1QXHA

Crystal structure of escherichia coli thiol peroxidase in the oxidized state
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
SQTVHFQGNPVTVANSIPQAGSKAQTFTLVAKDLSDVTLGQFAGKRKVLNIFPSIDTGVCAASVRKFNQLATEIDNTVVLCISADLPFAQSRFCGAEGLNNVITLSTFRNAEFLQAYGVAIADGPLKGLAARAVVVIDENDNVIFSQLVDEITTEPDYEAALAV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Thiol peroxidase
publication title Crystal structure of Escherichia coli thiol peroxidase in the oxidized state: insights into intramolecular disulfide formation and substrate binding in atypical 2-Cys peroxiredoxins
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 49
structure length 164
sequence length 164
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2003-09-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1qxhA00
3HY2A 1YKCA 2C3QA 3FY7A 4EDYA 4O5RA 1I9DA 3M1GA 3M8NA 2REMA 1R4WA 2RIIA 3LORA 3KM6A 1F6MC 4EDZA 4NHZA 3UIWA 2YWNA 16GSA 4Q5RA 3PINA 1JLVA 1PSQA 1O6JA 4MK3A 2WJUA 1TU8A 5CYYA 3WD6A 2MMNA 2AHEA 5G31A 4KUNA 2C0GA 2GQKA 2VCQA 1AC1A 4O92A 2PU9C 5F05A 3M3MA 4X43A 5IQYA 4HZ2A 1FB6A 4MH2A 1HD2A 2CVDA 3KP9A 3CTGA 4NXIA 4MJEA 2WB9A 4I5QA 4WR4A 4IVFA 5IMDA 3TKPA 3TOUA 2IMFA 2FNOA 5HR2A 5A4VA 3I6AA 4PQIA 4PURA 2H6YA 1G7EA 4G9HA 5IOWA 2JU5A 3J7Yk 5J9BA 3DMLA 5A5KA 2HI7A 3GURA 3TJFA 2YWMA 4ZBBA 1XWGA 3RHCA 2B1KA 3UAPA 4MMMA 3GHAA 4DSSA 2VCTA 2DJ3A 5FT3A 1PX7A 5B6NA 2CVKA 1PX6A 1Z6MA 1GLQA 2B7JA 1AQWA 2H1BA 2GSRA 3QPMA 2C3TA 2H74A 4L0UA 4F9ZA 1ZCPA 5F8BA 3ZMLA 1SL0B 1TP9A 1U88A 4N0ZA 4JBBA 1B8XA 1XW6A 1BQ7A 1N2AA 3H8QA 2PPTA 4GF0A 1Z9HA 4LMWA 5DJMA 4YQMA 3DRNA 4ILFA 3TJKA 3MSZA 2PERA 1EV9A 3HVXA 1O85A 1ZOFA 1HNCA 2V6KA 1XW5A 5D9WA 3A3TA 5DALA 2XPEA 3F0IA 