3F8UA

Tapasin/erp57 heterodimer
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
469
structure length
469
Chain Sequence
SDVLELTDDNFESRISDTGSAGLMLVEFFAPWCGHAKRLAPEYEAAATRLKGIVPLAKVDCTANTNTCNKYGVSGYPTLKIFRDGEEAGAYDGPRTADGIVSHLKKQAGPASVPLRTEEEFKKFISDKDASIVGFFDDSFSEAHSEFLKAASNLRDNYRFAHTNVESLVNEYDDNGEGIILFRPSHLTNKFEDKTVAYTEQKMTSGKIKKFIQENIFGICPHMTEDNKDLIQGKDLLIAYYDVDYEKNAKGSNYWRNRVMMVAKKFLDAGHKLNFAVASRKTFSHELSDFGLESTAGEIPVVAIRTAKGEKFVMQEEFSRDGKALERFLQDYFDGNLKRYLKSEPIPESNDGPVKVVVAENFDEIVNNENKDVLIEFYAPWCGHCKNLEPKYKELGEKLSKDPNIVIAKMDATANDVPSPYEVRGFPTIYFSPANKKLNPKKYEGGRELSDFISYLQREATNPPVIQEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into MHC class I peptide loading from the structure of the tapasin-ERp57 thiol oxidoreductase heterodimer.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Protein disulfide-isomerase A3ERp57
source organism Homo sapiens
molecule tags Immune system/isomerase
total genus 137
structure length 469
sequence length 469
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2008-11-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
A PF13848 Thioredoxin_6 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3f8uA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3f8uA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3f8uA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3f8uA03
4IKHA 2OBIA 1JZRA 1BEDA 5DBQA 2LSTA 4EDZA 4TRXA 2JL4A 1H75A 1NHOA 1AW9A 4LMVA 2DJ2A 4F03A 3O6TA 1OE8A 5L71A 3CRTA 3GRXA 3A3TA 6GSUA 3ZYWA 3M1GA 2LNTA 4AJ6A 3TRXA 3RHBA 2KP1A 2TRXA 5G1KA 3J7Yk 4EXJA 2I1UA 1GSQA 3DGQA 3TKPA 2WDUA 2XBIA 3GTUB 5DJMA 5DQSA 1EOGA 2N5BA 1BX9A 4XS4A 3BOAA 1X0RA 2IMFA 4BVYA 4AJ7A 1S3DA 1U88A 5IMAA 2DMLA 3TRQA 3EYTA 3NZNA 1BAYA 2VOCA 1R7HA 3M3MA 1NW2A 4HU7A 3DD3A 1URMA 