1AAZA

The structure of oxidized bacteriophage t4 glutaredoxin (thioredoxin)
Total Genus 19
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
19
sequence length
87
structure length
87
Chain Sequence
MFKVYGYDSNIHKCVYCDNAKRLLTVKKQPFEFINIMPEKGVFDDEKIAELLTKLGRDTQIGLTMPQVFAPDGSHIGGFDQLREYFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of oxidized bacteriophage T4 glutaredoxin (thioredoxin). Refinement of native and mutant proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAREDOXIN
molecule tags Electron transport
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 19
structure length 87
sequence length 87
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 1992-04-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1aazA00
4V2MA 2GLRA 1UA5A 3D21A 2WDUA 2K18A 2NBSA 2DIYA 4K0NA 3QAGA 1EOHA 2L4CA 2XBQA 1SD8A 3HA9A 3CSJA 2H73A 2GGTA 4OFNA 5IMAA 2L5OA 1O7UA 3V1WA 3UVTA 4BPYA 1XVWA 5AISA 1GTBA 2GSSA 2VM1A 5GSTA 3GKMA 4GWRA 3DRNA 4H86A 3ZITA 4IP1A 3U6VA 4IKHA 22GSA 2L5LA 2X8HA 4AGSA 1T4ZA 3W8SA 1GTAA 3FEUA 3GSSA 3CMIA 2R3XA 1YQ1A 1EEJA 5IO0A 2H1BA 2D2ZA 2YNXA 3HYPA 4ZL8A 3KXOA 1FAAA 1FHEA 1USBA 1X0RA 3ZFLA 4WR4A 3TJFA 2X8CA 4PQIA 3LG6A 4WEYA 2X99A 1TOFA 1GNEA 4K7OA 3F8UA 2NVLA 2XHFA 4G9HA 4YQVA 4ZBAA 4ISDA 1M2DA 3A2VA 4ML1A 1M2BA 1OAZA 3MWHA 3TJBA 4X1UA 3QAVA 3US3A 2V2GA 5ECKB 3ZRDA 5AIVA 3A3TA 1SL1B 5AN1A 4DSSA 5D93A 3P2AA 3HD5A 1XVQA 4P3YB 3WYWA 3FZ5A 2VIMA 4GQFA 1RK4A 3L9UA 3VURA 3HCZA 3DVXA 1XW9A 1R26A 5J4UA 1SENA 2IWTA 2LEGA 2V6KA 5ECHB 3MDKA 1Z7PA 3F63A 3CSIA 4MMMA 4KUNA 2KLXA 4GXZA 3FKFA 1RQMA 4G2EA 1V57A 3KMOA 2WFCA 6GSWA 1EV9A 5B7CA 3EMPA 5CNWA 1J9BA 3VLNA 3CXGA 3QOUA 3UJ1A 5B6NA 2CAQA 4MABA 4RI6A 2PPTA 4JR4A 2HNLA 4XS6A 4D73B 5IOXA 2YANA 5DJMA 3W6GA 4HUAA 2VLTA 3EURA 3GX8A 5IMZA 4DSQA 1SYRA 3LYKA 7GSSA 3QFBC 4EVMA 1HQOA 2FLSA 2PN8A 1E2YA 4FYCA 3GMFA 5CREA 4TW5A 1ERTA 5DDLA 1JZWA 2B7JA 1YEPA 3CTGA 4HU9A 2CX4A 2RM6A 5DQSA 3F4TA 3QCPA 5B6MA 2AHEA 2RLIA 4IHUA 2MBTA 1O8WA 12GSA 1PX6A 2OACA 2V6OA 4NMUA 1I5GA 2YV7A 4GQCA 