2ON7A 3GSTA 2HZEB 2V41A 4IS0A 5AIXA 3EC3A 4MLYA 3EU3A 1Y6EA 1PKWA 4WR5A 4DEJA 2MYGA 5CRWA 1YZXA 2HLSA 3KH9A 5CREA 1K0AA 2PBJA 5DJLA 2I9HA 2LV3A 2NBSA 3HJOA 1O8XA 2C8UA 3GTUA 4XS4A 4NMUA 3KXOA 1Y25A 3RDWA 2KLXA 5H5QA 3GL5A 3ZIJA 1WRYA 2C0DA 3L9SA 1YF1A 1ZGNA 2YZHA 3ZLPA 1A2LA 2IL3A 4ULXA 4TOPA 4BPYA 4WXTA 3FR3A 1W4VA 4QL7A 3F6FA 5IMCA 3DIEA 1XOAA 3FR6A 3EYTA 3TUEA 1NSWA 3L9VA 3GKMA 2JZTA 1TK5B 3FHKA 18GSA 2C3NA 2CVBA 4K0GA 2AV4A 4E8EA 3KIJA 2FD3A 3TDGA 2RM5A 5DQYA 1Z5YE 3P2AA 1VRSD 4ECBA 4KNDA 4Q5FA 3F3QA 1EGRA 2N5BA 3ME8A 3TKSE 3H93A 1QGVA 3HJMA 4ZBAA 1T1VA 1KTEA 1OC8A 4XTSA 1SKSB 4X0XA 2GSQA 3HCZA 4ML6A 3F9UA 3BOAA 1JFUA 3C7MA 4ZILA 2B6MA 4QL9A 1GTUA 3WT1A 3IBHA 2J9HA 1H4OA 2YZUA 4KH7A 2F8FA 3HYPA 5HFKA 1U87A 3MNGA 3KH7A 5GAND 2VUPA 1SYRA 2IFQA 2PGTA 3VURA 3EMPA 5CO3A 2ZNMA 1VGLA 1EOHA 3F3RA 4AGSA 2GSSA 2F51A 4KA0A 1R7HA 4KDUA 1O73A 2R37A 2YV7A 4K6XA 2VLVA 2CZ2A 2WCIA 3KP8A 1OVNA 3GKKA 3DKSA 4PUFC 1A0RP 3H1NA 4OFTA 2FLSA 2A4VA 5ELAA 2GDRA 4FIWA 2LKUA 1DSBA 1FHEA 2GT5A 1VF3A 5DBQA 1FG4A 1SENA 4GSNA 3W8JA 2J23A 4HI7A 2MMZA 3LWAA 2LJAA 1X9SB 3FR9A 2JACA 5ECOB 4EXJA 1AUCA 4KX4A 3ZVJD 1SK1A 2DJKA 3GX0A 2F9SA 4JR6A 4KW6A 5A4UA 4RI7A 3NIVA 3DEXA 2DJ1A 2IWTA 2XC2A 3GIXA 2F8AA 3TKRA 3KGKA 1HQOA 1K3LA 4KAEA 1ZYQB 5HR0A 1GNWA 1TRVA 3CTFA 1ABAA 2VD0A 3W8SA 4ZXGA 3W6GA 2CAQA 5GSTA 3VI5A 1XWCA 2WULA 3L9UA 2FY6A 3WGEA 4ZB9A 8GSSA 1OKDA 2MZCA 3QR6A 2WS2A 3GSSA 1THOA 1J08A 4IP6A 1UN2A 3FZ5A 3IAM2 1M9BA 3RHBA 4WF4A 4D73B 4JE1A 5HR3A 2WZ9A 4OO5A 2FGXA 5KN1A 1YDKA 4HJ2A 3KTBA 5AGYA 2VD1A 1SJIA 1V58A 2DJJA 1O81A 2O8VB 4QQ7A 3FRCA 5HQPA 4LA1A 4Z7XA 3UJ1A 2HRFA 4JR4A 1JHBA 2A2SA 1A2JA 2O89A 3DVWA 3EURA 4NAXA 4TR3A 3ZRDA 3LGCA 1LBKA 1DUGA 