1A2JA

Oxidized dsba crystal form ii
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of reduced and oxidized DsbA: investigation of domain motion and thiolate stabilization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DISULFIDE BOND FORMATION PROTEIN
molecule tags Oxidoreductase
total genus 69
structure length 188
sequence length 188
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-01-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1a2jA00
5ECOB 2HE3A 3EU4A 2VD1A 3GKMA 1TRWA 1WIKA 3I6AA 3D22A 4KDYA 1BYEA 1JLVA 1F37A 2OBKA 4J56E 2PERA 6GSUA 5IMZA 2QGVA 4JE1A 2ZUPA 4KAEA 1M0UA 4K8MA 2HT9A 1J08A 5ECKB 17GSA 4MJAA 5IM9A 3KGKA 1X0RA 3UMAA 3ZYWA 1ERVA 1J0FA 4PGTA 1EEJA 2MBSA 5L71A 1TU8A 3CSJA 3HVSA 4LMVA 1HNBA 4OD7A 3UL3A 4JR4A 2HRNA 4QL9A 1G6WA 1AQWA 4WEYA 2LRNA 2YANA 3APSA 3ZIVA 4IKHA 4I97A 2RIIA 1F2EA 2K8VA 1NHOA 1TI3A 1FB6A 4POMA 3HJPA 4I5QA 3ZL5A 3ZVJD 3CBUA 4KE3A 2GQKA 5J9CA 2H19A 4NV2A 2E2MA 3D4MA 4F9ZA 3I9V2 1AXDA 4ZBDA 4AJ6A 1PKZA 4FYBA 1SYRA 2FY6A 2VCQA 4DSSA 3VWUA 5CO3A 3W8JA 2KUCA 4EUYA 2I4AA 2QKEA 2L6DA 1WRYA 2C0EA 4L0WA 1KTEA 5IPGA 1M99A 2WFCA 4AJ7A 1YF0A 2VM1A 3NZNA 3EINA 2QSIA 3C1SA 4FIWA 2A2RA 2H73A 5E59A 1XIYA 4POKA 2DSAA 4TKYA 2REMA 2YJHA 2XBIA 1F9MA 1EEMA 2GLRA 3LYPA 5IMDA 2LQOA 1SK2A 3KP9A 2AJQB 2E7PA 1XWKA 5G2ZA 3L4NA 5HR2A 3UBLA 3BD2A 1ABAA 3F6DA 4ULXA 5IMAA 1M7TA 5D93A 1OC9A 3BCKA 4PNGA 2C3QA 1FB0A 2I1UA 3TJFA 2QC7A 1XOAA 2IFQA 2H8LA 3TKSA 4JBBA 3TKRA 2IN3A 4I8BA 4ZL9A 3ZVJA 2CZ2A 4XS4A 4K9ZA 5CREA 1SJIA 1EP8A 4D73A 1PX7A 3UEMA 3DEXA 1V57A 1TOFA 3DIEA 3KMOA 1XW6A 3IHQA 1GTUA 1NM3A 3RAZA 3KIJA 2C0FA 2ES7A 2TIRA 4I2UA 3ZFLA 1OE7A 11GSA 4OO5A 2VL9A 4QL7A 2YWOA 1WPIA 2Z9SA 2P31A 4EF0A 4FYUA 2GQMA 2OE3A 3ISOA 1DE2A 4F03A 4YQVA 1ZOFA 3F3QA 4IJ3A 5GZZB 22GSA 5INYA 1M9BA 3MWHA 4TOPA 3ME8A 3KMNA 1PKWA 8GSSA 3TJGA 1USBA 4NXIA 2IL3A 4MF5A 1ACVA 3LYKA 3P2AA 5D96A 5GAND 2PVQA 3IPZA 2V32A 3FR6A 2HSYA 5CRHA 3VFIA 4TR1B 3IOSA 2ZCTA 3H1NA 