1BEDA

Structure of disulfide oxidoreductase
Total Genus 56

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
181
structure length
181
Chain Sequence
AQFKEGEHYQVLKTPASSSPVVSEFFSFYCPHCNTFEPIIAQLKQQLPEGAKFQKNHVSFMGGNMGQAMSKAYATMIALEVEDKMVPVMFNRIHTLRKPPKDEQELRQIFLDEGIDAAKFDAAYNGFAVDSMVRRFDKQFQDSGLTGVPAVVVNNRYLVQGQSVKSLDEYFDLVNYLLTLK

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
TII1 (4-7)TVIII1 (1-4)TIV1 (5-8)S1 (9-11)TI2 (161-164)EMPTYS5 (157-159)TIV3 (17-20)TIV6 (152-155)S3 (52-57)S2 (21-26)TI1 (27-30)AH1 (31-46)TII2 (48-51)3H1 (63-65)TIV4 (60-63)AH2 (66-79)AH3 (81-95)S4 (150-153)TI'1 (153-156)AH7 (167-179)AH4 (103-112)AH5 (117-125)AH6 (127-143)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase
publication title Structure of TcpG, the DsbA protein folding catalyst from Vibrio cholerae.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DSBA OXIDOREDUCTASE
total genus 56
structure length 181
sequence length 181
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-09-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1bedA00
2AYTA 3US3A 1Z6NA 2LNSA 4WR5A 5CAXA 5JCGA 1SYXA 1T4ZA 2IN3A 2LSTA 4ZB8A 2G0FA 2H0HA 3TKSA 4TRXA 2FGXA 2KHPA 3C71A 2QGVA 5AN1A 3JCML 4GLTA 5AIVA 4IQAA 3GUSA 2LRTA 3VI5A 3HCZA 5L71A 1XW6A 4P3YB 1YJ6A 2IMKA 3H1NA 2C3NA 3Q19A 2H75A 1B48A 2H1GA 5B6NA 2FWGA 10GSA 4TVEA 2LUSA 3TKSC 4OD7A 2YZHA 1B9YC 1M9AA 3UBLA 4I97A 1V9WA 4PUFC 1O81A 4RQRA 3CTFA 5IIZA 2DIZA 3QDNA 12GSA 2KLXA 3GTUA 3Q74A 1ON4A 1VGLA 1A0RP 1JZOA 1JFUA 2P5RA 5H5RA 2HRFA 3DYRA 4EO3A 2EIRA 2WRTA 4KDXA 2VCXA 3DD3A 3WYWA 2HZFA 4KUNA 2F8FA 4XRAA 1THOA 2VM2A 2H1AA 5G31A 2CZ2A 2OE0A 5JCUA 3DMLA 3EC3A 2GT5A 3ZL5A 1Y25A 4AJ8A 1E2YA 3UBKA 3HKRA 4GCIA 2J9HA 2PUKC 4MH2A 