3TJJA

Crystal structure of human peroxiredoxin iv c245a mutant in sulfenylated form
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
167
structure length
166
Chain Sequence
LSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Peroxiredoxin-4
publication title Crystal Structure of Reduced and of Oxidized Peroxiredoxin IV Enzyme Reveals a Stable Oxidized Decamer and a Non-disulfide-bonded Intermediate in the Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Oxidoreductase
total genus 59
structure length 166
sequence length 167
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tjjA00
3EMPA 1ZMAA 4WEYA 4BPYA 2LEGA 2B3SA 1XCCA 3IE3A 1U3AA 17GSA 3WT2A 1E2YA 3PINA 1TRWA 4RUVA 3V1WA 3EVIA 4RI6A 3CXGA 1W4VA 2L57A 2OE1A 2X8HA 4IELA 2IMEA 2K8SA 2GQLA 1JZDA 4F03A 3F6DA 2F51A 1PMTA 3LORA 4EVMA 2WCIA 1BYEA 4ZL9A 1BQ7A 3GIXA 2G0FA 3WD6A 4YQMA 2H74A 1BX9A 3KCMA 4F9ZA 5A4UA 1QUWA 4LLRA 5L71A 4N10A 3ZIJA 5F8BA 5DQYA 1GSFA 3M0FA 4BWSA 5ECMB 4KDXA 1AC1A 3BCIA 2GZZA 5D96A 4GSNA 1GLPA 4HQSA 2LTKA 3EMXA 3I9V2 5EY6A 5LCZA 2PPTA 2NPBA 4I97A 2ZCTA 2H1BA 3KM6A 1K3LA 4FIWA 2H1DA 3ZIVA 2AB6A 3M8NA 3VPQA 1TTZA 1IYIA 2N5AA 2LNSA 5CREA 3ZTLA 2MMNA 3HVXA 2B5EA 2B5XA 2R2JA 1A2LA 3IK7A 2WJUA 5FT3A 4K1FA 1PN9A 2R37A 4OMVA 3GKMA 3J7Yb 3M9JA 2DJ1A 1WE0A 2B7KA 2RM5A 5CO3A 3HXSA 3KEBA 1SJZA 2R4VA 2NTOA 3NIVA 1GTAA 1HQOA 3LXTA 2JSYA 5D9WA 5LD0A 3TKRA 1QK8A 4L5OA 2VUPA 5KN0A 3DD3A 4K9ZA 3FZ5A 2IJYA 1V58A 5J4UA 3TJGA 2VCVA 3KD0A 1O8XA 1EP7A 5IIZA 2H66A 1AQXA 8GSSA 5EVOA 2LQQA 1I5GA 3LYPA 1JLVA 2H0GA 4DSSB 2H76A 3GSTA 2VLTA 5DQSA 5IOXA 4IW9A 3IRAA 4ZBBA 3GHAA 2IL3A 2P0GA 4LMWA 2C0EA 4WF4A 1V9WA 2MMZA 5IO0A 4WXTA 1GTBA 3F8UA 1GULA 3KH9A 3QAWA 5A5KA 2GLRA 1V57A 1XWKA 2V41A 3A2WA 4KUNA 4ZB6A 2C80A 1SKSB 5CRGA 5JCUA 3RAZA 3BCKA 4K0NA 3DVWA 1LU4A 2LQOA 3DXBA 4Z7XA 3GURA 1VGLA 4DEJA 3L0HA 1WIKA 1PD21 3GSSA 3VK9A 1PX6A 5IM9A 5B7CA 4IGJA 1VRSD 4ZB9A 3Q74A 4XS4B 2HYXA 5J41A 4GQCA 2D2ZA 1J0FA 5IO2A 4X0XA 5CNWA 4KSOA 2C3NA 3GTUA 1TU7A 1ON4A 3LFLA 3BBYA 4TKYA 3ZITA 3H4KA 3QR6A 4N11A 3GKXA 3HA9A 1GSQA 1TKDB 1OC3A 2YWMA 3IPZA 3L4NA 4GQFA 5H5QA 4MABA 3GH6A 4O7HA 2ZNMA 3VWUA 5AIVA 4MPFA 1GSDA 3SBCA 4ZBDA 3WGDA 5IPHA 3GH9A 2DMMA 4TR1B 3QD9A 1M2BA 2N5BA 3E9JB 2V1MA 1R26A 3CRUA 3DYRA 1OC9A 3S9FA 2K9FA 5AIXA 1AUCA 2H19A 4IQ1A 2HRNA 4HZ2A 3VI5A 1BEDA 2YV9A 3R2QA 5J5NA 4KH7A 4V2MA 1X9SB 1JZWA 2QKEA 1PL2A 1ILOA 1B4PA 4G19A 3QAVA 1SK0A 4I8BA 4RQXA 5DDLA 2CX4A 1FVKA 1U88A 4ZXGA 3HZ8A 1GWCA 3TCOA 3IA1A 4G9HA 1XW9A 1G0TA 3CSIA 3D6IA 2K6VA 2IMFA 1ZOFA 1GSEA 2VL2A 5CP1A 2ALBA 3FY7A 5EL8A 3ZL5A 1XW5A 5GSSA 4OCFA 2H72A 1B9YC 1SENA 5D9XA 2J23A 1K0DA 5ECRB 2JACA 1TJDA 5DAKB 2KP2A 4K8MA 1EGOA 4CW9A 2DBCA 3F0IA 1T3BA 2AYTA 1F3AA 2VCXA 3ZRDA 4V2LA 5IMDA 1Z6NA 1Z9HA 3ED3A 1B8XA 3LG6A 2AAWA 2VCZA 2KUCA 1GUMA 1EEMA 2GSSA 1S3AA 3FRCA 2GDRA 4MDCA 1YY7A 2NBSA 2IMIA 2IFQA 1EOHA 5H5RA 1TP9A 5INYA 3TKSA 1HNBA 2RUEA 1M99A 3GKKA 2ZUPA 4G2EA 4K7IA 2DLXA 4EXJA 4TXVA 2OACA 1ERWA 2HZEB 2H71A 1CQGA 4MF6A 1KBNA 2M80A 1ZYEA 5ECQB 1WMJA 1IYHA 1GH2A 1YKCA 3UVTA 1YKAA 3GRXA 3FEUA 3U6VA 4AJ7A 1GSYA 2I3YA 1U6TA 3MNGA 3FHKA 4GF0A 4ZILA 1TDIA 2X8CA 1ML6A 2JZTA 1YZXA 4CDOA 4ULXA 1R5PA 4X1UA 1S3DA 3IHQA 2YWNA 2C0FA 2B6MA 3FZ9A 2V6OA 3WT1A 1M2DA 2V6KA 2GGTA 1NSWA 3ME8A 1T7PB 5C00A 1PGTA 3DEXA 3TJBA 3HY2A 1FVJA 3GV1A 3HVVA 1UC7A 2P5QA 3P8WA 4QQ7A 4WBJA 3EWLA 2VIMA 2H6YA 2VL2C 1J08A 5ENUA 3F4SA 3ZVJD 1UN2A 1PX7A 5G5EA 1V40A 4TW5A 4WKWA 2PBJA 3HZ4A 2VCTA 3F3RA 4WF5A 3PGTA 3D21A 1XVWA 2CX3A 2VOCA 1ZZYA 3LSZA 4PNFA 2MYGA 4EF0A 2VLVA 1X0RA 4KB3A 3C1RA 1Q98A 2LRTA 2CVDA 1A24A 3EINA 3CSHA 1WWJA 1WPIA 5GZZB 4D73A 3FYGA 1F37A 4MA9A 4EDYA 4MPGA 3ERGA 1BG5A 4IHUA 4NXIA 4GRFA 1K0CA 3DMLA 3LJRA 5DBQA 1BAYA 6GSYA 1G7OA 2OBIA 2GZYA 1OAZA 2RIIA 5AISA 1B48A 3QPMA 5D9TA 1A0FA 1AAZA 2GSRA 4O32A 4PXOA 5ECHB 3KIJA 1JZRA 2CQ9A 2CA8A 3EU3A 3CSJA 4J57E 5GAND 2OE3A 2DMLA 1GUKA 5ELGA 2I9HA 2CZ3A 2GTUA 4O92A 3CBUA 3QAGA 2YCDA 1Z3EA 3PH9A 2HSYA 3HKRA 1Z7RA 3DVXA 2YWIA 5C04A 2LV3A 4KSMA 4XHMA 3VURA 2L5LA 2MBTA 5KN1A 4J2FA 1M2AA 1UA5A 1F2EA 2EIRA 4YAVA 3LEFA 1DBYA 3F4RA 5D93A 3CTFA 2OA7A 2RUFA 1AQVA 1EOGA 3TGZA 4ZBAA 3MSZA 2FLSA 4IVFA 4K6XA 4MMMA 3F6FA 5D9VA 2OADA 3EU4A 2FWHA 2PN8A 2P5RA 1SJ6A 1AQWA 3AY8A 1V98A 2JL4A 3VLNA 1VF3A 3OR5A 5B6MA 5ECNB 4JR4A 2JADA 1X9MB 3TJFA 4TXOB 1SD9A 2HLSA 2DJJA 3RBTA 1MDKA 2R6KA 2HFDA 4KCAA 1GNWA 2EC4A 2IN3A 2HT9A 3TKPA 3FR3A 3W8JA 1OVNA 3LYKA 1TK8B 1HNAA 4XS6A 1M0UA 4PUAA 1YF1A 4IBPA 2GQKA 3A5WA 4HS1A 4O5RA 2YJ7A 5LNKe 2EIOA 2A2RA 3UJ1A 5ABRA 3FZ4A 4MZBA 1XW6A 3ME7A 2YP6A 4HDEA 2FD3A 3I69A 4DSSA 2GS3A 2DIYA 5GAPD 3TJJA 2O87A 3TRPA 4BA7A 1FOVA 3IV4A 2FWGA 5DALB 3RPPA 3GUSA 3CTGA 3E0UA 1XBSA 2LKUA 1VF4A 4TR3A 3UBKA 2LJAA 2WFCA 2KOKA 2HXKA 2I4AA 1EWXA 5J3RA 4YQUA 3Q19A 1C72A 1XZOA 1BJXA 2B1KA 2RM6A 2VM1A 1GP1A 5IMZA 4EE0A 4IQAA 5F0GA 1AXDA 1XWAA 1A0RP 4XRDA 4XS4A 2DSAA 2LRCA 2YZHA 1R5AA 3ZREA 3D0ZA 2WS2A 10GSA 2F3MA 1KTEA 2JSZA 2A2SA 3CMIA 2F8FA 2L4CA 2WZ9A 5IOWA 1FG4A 2TRXA 5CAXA 4KNDA 3EURA 3LGCA 1XFLA 2IIYA 5G1KA 1THOA 5IMCA 4KCEA 3HD5A 3P2AA 2ES7A 3IR4A 1S3CA 2B5YA 3UL3A 2OJLA 4OD7A 2AHEA 5ECIB 4EC0A 4TR1A 4FYCA 3C7MA 2XBQA 2YWOA 2H8LA 3L9VA 1A23A 3I6AA 3G7IA 1O73A 2VLUA 5DJMA 1H4OA 6GSTA 1YF0A 4LL1B 4QL7A 4JBBA 3IAS2 1TRUA 4K7OA 1MDJA 1SK2A 2N5FA 2FA4A 1YDKA 2E0QA 1PA3A 3Q6OA 4OO4A 1F9MA 2H70A 2LJRA 11GSA 2CV4A 2H1GA 1SL0B 4NHZA 2O7KA 2H0HA 3GYKA 5G1LA 3TOUA 4GCIA 1OC9B 2F9SA 1QQ2A 2GSTA 3KMNA 3UOMA 2HNLA 2H6ZA 3D4MA 1CQHA 4ECCA 4Q5NA 4POBA 3C8EA 1SL1B 2XPEA 2Z9SA 1E6BA 4HOJA 4ID0A 1TOFA 5D73A 4FYBA 5G31A 3US3A 3GX8A 3KTLA 1G6YA 1GRXA 1URMA 2L6DA 9GSSA 1O7UA 2X8GA 1U3IA 4ILFA 4XCSA 1FW1A 4V1Ap 5DAKA 5KN2A 1FAAA 5ID2A 3FW2A 3G7YA 3GX0A 4H86A 1DE2A 2AV4A 1N8JA 2HSHA 2YZUA 3FZAA 3O76A 3K8NA 14GSA 1W89A 1OC8A 4ECIA 4ECJA 3UMAA 3QFAC 4PQIA 2IMKA 3HYPA 1KNGA 4PQ1A 1RK4A 1TW9A 4L8EA 1ZYQB 1KEBA 4PQHA 3IK9A 3KP9A 3FK8A 1J9BA 4WETA 5G5FA 2FWEA 1XVQA 5ECLB 1GNEA 4I2TA 4NAXA 2ON7A 3F9UA 4AJ6A 5AN1A 5F07A 4KX4A 1RW1A 5F06A 3ERFA 4LA1A 2X64A 4F2IA 3MAKA 2VCQA 1O8WA 4HJMA 1Z5YE 1HYUA 1Y25A 20GSA 1JLWA 1OKTA 4J56E 4NWYA 3TOTA 1VF1A 2IFQB 4IN0A 5ECSA 4GTUA 3FKFA 3WGXA 5KN3A 1FB0A 4Q5RA 2J9HA 2QC7A 4JR6A 3GA4A 2H6XA 5CRHA 1A2JA 2PUKC 3TDGA 4PNGA 4ZIJA 3D22A 1GLQA 4X43A 2B7JA 4TVEA 2CT6A 1GSSA 2BMXA 2MMOA 5G30A 1DUGA 1K0MA 1QXHA 3PR8A 2B1LA 2XBIA 2V2GA 2HE3A 2K8VA 3GFKA 5ELAA 4QL9A 2G2QA 1OE7A 4RQRA 2KHPA 2RLIA 1I9DA 2NDOA 3GMFA 3MWHA 1YEPA 3VWWA 5HR1A 2GQMA 2GVPA 1T4YA 2H01A 1NHYA 5B6NA 1NM3A 12GSA 4KE3A 5IQYA 3HJMA 3KXOA 4MH3A 4NV5A 3DWVA 2LNTA 3M3MA 3ZLPA 4TR4A 4EDZA 5IMVA 3I43A 4HQZA 2CVBA 1QFNA 4OFTA 4OFNA 2LRNA 2VO4A 3QCPA 5HQPA 5DCHA 3VFIA 2GT5A 1XIYA 1ERTA 1M7TA 5ECOB 2XPDA 5A4WA 2E7PA 1TI1A 2LS5A 4MJCA 1PQNA 1K0AA 4EUYA 4ISDA 4BVYA 1OKDA 4OWYA 1MD3A 2O85A 2PWJA 3ISOA 5A4VA 5HR0A 5J9BA 1EGRA 2E2MA 1T00A 4E8HA 4XRAA 3WYWA 2GT6A 1XOAA 4GSTA 1FO5A 4FO5A 2HZFA 3HHVA 4Q5QA 1A2MA 1SYXA 1XPVA 3NZNA 3TKQA 4EKZA 1YJ6A 1Z7PA 3TJKA 1LBKA 2LJKA 1T8EB 4POKA 4Q5FA 3W6GA 3EE2A 4K7NA 16GSA 2WULA 2C4JA 3C73A 4HUAA 5JCWA 3N9JA 2FGXA 4WBRD 1EEJA 3C71A 2H73A 1ERUA 1NW2A 1B4QA 2PGTA 5JWQB 2L6CA 2GZPA 2DJ2A 2YPMA 4GSSA 4L0WA 5HR2A 5DCGA 5ECPB 1NHOA 5FHIA 1O85A 1XXUA 4MCUA 2H0IA 2HRFA 3H79A 1H75A 2YANA 1SKWB 1X5DA 3M9KA 4E8EA 1SD8A 3L9SA 3ZFBA 4WR4A 2DIZA 2MMAA 3BJ5A 1O81A 4G10A 3H93A 3IDVA 2XC2A 4N30A 5J9CA 5IPGA 2LUSA 2VD0A 2DJ0A 1GUHA 1YQ1A 1AW9A 4MZWA 1MD4A 3BD2A 4JEDA 3TUEA 3ZMLA 4TXOA 3E3EA 2XHFA 3ZYWA 4ACSA 4LMVA 1T4ZA 4LL4B 3HDCA 1GTIA 1G7EA 1TI3A 4KDUA 2VM2A 4K0GA 4BL7A 4JU5A 2BJXA 1DSBA 5CRDA 2JZSA 4BVXA 4PURA 4ML1A 3IXRA 2FA8A 5FWGA 1JZOA 3RPNA 4I6XA 4EO3A 1F6MC 2C1YA 1TXXA 3GN3A 4GXZA 1A8LA 1WP0A 4YAPA 4HI7A 4OO5A 3RHCA 4I5QA 4YH2A 1MDIA 4POMA 3HJPA 2F8AA 4DSRA 5AGYA 3VWVA 2VAFA 4NV2A 5DALA 1XWBA 3O6TA 3HCZA 2V32A 1TK5B 3KH7A 1PSQA 1XWGA 2H75A 3APSA 4F82A 3M1GA 4MJEA 4JE1A 4HU9A 3TB2A 3WGEA 4NHWA 3CYNA 1B9XC 2C0GA 4HJ2A 2VCWA 3KJYA 2P31A 2LSTA 4K2DA 2FWFA 3J7Yk 2OKAA 2KP1A 4MH2A 4F0BA 2AUVA 3ZVJA 3GKNA 3DIEA 3FR9A 4IS0A 4PUFC 4CHSA 3VWXA 3DGQA 4RI7A 3UBLA 3A2XA 1WRYA 3IC4A 2FCHA 1ZGNA 4PX1A 1TU8A 4TRXA 4TR0A 3UVHA 1EP8A 3Q18A 4P3YB 2GSQA 2I81A 3TKSE 2YOIA 1MEKA 4KAEA 4MZCA 1JHBA 4ECBA 18GSA 2ON5A 3QFBC 5E4WA 4V2NA 1O6JA 1GTUA 1MTCA 5DVBA 1G6WA 2FUG2 3HJOA 2C3TA 5CYYA 3GTUB 1PKZA 2M46A 4AF2A 1SKRB 3HVSA 2VD1A 2FNOA 3O3TA 3H8QA 1U87A 4XTSA 3BOAA 1USBA 2CAIA 3LQ7A 4HU7A 4IJ3A 1JFUA 1PL1A 1R7HA 2YN1A 2DJ3A 4IJIA 2DC5A 4AJ8A 2PVQA 5HFGA 3NOFA 1YEXA 1LJRA 2PMTA 3DRNA 2HI7A 3C1SA 1SK1A 5H5SA 2NVLA 3G9BA 1GSUA 4MJBA 1FHEA 3QMXA 2JU5A 2WRTA 3ERWA 4GWRA 3D5JA 4TN8A 3QDNA 5IMAA 3MDKA 1ZCPA 1N2AA 5CRWA 1T1VA 2PERA 4I2UA 2EIQA 2IPAA 4V1Ag 4NMUA 3APOA 5G2ZA 4N0VA 4POLA 2C8UA 3KMOA 2L4QA 2X99A 4JZQA 4OCEA 7GSSA 2TIRA 1HNCA 4L0UA 3RHBA 1EV4A 1XWCA 3H1NA 1EZKA 3GL5A 1UVZA 1ST9A 3JCML 3VPTA 1TRSA 4JRRA 3IAM2 4MLYA 4ZL8A 1FB6A 5ID2B 3APQA 2L59A 2TRCP 3W8SA 4XIHA 3QOUA 1M9AA 1QGVA 2C0DA 5D8IA 3KGKA 3EYTA 2HZEA 3KP8A 13GSA 4IP6A 1X9WB 2L5OA 4L5LA 4XS1A 2VL3A 5COHA 5ECKB 4KGIA 22GSA 5B8BA 4KA0A 3LWAA 1SJIA 2MBSA 1K3YA 1SL2B 2YJHA 1K0OA 2REMA 3F63A 4EL1A 3IBHA 1X5EA 3ZZXA 3F3QA 4ZL7A 1Q4JA 2YV7A 2AJQB 1QMVA 1Y6EA 2JZRA 3VI7A 4OFMA 1XOBA 3P90A 4KW6A 1M9BA 4PGTA 1K0BA 5EPFA 2BTOT 2QGVA 1OYJA 1ABAA 4ZB8A 3FR6A 2OBKA 2VL9A 2WB9A 4GLTA 6GSSA 4MF7A 5E59A 5HFKA 1V2AA 3N5OA 4TOPA 4HEA2 3KTBA 4NPBA 2YNXA 1Z6MA 2KLXA 2H1AA 2M72A 1ZL9A 3UIWA 1X5CA 4KDYA 1SU9A 3F4TA 1TRVA 3LXZA 1RQMA 2QSIA 1HD2A 2A4VA 1K3OA 2H30A 2O89A 3G7JA 4MJAA 5GSTA 3L78A 4IKHA 1VF2A 4BWQA 2WGRA 2PVOC 4FH8A 3D4TA 5JCGA 1AIUA 1K0NA 3ZMKA 5B8AA 5JWOB 2IWTA 3A2VA 4AGSA 5DJLA 1ACVA 2PU9C 5KEJA 2OE0A 2CVKA 2K18A 3KZQA 2O8VB 4HZ4A 3CRTA 2IMDA 2R5GA 4MK3A 3SWLA 3IOSA 1GL8A 6GSUA 4YQVA 2E2GA 1OE8A 3GL3A 4N0ZA 4IP1A 1EV9A 1WOUA 5HFIA 5JWRB 1WJKA 6GSXA 5HR3A 2WDUA 4FYUA 1A8YA 3DKSA 3U5RE 5IMFA 3TRQA 4D73B 4F0CA 4ML6A 3TRXA 1TK0B 3GNJA 6GSVA 2I1UA 2FY6A 3UAPA 2DJKA 3ZFLA 4MF5A 1ERVA 1SYRA 3RDWA 1DE1A 2FHEA 3TKSC 3EC3A 3UEMA 3UARA 4MP4A 3L9UA 3A3TA 4DVCA 4DSQA 4WR5A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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