4TR3A

Mouse iodothyronine deiodinase 3 catalytic core, semet-labeled active site mutant secys->cys
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
b'GIDPFTGQKLDFFKQAHEGGPAPNSEVVRPDGFQSQRILDYAQGTRPLVLNFGSCTCPPFMARMSAFQRLVTKYQRDVDFLIIYIEEAHPSDGWVTTDSPYVIPQHRSLEDRVSAARVLQQGAPGCALVLDTMANSSSSAYGAYFERLYVIQSGTIMYQGGRGPDGYQVSELRTWLERYDEQLHGTRP'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of mammalian selenocysteine-dependent iodothyronine deiodinase suggests a peroxiredoxin-like catalytic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Type III iodothyronine deiodinase
source organism Mus musculus
molecule tags Oxidoreductase
total genus 53
structure length 188
sequence length 188
ec nomenclature ec 1.21.99.3: Thyroxine 5-deiodinase.
pdb deposition date 2014-06-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4tr3A00
4HI7A 3D5JA 1JZRA 4KA0A 2XBIA 4ZB6A 3APQA 1T4YA 4J2FA 1F3AA 4GQCA 3EC3A 3L9UA 1EEMA 4TN8A 2MMZA 1A2JA 2PVQA 3M3MA 2TRCP 3H1NA 1B4PA 3ZL5A 3L0HA 1RQMA 3LSZA 4K8MA 5A4VA 5DCHA 2KLXA 2R2JA 4RI6A 3CRTA 5ECMB 5ID2B 2B6MA 3F6DA 3H79A 4V2NA 1R4WA 4TR3A 1GLQA 2IPAA 1XCCA 3SWLA 5J5NA 2O7KA 4AGSA 6GSTA 3IA1A 2LV3A 3IPZA 2PUKC 2HZEA 4E8HA 2O8VB 4I2UA 1SJ6A 2QGVA 1VF4A 2A2SA 3GSSA 1A0RP 1THXA 3LQ7A 2FNOA 3GHAA 2DJKA 5EL8A 3IK7A 2HT9A 3EE2A 3ZYWA 2VL2A 1OC8A 4KCAA 2F8FA 4IP6A 3U5RE 4L0WA 3RPPA 4YAVA 5IMCA 4IQ1A 6GSXA 4PNGA 5LCZA 2YNXA 5HFGA 2BTOT 2GZYA 2AUVA 2X8CA 2O87A 5AIXA 5ECNB 3ZREA 4IBPA 1XWGA 3DD3A 1I5GA 4XRAA 2BJXA 2FWEA 1ZGNA 4MZCA 1JZDA 3HZ8A 4L0UA 2I4AA 1WE0A 1TTZA 4IGJA 4LMVA 4N0ZA 4TR0A 2F9SA 1W89A 3G9BA 1SL1B 3GL3A 3HCZA 3VPQA 4HU9A 1Z5YE 1XW9A 2M46A 3QR6A 4ZL8A 2JADA 2HI7A 4PGTA 1V9WA 19GSA 1OAZA 