3TJJA

Crystal structure of human peroxiredoxin iv c245a mutant in sulfenylated form
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
167
structure length
166
Chain Sequence
LSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal Structure of Reduced and of Oxidized Peroxiredoxin IV Enzyme Reveals a Stable Oxidized Decamer and a Non-disulfide-bonded Intermediate in the Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-4
total genus 59
structure length 166
sequence length 167
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tjjA00
3FKFA 4MMMA 1WP0A 2RM5A 4IGJA 4QL9A 4EDZA 1YEPA 1UA5A 1GTIA 4AJ7A 2I4AA 1I5GA 4FYBA 2LJRA 4IN0A 2L6DA 2VM2A 2I9HA 2HSYA 4GCIA 4JZQA 1YQ1A 2GLRA 3VFIA 2IWTA 2P0GA 3UBKA 2ALBA 1HYUA 1TU7A 1TKDB 1K3LA 1OKDA 3DVWA 2V1MA 1AC1A 5DAKB 4NV5A 3EMXA 2GDRA 1DSBA 1YKCA 5F06A 1AXDA 3H1NA 5D9VA 4EVMA 5CO3A 2DJJA 3G7JA 2K6VA 1K0OA 2M72A 2VL2C 2C80A 4WKWA 2LEGA 2VIMA 2C0GA 1PRXA 3WT1A 1BJXA 2CV4A 3TKQA 2OBKA 2QKEA 2K8VA 3IE3A 1ZYEA 2A2RA 1X0RA 2H70A 1EEMA 3GSTA 3TB2A 3TJFA 1Y6EA 2R2JA 2XHFA 2PUKC 1JZOA 4F82A 2CX3A 5AISA 3IC4A 4F0BA 2FHEA 4MJBA 4DSRA 3KEBA 1GP1A 2N5BA 2RLIA 2LNTA 4BVXA 1TRUA 2IMEA 4GSTA 3ZL5A 3FZ5A 4D73A 4EE0A 5ECIB 4I2UA 2DJ2A 5J41A 3PGTA 2M80A 4I2TA 4ML1A 1AIUA 3IA1A 1XPVA 2YCDA 3TCOA 3DIEA 1V98A 1NSWA 3F4TA 4WXTA 1LJRA 2OE0A 4KW6A 4TRXA 2H1AA 3RBTA 1TRSA 4TN8A 3CMIA 1O6JA 5DDLA 2H72A 4ZBBA 3IRAA 3W6GA 4ML6A 1TU8A 5E59A 4IKHA 2XBQA 1AW9A 1G7OA 1Y25A 4JRRA 3IK7A 1GSYA 4L5LA 1FOVA 4DEJA 3TKSE 2IJYA 3DVXA 4MZBA 3ERGA 3UAPA 5CAXA 3Q19A 2KP2A 2L4CA 4MJCA 2L5OA 3DRNA 3KD0A 5ECMB 2E0QA 2N5AA 2CA8A 2C3NA 2FD3A 1XCCA 1FVKA 1S3CA 2EIQA 3HVXA 2B5YA 3KH9A 1U6TA 4D73B 1EZKA 2I3YA 3JCML 4YAPA 3K8NA 2GSTA 4EC0A 2N5FA 2MMAA 3C1SA 1ZL9A 4ZB9A 1HQOA 2C3QA 3ZITA 2VL9A 1JLWA 3D22A 3F3RA 2H76A 1SENA 3APQA 4OWYA 4Q5RA 4XTSA 4ACSA 5B6NA 2GSQA 1N8JA 4KX4A 3MWHA 5J9CA 2X64A 1JZDA 1EGRA 3RHCA 4O32A 2PU9C 5AN1A 3GSSA 3EU4A 3QOUA 3TOTA 4G19A 1TI1A 3MDKA 2H75A 2MMZA 3TJGA 3HCZA 