1AIUA

Human thioredoxin (d60n mutant, reduced form)
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPCKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVNDCQDVASECEVKCMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Human thioredoxin homodimers: regulation by pH, role of aspartate 60, and crystal structure of the aspartate 60 --> asparagine mutant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
molecule tags Electron transport
source organism Homo sapiens
total genus 34
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-04-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1aiuA00
4MA9A 2V6KA 4XTSA 3NIVA 1VF3A 2OADA 5ELGA 4Z7XA 2RUFA 1A2MA 3QOUA 3F0IA 1TRSA 2OE0A 3L0HA 4OCEA 4ZB9A 1BYEA 3CSJA 4ECBA 2R4VA 3KH9A 1X5CA 3VURA 2X64A 2REMA 3GKXA 1XVWA 8GSSA 2BJXA 3F6FA 3TKPA 4GSSA 4HU7A 1ZGNA 1H75A 1QFNA 3RPNA 4POKA 4TXOB 5IPGA 1TKDB 2VAFA 3SBCA 1K3OA 3LXTA 2H6ZA 4YH2A 1B9YC 2PBJA 3PGTA 1DUGA 3CSIA 1GSSA 1U6TA 1IYHA 1EV9A 4K7NA 4PQIA 1G0TA 2HSHA 4MCUA 3UBKA 1GNWA 2C0GA 1YKAA 3IK9A 5ECMB 4FYUA 1SD9A 1QXHA 2YV9A 3GKKA 1TK5B 5HR1A 2B7KA 4K9ZA 1FVKA 3QFBC 1GSFA 2A4VA 4HZ2A 4K0NA 4OWYA 2A2SA 2H19A 3GL3A 1WJKA 5H5QA 2CZ3A 4PQHA 5ENUA 12GSA 3P7XA 6GSWA 2AYTA 4DEJA 4MPFA 1OKTA 3KEBA 1JLVA 3ZZXA 5EVOA 2H72A 5ECQB 1UA5A 2B7JA 4GQFA 1THOA 1AW9A 4YAPA 4NPBA 3ED3A 2K6VA 1SKSB 3FR3A 3BCIA 2X99A 4KSMA 3UJ1A 4JRRA 1TU7A 3O76A 2PVOC 2O7KA 2DJ2A 4PNGA 1HNBA 4TXOA 2OBKA 3GSSA 2IJYA 4IKHA 3LORA 1PL2A 1T4ZA 2WRTA 2XPDA 5FWGA 4D73A 1X5DA 2HI7A 2XPEA 4F03A 2VIMA 1K0AA 1AQXA 4AF2A 1ERUA 4K7OA 1SU9A 1V9WA 3IBHA 1G6YA 1HNAA 4BPYA 3F4RA 4NAXA 4TXVA 3EVIA 4V1Ag 2JSYA 5ECNB 4N11A 1M2AA 2VM1A 2VL3A 2PERA 3CTGA 2DIZA 4RUVA 2B1KA 2LJAA 2P5RA 3WGXA 1YJ6A 2CAQA 3IV4A 1EGRA 4ZBAA 2NBSA 3F3QA 4PUFC 2DC5A 2LUSA 5L71A 2XHFA 2H0HA 1TXXA 3H93A 5AGYA 1MDKA 2H66A 2IMIA 2WGRA 1EEMA 3WGDA 4KUNA 5DAKB 2WCIA 2LRNA 4MF6A 1AIUA 2CVDA 3TJBA 19GSA 3WD6A 2N5AA 5KN3A 1XFLA 1JZOA 2V1MA 2YPMA 2PPTA 4LL4B 5CREA 2IWTA 3NZNA 2RUEA 3VWXA 2VUPA 