3HDCA 1SL2B 3IOSA 4XHMA 2V1MA 4AF2A 3MWHA 1T4YA 4HZ2A 3E9JB 5KN1A 4MJCA 3HA9A 1EWXA 5ID2B 5DAKB 1K0DA 4I2UA 3HVXA 4AJ6A 3PR8A 3H93A 5IMVA 4GTUA 3KP8A 2JADA 2LTKA 1YF0A 4WR4A 4PUAA 1T8EB 4X43A 2CVDA 1MTCA 4IGJA 2YWNA 4E8EA 1EGRA 1BAYA 2A4VA 2Z9SA 1JLVA 4OFTA 2ZNMA 2H0IA 2H1BA 2JSZA 3WD6A 2YWOA 4WF4A 1RQMA 3EMPA 1PN9A 5F07A 2XC2A 3TUEA 6GSWA 3CTGA 4GRFA 1JHBA 1SKRB 5ECPB 2FHEA 5DJMA 2HYXA 3LWAA 1Z5YE 3QPMA 3TRXA 3VPQA 2DJ0A 3RHCA 2YZUA 1B8XA 1LBKA 1SJ6A 2DMLA 1S3DA 1K3LA 5FHIA 2HE3A 3CMIA 1HYUA 4MZCA 1H4OA 2R4VA 2IMFA 3ED3A 1R5AA 4Q5QA 3BJ5A 3GA4A 2YJHA 3V1WA 5DQSA 4H86A 1A0FA 1BYEA 2GQMA 5DCGA 1K0NA 1GSQA 4K0NA 3G7JA 1H75A 3RPNA 3TKSE 2PBJA 2KP1A 3UVHA 3M9JA 3F3QA 1E6BA 2GZZA 2YN1A 4LL1B 2FD3A 2AB6A 5AGYA 2NBSA 1EOHA 3GKXA 1JZDA 4ZILA 4IP1A 1FAAA 1U3AA 4N10A 3GV1A 1ZMAA 5FT3A 3RAZA 1TI1A 3HYPA 1MDIA 3BOAA 3MDKA 4ECIA 5KN2A 1TI3A 4X1UA 2L6DA 2PU9C 4EKZA 4ML6A 4TR3A 1XXUA 2C80A 1LU4A 5KEJA 3EURA 3GN3A 3Q18A 4F0BA 2VLUA 2E2GA 4MABA 4GSTA 3O6TA 5CYYA 5HR0A 2C0FA 1OE8A 4ZXGA 3N5OA 1F3AA 5EY6A 2I4AA 3VPTA 3O3TA 2FWEA 1YDKA 4EDYA 4DSQA 1GTIA 2CAIA 2MYGA 4DSSA 5J3RA 2WJUA 4ZBAA 1XW5A 3FR9A 2F51A 4WEYA 1AQVA 3KP9A 1TW9A 2RUEA 3WGXA 1W4VA 5IMCA 4X0XA 1VRSD 2C3TA 4KNDA 1A8YA 2R2JA 2EIOA 3C7MA 4ULXA 1BEDA 2E0QA 3KMNA 4IW9A 3IPZA 1T7PB 1Q4JA 2VIMA 4WBRD 3NZNA 3HJPA 2LQOA 1TRSA 5IM9A 2FWFA 3LYKA 4MLYA 3ERGA 4KA0A 3FR6A 1F3BA 2C0DA 1SD9A 6GSVA 2WB9A 3UIWA 2H70A 3DVWA 2XPEA 2QSIA 4ML1A 1WIKA 4BVYA 4GQCA 2B3SA 3ME7A 1ST9A 1U87A 3D5JA 3RBTA 4N0ZA 2CT6A 3MSZA 4YAVA 3I6AA 1GLQA 3QCPA 2LRCA 2B5EA 2FY6A 4ECCA 2LJRA 3LG6A 1X5EA 2AJQB 4POKA 3EU4A 2VAFA 2V6OA 3ERWA 3KTBA 5JWOB 1AW9A 1GP1A 3IK7A 4QL9A 1X9WB 1YKAA 1T3BA 1ZZYA 1FB6A 3DRNA 3IDVA 4Q5RA 1VF2A 3GX0A 2OE3A 4PQIA 4PURA 4WBJA 1DE2A 