4F2IA 2IMEA 5IPGA 2K18A 4CHSA 4IGJA 1LJRA 1ZMAA 3FEUA 1YEPA 3VWWA 3LEFA 3VWVA 3VK9A 4EKZA 1URMA 4TXOA 4TXVA 1K0DA 1Z3EA 5JCUA 5DQSA 1U6TA 2X8HA 3ERFA 4AJ7A 2PMTA 3GRXA 1GULA 12GSA 2VL2C 1XWAA 3UVTA 2IMDA 4KB3A 2OE1A 2VAFA 2IMIA 1CQGA 4GTUA 4ZB6A 1V57A 2XBQA 1E6BA 2VOCA 4BL7A 2JSZA 3NZNA 2C0FA 3ZL5A 1BG5A 1GUKA 3GFKA 3BD2A 1DE2A 5IMFA 2NPBA 3CSJA 2QGVA 1OC9B 2DJ0A 1A24A 2K6VA 2Z9SA 3GH6A 9GSSA 1ERUA 3PR8A 3EU4A 2PVQA 5ECPB 1F9MA 1USBA 1JZWA 4FYUA 2HZFA 3HD5A 1T00A 1VF4A 5C00A 3BCIA 4EE0A 2FWHA 2VM1A 4O32A 1TI1A 1WMJA 1PL2A 3FW2A 4ACSA 22GSA 3S9FA 1EEJA 5G1KA 4AJ8A 1PA3A 2YN1A 4HU9A 1ZL9A 3G7IA 3I9V2 2EIQA 3DXBA 1TXXA 2OBKA 3TB2A 5F07A 4XIHA 3LFLA 3TGZA 1ZZYA 3HZ4A 2CX3A 4POMA 4LLRA 1GUMA 3UOMA 3C1RA 3G7YA 2DSAA 1V9WA 2H75A 3DWVA 5ENUA 1Z6NA 3I43A 4WKWA 4BA7A 1K0OA 4RQRA 2FHEA 2JSYA 1A23A 3KJYA 3GYKA 1SU9A 2H1GA 2YPMA 2L59A 5CRGA 3M9JA 4GRFA 4N30A 4ECCA 6GSUA 2H0HA 3H79A 1EP7A 4ISDA 1GSEA 4MH3A 1PQNA 2MBSA 2IPAA 1QMVA 2GS3A 4NV5A 20GSA 2HFDA 4MJCA 2CV4A 5EY6A 4K8MA 1K3OA 1S3AA 4YQUA 3A2VA 2VCXA 4PNFA 1SD8A 2WFCA 3GA4A 2BJXA 3O6TA 4Q5NA 3QD9A 1SK2A 3F6DA 5IMZA 2JZSA 1CQHA 2B1LA 2PWJA 1MDIA 1PN9A 3EMXA 2LEGA 5DCGA 4WBRD 4KCAA 1RK4A 2CQ9A 4CDOA 3HDCA 3ISOA 5DDLA 1W89A 3UARA 1A8YA 1LU4A 2PUKC 4NV2A 1RQMA 2LS5A 1PMTA 1XBSA 2VLUA 2JL4A 4V2NA 2H6ZA 3F8UA 4MF7A 2WGRA 1BX9A 3Q6OA 1V2AA 5H5RA 4LL1B 4KDXA 4AF2A 1FW1A 1M9AA 4NPBA 4IELA 3ZZXA 3LXZA 3KCMA 1MDJA 1HYUA 2CZ3A 2O87A 1PL1A 3QAVA 2RUEA 2ON5A 2R5GA 1SJ6A 3F63A 3APOA 2QKEA 1B9XC 2A2RA 2CT6A 5D9TA 1UVZA 5LD0A 3IHQA 2VIMA 2RM6A 1EOGA 2MMOA 3GKNA 5HR1A 4ZBDA 4KCEA 2K8VA 13GSA 3L78A 2B3SA 4L0WA 3N5OA 1T4YA 1GTIA 1PD21 4ECJA 3ERGA 2GLRA 1GTAA 3LXTA 1E2YA 1VF2A 3IA1A 4XHMA 5ID2A 