2FGXA 1M2AA 3M8NA 2CVBA 4JBBA 4I2TA 1ILOA 2NDOA 2F8AA 1Y25A 3IBHA 2WZ9A 2OE0A 1EV4A 1DSBA 2C0GA 3QAGA 3N5OA 1TJDA 1N8JA 17GSA 3DVXA 4NXIA 1SENA 2VD0A 3APOA 5G5FA 3GKNA 2RLIA 4WBJA 4N11A 1M9AA 3C1RA 3MAKA 3G7JA 5CNWA 4HZ4A 3UEMA 2NBSA 4N0VA 2RM6A 1TRSA 4DVCA 2CX4A 16GSA 4HQSA 2MYGA 1PMTA 1PKZA 5AGYA 4MJCA 2GTUA 3EU3A 3GUSA 1EP7A 1EV9A 2EIQA 4EKZA 2R4VA 3G7IA 3F4TA 5DJLA 1M7TA 2LJKA 3BD2A 1T00A 1LU4A 5IMAA 1GSQA 5ABRA 2YZUA 2HSYA 7GSSA 5J3RA 2K18A 1BJXA 1A8YA 3L78A 4MPFA 1DE1A 2OA7A 4POLA 6GSWA 14GSA 2LQOA 3APSA 2OE1A 4I5QA 2L59A 2ZNMA 1THOA 3RBTA 4ACSA 3GX8A 1BQ7A 3C7MA 5CAXA 1LJRA 3M9JA 1K0AA 1SYRA 3LG6A 2WB9A 5H5SA 4WF4A 3GKXA 4FO5A 5ENUA 2KP2A 3E9JB 1K0CA 1WMJA 9GSSA 4BVYA 3TRQA 3P90A 4GXZA 2H0IA 5ECPB 1A24A 3FYGA 4Z7XA 1FVKA 1GP1A 1SL2B 3DRNA 3GN3A 5F05A 1TP9A 5D9XA 3EINA 3AY8A 1WRYA 1TOFA 4OMVA 4O92A 1YQ1A 4O5RA 2H1DA 3HVVA 3GYKA 3HJMA 3FHKA 2KHPA 2HSHA 1X5EA 2F51A 5CRHA 2H8LA 3JCML 1J08A 5GAND 4POKA 4P3YB 5GZZB 3NOFA 2L5OA 3RAZA 3EU4A 2DMMA 4WXTA 3M0FA 3MSZA 1ABAA 1F6MC 2X8GA 1Z3EA 4NMUA 1QK8A 4OCFA 3TJBA 3C1SA 2AJQB 4MZBA 1M0UA 1F9MA 4FYUA 2DJ0A 2FLSA 1EP8A 1O7UA 4KE3A 4TXOB 1PL1A 4ZIJA 1HNCA 4HZ2A 4YH2A 2N5BA 5HR3A 3ERGA 4F0CA 3K8NA 2PWJA 2JL4A 3D22A 3TUEA 3HVXA 3E0UA 3Q74A 5AN1A 5IQYA 4WETA 1XWAA 3CTGA 2DLXA 3C71A 5EY6A 3P7XA 4IJIA 5ECRB 3KIJA 4MABA 3HA9A 11GSA 5D93A 4D73B 4LLRA 5ECSA 4MF6A 4XS6A 2DJ3A 1OYJA 5IOXA 3ZFLA 5IPHA 1B9XC 1NHYA 3HYPA 2L4CA 2B3SA 1F37A 2GSTA 3H4KA 3UJ1A 1WJKA 4XCSA 1UVZA 2WULA 2YWOA 4POMA 6GSYA 3LXTA 2WRTA 4CHSA 1B9YC 2H19A 2YN1A 4PX1A 4MJBA 2H74A 3IAM2 4PUAA 2A2RA 4XIHA 1SJIA 4ECBA 5B6NA 3ZIVA 1OKDA 20GSA 1GWCA 2MBSA 3GH6A 2GZPA 2L6DA 4Q5QA 3W6GA 5KN1A 4FIWA 4DSSB 2DJ1A 2IL3A 2H01A 1YKAA 