3FK8A 1FO5A 1XWGA 1S3AA 2NPBA 1Z7PA 1J08A 4KSOA 4E8HA 2L4QA 1AIUA 14GSA 2RLIA 4F82A 3ZIJA 6GSSA 1PX6A 3RHBA 2GSTA 4DVCA 4MJAA 4JRRA 3ZYWA 3F6FA 4EL1A 1GUHA 2MZCA 2CVKA 3KXOA 1O8WA 5ECLB 1ERVA 4D73A 1UC7A 5EPFA 3TOUA 3HXSA 1PQNA 4FO5A 3IXRA 4DSSB 2E2MA 3DXBA 3VWXA 3QAVA 3N9JA 2DBCA 2EC4A 1X5CA 1ZOFA 4JR4A 3P8WA 1GUKA 2YNXA 2H72A 1PMTA 1GSFA 3KH7A 1XWBA 1PKZA 4KB3A 4V2MA 3U6VA 3EWLA 3GURA 22GSA 4YQUA 1EOGA 2B6MA 5H5SA 1T1VA 3QR6A 3Q6OA 4DEJA 4OWYA 3TJBA 18GSA 2GS3A 3WT2A 1ERUA 3HZ8A 2VCQA 2YV7A 4F03A 3LYPA 2H6YA 2P0GA 2FNOA 1UN2A 4TXVA 4G19A 4JZQA 2RIIA 3VWUA 1R26A 1PKWA 1FVKA 4NPBA 4O7HA 1DSBA 1TK8B 4AGSA 3PINA 2YV9A 6GSXA 4ILFA 3KEBA 4WXTA 4K7NA 1U88A 2R37A 1M2BA 9GSSA 1QK8A 2M80A 2J23A 3PGTA 4BA7A 4XTSA 4GSNA 17GSA 1TU8A 1YY7A 3KCMA 4KAEA 2K6VA 4BL7A 1EV4A 2GVPA 3GNJA 1RW1A 5D9WA 2VOCA 4JR6A 4KCAA 2L6CA 2AV4A 3EE2A 3J7Yb 3IAM2 4CHSA 4O92A 4EXJA 2VD0A 2GLRA 2GSRA 2GT6A 1EEJA 2YCDA 3GH6A 1BX9A 1XCCA 1OKTA 13GSA 2MMOA 3IK9A 4KGIA 4K0GA 1FB0A 1ERTA 2MBSA 4K2DA 1SKSB 1HNBA 2H71A 5D8IA 5FWGA 2DLXA 4FYCA 4JU5A 2HSYA 4D73B 4KDYA 4L5LA 5ECRB 1F2EA 2IPAA 2HRNA 2M72A 2JACA 5AIXA 4G2EA 5ELAA 1AUCA 1U3IA 2LRNA 3CYNA 3TKPA 1X5DA 2REMA 2E7PA 2L5OA 3M9KA 4MF7A 2K9FA 1V2AA 2YP6A 2JL4A 3L78A 1OVNA 5GZZB 1SK1A 3ZLPA 2XHFA 1OAZA 4GSSA 3ZMKA 3MNGA 1N2AA 2HNLA 4XS4A 1QXHA 1FVJA 3TDGA 1A8LA 4MF6A 3CRTA 4Z7XA 1XVQA 2X8CA 1JZRA 2ALBA 4TR1B 1X0RA 2OJLA 4J56E 1ERWA 2DIYA 3D4MA 5ECKB 3DWVA 4ZBDA 5B7CA 1BQ7A 1ZGNA 1XWKA 4O32A 1XOBA 2LJKA 3D21A 5D9XA 3F0IA 5A4VA 1YEXA 5B6MA 3LEFA 1EGOA 2N5BA 5DJLA 5COHA 5IQYA 4YQVA 1TP9A 2RM6A 5D73A 1TTZA 1C72A 4NWYA 4ZL7A 3E3EA 1Z6MA 4HEA2 2IMDA 4MA9A 4RI6A 3E0UA 1URMA 2CX4A 3QFAC 1PL2A 1XWAA 3GL5A 5IOWA 3HY2A 3F63A 4IHUA 1XOAA 4HQSA 3MAKA 2WDUA 3K8NA 2ON5A 3LJRA 2B5YA 4MH3A 1FOVA 3ISOA 4BWSA 2YANA 3UMAA 3TRQA 4NMUA 2C1YA 1M7TA 2DJ3A 4EF0A 1MDJA 3GSSA 3LFLA 4IP6A 3LXZA 1XWCA 5F06A 4YQMA 1X9MB 5HR3A 1SL0B 1MD4A 2X8HA 1USBA 3M1GA 1G6WA 3FZAA 3WT1A 5HFKA 3QAWA 4TXOA 3TOTA 5GSSA 3A5WA 1ZYEA 4JEDA 2I81A 1Q98A 1F6MC 5DVBA 1K0CA 2YOIA 3GTUB 5ECHB 1ZYQB 3VFIA 4Q5FA 4MZBA 1G0TA 2TRCP 5G5FA 1WPIA 2OADA 3D4TA 1PL1A 1EP7A 3IC4A 4EDZA 4LA1A 2H6XA 4ZB9A 2VUPA 5F05A 3S9FA 4IKHA 2GQLA 2IMIA 11GSA 3L9VA 1N8JA 2LS5A 5D9TA 4NHZA 4KE3A 5JWQB 3TGZA 4KDUA 4XS1A 3DGQA 3ZRDA 1FW1A 4IQ1A 1TRWA 2IFQA 2R6KA 2TRXA 2DJJA 5HFGA 1AQWA 1ABAA 6GSYA 5G2ZA 2HZEA 5F0GA 3IHQA 4I5QA 3GKNA 3IA1A 1MDKA 2WULA 1YQ1A 3TRPA 3W8JA 2VM1A 2WCIA 2PMTA 1A2MA 3KD0A 4ZIJA 3TJFA 1TKDB 4K6XA 1AC1A 2HLSA 5A4WA 2AUVA 5GAND 3ZFBA 3BD2A 1K0MA 2YWIA 5C04A 5G30A 3HVSA 2DJ1A 2WS2A 2HSHA 2A2SA 2AAWA 2GSSA 4V1Ap 2PN8A 2ZCTA 2N5AA 2YPMA 5DQYA 1XIYA 1NM3A 3I43A 3UARA 5ECIB 1WOUA 4PQHA 3G7YA 5HR1A 1OKDA 1GSUA 2BTOT 3IAS2 5LCZA 3TJKA 1XBSA 1O73A 1TOFA 1GTAA 4L0WA 1SD8A 3G7IA 2A2RA 2NTOA 3I9V2 3L4NA 4MK3A 2VCVA 4IBPA 2B7KA 1V98A 4V1Ag 3ZITA 4MPFA 4ZL8A 1M99A 3A3TA 1I5GA 2C0EA 5HQPA 2O85A 2HXKA 2L59A 1U6TA 2C3QA 3ME8A 1WJKA 4J2FA 4TR0A 4N11A 3GL3A 1GL8A 4N30A 1SJZA 1GRXA 2IIYA 1HQOA 3EVIA 2NDOA 3SBCA 1K0OA 3D0ZA 2LJAA 4RUVA 4V2LA 5J41A 3VURA 1GLPA 3ZMLA 1HD2A 1PX7A 4FH8A 4NHWA 3O76A 4GQFA 2H66A 4HJMA 4JBBA 3F3RA 1PSQA 5ELGA 1SENA 3FZ5A 3U5RE 3SWLA 1HNCA 1JZWA 1OC9A 5HR2A 1KEBA 3IR4A 5HFIA 4OCEA 4BPYA 4K1FA 3KJYA 1K0BA 2X64A 1J0FA 4O5RA 5EL8A 3QMXA 1ILOA 1R4WA 2QC7A 4F0CA 1WE0A 3NOFA 2H1DA 3CRUA 5E59A 2L57A 1VF4A 5DALA 3APOA 1QUWA 2IJYA 4KH7A 4MZWA 2RUFA 1TU7A 5CO3A 3GRXA 3IE3A 3FHKA 3DEXA 2OKAA 3L9SA 1T00A 1HNAA 2B7JA 5DBQA 1ZCPA 1BG5A 1DBYA 1WWJA 3RDWA 2O87A 3FKFA 2CVBA 1M9BA 1JLWA 1EP8A 1GNEA 1SL1B 1A24A 3WGDA 4ECJA 2VLVA 6GSUA 4OO5A 3ZVJA 1B9XC 3FZ9A 2L4CA 2OA7A 5CNWA 1QQ2A 2VL9A 2M46A 4NV2A 2KUCA 3L0HA 4FYUA 5A5KA 4TOPA 3GSTA 5INYA 3UJ1A 1EV9A 4QQ7A 2ES7A 1UVZA 3C1SA 1GSYA 2VLTA 3F4TA 3TKQA 2GDRA 4LMVA 1VF3A 4OCFA 3BCIA 3ZVJD 2C0GA 2FUG2 3TCOA 3IRAA 3FEUA 3GMFA 1XW9A 1F37A 1W89A 3KH9A 2FWHA 3H4KA 4MMMA 1GULA 3OR5A 5ID2A 5DAKA 3LXTA 4GWRA 4RQXA 1ZL9A 3D6IA 2VCWA 3DKSA 1R5PA 1ACVA 2I9HA 1IYHA 1G6YA 1X9SB 3ERFA 5C00A 4ID0A 5J9BA 5IOXA 1SK0A 1WRYA 3VWWA 3NIVA 2F9SA 1I9DA 5JWRB 4LMWA 1OC9B 3GIXA 5IPGA 2O8VB 1GSDA 1NHYA 2R5GA 5J9CA 2IL3A 4Q5NA 1Z7RA 2FCHA 3M8NA 2V32A 5LD0A 4K9ZA 1EZKA 4ZL9A 2HFDA 5B8BA 5DALB 5IO0A 4XCSA 4MCUA 2GZYA 3DIEA 1K3OA 1FG4A 2H6ZA 5KN3A 5J5NA 1PD21 3GH9A 4QL7A 4OFNA 1M0UA 1A2LA 2CZ3A 3H8QA 4EE0A 1YZXA 3VI7A 6GSTA 4HI7A 3QD9A 4G9HA 4ACSA 3EMXA 5CP1A 3FR3A 2CQ9A 2GTUA 2B5XA 4IELA 1FHEA 1DE1A 2V41A 4LL4B 1CQGA 1SKWB 2PWJA 1OYJA 1TRVA 2RM5A 1GSEA 2AHEA 3LQ7A 2OBKA 3IBHA 5EVOA 2IMEA 4HS1A 5G1KA 2BJXA 4BWQA 1O7UA 1TK5B 3A2WA 5AISA 1K0AA 3QOUA 4EUYA 2DSAA 4NXIA 5H5QA 4I6XA 2LEGA 2MMNA 2YWMA 1PRXA 3ZTLA 4GF0A 2DC5A 5D96A 4TKYA 5D9VA 4XIHA 2FLSA 7GSSA 4IVFA 5IMAA 2TIRA 4F2IA 1NSWA 2H8LA 2QKEA 4IJIA 1NW2A 1TRUA 1ML6A 5IMDA 3W8SA 3C73A 2ZUPA 3ZIVA 5GAPD 1KTEA 4IS0A 1MEKA 4JE1A 3APSA 4HQZA 2B1KA 4G10A 3FZ4A 3GKMA 2PVOC 1O6JA 20GSA 4WF5A 1YEPA 2H30A 2N5FA 5D93A 2XBQA 4LLRA 4GXZA 5ECOB 2D2ZA 5ECSA 3BCKA 1LJRA 3M3MA 4FYBA 4XRDA 1S3CA 1SJIA 3HVVA 4K7OA 4KSMA 4XS6A 4WETA 2L5LA 1B4PA 3I69A 4ZB6A 3ZFLA 2OACA 1GWCA 4HU9A 1V57A 1GTUA 2JU5A 3C8EA 1KBNA 1TJDA 2H0GA 4MJBA 2H74A 4MP4A 3UEMA 2GGTA 2K8VA 3H79A 4NAXA 3D22A 4XS4B 3FYGA 1SK2A 4HJ2A 3EINA 4HOJA 3CXGA 3KTLA 3TB2A 1A23A 2LNTA 4TW5A 3QAGA 3APQA 4K7IA 3UL3A 4POBA 1G7EA 16GSA 4POLA 3TKRA 3PH9A 2LV3A 3TJGA 1AAZA 4V2NA 4FIWA 3W6GA 4IN0A 3P90A 5B8AA 2G2QA 2WZ9A 1PA3A 5G5EA 2GZPA 1J9BA 2ON7A 2CAQA 3RPPA 2DJ2A 1GH2A 4WKWA 1NHOA 1V40A 2F8AA 5IMZA 4BVXA 5DCHA 1TK0B 4NV5A 3TJJA 2H76A 5IO2A 3UAPA 1OE7A 3P7XA 2NVLA 2JZTA 4POMA 1RK4A 3LSZA 1TDIA 5J4UA 3EYTA 2JZRA 5CREA 4OFMA 2IWTA 4DSRA 2WFCA 5LNKe 3UVTA 4CW9A 4PXOA 1OC3A 2PERA 5A4UA 2R3XA 2F3MA 5G1LA 4TXOB 2VL3A 1XZOA 3KMOA 5E4WA 8GSSA 1CQHA 3GYKA 4PQ1A 3GFKA 4MJEA 4I8BA 1M2AA 2O7KA 4TN8A 5IPHA 3L9UA 3CSHA 2DMMA 3F4SA 2KP2A 3CSJA 4HU7A 3F6DA 1G7OA 3AY8A 5ABRA 2C8UA 4PNGA 2V6KA 4PGTA 3GX8A 5F8BA 4YH2A 5CRDA 1XVWA 1AXDA 2X8GA 3LORA 4K8MA 4L0UA 1YKCA 2XPDA 1PGTA 3HJMA 1GNWA 1O8XA 2XBIA 3CSIA 2CA8A 3WGEA 1V58A 2C4JA 4KX4A 4IJ3A 1O85A 2CV4A 4ZBBA 2VD1A 2MMZA 3HD5A 3ZZXA 3FW2A 1VF1A 1DUGA 2H01A 3VWVA 2IFQB 1WP0A 1GUMA 2LKUA 5CRHA 5CRGA 2P31A 3LGCA 1M2DA 3P2AA 2HZEB 4HUAA 2MMAA 4RI7A 5IMFA 2FA4A 2PPTA 2H19A 4KW6A 5ECNB 1Z3EA 3FY7A 3HHVA 2CX3A 3HJOA 3GHAA 4N0VA 1A2JA 4I2TA 2V2GA 4F9ZA 3KZQA 4TR4A 2P5QA 1TXXA 1QFNA 4HDEA 3EU3A 2VCTA 5KN0A 1F9MA 4PNFA 3IV4A 4J57E 19GSA 1AQXA 4PX1A 1SU9A 4OO4A 2I3YA 3QFBC 3A2XA 4AJ7A 2O89A 5ECQB 3UOMA 5ECMB 3R2QA 3DVXA 3FRCA 2VL2A 3KM6A 4MDCA 3M0FA 3BBYA 1YF1A 3VK9A 1GSSA 1KNGA 2PVQA 2KOKA 2JSYA 2HI7A 2GQKA 3C1RA 3F9UA 5ENUA 1UA5A 2HT9A 2K8SA 2VL2C 1OC8A 2H73A 3A2VA 2DJKA 1BJXA 2GSQA 3GKKA 3KGKA 5GSTA 4MF5A 3F4RA 2WGRA 2X99A 1XPVA 1WMJA 4TR1A 1XFLA 2VO4A 3VLNA 2FA8A 3CBUA 3HZ4A 4MPGA 2JZSA 3G9BA 4OMVA 4YAPA 4ECBA 2OE1A 1GTBA 1QMVA 2B1LA 2YJ7A 4KCEA 4L5OA 4CDOA 1K3YA 2I1UA 2LQQA 2OBIA 4ISDA 1QGVA 1B4QA 1IYIA 3J7Yk 2PGTA 1Y6EA 5CRWA 4EVMA 5JCWA 4EC0A 2EIQA 2VCZA 1EEMA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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