1JFUA 2YWMA 4TR1B 3MDKA 5ECOB 3C73A 4J57E 6GSXA 4K0NA 3D4MA 3KH9A 4GSTA 5GAPD 1OC9A 4QL7A 2R37A 4MH2A 2HSHA 4TXOB 1PMTA 3HY2A 4IELA 4MMMA 4EDYA 1T1VA 1O81A 2DJ1A 3A2WA 3LQ7A 1O85A 5ECIB 3F4TA 2MBSA 4KB3A 2TIRA 1OYJA 1NSWA 1ZMAA 2VLTA 3M9KA 3D6IA 1S3AA 4RQXA 5D9TA 4FO5A 1X5CA 3HJMA 4DSSB 3RPNA 2GDRA 1TDIA 3HHVA 3L9SA 4I5QA 3VURA 20GSA 2YPMA 3APQA 4AGSA 2XBQA 4POMA 2HT9A 2CT6A 1QFNA 3ERFA 1QUWA 5J9CA 2PU9C 1EV4A 22GSA 3MWHA 3TKRA 2PVOC 2WB9A 5E4WA 3CTGA 1PA3A 4GXZA 1XVQA 2OE1A 3KMNA 1W4VA 4I6XA 1PSQA 5B7CA 3P2AA 3CTFA 2A2SA 4LL1B 13GSA 1WWJA 3VWXA 1K3OA 1A8LA 2A2RA 1SKWB 4JZQA 2XPDA 4MZCA 3TJKA 4XRDA 1XZOA 1TKDB 1EP8A 2DSAA 5GZZB 3U6VA 2VL9A 4WEYA 2I4AA 1V57A 1HNCA 3IE3A 1EZKA 4PNGA 12GSA 2HYXA 4POKA 3GURA 3LFLA 1A24A 2OADA 6GSWA 3EURA 4K0GA 2YV7A 1FVKA 1ZOFA 4JR6A 4PQIA 1SENA 4HQSA 1M2DA 3SWLA 3GKXA 4OCEA 1NM3A 2V41A 1EGRA 4D73A 3H93A 2O87A 1CQHA 2P0GA 4GSSA 4I8BA 1GSYA 3FZ5A 3J7Yb 2LRTA 3KCMA 4WETA 4NV2A 3GV1A 4EE0A 3LYPA 2F9SA 1GLPA 2C0GA 1YJ6A 4PQ1A 1R4WA 4KDYA 3HZ4A 1AC1A 4CHSA 2LQQA 3Q19A 3UMAA 1V98A 1Z7RA 1FAAA 2PPTA 1HQOA 2HRNA 2CAIA 4KW6A 4GQFA 1JZWA 1G0TA 2IPAA 3EMPA 1AUCA 6GSYA 4N30A 4EC0A 2H19A 4POLA 3H1NA 3LORA 1Z5YE 1PGTA 3WT2A 2VCZA 4N11A 5D96A 3PGTA 2K9FA 2C80A 4HS1A 2GZPA 2OE3A 2ZNMA 5LD0A 3GFKA 1F3BA 2G2QA 2DJ0A 4IQAA 1K0DA 3HCZA 1YY7A 1THOA 4HJ2A 3F6FA 1A2JA 2IWTA 3IBHA 2QC7A 1SKSB 3QCPA 5EL8A 2O85A 5EPFA 3L78A 2HI7A 1SYXA 1G6WA 2B1LA 4IJ3A 1M7TA 4QQ7A 3BJ5A 3FZAA 4BA7A 3VI5A 3TOTA 3QAGA 3EVIA 4WR5A 3EC3A 4ML1A 1MDJA 2NVLA 1OC3A 4PUFC 4TOPA 5A4UA 3VLNA 5LCZA 3ZIJA 4E8EA 4ZBDA 4RUVA 1AQXA 4TR3A 3HXSA 2HZEB 2H76A 4OO4A 1ST9A 3FW2A 1FHEA 1U87A 2YJ7A 1XVWA 4ML6A 3GIXA 2H6YA 2WULA 5JWOB 5HFGA 4JRRA 3CYNA 3Q18A 4BWQA 4HU9A 3VWWA 2B7JA 3A2VA 3QAWA 4NHWA 3FHKA 1GTUA 2R3XA 5AGYA 1LBKA 1GSEA 3IDVA 