1GRXA

Structure of e. coli glutaredoxin
Total Genus 27
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
27
sequence length
85
structure length
85
Chain Sequence
b'MQTVIFGRSGCPYSVRAKDLAEKLSNERDDFQYQYVDIRAEGITKEDLQQKAGKPVETVPQIFVDQQHIGGYTDFAAWVKENLDA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title NMR structure of oxidized Escherichia coli glutaredoxin: comparison with reduced E. coli glutaredoxin and functionally related proteins.
pubmed rcsb
molecule keywords GLUTAREDOXIN
source organism Escherichia coli
molecule tags Electron transport
total genus 27
structure length 85
sequence length 85
ec nomenclature
pdb deposition date 1993-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1grxA00
2FD3A 1XW5A 4KAEA 2FWHA 1PL2A 4MA9A 2KP2A 3GSSA 3RHBA 1K0OA 2VUPA 1M9AA 1PKWA 1G7OA 3W8SA 2LRTA 2FLSA 3I6AA 4N10A 1NHOA 2FWEA 1ACVA 3IPZA 1OC9B 1T8EB 1PSQA 6GSTA 1VF1A 1EOGA 1PA3A 4TN8A 2L57A 2JZTA 1XOBA 5L71A 2GLRA 4AJ7A 3QOUA 3GYKA 5HR2A 3ME8A 2B1KA 3ZVJA 4V2LA 2VLTA 3IHQA 5IM9A 3GTUB 4DSSA 3EC3A 2DLXA 4K1FA 1FAAA 4EVMA 5CO3A 3TKSC 3H1NA 4IVFA 4PUFC 1EWXA 3LWAA 2PN8A 5F07A 20GSA 2O7KA 1ZCPA 2I81A 2VL2A 4NAXA 5B6NA 2YCDA 1QK8A 2NTOA 4EC0A 2OE0A 2X8CA 4OFMA 5HR1A 1GTAA 4ID0A 4TRXA 3CYNA 3GMFA 5B7CA 4NPBA 1TU8A 4HDEA 1TRWA 4GXZA 3L9VA 4ECCA 2VCVA 1QXHA 3VWUA 1K0BA 3QFBC 4RQRA 2YZUA 5LCZA 1FB0A 1GH2A 2CAQA 4NV5A 1EP7A 2RM5A 4FIWA 16GSA 2L6DA 3WT1A 2H30A 2QGVA 1U6TA 3DYRA 3VI7A 1IYHA 3HVXA 2REMA 4GWRA 1GLPA 1TOFA 5CRWA 3U5RE 2F51A 4BPYA 1WPIA 2YPMA 4PURA 4ISDA 2I1UA 1ZYQB 1DE1A 5DAKA 3TB2A 1YEPA 3ZVJD 1YEXA 2VCTA 4JZQA 4K9ZA 2QKEA 19GSA 1VF2A 5D96A 1ZZYA 2HZEA 2YWNA 1EGOA 2P5QA 1VF4A 1HNBA 1GSEA 5B8BA 4OWYA 2ZCTA 1J9BA 2DIZA 3KD0A 2MMAA 2L5OA 5H5SA 4MJAA 1YZXA 4IQAA 2TIRA 3QDNA 3ZFLA 2YWIA 4JBBA 1ZGNA 2DSAA 3ERGA 10GSA 2Z9SA 2YNXA 5EL8A 2PWJA 2JSZA 3L4NA 3FYGA 5HFGA 4ZB8A 4ZXGA 4I2UA 4IELA 5DBQA 1XCCA 3G7JA 1F37A 5CRHA 2IFQB 2X99A 1DE2A 2CVKA 4O7HA 2GT5A 2HI7A 2FA8A 2FA4A 4TR1A 1X5DA 1M99A 2B7KA 1K3YA 1HNCA 4MF5A 2R3XA 5G31A 