4TR3A

Mouse iodothyronine deiodinase 3 catalytic core, semet-labeled active site mutant secys->cys
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
GIDPFTGQKLDFFKQAHEGGPAPNSEVVRPDGFQSQRILDYAQGTRPLVLNFGSCTCPPFMARMSAFQRLVTKYQRDVDFLIIYIEEAHPSDGWVTTDSPYVIPQHRSLEDRVSAARVLQQGAPGCALVLDTMANSSSSAYGAYFERLYVIQSGTIMYQGGRGPDGYQVSELRTWLERYDEQLHGTRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Mus musculus
publication title Crystal structure of mammalian selenocysteine-dependent iodothyronine deiodinase suggests a peroxiredoxin-like catalytic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Type III iodothyronine deiodinase
total genus 53
structure length 188
sequence length 188
ec nomenclature ec 1.21.99.3: Thyroxine 5-deiodinase.
pdb deposition date 2014-06-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4tr3A00
3GX8A 3M0FA 3GL3A 2QGVA 3C71A 3F0IA 4I97A 5HFGA 2FWFA 1R5PA 1B9XC 3TUEA 1OAZA 4MH2A 3C7MA 1GULA 4JRRA 2FY6A 4PUFC 2C0DA 5DCHA 4V1Ap 4RUVA 1EZKA 4HDEA 1PL2A 4TVEA 1ERVA 4EE0A 2GT5A 4X1UA 4GXZA 1ZL9A 6GSYA 1GSYA 10GSA 2GTUA 1M9AA 1O8XA 2LNSA 2O7KA 2ZCTA 3IAM2 3F63A 3RHBA 2NVLA 1FO5A 2D2ZA 5F0GA 4AJ8A 3L9SA 3ZITA 3GMFA 3CRTA 3GUSA 5H5RA 4NV2A 1B8XA 1FB6A 1H75A 1WIKA 4N30A 3M1GA 3BCIA 3DD3A 3RPPA 2LSTA 2HRNA 2E0QA 2IWTA 1KTEA 3FY7A 3I69A 2GQLA 5B8AA 5J5NA 3FKFA 4YQVA 2QSIA 3GKKA 3TJJA 1Z6MA 4BL7A 1TRVA 1R5AA 2JZSA 5J9BA 1OYJA 3PR8A 5IOXA 3VWUA 5D9TA 2PMTA 4MF5A 2BJXA 1LJRA 18GSA 3FK8A 1UN2A 2LEGA 3E0UA 4L0WA 3A2VA 1KNGA 3HA9A 1JLVA 3M9KA 4PQHA 2CVDA 2VIMA 4IHUA 1SD9A 1PKZA 5CYYA 4XTSA 4XS4A 2B5XA 4K7NA 1FOVA 2GDRA 2MBSA 4POBA 5AIVA 1XZOA 4GSSA 3L4NA 4WBJA 2VL3A 3LGCA 1OC9B 2JACA 5GSTA 19GSA 3ZLPA 1XWGA 1Z7RA 