3FEUA 4WF5A 4F9ZA 1JZWA 2AB6A 4MH3A 1TRWA 1AUCA 3KEBA 4JE1A 3W8SA 2CZ3A 3VI5A 4XTSA 4K0GA 3IDVA 3ZVJA 4ILFA 2LNTA 1XBSA 1GLPA 1VGLA 4TRXA 4PQHA 3TB2A 5C00A 4IKHA 1XWKA 2DJ2A 3IOSA 4L8EA 4KUNA 4O7HA 5D9VA 5ECLB 1ACVA 5JCWA 4E8EA 3KH7A 2IFQA 2VCTA 4DSQA 4ZBDA 2J9HA 3A2VA 3IR4A 1MD4A 1S3DA 1ST9A 2E7PA 2VL9A 2K8VA 3UVTA 1Z6NA 2GQLA 1WPIA 5GSSA 4H86A 1Z6MA 1T4ZA 1AQXA 2H0GA 1QGVA 2AAWA 3KGKA 4F03A 3L9VA 5DAKB 1V2AA 3KD0A 3ISOA 2YJHA 4RQRA 1EZKA 3KP9A 4XS1A 3KJYA 2H70A 3EYTA 2LKUA 2FD3A 4GSSA 2E2GA 4ML1A 3IHQA 3TKSC 2MMAA 1GULA 3ME7A 1KEBA 5D8IA 2B5YA 1JZOA 4TR4A 1PRXA 4RUVA 4EDYA 3CSJA 3LFLA 1ZCPA 4MZWA 1A2LA 3TKRA 3ERFA 1A0FA 1HNAA 2C0FA 2FY6A 2IWTA 3ED3A 1PA3A 4DSSA 1K3LA 4HDEA 2HNLA 18GSA 4MA9A 2H76A 4MPGA 1O85A 3FKFA 2HZFA 4YQMA 1Q4JA 4PXOA 5FHIA 2YP6A 1PX7A 1XW5A 4KSMA 5INYA 1R7HA 2GT6A 2VOCA 5KN2A 2EIRA 4ZBBA 2C4JA 3KM6A 2IMEA 2IMIA 5F8BA 2X64A 2XC2A 1G7OA 4OD7A 3FK8A 2JZTA 5CREA 4O32A 3F3RA 3WGDA 2GSRA 2GSQA 1G6WA 2CAIA 1WOUA 2OACA 3KMOA 4AJ8A 2RUEA 1B8XA 3IRAA 5DALA 4AF2A 2PGTA 2OKAA 5JCUA 3CSHA 2C3TA 4AJ7A 4OFTA 5G31A 4ISDA 4L5LA 2DBCA 3PH9A 3GL5A 4GF0A 5ECIB 4NHWA 2XPDA 4HU7A 2G2QA 1FB0A 1PSQA 5G5EA 4YQVA 1EOGA 2B5EA 3CTFA 4J57E 3KXOA 4N30A 4XS4B 3TCOA 2XBQA 3UL3A 2H1GA 3PGTA 3D4TA 1TU7A 2HFDA 3QAVA 1GUMA 1MDIA 3D21A 5G30A 1XVWA 3EVIA 4BVXA 2R37A 2WS2A 5J9CA 4K7OA 1GTBA 3HXSA 4EF0A 3LXZA 2VCQA 4FYBA 2FHEA 2EC4A 3BBYA 1MD3A 3S9FA 4V1Ap 5IOWA 3TJFA 1U3AA 5ID2A 22GSA 4GRFA 2WDUA 2F3MA 2KP1A 2VLTA 1O6JA 1QFNA 1F2EA 4HOJA 3GNJA 4KAEA 3EWLA 1R5AA 1J9BA 3F9UA 3GV1A 5IM9A 5E4WA 2CZ2A 1AIUA 2P31A 2R6KA 5H5QA 3TJKA 2VD1A 3TKSA 5C04A 1O81A 1FO5A 3GTUB 3C8EA 3OR5A 2ALBA 1DUGA 3GSTA 5ECOB 2O89A 4IN0A 2CQ9A 2YJ7A 2I1UA 3RPNA 3VPTA 