4KW6A

Crystal structure of peroxiredoxin-1 (c-terminal truncation mutant) from the human hookworm ancylostoma ceylanicum bound to conoidin a
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
172
structure length
172
Chain Sequence
HMSKAFIGKPAPDFATKAVFDGDFVDVKLSDYKGKYVVLFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRFPEFKNLNVAVLACSTDSVFSHLAWINTPRKHGGLGDMKIPVLADTNHQIAKDYGVLKDDEGIAYRGLFIIDPKGILRQITINDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Peroxiredoxin-1 from the Human Hookworm Ancylostoma ceylanicum Forms a Stable Oxidized Decamer and Is Covalently Inhibited by Conoidin A.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-1
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Ancylostoma ceylanicum
total genus 52
structure length 172
sequence length 172
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2013-05-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4kw6A00
2K6VA 2GDRA 5DDLA 3GFKA 3D22A 1VRSD 2TRCP 2R5GA 2JL4A 1GP1A 2C3QA 4EC0A 3QFAC 4GCIA 1F3BA 2O89A 5AIVA 2B6MA 3ZVJA 5HFGA 2H0HA 3M3MA 3GX0A 2R2JA 1ZYQB 1KBNA 1ACVA 3EYTA 2CT6A 4GSSA 1PX6A 2FY6A 1NM3A 1A23A 4OFTA 1GSSA 4N30A 3MNGA 1C72A 3BCIA 3IHQA 5F05A 3HCZA 2H66A 2L57A 1G6WA 4FH8A 3QR6A 1X5EA 2GQMA 3Q6OA 1RQMA 2GLRA 3O6TA 1GTIA 4XS1A 5IOWA 2L5LA 1TI3A 3WGXA 3VI5A 4TXOB 4PUAA 4ACSA 4G2EA 2H72A 1UC7A 3ERGA 2K18A 5A4UA 1XVWA 3IRAA 1PGTA 2B3SA 3CRTA 1XWGA 2YCDA 5G30A 1CQGA 4KDUA 2H6XA 2GSQA 5J4UA 3F3QA 3ZL5A 1HNBA 5GAND 3LXZA 3TJBA 3GL5A 5G1KA 2HRNA 4ZL7A 4JRRA 2KOKA 5CO3A 5CRHA 2IMFA 3WT2A 3KJYA 3QMXA 1AUCA 3GH9A 1F37A 2EIRA 4XRAA 5JWOB 1K3OA 2I4AA 1TRUA 4O92A 3IA1A 1LJRA 5JCWA 1A0FA 1XCCA 2HSYA 4BVYA 1PX7A 2GSTA 2FUG2 4HZ2A 3I69A 6GSSA 5CRGA 