4KW6 | Genus

Total Genus 52

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	52
sequence length	172
structure length	172
Chain Sequence	HMSKAFIGKPAPDFATKAVFDGDFVDVKLSDYKGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRFPEFKNLNVAVLACSTDSVFSHLAWINTPRKHGGLGDMKIPVLADTNHQIAKDYGVLKDDEGIAYRGLFIIDPKGILRQITINDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Ancylostoma ceylanicum
publication title	Peroxiredoxin-1 from the Human Hookworm Ancylostoma ceylanicum Forms a Stable Oxidized Decamer and Is Covalently Inhibited by Conoidin A. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Peroxiredoxin-1
total genus	52
structure length	172
sequence length	172
chains with identical sequence	B, C, D, E
ec nomenclature	ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date	2013-05-23

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00578	AhpC-TSA	AhpC/TSA family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4kw6A00

4TW5A 1C72A 5F0GA 1GULA 2R2JA 1SK1A 4POBA 3VURA 4PUAA 1DE1A 3AY8A 4KDYA 2VLVA 3EYTA 2QSIA 2E0QA 2JACA 1QMVA 1TK0B 5H5SA 3IPZA 3IAM2 1BEDA 3A5WA 4MPGA 3FYGA 4AF2A 5KN0A 2HSYA 3HHVA 2EIOA 3IC4A 3L4NA 4GTUA 1J9BA 2IN3A 2BJXA 4Z7XA 1B4PA 4GCIA 1SD8A 3CRTA 4F03A 3LYKA 2YV9A 1YEPA 5DVBA 2A2RA 5H5QA 3H79A 3UBKA 2JSZA 1M9BA 11GSA 4OD7A 1YEXA 4XS1A 3IK9A 2F9SA 4KDXA 4MF7A 5A4WA 1SL0B 20GSA 1G6WA 2TIRA 4HI7A 1Z6NA 3UBLA 2IMDA 1A0FA 4MJAA 3EU3A 3Q19A 4WR5A 2XPEA 4IQAA 1M2BA 1YKAA 1B9XC 3GMFA 2B7KA 1B8XA 4TVEA 1F37A 4XHMA 1NSWA 5DDLA 4X1UA 3QAWA 4E8EA 3VWWA 2LSTA 2L59A 1Z7PA 1XW5A 3DMLA 4KDUA 2C3QA 4LL4B 2FA8A 1TRWA 1VF4A 1EV9A 1XVQA 5HR1A 1JZRA 3GKXA 2OJLA 1T1VA 2OE1A 3TKPA 2GT6A 2R6KA 2GLRA 2EIRA 2DC5A 1FVKA 1SK0A 1PRXA 1B4QA 2P5QA 1GSSA 1O85A 