5ECIB 1GH2A 4PGTA 2H76A 1K0BA 4EF0A 4L8EA 1M99A 2HE3A 4I97A 3QFAC 1X5DA 4FYCA 5A4WA 3Q18A 1DBYA 5GZZB 2IN3A 4MZCA 3TKSC 2H66A 3ZFLA 1KBNA 2H1AA 1AIUA 4Q5QA 3GMFA 1IYHA 1T7PB 3TRQA 1TI3A 5IMAA 5IIZA 1SL2B 3KMNA 1G6YA 3ED3A 3AY8A 3HVVA 4J56E 5COHA 5HFGA 2C80A 1M2BA 1EWXA 5D96A 1F37A 2YWOA 2NTOA 2FUG2 4IKHA 1UA5A 5GSSA 3E9JB 1FB0A 5EPFA 1T4ZA 2DMLA 3UMAA 10GSA 1WP0A 5KN2A 1GLPA 4ZL8A 4HQSA 3PH9A 1X9MB 2G0FA 2N5AA 2XPDA 2P5QA 5G5FA 1ERVA 2AYTA 2LNTA 2G2QA 1B48A 3VI7A 1MD3A 1X5EA 5FWGA 1S3DA 2XHFA 4K7OA 4DSSB 4WF5A 1KEBA 2LSTA 2YV9A 2I3YA 2X99A 5AISA 4MP4A 1QQ2A 4OMVA 4K0NA 1A2MA 1UC7A 1GSQA 1XFLA 1J0FA 5B7CA 2GTUA 1M2DA 3MAKA 1O8WA 1BYEA 3KMOA 1YJ6A 1GWCA 2R3XA 4MJAA 2WDUA 4YAVA 1QUWA 1XVWA 4V1Ap 3KEBA 1M0UA 4IW9A 3P7XA 1K0MA 1JZRA 5EL8A 2YP6A 5IO2A 3U5RE 1B4QA 3D6IA 5C04A 4MDCA 4XS6A 4HQZA 1V40A 1SYXA 2GZZA 1WOUA 5DALB 2N5FA 2VL3A 1OE8A 1Q4JA 4GXZA 4F0BA 3RBTA 3EE2A 3TCOA 3SWLA 5DVBA 1XWBA 3ERWA 3EWLA 3IDVA 4KE3A 1QFNA 4EVMA 1EEMA 3EVIA 5E4WA 4OD7A 4IQAA 4GQFA 3N9JA 2M72A 4V1Ag 2BMXA 5CRHA 4GWRA 2V2GA 3GTUB 4IJ3A 3IPZA 2PN8A 1U3IA 5IMVA 4XS4B 1TRSA 1XOBA 3D0ZA 3LJRA 3H4KA 1I5GA 2YJ7A 2HSYA 1HNAA 2H0GA 2XBIA 4MPFA 2C1YA 1NHOA 2ZUPA 2L6DA 2HSHA 2ES7A 1BAYA 2LQQA 4LMVA 2D2ZA 1SJZA 4HEA2 3TJBA 1Z7PA 3WT2A 2B5YA 4PXOA 4ZB8A 2AUVA 1ON4A 2FA8A 1TTZA 5ECRB 5IO0A 5D8IA 4TW5A 1TK0B 2B5XA 5CP1A 2E2GA 2NVLA 3TJGA 2P0GA 2KP1A 3R2QA 1XWKA 3LYPA 5ECMB 5H5SA 5CAXA 5ECQB 3APSA 4WETA 5DCHA 2FA4A 4MF6A 4V2LA 2EC4A 1AXDA 5IM9A 1XW9A 4DVCA 5JWOB 1O7UA 1YKAA 4KSMA 2DIYA 4XRDA 1V98A 2VCVA 1ILOA 4L5OA 1AW9A 2HT9A 3SBCA 3HVSA 4X1UA 2K8SA 1A8LA 4K7NA 3D4MA 4BVXA 2QSIA 5D93A 4K1FA 1ST9A 5ECNB 2IFQB 2H71A 3IC4A 4TN8A 5D73A 1GP1A 5KN3A 1GSUA 4WBJA 