4HZ2A 3GSTA 2C1YA 2V41A 2VLUA 3I6AA 4IVFA 3TJBA 2YWIA 2F8FA 3LSZA 4MDCA 3ZRDA 3F6FA 4PURA 3D0ZA 5ID2B 3PH9A 1T00A 3KP9A 3ZVJA 2PERA 2LRCA 4F9ZA 3M8NA 1TXXA 2LNTA 1XWAA 5ECOB 1K0NA 4OFTA 2L59A 1A8YA 5HFIA 3ZIJA 3KM6A 1K0OA 1THXA 1R26A 3PINA 1BJXA 1GL8A 2O87A 3IXRA 3D4MA 3IPZA 5G5EA 1QXHA 2WDUA 3IK7A 3MAKA 1EV9A 4HU7A 4KE3A 1CQHA 5F06A 1OE8A 3GN3A 1MTCA 1UC7A 2F9SA 4TR0A 5CO3A 4FO5A 4ZL7A 4TXOA 1DUGA 2WJUA 3APOA 2YWNA 5IQYA 4GQFA 3GA4A 1PRXA 3BBYA 4WF4A 3OR5A 3HDCA 2VCZA 1FW1A 5B7CA 1ML6A 2IPAA 5E4WA 4BA7A 4HJMA 2I4AA 5HQPA 4MK3A 4QL9A 1SJIA 4ZXGA 1SK1A 1TW9A 4IKHA 1K3LA 3CTGA 4MJBA 3HVVA 2DMLA 3LYPA 4NXIA 2WZ9A 1GRXA 3IE3A 1Z6NA 4PNFA 2H1GA 1M0UA 2HT9A 3MSZA 1HNBA 1GSUA 2V6KA 5HR3A 4OCFA 3IA1A 5ECHB 2VCTA 1V58A 1VRSD 3PGTA 5IMZA 3P8WA 3CSJA 1Q4JA 5CAXA 1QQ2A 4IQ1A 3O3TA 2I3YA 2F51A 1NSWA 3P7XA 2OE1A 4GRFA 4KUNA 1YF0A 1J9BA 2KP1A 1SYRA 1BX9A 5ECRB 2WS2A 1SL1B 2LQQA 1M99A 1PMTA 2P31A 5DALA 4ECCA 2ON7A 2DIZA 3FW2A 5LNKe 3KMNA 4EDZA 1EP8A 2M72A 1QK8A 5G1KA 2TRCP 4GLTA 2DJ2A 3UOMA 1HNAA 4RI7A 5AN1A 4DSRA 2WULA 3A2WA 5JWRB 3WGXA 3V1WA 5G2ZA 2GT6A 1B9YC 4WETA 2GLRA 2H6YA 2PUKC 2B1LA 1ERUA 3EMPA 3GH9A 3KGKA 2HZEA 2OBKA 4OD7A 2B6MA 2O8VB 5KEJA 1TU7A 1WMJA 3EVIA 1F2EA 1XOAA 2YNXA 2MYGA 2AHEA 3H79A 4I8BA 12GSA 1JFUA 4MABA 4D73B 2WCIA 3KIJA 3WGEA 1K3OA 2RM5A 4ECIA 1S3CA 2LRNA 2WRTA 4NWYA 5A5KA 4ZBDA 5KN1A 5LCZA 3UMAA 2YANA 3F4SA 2GZZA 2RUFA 5D96A 2TIRA 2B3SA 3WT1A 2RLIA 2DJJA 3DVXA 2V1MA 4EO3A 5A4WA 2MBTA 1MDKA 2NPBA 2LKUA 2QC7A 4KSMA 2CX4A 2FD3A 2DJ0A 1SKWB 4MZWA 5GAPD 1ERTA 2IMIA 4BVXA 3W8JA 6GSUA 1OC8A 5IMFA 1GTBA 2EC4A 1GLPA 2R37A 4DEJA 1ZOFA 2JADA 4TOPA 3Q18A 4TR4A 3DIEA 4NV5A 2JSYA 4LA1A 3VI5A 2YV7A 3GTUA 3MDKA 2MZCA 1T4ZA 2I81A 