3F8UA

Tapasin/erp57 heterodimer
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
469
structure length
469
Chain Sequence
SDVLELTDDNFESRISDTGSAGLMLVEFFAPWCGHAKRLAPEYEAAATRLKGIVPLAKVDCTANTNTCNKYGVSGYPTLKIFRDGEEAGAYDGPRTADGIVSHLKKQAGPASVPLRTEEEFKKFISDKDASIVGFFDDSFSEAHSEFLKAASNLRDNYRFAHTNVESLVNEYDDNGEGIILFRPSHLTNKFEDKTVAYTEQKMTSGKIKKFIQENIFGICPHMTEDNKDLIQGKDLLIAYYDVDYEKNAKGSNYWRNRVMMVAKKFLDAGHKLNFAVASRKTFSHELSDFGLESTAGEIPVVAIRTAKGEKFVMQEEFSRDGKALERFLQDYFDGNLKRYLKSEPIPESNDGPVKVVVAENFDEIVNNENKDVLIEFYAPWCGHCKNLEPKYKELGEKLSKDPNIVIAKMDATANDVPSPYEVRGFPTIYFSPANKKLNPKKYEGGRELSDFISYLQREATNPPVIQEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Immune system/isomerase
molecule keywords Protein disulfide-isomerase A3ERp57
publication title Insights into MHC class I peptide loading from the structure of the tapasin-ERp57 thiol oxidoreductase heterodimer.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 137
structure length 469
sequence length 469
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2008-11-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
A PF13848 Thioredoxin_6 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3f8uA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3f8uA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3f8uA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3f8uA03
2OE1A 1THOA 2E2GA 2YZHA 2K6VA 1OC3A 2V32A 2HLSA 3KGKA 1E2YA 3KEBA 3KIJA 1AW9A 2QGVA 2I1UA 1SJ6A 3KMOA 5A5KA 4IN0A 2GZPA 3LEFA 3TKPA 1XW5A 4H86A 3KMNA 5DALA 2PMTA 3UAPA 3UMAA 1GSDA 1HNCA 4Z7XA 2CZ2A 3GNJA 4MZCA 4GSNA 2C0EA 1Q98A 3FW2A 1WE0A 2CX4A 3TRQA 4WETA 4MPGA 4TVEA 2IFQB 3ZIJA 5ECPB 2REMA 5IO2A 1AAZA 1ERVA 2BTOT 1QQ2A 3F63A 3GA4A 5DVBA 4IQAA 5J3RA 1TK0B 2DMMA 3QCPA 3UBLA 1TK8B 1M9AA 2B7JA 4WR4A 