4IS0A 5ELAA 1SL1B 2WB9A 4N0ZA 5A4VA 3BOAA 2HLSA 2H73A 4ISDA 3VPQA 5ECKB 3I9V2 4NMUA 2IMDA 4TXVA 1Z6MA 3FK8A 6GSUA 3H8QA 5GSTA 2VD0A 4ILFA 2F9SA 1S3DA 4EF0A 5AIXA 3IOSA 4K0NA 2CX4A 4HJMA 3FW2A 3GH9A 1K0NA 3HJMA 2FCHA 1QMVA 1A0FA 4KDXA 4MF7A 2LKUA 5G5FA 4F2IA 4GQCA 3NIVA 4WR5A 1LU4A 1O73A 4HJ2A 4G10A 2J9HA 4ZB6A 1SL2B 3DGQA 5F07A 3TJBA 4KDYA 1EV4A 2B6MA 1J0FA 4JE1A 5CP1A 1GH2A 4WEYA 5G2ZA 1ZZYA 3BCIA 3KM6A 4BVYA 3ISOA 4Q5FA 1YJ6A 3VWXA 5IMZA 4KCAA 1XWKA 2DJKA 2GQMA 4ZL8A 2WS2A 1OC9A 6GSYA 4PXOA 1GNWA 1EOHA 3LYKA 1SL0B 2IL3A 1LBKA 1B9YC 4IELA 5KN2A 2I1UA 2P5RA 1J9BA 5ECLB 2GZZA 2YP6A 1VF3A 4HI7A 3I69A 4FYUA 2H71A 3QFBC 1JZRA 2X8GA 3IV4A 3ME7A 1FB6A 2CZ3A 1SD9A 4NXIA 4CDOA 2DIYA 5JWQB 5KEJA 4HZ2A 1EV9A 3HJOA 2VCXA 2TIRA 19GSA 3A2WA 4X0XA 4IQAA 1M2AA 4KGIA 2D2ZA 1EOGA 3EC3A 3ZMKA 5IO0A 3NOFA 1V9WA 2RM6A 1M2BA 5KN3A 3HY2A 1SU9A 1ABAA 4J57E 1OC9B 2KP1A 1PMTA 3M8NA 4BWSA 6GSTA 4GQFA 4MZCA 4IQ1A 3P2AA 2DBCA 2C0DA 4YQMA 2K18A 2LQOA 3KMNA 3TDGA 4GSSA 4BL7A 4ECJA 1U87A 4G2EA 3DKSA 1GL8A 4E8EA 4ZB8A 3GTUA 3P7XA 1G6WA 1ERWA 3ZMLA 1X9MB 3SWLA 2WCIA 4RUVA 1GWCA 2RUFA 4I5QA 5HFGA 3VLNA 1SKRB 4HOJA 5HR3A 1ST9A 4PNGA 3GUSA 2B5XA 4TVEA 5CRHA 2YV7A 2H0GA 3RDWA 3HA9A 4HEA2 2VL3A 4BWQA 3C8EA 4NV2A 2GZYA 2EIOA 1XW9A 2JZSA 2GGTA 3BJ5A 5DVBA 2MMNA 5FHIA 2WJUA 3WYWA 3MSZA 3W8JA 2YANA 2JU5A 3OR5A 1GNEA 1UVZA 1THOA 3DXBA 3L9UA 2YV9A 1WWJA 1NHYA 1C72A 5IMAA 2F8FA 2K8SA 1T00A 1B4PA 2OADA 1Z6NA 2R5GA 3MNGA 1TW9A 4TXOA 3GTUB 3EWLA 2OA7A 3WGXA 3UIWA 1A23A 2Z9SA 1QQ2A 2R6KA 2OBIA 3C1RA 3M3MA 5IMCA 1EP7A 2HRFA 1Q98A 2IPAA 1XBSA 2H30A 4RI6A 1R5AA 1TDIA 5DQSA 4GWRA 2FY6A 3KZQA 4E8HA 1VRSD 5IMFA 2DSAA 3GRXA 2PERA 2XBIA 3EVIA 3VI7A 3TUEA 1CQGA 4HZ4A 4KA0A 3M9JA 2C8UA 4OFNA 5E4WA 1GULA 2CAQA 3GFKA 4OCEA 2REMA 1F3AA 1YEXA 4JR6A 2YOIA 10GSA 4GF0A 3RAZA 2HE3A 2VL2A 1OAZA 4OO4A 1M7TA 1XW5A 1T3BA 2FUG2 4LLRA 1PX6A 1ZYQB 3P8WA 2MMOA 4N11A 5GZZB 1TOFA 2YJ7A 3QD9A 4POLA 1ACVA 2VM1A 1ERTA 5A5KA 4TXOB 2OE1A 5F05A 1GSDA 1R5PA 1B48A 3H79A 5ID2A 