2PERA 5G2ZA 2GGTA 3QFAC 2YZHA 1BX9A 3D21A 3GHAA 1J08A 5E59A 1GSEA 5EY6A 2CT6A 1G7OA 1V2AA 1FHEA 5D8IA 2PU9C 4EE0A 4K7OA 2ZCTA 5IM9A 3W8JA 3G9BA 2FUG2 4N0VA 3ED3A 1ERUA 3DYRA 3RBTA 2WRTA 2CAIA 3R2QA 3UMAA 1USBA 3BJ5A 3BD2A 3K8NA 4GWRA 2JZRA 5B7CA 2HI7A 1RQMA 3F4SA 1FB6A 3DVWA 3N9JA 1W4VA 6GSWA 3TGZA 4H86A 1FO5A 2IL3A 2CAQA 4YH2A 2NDOA 3UVHA 3APSA 1AC1A 2YNXA 3GTUA 2H6YA 4TR1A 4G2EA 2FWGA 2H6XA 3E3EA 3ZMLA 3JCML 3LXZA 1GSQA 3GURA 1Y6EA 2RLIA 3HVXA 5DJLA 3I43A 5JCUA 3ZITA 1VF3A 4ZBBA 3DRNA 1GSYA 1GSFA 2YJ7A 3WGEA 1X9WB 4OFTA 1M2AA 1PD21 4I97A 3TKSE 4K6XA 3VLNA 1V9WA 5ECHB 2IMEA 1XIYA 1B48A 2YCDA 3VFIA 2WB9A 1N2AA 1OC9B 3VI5A 1ZYQB 4FYBA 4IQ1A 4P3YB 2H1DA 2K8VA 4GRFA 2NTOA 1OC3A 2NPBA 2VUPA 4HJMA 12GSA 2WJUA 4POLA 2RIIA 1GSDA 3EMXA 4IKHA 4ZB9A 3DVXA 2DJ1A 2PGTA 4GSSA 1FB0A 4L5LA 5A5KA 1TW9A 2OADA 3CYNA 3UVTA 2B6MA 3F3RA 4ECBA 2DJJA 2K9FA 1ZOFA 4NHZA 4IW9A 2V41A 1SENA 4AGSA 1TOFA 4WEYA 3TRQA 4KCEA 5G31A 2L6CA 3GSSA 4DSRA 3D22A 3FZ4A 4TOPA 5AIVA 2MMAA 1V40A 3CSJA 1J0FA 2C80A 5HFGA 2YOIA 4WETA 3E0UA 3HVSA 3ZFLA 1AQWA 4KCAA 4JR4A 4MJEA 2I4AA 1GH2A 1Z7RA 4DSSA 4NXIA 1CQHA 4GQCA 1JZWA 4ZXGA 5JWQB 3FR9A 3TJJA 4HQSA 1DSBA 2LS5A 2KP2A 4O92A 2GSSA 3ZYWA 1UVZA 1PN9A 2FWEA 3IE3A 1G6YA 2RM6A 4MDCA 1U6TA 1X5CA 4V2NA 5LNKe 3F4TA 3H1NA 1G0TA 2IFQA 2PVOC 4PGTA 4TKYA 4PUFC 4NAXA 2FWHA 3M0FA 1K0BA 2OKAA 4CDOA 1T4ZA 5ELAA 2I81A 3S9FA 2IMIA 1JLVA 2VLTA 4TR3A 3I69A 3GRXA 4ILFA 3HZ4A 1MD3A 1LJRA 2GZZA 1Q98A 3G7YA 3F9UA 3BCKA 1TJDA 4EXJA 2B5XA 2VO4A 5JWRB 2ES7A 5HR0A 1GLPA 3LGCA 4WF5A 3DXBA 4ZL7A 3GL3A 2H75A 4I5QA 2G2QA 1DE2A 3ERWA 2IMFA 3U5RE 3ME8A 3P8WA 19GSA 3A2VA 3CSIA 1G7EA 1THOA 1XXUA 1GTIA 5L71A 2R37A 4OMVA 4IP1A 22GSA 2GQKA 3L9SA 2H76A 3ZMKA 3PGTA 1K0NA 1TRVA 2VOCA 2OBKA 2VCTA 