3GFKA 2ON5A 1O73A 4JE1A 5ECSA 5ABRA 4TR0A 4J56E 4HQSA 3TKSA 3LYKA 3DXBA 4HEA2 4CHSA 1AAZA 4JR6A 3M3MA 3A5WA 2AUVA 3E3EA 4KDYA 1W4VA 4YQVA 2YOIA 4ECJA 5ECIB 1OKTA 2YJHA 4AJ6A 3IBHA 3LSZA 3ZMLA 2H0GA 3J7Yk 1F3AA 2E0QA 1GSFA 1EV9A 4KB3A 2GSTA 2R2JA 1WOUA 1A8LA 2RUEA 3WGDA 3F4SA 1PKZA 1Q4JA 4JRRA 2DJ0A 4DVCA 2WB9A 2N5AA 4XS4A 1K0MA 1URMA 2GSSA 1R5PA 2GQKA 5AIXA 5IMAA 3C71A 4L5OA 1FOVA 1A2JA 1GTUA 2C3NA 3VWXA 3TKSE 2PU9C 4TR4A 1PQNA 4MCUA 4KSOA 1HD2A 4L0WA 2WCIA 2QC7A 3HCZA 4XRAA 3IA1A 2GSRA 4KCAA 13GSA 5DALA 4EDYA 4J57E 1RK4A 1K0DA 2O87A 1N8JA 3C1SA 1GP1A 3UARA 2HE3A 5EPFA 2HYXA 3L9UA 5IPHA 2IMDA 3CSIA 4MMMA 1M2AA 1AQWA 1A2LA 2MMNA 4V1Ap 2LQQA 5AN1A 1ST9A 2H8LA 2PERA 4HZ2A 1JLWA 1TK5B 1SK1A 4PXOA 5GAPD 1BJXA 2AHEA 1T7PB 2P0GA 2FNOA 2OBKA 2AB6A 4L5LA 1PN9A 3KTLA 5FHIA 3VI5A 3L78A 1TDIA 3HD5A 2LSTA 4POLA 3TKQA 2B5XA 9GSSA 4TOPA 3IOSA 2FWFA 4AJ8A 3RDWA 2EIOA 3IK7A 2FWGA 1SKWB 1QMVA 1W89A 2B7JA 2A4VA 2MMOA 2K6VA 2H1BA 1TRVA 2CVBA 1CQHA 1WMJA 3SBCA 2MBTA 1U88A 5ECLB 3DD3A 1WIKA 2XC2A 3GKKA 1DUGA 11GSA 4F0CA 1V2AA 1PX7A 1M9BA 2WS2A 2IMIA 2NPBA 2VO4A 3FW2A 3O6TA 3F4TA 4EL1A 4RQXA 1ML6A 2X8GA 1ZOFA 1AQVA 1JLVA 1Z9HA 2VM2A 4JEDA 2HLSA 5A4UA 1SK0A 5AIVA 4K2DA 1FB6A 1LJRA 1TKDB 1I5GA 4K7NA 5ECOB 1GSSA 2IJYA 3KZQA 1NHYA 1TJDA 2V1MA 2XHFA 4D73B 3D21A 3FZ5A 5DQSA 1OAZA 1JZDA 1ZMAA 3EU3A 4ZBDA 1IYIA 3D22A 1HQOA 1X0RA 2FY6A 2GZZA 4WBJA 3Q19A 2L59A 3DVXA 2J9HA 3GTUA 4KDXA 2D2ZA 3ZFBA 5G2ZA 3VPTA 2L6CA 1YKAA 2QSIA 1FVJA 1C72A 2OBIA 2GQMA 4HJ2A 2PGTA 4ULXA 2RM6A 1LU4A 4HU7A 4NHWA 2G2QA 2GZPA 1K0CA 1OYJA 2LKUA 3ZZXA 2C3TA 4BWQA 4IHUA 4DEJA 1M0UA 6GSUA 3GH9A 1GLQA 2VCXA 4QL7A 3UBLA 1SENA 3C7MA 3UOMA 17GSA 3TKRA 3LQ7A 1SKRB 4DSRA 2V6KA 2GQLA 2A2SA 4G2EA 4PQ1A 5KN2A 3ZTLA 3QFAC 1M7TA 1YF1A 2N5BA 3IE3A 2ON7A 2VL3A 3HXSA 1ON4A 7GSSA 1XWKA 1X9SB 1EOHA 4KDUA 3FZ4A 4QL9A 2E7PA 2KLXA 4MZBA 4K7OA 1TW9A 1EEMA 5D9XA 5DCGA 2H0IA 3L0HA 8GSSA 3F6FA 4Q5RA 4BA7A 4MPFA 1EP8A 2YP6A 2B6MA 4JU5A 3DKSA 1XZOA 4GRFA 4WETA 3FR3A 3QPMA 3IAM2 5ECHB 1HYUA 2V41A 1XVQA 3UMAA 