1AUCA

Human thioredoxin (oxidized with diamide)
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPCKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDCQDVASECEVKCMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Human thioredoxin homodimers: regulation by pH, role of aspartate 60, and crystal structure of the aspartate 60 --> asparagine mutant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
molecule tags Oxidoreductase
total genus 36
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-08-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1aucA00
3IC4A 4I2UA 3G7IA 1S3CA 2FCHA 5G31A 3UMAA 4WXTA 4K0NA 4Q5RA 2VL3A 3H93A 2PVQA 2H0HA 3QCPA 1V57A 4XRDA 3DVWA 5E59A 1Z5YE 2YP6A 1VF3A 4IJIA 1ST9A 3MSZA 4BWSA 1VF4A 2C0DA 3I9V2 3QFAC 4PX1A 1E2YA 1GUHA 1YQ1A 1TK8B 3DWVA 5IO0A 4OD7A 2H6YA 2FY6A 1BJXA 1O73A 2H76A 1GSEA 2C80A 2AHEA 1ZL9A 2LJRA 3GX8A 1VRSD 1M9AA 1N8JA 3E9JB 3P8WA 1U87A 1OVNA 1ZYQB 2V2GA 2WGRA 1V40A 3GA4A 3QR6A 5F0GA 3LYPA 1GSYA 2WS2A 3L9UA 8GSSA 4OCEA 5J3RA 2NVLA 4BL7A 2QSIA 5KN3A 2FNOA 1PA3A 4K6XA 1BX9A 3ME7A 5GAND 3FW2A 2H71A 4KCEA 2YNXA 4MJAA 1JZWA 3F4SA 1XWBA 4ZL9A 2IFQB 2HSHA 2YJ7A 5JCWA 2N5BA 4XS1A 5IMDA 3LXTA 3A3TA 3EU3A 5CYYA 3HJPA 2CA8A 5CRWA 2FWHA 1TXXA 1XIYA 2VOCA 2FHEA 4WR5A 2I9HA 2R5GA 1M9BA 2BJXA 3L9VA 3RPNA 4IQ1A 1Q4JA 4F82A 2VLVA 2C0GA 2R37A 2L57A 2CX4A 2DJ3A 3ISOA 1RW1A 1O85A 3GSTA 3KEBA 1TTZA 4WF4A 3Q18A 5KN1A 1EP7A 2DJJA 4ZL7A 3BOAA 2O7KA 2Z9SA 2O8VB 1K3YA 6GSTA 4TOPA 3DEXA 2KUCA 3W6GA 1K0OA 1TRUA 1FHEA 4JE1A 5LNKe 2RUFA 5DALB 1Y6EA 3KP9A 3RHBA 1SKRB 2H70A 2GSQA 2MZCA 4MH3A 1YY7A 4LL4B 3ED3A 3C1RA 3L4NA 4X1UA 4K8MA 4P3YB 2VD0A 5DALA 1EP8A 5D8IA 4K0GA 4ULXA 2ALBA 1JLVA 2LV3A 4IBPA 1BG5A 2K8SA 4QL7A 5ECKB 1PN9A 2XBIA 22GSA 1AQVA 1H75A 3M8NA 1J0FA 4PNFA 5B8AA 4EF0A 3VPTA 3IR4A 1F9MA 3IK9A 5A5KA 1ZGNA 3BCKA 4L0WA 3F63A 1YJ6A 1EGRA 5B6NA 4MJCA 4IELA 3TJBA 2KP2A 1AIUA 2YZHA 2GLRA 3TKSA 4YQVA 2YN1A 2H73A 3WD6A 6GSSA 3F4TA 3GTUB 3LORA 5ECRB 2DBCA 3CMIA 3WYWA 3IA1A 