2LRNA

Solution structure of a thiol:disulfide interchange protein from bacteroides sp.
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
152
structure length
152
Chain Sequence
MSLATGSVAPAITGIDLKGNSVSLNDFKGKYVLVDFWFAGCSWCRKETPYLLKTYNAFKDKGFTIYGVSTDRREEDWKKAIEEDKSYWNQVLLQKDDVKDVLESYCIVGFPHIILVDPEGKIVAKELRGDDLYNTVEKFVNGAKEGHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein
publication title Solution structure of a thiol:disulfide interchange protein from Bacteroides sp.
rcsb
source organism Bacteroides sp. 4_3_47faa
molecule tags Oxidoreductase
total genus 51
structure length 152
sequence length 152
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2lrnA00
4Q5FA 2N5BA 3IXRA 3WT1A 5G1LA 3QAWA 1PX7A 1EGRA 2C1YA 4HZ4A 1OYJA 18GSA 2H30A 2HZEA 2YZUA 3VPTA 1YEXA 4NHZA 1EV9A 4BWQA 2IMIA 1ERUA 1V58A 1Z9HA 4K9ZA 2VCZA 5D96A 2RM6A 3O6TA 4EC0A 2CAIA 4KSMA 3CSIA 4D73A 1M2AA 2X64A 2VL2C 3HVSA 3TOTA 3A3TA 2X8HA 2OBIA 3RHCA 3DXBA 5E59A 3TJBA 2HFDA 4BA7A 5FWGA 3Q6OA 3KM6A 3LXZA 4JR4A 2GS3A 4P3YB 3FYGA 4GWRA 5GSTA 2OBKA 5CYYA 4O5RA 3UVHA 4O92A 1U3IA 2N5AA 1XOBA 3LEFA 3FK8A 1E2YA 3P2AA 1CQHA 3C71A 1G6WA 4HU7A 1SKRB 5ECOB 4GTUA 3ZIVA 1XVQA 1NW2A 1EZKA 2G0FA 9GSSA 5IIZA 1SENA 3QFAC 5JCGA 3F3RA 2DJ1A 5F0GA 2IMDA 3KD0A 4L0WA 2HZFA 5IOXA 1X5EA 3IHQA 4K6XA 1R5AA 3BBYA 2M80A 2C3NA 2FHEA 1TXXA 4TW5A 5IOWA 4LMVA 2MMAA 3HHVA 4TN8A 2L4CA 1MTCA 1GSFA 2V2GA 2DMLA 5F05A 1Z7PA 3KH7A 2DBCA 1SL1B 4DSQA 4NMUA 2MMZA 3I6AA 3BJ5A 1YEPA 4POLA 3CTFA 1PA3A 4FH8A 3GSSA 2XBIA 4GSTA 2PVQA 2L5OA 5DALB 2XPEA 2NVLA 1YQ1A 3WGXA 1T7PB 3L9UA 4PUAA 1PX6A 1WWJA 6GSSA 1XW5A 5JWQB 2MZCA 4KH7A 3FR3A 3KP9A 5AISA 4GQCA 3EMXA 3J7Yb 4EUYA 2AV4A 3TKSA 4HZ2A 3UIWA 1HYUA 1G7OA 1N2AA 3U6VA 1BYEA 3TJKA 1FVKA 3ERGA 3DD3A 1FG4A 1URMA 3IV4A 4GXZA 1T1VA 4KDYA 4RQXA 1EEMA 1ZGNA 3GUSA 2WJUA 19GSA 5JWOB 2H19A 1WPIA 3FEUA 3GTUA 1F37A 2YCDA 4EL1A 1GTIA 3HYPA 1KNGA 22GSA 2DMMA 1GSSA 1YDKA 3C1RA 3ZVJA 3FY7A 5IMAA 1VF1A 2YV7A 4MZCA 1Q98A 1USBA 1HQOA 3F63A 3GL5A 2GQLA 1JZRA 1O81A 