2H75A 3M9JA 4KGIA 2HSHA 1AC1A 4OCEA 5CP1A 1TRUA 3CRUA 4K6XA 4OMVA 4RUVA 3VFIA 5ECPB 3A2XA 3RPPA 3GSTA 3KXOA 2DJ2A 4Q5NA 3D5JA 1SL0B 3ERFA 4G9HA 1J08A 1O6JA 4HI7A 3WYWA 3G9BA 2BTOT 2BJXA 2V6OA 1WRYA 3NOFA 1H75A 2C1YA 5G1KA 2CVDA 4GSSA 1T1VA 3TDGA 4XTSA 2FCHA 4G10A 2H66A 1Z5YE 3FHKA 4O92A 5JCUA 3IDVA 4IQ1A 3DGQA 4XHMA 3KH9A 4YQMA 3QAGA 5HFIA 5ECMB 1R26A 1T00A 4HOJA 1J0FA 1T4YA 4V2MA 2M72A 2WZ9A 3F0IA 5B8AA 3EE2A 1DSBA 1R4WA 2RUFA 5ECNB 1SL2B 4POKA 1MDIA 2IMKA 3GA4A 4EO3A 3GUSA 1PD21 1SJIA 2DJJA 5IMCA 1GNWA 3V1WA 4GCIA 3D4MA 4K0NA 1OC3A 1Z7PA 4RI7A 2H1GA 4GSNA 4WR4A 1USBA 1BQ7A 1EZKA 2GT6A 2OKAA 4MZWA 3IV4A 3I69A 2JZSA 3GL3A 1GWCA 1JZWA 5ELGA 3U6VA 5IQYA 5IMZA 2IWTA 1Z7RA 4EUYA 4TKYA 4NMUA 2DIYA 1WE0A 3FY7A 3HKRA 5AGYA 2VLUA 1SU9A 4NWYA 2VIMA 3FZAA 2CT6A 4FO5A 4GLTA 1V98A 4L8EA 2VM1A 3KP8A 5ELAA 2V2GA 2VCZA 4ZIJA 3DMLA 2R4VA 5CRDA 2MYGA 4TXVA 4Z7XA 5HQPA 2FGXA 3HDCA 5JCWA 1S3CA 2OADA 1EGRA 1V9WA 2LNSA 2LEGA 4FYBA 3PGTA 1H4OA 4HS1A 3F4RA 3KCMA 5G5FA 4KH7A 4IBPA 3J7Yb 2P31A 4FYUA 4O32A 1U3AA 2OE3A 2EC4A 2WRTA 1PRXA 1O85A 4GSTA 4ZB6A 4MK3A 2B3SA 2VCWA 3LJRA 4ZL8A 4HQZA 1T3BA 1E6BA 3FZ9A 2LJKA 2KHPA 1SJ6A 3CTFA 3GHAA 4POMA 3BCIA 2YWOA 2H76A 4TR3A 1GNEA 4Q5FA 1FVKA 1Z3EA 4ZBBA 3TRQA 5CNWA 2WGRA 4MJCA 2YV7A 5GSSA 3S9FA 3ZITA 4IP6A 5J9BA 3HA9A 3KJYA 1XWAA 5DVBA 3IR4A 2HZEB 1UA5A 1SL1B 3IAS2 2H72A 2KOKA 3BD2A 4GTUA 3CSHA 1XW9A 3TJJA 2LRCA 3LORA 2C4JA 1Y6EA 4I5QA 2C0GA 3FEUA 1B4QA 1A8YA 3GURA 2M46A 5DDLA 1B9YC 5LNKe 3LXZA 4XS6A 4E8HA 1GUKA 3CSJA 5D9WA 2IMFA 2ZUPA 5G30A 4KX4A 2H6ZA 18GSA 3UL3A 1XXUA 4ILFA 3VWWA 1EEJA 1JZRA 3HVSA 2H74A 5B6MA 1AIUA 3EVIA 3A3TA 1T4ZA 4GQFA 2PPTA 3G7IA 4MP4A 2HZFA 2MMZA 4OD7A 1M2DA 1KEBA 2IPAA 1FHEA 3F3QA 4X0XA 3L9SA 1TTZA 2R37A 2KUCA 3GIXA 4N0VA 1TI3A 4EE0A 3KIJA 3QR6A 5COHA 4ZL7A 3ZL5A 2VL9A 4GQCA 3TCOA 2WJUA 2LJRA 2KP1A 3BOAA 5KEJA 2O89A 5CYYA 4D73A 3P2AA 1GSQA 2E2GA 5C04A 3NIVA 3TJKA 3US3A 1Z6NA 4XS4B 3MAKA 5IMFA 5KN0A 3KMOA 2OACA 1AW9A 5JCGA 5G1LA 3ZLPA 5LD0A 5HR3A 3D0ZA 1VRSD 2WULA 2VAFA 3F6DA 4MZCA 