2H1DA 2H6ZA 2MBSA 4EL1A 5F05A 3KP9A 1ERUA 2EIOA 2LNTA 2AUVA 1X9MB 3RDWA 2P5QA 2KUCA 2CZ3A 3EWLA 1PD21 1K3YA 3KCMA 1NM3A 3LXZA 4KE3A 4KCAA 5GSTA 4MJCA 1PSQA 4WEYA 2GZZA 1EV4A 5CRDA 1QUWA 3L9VA 1TU7A 4HU9A 5AIXA 6GSYA 2YNXA 3TJGA 2IMFA 4J56E 3VPQA 1E6BA 5AISA 4ECIA 2V6KA 5B8BA 2C8UA 3DVXA 2DJ0A 2M46A 1U87A 1LBKA 4ECJA 2TRXA 1M2AA 2Z9SA 1T3BA 4YQVA 3TJBA 3FKFA 1T1VA 1K0DA 1ZCPA 2LUSA 2DSAA 5ECNB 1YKAA 1U3AA 2LJKA 2H1BA 2F51A 2ZCTA 3TKRA 5DAKA 5GAPD 2N5AA 3LG6A 4MF7A 1ILOA 4BWSA 4GWRA 2EIQA 19GSA 1G7EA 4O5RA 2FY6A 2A2RA 4LL4B 3RPPA 5G5FA 1A0FA 1ZGNA 2AYTA 1SJZA 3K8NA 4I5QA 4L8EA 1A23A 2YPMA 1O81A 5ECSA 2K9FA 3FYGA 5GZZB 2IL3A 3DYRA 1HYUA 3C1SA 4PQHA 1V58A 1BYEA 4MF6A 2L4CA 2LQOA 4EC0A 5AIVA 4XRDA 1R5AA 1B4PA 1VF3A 1GH2A 4TR3A 4MJEA 3MWHA 3D4MA 3FK8A 1RQMA 4E8EA 5IIZA 1Z6MA 2LKUA 3FR3A 1A2MA 4XS4A 3PH9A 4HOJA 1RW1A 2XPDA 4KDXA 1WMJA 3GIXA 4ML6A 2WS2A 1NSWA 4TXOB 5ECQB 3VLNA 6GSSA 3TRPA 2AHEA 4NAXA 1BEDA 1PA3A 1XW6A 3VURA 4HS1A 3ERWA 4XTSA 4LL1B 3RHCA 4ZB9A 1EV9A 4YQUA 3BD2A 2F3MA 2OE0A 2C80A 3PR8A 2OADA 2LEGA 3CSHA 4MK3A 3LQ7A 1WWJA 3FR9A 4N10A 2WGRA 2VAFA 4KGIA 3GKNA 2H6YA 2E0QA 4ECBA 4PNFA 2H75A 4HQSA 2FHEA 2CVKA 1FAAA 2FWFA 4ZBDA 2WFCA 2IMEA 4LMWA 1V40A 1GULA 5JWRB 5C00A 3VFIA 2MYGA 1M9BA 1K0OA 1PX7A 1IYIA 3DWVA 1TU8A 4FYCA 4F0BA 3D4TA 1XOBA 1A8LA 3CYNA 5DALB 10GSA 4BWQA 1XOAA 1GTUA 1NHYA 1PGTA 2NTOA 3HJMA 1MD3A 1UN2A 4GQFA 1SK2A 2DIZA 4ZXGA 1JFUA 4F03A 1MTCA 3F6FA 4GRFA 4V2MA 4XIHA 4L5OA 3G7IA 5F06A 4KB3A 4WF4A 2FGXA 3CRUA 4HZ4A 1TI3A 3P2AA 4KSOA 3U6VA 2VL3A 4EDZA 2C4JA 4K2DA 4V2NA 5A4WA 3TKSC 2AAWA 4OCFA 4PX1A 1VF4A 1YZXA 2YZUA 3L78A 4NHZA 3IDVA 2GQMA 2XBIA 1EEMA 5KN3A 3FR6A 6GSWA 2LRCA 2BMXA 1N2AA 4FO5A 2N5FA 1IYHA 1SL2B 1M2DA 1KNGA 3EE2A 1SK1A 4IJIA 3H4KA 4JBBA 1MD4A 1QGVA 5DJLA 1OKDA 5DDLA 5JWQB 3NIVA 1WP0A 3I9V2 2CA8A 3N5OA 1KBNA 1FG4A 3J7Yk 4YH2A 3GL5A 1MDJA 1EWXA 1YJ6A 2HZFA 3LWAA 1MDIA 4ECCA 3IA1A 3DGQA 2HXKA 3HY2A 3IHQA 5HR3A 2HSHA 1TXXA 2OE3A 2WDUA 2KLXA 1B48A 2H0GA 6GSUA 2A4VA 1ACVA 3M0FA 1ZYQB 9GSSA 2J9HA 4AF2A 2I3YA 1GUKA 1FB0A 1T4ZA 3TB2A 3C71A 5IPGA 4EKZA 3MNGA 1PN9A 3ZITA 1ML6A 2H71A 2LV3A 4TR1A 2JACA 1G6WA 2H19A 3EURA 5G31A 3L9UA 5DAKB 1HQOA 3ZREA 1K0AA 2IMKA 2WCIA 1OE7A 3TOTA 2YWMA 2YV9A 2B5EA 1QFNA 3IC4A 1GSEA 1CQHA 4ZILA 3L0HA 5JCGA 2O87A 4XS6A 1CQGA 2C0FA 4RUVA 3DRNA 20GSA 2JL4A 4BL7A 1JLVA 3QPMA 5AGYA 3TDGA 4O32A 4BPYA 1U3IA 3TJFA 3HYPA 3HXSA 3N9JA 4ZBBA 1O6JA 3EMPA 1XFLA 5CP1A 1PX6A 1WJKA 1F9MA 4O7HA 4YAVA 1I5GA 3GHAA 3QAVA 2H0IA 3E9JB 3GRXA 3L4NA 3FZAA 2R4VA 3CMIA 2L5OA 1SK0A 2GSQA 4KNDA 3FZ5A 3W8JA 5CNWA 1PKWA 2DLXA 3HDCA 4J2FA 1SKRB 4V1Ag 1F37A 3C7MA 1EP8A 1GTIA 4MZWA 2CT6A 4POLA 1DE1A 3LGCA 4XS4B 4D73A 2GT6A 1O7UA 1AIUA 1OYJA 2M80A 5J9CA 2LJRA 4KH7A 3OR5A 1Z7RA 3M9JA 1TDIA 2CAQA 2H70A 4XHMA 3ZRDA 1VGLA 1VF2A 1Z7PA 4KDUA 1TOFA 2P0GA 3O6TA 2PVOC 3E0UA 2NPBA 1XCCA 3QMXA 1TJDA 4WBJA 3QD9A 3VWVA 4OFMA 2QC7A 3VWWA 1XZOA 4ZL9A 3GX0A 3BJ5A 1FOVA 1Z5YE 2H73A 5D9WA 2CVDA 3ISOA 3QFAC 4Q5QA 1M7TA 3IPZA 3PGTA 4IJ3A 3DKSA 3WD6A 3GH9A 2BJXA 3Q19A 3L9SA 3UVTA 5ECRB 1GLPA 4IQ1A 4KDYA 1ZL9A 3UARA 2FWHA 5FWGA 4NMUA 5H5QA 4DEJA 2MZCA 2CAIA 5J9BA 3UIWA 5D93A 1R26A 2HZEA 2VIMA 4NWYA 5INYA 4MABA 1H75A 1XVQA 5ID2A 1ZMAA 1UC7A 4HZ2A 5B6NA 4MDCA 2NVLA 1BAYA 4K9ZA 5DQSA 4MH3A 3F8UA 3C1RA 2VCWA 4PURA 3FZ4A 3ZIVA 4POMA 3KP8A 2L5LA 2H76A 4L0UA 2PUKC 3UJ1A 4N11A 1HNAA 3GN3A 1SL0B 1GP1A 2VCTA 4Q5RA 4XS1A 1TI1A 2HYXA 5IMDA 5HR2A 3IV4A 3FEUA 1O8WA 2C3QA 1JZDA 2EIRA 4HJ2A 1DBYA 3ZVJD 4G10A 3F4RA 2X64A 2IWTA 1A2JA 2WB9A 2F8AA 4ZBAA 4WF5A 2DJJA 3HCZA 1PRXA 2I4AA 3O76A 3ZTLA 1BX9A 3W6GA 4MJAA 1HD2A 4NV2A 4GQCA 1GUHA 