4GRFA 3GL5A 4POMA 2LQQA 1THXA 1XWCA 5GAND 4K1FA 1USBA 2RUEA 5IMDA 4LA1A 5J5NA 4BA7A 4HU7A 3S9FA 3TGZA 4F9ZA 1WMJA 4K7NA 4KDUA 5EVOA 2BJXA 2QSIA 4HQSA 3O6TA 3H93A 4DSQA 4MLYA 1PA3A 1QXHA 13GSA 3GKNA 1M0UA 3DMLA 2CQ9A 2KHPA 2PWJA 4IJ3A 2K9FA 2F51A 2H6ZA 4I6XA 1PL1A 1U3IA 4IP1A 5A4WA 2ON7A 2VD1A 1R7HA 3G7YA 1PKWA 1SYXA 3UARA 4TR4A 2VLUA 3QFAC 4EL1A 1TXXA 4ZXGA 1E2YA 2FWFA 3GIXA 4EUYA 2GSSA 4KCEA 5ID2B 4XRAA 4MJEA 2AUVA 2MBTA 3IHQA 2OACA 3C71A 2YZHA 2LNSA 1R4WA 2AHEA 3KIJA 4H86A 3KTLA 2H0IA 3ZRDA 1XOBA 4PNFA 1AQWA 4TR3A 1T7PB 4EDYA 3UOMA 1ON4A 2H6XA 4POBA 3M9KA 4TR1A 4BPYA 1MDJA 3CBUA 5JWRB 2IN3A 2YZUA 5G1KA 3FR3A 3ZZXA 2G0FA 1G0TA 1F2EA 3LG6A 1XWBA 1FW1A 2LJAA 1F3BA 2GQKA 1VGLA 2JZRA 2ES7A 4OD7A 3TJJA 5IMVA 2HRNA 1FB0A 3Q18A 4PUFC 5G31A 3VURA 3L78A 1JFUA 4MCUA 1B9XC 2X8CA 2H0HA 4WF4A 3M1GA 5G30A 1WIKA 1X9WB 3KXOA 3D4TA 1UC7A 1YZXA 1W89A 2DIZA 2H66A 2B3SA 1BAYA 5D9WA 4KSMA 1PN9A 4YQVA 2F3MA 4HU9A 2PMTA 3L4NA 4L5OA 1K3OA 3GNJA 1NM3A 1F37A 3BD2A 2DMLA 4TR1B 3E3EA 1YY7A 1HNBA 5IO2A 1XVWA 2JACA 2FLSA 1ERVA 3HYPA 4RI7A 3TKRA 4FO5A 3GKXA 6GSSA 1XW6A 5ECSA 5CREA 3J7Yk 3TRQA 2CVKA 1CQHA 1PSQA 1RW1A 1PD21 3TKSA 1FO5A 2WFCA 4ECIA 3BBYA 3GYKA 5ABRA 2VCWA 1Q4JA 4HDEA 4ID0A 3CTFA 3RHBA 3UVHA 3D21A 2HXKA 3GKKA 1GUMA 6GSVA 2AAWA 4CHSA 4V1Ag 3PH9A 2VOCA 5F0GA 1Z5YE 2FGXA 1KEBA 4FIWA 3I6AA 2VCVA 5C04A 1QFNA 1HNAA 1TK8B 4ECBA 3QCPA 2VLVA 1XWGA 2QC7A 2KUCA 3QAVA 1GTAA 6GSWA 3TKSC 2HFDA 2J23A 1O8XA 3QDNA 3HDCA 4AJ8A 3ZREA 1F6MC 1TI3A 1YF1A 1GSQA 3GKMA 3LSZA 5DCHA 5D9TA 2B7KA 2H19A 4K7IA 1KBNA 3J7Yb 5J4UA 5C00A 3ZFBA 4ZL9A 1MD3A 5JCWA 1VF1A 5ECRB 2B1KA 14GSA 3TKPA 2R4VA 4TOPA 2V6OA 2O87A 4ECCA 2GS3A 3FZ4A 3HD5A 4N30A 4XS4A 3LFLA 3ERFA 1WOUA 1SD8A 2YWNA 2FWEA 3GX0A 2VCZA 3QAGA 4MZWA 3D4MA 1H75A 1M9BA 3GN3A 5JWOB 2V41A 2CAIA 1WPIA 3A2VA 1H4OA 1FG4A 2C3TA 3HJPA 4ZBAA 3U5RE 3ZIVA 5B7CA 3KJYA 5B8BA 3E9JB 3C73A 4IBPA 2V2GA 5IIZA 3ZLPA 2OE3A 2B1LA 1T1VA 3SBCA 1TP9A 3KMOA 2CVBA 1GUHA 1O8WA 1V40A 4JR4A 1XVQA 3GL3A 1O85A 