2DJKA 1JLWA 3IR4A 3ZVJA 1UC7A 1ML6A 3PINA 3ISOA 1GUMA 1N8JA 3FZAA 5ENUA 2O87A 3ME7A 3VI7A 4E8HA 3WT2A 4IJIA 3LORA 2YV7A 1YF0A 2YP6A 1PQNA 6GSSA 2PPTA 2H74A 5KEJA 5KN3A 1A2MA 4MH3A 2PWJA 5DCGA 4F2IA 1WMJA 5D9XA 5CRWA 4OCEA 4DSSB 2GS3A 1EGOA 4ISDA 1R7HA 3C1RA 4ECJA 2OACA 2CX4A 3SWLA 3U6VA 3O3TA 1KTEA 5ECKB 3L9UA 3GX0A 4J56E 2P5RA 1PGTA 1NHOA 2AHEA 2O85A 3DEXA 2I3YA 1A2JA 4G10A 3RPNA 3C7MA 2R5GA 3LWAA 2K6VA 3C71A 2VL9A 4ZL9A 2X64A 2AAWA 2Z9SA 3TUEA 8GSSA 2FD3A 1F9MA 2HYXA 2JADA 5C00A 3CRUA 3KCMA 5FHIA 4OCFA 4CHSA 1SU9A 3KD0A 2CZ3A 3GYKA 5DALB 1I5GA 1V58A 2DJ0A 3D0ZA 2L57A 2AB6A 1PSQA 1XWCA 1YY7A 2M46A 4FH8A 5DAKB 5DCHA 3NOFA 2JL4A 1E2YA 3QOUA 2IIYA 3GIXA 2V1MA 2FLSA 1YQ1A 2DIYA 4KAEA 5IQYA 2LV3A 4HZ4A 1ZL9A 5AIXA 2CV4A 3GNJA 1MDIA 1VF2A 3D6IA 1ZMAA 2KLXA 2YWIA 3H93A 2KUCA 5GAND 2IPAA 2BMXA 3OR5A 2PBJA 2CVKA 4DSQA 4YAPA 4ZB8A 4F0BA 4ZILA 4Q5NA 1B9YC 5IIZA 1XZOA 5D9WA 1PKWA 1K0AA 2F51A 2IJYA 3EU4A 2KHPA 2TRXA 2VL2C 2H8LA 4JZQA 1JZOA 3VWVA 1OC9A 3C1SA 1DUGA 1PA3A 1TI1A 5CRGA 4XIHA 2CQ9A 4ECIA 2LTKA 1HNAA 1O81A 4KW6A 3J7Yb 1BG5A 2C0EA 1O7UA 1SL1B 2B1LA 4DEJA 1EWXA 1Z6MA 1SKWB 5LD0A 3HVVA 5D9TA 2MBTA 2LNSA 2HNLA 3GKNA 1QFNA 2V6OA 4O5RA 4K0GA 5A4VA 1XFLA 3TKQA 2LUSA 6GSTA 1I9DA 1AAZA 3EC3A 2N5AA 2OE0A 3MAKA 4QQ7A 2GZYA 4V1Ag 2VCWA 4XS4A 4D73B 1FVJA 4PURA 2IMKA 3UAPA 1U87A 4ZBDA 3FEUA 3BCIA 4DVCA 3DIEA 1A24A 2XBIA 3ZFBA 3BBYA 4ZBAA 2LQOA 5ECOB 1R5PA 3TJBA 2AUVA 5J41A 2IWTA 4KNDA 2N5BA 1BYEA 3GFKA 4GF0A 4K8MA 3C8EA 4EKZA 1JHBA 4FO5A 4GLTA 3MDKA 18GSA 2E7PA 1SJZA 5F8BA 2EIQA 4RQRA 5B6MA 4IGJA 1SYRA 4BA7A 4BPYA 2JSYA 1PMTA 4MMMA 2P0GA 2LKUA 2C1YA 2XBQA 1K0MA 2D2ZA 4ACSA 3HCZA 1Z9HA 3EMPA 1ERVA 3O76A 4K2DA 3RAZA 1ERWA 4MK3A 2FY6A 3GV1A 3HKRA 1KNGA 2FGXA 4RI6A 2MZCA 1A8LA 