4TR0A 4I8BA 5ABRA 2HZEA 1NM3A 3MWHA 4TR1A 4K7IA 2H72A 3GV1A 1XVQA 5J9CA 1WJKA 3C8EA 3HZ8A 4OCFA 3A5WA 2ALBA 2VL9A 4TVEA 1PGTA 2MBTA 5ELGA 1G0TA 4MCUA 4YAPA 1OC3A 2RUFA 5J3RA 1GSSA 1QK8A 4ZL9A 3Q19A 1BEDA 3UVHA 5IOXA 1T8EB 3CMIA 3UEMA 1FVKA 1JZDA 4DSRA 2DLXA 3BJ5A 4HDEA 4IN0A 2V1MA 5KN0A 3LQ7A 2FWFA 3FZ9A 5LNKe 1TDIA 2HRNA 2VCWA 2O7KA 2RLIA 3IOSA 2KHPA 3C73A 2GGTA 1THXA 2LRCA 1OAZA 3NOFA 1ZYEA 3DGQA 3FZAA 3QDNA 3ZVJA 3VLNA 3J7Yb 5LCZA 4MPGA 4HZ4A 4FH8A 5D9XA 4EC0A 3UL3A 1TU7A 1GSYA 2M80A 1TOFA 5B8BA 4L5LA 1NW2A 17GSA 4KDYA 4PNGA 1TKDB 3IK7A 2VL2A 4HS1A 2V6OA 1VF1A 4TR4A 2L4CA 4XCSA 2GZYA 4JZQA 4V2MA 4N10A 4YQVA 3LYKA 3APQA 1YEXA 3ZITA 2EIOA 3IK9A 3IXRA 3DVXA 3QFBC 2YCDA 1J9BA 5CRDA 2PVOC 2OACA 1M7TA 2E7PA 3GUSA 3VPTA 2CX4A 4G2EA 2HXKA 3MDKA 1EGOA 1X9WB 2LNSA 4RQXA 3P8WA 2B5EA 3ZMKA 2OADA 1DE1A 1XZOA 1MTCA 2DMMA 3Q74A 4J57E 5IPHA 1H75A 2FWGA 3KTLA 2CAIA 5G1LA 2VLTA 4DSQA 3QCPA 3F4TA 4POKA 1FOVA 2E2MA 3VWUA 3LG6A 1KNGA 4GSTA 4TXOB 4JU5A 3DYRA 3ZTLA 4K9ZA 4I2TA 3ME7A 3GNJA 3A2WA 3TKQA 4JEDA 3C1SA 5G30A 3JCML 5E59A 2GSTA 4YH2A 2VO4A 4FYBA 2L5OA 1K0CA 2JZRA 1WWJA 2IMKA 3E0UA 1N8JA 6GSTA 2QC7A 5HFIA 4RI6A 1OKTA 2KP2A 1TRUA 2X8CA 1XIYA 1GTBA 2LJKA 1ERTA 3BCKA 4TR1B 3TRPA 1B4PA 4BWQA 1AQVA 1K3YA 2MMAA 5B6MA 2YJHA 4ID0A 3ZYWA 5F0GA 3LSZA 1F3BA 1GRXA 1TRWA 1TW9A 4GQCA 3O76A 2YWIA 4PQ1A 4EO3A 5DAKA 2EIRA 4OWYA 3HHVA 4OFNA 2DBCA 4I2UA 3ZREA 2OE3A 2LTKA 2GQLA 2GQMA 5J5NA 1YQ1A 5KEJA 1NHYA 2FWEA 1B9YC 2KUCA 2P31A 3HXSA 2OA7A 4H86A 4ZL7A 1WPIA 3FK8A 4D73A 1EZKA 4I6XA 5ECKB 6GSWA 4PQHA 1SK0A 1GSFA 1AQXA 2H70A 3P90A 1GNEA 4JRRA 3VWXA 2H8LA 5AIVA 14GSA 3GH9A 3M9KA 3FZ4A 2AB6A 3IAS2 1ERWA 3HJPA 7GSSA 2P5RA 4GLTA 5JWRB 1BJXA 5JWQB 1K0NA 