3HKRA 2VM2A 4TKYA 1MTCA 4N10A 2G0FA 3DIEA 2NDOA 2PWJA 5G2ZA 3DD3A 1SL0B 1BX9A 2E2GA 4IS0A 2L4QA 2WCIA 2VUPA 3KMNA 1Z9HA 2LJAA 1G6WA 4K2DA 4ACSA 1U87A 4IGJA 1YZXA 3NOFA 3CBUA 4I5QA 3BBYA 2KUCA 3TUEA 4DSSB 3KZQA 1EEMA 2PERA 4J56E 3HVVA 1KBNA 3TKRA 1R5AA 3FW2A 2H70A 1FB0A 4JBBA 4WETA 1M2AA 5ECMB 5G1LA 1EWXA 1AC1A 16GSA 1XWKA 3R2QA 2VOCA 3QD9A 3HHVA 1TRSA 1Z5YE 3ZZXA 4MF7A 5J3RA 2B1KA 3C71A 1WE0A 4F82A 3EWLA 4GSNA 1OVNA 2FCHA 5D73A 2VCWA 2H0HA 4PX1A 2AYTA 1SK2A 4AJ7A 3J7Yk 4K9ZA 2HT9A 4HQZA 2FGXA 1X5DA 2H6ZA 2M72A 3RHCA 1Q4JA 2OADA 2ES7A 3Q74A 1YF0A 4QL9A 4MPGA 3APQA 1GP1A 3UAPA 1PSQA 1K0DA 2RM5A 2GTUA 1Z3EA 2VLUA 5F07A 4ZB9A 4KE3A 4OCFA 1FB6A 2YV9A 1DBYA 4WKWA 1T3BA 4MF6A 3DKSA 3QMXA 3DEXA 3TB2A 5EVOA 4TOPA 3F0IA 6GSUA 2JZRA 1LJRA 2ON7A 2H75A 3W8JA 3G7YA 5EPFA 2C0FA 1GTUA 3FY7A 2E2MA 3UVHA 2H0GA 1T4YA 1YKAA 3GL3A 2V32A 4OD7A 4BVXA 3U5RE 2B3SA 2HZFA 5D9WA 4ZBBA 4YQUA 5IPGA 4BWSA 1TRUA 3TRPA 2IL3A 4CDOA 3ZREA 1TRVA 5ECPB 3IA1A 2DSAA 2CX3A 5D9XA 1M0UA 3LFLA 17GSA 5IQYA 4JU5A 2LNSA 3D6IA 5LD0A 1GLQA 5F0GA 4IP6A 3IDVA 3GRXA 3MAKA 4FYBA 2H01A 1EP7A 3M8NA 3LJRA 3E0UA 4EC0A 1HNAA 5IOWA 5ECNB 2IMIA 4ZXGA 2LS5A 4EXJA 4V1Ap 1ERWA 2TIRA 1GWCA 4HS1A 3RHBA 3WD6A 4GF0A 1NHYA 5F8BA 4POLA 2J9HA 4KDXA 2H74A 2OE0A 2VAFA 3NIVA 2K8SA 2O7KA 5FHIA 1TTZA 1VGLA 2A2RA 2DBCA 1GRXA 1OKDA 1QXHA 2WULA 2HSHA 2CV4A 1TXXA 3N9JA 4TXVA 3KEBA 3F6DA 2QKEA 3OR5A 1WMJA 3PR8A 1TRWA 1MDJA 4YH2A 4IJ3A 2M80A 4Q5NA 1GLPA 1SD9A 2V1MA 5DAKA 4L5OA 1ERUA 2C0GA 5HFKA 3UBKA 5CRWA 1XW6A 3GN3A 4EL1A 3EYTA 4WXTA 1K0AA 4L5LA 3GUSA 4MLYA 1K0OA 2VCZA 3M3MA 4QL7A 3K8NA 3HJPA 1F3BA 2LJRA 1VRSD 5FT3A 4AJ6A 3H79A 2VLVA 4KX4A 3TRQA 1TJDA 2YZHA 4V2NA 3HJMA 1GTIA 4WBJA 4GLTA 1GULA 2MMAA 1FW1A 4MH2A 2HFDA 2CT6A 5CRGA 3D5JA 3IAS2 3ED3A 1TU8A 1T00A 4LA1A 3UIWA 6GSSA 5JWQB 2IMDA 1Z6NA 2AUVA 2VL3A 5H5RA 4O32A 5CRHA 1V9WA 4XS1A 5ELGA 4WR5A 1ZYQB 4FO5A 2CVBA 1ST9A 3IE3A 1TI3A 2H0IA 4KSOA 3IBHA 4TN8A 2PVQA 19GSA 3UEMA 4K7IA 4WBRD 2H1GA 3KD0A 4ECCA 4Q5RA 1ZYEA 5E4WA 5IMDA 1FOVA 1GSYA 1K3OA 3IXRA 2PMTA 4PUFC 2M46A 3ISOA 3A2XA 1XPVA 3VI7A 4LMWA 3TKSA 2VO4A 4IELA 4OFMA 2FA4A 1J0FA 1AQWA 2L59A 3E3EA 2GT6A 3VPQA 2DJ2A 2H72A 3WGXA 2GQMA 2JACA 4OO4A 4F03A 1G6YA 3L9VA 5LCZA 1A2MA 3QPMA 1TP9A 2GSTA 2AB6A 4RUVA 1LU4A 2QC7A 3GFKA 2CVDA 4KNDA 1JZRA 1CQHA 4JE1A 2LUSA 2XPDA 2H71A 2GSRA 5F06A 2BMXA 5G31A 1OC3A 4J2FA 3HVXA 1T7PB 4HZ2A 1K3LA 3GNJA 4HJ2A 4E8EA 2VL2C 5IMVA 4EF0A 1QGVA 3FZ4A 5DAKB 4PQ1A 5J5NA 3L4NA 3C1SA 4F0BA 4TR4A 1JZDA 3VK9A 3IC4A 1M99A 2JSZA 2ZCTA 1RW1A 1VF1A 1S3AA 3F3QA 2OE1A 4AJ8A 3Q18A 4KH7A 3KJYA 3FZAA 1UC7A 3MNGA 5KN1A 3KTBA 5JWOB 3ZIJA 1K0MA 3DMLA 1BJXA 1GSFA 4ML6A 3JCML 3TKPA 2YZUA 4MJCA 4RQXA 3AY8A 3IHQA 3TKSE 3KH9A 4G19A 5GZZB 4ECIA 2HRFA 1QQ2A 2FHEA 3LEFA 5ECLB 4HDEA 1XWGA 2B5XA 4F0CA 4ZIJA 1QK8A 2C80A 3H93A 4OWYA 4XRAA 2JSYA 2BJXA 5IPHA 4OMVA 3LWAA 1PRXA 1M7TA 3GYKA 3I9V2 2YJ7A 5KN3A 4I97A 2GSQA 2F51A 4TRXA 3APOA 4TXOA 2FWEA 1IYIA 2CZ3A 1U88A 1J08A 2TRXA 1G7EA 1B8XA 5LNKe 2CA8A 2A4VA 1XOAA 4O92A 1PL1A 3FHKA 5J41A 4ZB8A 1G0TA 5ECRB 1KNGA 1TK8B 5HFGA 1YKCA 5IM9A 3TGZA 10GSA 1WRYA 3LORA 3D4TA 3PINA 4ILFA 2GQKA 3HY2A 2IPAA 2IFQA 1SU9A 3UMAA 3O6TA 4PNFA 4DVCA 1JZOA 3WGDA 2REMA 1A23A 2X8GA 3UARA 3HDCA 2R37A 1B48A 2QGVA 3QR6A 4I8BA 1V2AA 1DE1A 2C0DA 3A2WA 3C7MA 1XCCA 3S9FA 3ERWA 1F3AA 1AQXA 1A8YA 1T1VA 4HOJA 1TU7A 2N5AA 2H6YA 1XWBA 3EC3A 4OCEA 2RUEA 4HJMA 2I1UA 2JU5A 1G7OA 2VCVA 3GHAA 3KIJA 3RAZA 5HR1A 2KP1A 3BJ5A 1ZZYA 2OA7A 1XWCA 4EDYA 1HYUA 2IN3A 2B5EA 1VF2A 3ZMKA 2HLSA 2DJKA 4ECBA 3I43A 5A5KA 1DSBA 2MMNA 4ID0A 1ZMAA 3BD2A 3I69A 6GSXA 2E7PA 4XTSA 3E9JB 3N5OA 4FYUA 1S3DA 1EP8A 4JEDA 4POKA 1TK0B 2OKAA 1EZKA 5A4VA 2NPBA 2DC5A 2O89A 3CRUA 3TKQA 4NV2A 5HFIA 2CVKA 1SL2B 1A0RP 2DJ1A 2OJLA 4TXOB 1HD2A 3C1RA 3DYRA 5IIZA 3CSHA 5HQPA 5DCGA 3ZIVA 4X0XA 3UBLA 1X5CA 4KCEA 3BOAA 1LBKA 3BCIA 2PVOC 2H76A 1XBSA 1EGOA 4N30A 1X9WB 1AW9A 1HNBA 4V2LA 3TJKA 3TRXA 1TDIA 3GKKA 3H1NA 2Z9SA 1YDKA 3C73A 4NV5A 1H4OA 5IMFA 2IFQB 3EE2A 2O87A 3UOMA 2GZYA 1PGTA 2CAIA 1WP0A 2PUKC 1Z7RA 3D22A 1OC8A 1OC9B 3C8EA 5H5SA 3WGEA 4EO3A 2MZCA 2R5GA 2O85A 3WT1A 3H8QA 2F8FA 2K6VA 3EU3A 4ZB6A 1WOUA 1I9DA 2ZUPA 3DWVA 2PBJA 4ZILA 3ZFBA 4XRDA 4K8MA 1IYHA 3M9KA 1XFLA 1GL8A 2LRCA 3D0ZA 2GZZA 1EGRA 2FWFA 1SKWB 4OFTA 4MZWA 3TJJA 4L0WA 2QSIA 3M0FA 1B9XC 3GV1A 2H19A 3ZVJA 4K0GA 2ALBA 4GSSA 1R4WA 2EIQA 1WWJA 3VWXA 1UVZA 2C1YA 2P5RA 1Z6MA 3GSTA 1AAZA 4AF2A 1S3CA 2I81A 2EIOA 1OKTA 3O76A 4KAEA 1SJZA 3F6FA 3GX0A 3DVWA 5C04A 2F9SA 2LRNA 1SKRB 1PL2A 3I6AA 4KDUA 8GSSA 2C3QA 3IK7A 2YN1A 4MPFA 4HU7A 1K0NA 2OE3A 3BCKA 2YWIA 4HQSA 2YPMA 2P0GA 3DGQA 4DEJA 1BEDA 2XC2A 2GDRA 3GKXA 1YY7A 3TOUA 2HSYA 4HI7A 1C72A 2C8UA 4O5RA 1K0BA 3GA4A 1JFUA 3ZYWA 2LRTA 1KEBA 1N2AA 3G7JA 3ERGA 1VF3A 1ILOA 1SJIA 2DJ0A 2RUFA 1MD3A 5GAND 3CYNA 3GIXA 1W4VA 5GAPD 3VPTA 3TCOA 3GKNA 4HEA2 3J7Yb 1JHBA 11GSA 2LV3A 2B1LA 1ML6A 1NM3A 3FR9A 3QFAC 4CW9A 1PX7A 3GH9A 2H6XA 1U3AA 3ERFA 3VI5A 3TKSC 2L6DA 5E59A 3IV4A 1GSSA 5KEJA 3LYPA 2H66A 3TDGA 3RPNA 4ULXA 4V1Ag 1EV4A 2IMKA 2X64A 2IJYA 3G9BA 2AJQB 2H1DA 2A2SA 2KOKA 4Q5QA 3DXBA 1YJ6A 1NSWA 3IRAA 2DIZA 2FWGA 1WIKA 4NWYA 5J9BA 2YCDA 2JL4A 3M1GA 5IMCA 2LJKA 1O8XA 4PUAA 4PQHA 4L0UA 3ME7A 4KW6A 4EUYA 4YQMA 1O6JA 4TR1A 2DMLA 5IO2A 2C3TA 2XPEA 5D96A 5DBQA 2DMMA 4JR6A 4YAPA 1EOGA 13GSA 3MSZA 5H5QA 2HXKA 2HRNA 1A2JA 4LLRA 1Q98A 4MA9A 4N11A 2BTOT 1BQ7A 4MJEA 1O73A 5INYA 4ZBDA 5AGYA 6GSYA 5DALB 3Q19A 4RI7A 4WF4A 2MMOA 18GSA 2HZEB 4L8EA 9GSSA 3G7IA 1H75A 1GH2A 1X9SB 4EKZA 4POBA 1F6MC 2AV4A 2I9HA 2VCTA 3KH7A 3QAWA 3SBCA 4EE0A 2VL2A 4PXOA 2L57A 2R4VA 5G5FA 2CQ9A 5ECSA 1UN2A 1FVKA 1THOA 3F3RA 2F8AA 4TVEA 4Z7XA 14GSA 1AQVA 2G2QA 2R2JA 3VFIA 1SK1A 4MP4A 3ME8A 2ON5A 2YWNA 2O8VB 3SWLA 4MJAA 3NZNA 2HYXA 3HZ8A 1WPIA 1XIYA 4N0VA 2MMZA 1MDIA 1PD21 1X9MB 3F4RA 5GSSA 1VF4A 2MBSA 2TRCP 2YJHA 5D9VA 1XWAA 3KM6A 5HR3A 3IR4A 3O3TA 4GSTA 1B4QA 3P8WA 1HNCA 1FO5A 1TKDB 5JCUA 4I6XA 4CHSA 5B8AA 3GTUA 5DJLA 2JZSA 2PU9C 2I4AA 2KHPA 2LKUA 4QQ7A 5ABRA 1BYEA 1JLWA 2P31A 4KA0A 2IMFA 4GCIA 1GUKA 6GSTA 3PGTA 2K8VA 2R6KA 1GSUA 1W89A 4KCAA 2L6CA 1PQNA 1GUHA 1A8LA 5C00A 4O7HA 5AIXA 5ID2A 2VD0A 2VD1A 2HI7A 1K3YA 2FD3A 3IPZA 3TOTA 3VWVA 3IK9A 2DLXA 4XS4A 3HXSA 2P5QA 4TR1B 4N0ZA 1GSEA 3GH6A 5KN2A 3ZL5A 1MD4A 5FWGA 2WZ9A 3PH9A 3ZLPA 1DUGA 1OC9A 1OE8A 1E6BA 4IQAA 3P90A 5CRDA 3CRTA 4JZQA 4LL1B 5D8IA 2YOIA 4KDYA 3KTLA 1CQGA 5HR0A 1R7HA 2IMEA 3GURA 2GT5A 1B4PA 3FR3A 2GVPA 5B8BA 3FK8A 1YF1A 3HJOA 1TI1A 2LTKA 5ECOB 2C3NA 1BG5A 1R5PA 1F9MA 4F2IA 1KTEA 5HR2A 4I2TA 2FNOA 4IJIA 2DJJA 4IW9A 3TJGA 4KSMA 2H1AA 1AIUA 4K6XA 1ZL9A 4DSRA 1DE2A 3L78A 1U3IA 4MZCA 2LSTA 2CZ2A 1PKZA 2VL9A 4MZBA 1GUMA 2FWHA 5DCHA 4RQRA 5CO3A 2OBIA 3CTFA 4J57E 4NHZA 2KP2A 4NPBA 3LQ7A 1T8EB 2PGTA 2B5YA 5G30A 5J9CA 3LSZA 5ELAA 3RPPA 4IN0A 3VWUA 5A4WA 1AXDA 3P7XA 4FIWA 1ACVA 3Q6OA 2N5FA 2VCQA 2EC4A 4IBPA 1ZGNA 1TW9A 4POMA 2LNTA 5DVBA 1Y6EA 4EDZA 4MK3A 2MYGA 4K1FA 2FA8A 1XZOA 4NHWA 1THXA 1F2EA 3GTUB 4Q5FA 3EMXA 1X5EA 3LGCA 3L0HA 1ZCPA 1QFNA 5KN0A 1PMTA 1MEKA 1M9BA 2H8LA 3GL5A 5EY6A 3FRCA 2V41A 1SK0A 4BA7A 1O85A 5CAXA 3F9UA 4TR3A 5ID2B 2NTOA 3QDNA 3HVSA 3RDWA 2F3MA 1FVJA 3APSA 1SKSB 2JADA 4XS4B 2GZPA 3IOSA 4K7NA 3ZMLA 1MDKA 1WJKA 1GSDA 4ZL7A 5CYYA 1SYXA 4IQ1A 1V98A 3FZ9A 2N5BA 5D9TA 2WRTA 1ERVA 1OE7A 1PKWA 2YWMA 4GTUA 3KGKA 3M9JA 5ECQB 1YEXA 2WS2A 2XBIA 3ZTLA 5G1KA 1SJ6A 4FH8A 3L9SA 2C4JA 3WT2A 4PGTA 4I2UA 2RIIA 2LQQA 2B6MA 5COHA 3F4SA 2YWOA 3FR6A 5F05A 1Y25A 5EL8A 5A4UA 4MJBA 1URMA 1GNWA 2IIYA 3ZVJD 4MF5A 4MH3A 4BL7A 2VCXA 4PURA 5JWRB 3EU4A 1O81A 4NXIA 1N8JA 3KP9A 4TR0A 3FYGA 3KCMA 3KP8A 2JZTA 20GSA 1U6TA 4MCUA 5ECIB 1ZOFA 3EINA 1JLVA 4X43A 3VWWA 3HZ4A 2E0QA 4LMVA 4BVYA 4PNGA 4LL4B 4E8HA 1TK5B 1GSQA 2YP6A 1OYJA 2AAWA 2WGRA 5DALA 5JCGA 4ECJA 1M9AA 1A2LA 2HZEA 4IVFA 2DJ3A 4G10A 4NAXA 1A24A 3IAM2 5JCWA 3D4MA 2FUG2 4GRFA 4OO5A 2GS3A 1PA3A 4JRRA 1ON4A 2HE3A 1BAYA 3A5WA 1V58A 4XCSA 2FY6A 5G5EA 1NHOA 2LQOA 2GQLA 4BWQA 4KGIA 1QMVA 2K9FA 1AUCA 4WF5A 1K0CA 3UL3A 4MDCA 1PN9A 2H30A 3H4KA 2C0EA 3RBTA 2J23A 5DQYA 2B7KA 6GSVA 2I3YA 1XOBA 4KB3A 1XXUA 3EVIA 4XIHA 2ZNMA 5CP1A 4HZ4A 5ENUA 1NW2A 3LXZA 1B9YC 1XW5A 1V40A 1A0FA 2WB9A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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