1GSYA 2FWEA 3ZREA 5ECSA 2YOIA 2GSRA 1SL0B 2RM5A 1VF4A 3EMPA 3QOUA 2KP2A 1TP9A 4ILFA 4TXVA 2AYTA 4IP1A 1AQVA 2VUPA 1SKSB 1XOAA 1U87A 3E0UA 3I43A 3E9JB 4TOPA 3ME8A 2PGTA 2V41A 2QGVA 3IA1A 3M9KA 5LNKe 4POKA 3GIXA 5EVOA 2GQKA 1PMTA 3W8SA 2F8AA 3LYKA 2IFQB 2DJKA 5C00A 1WIKA 4NV2A 4KCAA 3DEXA 1GH2A 2PVOC 3TKQA 2HE3A 4F9ZA 4PQHA 1QGVA 1QXHA 4XRDA 4PQIA 1J0FA 1K0CA 2OA7A 2VM1A 3QMXA 2VAFA 1TRSA 2A2SA 4ZB8A 2D2ZA 2FCHA 2J23A 2DJ3A 4IVFA 3UARA 2C3TA 2GVPA 1A2LA 3CYNA 3K8NA 1X5DA 3ISOA 1PN9A 4Z7XA 2X99A 4XHMA 3L4NA 1JLWA 3UMAA 3QCPA 2H71A 2E7PA 1GUHA 2YWOA 4HI7A 2CA8A 2PERA 2ZUPA 4MF5A 5HFKA 4PQ1A 3LSZA 1RW1A 3UBLA 1F2EA 1BJXA 3DYRA 2R5GA 5AIVA 3UAPA 3GSTA 4I2TA 1EOGA 3TKSC 1PKZA 2FA4A 1XWAA 3PR8A 1AW9A 2WGRA 3G9BA 4EVMA 2R4VA 3CBUA 2HXKA 3L78A 2O87A 3UEMA 2YP6A 4KW6A 4MZBA 1ACVA 1YJ6A 3HDCA 4OCEA 2VCWA 1EP7A 2H0HA 4L8EA 3IC4A 4Q5NA 4WF5A 4KDXA 2MBTA 1WRYA 3VWUA 4KX4A 5EY6A 3KTBA 3TRQA 1SJZA 2B1KA 10GSA 1AQWA 3CSJA 2FWGA 4IS0A 1K3LA 1OC9B 2HRFA 2CVBA 3VWXA 1Y25A 2LRCA 4V2NA 1S3CA 6GSUA 5IMDA 2ALBA 3GKKA 1WOUA 3HD5A 3VPQA 1J08A 1TRUA 3L9SA 1DBYA 2DJJA 2AAWA 1O6JA 3QAGA 3M1GA 2KHPA 3D4TA 3ERWA 4YAPA 3MNGA 2I3YA 1R5PA 5H5QA 2F9SA 4NV5A 2JZRA 5G2ZA 1TDIA 4YQVA 1K0DA 2XPDA 2CT6A 4FYCA 1YF0A 2A2RA 5G1KA 2IJYA 2CX4A 2O8VB 1CQGA 4ECIA 1WJKA 3MSZA 5DBQA 2IMFA 5ID2A 1XBSA 2CZ2A 3ME7A 4AJ7A 1MDKA 3APQA 1GNEA 5J3RA 3FZAA 2P5RA 3OR5A 4GLTA 3EE2A 4EO3A 4YH2A 4MCUA 3CSHA 1TW9A 2XBQA 4ULXA 2MYGA 3EU3A 3VK9A 3SWLA 2HLSA 14GSA 3UJ1A 3US3A 1IYHA 2H76A 5CO3A 5KN0A 3QAVA 2V1MA 1S3AA 3R2QA 2JSYA 4TXOB 3GH6A 1THOA 5B6MA 3APOA 2FY6A 4NWYA 2VOCA 3DKSA 2MBSA 2H1AA 4Q5QA 3ZLPA 2AUVA 6GSYA 1KEBA 4O32A 2MMNA 1YKAA 1GTAA 3GKNA 2OE3A 1TK8B 5D9VA 1G0TA 3F8UA 1GL8A 3A2WA 3DIEA 4DSSB 3HVXA 4IBPA 4PNGA 1OKDA 1K0NA 1TTZA 4JE1A 5JCUA 3H79A 4KE3A 2J9HA 1R7HA 5ECRB 1GWCA 4ZL7A 4MJBA 5DQYA 3GX8A 3QPMA 2GLRA 2E2MA 2BJXA 1O73A 1WMJA 3Q74A 1QFNA 1AXDA 3L9VA 1SK1A 4ZBAA 5F06A 2LKUA 3LQ7A 4JU5A 2GSQA 1ABAA 4IGJA 1MDIA 2EC4A 2R3XA 4K8MA 2YWNA 5B8AA 5FHIA 5AIXA 3TRXA 3I9V2 