4MPGA 4MH3A 2PVOC 4GQFA 2IMEA 3QD9A 4Q5NA 4MH2A 2GGTA 5HR0A 4MJCA 1TK0B 2K8SA 1GP1A 2JADA 1TDIA 2FCHA 4HU9A 2R3XA 2H75A 4NWYA 3HZ8A 1K0OA 2JZTA 5GSSA 3GX0A 4BL7A 4PQ1A 4X1UA 5ECSA 1WP0A 3E3EA 1VF1A 3VPQA 5ID2B 1AW9A 3RDWA 3IR4A 3NOFA 2H76A 4PXOA 2MZCA 2R2JA 3ZRDA 5DCHA 2GVPA 3IE3A 3IXRA 3GURA 4E8EA 2CVDA 3VK9A 1PX6A 3TUEA 3WGDA 4K0NA 5JCWA 2F3MA 2IMDA 2HNLA 5CP1A 2FUG2 1DSBA 1X5DA 1NSWA 4CW9A 1EV4A 3D4TA 4IBPA 3KZQA 1GH2A 3GNJA 5EY6A 2H70A 3CRUA 3R2QA 4LL4B 1GLPA 1X9WB 2I3YA 2KP2A 3F3RA 2C3NA 1SENA 3TKQA 3C7MA 5HR1A 4ECCA 3FZ9A 4O7HA 5ELGA 5ECLB 4Z7XA 4GSTA 7GSSA 3VWWA 3IRAA 1R26A 2X64A 1O81A 1XWGA 1ON4A 2WB9A 2CZ3A 3QFAC 1DUGA 1QQ2A 4K0GA 5J5NA 1FW1A 4L0UA 3HCZA 3L0HA 3W8SA 3IA1A 3GA4A 5H5SA 5IIZA 13GSA 3O3TA 3BBYA 4TN8A 4AF2A 2DJ2A 2YZHA 2GZYA 3ME7A 1X5EA 4TXOA 3C1RA 1JLWA 2V41A 2LNTA 4OWYA 2DJ3A 5DQYA 2JSYA 4LLRA 1ERUA 2RLIA 5D9XA 3GRXA 6GSWA 3GHAA 5B8AA 2YV7A 1TXXA 2GQLA 2AYTA 4LA1A 5IPHA 4KGIA 4MCUA 5HFGA 1GUKA 3GH6A 3FW2A 1PL1A 5G5FA 1GNWA 3TKSC 1W4VA 2ALBA 3DWVA 3RPNA 1BJXA 2PGTA 3M3MA 4F0BA 2I9HA 2HXKA 3ZLPA 1S3CA 1URMA 2DJKA 2NDOA 6GSXA 1EGOA 2MBTA 2NTOA 4YQMA 1GSQA 1O85A 3TKPA 4MZBA 5D9VA 1SKRB 1TI1A 5DALB 2OACA 2X8GA 4MZCA 4IELA 2LRTA 3RPPA 5G1KA 4G19A 4JEDA 5ECHB 3QR6A 3FKFA 4XTSA 4GLTA 1M2AA 4XS6A 1XPVA 4WXTA 1GSSA 2LS5A 4YAPA 5E4WA 1X5CA 3HVXA 5AIXA 3L78A 3GL3A 3FR9A 2L5OA 1G0TA 3O6TA 2V1MA 3FR3A 3N9JA 5CRGA 1XZOA 3TCOA 4J57E 3US3A 2P0GA 2LQQA 1SKSB 1XVWA 3TDGA 1A2MA 4WKWA 1G6YA 3CXGA 1ZGNA 4IW9A 3WD6A 3APQA 1B4QA 2CAIA 1GWCA 1SJZA 1U88A 4ZILA 4WF5A 1V2AA 3EMXA 4NV5A 4O32A 4KW6A 1TTZA 4J2FA 2MMOA 1I5GA 1MDIA 1MD4A 3P8WA 1Z5YE 1K3OA 2G0FA 1XBSA 1PSQA 3HD5A 4ZL7A 1ZZYA 3FK8A 1K0MA 1EOGA 3G7IA 2F8AA 3BJ5A 2YN1A 4MJEA 2B1LA 4OFNA 2I81A 3FZ5A 2CT6A 3KJYA 5C00A 4K7NA 3LWAA 3D0ZA 4WBJA 2DMLA 2BMXA 1XWCA 3KH7A 1Z7RA 1EGRA 1YKAA 4OCEA 4GQCA 3DYRA 3P7XA 4OFMA 3HA9A 2X99A 3EWLA 2LV3A 1O73A 1YY7A 3GSSA 3LQ7A 4TVEA 1WOUA 1MDKA 3KTBA 3UOMA 4IP6A 1THXA 2D2ZA 2WJUA 2KP1A 4GRFA 3ED3A 4Q5FA 1QFNA 2GSSA 1GLQA 1TRUA 1Z6NA 5AGYA 2HLSA 3F4SA 3GH9A 1U6TA 2YZUA 4OCFA 1A24A 1N8JA 2FGXA 1PL2A 1TJDA 2IWTA 2X8CA 1GULA 3GMFA 1S3DA 4PNFA 3C73A 1ZL9A 2AB6A 1M2BA 1HD2A 3IV4A 2VLVA 1VF3A 2C1YA 1S3AA 5KN0A 4G9HA 2HSHA 2B1KA 1ILOA 2OA7A 2KLXA 4WR5A 4HDEA 2G2QA 1O8WA 4DSSB 4IGJA 1V58A 5LNKe 1XWBA 1IYHA 1OYJA 5J9BA 5KN3A 2IPAA 5FT3A 3ZTLA 1RW1A 5B6MA 1T4ZA 3EU3A 2L4CA 2R6KA 2HYXA 3CRTA 4GF0A 5F05A 2C8UA 3LXZA 2IJYA 1OKDA 1F6MC 4HJMA 1W89A 1A8YA 1MEKA 1V40A 5CYYA 5DAKA 3V1WA 2K9FA 1F3AA 3F63A 2FWGA 3KCMA 4N0VA 4YH2A 4ECBA 2L5LA 5H5RA 3VWXA 1ZYEA 4E8HA 5CAXA 18GSA 1OC9B 3IDVA 4GXZA 2YJ7A 3MAKA 4KDXA 4N11A 4AJ8A 1FVKA 3IBHA 2GTUA 4ML1A 4ML6A 2CVBA 5F06A 3HZ4A 1IYIA 3GSTA 10GSA 3G7YA 3QPMA 4JZQA 5B6NA 2NPBA 1RQMA 4OO4A 2IFQB 4BVYA 2H72A 1O7UA 3DRNA 4CDOA 1KBNA 4MK3A 4XS4B 2WGRA 5ECIB 2NVLA 4D73B 2NBSA 2FA4A 3LORA 5DQSA 1UVZA 5IOXA 3VPTA 4ECIA 3EMPA 5CRDA 3APOA 4P3YB 3QAVA 3F4RA 3LFLA 5EVOA 1B9XC 1C72A 2GT6A 2H1BA 2AV4A 1OE8A 4EDZA 3RHBA 4DSRA 3M1GA 2YP6A 3C8EA 4IP1A 2O85A 3EVIA 1DBYA 2JZRA 2EIRA 2DJ1A 4GSNA 3TB2A 1EV9A 4L5LA 4JRRA 1HYUA 4WBRD 1X9SB 4PX1A 2F8FA 1PA3A 3EE2A 3C71A 5IOWA 2ZNMA 5IMCA 2VLTA 4KB3A 2N5BA 5G1LA 2N5AA 3FRCA 1TK8B 1SYXA 3LSZA 3CYNA 3GFKA 2IIYA 3AY8A 3D21A 3ZREA 5B7CA 2OKAA 12GSA 1YF1A 1E6BA 2H66A 3SBCA 3QCPA 1H75A 5C04A 4WF4A 2VL2A 3CTGA 2GSQA 5CNWA 4ZB9A 4K6XA 3UVHA 2K18A 3GTUA 3KEBA 3KM6A 4G10A 3SWLA 5DJLA 2VCVA 3FZAA 1FAAA 1X9MB 2F51A 3HYPA 3QFBC 1PGTA 1K0CA 1B4PA 1ERTA 2DC5A 4YAVA 1K0NA 3IK9A 3WYWA 1QK8A 3M8NA 4MDCA 1XWAA 1THOA 2P5RA 4HQSA 3S9FA 2X8HA 3TJBA 3UJ1A 3JCML 3GTUB 1EP7A 1YKCA 4ZB6A 1WE0A 5DCGA 1XVQA 2AUVA 1O6JA 2LEGA 3IK7A 1G7OA 2JU5A 6GSTA 4FYCA 2BJXA 2TRXA 1GSUA 1A0FA 2L59A 2XPDA 5EPFA 1B8XA 2DIYA 4K1FA 1FOVA 2GS3A 2H1GA 2VD0A 3KP8A 1JZDA 1TW9A 1Z3EA 2L4QA 4V1Ap 2MYGA 3D5JA 4EL1A 2YWNA 4PQIA 2DBCA 5LD0A 1MD3A 1OKTA 2FHEA 1YEXA 2M72A 1T7PB 4BVXA 3ZMKA 2ON7A 4ID0A 4HI7A 1PD21 5KN1A 2CV4A 2GZPA 2DJJA 2GSRA 4JR6A 1JHBA 4BWSA 2EC4A 3IAS2 4IN0A 1SL0B 3HHVA 2EIQA 4IS0A 5JCGA 2C0GA 1K0AA 3IAM2 3HKRA 1GL8A 5DBQA 2YV9A 1WMJA 3ZMLA 2WDUA 1VF2A 4KCEA 1SL1B 1ZMAA 3UARA 4MJBA 3FYGA 1GUMA 5ECNB 2R37A 1VGLA 5D73A 1EOHA 2YWIA 4HU7A 4MLYA 1GTAA 5HR3A 4HJ2A 1Z6MA 1TRVA 2CA8A 3PH9A 4TXOB 2M80A 1YZXA 5ELAA 1A0RP 1R5PA 1BG5A 1FVJA 4YQUA 4JU5A 4K7IA 14GSA 3GX8A 1N2AA 3L9VA 2GDRA 4H86A 3EURA 4EVMA 2WULA 2HZFA 2YNXA 2FWFA 2O7KA 1XOBA 3ZIJA 1Z7PA 2KHPA 1XW5A 2H1DA 5A4UA 2H71A 3GYKA 5HFIA 4DEJA 2A2SA 4NHWA 2HZEA 3QOUA 1AC1A 1NHYA 3TRPA 2VCZA 1R4WA 2HI7A 2VM2A 4NPBA 1PMTA 1VF4A 20GSA 2BTOT 1TK5B 4Q5QA 5GAPD 2EIOA 4IQAA 2XHFA 16GSA 3KXOA 1KEBA 3E0UA 4RQXA 1OC8A 4IQ1A 5CRWA 5JWQB 4MZWA 1YEPA 2KOKA 5A4VA 4NHZA 4EKZA 4EXJA 2FLSA 3DVWA 3U5RE 3QMXA 4MP4A 2J9HA 4EC0A 4K2DA 4WR4A 3L9UA 1Y6EA 1OVNA 3I69A 2MMNA 5GSTA 3CSIA 4KA0A 3MNGA 3H79A 4ZXGA 2IMFA 2E0QA 3F4TA 5HQPA 1T4YA 5D9WA 3LEFA 1BAYA 3N5OA 5J3RA 2FWEA 4KCAA 5F07A 4TR4A 2XC2A 4F2IA 4TXVA 3ZFBA 2FNOA 4KX4A 4PQHA 3F0IA 1ERWA 3K8NA 1DE1A 1M2DA 3UBKA 5DVBA 3TGZA 1QGVA 4V2LA 1GNEA 3H4KA 3J7Yk 2VL2C 3MSZA 1B48A 1ST9A 1QUWA 3DMLA 4Q5RA 3DD3A 2H6ZA 3W6GA 3Q6OA 3EC3A 4PUAA 4GSSA 3VI7A 1V9WA 5A5KA 1MTCA 2B5YA 3E9JB 4I2TA 3UVTA 3OR5A 1PQNA 1JZRA 3PR8A 3HDCA 2ON5A 3F6FA 5ECRB 2FA8A 2CAQA 1K3YA 3QAWA 3UAPA 4NAXA 4OFTA 4V1Ag 4MMMA 2LSTA 4BA7A 5H5QA 1R5AA 4L8EA 3ZITA 4PURA 2A4VA 2PBJA 3D6IA 4LMWA 4MA9A 2M46A 2JZSA 1G7EA 3A3TA 4KUNA 2RM5A 2AAWA 2H01A 3BOAA 1AUCA 2RUFA 2E2GA 4XS1A 4ECJA 2LJKA 2DIZA 2OE0A 2O87A 3FEUA 2N5FA 1T8EB 1TRSA 1JZWA 3RHCA 5G31A 4KNDA 3Q18A 4ZIJA 2OBIA 2VL3A 4N0ZA 2LRCA 2DLXA 2J23A 3GL5A 4DSQA 1A8LA 1TKDB 5IO2A 1SD9A 5HFKA 1A2LA 1HNCA 3GV1A 3TJKA 2FD3A 3TOUA 1XXUA 1FHEA 4MPFA 1O8XA 9GSSA 1J9BA 2F9SA 1B9YC 4POLA 2VIMA 5IMVA 2H0HA 3HVVA 2CX3A 1SU9A 3BCIA 1TP9A 4IJIA 1SK1A 4GTUA 2XPEA 4CHSA 4ISDA 2LTKA 2CQ9A 4RI6A 1NW2A 1CQHA 5IMFA 5J41A 2JSZA 3GN3A 3DXBA 2PMTA 3J7Yb 3PGTA 2B7KA 5JWOB 4G2EA 1M9AA 1JZOA 1PRXA 5ECQB 2GSTA 3VI5A 1GTBA 3CSHA 3DGQA 2L57A 4XCSA 3U6VA 5AN1A 3MDKA 1T00A 1BX9A 5DAKB 1EWXA 5B8BA 3TKSE 2DJ0A 3KH9A 3HXSA 1H4OA 3F8UA 4FO5A 1PN9A 1RK4A 3DVXA 2GZZA 4HZ4A 1SKWB 3IC4A 3A2VA 2B7JA 1FG4A 1BEDA 3FY7A 3M9JA 2L6CA 1A23A 5ABRA 4XRDA 1ZYQB 2H6XA 2H30A 4WETA 4HUAA 3WT1A 2IMKA 2VO4A 4ZBAA 3GKNA 3RBTA 1UN2A 4HS1A 4TR1A 2PWJA 5J4UA 1XCCA 2VUPA 4TW5A 3VLNA 5AIVA 4RQRA 5JWRB 4IVFA 1UA5A 2WZ9A 5KEJA 3LGCA 4TR0A 3PINA 2V2GA 3L9SA 2PUKC 4F0CA 2IMIA 2LJAA 3GKXA 4V2MA 2XBQA 4X43A 3I43A 3QDNA 1FO5A 1U3AA 1ZCPA 5ID2A 5DDLA 4LL1B 2RM6A 1A2JA 19GSA 4XHMA 2GT5A 3FHKA 2VCTA 5IO0A 5IQYA 2FWHA 1HNAA 2HFDA 1U3IA 3G7JA 4F82A 2TRCP 3WT2A 2P5QA 4GWRA 1UC7A 4OMVA 1GRXA 5G5EA 3FZ4A 6GSVA 1Y25A 4FH8A 1T3BA 1CQGA 4N30A 2B6MA 4MF6A 2MMZA 3LG6A 3VWVA 1AQXA 2B5XA 3TRQA 4MABA 3WGEA 4HEA2 1U87A 5EL8A 4HZ2A 3TRXA 3LXTA 2YPMA 4TR3A 1SK0A 3HY2A 6GSYA 2JL4A 5ENUA 2V6OA 1Q4JA 1YJ6A 3HJOA 4X0XA 4EO3A 2MMAA 1LBKA 3UIWA 1XW9A 3CMIA 2YWMA 3WGXA 2JACA 4AGSA 3Q74A 4EDYA 4GCIA 2B5EA 4DVCA 4POBA 1SJ6A 4EE0A 5LCZA 2LUSA 2B3SA 2R5GA 3EYTA 1WWJA 3A2XA 1AIUA 4HQZA 5COHA 5F0GA 1GSEA 3KD0A 1GSYA 3DKSA 1YQ1A 2H6YA 5FWGA 3KTLA 4KSOA 2OE1A 2WS2A 1GUHA 4N10A 2OADA 2VAFA 2PPTA 2C3TA 3GKKA 2OJLA 1K0BA 3TOTA 1JFUA 1OAZA 2HRFA 4ILFA 3VURA 3HJMA 3H93A 3ZZXA 1OC3A 2R4VA 2V6KA 1HQOA 3A2WA 1BQ7A 3M9KA 2PN8A 2K6VA 4O92A 1EZKA 4BWQA 4IHUA 3F9UA 2PU9C 1I9DA 4ZBBA 3M0FA 5JCUA 2YCDA 1YDKA 1AAZA 5AISA 2H74A 1SL2B 3ERFA 3H8QA 2CX4A 2LNSA 4RUVA 2VLUA 2WRTA 1TU7A 1QXHA 4ZB8A 1F3BA 2WCIA 1GSDA 2VOCA 2H1AA 5DALA 4XIHA 1E2YA 2H0GA 1K3LA 4L5OA 2CVKA 1QMVA 3GUSA 1T1VA 4BPYA 4I6XA 3P90A 3G9BA 2O89A 4HOJA 3ERWA 4XRAA 3TJJA 4QQ7A 4V2NA 2C4JA 3A5WA 3O76A 2C0DA 5D9TA 1VRSD 1Q98A 4TRXA 2AHEA 5FHIA 2YOIA 1GTIA 1K0DA 1GSFA 4KDUA 2VCXA 4NMUA 3ERGA 4O5RA 3NIVA 3GIXA 4K7OA 4KH7A 5ECMB 5G30A 4ZL8A 1ML6A 4ACSA 1LU4A 1MDJA 1LJRA 3LJRA 1Z9HA 3QAGA 5KN2A 3CTFA 1WJKA 1XFLA 2LKUA 1V98A 2LJRA 5D8IA 4RI7A 1AQVA 2H0IA 5A4WA 6GSSA 5DJMA 2C80A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite