1GRXA

Structure of e. coli glutaredoxin
Total Genus 27
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
27
sequence length
85
structure length
85
Chain Sequence
MQTVIFGRSGCPYSVRAKDLAEKLSNERDDFQYQYVDIRAEGITKEDLQQKAGKPVETVPQIFVDQQHIGGYTDFAAWVKENLDA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title NMR structure of oxidized Escherichia coli glutaredoxin: comparison with reduced E. coli glutaredoxin and functionally related proteins.
pubmed rcsb
molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
molecule keywords GLUTAREDOXIN
total genus 27
structure length 85
sequence length 85
ec nomenclature
pdb deposition date 1993-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1grxA00
1Y6EA 1WP0A 3QAVA 4TKYA 4WF4A 4IVFA 3FR3A 3D6IA 2GZPA 2X8GA 3RDWA 4RI6A 1NM3A 1V40A 1TRUA 3TUEA 3GUSA 1TK0B 2RLIA 2RUFA 1VF3A 1K0CA 1XWAA 5ECMB 4YQVA 2O7KA 1AQWA 3US3A 5IQYA 4ECIA 1U3AA 5GAND 5EL8A 2GQLA 1USBA 4HU9A 1EP7A 2LJKA 2E0QA 3H4KA 4FYBA 3PH9A 3F4RA 3IE3A 5F8BA 2IFQB 5G1LA 1TI3A 4QL9A 1J0FA 3GH6A 2EIOA 3QAWA 1XW9A 2HRFA 3WT1A 3HD5A 4ZBBA 2YWNA 4V2MA 1X9WB 3IAM2 3RAZA 5LCZA 12GSA 1DE1A 1F9MA 2B1LA 2OKAA 3QR6A 3BJ5A 2HZEA 2F8FA 3DGQA 1PMTA 3ISOA 2AB6A 3IRAA 5ECLB 4HDEA 4ZBAA 3KH7A 14GSA 5DAKA 2AYTA 2XBIA 2VCTA 2YWIA 2JACA 5KN0A 1S3DA 1K0AA 3ZTLA 1KTEA 2QKEA 1X5CA 4XS6A 3F6FA 3RHBA 4L0WA 1OE7A 1QMVA 3ME7A 1PL1A 6GSTA 5J5NA 3IPZA 2DIZA 2CZ3A 1GUMA 1KNGA 3GSTA 4HS1A 4ID0A 2JZTA 3P7XA 1N8JA 4GF0A 5KN2A 3GKMA 3L0HA 2C1YA 5E59A 3ERFA 3QDNA 3C1SA 1O6JA 2GT5A 5D9TA 4XHMA 4HQSA 1THOA 1TTZA 4YAVA 2L6DA 4IS0A 4IHUA 5AGYA 4PQIA 3VPTA 2VUPA 4MDCA 3APSA 3L78A 1VGLA 4EL1A 2REMA 1RK4A 2LJAA 5LD0A 4FIWA 1PN9A 1THXA 5AN1A 3D5JA 4X1UA 4OMVA 3H93A 2CA8A 2L5OA 1RQMA 4GQCA 1AXDA 1H75A 19GSA 2H01A 3PR8A 2R37A 3TRPA 4GWRA 1YKCA 4KGIA 4ILFA 4XIHA 1K0NA 1EV4A 2A2RA 3FK8A 1M9AA 1K0DA 1GP1A 1O85A 2O89A 1GH2A 2OE1A 4L8EA 3KP8A 2H1BA 3EWLA 2GT6A 5G5FA 4IP1A 2ZUPA 3UVHA 2FWHA 1T4ZA 4N10A 5D9XA 1CQGA 4EDYA 4N0ZA 3ERGA 4HU7A 4I2UA 2CX3A 2P5QA 1U87A 2B7KA 