1VF1A 5E59A 3WGXA 2DIZA 4K7NA 4G10A 2H73A 1O8WA 2LRTA 4JRRA 5CYYA 1FB6A 5CRWA 5IMZA 2H1AA 1YKCA 1WIKA 2IMKA 6GSUA 2X8HA 3TJJA 2GLRA 2JSZA 4XS4A 1XXUA 1NW2A 2VCWA 3TJGA 2OADA 4GTUA 1GUHA 2LQQA 6GSSA 2FA8A 3ZTLA 1GUKA 2IMDA 1E6BA 2L57A 1H4OA 1K0OA 4GSNA 3DXBA 3EMPA 2CX3A 2FA4A 1V98A 2LSTA 2R3XA 2YCDA 3L4NA 8GSSA 3IXRA 3VFIA 2E0QA 3DVWA 1YEXA 3QFAC 3PINA 1G7EA 4WEYA 3BOAA 2K6VA 2IMFA 1TK5B 2DC5A 1K0DA 5J9BA 2K8SA 1V57A 3KP8A 1BAYA 1TRVA 5B7CA 3FZAA 1SJZA 3D6IA 3ME8A 3NZNA 5KN0A 1HQOA 1GSDA 1TXXA 4MCUA 1TK0B 1TKDB 1Z7PA 1SK1A 3QPMA 3VURA 6GSVA 5HFIA 1HNBA 2BMXA 4ID0A 5CO3A 1Z9HA 2FUG2 4X0XA 2VM1A 2PU9C 2IIYA 2VLUA 3FZ5A 4G19A 5JCGA 1GTIA 3CXGA 4ZL9A 5HQPA 1LBKA 2FCHA 2VLVA 4LA1A 5HR1A 2P0GA 1QXHA 4V2MA 1WWJA 1TW9A 4ZB9A 5CRGA 4I97A 4ZILA 1B48A 1FVJA 5LNKe 1BX9A 1ERVA 1RK4A 3F4RA 1T3BA 4LMWA 1CQGA 5COHA 1MDJA 1DE2A 3UBKA 1MTCA 4KSOA 3G7YA 5G1LA 3A2WA 3FR6A 4TR1B 2B5XA 4K1FA 4HUAA 5IMDA 3GX0A 3A2XA 5HFKA 1QMVA 3EMXA 2C0DA 1YF1A 2H30A 2V6KA 4KX4A 1GSSA 5A4WA 2LUSA 3IAS2 4MP4A 4GSTA 3TKQA 5IPGA 1N2AA 5KEJA 2H1BA 5CP1A 3UAPA 1ML6A 3IE3A 3QDNA 4HQZA 1T8EB 3ZRDA 4KDUA 1PX6A 3CYNA 1BG5A 1AAZA 2I9HA 1RW1A 1UN2A 2RM5A 1EGRA 2HLSA 4EUYA 3GKKA 2G0FA 5D96A 2I3YA 3FZ9A 3BJ5A 4ZBAA 1R5PA 4K6XA 5JWRB 1TK8B 3Q18A 2DJJA 3VWXA 1FW1A 4IP1A 1GTUA 4Q5NA 2Z9SA 4X43A 2XPEA 3V1WA 1SL0B 2AHEA 4LL1B 5J41A 2ES7A 2H66A 3DGQA 2CV4A 1M2BA 2VCVA 3ZIJA 2A4VA 4EE0A 4GQFA 1PL2A 3LEFA 5DJMA 3MDKA 1EGOA 2JSYA 1UC7A 2PBJA 1GSEA 2VL3A 1URMA 2H6YA 5IMVA 3WT1A 2EIOA 5D73A 1OC9B 1ERTA 2I81A 2H0HA 5HR2A 1G0TA 2GDRA 1WP0A 4WKWA 1W4VA 4TXOA 1EWXA 3UMAA 3O6TA 2QC7A 3F63A 2CVKA 3P2AA 2E2MA 3F6FA 3RHCA 3LJRA 1KTEA 4HS1A 1S3AA 3TDGA 2VCZA 3HKRA 1JLVA 4TR1A 4MLYA 2KOKA 2YANA 2PN8A 