2H74A 1PGTA 5IPGA 2NPBA 3FZ9A 4LL1B 4GTUA 5EY6A 5EL8A 1IYIA 4Q5NA 1B4QA 1MTCA 4GSNA 1T8EB 4XS4B 2YN1A 4WETA 4MDCA 4NWYA 2A4VA 3CRTA 1MEKA 1GTBA 1OE7A 3DWVA 5ECNB 1MDIA 2P5QA 3U6VA 3TRPA 1URMA 1JZWA 4MH3A 3KTBA 2AV4A 2PPTA 4PX1A 2GT6A 2BMXA 4Z7XA 2G2QA 1XZOA 2VO4A 4FYCA 4MH2A 3CSIA 2TRCP 2L4QA 4PGTA 3D0ZA 3QR6A 3EYTA 17GSA 1WE0A 1V57A 1SJIA 5IOWA 4ZIJA 1SJ6A 20GSA 3DYRA 2ON5A 4XIHA 1GLQA 3ZVJA 5CRWA 3GH6A 5IQYA 1VF4A 3WGDA 1XOAA 3ME8A 18GSA 5LCZA 1M2DA 1Z7PA 2L57A 1X5DA 4XRDA 2E2MA 1TK0B 2OKAA 1XFLA 3RPNA 2MYGA 1Z9HA 4RQXA 2CVDA 5J9BA 4IVFA 3FEUA 4OMVA 2B7JA 2TRXA 4J56E 2I81A 1TJDA 1BQ7A 4O92A 4KE3A 5D9XA 2DMMA 3F3QA 3VPTA 4AF2A 5G5EA 1TTZA 4L0UA 3HVSA 1OE8A 1HD2A 2RIIA 3L9SA 2DC5A 4IW9A 1OC3A 2FA8A 2EC4A 1ZOFA 4V2NA 3WD6A 3M0FA 5ENUA 1ML6A 4MF6A 2V32A 2YWMA 3ED3A 4N10A 4X1UA 3LEFA 22GSA 1KNGA 1PX7A 1Z3EA 2YJHA 3V1WA 2FWGA 4K9ZA 5DBQA 1K3YA 2IFQA 2IIYA 1XWAA 1GSUA 1A2MA 4V2MA 4ZILA 3LORA 3HXSA 3KCMA 3ZFLA 3ZYWA 4K6XA 5A4UA 2JSYA 3FR6A 3F6DA 2XPDA 4FH8A 5DCGA 5EPFA 3W8SA 5GSSA 2PGTA 3APOA 3O76A 4KNDA 4MA9A 3UJ1A 2A2SA 5DQYA 2M46A 2VCTA 3D5JA 1GUKA 5B8AA 3G7IA 5JCGA 2IMKA 4YH2A 3NZNA 3IPZA 1EEJA 4PQIA 3KP9A 4QQ7A 4ULXA 2KOKA 2PN8A 5CYYA 3IAM2 2O8VB 2WDUA 4LMVA 2AB6A 5LNKe 3FYGA 4PQHA 3N9JA 4POKA 2IFQB 2CZ2A 2FNOA 4G9HA 1T4ZA 3PINA 1S3AA 4IP6A 4OO5A 4JEDA 1G7EA 2O85A 4DVCA 1V58A 1BG5A 4MPFA 3GV1A 2E7PA 4XS6A 1X5EA 1B8XA 3F9UA 1SJZA 3A3TA 4PQ1A 5ECOB 5HR1A 2NVLA 5IOXA 2LTKA 1U3AA 2HNLA 4WBRD 3CSHA 4IHUA 5KN0A 2E2GA 2V6KA 1BYEA 5KN1A 4OFTA 2X99A 1BEDA 4NHWA 4K2DA 5COHA 3QPMA 4XHMA 3IBHA 2H01A 1UN2A 2FWHA 3HZ8A 2PVOC 3EMPA 3VK9A 1SKSB 4EKZA 3CTGA 3FR9A 4JU5A 5CRDA 2MBSA 2O7KA 1SK0A 3FY7A 4EXJA 3ZIJA 1GRXA 2LUSA 3DEXA 1AQXA 3IAS2 4HUAA 1M9AA 1M99A 3PR8A 4NHZA 2IMFA 2H8LA 4J2FA 5ECQB 1TRWA 1G6YA 1ILOA 2GTUA 4I8BA 2HSHA 4MPGA 3N5OA 3O3TA 4CW9A 4KAEA 4L8EA 3GURA 1GSSA 1YF0A 1K0BA 4QL7A 5CRGA 3APSA 4TW5A 2H1DA 4F03A 2LS5A 4RQRA 2VCQA 2NTOA 3F0IA 1DE1A 4K8MA 2HYXA 1E6BA 2GVPA 5HQPA 1A2JA 3GX8A 1OKTA 2ZUPA 