2CVBA 4KCAA 4JE1A 4OO5A 4ZIJA 4OFMA 3KM6A 1B4PA 5CNWA 2L6CA 5DJMA 2VCWA 2HI7A 3KXOA 1WIKA 3EYTA 2I1UA 2PPTA 2FD3A 3FRCA 1ON4A 5GSSA 4IW9A 2EC4A 2VLVA 3WD6A 4DSRA 4G19A 3KIJA 2C0FA 4J56E 1GL8A 3IK7A 2H73A 5F07A 5IMVA 5J9BA 4GSSA 4BA7A 2VCQA 5ECQB 1TKDB 4Q5RA 4MF7A 2JU5A 3U5RE 2L5LA 2C0DA 2R5GA 4ZL8A 2DBCA 3UBLA 1JZRA 4KH7A 3EE2A 2GGTA 2GZZA 2OE0A 3WGEA 1N2AA 1V2AA 1T7PB 1EOGA 2M72A 2N5FA 4MZCA 4O7HA 3UARA 4BPYA 1AC1A 4J57E 1PL2A 2TRCP 5JWOB 2JZRA 1FVJA 2KP1A 2WJUA 1G7OA 2H30A 2GDRA 1Z9HA 2R2JA 2V6OA 1WMJA 2V6KA 2VOCA 4TXOB 3WGXA 1G7EA 4L0UA 1YEPA 2DJJA 2CX4A 2H1AA 1QFNA 4I6XA 1ERVA 3TKRA 2YJHA 5H5QA 3UL3A 1PX7A 1GLQA 2H6XA 3C71A 2WCIA 5DALA 5GSTA 2NVLA 3G7YA 5EVOA 2GZYA 1BQ7A 2BJXA 4OO4A 5ID2B 1M2BA 2B5XA 2WGRA 4LL4B 4OFNA 1Y25A 4IJ3A 2XHFA 2H0IA 2GSQA 3BBYA 4IKHA 5CAXA 5A5KA 4MLYA 4EVMA 2CZ2A 2H72A 5HFGA 2WS2A 1XCCA 2V1MA 2DJ2A 2H6YA 1GTBA 2NBSA 1I5GA 2JL4A 4E8HA 3HYPA 2K8SA 4MZBA 4ML6A 4V1Ap 4EF0A 2P0GA 2H0HA 5ID2A 3DD3A 3Q19A 2OADA 2BTOT 3FEUA 1TI1A 2L57A 1JFUA 1GRXA 2YWMA 3EU3A 2QSIA 4EDZA 1HNCA 2JSZA 1Z5YE 4XS4B 5CRDA 3G9BA 4Q5NA 3UOMA 1LJRA 1AW9A 4F0CA 2PVQA 4K7OA 1QGVA 3ZVJD 5IPHA 4ECJA 4MA9A 4ECBA 3VURA 4KDYA 2VM2A 3TOTA 3VFIA 4AF2A 1MDKA 2FNOA 1QUWA 1F3AA 3GN3A 5A4UA 3ZL5A 5D96A 5ECHB 1GSSA 5JCWA 1T3BA 2TIRA 4FYUA 4I2TA 3C8EA 3ZMLA 5AISA 1SD9A 5F06A 1XBSA 4JU5A 2OBKA 1NW2A 5IO0A 5ELAA 4AJ7A 5DJLA 5DQSA 2DLXA 1C72A 2IWTA 1R26A 3HVVA 5FWGA 2YWOA 1M99A 5ECOB 3MAKA 1EV9A 2I81A 2P31A 1PGTA 1HNBA 3HY2A 4ZL9A 5KN3A 4XTSA 2TRXA 4ACSA 3QFAC 5C00A 4AJ6A 3KEBA 4WKWA 5INYA 3RBTA 3GFKA 4GTUA 1SKWB 1XWGA 3AY8A 1QK8A 2GQKA 3C1RA 3HJOA 1TRVA 2VL3A 1UVZA 3M0FA 4L5LA 2RM5A 4KW6A 5B8AA 4MJAA 3EU4A 2VCVA 1AIUA 1SKRB 4KE3A 6GSSA 3QAGA 1XIYA 2A2SA 2YCDA 2DJ1A 1M2AA 3VI5A 4POLA 4MF6A 1F6MC 1GSFA 4P3YB 1JZWA 3QOUA 5HFKA 5D9WA 3CTGA 4MK3A 4NXIA 3UIWA 5A4VA 1PKWA 2PWJA 3GHAA 2LQQA 2M80A 3F0IA 1ZZYA 5CO3A 4TW5A 5A4WA 1W89A 3VWVA 1GUHA 4GSTA 2X8CA 4G10A 4D73A 1ST9A 4GQFA 3HVSA 3BD2A 4XRDA 3GA4A 2E7PA 6GSYA 3TKPA 3TJBA 2GS3A 1ZOFA 2FUG2 2MZCA 