4OFTA 2LJRA 5A5KA 3EYTA 1GSUA 2H8LA 1GP1A 3HVVA 4WBJA 4PUFC 2DLXA 1ERTA 3E3EA 3TUEA 3NZNA 6GSVA 4LLRA 1JZWA 1GULA 1THXA 2LNTA 2HSHA 3H1NA 2B3SA 2X8CA 4IELA 2YPMA 3QFBC 2F51A 1FHEA 1SD8A 2IMKA 4Q5RA 3EC3A 4ZXGA 3IR4A 2PU9C 2XHFA 1SYXA 3H4KA 3GHAA 1XPVA 1M9BA 2PBJA 1VRSD 5J4UA 5DAKB 5CRHA 3DRNA 2LEGA 2TRXA 3KEBA 4HS1A 1M7TA 2ON5A 1OC8A 3TGZA 4ZILA 2O7KA 3NOFA 3C7MA 3ZMLA 5IMCA 2B7JA 1EWXA 3H8QA 2C0GA 3IK7A 2OKAA 4X1UA 1TJDA 3P7XA 4TRXA 2I9HA 3KMNA 1EEJA 1MD3A 3D4MA 1H4OA 2M72A 1OE7A 2JACA 2OACA 1XZOA 5CRWA 4AF2A 5H5RA 4IQAA 1OC9A 5D9WA 5KEJA 2GT6A 2H70A 4G2EA 4CW9A 4OCFA 1M0UA 1OVNA 2LRTA 3U5RE 11GSA 2JSZA 2F3MA 1HNCA 3VURA 1JLVA 3LXTA 3Q18A 4K7OA 1ZYEA 3FKFA 20GSA 4LL4B 4EE0A 2H1GA 5E4WA 2CV4A 4OMVA 3KMOA 4OO4A 2BMXA 5A4WA 1TKDB 2HT9A 2B6MA 1K0OA 5J9CA 3A5WA 4WKWA 2VCQA 2H6YA 4LL1B 2H72A 2TIRA 3G7JA 5B8BA 1YZXA 2V6KA 4X0XA 1T3BA 2YANA 3A2XA 4IP6A 4ECJA 4GSSA 3IE3A 4DSRA 4MABA 2B1LA 3IOSA 5DJMA 1B4PA 2EIRA 2NBSA 1K0AA 3P8WA 3HXSA 4ISDA 5HQPA 1V2AA 2LJAA 1GRXA 5ENUA 2B5EA 2YJ7A 5GAND 5J41A 1X5CA 1O7UA 1O85A 1W4VA 5CAXA 3V1WA 1XIYA 5JCWA 1GSQA 2H6XA 3F4SA 2VL9A 2VLUA 4MP4A 3TJJA 5ECIB 5DCHA 4XS6A 4J57E 2C80A 2H75A 5C04A 3KP8A 4KCEA 2L5LA 5ECKB 2VL3A 3HCZA 3O3TA 5HR1A 1K0MA 2C3QA 1FOVA 1UC7A 1HD2A 2H73A 4TKYA 4CHSA 4EDZA 3PH9A 1KBNA 4FYBA 3HY2A 1GUKA 1XVWA 1SYRA 2IIYA 5F8BA 4IN0A 2JADA 5CREA 3KGKA 1NHOA 1RK4A 4MH3A 4HEA2 2I81A 1JZDA 2RIIA 1G6YA 5IMVA 3HA9A 2LNSA 3GYKA 2WZ9A 3RHBA 4ML1A 4FYUA 1UVZA 2HZEB 1V57A 4OD7A 2FD3A 4BVYA 4BL7A 1QMVA 5HR3A 1PKWA 2V32A 4WR4A 1ILOA 2GQMA 1GNWA 1U3AA 2WCIA 2IMEA 1ZMAA 3CRTA 1ZL9A 3FZ4A 4HJ2A 4HOJA 3LYPA 5B7CA 3FR6A 3GFKA 4I5QA 4TR4A 4F2IA 2R37A 4I8BA 2B5YA 2IWTA 1ST9A 1HNAA 4IJIA 2LQOA 1G7EA 4JRRA 3F9UA 3HJMA 3LGCA 4EXJA 3F3QA 4RQRA 2CQ9A 5D9XA 3FZ9A 2DJ0A 5ELAA 2DC5A 3ZIJA 3M0FA 3F4TA 3IBHA 3PINA 4ZL9A 1UA5A 1Z5YE 2OADA 5J9BA 1Y6EA 3D21A 1XWKA 4K7NA 3D6IA 2L4QA 3HJOA 3TCOA 4JBBA 5DAKA 2P5QA 4GSNA 4MF7A 3VI7A 5D93A 2C4JA 4K2DA 3W6GA 1XCCA 3BCKA 3TKSE 5KN1A 3D22A 3GKMA 2WDUA 1FO5A 4DVCA 1GTUA 2RUFA 1JFUA 1QUWA 3TDGA 1MD4A 5HFGA 3D0ZA 3F6DA 5IMFA 5HFIA 3VFIA 2VCXA 1K3YA 1JZOA 4MJEA 2ON7A 2WFCA 2KOKA 3IK9A 4H86A 5A4VA 5COHA 5HR0A 4GCIA 1GUMA 5GSSA 2GGTA 2DIZA 4KGIA 3GV1A 3QD9A 1F3BA 4KNDA 1TI1A 3PGTA 4G9HA 4POMA 3L0HA 4OFNA 5IQYA 2VLVA 2KLXA 1TRWA 1YF1A 1SK2A 5L71A 5DALA 4MF6A 3ZFBA 4G10A 4TR3A 3GTUB 4PGTA 3G7YA 4QL9A 3TOUA 2H74A 2CVKA 1OC3A 4MJAA 3QDNA 3ZVJD 2GZYA 4YQUA 3UVTA 2C0FA 3UOMA 1I5GA 2HSYA 4F0BA 2DJ2A 2R6KA 3UBKA 1VGLA 3HKRA 3GL3A 4V1Ap 4ZBDA 4HUAA 1SKWB 4ECBA 4TVEA 3TJFA 3N9JA 2IL3A 3C73A 2JL4A 2H1BA 2WB9A 5GZZB 2YNXA 1UN2A 1SL2B 1Z3EA 1GTBA 3KJYA 2B7KA 3WYWA 5EPFA 2KUCA 1B9YC 4PURA 3IPZA 3W8JA 2DSAA 5B6NA 5ECLB 2QKEA 1DSBA 2ZNMA 2O85A 5LD0A 2PN8A 3RPNA 2ZCTA 1XWBA 4WF4A 16GSA 2VLTA 2GZZA 2GT5A 1S3DA 1YKCA 4AJ8A 4MA9A 3TKPA 4E8EA 4BWSA 1PRXA 2KP1A 1B48A 1M2BA 5D8IA 3G7IA 4IJ3A 3ZFLA 1PD21 2GZPA 2K9FA 4HU9A 1OKTA 1BAYA 1JHBA 3FR9A 3H93A 3LWAA 5JWRB 4MDCA 2IFQA 2GSTA 2FWFA 5DCGA 1LJRA 1YY7A 17GSA 2OE1A 5IPHA 1PGTA 3M9JA 1LU4A 2AJQB 3GX0A 4FIWA 1OAZA 1XW6A 2K8VA 8GSSA 2GDRA 4V2MA 3A2VA 4MPFA 2HNLA 1AQXA 3DVWA 5ABRA 1ERWA 2WS2A 1A2JA 1HNBA 4ID0A 2LUSA 3IDVA 4AJ6A 1H75A 3C8EA 2FUG2 3GMFA 3WGDA 3TKRA 4JZQA 2OE0A 2O89A 5IO0A 2N5FA 1A8YA 3IAS2 1X0RA 4X43A 2GSSA 3GA4A 4LA1A 3P90A 2L6CA 6GSWA 4BPYA 3SBCA 1T00A 2C8UA 3S9FA 2R2JA 1K3OA 4MLYA 3UL3A 3DMLA 4N30A 3HZ4A 4GQFA 2VCVA 2LJKA 5DQSA 4V2LA 4KB3A 1T4YA 5IPGA 3EURA 1ML6A 1SJ6A 1M9AA 2VD0A 1PQNA 3GN3A 3C1SA 2YN1A 1XXUA 5DDLA 5ECPB 4I2UA 1LBKA 4HQSA 4BVXA 3FHKA 4IHUA 5KN3A 3EU4A 4K0GA 1A8LA 2YJHA 5ECHB 1F3AA 4MJCA 4YQMA 2PUKC 4XIHA 2LSTA 3KIJA 1AIUA 4OWYA 1PL1A 3BCIA 1TRVA 3ZTLA 4WETA 4E8HA 3ZITA 4ZBBA 2VM2A 4KUNA 5ID2B 4NPBA 1GSDA 5J5NA 2FNOA 3D5JA 4POBA 2FA8A 5INYA 2EIQA 3M8NA 4XS4B 1BX9A 2E0QA 1DUGA 2L57A 4HQZA 1A23A 2AHEA 2P31A 4EDYA 2OJLA 4K7IA 2YZHA 4GRFA 3LJRA 1A0FA 4PNFA 4AGSA 1R26A 1SU9A 2XC2A 4HJMA 1B8XA 5ELGA 1B9XC 3M3MA 1W89A 1ZZYA 2PWJA 1X9SB 3O76A 1R4WA 2NTOA 1NSWA 3ERFA 4NXIA 3HZ8A 1TU7A 5FT3A 1N8JA 4WXTA 2H6ZA 1Z7RA 1BG5A 3CMIA 4TR1B 