3UBKA 1SKRB 1M2AA 1EP8A 2H30A 2AJQB 4HU7A 3G7JA 1X5CA 4G19A 4ZIJA 3F4SA 4O7HA 3VFIA 3ZIVA 4OO4A 4F03A 1PRXA 2L4QA 3QAGA 4HOJA 1R5PA 2V32A 2H1DA 5B8AA 3WGDA 4IHUA 4OCEA 3F4RA 2OBIA 2LRNA 4MF5A 1TK8B 2I81A 4TKYA 2TRCP 4OFMA 1SL1B 2DIZA 2HYXA 1XXUA 4K2DA 2GVPA 5GAPD 1FAAA 4TRXA 2TRXA 4MZWA 1MEKA 3IR4A 3L4NA 1ML6A 5JCWA 2LJRA 5ECLB 5JCGA 3CSHA 2FCHA 3E3EA 1MDKA 1EV4A 1F3AA 3GKXA 1XPVA 5ECSA 2M46A 1AAZA 2VM2A 3D5JA 3RAZA 3M0FA 2VCZA 2HNLA 2JADA 1OYJA 1FO5A 1OC9A 1OE7A 3VPQA 4NHWA 2X64A 4AJ6A 3D4TA 3L0HA 2OJLA 3RPNA 3CRTA 1JZOA 3TKSA 3QAWA 5G2ZA 4PUAA 3HKRA 3TJJA 2X8GA 4POLA 5FHIA 4G10A 3GN3A 1GSDA 4BWSA 2GT6A 1RW1A 4MABA 1R26A 5J41A 5F06A 2CA8A 3O3TA 2GZPA 2BTOT 4LL4B 4EUYA 4XS1A 3A2XA 1HNBA 1T3BA 2KOKA 2L5LA 6GSSA 3WGXA 4IP1A 3OR5A 3PGTA 3HA9A 1SD9A 3EINA 3D22A 2AAWA 3RPPA 3I69A 3D21A 6GSVA 2C0EA 2H0IA 5L71A 2L57A 2LRTA 3CSIA 1GUHA 3BBYA 1WIKA 1S3CA 4WEYA 1YY7A 1R5AA 5DAKB 3TOTA 5ID2B 19GSA 1MD4A 1IYIA 1A0FA 2TIRA 1YF0A 2H19A 2YOIA 3U6VA 4J2FA 2ZCTA 3V1WA 4IQ1A 1FVJA 3KD0A 1ACVA 2LQOA 1WE0A 2R2JA 5J4UA 3KZQA 3CXGA 4GSSA 1XCCA 4E8HA 4NWYA 2DC5A 3GL3A 1G7OA 3IE3A 2YANA 1QXHA 2H01A 2WRTA 1Q98A 1PKZA 4BVYA 3WYWA 5EVOA 2NDOA 4HJMA 1SKWB 1JLWA 3IRAA 2R4VA 5INYA 5CNWA 2LUSA 3FYGA 4ML1A 1G6WA 4KGIA 3IV4A 5D9VA 2K9FA 2IIYA 3TRXA 4F0CA 1X0RA 3QMXA 1C72A 4N11A 4ECIA 4FO5A 4XRAA 4P3YB 3QOUA 1U3AA 3US3A 6GSXA 2OKAA 2O85A 2IJYA 5ECHB 3DD3A 3C71A 2OE0A 4N0VA 4IBPA 2F3MA 4MA9A 4GCIA 6GSYA 2YNXA 4EL1A 1F2EA 2R6KA 4F82A 3K8NA 2L6CA 2I4AA 5AN1A 3G9BA 4CW9A 2C4JA 3ZFBA 5G5EA 11GSA 2H6XA 4PX1A 2E0QA 1TJDA 1Z7RA 4MJBA 3CBUA 2H73A 3UBLA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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