1PKZA 2CX3A 1BJXA 3CXGA 3H8QA 3LSZA 1JFUA 4PX1A 2DJ3A 1WP0A 3UL3A 5GZZB 1K0DA 2HE3A 1GTBA 2M72A 2BTOT 4ZB6A 6GSVA 6GSYA 1O6JA 2NVLA 4FYUA 1XOBA 4OO4A 5B6NA 1ZZYA 2H30A 5ECRB 2AV4A 1AUCA 1PL2A 1XCCA 4MJBA 2CVBA 2DBCA 3IXRA 5CRHA 4HZ2A 3D4MA 3QAVA 1WIKA 4GSNA 1UN2A 2ALBA 3M9JA 3QPMA 1OC8A 4EUYA 2YZUA 2LJRA 2ON5A 2LQQA 3FK8A 2L6DA 5IMVA 1X9SB 1ZYEA 4HQZA 4Q5FA 1QK8A 4MF5A 5HR3A 3GKKA 3GH9A 5HQPA 4XS4B 3UJ1A 1QQ2A 3RDWA 4ML1A 4BL7A 1MDKA 4WBJA 5EVOA 3UIWA 4JE1A 3UEMA 5EPFA 4NMUA 5D96A 4N0ZA 5CO3A 2VL2A 5J9BA 4TXOA 1SJ6A 1WPIA 1TXXA 1XWGA 4POKA 2R4VA 2X8GA 3NZNA 3GSTA 2X8CA 1TTZA 1SL2B 4HUAA 3Q6OA 4O32A 3ERFA 3HJOA 2B5EA 3ZVJD 3HXSA 3QD9A 1KBNA 2VIMA 3D4TA 3GN3A 2C4JA 1SKRB 3GX8A 2V6KA 5CREA 4HDEA 2FNOA 2LRNA 4HOJA 1TI3A 1AQXA 17GSA 5C04A 1XWAA 3FR3A 1GL8A 2HLSA 3M8NA 2WZ9A 3A2WA 1XWKA 3LXTA 5J3RA 2RUFA 1GTAA 2LJAA 3EE2A 2HSHA 1EOGA 3KGKA 5ECMB 1MD4A 4EDYA 2H6ZA 4JU5A 1OE8A 1ABAA 1EEJA 3ZIVA 3KMOA 5DALA 4MLYA 3TOUA 5DAKA 2DJ2A 2MBSA 1U88A 4IELA 2VCVA 1T4YA 3APQA 4G9HA 2WS2A 4Q5RA 3GA4A 16GSA 4BWSA 4EVMA 2XHFA 10GSA 3KH7A 2C8UA 1XOAA 3PR8A 4L0UA 1R26A 2F8FA 2MYGA 4KSOA 3I6AA 5COHA 1WOUA 3DWVA 2PVQA 3VWUA 2J23A 2XPDA 4PXOA 4XRAA 1EP7A 2WULA 1SYXA 4MZCA 4KX4A 5AN1A 1MTCA 3HYPA 5DQSA 4PQ1A 4NV2A 1MDJA 2MMNA 5IPGA 4L5OA 5CRDA 3GKMA 2B5YA 4LA1A 5HFIA 2O8VB 4K7IA 3F6DA 4J57E 4MZBA 3CTFA 2YJHA 4V2LA 13GSA 5ELGA 4AJ8A 5ID2B 1GUKA 1K3LA 1ON4A 3P7XA 4TXOB 2FA4A 5IPHA 4LL1B 2LRCA 3J7Yk 4PQIA 2YWOA 4I6XA 4EDZA 1OE7A 4I8BA 5JWOB 2H70A 4YQVA 2LJKA 4MABA 3L0HA 3A3TA 3IDVA 3GL5A 3LQ7A 1T8EB 1OYJA 5ECNB 2GSTA 2H0IA 4ML6A 1DBYA 5H5RA 2L5LA 2YWMA 3US3A 3WGDA 1TKDB 6GSUA 2H73A 5D9VA 1HQOA 3LJRA 4MCUA 4G19A 1JZDA 2TRCP 4IVFA 4PNGA 4AJ6A 3P2AA 2DIZA 4D73A 3HY2A 4PQHA 1VF1A 3KIJA 2R3XA 