1QQ2A 1UN2A 1XCCA 1E6BA 4ECCA 4WBRD 1V9WA 3H8QA 1H4OA 2R6KA 2B5XA 2B6MA 2VCXA 2X8HA 5IO0A 4ZB6A 1JHBA 1EGOA 4GLTA 3GX0A 4N10A 5F06A 1GULA 2KHPA 3D5JA 4OWYA 4POBA 4PNFA 4V1Ag 2R2JA 4V2LA 1Z6MA 18GSA 1M99A 3M9JA 1ZCPA 3HD5A 4GQCA 2B3SA 5A5KA 3IR4A 2VAFA 2O89A 2YWOA 2VD0A 2PN8A 2I81A 3FY7A 3UVTA 3DYRA 4KNDA 1ML6A 2YZUA 2EIQA 3F6DA 2H75A 4Q5FA 2C0DA 2HNLA 2E0QA 4MLYA 1YQ1A 5E59A 4J2FA 4EVMA 3ZMLA 4WF4A 3TJBA 1SJZA 1DBYA 5JWQB 3CSJA 4KGIA 2XPEA 4HEA2 2HFDA 4NV5A 3L9UA 3KJYA 1VF1A 2WZ9A 1PRXA 5DALA 3DVWA 1UA5A 2JADA 3UL3A 1XOAA 5DVBA 3RHCA 1GH2A 4NHZA 1X9MB 2FGXA 4ZL7A 4ZB9A 4GTUA 2VO4A 3AY8A 1K0OA 2XC2A 4KA0A 5B8BA 4DEJA 1E2YA 4PX1A 3VWUA 1RW1A 2V2GA 4I2TA 2CVBA 1A23A 4V2MA 3IK7A 4GWRA 1OE7A 4DSQA 2N5AA 3GHAA 3KGKA 2IMKA 5D9WA 3UVHA 5F0GA 3G9BA 3QFBC 1TXXA 2O7KA 4F0BA 4RI6A 2XHFA 3LJRA 4ZL9A 3TKSE 1U6TA 5F07A 2YN1A 3IAS2 2IL3A 5LNKe 1TK5B 2PERA 2E7PA 2R4VA 1GNEA 1LJRA 3TGZA 1F3AA 1K0AA 1UC7A 4MJAA 5ECHB 4GCIA 4NWYA 1B9XC 2A4VA 2QGVA 3TJFA 2L5OA 1N2AA 2AUVA 1OKDA 2CQ9A 2H0GA 5IO2A 2VCQA 4L0WA 1R5PA 3EMXA 3IPZA 2HXKA 4MA9A 1GUMA 2FA8A 4V2NA 4IW9A 3C71A 4N0ZA 3LGCA 2K18A 1I9DA 2H74A 2F51A 4Q5NA 3DRNA 3BCIA 3MAKA 1XWKA 1ERWA 3VPQA 4G10A 2JU5A 4NXIA 1GL8A 1Q4JA 2H0IA 5H5RA 1J9BA 3QD9A 1TP9A 1KBNA 2GQKA 3TJJA 5IPHA 3UEMA 3V1WA 1WPIA 2GGTA 4ISDA 4WF5A 3LXTA 2GS3A 2H30A 2LRNA 1A0RP 3TDGA 3EINA 1QMVA 2L6CA 1M2AA 3ZITA 4K9ZA 4ACSA 4ID0A 2L4CA 4ULXA 3M8NA 2CX4A 4JR4A 4PUAA 1J0FA 4V1Ap 4ZIJA 4F2IA 1GSFA 1IYIA 1GP1A 2FCHA 4CW9A 2LV3A 4HI7A 1ZL9A 1Z7PA 3UBKA 1S3CA 3G7IA 4XS4B 1MDIA 4HUAA 1XW9A 1X5DA 4ECIA 4G2EA 3EWLA 4X0XA 4HQZA 5D8IA 2KLXA 4Z7XA 1VF2A 3KXOA 3WGXA 1JLWA 2L59A 5HFKA 1X5EA 2FD3A 2JZRA 1V2AA 2VL2C 1Y25A 4E8HA 3FEUA 4IS0A 5IOWA 1ACVA 2C3QA 1KNGA 1F9MA 3RPPA 1BYEA 3KMOA 3DVXA 3ISOA 5ID2A 2LQOA 3F4SA 1N8JA 4J56E 