2B7KA 2VL2C 1TP9A 4IVFA 3A3TA 2VL9A 4IS0A 2RIIA 4PNGA 2GSSA 4GTUA 5C04A 3VI7A 2YV7A 4QL9A 5EY6A 2XBQA 3KXOA 5EPFA 4WXTA 4DSSA 3SBCA 3F4SA 1VF1A 2G0FA 5LNKe 2EC4A 3GMFA 5COHA 3IE3A 4TR1B 1T00A 1J0FA 4EE0A 1XW9A 2CQ9A 2YN1A 3D21A 3KZQA 4IP6A 3TKSE 2IIYA 4TOPA 4WKWA 3M1GA 1URMA 3VI5A 4BVYA 2PVQA 1T8EB 3JCML 2FD3A 1JLWA 3ZMKA 3S9FA 4IELA 3TKSA 1TRSA 1YY7A 5JCWA 5IMZA 4N0VA 3TJJA 1PL1A 2RUFA 5CRGA 3EVIA 4XCSA 3M9KA 2L59A 4GXZA 2F8FA 2ON5A 3SWLA 3I69A 4HDEA 4K7NA 1I9DA 1G6YA 1GSYA 2IMDA 1LU4A 2PN8A 4IGJA 5ENUA 4OMVA 1QMVA 4MZBA 3F0IA 3DD3A 2DMLA 5IM9A 1GNWA 2PU9C 2LTKA 4ULXA 3IOSA 6GSVA 3BCIA 4TXVA 4KAEA 3KD0A 2AB6A 2YANA 4LA1A 4G19A 3ZLPA 5KN0A 4MLYA 4D73B 3H79A 2JSYA 12GSA 4K7OA 3P8WA 4F0CA 3DXBA 3IBHA 2LRTA 3EMXA 5CREA 1JZWA 4PQ1A 3HVVA 4KSMA 2IN3A 1OE8A 1W4VA 3TOUA 1F6MC 2P31A 2JU5A 2DBCA 1TTZA 2KHPA 2FA4A 3GKMA 5ELAA 4Q5FA 2B6MA 4KW6A 4MP4A 2N5BA 5A4UA 1DSBA 4JR6A 2DJ1A 3ZVJA 4EF0A 3UBKA 2V1MA 3LJRA 4K7IA 2C3NA 1M99A 1WIKA 2FLSA 1X5DA 3DIEA 1WOUA 3VPTA 2CV4A 3APOA 16GSA 2NBSA 3LXTA 5D8IA 1A2LA 1YDKA 3M3MA 3IXRA 2YWIA 2R2JA 4J57E 5CAXA 1K3LA 3CXGA 2HZEB 2GGTA 4EO3A 3D5JA 4PGTA 4HEA2 2C0GA 2LRNA 1F2EA 3WGXA 5ID2B 1EOHA 3GTUA 1AC1A 4L5LA 4GF0A 1R5PA 1Z6NA 5D96A 1QK8A 5E4WA 4OCEA 2ALBA 1M0UA 3G9BA 11GSA 3R2QA 1V2AA 2JZRA 2PGTA 4EDYA 2PWJA 3ERGA 2KOKA 3O3TA 1EOGA 4WBRD 3HVXA 4AJ6A 3U5RE 3BOAA 4RI7A 1AQXA 2DC5A 3F6DA 3MAKA 1X5EA 1ON4A 1G0TA 3US3A 4LLRA 2GT5A 2C3TA 2TIRA 1SYXA 4ZL7A 2O89A 1BG5A 2GVPA 5KEJA 3P90A 2WRTA 3HHVA 2YJ7A 1PQNA 2KP2A 3RAZA 2KP1A 2VM1A 4L0WA 4I6XA 1X9SB 2OJLA 1O85A 3GH6A 4IBPA 3FY7A 2RM5A 5KN1A 1FB6A 2H30A 1B4QA 2C0DA 5D73A 2M72A 4EVMA 1USBA 3WGEA 3FHKA 1K0MA 1EP7A 4FIWA 2OBIA 4I97A 4DSSB 1ZOFA 2H6XA 4CW9A 3A5WA 4MA9A 2QKEA 4ZL8A 4NHWA 2MMNA 1KEBA 1F3BA 5F8BA 3CBUA 2V6OA 2LJAA 3WGDA 1DUGA 