3RHCA 1FOVA 4L0WA 1GNEA 2H71A 1K0CA 3CSHA 3H4KA 2REMA 3KMNA 3TJKA 4V1Ap 1ILOA 4OO5A 1U3AA 2KOKA 1EZKA 1M2DA 3L78A 2M80A 4L8EA 1GTUA 3F6FA 5INYA 5EL8A 3RPPA 2N5FA 3BOAA 3W8SA 3F8UA 3UOMA 4FIWA 5F05A 2H0GA 2K8SA 4KA0A 2FHEA 4QL9A 1R4WA 2H01A 3E9JB 4EC0A 2GDRA 1TRSA 1OVNA 5IOWA 3KP8A 2LEGA 4IS0A 2AJQB 2HXKA 4XTSA 3QFBC 1GWCA 3VWXA 2V32A 1ZCPA 1E6BA 3TRXA 1T7PB 1QUWA 1A23A 2MMZA 4NHWA 2H1BA 5F06A 2A4VA 5G5EA 1FAAA 2LNTA 4GSTA 5J4UA 2HZEB 2FCHA 1TRUA 4NWYA 4TXVA 2VL3A 3IAS2 5IMFA 4POMA 2E2MA 2DMMA 4IHUA 4KH7A 2ZNMA 3P90A 5G1LA 4V2MA 3WGXA 2VM2A 4HEA2 1EGRA 5LCZA 5G30A 3ZL5A 3IOSA 3ZLPA 1PX6A 3QMXA 7GSSA 1TK8B 1F2EA 5KN1A 1YDKA 2DSAA 2JZTA 1O8WA 1THXA 2JU5A 2VCXA 4AJ7A 1HNCA 5DBQA 3V1WA 3TCOA 1M0UA 3VPTA 4WR4A 4K1FA 3ZZXA 3EINA 3QDNA 3EWLA 5IO0A 3WD6A 2VD1A 2G0FA 5D93A 1O8XA 3FW2A 2B7JA 2H1AA 4KUNA 2GVPA 3TKRA 2WDUA 1H75A 2C3TA 5DJMA 4MA9A 3F3QA 1NW2A 5FWGA 4OWYA 2WGRA 3TJFA 4KE3A 1OKDA 1EOHA 1TK5B 4XS6A 1SKSB 3N5OA 3MSZA 1ST9A 3FR6A 2V2GA 4WF4A 4KB3A 2GZPA 2B1KA 1ZGNA 3F0IA 3NIVA 2EC4A 3IHQA 2VCQA 3TRPA 4HU7A 1M7TA 4WBRD 4GQFA 9GSSA 4ZIJA 2FWFA 4WKWA 3TOTA 1X0RA 3ZIJA 4MJCA 2GSQA 1GUHA 2H66A 1IYIA 2C3NA 2GQLA 2VD0A 5E4WA 4MPFA 4LMWA 3HA9A 5ECSA 1AIUA 2DLXA 1HD2A 4X43A 3KM6A 3VPQA 1TU8A 2OA7A 3TDGA 1W89A 1EP8A 2YANA 2WFCA 1X5EA 2QKEA 1XBSA 2H72A 2XC2A 2K18A 4IP6A 2J9HA 4F0CA 4QL7A 3ZRDA 4MH2A 1BAYA 2H19A 4RQXA 2X8HA 1OKTA 2PMTA 1GRXA 2HRNA 1K0OA 1PL1A 5F07A 1X9MB 4O7HA 3FKFA 5IMCA 4MZWA 3QAGA 4LLRA 4TN8A 1FW1A 3C73A 3F4RA 3IRAA 1H4OA 4X0XA 3EURA 1V57A 3Q18A 2PN8A 3DD3A 1HYUA 3ZTLA 3TB2A 5GSTA 2YPMA 5B8AA 3FHKA 5IMDA 1MEKA 4WXTA 1RW1A 3G7IA 1A2LA 1GP1A 2L4QA 2X99A 4OFMA 2RM5A 3TKSC 2GSRA 3QR6A 2NBSA 1Z3EA 3FRCA 2A2SA 1GSUA 2H1GA 1XWBA 5D73A 1VRSD 2DMLA 3GUSA 5IOXA 