2JSZA 4NV2A 1TKDB 1WOUA 9GSSA 1USBA 2V6OA 2R6KA 5JWRB 5LD0A 1M99A 1NSWA 3GTUA 2F8AA 4EL1A 2I81A 1CQHA 2IMDA 2YCDA 1YF0A 3U6VA 2FWFA 5FHIA 3W8JA 1B4QA 2VM1A 4EO3A 11GSA 2PGTA 1N2AA 2LQOA 3CBUA 2JL4A 5A4UA 2YV7A 2H1GA 4MDCA 2J23A 5DAKB 5CRHA 3GN3A 2XPDA 2LRCA 3KTBA 1PX6A 4PQIA 3D22A 1PL2A 1GLPA 3VLNA 2EIOA 2N5AA 2YANA 4K7IA 3P7XA 2LTKA 4JEDA 3CSJA 2RLIA 5DAKA 3FR6A 3FZ9A 2E2MA 2LQQA 3VWWA 4J56E 4N11A 1FVJA 2WDUA 4POKA 5ECPB 2K9FA 4XS4B 2GZZA 1URMA 3PINA 2H19A 3HDCA 3KIJA 2PPTA 1A24A 3O6TA 1DUGA 1PKWA 2VCQA 3TOUA 3BBYA 1EGOA 5F05A 1XW9A 1DBYA 4OWYA 4ZIJA 2ZCTA 4PNGA 3IAS2 4OCFA 1AQWA 2AYTA 5DJMA 3KTLA 1GNEA 2PVOC 3KD0A 1K0NA 4L5OA 4BPYA 1ACVA 2X8HA 3CXGA 1C72A 2H1AA 3VI5A 2PN8A 4TN8A 5HR1A 4ZB9A 3DRNA 4L8EA 2GZYA 4GWRA 4KW6A 3APOA 5G30A 3VI7A 4NAXA 3C73A 2DSAA 3KP8A 2AJQB 4D73A 5F06A 1OYJA 1HYUA 3FYGA 3GKNA 4RI7A 1JFUA 4IS0A 3RAZA 5ECIB 4E8EA 3C1SA 1B8XA 2OBIA 1S3AA 5A4VA 4GRFA 1SK0A 4WBJA 1FVKA 3AY8A 2MYGA 5H5QA 1SENA 1SYRA 2H72A 1ZYEA 4HEA2 3A5WA 4HI7A 1O81A 5EPFA 2OBKA 4OMVA 4E8HA 2H6ZA 1GH2A 4V2NA 2V1MA 3WT1A 3ZZXA 4ZL8A 5J9CA 4MMMA 3QPMA 4HQSA 4AJ6A 2XBQA 1IYIA 1EZKA 2MMZA 2K18A 1FAAA 3J7Yb 1QFNA 1R7HA 4ID0A 5ID2A 2FUG2 5IMVA 2JZTA 4FO5A 3QAVA 1G7OA 5C04A 2O87A 4O7HA 4OFMA 1XVQA 3A2VA 3TB2A 2TRCP 3G9BA 3GSSA 2IMIA 5H5RA 5JWQB 4KX4A 3EURA 3IPZA 2BTOT 3TRQA 4ML6A 2GSSA 2YWNA 13GSA 5D9TA 2FA8A 1GTIA 3H8QA 4HOJA 5ECMB 1U88A 12GSA 3JCML 1Y25A 3FK8A 4TKYA 3HHVA 4WEYA 2MMAA 3F6FA 5KN0A 4JR4A 4G2EA 2RUEA 5HFIA 1AAZA 3O3TA 5IM9A 2XC2A 4PQ1A 4YQUA 1NM3A 2DMMA 3IRAA 1SKSB 1XWAA 5ENUA 3CTGA 3ZVJA 1NHOA 3S9FA 4PURA 3TCOA 5ECSA 1XFLA 2GT6A 3EVIA 5G1LA 3GHAA 2B5XA 3UBLA 1I9DA 3LEFA 2CAIA 3NIVA 2NDOA 4GQFA 1ABAA 2YPMA 2LNTA 2KLXA 1YEXA 1XOAA 4MF6A 5J4UA 5CAXA 3VURA 4POBA 2CVKA 5CRDA 3H4KA 1FG4A 3GKXA 3QAWA 1G7EA 3FKFA 3F8UA 5L71A 4J2FA 3UL3A 3V1WA 3HVXA 2NBSA 4F03A 4JRRA 4MJBA 2B5EA 1R5AA 1LBKA 3D4MA 3TKSC 1ERTA 2IJYA 2GZPA 4EUYA 1ZCPA 2M80A 3TRXA 4HDEA 2HZFA 2YZUA 1QGVA 2QGVA 4TR3A 2JU5A 4YQMA 5CP1A 4MZBA 