1OYJA 4PX1A 1VF2A 4MPFA 3H8QA 3K8NA 4ZB9A 3ERWA 1K0BA 1Z6MA 4YH2A 2VL9A 5FHIA 4IP6A 4NHZA 4WXTA 3M9JA 2CAIA 2VLUA 4RI7A 2O85A 3F4SA 2RM6A 1ERWA 1YKAA 3VPQA 4BVYA 2YOIA 3UMAA 3SBCA 1SJZA 1KBNA 3ZREA 4LMVA 3I43A 1GWCA 5CP1A 5ABRA 1K0MA 3LG6A 4DSSB 1PQNA 4MMMA 3UJ1A 1NSWA 2O8VB 2IMEA 3KMOA 1SL2B 5F05A 2KHPA 3TCOA 2P5RA 1OKTA 2D2ZA 3ZIVA 3UEMA 2LNTA 2FWFA 7GSSA 4RQXA 3APOA 2CVKA 2PU9C 1ZCPA 2CT6A 2IFQA 4LLRA 3A2WA 3WYWA 2A4VA 5IMAA 2QGVA 3F6DA 3ZITA 4NMUA 4FH8A 5EPFA 2VM1A 4K6XA 2YN1A 5G30A 4LA1A 4K2DA 3KGKA 2YV9A 1QXHA 5LNKe 4MJCA 2IJYA 4HOJA 4WBJA 5DVBA 5KN1A 4POBA 2YV7A 3GSSA 1Q4JA 2WDUA 4X43A 3GX8A 2YP6A 16GSA 3KJYA 5D93A 1G6WA 3ZRDA 3QFBC 3GV1A 2FGXA 2OJLA 2FY6A 2WRTA 2JZSA 3HZ8A 1E2YA 2OBIA 3HVXA 5HR3A 4Q5FA 2WB9A 3FZAA 1ZL9A 3LEFA 4IQ1A 3D4MA 1UN2A 2KOKA 3BCIA 3L4NA 5G2ZA 3RPPA 2N5AA 4CDOA 1OAZA 1SK2A 3DYRA 4TOPA 4K7NA 1X5EA 3ZVJA 1GULA 3DXBA 1SYRA 4X0XA 2H8LA 3TKQA 2AUVA 5D8IA 4HQZA 3LXZA 5HR0A 1GSDA 1BG5A 3W8JA 3F4TA 1EGRA 2H66A 5J3RA 4GLTA 3LGCA 2IIYA 5ECKB 2NTOA 3KH9A 1SK1A 3TRXA 5HR2A 4F2IA 5B7CA 1B4QA 1YJ6A 4F0BA 3S9FA 1HD2A 1UA5A 4K1FA 2DMMA 1PKZA 2M46A 4TVEA 3KTLA 2HRNA 2X64A 2IPAA 5F0GA 5JWQB 3HKRA 4YQMA 4K0NA 1O8WA 1QQ2A 3D22A 2FWGA 2VD1A 4ZL7A 2CAQA 5CRHA 1ACVA 3BOAA 2B6MA 1G0TA 5CRGA 2FHEA 3E0UA 5KEJA 1B48A 3GYKA 5IO2A 1BJXA 4TR3A 4KX4A 2C3TA 1LU4A 3CXGA 4O92A 5AIXA 8GSSA 4ZBDA 1ZYQB 1A8LA 5ECPB 4EC0A 4GXZA 1VF4A 2C80A 3HJPA 2N5BA 1XWBA 5DQYA 1T4YA 5ELGA 4OCEA 3ME8A 2MMAA 3CBUA 2MMOA 2FCHA 2C3NA 4EUYA 2C0EA 3I9V2 4WETA 4WF5A 4J2FA 2L4QA 2LUSA 3CTFA 5ECSA 2YANA 2VCZA 1OC8A 1SYXA 2V2GA 4N11A 1SKSB 4XS1A 3L9UA 3N9JA 1O7UA 3R2QA 3DEXA 5GAPD 1XW6A 1IYHA 3M1GA 3ZMKA 4MABA 3GKXA 4BWSA 1GSYA 6GSVA 2VL2C 3IC4A 3CYNA 1DUGA 3M3MA 3ZZXA 3ZYWA 1PX6A 4TXOA 3CSJA 3EMPA 4PUAA 5CREA 4K7IA 2HNLA 1AQXA 1YF0A 2G0FA 2H6ZA 1TJDA 3C73A 5HQPA 1PA3A 1OC3A 3MWHA 2DMLA 4I97A 4JR6A 1XZOA 3NOFA 2ZNMA 3ZFBA 3J7Yk 3PGTA 3HDCA 4F9ZA 2AV4A 1O73A 3VWWA 1GUKA 3GH9A 3TJGA 1YQ1A 2XPDA 3NIVA 4F03A 4PNGA 4EKZA 5IOXA 10GSA 1LBKA 20GSA 2PERA 3F3RA 