3HJOA 2ON7A 2HT9A 2VCZA 5L71A 4QL7A 2AJQB 4NV5A 3EU4A 4POBA 3GKXA 1AUCA 2XPEA 4TRXA 4PQIA 1J08A 2O8VB 4OFTA 3H93A 3Q18A 3NZNA 2AV4A 4HI7A 2VOCA 4EXJA 4MPFA 3GYKA 1OC8A 3IK9A 3HZ4A 2B1LA 2WZ9A 1XBSA 5D9VA 2H66A 4X0XA 4JEDA 4GSTA 1W89A 3E3EA 1AXDA 2L57A 3Q74A 1NW2A 5HFKA 5IMCA 3HA9A 1PMTA 2GTUA 1GSUA 3CTFA 2J23A 1HNBA 1U6TA 1V9WA 3F3RA 2ZUPA 3RHBA 2H72A 1PL2A 2GSTA 5EL8A 3CSJA 1XWBA 4PUAA 5E59A 5F0GA 1V57A 2NDOA 1XPVA 3ME8A 1UA5A 1MDKA 2K8VA 4G2EA 5JCUA 1B8XA 4TR0A 8GSSA 1GWCA 1N8JA 2VL2A 3QR6A 5IQYA 5FHIA 2FA8A 1Q4JA 4AJ7A 1TW9A 3W8SA 5LCZA 4MJBA 2ZNMA 4N0ZA 5G1KA 1WPIA 2DJKA 3C8EA 1K0CA 2LNSA 3APSA 3RPNA 4ACSA 1A8YA 2R37A 2QSIA 4N30A 1NHOA 4TKYA 2IJYA 4X43A 3HD5A 3J7Yb 2JADA 5H5SA 3F9UA 2YWNA 1S3CA 2P5RA 3ERFA 1AQVA 1J9BA 2GQLA 2LSTA 3QDNA 5HFGA 4MMMA 4PUFC 2H01A 2VO4A 1T4YA 3FZ9A 3ZYWA 1GSFA 1V98A 2O85A 5B8AA 4RI6A 2F9SA 1ERTA 5G30A 1B9YC 3G7YA 4MH2A 5ECOB 2HFDA 2LQQA 3KTLA 1YQ1A 2MMOA 1OAZA 4K6XA 2VM2A 3TCOA 4BA7A 4RQRA 5ABRA 2VCQA 4MCUA 5IMAA 2X8HA 3QAWA 2IPAA 1B9XC 3F4TA 2B5XA 1O73A 2DIYA 2B1KA 1FVKA 4IW9A 3KM6A 1ERWA 1O8XA 2A2SA 5DQYA 13GSA 3IAM2 2RUEA 1SENA 2RLIA 4KUNA 3ZMLA 4DVCA 4WR5A 1WRYA 4ILFA 3H8QA 3TUEA 3QAGA 2VLVA 1VRSD 2E2MA 3GTUB 4NPBA 2V41A 1UVZA 4JZQA 3IAS2 5ECKB 5IMVA 5ECHB 4AGSA 4CDOA 6GSXA 1BJXA 2WJUA 1A0RP 3MSZA 6GSTA 1TRVA 1SD8A 2HSYA 1K0NA 2K8SA 1Y25A 2L4QA 5IOWA 2YWOA 1Z9HA 4MF5A 2GSRA 3M8NA 3TRXA 5LD0A 3RBTA 2RM6A 2FWEA 4F82A 3KJYA 1BQ7A 1TK5B 1ZYEA 1H4OA 5DJMA 5HFIA 5D9TA 4K8MA 2TRCP 2PPTA 4JR4A 4XRAA 1THXA 1OC9A 5ECLB 3LFLA 5J5NA 1SD9A 2MMAA 3GL3A 1XVWA 1X0RA 1ST9A 1FVJA 2C1YA 1X9WB 1GTAA 5DCGA 2H74A 3A2WA 4DSRA 1EZKA 4RQXA 2K18A 3LYPA 1Y6EA 2IMIA 2HE3A 5B6MA 1XXUA 3I6AA 4ZB8A 3G7JA 4I2TA 2LS5A 4HUAA 5KN2A 1XWGA 3LYKA 3MDKA 2VCVA 1T7PB 1A24A 4CHSA 1FO5A 5FT3A 2YCDA 3TJKA 