4XS6A 3APQA 1R26A 4ACSA 5EY6A 3SWLA 3KGKA 1XBSA 1GTBA 2CT6A 3M9KA 3FHKA 3ZITA 2HI7A 4KDXA 3NOFA 2YJHA 2H74A 1FO5A 1GTAA 4QQ7A 1K0CA 4JBBA 2VCZA 5AIXA 3LFLA 1WRYA 2DC5A 3UARA 2EIQA 17GSA 4I5QA 3F0IA 2J9HA 1TP9A 2VCXA 2FLSA 2HNLA 4N30A 3HYPA 1MEKA 2PMTA 4GF0A 3UBKA 2REMA 4V2LA 5F8BA 2JADA 4MH2A 3TDGA 2OACA 3DYRA 3L78A 2BMXA 1WWJA 2VCWA 1ERVA 1DSBA 1THXA 1JLWA 4GSSA 3RDWA 4KAEA 3W8SA 1MD3A 4PUAA 4IVFA 10GSA 3F9UA 4XHMA 2LEGA 6GSYA 1NW2A 3QMXA 5D9XA 4YAVA 2P5QA 1MTCA 4KDYA 5J41A 4AGSA 4QL9A 2ON7A 4JU5A 1HD2A 3VWVA 1OKTA 2IFQA 3FRCA 1A0FA 4KUNA 2IPAA 1WJKA 1MDJA 3HZ4A 1U3AA 4NHWA 1PRXA 4V2MA 2EIRA 1GSQA 2B3SA 4ZXGA 4WBRD 3HVSA 4YH2A 1PD21 4EVMA 2DIYA 1K3OA 4MJEA 5D9VA 2R2JA 1WIKA 3WGXA 1Z7RA 1HNAA 2LKUA 3N9JA 1A2LA 3TKPA 1KEBA 7GSSA 1G6WA 3KH9A 5KEJA 4PUFC 4ZBDA 1BQ7A 1LU4A 4POMA 4TRXA 2LJAA 3QFBC 4LMWA 2YWMA 3WT2A 1R4WA 4K1FA 4ECIA 1UVZA 5LCZA 3FZ4A 2LNSA 3VK9A 4GQCA 1YKCA 5G5EA 3BCIA 2C1YA 2HXKA 3VFIA 3VPQA 3HD5A 1K0BA 2X99A 1OC3A 1TU7A 1U6TA 4BA7A 1IYHA 4MPFA 4F2IA 4J57E 1KBNA 2TIRA 3GL5A 1X5DA 2R4VA 3H79A 2HYXA 3A2WA 2B6MA 1F2EA 4ECBA 4Q5NA 1XWKA 1SL2B 2WFCA 2OKAA 1TU8A 4KSOA 4HJMA 2QC7A 4NPBA 4PXOA 2YWOA 1V98A 2M46A 5ECQB 1ZOFA 2CV4A 5B8BA 2H30A 2N5FA 3QOUA 1GLQA 2AV4A 3E3EA 1TRWA 3GFKA 2WCIA 3ZFBA 4MP4A 3PR8A 3ERGA 3GX0A 1A23A 2HFDA 1O6JA 4GXZA 3CRUA 1X9WB 2V41A 3PGTA 5D9WA 2MBTA 3G7YA 1B9XC 1X5EA 4WF5A 1KNGA 3IK7A 1EEMA 1A2MA 3ZRDA 4XRAA 4F0BA 5HFKA 2O85A 4HU9A 1AC1A 3EYTA 4ILFA 1M0UA 3U5RE 1HQOA 4BWQA 4EKZA 1HNBA 4MF7A 5IPHA 5FWGA 2H01A 4MLYA 4HZ2A 1QK8A 4HZ4A 2KHPA 1RQMA 2MBSA 4Q5QA 3G7JA 2H75A 4DSRA 3R2QA 1TK0B 5DJLA 1XW5A 1J9BA 2DMLA 3GKKA 5D96A 3ZIVA 5G1KA 4HU7A 3TUEA 3WGDA 2IMFA 2ES7A 3LWAA 1SK1A 3ZMKA 5AISA 2OE0A 3Q6OA 1SK2A 3EMPA 3TRPA 1PX7A 3GIXA 1YZXA 3UVTA 5HQPA 3EINA 5EVOA 4ZB6A 1DE1A 1YF1A 4XS4A 3Q74A 1G0TA 1GP1A 3F6DA 2XPEA 14GSA 5CRGA 2VCVA 5JCGA 3OR5A 2C3TA 5J9BA 3APSA 1OC9B 1PSQA 5D93A 1TOFA 2FWGA 4WKWA 2F51A 3C71A 3QAGA 4O92A 3GMFA 3EMXA 1WE0A 4ECJA 1VF2A 1SU9A 3GYKA 3ZFLA 3I69A 1QQ2A 1ZZYA 4BVYA 4NWYA 3MAKA 1SL0B 4FYBA 2OE1A 3DVXA 2GVPA 1WPIA 1WP0A 4PGTA 4X43A 1AUCA 2CVBA 1K0AA 5DQSA 16GSA 3UJ1A 1EWXA 2LUSA 1VGLA 3EC3A 3M0FA 2DIZA 4MA9A 1X9MB 2EC4A 2E0QA 5JCUA 4ZILA 4KGIA 4G19A 4IKHA 1AQXA 1V58A 2JSYA 1ZMAA 2PWJA 1ON4A 4NXIA 4DSSB 3HKRA 4X0XA 2IN3A 3TJKA 3PH9A 2E7PA 2VO4A 3CTFA 2K8VA 1E6BA 5IMZA 4RI6A 3KH7A 5D73A 1T7PB 2VL2A 1TI3A 4Q5FA 1OKDA 3BD2A 2JACA 4DSSA 3HZ8A 4ZBBA 2OA7A 4YAPA 5CO3A 5IOWA 2IMEA 2WJUA 3HJOA 4IQAA 1O8WA 2X8CA 3IOSA 4I2TA 3H1NA 5G2ZA 5DVBA 5A4WA 1MDIA 4FIWA 4IP6A 2VIMA 1K0MA 3KXOA 1OAZA 1EV9A 2HT9A 4N10A 2O89A 1Z6NA 3GURA 4I8BA 4DEJA 5ECLB 3LGCA 2DJKA 2GT5A 2CVDA 3TJJA 1S3DA 4TR1B 4MZCA 1MDKA 2VLTA 2P5RA 4ECCA 3DD3A 2HE3A 2KOKA 5DBQA 3L0HA 2L6DA 3FZAA 2L59A 5IQYA 2DJ2A 3N5OA 1TI1A 1GSSA 4TR1A 1GULA 3ERWA 2IIYA 2F9SA 2L6CA 5GZZB 2X8GA 5G5FA 5B7CA 2WULA 2OJLA 1KTEA 1SJZA 3WGEA 4CW9A 2AUVA 2IWTA 2C4JA 4KNDA 5ELAA 1A0RP 3ZYWA 2B1KA 4HQZA 2IL3A 4TXVA 1M2AA 3ZTLA 3LSZA 4L5LA 5IMFA 1UA5A 3UAPA 1PL1A 1T4ZA 5CNWA 1BEDA 4KSMA 2L4QA 4WETA 4ZBAA 1Q98A 3M9JA 1W89A 3FR9A 3M3MA 4EE0A 1QXHA 5CREA 2G2QA 4JZQA 3CYNA 3TKSE 1TJDA 3ZVJD 1XOBA 2C8UA 4POLA 2V6KA 2R3XA 3TGZA 3L9SA 2NPBA 4JR6A 4HUAA 3UVHA 2ZNMA 4TW5A 5IOXA 2QKEA 2AAWA 1XWCA 4AJ7A 4CHSA 1FW1A 3QD9A 4ZB8A 1RK4A 2C3QA 4PQHA 5C00A 1XW6A 1UN2A 2CX3A 4K7OA 2CQ9A 2NTOA 3IHQA 3FY7A 2JZSA 1O8XA 2WRTA 4TR0A 1XVWA 4GCIA 3BJ5A 4TR4A 2GDRA 2OE3A 4IN0A 5IMAA 2D2ZA 3E0UA 2HRNA 1XZOA 2FA4A 2C0EA 1PKZA 3GH6A 2LSTA 4GSNA 4LL1B 3LJRA 4O32A 4DSQA 4NV5A 1B48A 2DJ1A 1DE2A 1NHYA 1X0RA 2WB9A 3NZNA 1EOGA 2LS5A 4OO4A 5ECHB 3KJYA 2B7KA 1M2DA 1W4VA 3DKSA 4TXOB 4DVCA 1V2AA 4IJ3A 2GGTA 3DXBA 4GTUA 4LLRA 2MMNA 2XHFA 5GSTA 1B4PA 2HLSA 3F3RA 5AIVA 4V1Ag 2ZUPA 2A2SA 4I6XA 3HXSA 4TXOA 2HRFA 3D5JA 3RPPA 4IW9A 1F37A 3F3QA 3VWXA 2JZRA 3LXZA 4MPGA 2VLUA 5IIZA 2LRNA 4LMVA 1SJ6A 4MF5A 1GRXA 1ILOA 2GSTA 3IV4A 3CRTA 1GTUA 1PQNA 4CDOA 1X5CA 4LA1A 4F9ZA 1T4YA 4OO5A 3Q19A 1YKAA 1AW9A 1CQGA 2RIIA 2KP1A 3EWLA 2H1BA 2PBJA 3UOMA 2A2RA 1SL1B 5EL8A 3GUSA 