1LBKA 1Z9HA 2CZ2A 1WE0A 1DSBA 3H93A 3HVXA 1Y25A 4K8MA 1HD2A 2P5QA 2E2GA 1OE7A 3DXBA 5IMDA 1SKRB 2GVPA 2LS5A 5ECPB 2JZRA 4O32A 3BOAA 4TRXA 1MDIA 4X0XA 3VURA 1JLWA 3GX0A 3QAGA 4LL4B 13GSA 2L6CA 3AY8A 2H0IA 4IQAA 3HVSA 3GURA 5DJMA 2DLXA 1F3AA 4FYBA 1XWCA 3D6IA 2AB6A 5IMVA 5C04A 5F8BA 1OC3A 3QDNA 3BD2A 2C0GA 3R2QA 4N11A 2RIIA 2C3TA 5ECMB 2CVBA 2PBJA 3GKNA 3GKMA 5DAKB 4JE1A 3CMIA 3HKRA 5F07A 2H0GA 1A2JA 3ISOA 1KEBA 3ZMLA 2RUEA 5DVBA 3WGDA 3HZ4A 1I5GA 3I9V2 1YEXA 3KMOA 2XPEA 4XS1A 1O8WA 2OACA 2MMOA 3TGZA 2FHEA 3TRXA 1JZRA 1F37A 4LL1B 4WBRD 3EE2A 2H71A 2ZNMA 1OVNA 4RI6A 1PX6A 4DSSB 4F0CA 4POKA 2NBSA 2PGTA 16GSA 3D21A 1EGOA 3F3RA 3GL5A 2DC5A 4PX1A 3RBTA 5G1LA 1GTAA 3APQA 4PQ1A 4XRAA 4XIHA 5HR0A 2GSSA 1AXDA 4BWQA 1X5EA 2IIYA 5ECLB 4I6XA 1MEKA 4HEA2 1GNEA 4TR1B 3LORA 1XWKA 4BPYA 4G19A 3WT2A 4G10A 2O85A 4V1Ag 2CT6A 1EEMA 2BTOT 4K6XA 4I5QA 2YJHA 1KBNA 1GSFA 3CBUA 1HYUA 2O89A 3ED3A 1AAZA 2XPDA 4K7OA 3JCML 5JWOB 1E2YA 3L9VA 1UVZA 5C00A 2H74A 5B6MA 3SWLA 2HSYA 2HYXA 3TJKA 4BWSA 1IYHA 1K0BA 1URMA 3FZAA 3UBKA 4Z7XA 5JWQB 2VAFA 3F3QA 3A3TA 2CAIA 1A0RP 1FVKA 4ZB6A 2B7KA 6GSSA 2VOCA 4N10A 1K3YA 5EL8A 4IJIA 1G7OA 1G0TA 3E9JB 4GWRA 3F6DA 1ZGNA 1Z3EA 1SU9A 2FWHA 1X9MB 4GCIA 4ZBBA 3HJMA 5GSSA 2L4QA 3VWXA 3EMXA 5L71A 3FR6A 1NHOA 4EF0A 2F8AA 1ZMAA 1SJ6A 2IL3A 3GIXA 2B1KA 4MJEA 1VF2A 1SK2A 3ZYWA 4KAEA 2CZ3A 3F4RA 3LQ7A 4LMWA 1HNCA 4KNDA 3P90A 4K1FA 1O6JA 2H01A 3IRAA 3LXZA 2IFQB 4F2IA 4RQXA 1E6BA 5D93A 3DWVA 3SBCA 3EU4A 5ECQB 1GSQA 2XBIA 5IMCA 4ZILA 4EL1A 2B5EA 1SYXA 2VL2C 4I2UA 4YH2A 2XHFA 1JZDA 4OCEA 4ZBAA 1W4VA 6GSXA 4OO4A 4L5OA 4IP1A 1BG5A 1ERWA 1GTIA 2PWJA 3QFBC 2DJKA 1XW9A 3HYPA 4JEDA 1WOUA 1FB0A 1YJ6A 2ZUPA 2LQOA 3TKSC 2M80A 1WJKA 14GSA 2LUSA 