1TDIA 4LMWA 3IV4A 4KAEA 4KA0A 2XC2A 1A24A 3EVIA 3WGDA 2OACA 1V57A 2F9SA 3UBKA 3GL5A 3MDKA 2QC7A 3TDGA 1S3CA 4FO5A 3IK9A 3PINA 5JCGA 4AGSA 3H1NA 5ECIB 4XS4A 3BCKA 4IN0A 2LSTA 1T1VA 1J9BA 1B9XC 3OR5A 2B3SA 3QD9A 1IYIA 1XOAA 2GVPA 4DSQA 1OC9B 4I5QA 4ECCA 1BEDA 1TU8A 2F3MA 5B6NA 3NZNA 1X9MB 1SK0A 3TKSC 2LKUA 2LNSA 1A23A 4KB3A 2K18A 1YDKA 5G31A 3J7Yb 4NV2A 2ALBA 4KDUA 1F2EA 4WR5A 2LV3A 3TJJA 1A2MA 2DJ0A 4OWYA 3DMLA 3QPMA 2K8VA 3A2XA 2I4AA 3HXSA 3Q74A 4TR1B 4NWYA 2IMFA 2YJ7A 5IOWA 3W6GA 4JBBA 1OVNA 1PSQA 3O76A 3KCMA 1K3OA 3LQ7A 5H5RA 1XWCA 3DKSA 4XCSA 1AAZA 1XXUA 2IMDA 1A2LA 2C4JA 1SD8A 2VIMA 3KD0A 4PUFC 1SENA 2J9HA 1UC7A 3N5OA 3TKSE 1V9WA 1HNAA 1F37A 1YY7A 4IELA 3GIXA 3MSZA 2B5YA 5FT3A 4WBRD 5E4WA 1FOVA 5G1KA 2MYGA 1X5DA 3L9SA 2PUKC 4JR4A 3GTUB 2HSYA 1JZOA 1R5AA 1K3LA 2L4CA 2PBJA 1XVQA 4KCEA 1YZXA 4Z7XA 1V98A 2FA8A 1JLVA 2ON7A 4YQUA 1TRWA 2B1KA 4AJ8A 6GSWA 2LTKA 1DE2A 1SJIA 3TRQA 3M9KA 5JWRB 1M2DA 1GSQA 4OFTA 3CRUA 2R6KA 3EURA 1Q98A 4MJEA 2H74A 3TB2A 5HFIA 3QMXA 2VD0A 3FY7A 4Q5QA 2CQ9A 1ZMAA 4PGTA 2EIRA 3GKKA 4BL7A 3FR9A 4V1Ag 3ZFLA 3GX0A 3LWAA 2HZEB 5ECNB 1TOFA 2K9FA 2AHEA 2FWEA 3CSIA 3VLNA 2OA7A 2VL2A 4OCFA 3U6VA 4ULXA 5DAKB 5J9CA 3GURA 3M8NA 2YZHA 1A0FA 1ZYEA 2JSYA 1EP8A 3TJKA 1MEKA 3HCZA 2AJQB 1U88A 1Z3EA 1V58A 2MBTA 2GSTA 4HZ2A 1ERTA 4MP4A 3VWXA 1E6BA 2VO4A 3IXRA 5IPGA 4DSSA 1MDJA 3APQA 3HZ4A 2L59A 1MDIA 1TRSA 2HLSA 2PN8A 2LRNA 3DWVA 2I3YA 4O5RA 1WE0A 3VK9A 3GMFA 3EC3A 2GSRA 1ABAA 2PMTA 3L9VA 1EEMA 2LQOA 1ERUA 4V2LA 2GSSA 2B7JA 2HZFA 4MH3A 3E3EA 4H86A 4YAPA 4F82A 1B9YC 1O8XA 1G6YA 3KTBA 22GSA 3IA1A 1FVKA 4EXJA 3GL3A 1FO5A 4WEYA 3HJMA 3SWLA 3MNGA 3IR4A 4ISDA 4MCUA 4TN8A 2MMZA 3LJRA 3O6TA 2HT9A 1WPIA 2WULA 1SL0B 3O3TA 4NHWA 4BWQA 3IAS2 1GNEA 2CVDA 2HSHA 3F9UA 4JRRA 3FYGA 3KP9A 1XWKA 2PGTA 1SU9A 1URMA 3ED3A 1GTIA 2XBQA 2JADA 4MZWA 4OD7A 4TR4A 1H4OA 4IQAA 5IIZA 1B8XA 4FYCA 2HE3A 3D21A 5G5EA 3TKSA 3G7JA 3ZIJA 1CQHA 4PXOA 1GSEA 3FZ5A 1S3AA 1YEXA 1R5PA 5ENUA 2HXKA 3GNJA 2I9HA 4ML1A 3QCPA 1TK8B 1XW5A 4NV5A 4XRAA 5GZZB 1JHBA 5ECRB 