18GSA 4WF5A 4AJ8A 3IXRA 2I9HA 5D9VA 4XTSA 1XW9A 3IK9A 4DSSA 4ILFA 3C1SA 3D4MA 4IS0A 2L6CA 4WR4A 2LRNA 1R7HA 4PURA 2M80A 4HQZA 5IM9A 1EGOA 5DCGA 4N11A 3FZ4A 4ID0A 2FCHA 6GSWA 3TJFA 4PNFA 1ERUA 2FWHA 4IHUA 1MD4A 2H75A 3ERFA 4KE3A 2WULA 3FZAA 1EP8A 4TW5A 4F0BA 4OO5A 3GKMA 4BA7A 1TKDB 3GX8A 4GLTA 2L6DA 2GQLA 1ST9A 3APQA 4OFMA 5CREA 2H1DA 3GURA 3GSSA 5ECRB 3RHBA 3IV4A 4N0VA 4YH2A 3MSZA 4K6XA 1GUHA 2FWGA 5B7CA 3UVHA 4TR0A 3TKPA 2G2QA 3FZ9A 4OMVA 1SKRB 4TRXA 4WKWA 3KCMA 1X9MB 5L71A 1KNGA 2LQQA 2MBSA 5GZZB 2VL9A 1TU8A 4ZB6A 2LEGA 1M9AA 2H6ZA 4QL7A 3D5JA 1GULA 4MZCA 3KXOA 3L9SA 4NMUA 2P5RA 3IOSA 4DSQA 2LKUA 5D93A 3GMFA 3BD2A 1B9YC 4JBBA 4G9HA 3W6GA 4MZWA 4V1Ag 4ZBAA 5ECLB 3G7IA 3AY8A 2YPMA 1FAAA 2K9FA 2CAIA 2C4JA 3L9VA 3HHVA 3HZ8A 1OKTA 3TKSA 5GSTA 3HKRA 4L0WA 1AAZA 2IMKA 4F2IA 1O81A 5KN2A 1FG4A 3KM6A 4YAVA 4BWQA 4LL4B 3EC3A 1UN2A 2KP1A 4PQHA 2CZ2A 4DEJA 2VCVA 1A8YA 3EVIA 4Z7XA 3PGTA 2BTOT 5LNKe 3UOMA 5FHIA 2Z9SA 1V9WA 3A5WA 1YEPA 4RQXA 3KP8A 3HXSA 4GSTA 2DSAA 3QDNA 3GSTA 3H8QA 1I5GA 5ELGA 4IW9A 4JZQA 3UL3A 19GSA 3BOAA 2GGTA 5EPFA 3LEFA 3PR8A 3FK8A 2VCQA 5JWRB 2NVLA 5CRDA 4GF0A 1GTBA 1SJZA 2C0FA 1BAYA 4EO3A 3S9FA 2H19A 5IO0A 1T3BA 1THXA 2VL2A 2JZRA 1ABAA 1SD9A 2YNXA 3CTGA 2VLVA 2WGRA 3IC4A 4LMVA 3N9JA 1XBSA 3C8EA 2VAFA 6GSTA 3GKXA 2GZPA 2AV4A 1QQ2A 4PUFC 1FW1A 1XWAA 1K0MA 1HNCA 2KHPA 2WB9A 3DVXA 1XPVA 1Z5YE 7GSSA 4NV5A 5DQSA 2YZUA 1EZKA 3ME7A 4TR1A 2LJAA 2B1LA 4KCAA 5F07A 3LFLA 5G5EA 1TXXA 2VCZA 3LJRA 3J7Yb 5J5NA 4EKZA 2DIYA 3TKSC 4KDXA 4KX4A 2OE1A 2PVQA 5HFIA 1BYEA 5D9TA 1XWCA 5COHA 2IFQA 4P3YB 4HS1A 3ZLPA 1X5CA 3A2VA 1W89A 6GSYA 1R5AA 2L4CA 4L5OA 3G7YA 3GV1A 4ECBA 3HJOA 2LQOA 5DJMA 3NZNA 1VF2A 4POKA 2RUFA 1V2AA 3W8JA 1SJ6A 14GSA 2VD1A 4I5QA 