3L9VA 1B4QA 4PGTA 5CRHA 1I5GA 4V1Ap 4I97A 1WPIA 3D5JA 4KCAA 2PWJA 4JU5A 4ECJA 1T8EB 1TDIA 2GTUA 1BX9A 1O8XA 1PL1A 2X8HA 4TOPA 14GSA 3GX0A 4K7IA 2MBSA 4ZB6A 3FK8A 4POMA 2LRTA 2IL3A 1NM3A 1GRXA 3I69A 3FZ9A 1ZL9A 3I6AA 1TI1A 3GIXA 1GSEA 4ZL7A 3GX8A 4TR4A 3UVTA 3D22A 5DQYA 1ML6A 4JZQA 3F4SA 3KJYA 4IN0A 4I2UA 5A4VA 1TTZA 2L5LA 5CO3A 2FNOA 1R7HA 4BA7A 3IOSA 4XRAA 3I43A 2HE3A 5F07A 5G31A 2PN8A 4WF4A 1UVZA 5DAKA 3GRXA 5J41A 3EU3A 3DXBA 2EIRA 2DJKA 2I3YA 5J5NA 1K3YA 2B1LA 2VOCA 4F0CA 1ZYQB 4N10A 5LCZA 2FY6A 1OKDA 2GT6A 4V2NA 1W4VA 2QGVA 1YKCA 1UN2A 1O6JA 4K2DA 2H75A 4PX1A 4X1UA 1GSQA 5B8AA 1ON4A 3TGZA 1T4YA 2BMXA 2EIQA 3DKSA 2H1AA 4TVEA 2F3MA 3M3MA 2G0FA 3GH6A 3KZQA 4PNFA 3IRAA 1QUWA 2KUCA 5G5FA 2GZYA 4EXJA 4K6XA 2K8VA 2JACA 2VCWA 4FH8A 5D9VA 2CX3A 3HVVA 4MDCA 2VO4A 4XCSA 4MZWA 1O73A 5CP1A 4PXOA 4F0BA 1K0NA 4POBA 2ZNMA 3P2AA 1IYIA 2FD3A 1AXDA 1Z9HA 4O7HA 2LRCA 1SL1B 2LNSA 4OD7A 2H6XA 3C7MA 1GWCA 5GZZB 3F4TA 3GH9A 2F51A 4OO5A 4ZILA 5CNWA 1BG5A 3ZREA 3ZLPA 3P8WA 1Z5YE 3M9JA 5INYA 3TB2A 2PGTA 4MJCA 3D6IA 3M0FA 1EP7A 3D21A 1EGOA 3QAVA 2FA4A 5DCHA 4N0ZA 4OO4A 4MK3A 5IOWA 3FZAA 5ECRB 5ABRA 2LV3A 3K8NA 5J9CA 5HQPA 2K8SA 3EU4A 2IMKA 2EIOA 5GAPD 2AV4A 4ID0A 4OFNA 2OBIA 2AJQB 1Y6EA 4DVCA 2F9SA 2KOKA 3PINA 2VL9A 5A4WA 4OCFA 6GSUA 5C00A 5DJMA 2IMEA 1YF1A 3APQA 3FRCA 1AC1A 5IPHA 1WRYA 1F2EA 3FZ5A 1SKRB 2GSRA 4YQVA 3RDWA 3DVXA 3GKMA 3WGEA 3IDVA 1GSDA 3PH9A 2DJJA 1GTIA 1SD8A 4ECIA 3LXZA 1A23A 4IHUA 3ZL5A 3EMXA 5JCUA 3EE2A 3W8JA 4G2EA 3HJPA 3DRNA 5F05A 3BOAA 2H6YA 3F63A 1LJRA 3Q18A 4KDUA 3C1SA 1QQ2A 1A2JA 4MP4A 2AAWA 2EC4A 4HJ2A 2R2JA 1OVNA 3NOFA 1SJ6A 2GT5A 1G6WA 5ID2B 2H1BA 3BD2A 1OC3A 1XOAA 3SWLA 2HSYA 4XS6A 5IIZA 4BVXA 4NHWA 2QSIA 3CRTA 2NDOA 3GMFA 3QCPA 4CDOA 1CQHA 3EC3A 4QL7A 4NXIA 2RLIA 5ECLB 4MF5A 2GSTA 3HDCA 1AUCA 5IO0A 2KLXA 3VPTA 2MMZA 3UAPA 1PX6A 1YF0A 1A24A 2RM5A 3ZTLA 5GSSA 5G2ZA 1K0CA 5KEJA 3LWAA 3VWVA 2H0GA 2M80A 4IW9A 3CMIA 1V57A 3D4TA 4GRFA 3C73A 3LGCA 3FW2A 3OR5A 1SYRA 4JE1A 3A2VA 5HR2A 3IE3A 2LNTA 4D73B 