1VGLA 2HFDA 2ON7A 5G1KA 4RI7A 4BWQA 3QCPA 1TDIA 5ID2A 3KP9A 3A2XA 4YAVA 1T00A 3M9KA 3MWHA 2VAFA 4IJ3A 1YF1A 2I1UA 1S3DA 3W6GA 4HU9A 4PNFA 1WE0A 4F9ZA 4BVXA 3HDCA 5ECQB 2OE3A 5G5FA 3KTBA 1WWJA 1AQVA 4JBBA 5GSSA 1F3AA 1Y25A 5FT3A 5A4UA 4ULXA 2OBIA 1FG4A 3TJGA 2O89A 3CTGA 2HRFA 4XCSA 4HS1A 1K3YA 3CMIA 2CVDA 3D5JA 3RHBA 1PX7A 2YWNA 1SJIA 3HD5A 2RUEA 1YJ6A 1X5DA 1GLQA 4KSMA 3FZ9A 3GTUB 4TR1B 1R5AA 3ERGA 4YQMA 5IMAA 4KGIA 1QXHA 3MNGA 2CZ2A 2F8AA 4JEDA 3IA1A 4K7NA 3KEBA 4OFNA 3M1GA 5ABRA 1WRYA 4IBPA 3KZQA 2GTUA 5CAXA 5IO2A 3PH9A 1AW9A 4MF6A 3IBHA 1EV4A 5DQYA 2C0DA 1XPVA 4ZL8A 3KH9A 3KXOA 1S3CA 1LU4A 1LBKA 3CBUA 1M9AA 2MMOA 4RUVA 4IN0A 4ECCA 2B3SA 2WCIA 4MP4A 1T3BA 5JCGA 3GH6A 6GSXA 1A8YA 3DGQA 1XW6A 4F82A 4TRXA 1NM3A 4N10A 1YKCA 1YZXA 1OAZA 1Q4JA 5KN2A 4LMVA 2HZEA 3ZREA 2JZSA 2L4CA 2L5OA 1UA5A 1A0RP 5ECLB 2GQMA 2ZUPA 1V98A 2HZFA 3WYWA 4EF0A 2QGVA 3IK7A 4I2TA 2P31A 3Q74A 5J9CA 1U3IA 4N30A 5CNWA 4NPBA 3I9V2 4CW9A 4JRRA 2VLUA 3APOA 3HJPA 1AXDA 1WJKA 2E2GA 4K9ZA 4TR0A 5CYYA 3WT1A 3IV4A 4I2UA 2F3MA 1F6MC 1K3OA 5HFKA 3M3MA 2GT5A 4K0NA 3L9VA 2HT9A 5ECPB 4J2FA 3LYPA 1CQGA 1URMA 2C0FA 4HJ2A 1M99A 5IMZA 3KTLA 2YN1A 5ECIB 3KJYA 1SD9A 1NHYA 1TU7A 3FY7A 1SK2A 3HZ8A 3O6TA 2VM1A 3LEFA 4EO3A 2LRTA 1IYHA 3FZ5A 4Q5QA 5AISA 4YQUA 4TR4A 5AGYA 1Z5YE 2VCZA 5HR2A 4XRDA 2KP1A 3F63A 5JCWA 2C0GA 3LG6A 4FYCA 1HNBA 2I9HA 3TKSA 1GNWA 1O73A 1RK4A 1F3BA 2H0HA 14GSA 1XVWA 1TP9A 4BVYA 3G7JA 3EVIA 5CP1A 1ERTA 3LFLA 3HJMA 2QC7A 3VK9A 4NV5A 3SBCA 2IFQB 1BQ7A 4JR6A 4EL1A 1KEBA 5GAPD 1EEMA 3DKSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

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#chains in the Genus database with same CATH topology
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