2A2SA 5H5SA 2AUVA 1MD3A 4K0GA 2CVKA 3GRXA 4Q5NA 3VFIA 1NM3A 1VF3A 5KN3A 1A23A 3KEBA 5ENUA 4YAVA 4AJ6A 11GSA 1FAAA 4IP6A 5ECIB 1XW5A 1U87A 4MZBA 5JCUA 3FEUA 3H4KA 1TK5B 4XCSA 3E3EA 1NW2A 2HSHA 4NHZA 3RDWA 1U3IA 3L78A 3G9BA 3F4TA 1FHEA 3FR9A 3KCMA 3ZFBA 4EXJA 1EV4A 1A2LA 3IV4A 1BAYA 1SENA 2Z9SA 3LYKA 2V32A 5CRWA 2IMKA 1THOA 7GSSA 3UVTA 2VUPA 5CRDA 3KTBA 3LXTA 4KX4A 5DJLA 1A0FA 4X43A 5CRHA 4K9ZA 2X8HA 4HS1A 2HE3A 2IMEA 4Q5RA 4Q5QA 3NIVA 4PNGA 1B48A 4ZL8A 5H5QA 1PX7A 3C1SA 3TKSE 1EGRA 3GV1A 1YKAA 2LV3A 3QMXA 2B5YA 1N8JA 1EP7A 1F3BA 4AF2A 2L6DA 1A24A 1SK0A 1V2AA 2OE0A 5EVOA 1XVQA 1TRUA 4OMVA 4L0UA 2YZHA 1FG4A 3RAZA 1S3DA 3VLNA 1T4YA 4NHWA 2VM1A 1O81A 2I1UA 4ZL9A 2K9FA 1IYIA 2YZUA 1K0CA 1AW9A 5A4UA 5G5FA 2KHPA 4EKZA 3TB2A 1XIYA 3C8EA 4MPFA 5J9CA 1Y6EA 4K7IA 3D5JA 3WD6A 4J2FA 4ACSA 3TDGA 2WFCA 2X8GA 1USBA 4WXTA 5COHA 5CREA 1J08A 3IAS2 1K0MA 2MMZA 3HZ8A 2P5RA 4POLA 4KSOA 2VLVA 6GSVA 3UJ1A 2DBCA 2AYTA 2X8CA 3Q6OA 1R4WA 4XS4B 1ZYEA 3EWLA 3DEXA 2IMFA 1YDKA 3ZMKA 3U6VA 4RQRA 4PXOA 3UL3A 1DE2A 2L5LA 1V9WA 3VWVA 5LD0A 2YP6A 4QL7A 3RPNA 4DSQA 2H6ZA 3HY2A 2EIOA 3IDVA 2ON5A 3DYRA 3KJYA 5FHIA 3O6TA 1ZYQB 2CAQA 4JZQA 1V98A 2MMNA 3F9UA 2F3MA 3QAWA 2JU5A 2K8SA 3LJRA 3ZVJD 2P0GA 3KP8A 2OE3A 2HZFA 1JZOA 1N2AA 5DQYA 2E2MA 4JU5A 2H30A 1U88A 4XRDA 8GSSA 4JBBA 3GYKA 3QR6A 1RK4A 4CDOA 4F03A 5KN2A 5ABRA 1TU8A 1HQOA 2KUCA 3L0HA 1OC9A 1GH2A 1F6MC 3GNJA 2VM2A 1SKSB 5CNWA 4HQSA 2EIRA 3TKSA 3UBLA 5ECSA 5D9WA 3VK9A 3QFAC 1OKTA 3TKPA 4NPBA 1BYEA 3TJGA 1GLQA 3N5OA 4ML1A 4MMMA 1YY7A 2VD0A 3ZL5A 4V2MA 4TXOB 2A2RA 2LJAA 5ID2A 3LEFA 1ACVA 4PQIA 2HLSA 3ERGA 2C0EA 3HXSA 3U5RE 1J0FA 3IBHA 2N5BA 3C1RA 5KN0A 2IN3A 1U3AA 2FWEA 3CTFA 4E8EA 1TTZA 5D9XA 5D9VA 1EEJA 2DJ3A 