2X8HA 2C3QA 4IBPA 4PQHA 4EE0A 1Z7PA 3F63A 1FHEA 4E8EA 2H1GA 1VRSD 3C7MA 1M9BA 3I6AA 1Z6NA 2LEGA 4KUNA 4HZ4A 2PVOC 4V2NA 2MBSA 3WT2A 1SJ6A 1NHYA 2H75A 3D0ZA 1M0UA 3IBHA 1A8YA 2H71A 1XVWA 5B8BA 2ON5A 1O81A 1M7TA 5COHA 3LFLA 5J41A 13GSA 4RUVA 2HFDA 5IMFA 1K3YA 1ML6A 1KEBA 3DVWA 2K6VA 4DEJA 1FG4A 3P90A 1EWXA 4PQ1A 3KMNA 5B6MA 2R3XA 5DBQA 1A2JA 2BMXA 1EOHA 4MF5A 1HQOA 1EZKA 1TP9A 2WFCA 2LRCA 2J23A 4ZB8A 6GSUA 1A0RP 1TXXA 1RW1A 1I9DA 4IJIA 4MJBA 2DC5A 1MTCA 5CRWA 4IGJA 3HA9A 1W4VA 1PRXA 3F8UA 2C8UA 2VCXA 4BVXA 3FR6A 1X9SB 1FW1A 4KSMA 2XPEA 4HEA2 2AAWA 4O32A 3Q18A 2B5EA 5DALB 2GQMA 3VWUA 2ZCTA 2X99A 1VF1A 3TGZA 4LL1B 2NDOA 2OE3A 5C04A 3RHCA 2KLXA 5IMDA 3H79A 3TJFA 3EINA 1GNWA 3E9JB 5H5SA 1OE8A 1HYUA 3A3TA 4NAXA 9GSSA 3G7IA 2IN3A 1JZDA 5AIVA 3RPNA 1WRYA 3LYKA 2LRTA 1FB0A 3DRNA 4ZB6A 4MPGA 1JLWA 3IDVA 4JEDA 4K8MA 2V32A 4POMA 4RQRA 4MH2A 1AUCA 3V1WA 3P8WA 4KNDA 3LSZA 1FB6A 3UVTA 4HJMA 6GSXA 3CSHA 3GKNA 5J4UA 4GCIA 2GTUA 1K0OA 2LS5A 2RIIA 2Z9SA 3FKFA 3FZ4A 1WJKA 4EO3A 1ZGNA 3I69A 1TW9A 4WR4A 4QL7A 1T8EB 1F3BA 3TOUA 2NPBA 5IMCA 1WOUA 2YNXA 2VLTA 3CRTA 3LYPA 1BAYA 2FA4A 5DCHA 2R4VA 2IMIA 3CMIA 4HUAA 3FW2A 2E2GA 2FLSA 2F51A 1Z7RA 2H0GA 18GSA 1AQVA 5D9VA 3FHKA 2MMNA 3F3QA 4QQ7A 2H19A 1BYEA 5DDLA 4CW9A 3A5WA 1DBYA 1J08A 3D4TA 2DJKA 1MD4A 4POKA 3UAPA 5EY6A 1DSBA 2RUEA 3HHVA 4K9ZA 1R7HA 4HJ2A 1PD21 2GLRA 1EGOA 2F8AA 3W8SA 3VI7A 1WWJA 3LXTA 3Q6OA 5CYYA 1XOBA 1TK5B 5IMZA 4HI7A 4CHSA 2ES7A 1NHOA 4TXVA 4PNFA 4ZILA 1OKDA 5DCGA 2IL3A 2WZ9A 2KUCA 2DSAA 2H70A 1U6TA 1U3IA 4I8BA 3IHQA 1OC9A 4N30A 1GLPA 2VAFA 4NPBA 3A2VA 1T00A 5D73A 1GTAA 2E2MA 3LORA 4K0GA 4PURA 4G2EA 1YF1A 4KDXA 1XFLA 3DIEA 3P2AA 2KP2A 5IM9A 2DJ3A 4JZQA 4N0VA 4TRXA 1BX9A 4D73B 1XPVA 2YZUA 5L71A 1GSUA 2H1DA 4TR1A 4DVCA 2V41A 3EMXA 1EEJA 1ILOA 5HR1A 3ZLPA 3IOSA 2O87A 2LJRA 2G2QA 2IMKA 4KSOA 1TU7A 11GSA 2CV4A 3GRXA 17GSA 4GRFA 4GSNA 4G9HA 1MD3A 1X0RA 5JCUA 2EIQA 1SL1B 3FZ9A 2DIYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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