2OE3A 1SKSB 2PVOC 4D73A 3KTLA 3Q19A 5D9WA 1OVNA 4NWYA 5A5KA 2DSAA 1O8XA 4ZXGA 4IJ3A 2VM2A 1S3CA 4OWYA 5ELAA 1GSYA 1K0NA 3U6VA 3R2QA 3VI7A 4BL7A 4KW6A 1XZOA 1YJ6A 4L5OA 3HD5A 3FW2A 3WGEA 2C3NA 2J23A 4KCEA 1ZL9A 3UBLA 2GT5A 4QL9A 4YAPA 1OC3A 3I69A 3ZMLA 4BWQA 5D9TA 4ECJA 2GGTA 1NM3A 2C1YA 12GSA 4QQ7A 3ZMKA 4K9ZA 2HRFA 4ECIA 2P5QA 2B1KA 2MZCA 3C73A 4PUFC 4RQXA 2YOIA 1V40A 4XRDA 3GH9A 3ZITA 4EDZA 5F0GA 2N5FA 4JZQA 5IIZA 1EOHA 4KB3A 1GRXA 4WR5A 1TI3A 3LGCA 4MJEA 4JU5A 2YZHA 2LJAA 1BEDA 3VWUA 2ZCTA 4TOPA 1OC9A 3SBCA 3ERWA 4EVMA 4K2DA 2LTKA 4HEA2 3VLNA 2V41A 4WBRD 2RIIA 3VK9A 2VO4A 3TRXA 4F82A 1U6TA 5KN3A 2IN3A 3GIXA 2XHFA 10GSA 4IQAA 3BCKA 4PQ1A 1BYEA 1X5DA 5AIVA 3I9V2 1MDKA 2R5GA 4DEJA 5JWOB 2JACA 2FWHA 3QOUA 4Q5RA 1K0MA 3KZQA 4TKYA 5DQYA 3QAWA 2LRCA 5DAKA 4TXVA 3WT2A 3FY7A 1OKTA 3W8JA 1I9DA 5B6MA 2WJUA 2JU5A 3QFBC 1IYHA 5DCGA 2P5RA 3KTBA 3I43A 1X0RA 4ML6A 3IV4A 3Q6OA 5ELGA 3L9SA 1NHOA 4MK3A 4OO4A 1PGTA 1ERUA 3F8UA 2OBIA 4I8BA 1R26A 3O3TA 3H93A 2VUPA 4YQUA 3UIWA 1B4QA 1DBYA 1FG4A 4PQIA 1GNEA 3FR9A 1A2MA 3DIEA 2V2GA 2MBTA 4IELA 1M9BA 3ZZXA 1SU9A 4IVFA 3TKSE 4GWRA 1M2DA 5FWGA 1VRSD 2QSIA 5EPFA 5GSTA 2HRNA 4IW9A 2LRNA 1ERWA 3QCPA 1SKRB 1HD2A 1T1VA 2AYTA 3LYPA 4KNDA 3VWVA 2YWNA 3DMLA 1HYUA 4PURA 1IYIA 3CSIA 2C80A 3ZFBA 3TOUA 2O85A 2H6XA 1A8LA 4X1UA 2YV7A 2QKEA 4EL1A 4OCEA 2L5LA 13GSA 4I6XA 1U87A 3DYRA 1GL8A 2K9FA 4OFMA 2V1MA 1GTAA 2HYXA 2LEGA 4MF7A 2H75A 1MEKA 2H72A 4IS0A 1TRUA 4J56E 1YZXA 3VWWA 5IO2A 3GA4A 3KH9A 5ECHB 4KDXA 3WYWA 5GAPD 5DDLA 5LD0A 2VCXA 5DBQA 1T7PB 4HJMA 4CW9A 3D0ZA 2LS5A 1K3YA 3KCMA 1SK0A 2YPMA 5J4UA 3E3EA 2NPBA 4Q5FA 2X99A 5A4UA 5F07A 1NSWA 4EO3A 1XWBA 2RUFA 3HJPA 3O76A 2HE3A 1ZYEA 3H8QA 2WGRA 5EVOA 3M1GA 1TU8A 