17GSA 2JZSA 5CRHA 2PERA 4OFNA 2VD0A 2V2GA 3HKRA 3UEMA 1Z3EA 3AY8A 2XHFA 4TW5A 4HQZA 1XWCA 2YP6A 2H1GA 2H0HA 2VLUA 3VK9A 1GSSA 2I81A 3CTGA 5IOXA 4HU7A 2JZTA 1EGRA 5G2ZA 5HR1A 5CRWA 3TKQA 3IR4A 2O7KA 2CVBA 1K0BA 3VWXA 22GSA 3GSSA 3HZ8A 4JRRA 3APQA 4AJ8A 5J4UA 3Q6OA 1SL1B 5CYYA 1R4WA 2VUPA 1YF1A 3ZFBA 3WT1A 5EVOA 4EUYA 1C72A 18GSA 1GLQA 4I2UA 1S3AA 4ISDA 1QXHA 3VWUA 4X1UA 2GQKA 1XWKA 2CX3A 4Q5NA 1ZZYA 3DVWA 3ME7A 1SKSB 4V2LA 4NXIA 1YKCA 5IMFA 4F9ZA 1EEJA 2IFQA 1KTEA 2X99A 3H1NA 4I8BA 4GCIA 5ECIB 1LJRA 3PINA 3KH9A 3BBYA 3GURA 3GKKA 4BVXA 1U88A 1AQWA 3QOUA 2JSZA 3HVSA 3NOFA 2HI7A 3GFKA 5G5EA 1GNEA 2XC2A 4KCEA 4OO5A 2X8CA 2HRFA 2GDRA 4E8HA 2FWGA 2H8LA 2E7PA 3UOMA 2R6KA 4TR4A 3CRTA 2HRNA 1JZOA 3P7XA 4G9HA 4QQ7A 3UVHA 3KTBA 2G2QA 3ED3A 1RK4A 4O92A 2D2ZA 1MEKA 3A2XA 4IKHA 4HJMA 4K1FA 1YEXA 5ECMB 3QFBC 4JE1A 3TGZA 1GSQA 2VCXA 7GSSA 4ZIJA 2MMZA 4P3YB 5DBQA 2OACA 3D0ZA 3BCKA 5F07A 1ABAA 3KH7A 5HR0A 3UL3A 4GSSA 5B7CA 14GSA 4FYUA 2L6CA 4TN8A 5JWOB 2DJ2A 3CSIA 1TKDB 3LORA 1TRWA 4IHUA 1FW1A 1OVNA 2GLRA 1JZRA 5A4VA 3IK7A 1GRXA 3DEXA 2R3XA 2X8GA 4V1Ap 2R5GA 4FYBA 5J41A 4IP1A 5HQPA 1XIYA 1X5CA 1S3DA 1YEPA 2B3SA 5IO0A 2YOIA 5G1LA 2I9HA 3ZL5A 1GUMA 2PBJA 2YJHA 1R7HA 5DCHA 1OC9B 1G7OA 2MBTA 3D6IA 3C73A 4F2IA 4K0NA 1K3OA 1OKTA 1SU9A 4ML1A 1XWAA 5GAND 3A2VA 3ZFLA 1YF0A 2ES7A 2VLTA 3FRCA 2FNOA 3I43A 3WYWA 4GLTA 1JHBA 3WT2A 2HNLA 5D9XA 2OKAA 4OO4A 1SJIA 3GV1A 2WULA 3F3QA 4FH8A 5GSSA 4DSQA 2FUG2 4KA0A 4K0GA 4PXOA 2B5YA 1SYRA 2GS3A 2GZYA 3LSZA 3GUSA 2OA7A 4TXOA 2DJ3A 1EGOA 2FCHA 5IPHA 5H5RA 4ZB6A 3D22A 2L6DA 3DMLA 5CO3A 3EYTA 4KX4A 1PKZA 1F3AA 4LMVA 3IRAA 5AN1A 3EC3A 2VD1A 4ID0A 1TRUA 4POKA 5ELGA 3GX8A 3GSTA 1GL8A 4YAPA 2H1AA 3HJPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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