1RQMA 5ECNB 2JSZA 1T3BA 3CBUA 1PKZA 1BJXA 4I2UA 4HZ2A 2HSYA 5HR0A 1AXDA 1T00A 1KTEA 1O6JA 1LU4A 4N0VA 3GKKA 3HKRA 4GF0A 1A2LA 5EVOA 2H73A 4KDXA 3F3RA 1EV9A 1GTAA 2H8LA 4ZBBA 2RM5A 1JZDA 3C7MA 3A2XA 3FR9A 4FYUA 1SYRA 2LJKA 1SL1B 3F63A 3O76A 3KIJA 4BPYA 5J41A 17GSA 3IV4A 1C72A 1V40A 3N5OA 1TRUA 5IMCA 4HJMA 2MYGA 4WXTA 3F9UA 4JEDA 5JWRB 4OMVA 1VF4A 3IHQA 3RDWA 3FKFA 3I9V2 2PVQA 1Y6EA 1YEPA 5J3RA 1XW6A 1PD21 4FIWA 2P31A 5KN3A 4MZBA 3P8WA 1HYUA 3WD6A 2PUKC 2C3NA 3IAM2 5G5EA 3ZLPA 3I69A 3C8EA 5IOXA 3JCML 3VK9A 5B6NA 1AQWA 1Z3EA 3BD2A 2LKUA 3HJPA 1XWCA 3KTBA 3CXGA 1OKTA 3RAZA 2GQMA 3VWVA 4JU5A 1EP7A 1K0NA 2HLSA 2DJJA 2VL3A 3TOUA 1YF1A 4O92A 3UOMA 4TVEA 2AV4A 3ZMKA 4H86A 4FYCA 4KUNA 2L4QA 2HE3A 5G31A 1K3LA 2FA4A 5IMVA 4K2DA 5DCGA 4L8EA 2NTOA 2DIYA 2H1DA 2ZCTA 3TKSC 4TR4A 2RUFA 5ECKB 2MMAA 4ZB8A 2GQLA 4D73B 4IHUA 5DCHA 1Q98A 4DSRA 4MZWA 3KH7A 2ES7A 4F9ZA 4ECJA 3GSSA 5G30A 3ZREA 1X9WB 3D22A 1XIYA 3ZZXA 5G5FA 2P5RA 2C8UA 2H6ZA 1TK8B 5H5QA 4PQHA 3W8SA 2VCTA 2N5FA 1EEMA 1TOFA 2NDOA 2OA7A 4F82A 3KTLA 2FWEA 5CRDA 2DLXA 2AJQB 2YOIA 3ED3A 3UAPA 1SU9A 2CV4A 4LL4B 3UIWA 1FB0A 3GUSA 1ZGNA 2LRCA 6GSTA 3FZ4A 3ZFBA 4KX4A 4X43A 3GKNA 4ZXGA 1EEJA 3FRCA 1FB6A 4MF6A 2WGRA 2ALBA 2K8SA 2OJLA 1GRXA 1PX6A 5EY6A 3HYPA 3GL3A 3LXZA 2IMEA 5CAXA 3QOUA 2GLRA 1WOUA 2YP6A 4YQVA 2QKEA 2YANA 5HR3A 1TRSA 1OVNA 1GSDA 3LWAA 4L5LA 3CSHA 5B8AA 1PX7A 5AN1A 1TRVA 3HVVA 3MSZA 1M2BA 1NHYA 5HR2A 2H71A 4EKZA 4WBJA 3L0HA 5CYYA 2X99A 1SJ6A 11GSA 3KEBA 2EIRA 3F8UA 2FUG2 3QAVA 3FK8A 4BVXA 1ERUA 2KOKA 2REMA 1A8YA 4MPGA 3W6GA 3GSTA 2E2MA 3HA9A 2I3YA 1TI3A 5D73A 1GTBA 1J08A 3WT1A 1YKAA 1ON4A 2C3TA 2H6XA 1O7UA 2GTUA 4TN8A 4MJCA 2DC5A 3GL5A 1O8XA 5B6MA 1ERTA 2GT5A 4IBPA 3U5RE 2WFCA 4K7IA 2DJ3A 3CMIA 2OKAA 4MCUA 2C0EA 3FR6A 5J9BA 3I6AA 3ZRDA 1K3YA 2CAQA 2VCVA 2K8VA 