4K9ZA 1PGTA 4KA0A 1ML6A 4ISDA 1FOVA 1F3BA 4HJ2A 3D4TA 4H86A 1SJIA 4MABA 3RBTA 4O5RA 1JZOA 3P90A 1X9SB 4AJ8A 3EE2A 2I1UA 4GSTA 1EOHA 2M72A 1YDKA 2VL9A 18GSA 1HNCA 4V1Ap 3DIEA 1B9YC 3TOTA 1FB6A 3D0ZA 1XWGA 2HZEB 4N0VA 3ZREA 1GSUA 1Z6MA 4KB3A 3I43A 1GWCA 1YEPA 2V32A 2VL2C 3KM6A 5COHA 3J7Yk 1I5GA 4K2DA 5ABRA 4KE3A 3D6IA 3C7MA 3FEUA 19GSA 2AB6A 1T8EB 1EV4A 1TRSA 2HZEA 1AXDA 3LYKA 3IE3A 3ZIJA 3KMOA 4EC0A 2B7JA 5DCHA 3GRXA 3TKQA 1EEJA 2FGXA 2E2GA 6GSWA 2VD1A 1M7TA 1O7UA 4AF2A 1GSFA 2A4VA 2OADA 2H8LA 2VCTA 1SD9A 4RUVA 2IMKA 4FYUA 4L0UA 2K6VA 4G9HA 3MWHA 4XIHA 1LJRA 2WZ9A 1ERUA 1T00A 1GUKA 3HCZA 2FD3A 4MZWA 1XPVA 3M1GA 1OC8A 4HS1A 3IBHA 3QDNA 1T3BA 5HFGA 2GQKA 1JZRA 4ML1A 5IO2A 5INYA 4XCSA 2CZ3A 3UIWA 4NHZA 2F8FA 5DCGA 1GSDA 1TK5B 4GLTA 4EXJA 5B6MA 3TJGA 4G10A 4TVEA 5KN2A 1SD8A 5H5SA 4IHUA 3HJMA 3LG6A 1JZDA 1SKWB 3GKMA 3UEMA 1PMTA 2LRTA 5FT3A 3US3A 6GSVA 3TJFA 3HVVA 3I6AA 4EDYA 1MD4A 3KZQA 1BYEA 3EU4A 1OC9A 1FB0A 2GQMA 1U3IA 3CSHA 3C8EA 5GAPD 3IAM2 2PUKC 5AN1A 2B5YA 1A8YA 4D73B 1SYXA 5DDLA 2ON5A 3ERFA 2H6XA 3O76A 1Z3EA 2F3MA 2HSYA 2L5LA 2FWEA 1R5PA 2YV9A 2X64A 2L5OA 2CAQA 5JWOB 4I97A 2B1LA 1T1VA 2VUPA 3FR3A 3CSIA 2G0FA 2PERA 6GSXA 1Z9HA 3A2XA 1JHBA 1QUWA 5E4WA 2L4CA 3IXRA 3LQ7A 3DGQA 1TW9A 2C0FA 4MK3A 3GNJA 3RHCA 5GSSA 5IPGA 3K8NA 5ECNB 2GQLA 5F07A 2RM5A 2H0IA 2VAFA 2YWIA 4KH7A 2I4AA 1J08A 1GL8A 1VF1A 1WMJA 6GSUA 4NMUA 5ECOB 4FH8A 2I3YA 1K3LA 1F3AA 4IGJA 1XCCA 1G6YA 4F0CA 3GH9A 3VWUA 2H0GA 2PU9C 3GL3A 2H1DA 5DQYA 3P2AA 4KDUA 2GTUA 5ID2B 2P0GA 3HY2A 4K7NA 4MCUA 1ERWA 4N0ZA 4XTSA 4RQXA 1UC7A 2H66A 2MMOA 4BVXA 3FZ5A 1OE7A 3ZMLA 2DLXA 1A2JA 4Z7XA 4KCAA 1M2BA 2GSRA 3D21A 1TDIA 1GNWA 3ZL5A 3DMLA 5HR2A 1OE8A 2YOIA 1F6MC 5IMCA 2DJ0A 3HA9A 5AGYA 2VM2A 4RQRA 5J5NA 1A8LA 2C3NA 2TRXA 3KCMA 1Z7PA 4WR4A 2RM6A 3F4RA 1TRVA 3ZLPA 5ELGA 1K0DA 3KMNA 5HR0A 1XXUA 1V9WA 3TKRA 3ME8A 1GUMA 5HR3A 20GSA 1H4OA 4EDZA 2GS3A 1QMVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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