1I9DA 3D6IA 3APSA 4F03A 3VURA 3LFLA 3TRPA 2C0DA 3EYTA 4K0GA 3A2VA 1XVWA 3GN3A 1ERUA 1GUHA 2O85A 4J2FA 3O3TA 2LV3A 3ZYWA 4WF4A 1MEKA 1FO5A 1MDKA 5ENUA 1TU7A 5IIZA 2DJ1A 5DALB 2GGTA 4WBRD 4XCSA 5AISA 2WDUA 4BWSA 1YY7A 3C8EA 1JHBA 2NDOA 2TRCP 2H01A 3UJ1A 1THOA 2H19A 3HZ4A 4BVXA 2X8HA 2LUSA 2YN1A 2XPDA 1K3LA 4X43A 4IJ3A 3ZREA 3GX8A 2C80A 2GS3A 1QQ2A 1AUCA 1PMTA 3E9JB 5ID2B 1BX9A 4TXOB 4POBA 1OC9A 4LMVA 2AV4A 3WGXA 3HZ8A 1WP0A 3WD6A 3LEFA 3TOUA 3FRCA 1GTIA 2FUG2 1ILOA 3KGKA 2L4CA 1X9WB 2F8AA 3NZNA 3CBUA 3GNJA 2B5YA 3E0UA 1XOAA 3I9V2 3KTBA 5KN1A 3IC4A 4JR4A 2R6KA 4AF2A 1QUWA 1O8XA 2NVLA 4ZBAA 3KMNA 1UVZA 2DJ3A 3RBTA 1F3BA 2DMMA 3UBKA 6GSVA 4YAPA 3KM6A 3C1RA 2GSQA 4EKZA 5J9CA 1ZL9A 5ECQB 3UEMA 2XBQA 3ERWA 1RW1A 1OKDA 2YANA 2L4QA 4MH3A 2NBSA 2OA7A 4E8EA 4NV2A 3DWVA 1K0NA 5J3RA 2XPEA 4WKWA 2LTKA 3QCPA 3M8NA 5G5EA 4BL7A 5IO0A 5E4WA 1PX6A 1ERTA 1XWGA 2ALBA 5D8IA 1MD4A 1Y25A 2B5EA 1SJZA 3GL5A 2P5RA 5J41A 4PNGA 5H5RA 1YJ6A 1NSWA 5FT3A 4ECBA 3MNGA 5GZZB 2YJ7A 1XIYA 3ZMKA 4MJBA 3PH9A 2K8SA 3CXGA 4IJIA 2F8FA 4OFTA 3H79A 4ACSA 1O7UA 1Z6MA 1TRSA 4N0ZA 1OC8A 2YZHA 4G19A 1DBYA 3FR9A 1G0TA 3RHCA 3EWLA 2C3QA 3DIEA 4FYCA 1X5CA 2F9SA 1G6WA 2JSYA 4V1Ag 4WEYA 2H6XA 2JACA 4XRDA 2IL3A 4YAVA 1SD9A 3GH6A 2GTUA 1FG4A 1VGLA 5C00A 4ML6A 4HU9A 2EIQA 3Q18A 1TK8B 4OCFA 1SD8A 3FR6A 5E59A 2WFCA 3A2WA 1ERVA 1GULA 4KUNA 1B4PA 1R5AA 1B9XC 4TW5A 3VWVA 5GAND 5DJLA 5IMDA 1NW2A 6GSXA 2PMTA 2IFQA 4I6XA 2PVOC 5D9TA 3HVVA 2TRXA 2GVPA 2O8VB 1X5EA 4WR5A 1GRXA 3WGEA 2DBCA 5F05A 2LRNA 3VLNA 4MABA 2I9HA 1XBSA 4BVYA 2AJQB 2K18A 3WT2A 2MBSA 1HNAA 2C0EA 1V40A 4RI6A 5DQYA 1E2YA 2IN3A 5JWQB 5FWGA 3HHVA 1XPVA 2H6YA 3O76A 4LA1A 3G7YA 4EF0A 1GTBA 4X1UA 1NM3A 2VCQA 1PGTA 1UN2A 3M0FA 2K8VA 1G7EA 2B1LA 2PBJA 3I43A 1UC7A 4LLRA 1KNGA 1OE8A 2VD1A 4DSSB 4HUAA 3TJBA 4I8BA 1X9MB 2A2RA 4NHZA 1V58A 2M80A 1MD3A 4EDZA 6GSSA 2I4AA 4N30A 2JL4A 3ISOA 4AGSA 2G0FA 5JWRB 2VD0A 3EURA 2ZNMA 4GF0A 1RQMA 2CV4A 1K3OA 2OE1A 3N9JA 1BYEA 1F9MA 3BBYA 3RPNA 1YKCA 3EU4A 6GSWA 1A2MA 3GRXA 3R2QA 4K7IA 1M2BA 1ABAA 