3TKQA 2CVDA 4EO3A 4NMUA 1WE0A 4ZILA 2CX3A 1GLQA 5COHA 2C4JA 2GSSA 4O7HA 1B4PA 2LTKA 1T7PB 4FYBA 3BCKA 5DAKA 1YEXA 1SKRB 5CNWA 3IRAA 4ZL8A 2GVPA 3S9FA 1K0BA 2GT6A 4LMWA 4XTSA 5DJLA 4ZBAA 3E3EA 1DE1A 2VCWA 2CVKA 2IFQB 5GAND 2FWGA 2YJHA 4K1FA 4FH8A 3D4TA 4K7OA 4EF0A 3ERGA 2BJXA 3QDNA 2IMIA 3HVXA 1TJDA 3GN3A 5CRGA 1SK1A 2LNSA 4MABA 2JSYA 3QR6A 3IOSA 3P90A 1TW9A 2E2GA 2HRFA 2MZCA 2V32A 3Q74A 5F8BA 2M72A 3PINA 2GZZA 3ZL5A 1XWAA 3TJGA 4TW5A 2DIZA 2NPBA 2IMDA 5AIVA 4L5OA 5ELAA 3SBCA 1XPVA 4EUYA 3GTUA 2D2ZA 4RI7A 4HZ4A 1RK4A 4G19A 2L6DA 1HNBA 1R5AA 3TRPA 5G2ZA 3CRUA 1DUGA 5ENUA 5KEJA 4MJEA 3GA4A 4JE1A 4NAXA 2B5EA 2FY6A 1WIKA 1AAZA 1U3IA 5D9VA 2YCDA 2F8AA 1T8EB 1X9SB 2VM2A 2YZHA 4TR1A 4MH3A 5IMFA 1PL1A 1JZOA 2RM6A 2HZFA 2B5YA 4MF5A 5HQPA 1XWBA 3HVSA 1MD3A 2B7KA 2KP2A 1Z9HA 3DKSA 5F05A 3PH9A 4TXOA 4KCEA 4IP6A 1WMJA 3CSIA 2JZTA 2J9HA 3UARA 2LJAA 2LS5A 3H4KA 2X8GA 1M9AA 5JCUA 4YAPA 19GSA 4DSSA 1A2MA 1AQVA 1YF0A 2FWFA 3A5WA 3HZ8A 14GSA 4IJIA 2L57A 2YNXA 2GSTA 3APSA 3R2QA 2VLUA 1VGLA 16GSA 3O3TA 3WGDA 1TU8A 3FZ9A 3TKSA 1YKCA 5CRWA 1ZYQB 4QL9A 4PURA 2B1KA 2CZ3A 1MTCA 5ECQB 2V6KA 4OFMA 1TI1A 4LLRA 1O73A 5IMZA 1Z6NA 3IXRA 5FHIA 5G1LA 1WRYA 1XXUA 2WRTA 5ECRB 3C1RA 2KUCA 4BWSA 5GSSA 4Q5QA 4K8MA 1OC9B 3H79A 1SL0B 3EU4A 3L4NA 2BMXA 3WGEA 4MP4A 1GWCA 3VPTA 1WJKA 2OE0A 2DBCA 1R26A 4HOJA 2O8VB 1USBA 1ZYEA 3NIVA 3Q6OA 2J23A 3WYWA 1ILOA 5A4WA 4XS6A 3GX8A 4YQMA 3ZTLA 1PN9A 2RUEA 1SD9A 3IC4A 1YZXA 2NBSA 2GSQA 1XOBA 7GSSA 3OR5A 1DSBA 3HJOA 2VLVA 5ID2B 1TRWA 3ZIVA 1ERVA 4KH7A 2TRCP 5ELGA 2GZYA 2K6VA 2FHEA 2H0HA 1M9BA 2EC4A 1I5GA 4EL1A 4PXOA 1SJIA 3FYGA 1ABAA 1TU7A 4KDUA 1PL2A 5JCWA 2F8FA 1TK0B 1XW5A 2R5GA 1B8XA 2F3MA 2VM1A 4KCAA 1YDKA 3DIEA 1F2EA 4X1UA 4XS1A 1JLVA 2PBJA 4K6XA 2OBKA 1UVZA 4MK3A 4IGJA 2IIYA 1G7OA 2G0FA 3KP8A 1G7EA 1SD8A 