2FUG2 3HKRA 2QKEA 1EP7A 2H74A 2YJ7A 2VLVA 4F82A 5GSTA 1PX7A 2FGXA 3TOTA 3ZTLA 3GRXA 5DCGA 2DJJA 1GRXA 1DE2A 2XPDA 3VFIA 1AQVA 4X0XA 3HDCA 3LSZA 3VPTA 3M1GA 3QDNA 4ML6A 3EYTA 2I3YA 3CSIA 3KMNA 1PGTA 3IA1A 5B8BA 4EE0A 3LFLA 5G5EA 1XZOA 1GNWA 4DSSB 1TXXA 1GSEA 4WR4A 4P3YB 2K9FA 4JR4A 1BJXA 2H71A 3TJJA 1HQOA 1UN2A 3O76A 1Z6NA 3GL3A 3L9VA 4IP6A 2VD1A 5JWRB 2LEGA 1SL1B 2GLRA 5DQYA 3TKSE 5CP1A 5GAPD 3D0ZA 5EVOA 6GSTA 3FK8A 1TP9A 1W89A 3A5WA 4ECBA 4KCEA 2VM1A 2NBSA 1HNBA 5IMVA 2WDUA 4FIWA 1X9SB 5ECNB 3EE2A 1XFLA 2AV4A 1GUHA 2B1LA 4FYCA 2DJ1A 2ES7A 5EL8A 2OBKA 1TI1A 4JR6A 3APSA 4OCEA 3ZVJA 3VWUA 1IYIA 2N5FA 1K3LA 1A0RP 2VCVA 1K0MA 5D9XA 4KNDA 4YH2A 4WETA 2FWEA 3L4NA 1HNAA 2KP2A 2L4CA 3H1NA 3MNGA 4LMWA 4IVFA 1W4VA 3BJ5A 1G7EA 3FW2A 1LU4A 3R2QA 4GXZA 1K0OA 4WEYA 4JE1A 10GSA 4IELA 3IAS2 2FWFA 1TU8A 1UC7A 2JZRA 2OACA 2L57A 3QPMA 4O32A 2L59A 2DMMA 5JCUA 4ISDA 2H72A 1WOUA 2IIYA 2M72A 2IMIA 3ERFA 3EINA 5IO2A 3PGTA 1RW1A 2IWTA 1B48A 2L5LA 3HZ8A 3QCPA 3P7XA 3QMXA 3KEBA 3FKFA 3GYKA 3LYPA 5D93A 2H0HA 3D5JA 2BMXA 4Q5NA 2TRCP 4TKYA 4ULXA 2H6YA 1OC8A 5LCZA 1K0AA 1XWCA 4EKZA 2FHEA 1O7UA 2VLUA 3M0FA 4MF5A 1U88A 2GSSA 3IC4A 1GSFA 3V1WA 3WT1A 4IHUA 2HRFA 2GZYA 3ZLPA 2C1YA 4LLRA 1U6TA 1TOFA 1A0FA 3EMXA 3HXSA 4IW9A 1A24A 1OKTA 3G7JA 5G2ZA 2CX3A 3FZ4A 2VIMA 2C0EA 2HSHA 5J9BA 4PQHA 1TRWA 4IP1A 2FD3A 3K8NA 2HSYA 2P5QA 1ERWA 2P0GA 4J57E 3U5RE 1S3DA 3RBTA 5JCWA 3UMAA 2WGRA 1ERUA 2VCWA 4DSSA 2CZ2A 4BWQA 2C0GA 5HFGA 1G6YA 5HR3A 1R5PA 5B8AA 3GH9A 5HR2A 5IOWA 22GSA 2IFQB 3UBKA 1THOA 4YQUA 4TXOB 3UIWA 3ED3A 3IBHA 4G9HA 3HD5A 4OCFA 3Q19A 4CDOA 5FT3A 1YF0A 4L0UA 5FWGA 1XBSA 1VGLA 4IJIA 3J7Yk 4F0CA 4POBA 1XOAA 2P5RA 3MAKA 4HQZA 1PRXA 2MMAA 5H5QA 1F6MC 2CVDA 1NHYA 2ZNMA 1Y6EA 4N10A 1TU7A 3ZITA 1M99A 4POMA 2C0FA 1GSQA 1THXA 2CAIA 3HA9A 1SK2A 2YV9A 2GSTA 4K0GA 4O5RA 1B8XA 1K0NA 3C1RA 4XCSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite