1AIUA

Human thioredoxin (d60n mutant, reduced form)
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPCKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVNDCQDVASECEVKCMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Human thioredoxin homodimers: regulation by pH, role of aspartate 60, and crystal structure of the aspartate 60 --> asparagine mutant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Electron transport
source organism Homo sapiens
molecule keywords THIOREDOXIN
total genus 34
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-04-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1aiuA00
2K18A 1MD4A 4G9HA 1EGRA 5D9XA 2C3TA 2V1MA 4GQCA 5IMAA 3GIXA 1J0FA 3H8QA 4PQ1A 4F9ZA 3VPQA 4KSMA 4LLRA 4IJ3A 3GKXA 5DCGA 4IELA 1VF3A 10GSA 3A2XA 1DUGA 4BWSA 4POLA 3WGEA 1M2BA 4L0UA 1CQHA 5ECQB 4HQZA 3KTBA 4ACSA 4TVEA 3DVXA 1LBKA 4KB3A 2OE3A 1VGLA 4TN8A 2FCHA 1OAZA 1TTZA 4MH3A 1E2YA 3UEMA 2C4JA 2WRTA 2ZCTA 2LJAA 2ZNMA 3Q74A 5G5FA 4ML6A 2CQ9A 2E7PA 3TDGA 1XOAA 1RQMA 4K6XA 4TR3A 4YAVA 1XW5A 4KAEA 4JR4A 2PGTA 2XPDA 2VIMA 2HSHA 5H5SA 2B6MA 2HYXA 12GSA 2J23A 3CXGA 1WP0A 1GWCA 2RUFA 5CAXA 3QCPA 4K2DA 3TJKA 2HI7A 3LYPA 3ZVJD 3LJRA 1GH2A 2ZUPA 5IMFA 3LWAA 1QGVA 2JSYA 4KCEA 1Z7RA 4JR6A 5J5NA 4DEJA 3ZFLA 4LMVA 1TJDA 3EWLA 3I6AA 2GLRA 5H5QA 4V2NA 1OC8A 4MF5A 2DBCA 4FH8A 2O85A 1EOGA 4IGJA 3ZMKA 5IPHA 4HJ2A 4V2MA 5JCGA 1K3YA 4YAPA 2DIYA 5EL8A 1SKRB 4MZWA 1FOVA 2C3QA 2VL3A 2L5OA 3TKPA 3PINA 2IPAA 3UBKA 3IBHA 1PL1A 1TRUA 2LRTA 4O5RA 3IR4A 2QSIA 1YF0A 2I1UA 5IMZA 3EVIA 4XS4A 3F6FA 5KN2A 2LRCA 1G7OA 4HOJA 5ECIB 7GSSA 3FR3A 3QPMA 2NPBA 2GVPA 4FIWA 3FR6A 5DQSA 2H1DA 4I2UA 1G6WA 6GSSA 2PWJA 5ID2A 5GAPD 2PPTA 4DSRA 2HZFA 1PKZA 5AGYA 3ZTLA 1OKDA 1V40A 1M0UA 1Z9HA 3GKNA 4G19A 2GTUA 3FR9A 5J9BA 4V1Ag 3FKFA 4F82A 3LORA 1TU7A 1A2MA 3UJ1A 1KEBA 3APSA 2MMNA 1G7EA 3QD9A 4XS4B 5G1LA 3ZIVA 1ABAA 5J3RA 3KJYA 2VL2C 3F0IA 4K9ZA 4JU5A 1XW9A 2ON7A 4NV2A 2FWFA 2C1YA 2CAQA 2WB9A 2NBSA 3ME7A 4WF4A 3GSSA 3CSIA 1DE2A 1XPVA 2K9FA 1A8YA 4ZBBA 1GUKA 4WR4A 2H70A 4X43A 18GSA 3ERWA 4WETA 4TXVA 2DMLA 1TI1A 5J9CA 3F3RA 1SK1A 1GTBA 3BOAA 3EURA 3N9JA 4IS0A 2XPEA 2O89A 2LS5A 1OC9A 1XVQA 1VRSD 3EYTA 2LJKA 1HD2A 5CP1A 2A2RA 1A2JA 4BWQA 1MDJA 4KGIA 4FO5A 1UN2A 1BQ7A 1XXUA 2H76A 1T4YA 2JSZA 3DXBA 4KA0A 2H1BA 2GDRA 3TRPA 3FRCA 3LG6A 1ZCPA 4LL4B 1UA5A 1FB0A 4EL1A 2WJUA 1GSYA 1M9AA 5IMCA 3TRXA 3TOUA 1YEPA 4KW6A 5DJMA 3BD2A 4CW9A 5IIZA 4D73A 3IRAA 2CAIA 4WKWA 2VCVA 5CYYA 4E8HA 1Z5YE 5ENUA 2AB6A 1BEDA 4BL7A 1T8EB 3ZREA 3UOMA 3TGZA 4TOPA 5JWQB 3TKSC 2H71A 3AY8A 3IDVA 3WD6A 4OWYA 3APQA 4PXOA 2L59A 2XC2A 2OJLA 3F63A 1NM3A 1FW1A 2YWNA 5JWRB 2FA8A 2PERA 3OR5A 4ZBDA 5CNWA 5HR3A 1GTUA 2L6DA 4D73B 2FD3A 4K7IA 5A4WA 4WBJA 2V2GA 3CSHA 1HNAA 4N11A 2M46A 3DWVA 2AJQB 4RI7A 4TW5A 3LYKA 4Q5NA 5IMVA 2H73A 2LTKA 3L4NA 4AJ7A 1YKAA 1J9BA 1NHYA 4F03A 2EC4A 4KH7A 1ZZYA 1T7PB 3EC3A 2N5AA 1OVNA 2KP2A 4TR4A 3HCZA 4ZL9A 2DJ3A 3GL3A 3I9V2 2D2ZA 1Q98A 2LJRA 1AAZA 1RW1A 1J08A 3MNGA 2K8VA 3EE2A 3PH9A 1AC1A 1PSQA 4N30A 3ZIJA 2QKEA 1GTAA 3GKKA 1GLQA 3VWXA 3TKRA 4XRDA 3FK8A 1ZGNA 2VAFA 1GUHA 1U3AA 1VF2A 4XIHA 3BJ5A 1EOHA 22GSA 1FB6A 5B8BA 5DALB 1SD9A 1TP9A 1ZYQB 3Q19A 4L5LA 1B4QA 4PQHA 1N2AA 1X9MB 1TU8A 20GSA 4E8EA 1O81A 1O6JA 2LSTA 3RPNA 3BCIA 1F6MC 2YJ7A 3U5RE 1MEKA 2JZRA 3VWUA 3D21A 2VCTA 1O8XA 1WJKA 5A4VA 1K0BA 2IMDA 11GSA 4TKYA 3HDCA 2HXKA 4GSTA 1WPIA 2YOIA 2VLTA 3G7IA 4PQIA 3M0FA 3QFBC 3M9JA 4TR1B 4XS6A 3IA1A 1DBYA 3C73A 4MA9A 2IN3A 4XTSA 4N0ZA 2VD0A 4WR5A 1GNWA 4MDCA 5AIXA 2HNLA 2LRNA 3PR8A 3D0ZA 4YH2A 1X5CA 4WXTA 5ECRB 2B7JA 1M2AA 3VWWA 5JCUA 14GSA 1BYEA 3IAM2 3H4KA 4KDYA 1VF4A 1X0RA 1BAYA 2JACA 4DSSA 2FWEA 1U3IA 2H01A 2B5XA 1K0NA 3TJFA 3P7XA 1LU4A 5H5RA 5F07A 3GKMA 5A5KA 4F2IA 1PGTA 1BJXA 4K0NA 2YPMA 3KMOA 3N5OA 2H6ZA 5ECPB 5ECLB 4ZXGA 16GSA 4I8BA 3C8EA 4GLTA 3KP8A 1TRSA 1Z6MA 3PGTA 2J9HA 3M8NA 3J7Yb 1GSEA 4PUFC 5ELGA 3IHQA 4DSSB 2PVQA 1Z6NA 4MJAA 3HJPA 4IHUA 1QMVA 1F3AA 1JFUA 1TK5B 1E6BA 3TJBA 3L9UA 3KZQA 2YZUA 1PX7A 1XWCA 3Q18A 4MJCA 4MPFA 4Q5RA 4ZL8A 2PN8A 3GRXA 3HYPA 4HI7A 2E0QA 4J57E 1JLVA 4JEDA 2AAWA 1B8XA 4Q5FA 4EDZA 3IK9A 2KOKA 3M3MA 4XHMA 4WBRD 5D8IA 2VD1A 2B3SA 4ECJA 1QQ2A 1EP7A 2GT6A 4G2EA 1YDKA 1TK8B 4NHZA 1FG4A 3IV4A 3W6GA 3GN3A 3FZ9A 2WFCA 4PX1A 1ZOFA 2JADA 6GSYA 3E3EA 3P8WA 1PRXA 1ST9A 3HY2A 2PU9C 3M1GA 5J41A 4FYCA 4K7OA 1F9MA 1RK4A 2DJ2A 4OFTA 2DIZA 5DQYA 1SJ6A 1I5GA 2FUG2 1V98A 4IVFA 4AJ8A 3HJMA 3APOA 4KNDA 5ECMB 2B7KA 4OO5A 3GUSA 3DEXA 3VURA 3E9JB 1V2AA 3F6DA 1YF1A 5EVOA 1T00A 2ES7A 4DSQA 1IYIA 2V6KA 4EXJA 4TR0A 3IAS2 2CX4A 4OFMA 1A8LA 4ZB9A 1SL1B 1XVWA 4MP4A 1XWAA 4GSNA 3QR6A 4OCEA 4GWRA 2GQLA 5CRHA 1S3AA 3US3A 3CBUA 3CYNA 1JLWA 1OYJA 17GSA 1SD8A 5D93A 3D5JA 3RPPA 3GHAA 4GTUA 3LXZA 3GX8A 1SK2A 4ILFA 5ECSA 1HQOA 1O73A 2O8VB 1AUCA 4HS1A 3SBCA 4MJBA 4IJIA 3C1RA 3H79A 4GSSA 3GFKA 8GSSA 3KMNA 2YWIA 4FYBA 4TXOA 2VCQA 2GT5A 2H66A 1KNGA 2X8CA 3FZAA 1XZOA 1PD21 3EINA 4NV5A 1IYHA 4IN0A 1M9BA 4JBBA 2L57A 1ERWA 5B7CA 1OC3A 2KHPA 1EEMA 4F0CA 3K8NA 4J56E 2ALBA 5ID2B 2L4QA 3F4TA 2WS2A 3Q6OA 1AQWA 1Z3EA 1YQ1A 2OBIA 5DAKA 1GSFA 4TXOB 5CRWA 1SJIA 1GSSA 1M7TA 2EIRA 1K3LA 3CTFA 4YQMA 4POMA 3O3TA 2E2GA 4MK3A 4K7NA 4X1UA 3LFLA 4RQXA 1GL8A 2QGVA 5KN3A 2PUKC 4POKA 1GRXA 3TUEA 1GSUA 3KM6A 2VCWA 1MDKA 3ZRDA 2REMA 1OKTA 1X5EA 2FA4A 3KXOA 3D22A 5DAKB 2HLSA 1ERVA 3RHCA 2H8LA 1ILOA 4LL1B 3GH9A 2GZYA 4IQ1A 4MF6A 4MH2A 1FAAA 2B1KA 2RUEA 1G6YA 1WWJA 4HEA2 3C71A 3IE3A 2P31A 4IW9A 2GQKA 2HT9A 4JRRA 1OC9B 1HNCA 3ZVJA 3IK7A 4PURA 3VI7A 4EUYA 3MAKA 5DBQA 5B6NA 5KEJA 4ZB6A 3ZITA 2YWOA 4L8EA 4QQ7A 2WZ9A 3CTGA 1X9WB 1SL0B 1PA3A 2GSRA 3QMXA 4DVCA 2C3NA 5G30A 2P5QA 4XRAA 3MWHA 6GSWA 1QFNA 3VK9A 2HZEA 4ECBA 2F51A 3LQ7A 1M2DA 3GTUA 4I6XA 2GZZA 2H75A 2VL2A 4LMWA 3HHVA 2VO4A 3ZLPA 4OCFA 13GSA 2LUSA 2I9HA 19GSA 2KP1A 4OO4A 4EKZA 3RBTA 1QK8A 1R5PA 9GSSA 1PQNA 2DJJA 3DD3A 3KIJA 1T4ZA 3GYKA 2XHFA 3TKSE 2V32A 3I43A 3EU3A 2IMKA 2C0DA 4KCAA 1NW2A 2VM1A 2IFQA 1GULA 2YANA 1PMTA 3GTUB 4L0WA 5D73A 3HD5A 6GSTA 5G31A 2HE3A 5AN1A 2AUVA 2H72A 2GQMA 1WE0A 1YY7A 3FZ5A 1HYUA 4GXZA 1XWKA 2LKUA 5IO0A 5LD0A 4HQSA 3G7JA 4MZBA 3A3TA 1FVJA 2HRNA 4KE3A 4MPGA 4MJEA 1B9XC 3FZ4A 4HU7A 4HUAA 4OD7A 2VLVA 5E4WA 2FNOA 2IFQB 2K8SA 5IQYA 3H1NA 1XFLA 2VL9A 2BJXA 2IMFA 4RQRA 5L71A 4BVYA 6GSXA 3VFIA 4NWYA 3TB2A 5F06A 4I2TA 1S3DA 2RLIA 5B8AA 2G0FA 3P2AA 2OKAA 3C7MA 4RUVA 5KN0A 1JHBA 4ML1A 4MMMA 3L9VA 2DLXA 4H86A 3VLNA 2VCXA 1G0TA 2G2QA 1XCCA 2WGRA 3JCML 3NIVA 5DDLA 1ZMAA 1F3BA 5DCHA 5C00A 5JCWA 1GUMA 4IP1A 4KSOA 4ULXA 4FYUA 1B4PA 4MABA 2L4CA 1NHOA 1X5DA 4CHSA 1B48A 2CA8A 3KP9A 1AW9A 1XWBA 3ME8A 2H74A 5D9WA 5IPGA 2MZCA 1A23A 2GS3A 4BVXA 1JZOA 4L5OA 1JZRA 1TRWA 4N0VA 3QAVA 1TOFA 3LSZA 2OADA 5COHA 4QL9A 3ZYWA 4EC0A 5INYA 2R6KA 3IXRA 4O7HA 2YWMA 3CRUA 5JWOB 4P3YB 5HR1A 5CRDA 3L9SA 4NPBA 4ECCA 2OACA 4J2FA 1A24A 4O92A 2IIYA 4XCSA 3EU4A 5EPFA 1XW6A 2L5LA 3F4SA 3ZZXA 2I4AA 3CSJA 4JE1A 2IMEA 5LNKe 4HZ2A 5FT3A 4HU9A 2NVLA 3UL3A 3WT1A 4EDYA 5GAND 3UVHA 1DE1A 2H0GA 2CV4A 5IOWA 3F9UA 1TRVA 1THXA 1WIKA 2MMOA 3QDNA 2YNXA 2PMTA 3ERFA 4MF7A 4GQFA 1FHEA 5FWGA 2R2JA 4MCUA 4AJ6A 1GP1A 2YP6A 1W4VA 2VM2A 1A0RP 2LNTA 2FLSA 2CZ2A 3QAWA 5KN1A 5DJLA 5C04A 2A2SA 5EY6A 3W8JA 4YQVA 2QC7A 5G2ZA 5LCZA 4CDOA 1YEXA 4MLYA 3MSZA 2TIRA 1EWXA 5CO3A 5G1KA 1V9WA 1K0MA 2DC5A 3KH7A 1F2EA 2DJ0A 1ERUA 5GZZB 4TRXA 4PNGA 1BX9A 4XS1A 3TJGA 3TJJA 2LV3A 4Q5QA 5ECKB 1N8JA 4F0BA 3G7YA 2R37A 1MD3A 3WGXA 2F9SA 2I81A 3F3QA 4HDEA 2YCDA 2PBJA 4OFNA 1K0DA 1ML6A 3QAGA 1Z7PA 1TKDB 4WEYA 3HVSA 2YN1A 4I5QA 5F0GA 5F05A 2A4VA 2C0FA 3RAZA 2BMXA 1BG5A 1K3OA 2V41A 2XBIA 1QUWA 4O32A 2YV9A 2GSQA 1EV9A 1SYRA 4MZCA 2TRXA 2B5EA 4IQAA 2RM5A 2KUCA 3VPTA 2WULA 3IC4A 4PNFA 1SK0A 4Z7XA 4GF0A 4HZ4A 1U6TA 1THOA 3GX0A 4I97A 6GSUA 3DRNA 1PN9A 1EZKA 2X99A 2FGXA 1A0FA 3GA4A 3HVVA 2IL3A 1AXDA 2IWTA 4X0XA 1A2LA 5J4UA 2LNSA 3ZMLA 1AQXA 3D4TA 4KDUA 3KEBA 5A4UA 2X8HA 1SENA 3DKSA 2HFDA 3E0UA 2B1LA 2MMAA 3KGKA 1TXXA 2R4VA 3EMXA 1UVZA 3WGDA 3D4MA 2DJ1A 4QL7A 1USBA 4K0GA 2H19A 1WOUA 4ZILA 3DYRA 4EO3A 2H30A 1I9DA 4EF0A 4KX4A 1GLPA 2C0EA 3GSTA 2JZSA 2M80A 1NSWA 1ZL9A 4PUAA 1SL2B 3LXTA 1WRYA 1OE7A 2I3YA 4K8MA 2P0GA 2GZPA 1XOBA 3L0HA 4POBA 4ISDA 2X8GA 3TRQA 1TK0B 1TW9A 2MYGA 5ECOB 4ZBAA 5HR0A 2RIIA 2O87A 1MDIA 5IM9A 3R2QA 3C1SA 2CX3A 5HR2A 3BBYA 2N5BA 2F3MA 3A5WA 4V2LA 3CRTA 2DJKA 1T3BA 2ON5A 3GNJA 3P90A 3KTLA 3FYGA 5DVBA 1HNBA 2JU5A 2VOCA 3BCKA 2EIOA 5CRGA 1DSBA 1SJZA 3V1WA 1YKCA 1QXHA 2CVDA 5B6MA 2WDUA 3SWLA 2R3XA 2R5GA 3GMFA 2KLXA 4YQUA 1V57A 2YV7A 2F8FA 2M72A 2H0IA 3FHKA 4NAXA 2C80A 4GCIA 2OA7A 3DGQA 1JZWA 5AIVA 2HRFA 2C0GA 1YJ6A 2XBQA 2NTOA 2K6VA 1LJRA 3HXSA 3VWVA 1PL2A 1KBNA 3ZL5A 3G9BA 1AQVA 3U6VA 3RDWA 3KH9A 2E2MA 1JZDA 3UMAA 3HA9A 4OMVA 3UBLA 1K0OA 4JZQA 1H4OA 2H0HA 1R7HA 3RHBA 3GL5A 5HFKA 2HSYA 4NMUA 5D96A 3FW2A 3D6IA 4BA7A 3M9KA 5AISA 2BTOT 1Q4JA 2CVKA 4GRFA 4ZIJA 4V1Ap 3NOFA 1C72A 5GSSA 4BPYA 2F8AA 1UC7A 2GSTA 1W89A 2O7KA 4ZB8A 1TI3A 4LA1A 2CVBA 2JZTA 3A2VA 1FVKA 4ECIA 3ED3A 1V58A 3TCOA 5ABRA 3HZ4A 1H75A 1X9SB 2Z9SA 2LQQA 5ECNB 3QOUA 1OE8A 2P5RA 1YZXA 1PKWA 2HZEB 4N10A 5D9VA 3H93A 1XWGA 1EP8A 2DSAA 4WF5A 2CZ3A 3HKRA 3IOSA 3UIWA 2EIQA 1R5AA 1PX6A 1XBSA 5HFGA 3I69A 2OE0A 1ON4A 5DALA 1WMJA 5HFIA 3ISOA 1VF1A 3LEFA 1KTEA 1ZYEA 1T1VA 1M99A 3EMPA 2IMIA 3A2WA 3UAPA 2YJHA 6GSVA 2N5FA 4IP6A 2H1AA 2MMZA 3DIEA 3WT2A 1EV4A 4EVMA 3HJOA 1CQGA 2PVOC 2GGTA 2AV4A 3MDKA 4ZL7A 1B9YC 5E59A 2DMMA 1GNEA 1Y6EA 2GSSA 5HQPA 4IBPA 1SKSB 2CT6A 3VI5A 3QFAC 3HZ8A 2X64A 3F8UA 5CREA 4TR1A 5IOXA 1SU9A 2WCIA 3KD0A 2V6OA 1GSDA 2H6XA 2TRCP 2VLUA 2MBTA 3TOTA 4PGTA 1SKWB 3UARA 3TKSA 1K0AA 5GSTA 1R26A 2H6YA 1MTCA 3IPZA 4K1FA 2OBKA 3FEUA 4EE0A 4KDXA 5IO2A 2FY6A 3CMIA 2AHEA 2L6CA 4RI6A 1U87A 1K0CA 3W8SA 1GTIA 3TKQA 2OE1A 3GH6A 1URMA 1ACVA 4IKHA 2VCZA 3S9FA 1U88A 1XIYA 3FY7A 1S3CA 4HJMA 2FHEA 3ZFBA 3F4RA 3GURA 3HVXA 1F37A 4KUNA 2JL4A 2NDOA 2B5YA 2LQOA 5FHIA 1AIUA 2IJYA 2MBSA 4NHWA 3L78A 1O7UA 1ERTA 3O6TA 5F8BA 2VUPA 1EEJA 2AYTA 2RM6A 2YZHA 3WYWA 1GSQA 3GV1A 1FO5A 5IMDA 1Y25A 3KCMA 2C8UA 1TDIA 3DVWA 5D9TA 4AF2A 4AGSA 2FWHA 3LGCA 3ERGA 4G10A 4NXIA 3NZNA 5ECHB 1EGOA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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