5HR2A 1WIKA 3V1WA 3H79A 3LXTA 3GL3A 3GN3A 2HLSA 2R3XA 2YV7A 4KGIA 1U3IA 1JLWA 4AJ6A 3IPZA 2JZSA 2VLTA 4GRFA 1HQOA 2M46A 1DBYA 3TJKA 4PXOA 1M2AA 2GS3A 4OCEA 1T8EB 4TR3A 1R4WA 3CBUA 1QUWA 1GTUA 1EEMA 2QKEA 4BVXA 3F63A 4POBA 3A2WA 4N10A 3FZ5A 2O85A 4AGSA 4IELA 1S3CA 1SL1B 4KCEA 3IAM2 1AQWA 2MMZA 1OVNA 1X9SB 2VL2C 1YJ6A 3F9UA 1FO5A 5IQYA 4F82A 1K0DA 2H74A 2P5QA 1YKAA 3C7MA 2HZEB 3G7JA 1MDKA 9GSSA 3EWLA 1GH2A 3RAZA 1MDJA 2YJ7A 3EE2A 2WDUA 1GNEA 5EY6A 4ECCA 4WBJA 4EL1A 2HI7A 1Y25A 2ES7A 4IBPA 1AXDA 1OAZA 3LGCA 2DMMA 2N5BA 1YQ1A 3F4SA 3O76A 1WP0A 4L8EA 3GYKA 1B9XC 1M2DA 1YZXA 2V41A 2GSSA 2YOIA 4TXOA 3TGZA 4EVMA 4IJ3A 3FHKA 4EUYA 5HR1A 2TIRA 5GAPD 2LRCA 2XBIA 1PD21 4ZBBA 1FB6A 3KH9A 5IOXA 1VF4A 2R6KA 1TJDA 4HI7A 3IAS2 4XCSA 2OE3A 4NXIA 3QAWA 3U6VA 5IPGA 2CV4A 1T4YA 3GTUB 3ERWA 4PNGA 3I6AA 3N5OA 2WS2A 4WXTA 3U5RE 4NAXA 3QD9A 4IQAA 1X0RA 4WBRD 3KMNA 2LNTA 1JZOA 1SKSB 3UARA 2X64A 2HXKA 4DSRA 5AIXA 5IIZA 3EMPA 1FVKA 3FYGA 5IPHA 1B8XA 1HD2A 4FYBA 3ZVJD 5D96A 5A5KA 3TRPA 3CRUA 3KMOA 1VF1A 3UAPA 3LQ7A 5J3RA 4GWRA 1A2LA 4TOPA 3EINA 3CSHA 1Z6MA 2IL3A 3TB2A 3DRNA 2NTOA 2FWFA 3K8NA 5J41A 3P2AA 5F06A 5G1LA 1BJXA 2LRTA 3SBCA 2DJ1A 4KB3A 3TDGA 1GRXA 1ZL9A 3E0UA 3MAKA 1K0NA 3BBYA 1QXHA 4HU9A 1OC9B 2H73A 4V2LA 5H5RA 1WE0A 6GSUA 3ZMLA 1GL8A 3TJGA 1G7OA 4MABA 5G31A 3ZYWA 4POLA 5CNWA 3DKSA 2DJ3A 2IN3A 4RI7A 5G2ZA 5DQYA 2CX4A 2JADA 3HVXA 1A24A 2QSIA 2OJLA 1DE2A 2FGXA 1FHEA 1SKWB 2LNSA 4PGTA 3TKSE 5HQPA 3L78A 3PINA 3NIVA 3QAGA 4ISDA 4L0UA 5IMAA 4XS4B 4MJCA 1Y6EA 4MJBA 1CQHA 5KN1A 2QC7A 1SU9A 4ZL8A 2HZFA 4J57E 1V58A 4FYUA 2OACA 3GRXA 4K1FA 3UBKA 2MMNA 2G0FA 4K0GA 3TKRA 4OFNA 3DEXA 2WRTA 2F51A 2MYGA 3US3A 1O8WA 2K8VA 5ECQB 1NHYA 4MK3A 2HE3A 3VURA 2JSYA 2H71A 1GLQA 1J08A 1TK5B 3HJMA 1YF1A 1TRVA 1GSYA 4PQ1A 3TOUA 1W4VA 1KEBA 2DC5A 3TCOA 4CHSA 2FD3A 4F03A 2ZUPA 4X0XA 3BCKA 3TRQA 4KAEA 1A8LA 1K3LA 3KEBA 2MZCA 3VWXA 1BX9A 1ZYEA 8GSSA 1M2BA 1PQNA 1SD8A 4XHMA 5JCUA 3QAVA 2V2GA 1TRSA 4HU7A 4ULXA 2XC2A 2AUVA 5H5QA 5IMDA 1XWKA 3LG6A 4NV2A 2GTUA 2IJYA 1ZGNA 3DYRA 1DE1A 2EC4A 2C0GA 1Z6NA 1DSBA 1JZDA 5ECKB 4G19A 2LTKA 4OCFA 1NW2A 1WOUA 5IMFA 1O73A 2RLIA 4WEYA 2X8CA 3EURA 1GSEA 2VCWA 1JHBA 5CAXA 22GSA 3ISOA 1HYUA 4ML6A 2JSZA 3VPQA 3ZIJA 4Q5RA 1ON4A 3ZMKA 1Q98A 1F2EA 3C71A 1PA3A 1F3AA 5EVOA 2M72A 3RPNA 3FR6A 3QOUA 4ECJA 2IMDA 2OE0A 4TVEA 5ECNB 1GSUA 1V40A 1JLVA 4BWSA 5DVBA 4KNDA 1FVJA 2E0QA 2CVBA 5C04A 1GLPA 2VM2A 5ABRA 3F6FA 2JU5A 2OKAA 1RW1A 1RK4A 2OADA 1OE8A 2DBCA 2YANA 1EGRA 2R37A 2FWEA 2HNLA 1MEKA 4N0ZA 2YWIA 2B1KA 2OA7A 1F9MA 3LSZA 1A0RP 16GSA 1K0AA 1XIYA 1QMVA 3VPTA 4ZB9A 1J0FA 4NWYA 1TI1A 1B48A 3P7XA 5G5FA 3F3RA 1R26A 1U88A 4Q5NA 1ZZYA 3EU4A 5IMVA 1GSFA 5DCHA 5CRWA 4OO4A 3WGEA 3ZIVA 1ZCPA 4D73B 1XWBA 2MMOA 3VWUA 2WJUA 1PL2A 2F8FA 1WMJA 1K3YA 2H1GA 3F0IA 1VGLA 3H1NA 3UVTA 3O3TA 2DIZA 2MBTA 3CTFA 3MWHA 5DALB 2VCXA 4FIWA 2GZZA 1M0UA 5KEJA 5ECPB 3J7Yk 4LLRA 3L0HA 4IP6A 3UJ1A 11GSA 4L5LA 5ELAA 5D73A 4GQCA 2VO4A 2HYXA 3OR5A 2J9HA 1KTEA 1V57A 1AW9A 1U87A 3M9KA 6GSXA 2ZCTA 5J9BA 5E59A 4ML1A 2HZEA 3IE3A 3LYKA 2B5XA 2PUKC 2H0IA 3I43A 2H6YA 5H5SA 5INYA 3P90A 3M9JA 3DD3A 2IMEA 2RUEA 4MH3A 1TTZA 1WWJA 4NPBA 2B7JA 5KN0A 1XXUA 2RIIA 5LD0A 4LMWA 1AQXA 2H70A 1A2MA 4HQSA 3VWVA 2AHEA 1I9DA 3L9UA 3P8WA 3QPMA 4GQFA 3WYWA 4MCUA 2YV9A 2FA8A 4KUNA 5D9WA 5A4VA 2CQ9A 1LBKA 4MMMA 1TK8B 2V6OA 1OKDA 2ON5A 4POMA 5ID2B 1X5DA 2FA4A 3KH7A 1MDIA 3A2XA 4AJ7A 2C0EA 2CAQA 2PPTA 2XPEA 5DAKB 1URMA 2K8SA 1SENA 2X8GA 1YKCA 4MPGA 3GTUA 2YWMA 1B4PA 4V2NA 1J9BA 2DMLA 2DLXA 3HD5A 4OWYA 1JZWA 1XOBA 2HRFA 3IDVA 1H75A 3RPPA 3KTBA 3Q19A 1SJIA 2E7PA 3H93A 4MJAA 4O32A 2OBKA 4H86A 4K7OA 4O7HA 1XW6A 5D9XA 2L59A 3D0ZA 2NDOA 1BQ7A 4RUVA 2GZYA 1QGVA 4Q5FA 3IBHA 4IVFA 1G0TA 4GSNA 3LWAA 4HZ4A 1JFUA 2C1YA 2LSTA 1PRXA 1UA5A 2A2SA 5CYYA 4K9ZA 1O85A 20GSA 3M1GA 4V1Ap 4IKHA 3ME8A 2AJQB 3ZRDA 2H01A 4XS6A 4I2TA 2J23A 2ON7A 1SYRA 2LS5A 2R4VA 4HOJA 1BEDA 4E8EA 1F6MC 1T00A 2IMIA 4YQVA 2H0GA 1LU4A 2B5YA 3CMIA 1OC9A 3IK7A 4LA1A 1UVZA 1K0OA 3LYPA 3Q18A 5FT3A 2PN8A 4I2UA 2VM1A 2V6KA 2DJKA 5ECIB 1OC3A 4K2DA 2PGTA 3FW2A 4DVCA 2CZ3A 2DJ0A 4E8HA 3KTLA 1PKZA 4BPYA 2IIYA 3HY2A 1B4QA 2HT9A 1OC8A 1PSQA 1M7TA 1USBA 4XS4A 4TXVA 3Q74A 4MDCA 3APSA 4MF6A 1E2YA 2PERA 4TKYA 1EEJA 2LUSA 3GHAA 1WPIA 2YJHA 1N2AA 2O87A 2H1AA 1FOVA 1ILOA 3TUEA 4IJIA 3KIJA 4IN0A 3ZFBA 3EMXA 2AB6A 2WZ9A 2B5EA 5DJLA 2MMAA 5F8BA 5EL8A 3FKFA 4YAPA 1ERVA 1Z7PA 4HUAA 2ALBA 5HR0A 2YWOA 4EF0A 2RM6A 2F3MA 2E2MA 2HFDA 3UMAA 5DBQA 2FHEA 4FO5A 3F4TA 2VOCA 4MJEA 2IWTA 3VLNA 2XBQA 3TRXA 3UBLA 4YQMA 4MZBA 4J56E 2CVDA 1ERWA 4ZXGA 4MLYA 4RQRA 3VK9A 5ENUA 1YDKA 1H4OA 3CSIA 2DJ2A 1YEXA 4ZB8A 5LCZA 3HJPA 3TOTA 3DVWA 5AGYA 2NBSA 2N5FA 1XVQA 4XIHA 2TRXA 1EWXA 1EOHA 2OBIA 2LV3A 1TP9A 3CYNA 3KP9A 3FR3A 2GVPA 3HVVA 3F8UA 1SK2A 1IYIA 2H30A 3HA9A 2I3YA 3FEUA 2XHFA 3E9JB 5E4WA 4V2MA 4CW9A 1DUGA 2YZHA 4MF7A 2GSRA 1GWCA 2EIQA 2VCTA 4EXJA 5B8BA 4MP4A 2V1MA 3GNJA 5B8AA 5ECMB 2PBJA 1X9WB 3DWVA 4TR4A 3TKQA 2JACA 1VF3A 4F9ZA 4PX1A 3EU3A 4QL9A 1O8XA 1T7PB 1M9BA 2YN1A 4WR5A 3ZFLA 5AN1A 2ZNMA 4FYCA 3D6IA 2L4QA 3IR4A 3ZITA 1OE7A 4AF2A 4JE1A 4I97A 1NHOA 1BG5A 2GQKA 2A2RA 2F9SA 4CDOA 4MA9A 3HZ4A 3HDCA 2EIOA 4DSSB 5IO2A 1OYJA 2GT6A 2LJKA 5B6NA 1TRWA 3GKNA 1SK0A 4WF4A 3BJ5A 4RI6A 1GUKA 3LORA 5GSSA 1R5PA 1TU7A 3F4RA 1O7UA 5IMCA 4HDEA 3QCPA 3L4NA 4X43A 3C73A 3ZZXA 2YP6A 1T1VA 1ZOFA 3F6DA 5ECOB 4KH7A 4IQ1A 5CP1A 3UIWA 3GA4A 2BMXA 5J9CA 1M99A 2A4VA 1SYXA 1WRYA 1K0CA 4D73A 3R2QA 1Z3EA 1PMTA 3VFIA 1SL2B 4KA0A 1TK0B 2P31A 5DALA 4ZIJA 2FNOA 4IGJA 3ZTLA 4BL7A 1A2JA 3VI7A 1Z9HA 3JCML 1XZOA 2CX3A 4K7IA 3M0FA 4YQUA 1QK8A 1TW9A 2V32A 2HSHA 1U3AA 3DMLA 4F0CA 2KUCA 4PQIA 3M8NA 4TN8A 3GKKA 4JR6A 4JR4A 5HR3A 1T4ZA 1PL1A 4MH2A 5F0GA 1S3AA 4XRDA 2VD0A 2VLUA 5JWQB 2DJJA 1SK1A 5JCGA 3DGQA 4GTUA 3H4KA 1GSQA 2X8HA 1TOFA 2C0DA 2LJRA 4O5RA 2L5OA 4ZILA 3VWWA 1G6YA 3D21A 2E2GA 2YWNA 2I81A 2D2ZA 2CA8A 1XW5A 4J2FA 5ECSA 2P0GA 5D8IA 2O7KA 13GSA 4Q5QA 2F8AA 3HYPA 4WETA 2B7KA 4HEA2 2PU9C 2H76A 3SWLA 4MPFA 2O8VB 5IMZA 4I6XA 1TDIA 1O6JA 4EE0A 1EP7A 1Z7RA 1PN9A 1XFLA 1IYHA 5ID2A 1QFNA 1GSDA 3QFBC 3C1RA 3CSJA 3APOA 2QGVA 2IPAA 4KSMA 5DAKA 1EV9A 4JEDA 4G10A 3RHCA 6GSVA 3A3TA 1HNAA 1Q4JA 4I8BA 1S3DA 1FB0A 2XPDA 1NSWA 1E6BA 2C8UA 2AAWA 4K0NA 4QQ7A 4HJMA 3D4TA 4MF5A 2H1BA 3NOFA 3HVSA 1YF0A 3KGKA 1MTCA 1SL0B 1GTAA 4NHZA 1JZRA 2C80A 1AQVA 2FLSA 4NHWA 4X1UA 3RBTA 1V98A 5HFKA 1EV4A 4JU5A 2CVKA 2BJXA 4EDYA 3UEMA 5C00A 5ECHB 3FR9A 2JZTA 1GNWA 10GSA 12GSA 1EOGA 1AIUA 5KN3A 3MDKA 1G7EA 2KLXA 3GIXA 1ML6A 3W8SA 2GT5A 1ZMAA 2REMA 4TR1B 2VL3A 4ZBDA 3GH6A 1ERTA 5B6MA 1YY7A 3KZQA 2VIMA 3GUSA 2WFCA 2C3NA 2X99A 4KDYA 2N5AA 4K8MA 4ZL9A 4KSOA 5FWGA 4KW6A 2H8LA 3PH9A 3G9BA 3CXGA 4IP1A 4HJ2A 4ECIA 4K7NA 2WCIA 4OD7A 4LL1B 5AISA 3E3EA 2IFQB 3WGDA 2PMTA 3FRCA 1N8JA 2NPBA 1AC1A 2KP2A 4GXZA 1GUMA 3KD0A 17GSA 2I1UA 3FY7A 1WJKA 2C3TA 2PWJA 2RM5A 3I9V2 4EDZA 1XOAA 1THOA 3ED3A 3WD6A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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