3EVIA 7GSSA 4WEYA 5CP1A 2M46A 1NM3A 1J9BA 3F0IA 3BOAA 4MZWA 2RUEA 2H66A 3BD2A 3VLNA 2F8FA 5AN1A 3ED3A 4L5LA 1Q4JA 2CZ3A 2A4VA 4TXOA 2H0GA 4PXOA 3MDKA 4OO5A 1SK0A 3VWWA 3KZQA 4MK3A 1F6MC 3WGEA 1B4QA 4JEDA 2I1UA 6GSTA 2C0DA 4GF0A 4IKHA 2WULA 4CDOA 2TRCP 1EV4A 2I4AA 1U6TA 1E6BA 4KSOA 5HR2A 2YWMA 4DSSA 3GH9A 4ZB9A 3TRPA 4WBRD 1O8XA 2AB6A 4G19A 5G5EA 1VF2A 2BTOT 1ON4A 3AY8A 4KDUA 1I9DA 2FLSA 2LQQA 2DIYA 3J7Yk 4QL7A 4HDEA 4LMWA 1ZYQB 2HI7A 2YWIA 1WE0A 5KN2A 4N0VA 2L59A 1SD9A 4D73B 1QQ2A 3VI5A 1A2MA 2QSIA 4RI6A 4F82A 1K0BA 13GSA 3KTLA 3JCML 1X9MB 2CVDA 1WP0A 3LORA 1C72A 3LG6A 1XW9A 1AUCA 3DWVA 5D9TA 2K8SA 2GTUA 3GURA 3MAKA 1DE2A 5EL8A 1V98A 1AC1A 5G5FA 1TU8A 4XCSA 3ZYWA 1XWCA 5GAPD 1F9MA 2JZTA 1M99A 1IYIA 1ZOFA 1XWGA 3EWLA 1AAZA 1GLQA 2LS5A 4TR0A 4YAVA 5IM9A 5DJLA 4MH2A 2B5XA 2REMA 1T8EB 3IAM2 6GSXA 2VCTA 5F07A 1FVJA 4K0NA 2VO4A 2IN3A 3FRCA 2LRNA 3FW2A 1TK0B 5ECNB 2L6DA 1MEKA 4ZB6A 2G2QA 3ZRDA 4QQ7A 4OFMA 5DVBA 3DVXA 2HRNA 1EP8A 4MPGA 2K18A 1M2DA 1RQMA 4DEJA 2E2GA 2ES7A 3Q19A 4N10A 3ZZXA 2FGXA 2VD1A 5D73A 1FAAA 4IW9A 3GKXA 3F4RA 4PX1A 2H1DA 1MDJA 1TOFA 3KCMA 4EKZA 3FZ5A 2H0IA 2FWHA 4RUVA 3GRXA 5A4UA 2Z9SA 3DGQA 3ZMKA 1ZCPA 5LCZA 1X9WB 3WD6A 4XS1A 1A0RP 5H5SA 2YV9A 4FO5A 1VF3A 3KXOA 5G30A 3LFLA 4ML6A 4J56E 4NAXA 5IMZA 3RBTA 4NHWA 4N11A 1V9WA 3RDWA 4JR6A 3F6FA 1T4ZA 1PSQA 3N5OA 4XRAA 5AGYA 2CAQA 3IRAA 3ZL5A 2VL2A 3CRUA 1FB6A 3QR6A 1XFLA 2C0EA 2P0GA 2PMTA 3EINA 3CTGA 3APSA 3RPPA 4ECCA 4XS4A 1O8WA 1Z6NA 1EGOA 4O7HA 2JZSA 5CNWA 3WT2A 1NHYA 2V6OA 2CX3A 1OE8A 4K1FA 2NPBA 1FW1A 3NIVA 1EOHA 2X8GA 1TK5B 12GSA 4V1Ag 4KA0A 1GSEA 4ZL8A 1FB0A 2EIOA 1ERVA 5ECMB 2LTKA 4WR5A 2PPTA 3TB2A 2VIMA 1V40A 3TJGA 4XTSA 1BQ7A 1U88A 4EF0A 4ACSA 1A24A 4N0ZA 2H01A 4MMMA 5G31A 2RLIA 4TR1A 4L0UA 3HJPA 4I97A 4IQ1A 2K6VA 1KTEA 3I69A 1BEDA 5CRGA 2HYXA 1Z6MA 4F0CA 1PL2A 1TI3A 3GNJA 4KAEA 2WRTA 5IO2A 5ECQB 2MMOA 3KH9A 2IPAA 3RAZA 2NDOA 2LV3A 1SJIA 3MWHA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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