3VK9A 2C8UA 1K0BA 1X0RA 4IBPA 4EF0A 2VD1A 4WR5A 1U3AA 2CT6A 1GSUA 4OMVA 1XCCA 3GYKA 2YWIA 4WR4A 1TU8A 3O3TA 4KX4A 3TKRA 5AIVA 4K1FA 1NHOA 4X0XA 4YAVA 3IAM2 1YZXA 2ZCTA 5ID2A 2K18A 3DYRA 4L0UA 5DVBA 2K9FA 3LYKA 5KN0A 1B4PA 3MAKA 1Y25A 4P3YB 2N5BA 1GL8A 2IIYA 3GV1A 5EL8A 2FA8A 5D8IA 1PSQA 4OFTA 1I9DA 4WBJA 4MZCA 2WDUA 2NPBA 4TR1B 2X8CA 4EUYA 3GURA 1DBYA 1QGVA 5JWQB 1GTUA 5F0GA 1QMVA 1V40A 3EURA 4JR4A 3HVXA 1XWKA 1QK8A 2H73A 1M99A 4JEDA 3FR6A 4RI6A 4J2FA 4G10A 2O8VB 1S3CA 3A5WA 1VF1A 4KA0A 1V2AA 3L9SA 1SK2A 2YV7A 2B6MA 2RIIA 5GAND 1YQ1A 2VLTA 5AISA 1HNCA 2FUG2 1GUMA 1SK0A 1AAZA 1ZCPA 2HYXA 4WKWA 3ZVJA 5D9XA 2FWGA 4HEA2 6GSVA 1EZKA 2CVKA 2MBTA 2WULA 2V41A 1O8WA 5IO2A 2H76A 3G7JA 4J57E 3LSZA 4BWQA 3L9UA 4EL1A 1V58A 4MLYA 3HY2A 2YN1A 4V2LA 1T7PB 2LS5A 3J7Yk 3W6GA 2ES7A 4Q5RA 3IR4A 3KTLA 4JR6A 5CRGA 5C04A 3F3RA 4TKYA 4ZIJA 9GSSA 2V6OA 3QD9A 1Z7RA 1R5PA 3CBUA 3H8QA 4TR1A 3QMXA 3W8SA 2H0IA 5B6NA 2H1GA 4YQUA 4FYBA 2O85A 4MMMA 3HCZA 2IFQB 4HJMA 1HD2A 4X43A 3UEMA 1NW2A 3DWVA 1X9WB 3VWUA 2N5FA 2V32A 2I4AA 1MD3A 1TJDA 5G1LA 1OE8A 1YDKA 3EWLA 1ST9A 4EKZA 1WWJA 3LEFA 2KHPA 2GQMA 1ZMAA 1AQVA 1A8LA 2H01A 3A3TA 2E0QA 5KN2A 2DJ1A 4RI7A 3TJFA 2R5GA 1GSYA 4IJ3A 5G30A 1MDIA 2G2QA 2LKUA 1TRWA 3LQ7A 5ECKB 1HYUA 2GZZA 2WS2A 1K3LA 1PMTA 5J3RA 1XOBA 3EMPA 1ZOFA 4GLTA 2GS3A 5CYYA 5E4WA 2DLXA 2HXKA 3FZ4A 4Q5NA 4IP1A 4ZB8A 1EOHA 4KCEA 1XWBA 5JWOB 3WT2A 2OE3A 3KGKA 5HFGA 2L4CA 3MNGA 2P31A 1B8XA 2C3NA 4WEYA 5ELAA 3TJGA 2LTKA 1JLWA 1U88A 4EC0A 3MWHA 3GN3A 1OYJA 5JCGA 2GQKA 5ECPB 3TCOA 3VWWA 2IFQA 1JZRA 2B5EA 2H74A 1S3DA 3FR9A 3ZRDA 2FCHA 4ZXGA 1PKWA 5G1KA 3ZVJD 2JZSA 6GSYA 1BAYA 3UBLA 2OE1A 1RK4A 2HNLA 3IAS2 1ABAA 1VF4A 1VGLA 1JFUA 2LQOA 1Z6MA 4NV5A 3UVHA 3F8UA 4L8EA 4XIHA 5CAXA 2I9HA 5IOXA 5HFKA 1XWAA 2IPAA 3QFAC 3CSHA 3M9KA 1Z7PA 5H5SA 2P5QA 2VD0A 1B48A 3H4KA 2XBIA 4TR3A 2HRFA 3ZMLA 1GUKA 1XPVA 3GFKA 3HKRA 3KD0A 2PMTA 5HR0A 2FWHA 1U3IA 4DSQA 4F2IA 5ECOB 3TOUA 2DSAA 1GNEA 2VM2A 1FW1A 4MJEA 4N0VA 5F06A 1F37A 1FO5A 1XWCA 3N5OA 2PVQA 3DGQA 3E0UA 2B5YA 2OJLA 3APOA 3LJRA 4DSSA 2ZUPA 5KN1A 3ME7A 3TJKA 4ULXA 5CRDA 3DEXA 4AJ6A 1JZDA 1PN9A 3H1NA 2CVBA 1SL2B 3HYPA 1Z6NA 4NWYA 2OKAA 2XBQA 1Z3EA 3UARA 2YWOA 3M8NA 2CX4A 4KH7A 1SKWB 4WETA 1MTCA 2YANA 5LD0A 5FT3A 4IVFA 2A2RA 2LQQA 2JSZA 3L78A 3GSTA 2J23A 2YCDA 4F9ZA 2E2GA 4MJBA 4V2MA 1LU4A 1TRVA 1DSBA 3HJOA 3VI5A 3HXSA 2FLSA 2YNXA 2M46A 3GKNA 1PQNA 1TK0B 4PURA 1PD21 4O32A 4I2TA 4XHMA 2WJUA 2GVPA 4WF5A 5IMFA 2R3XA 4E8EA 1F3AA 1M7TA 4KNDA 2VCQA 2F8FA 2E2MA 5HFIA 1K0DA 4ECCA 2I81A 4ACSA 3R2QA 3ZIJA 3FEUA 1JHBA 1E6BA 3ME8A 4LA1A 4Q5QA 4LLRA 3GA4A 3US3A 2OA7A 3DIEA 1V98A 5D96A 4CW9A 1MD4A 2PU9C 1YEXA 2DJ0A 10GSA 5D9WA 1MEKA 3RPPA 1K0MA 1O81A 4CHSA 2DBCA 4IGJA 3LG6A 2FWFA 1RW1A 4L0WA 5AIXA 4L5LA 4EE0A 2JZRA 5DALB 2TRXA 3HD5A 2QKEA 3BJ5A 3FHKA 3TKSC 4EDYA 4POLA 2C3TA 1SENA 1T3BA 3G7IA 6GSXA 4IS0A 1LBKA 4LMWA 4F82A 1N8JA 3C8EA 4TR0A 1BQ7A 1M9BA 2JZTA 2C4JA 2QC7A 5E59A 3ZFLA 1TI3A 1J08A 3TRXA 6GSSA 1R5AA 5D73A 2C1YA 1PGTA 5AN1A 2VL2C 2MYGA 2HRNA 1UC7A 5FHIA 3DVWA 1SYXA 5IMAA 2DIYA 4BVYA 3CRUA 2XC2A 7GSSA 1G7OA 4FIWA 2TIRA 1O7UA 4WBRD 4OFMA 3A2XA 2C0FA 4IQAA 3N9JA 1GLPA 3C1RA 6GSTA 4ISDA 3PR8A 2YOIA 1X9SB 2MMAA 4XRDA 1TOFA 1VF2A 2H70A 2KP1A 1R26A 4KDXA 3QAWA 1GUHA 3A2WA 3D4MA 5F8BA 11GSA 3VPQA 1ACVA 3FYGA 3ZITA 5DJLA 3F6DA 1THXA 1XXUA 5DALA 1U87A 4L5OA 3IC4A 3APSA 4Q5FA 3HVSA 3M1GA 4I5QA 4HS1A 2FWEA 2V2GA 2HFDA 1HQOA 2HT9A 2VCTA 4PUAA 3L4NA 3ISOA 3GHAA 3DD3A 4MJAA 1B9XC 2GLRA 1M2DA 2ON5A 4GQCA 1FB0A 1PA3A 3V1WA 3VLNA 4EDZA 1WMJA 2IMDA 1A2LA 5EY6A 1R4WA 22GSA 2VCXA 3WT1A 1N2AA 1XW9A 2AHEA 3FY7A 2J9HA 1GP1A 1KNGA 4HQSA 2H8LA 4GWRA 4ZBDA 1FOVA 3KM6A 1ILOA 2LJRA 3H79A 3HA9A 2CV4A 5GSTA 5COHA 3D0ZA 3ZMKA 4I8BA 5IMCA 1FVJA 4ML6A 3MSZA 1CQGA 3IK7A 1XZOA 1TP9A 4NV2A 2C80A 2YJHA 3TOTA 1M9AA 1URMA 2IMFA 4I6XA 3UL3A 5LNKe 5IMZA 1K0OA 1BJXA 3J7Yb 2M72A 2GQLA 3G7YA 3RHCA 3HZ4A 2CA8A 4TN8A 2VCVA 1PX7A 3EYTA 3TKQA 1XVQA 1EP8A 1XWGA 2FGXA 2NVLA 3KP9A 1ERWA 3KP8A 1RQMA 1PKZA 5CRWA 2YZHA 5HR3A 1EEJA 5ECHB 2Z9SA 1G7EA 3RHBA 1F6MC 3GTUB 1WE0A 2L59A 1YEPA 4NMUA 3UIWA 3TRQA 3HZ8A 3GL5A 4MH3A 2HZEB 4KAEA 1T00A 3FKFA 3CXGA 4GSTA 3QAGA 4FO5A 4FYCA 4KGIA 2R37A 4HDEA 2GZPA 1GTBA 4KW6A 2VLUA 4EVMA 3LYPA 5H5RA 1F9MA 1WP0A 1XIYA 3HJMA 2X8GA 3ZFBA 2WFCA 1BEDA 4KSOA 2YP6A 1FB6A 1O85A 3KXOA 2GSQA 4GXZA 2B5XA 1EV4A 4K0GA 1USBA 5A4UA 2O89A 5DCGA 2AUVA 3IPZA 2KP2A 2BTOT 3QR6A 3LFLA 4IJIA 1ZYEA 3QPMA 1AQWA 3ERFA 1ERTA 4N30A 5JCWA 1A0FA 2C0EA 4J56E 2LJKA 2L57A 5J4UA 5DBQA 1F3BA 2L6DA 3Q6OA 4MABA 3TJJA 1TK8B 1W89A 3E3EA 3TUEA 4TW5A 3ZYWA 3KIJA 2O87A 1E2YA 1OC9B 5EPFA 2H30A 4AJ8A 4DSSB 5IMVA 5A5KA 3KMNA 4HUAA 4G19A 3HHVA 4KB3A 1XBSA 1NHYA 1GTAA 1X5EA 1DE2A 3GTUA 2HZEA 2OACA 4XS1A 2HZFA 5D93A 3S9FA 3TKSA 1OC8A 3ZIVA 2D2ZA 3F9UA 1FHEA 4NHZA 4IP6A 4ZL9A 1KBNA 3MDKA 4H86A 1A8YA 5J9BA 1EOGA 3IHQA 3VFIA 5DQSA 2L6CA 1SL0B 1TW9A 5DDLA 2I1UA 2L4QA 3KCMA 4WXTA 4HOJA 4E8HA 2DMMA 2ALBA 2B3SA 2ON7A 3IA1A 3GUSA 5B6MA 2VL2A 4GF0A 2YWNA 1OAZA 4K8MA 2H71A 5B8BA 4KDYA 4XS4B 4MF7A 4LL1B 4EO3A 5IMDA 3O6TA 1GLQA 17GSA 1WOUA 2MMNA 1EWXA 2HLSA 1XW6A 2LEGA 4HZ4A 1ZZYA 5ECIB 3EINA 4GTUA 4MPGA 2JU5A 1KEBA 2H1DA 3UOMA 1TRUA 1OC9A 2R6KA 3BCKA 5G5EA 4QQ7A 2FHEA 5B7CA 3ERGA 1PRXA 3P90A 4KE3A 4O5RA 4BWSA 1H4OA 2TRCP 2WZ9A 1WIKA 1JZWA 3AY8A 1A0RP 3RBTA 4AJ7A 4ZL8A 2CAIA 3IXRA 1Q4JA 4ML1A 4JBBA 1SK1A 20GSA 3KTBA 2IN3A 1S3AA 3KH7A 1VRSD 1FAAA 3QDNA 1DE1A 16GSA 2CZ2A 4BL7A 1X9MB 3VI7A 4IQ1A 3U5RE 1XW5A 2JADA 4ILFA 4O92A 4HQZA 2DJ3A 2P0GA 4XS4A 1SJIA 3WYWA 4TRXA 1J9BA 1GULA 1GH2A 4HI7A 3E9JB 3GNJA 5IQYA 1ERVA 5D9TA 3DMLA 3I9V2 2DMLA 3Q19A 2LSTA 4G9HA 18GSA 2JL4A 4PQ1A 3CTFA 3C71A 4IELA 5IM9A 5JWRB 3ERWA 3RAZA 2WB9A 4HU9A 1C72A 4YQMA 5ECSA 2L5OA 2NTOA 2GGTA 1Q98A 2F8AA 1KTEA 13GSA 2YJ7A 2RM6A 1T1VA 2AB6A 3TKSE 2GSSA 4GSNA 2CQ9A 1J0FA 4MH2A 4QL9A 3TDGA 3TRPA 3G9BA 2E7PA 1MDJA 2YWMA 1YY7A 2MMOA 4LMVA 1OE7A 3UMAA 4DSRA 2VLVA 4RQXA 3KMOA 1M2BA 3Q74A 2MZCA 4ZBBA 3BBYA 4GCIA 1NSWA 3JCML 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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