4ILFA 3KH9A 1EWXA 2WB9A 2NTOA 4EDYA 3ME7A 3J7Yk 2R4VA 2YWMA 4O92A 1VGLA 17GSA 2C3QA 4IN0A 1YEPA 4HZ4A 2HFDA 2VCXA 4AJ7A 5GZZB 2NDOA 3GKXA 4WR5A 2PU9C 3TRQA 4GQCA 4CHSA 3HJPA 2OKAA 4ZB9A 1OKDA 4MZCA 2LJRA 4KCEA 1FVJA 2XC2A 3WYWA 2CA8A 2FLSA 3Q74A 5HR2A 2RM6A 5DALB 3FZ5A 4MH3A 1XOBA 2LJKA 4V2LA 2V6OA 3KXOA 1VF1A 3UIWA 2G0FA 1ZZYA 2J23A 1TI3A 2C0FA 3G7JA 1ABAA 2IMDA 4OO5A 2YPMA 1B4PA 3FR3A 2M46A 2AV4A 4IW9A 1B4QA 2VD1A 2PN8A 4ID0A 3VWWA 2KP2A 2C3NA 2H76A 4HU9A 5J41A 4OWYA 1S3AA 3H1NA 2R3XA 3MWHA 5J4UA 1UA5A 2H6XA 5AIXA 3NZNA 3TCOA 5JCWA 2HZEB 4QQ7A 2FGXA 2TRXA 3QPMA 4MA9A 1X5DA 4YQMA 3P2AA 1K0DA 3I43A 3EC3A 2OBIA 4KDUA 4EVMA 3DMLA 3CSIA 4MCUA 3EYTA 5AGYA 2LTKA 4IELA 3QCPA 3DGQA 3QAVA 4J56E 4L8EA 3TKRA 1TKDB 3A2XA 2HI7A 22GSA 5IPGA 2GZPA 3DRNA 1XPVA 4MPGA 4TW5A 5G30A 2H1BA 2IJYA 2YCDA 3ME8A 5ECKB 1WWJA 4FYUA 1TP9A 4YAPA 4N0VA 3VI7A 2X64A 1GSEA 2DSAA 2GZYA 2R2JA 2H72A 4GSNA 1TOFA 2C4JA 3HD5A 5IO2A 3US3A 2L4CA 3K8NA 1Z5YE 5DDLA 1T1VA 4MF6A 2GQMA 4ISDA 4MF7A 4D73A 2H0HA 2R5GA 3S9FA 4JR6A 2JL4A 3LWAA 4AGSA 1G7EA 4FIWA 1O73A 2DMMA 3L9UA 1A8LA 1JZWA 1AIUA 2VCVA 2XBQA 1T3BA 4KW6A 3IR4A 3VPTA 4NMUA 1ST9A 3GTUB 2VCWA 4XS6A 2PVQA 2JZTA 2B7JA 1LU4A 2H8LA 3KD0A 2PPTA 2KOKA 3GHAA 3IOSA 3FZ9A 4BVYA 2H70A 4PUAA 2GQKA 3HHVA 3VPQA 1YKCA 1XCCA 1VF4A 1NHYA 1EOGA 2H66A 1PSQA 2KLXA 2WGRA 3RHCA 3M9JA 4F82A 1GUHA 3GH6A 2AJQB 1RW1A 1PA3A 4DVCA 2YWOA 3APSA 4O5RA 3EU3A 1SD8A 4EUYA 1GSDA 3KZQA 1CQGA 3ERWA 4G9HA 3DKSA 3D4TA 2ES7A 2GSQA 3D22A 1G6YA 1QFNA 1SL0B 3TJFA 5F05A 1TJDA 4H86A 4E8HA 5EY6A 5HR1A 1RQMA 1Q98A 5D8IA 1EOHA 4KH7A 2H73A 4ULXA 3C73A 5IM9A 5DQSA 5CP1A 9GSSA 2FWGA 3CYNA 3ZFLA 2YN1A 5IIZA 2BMXA 1AQXA 2N5AA 2VO4A 2GS3A 3FYGA 1XVWA 1BQ7A 5B6NA 