4IHUA 1XIYA 2L4QA 1ZOFA 2ZUPA 4EC0A 1AQVA 1USBA 4KDYA 4MDCA 4POBA 1YEPA 2JZSA 5F06A 1F3BA 2ON5A 4BPYA 3LORA 4K0NA 4AJ6A 1JLWA 2CVDA 4NV2A 1AW9A 3ZLPA 3HY2A 2VAFA 2OJLA 4NPBA 2M72A 1K3OA 4WR4A 4EXJA 4G2EA 1JHBA 1JFUA 5JWQB 3HJOA 3KMNA 5AISA 4V2LA 5G2ZA 2V6OA 2C0EA 3A5WA 4MH2A 1J0FA 4F2IA 1KNGA 4BA7A 1XFLA 4GLTA 4ZL7A 3QMXA 1TDIA 1XW6A 1YF0A 1PN9A 1U88A 3HZ4A 4NV5A 3US3A 5FT3A 2V32A 2TRXA 2DMLA 2NTOA 3GTUA 3EURA 2CA8A 1AQWA 3J7Yk 1Z7RA 2PERA 5ECQB 4QL7A 2WFCA 4ECCA 1GNWA 3F4SA 1OE8A 1OE7A 2GZZA 2HXKA 1M99A 4V1Ag 5CRDA 3GFKA 1X5CA 3UARA 3UVHA 4KGIA 4NAXA 5DVBA 3IK9A 4KH7A 2LJRA 1YDKA 3GURA 1FHEA 3UOMA 4G9HA 1TI1A 2D2ZA 4PNFA 4XHMA 2CT6A 4CDOA 2M80A 1CQHA 3BCIA 1XOAA 2IJYA 1GH2A 1O73A 3LYKA 1C72A 1GSFA 2YWIA 4DSRA 3F0IA 4MJAA 5L71A 3GRXA 4OFNA 1GSUA 3MWHA 2LNSA 2IFQB 2MMOA 3TOTA 3HHVA 2FWGA 1H75A 1SYXA 4ZB8A 1AXDA 3TGZA 2NVLA 3FR3A 1VF2A 1PQNA 5IO0A 2CAQA 5HR0A 3J7Yb 3PR8A 3DEXA 3D4MA 4MF5A 1XPVA 4TVEA 4JR6A 4NHZA 3GKMA 2H6ZA 1FOVA 1QQ2A 3NIVA 4JR4A 3FZ4A 3M9KA 2KUCA 1X9SB 3TKPA 4ULXA 5DQSA 1FAAA 2GSSA 3RHBA 3FRCA 2YV9A 3HDCA 1E2YA 1K0BA 3IC4A 1SD9A 2AV4A 3ZVJD 2VL2C 3P8WA 2JZRA 1V58A 1PD21 1VF3A 4BWSA 1SD8A 2N5AA 4JEDA 4OO5A 4MMMA 1SK2A 1X9MB 2L6CA 4FYCA 1QUWA 2B7JA 4TW5A 3CBUA 1XVQA 3WD6A 1XWCA 2GQMA 2B7KA 5ECKB 2MMNA 1Y6EA 4K7IA 5B8BA 3N9JA 2VIMA 4FH8A 3DKSA 1SKWB 4GCIA 4N10A 1YY7A 2HZEB 1ON4A 2GQKA 4HJ2A 3LWAA 5IMFA 1U3IA 3TRPA 2C8UA 1EEJA 1UA5A 5B8AA 2GS3A 2FWFA 5G1KA 3GMFA 1XOBA 3CRUA 2GVPA 4RI7A 4F0BA 2PMTA 2C3QA 1AC1A 1X9WB 3DWVA 2TIRA 2WCIA 2REMA 2ON7A 3A3TA 2OBKA 5DALB 3MNGA 1ZZYA 5H5RA 1Q98A 3QD9A 2DIYA 1PKWA 3I6AA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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