3VWUA 7GSSA 2DJ1A 4YAVA 1GLPA 3VWWA 4KSOA 1K0MA 2OJLA 2YWIA 3F8UA 1VF2A 1I9DA 3KGKA 2LRCA 5DJLA 2C0EA 3UVTA 3IDVA 4DSSA 3FHKA 4MF5A 1IYHA 1NW2A 2XC2A 1GSEA 2C0FA 2C4JA 1DE2A 3HZ4A 2MZCA 3CXGA 4K0GA 2PBJA 5DALA 1TK5B 4I97A 5FT3A 1DBYA 1U88A 4P3YB 1RQMA 1QUWA 3A2XA 3A5WA 1ZGNA 1ZMAA 4TR0A 4NPBA 1JLVA 2NBSA 1SKWB 4TKYA 3UEMA 1AUCA 3I43A 1BX9A 4PURA 4AGSA 3D6IA 1EGOA 5D73A 4LL4B 1A8LA 3MAKA 1NHOA 4MJAA 3F4SA 4ZBDA 2F8AA 4HQZA 2WGRA 2X8HA 2C1YA 4AJ6A 3Q6OA 1XXUA 3CRUA 3LGCA 1GTUA 2WULA 3FRCA 2L59A 3LQ7A 3QMXA 1K0AA 1OVNA 2VLTA 3IR4A 3RPPA 4PUAA 1J08A 3ZVJD 11GSA 4GLTA 4DSSB 2PVQA 2GSRA 1A8YA 2WRTA 4Q5QA 2FA4A 4EO3A 5DALB 2WZ9A 4K7OA 2ZNMA 2L5LA 1A2LA 3G9BA 3EE2A 4KH7A 4JBBA 2LRNA 1ERUA 2EIRA 3F4RA 12GSA 1FHEA 3E0UA 3LJRA 2DLXA 1WJKA 1A24A 4L0WA 3ZTLA 16GSA 2H6YA 3KP8A 3HHVA 1SK2A 5L71A 2HT9A 4WF5A 3CSJA 3LYPA 2JSZA 1GSFA 1AAZA 3DD3A 1XIYA 2YWOA 3VWVA 3L9VA 2R3XA 2JZTA 5ELGA 5H5QA 2GQLA 3WGEA 3GMFA 1N2AA 5FWGA 5HR2A 4WBJA 1OC8A 4WR4A 2LRTA 3F6FA 1OYJA 2DJ3A 3UL3A 3LXZA 5ECHB 3CYNA 5INYA 5HR0A 2IMIA 2R37A 2H1GA 1YKAA 5AIVA 4HS1A 5ECPB 1QK8A 3US3A 4O7HA 1X5CA 5JCUA 2AYTA 3QAWA 5D93A 2HI7A 3EINA 4KUNA 2B5EA 1EWXA 3H4KA 4V2LA 2VAFA 5H5SA 5H5RA 1X9SB 1TRVA 5D96A 4ZL7A 5J3RA 5CNWA 2H1BA 3GA4A 3C7MA 1PQNA 1FAAA 2ZCTA 3UBLA 1YDKA 5F8BA 1PL2A 1ZCPA 2HZFA 3TOUA 1W4VA 6GSXA 1K0CA 2BTOT 2AJQB 5AGYA 1DUGA 3BCKA 1R26A 5DJMA 4OCFA 2HZEA 2XPEA 4IJIA 4KB3A 3HKRA 5G1LA 1RK4A 5GAPD 3F63A 1EP8A 1FVJA 3AY8A 2VUPA 2LJKA 3R2QA 2QGVA 4N0VA 5HFKA 3IXRA 4OFMA 4O5RA 1T4YA 3P90A 3EU3A 8GSSA 4V1Ap 3EURA 5LD0A 1AQVA 9GSSA 2L6CA 1V2AA 1F9MA 1SK1A 2P31A 3HVVA 2NDOA 3GHAA 2LV3A 2CT6A 3UMAA 2DJ0A 5IM9A 3TJKA 4GXZA 3Q74A 2KLXA 2JADA 1K0DA 5D8IA 1Z7RA 2GT5A 5IPHA 4XCSA 4XS1A 2O89A 3VI5A 2LSTA 4MABA 5DAKA 1MD4A 4YQUA 4MK3A 1PKZA 2YPMA 3TRXA 1O7UA 3L0HA 3IK9A 5B6MA 2HZEB 3FZAA 3WT2A 3ERWA 1O81A 4NAXA 1JHBA 4F0CA 2GZPA 1HNCA 1KTEA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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