3DVWA 3HY2A 1S3DA 1EV4A 3EMPA 4WF5A 3W8JA 2VLVA 3ME7A 2X64A 1CQGA 3KEBA 5A5KA 4IGJA 1YF0A 4I97A 3W6GA 1ZYEA 4IP1A 1B48A 3ZIVA 3DRNA 3KH7A 2MZCA 2LS5A 3TKPA 2LNTA 3DEXA 3QAVA 1QGVA 2GDRA 3P7XA 2HXKA 3TJGA 1G6YA 2JU5A 3P8WA 2AYTA 5DAKB 2LQOA 5A4WA 4ZILA 2H1AA 5IPGA 1XWCA 5KN3A 3UAPA 2CQ9A 1V57A 3IK9A 3F9UA 2DJKA 1TP9A 5EVOA 3M1GA 3M9KA 1OE7A 4HZ4A 4NXIA 3F8UA 1KBNA 2CZ2A 5D73A 3QMXA 4OO4A 2L5LA 3LXTA 3CTGA 1WJKA 5HFKA 2VOCA 5JWOB 3LYPA 1Q98A 2H71A 1N2AA 2LJAA 4I2TA 2I3YA 2DC5A 4P3YB 2IMEA 3P90A 5GSTA 4PNFA 3HYPA 4PUAA 5D9VA 5J5NA 3TRXA 4ECIA 4F0BA 1YQ1A 4YQUA 4MPGA 3LG6A 1VF3A 3ED3A 2GZYA 4ZB9A 1O81A 3Q74A 1A0FA 2PVQA 4TR1B 5EY6A 1OVNA 4HJMA 3H93A 4EXJA 3HJOA 3BCKA 4CW9A 4IW9A 5DJMA 4LL1B 2BMXA 2ES7A 4PGTA 3IXRA 3CMIA 3PR8A 1PL1A 3FK8A 1XWBA 2K9FA 5F06A 1SYXA 2OJLA 2DMLA 3QAWA 4Q5QA 4KCEA 1B8XA 4IN0A 2H70A 2YWMA 1GL8A 1A23A 2R5GA 3SWLA 3EINA 3N5OA 1KTEA 4MF6A 3F63A 5DCHA 1LBKA 4MDCA 4L0UA 14GSA 4QQ7A 3RAZA 2XBIA 5D93A 1GSDA 4MJEA 1F6MC 5ID2A 3GKMA 4YH2A 4FH8A 4TXOA 3UIWA 2IIYA 4ZL9A 2CA8A 3BJ5A 3Q6OA 2FHEA 5F8BA 1FW1A 12GSA 3TOTA 4MF7A 3UVTA 1GUMA 3MSZA 4KW6A 2CZ3A 1THXA 5H5QA 3JCML 2C0FA 3H4KA 1GSYA 4F82A 4H86A 1SK2A 1TI1A 2CAIA 1F2EA 3TGZA 1QFNA 1TXXA 2HRNA 4ML1A 4KA0A 2EIRA 1SKSB 3CRTA 3UVHA 3TJFA 4XIHA 5IMVA 5IOWA 5HR0A 3GV1A 1R7HA 5ECRB 1GSUA 4LMWA 3IRAA 4PX1A 1JZOA 3GKNA 2JZRA 3TUEA 4KNDA 5IO2A 4KSMA 2V32A 2AAWA 4O5RA 1BEDA 2PUKC 2N5FA 3HJMA 5ECKB 3VPQA 2RLIA 1WWJA 5F0GA 4TVEA 1A24A 2F3MA 2CX3A 3GX0A 2HFDA 3QD9A 3ZIJA 3APOA 2RIIA 2VL2C 4F9ZA 2C8UA 5J4UA 1XFLA 1U87A 1XW6A 1BAYA 1A0RP 4CDOA 1MDJA 3MWHA 1O8WA 3MDKA 2H73A 4OFNA 3VK9A 4N11A 4KE3A 1JFUA 2J23A 5CREA 5CAXA 2CX4A 3C73A 4OO5A 1K0AA 4DSQA 3AY8A 1TK0B 1MTCA 2HNLA 4IKHA 3K8NA 3ZRDA 3GKXA 2JADA 2HSYA 1S3AA 5A4VA 2HT9A 3D4TA 1AQXA 1ERWA 4XS1A 1YDKA 3KP9A 3H8QA 5CRGA 1BG5A 4LL4B 2HRFA 3APQA 2H0HA 4MH2A 4PQHA 4K8MA 2E2MA 4F2IA 5INYA 2YV9A 3EMXA 3LGCA 3PINA 5IOXA 1U3IA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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