2K18A 2OADA 1QUWA 5DAKA 3IHQA 3HJOA 4KCAA 1M9BA 4HOJA 5J3RA 4TN8A 1SL2B 5A4VA 5IO0A 3O76A 5EPFA 4XHMA 3KTLA 1I9DA 1X9SB 5INYA 2H75A 3CRUA 3NOFA 3GFKA 2N5FA 1WRYA 2HXKA 3G7YA 3HCZA 4MJAA 4ML6A 2DIYA 1A2MA 4HJ2A 2H1DA 2YV9A 5FT3A 5D73A 6GSWA 3TOUA 3ZZXA 4HUAA 4DSSA 2AAWA 4N0ZA 3W8SA 1GUMA 2OA7A 3G7IA 3N9JA 1PKWA 1ILOA 1M7TA 1PQNA 4I2TA 1M2BA 4P3YB 4NAXA 1YQ1A 2REMA 2DJ1A 4L5LA 1T8EB 4WKWA 2HRFA 4OFMA 5ELGA 5IMAA 3GSSA 4TR1A 2G2QA 2K8VA 4Q5FA 1Z7PA 1XW6A 3BJ5A 3FHKA 2ALBA 4KA0A 2FA4A 1MD4A 3ZREA 5IOWA 4TR3A 4J57E 2MMAA 5DBQA 4TKYA 4EC0A 5JCGA 1TK0B 3BCKA 4TXVA 1O85A 1XFLA 5CRGA 3CSHA 4KB3A 2R6KA 5AISA 3TRPA 1G6WA 4ZIJA 1AUCA 2FCHA 3FRCA 1AC1A 3FZ4A 1V57A 3ZIVA 4F0BA 4LMVA 2C80A 1XBSA 3CXGA 2GGTA 2HNLA 3QOUA 4MJCA 1R7HA 3KH7A 2K6VA 4G2EA 2FA8A 2EIQA 1SJZA 6GSTA 4WR4A 3IC4A 1U6TA 3F8UA 3LFLA 3DVWA 2YOIA 3LG6A 3H8QA 1M2AA 4GF0A 3EINA 5ECNB 4IJ3A 4WF5A 2E7PA 1JHBA 4IBPA 2VL2A 4YQUA 3UEMA 2GSRA 2JSZA 5IPHA 4GSTA 1QMVA 2L57A 1WPIA 4KDYA 4V2NA 4MLYA 2X99A 1QGVA 4WEYA 1PL1A 2H19A 2QKEA 4JR4A 2IFQA 3EURA 1GNWA 1T7PB 1GP1A 2OJLA 2VLTA 1YZXA 3QD9A 1V40A 3UAPA 3TOTA 2H1AA 3MNGA 5ELAA 4IGJA 5DCGA 3J7Yb 1YF1A 2PVOC 4OFNA 1C72A 1PD21 1F9MA 3W6GA 1M2DA 3ERFA 4PGTA 2L5OA 1TRSA 1X0RA 4ECJA 5G31A 2A4VA 5B8BA 4GTUA 3M3MA 4O7HA 4LLRA 2CQ9A 3Q19A 1DBYA 1ON4A 3A5WA 1BEDA 3IK9A 4CW9A 4ECBA 2C8UA 1X9WB 5FWGA 3ZTLA 2I9HA 5E59A 1O7UA 4HQZA 4POMA 2GSTA 1XWBA 1K0AA 1W89A 4ZB8A 3TKQA 3UARA 4K0NA 4MP4A 1DE1A 1GTUA 1TRWA 1H4OA 1AQWA 4KGIA 2FUG2 1GWCA 4IS0A 1TK8B 2LRTA 2YJ7A 4FYCA 1XXUA 2CX3A 1MDJA 1GUKA 1GSSA 2CV4A 4KDXA 1PN9A 2V2GA 5HFKA 20GSA 1WP0A 1ZCPA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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