1OC8A 1XWGA 3N9JA 3TUEA 3GKMA 5CREA 1U3AA 2FLSA 3E0UA 1THXA 2WS2A 3ZFLA 1EWXA 3PR8A 2RIIA 3L9VA 4Q5RA 5GSTA 4AF2A 1MEKA 3KD0A 2BTOT 3IK9A 1TTZA 4OD7A 2V6OA 1MDKA 4TKYA 3M0FA 5CO3A 1W89A 4ECBA 2AHEA 1T4YA 2P5QA 4YH2A 5IM9A 3LG6A 2IN3A 1GTIA 1B9YC 2YWIA 3LYKA 3TB2A 1WP0A 2H72A 5HFIA 2ZUPA 4XRAA 4JBBA 2RLIA 4CDOA 2MMZA 3BBYA 1QXHA 2LJRA 1AIUA 3KZQA 5IIZA 2HZEA 5JCGA 2DJKA 5D93A 5FWGA 4MDCA 4TR0A 3VFIA 1K0MA 1B4QA 1SK2A 5KN2A 1IYHA 2H01A 1EOHA 1O8WA 1F6MC 3KM6A 4I97A 2I9HA 2M80A 2EIOA 2H1GA 4MPFA 1BQ7A 2JZSA 4YAVA 1FG4A 2H1BA 2H70A 1SL2B 3GH9A 3KP9A 2C0FA 5C04A 3QFAC 1GNWA 2C1YA 3ME8A 4XIHA 4RQRA 1XFLA 5DDLA 1GSUA 2AYTA 3F3QA 4XCSA 5ECSA 5ECPB 2QSIA 2MMNA 3F0IA 2MMOA 5IQYA 1HD2A 1VRSD 1G6YA 10GSA 1FW1A 3F4RA 4NPBA 2GSRA 4DVCA 1MD4A 1PQNA 3K8NA 2DMMA 3E9JB 1K0CA 3I43A 3VI7A 5ABRA 2Z9SA 4OFNA 4PGTA 3GMFA 2X8CA 1FOVA 3GNJA 2YV9A 3ZVJA 6GSSA 3DEXA 4OO5A 3ME7A 4IVFA 2FWHA 3GYKA 2WJUA 4G9HA 5J4UA 4OCFA 3EE2A 4LA1A 4KAEA 3UBLA 1HNAA 1T4ZA 5KN0A 3RBTA 2CZ2A 3ZVJD 5FT3A 4KSMA 1VF3A 9GSSA 2FNOA 5INYA 2AB6A 2JACA 5A4VA 5CRHA 3GH6A 4HDEA 4P3YB 1F37A 1FO5A 1BG5A 4O32A 5AIXA 4IN0A 4KE3A 1GSSA 2H66A 4GSNA 6GSVA 3TCOA 2ON5A 2VIMA 1OAZA 2LUSA 8GSSA 3D21A 1PKWA 3HDCA 5C00A 3APOA 3G7YA 2IFQA 1FVJA 1A0FA 5DQYA 3ERWA 3LSZA 2VUPA 5KN1A 4IQ1A 3D0ZA 3QPMA 4XHMA 1B48A 5D9XA 3G7JA 2PWJA 2H1AA 4L0UA 4WKWA 5CP1A 2VL2A 4OFTA 1GUKA 2WCIA 3UJ1A 2AAWA 4O5RA 2PMTA 4K7NA 4MJBA 3C1SA 1QK8A 2CA8A 4TXVA 2L5LA 3P7XA 4KSOA 5ECLB 3DMLA 1M0UA 5IMDA 4IP1A 2PGTA 3FR3A 2ON7A 5DALB 1QGVA 1XBSA 1SK0A 4YQUA 5AISA 4WR4A 1ZZYA 5H5SA 5DAKB 2LEGA 3LEFA 4GRFA 3DWVA 2MBTA 4AJ8A 5HR1A 3US3A 3W8JA 2V1MA 3QMXA 4BL7A 3MNGA 2YWNA 5IPGA 2OACA 3NOFA 1DE2A 1GUHA 3IA1A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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