1CQHA

High resolution solution nmr structure of mixed disulfide intermediate between human thioredoxin (c35a, c62a, c69a, c73a) mutant and a 13 residue peptide comprising its target site in human ref-1 (residues 59-71 of the p50 subunit of nfkb), nmr, minimized average structure
Total Genus 24
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
24
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPAKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDAQDVASEAEVKATPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The solution structure of human thioredoxin complexed with its target from Ref-1 reveals peptide chain reversal.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
molecule tags Complex (electron transport/peptide)
source organism Homo sapiens
total genus 24
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-04-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1cqhA00
2DLXA 3O76A 3N9JA 2IFQB 4OO5A 4L8EA 4MMMA 3TJGA 3D6IA 3CTGA 1ERWA 1GUMA 1GUHA 2FHEA 1GSQA 1XW6A 3LYKA 4MZBA 3KTLA 4K7NA 3UEMA 2F8FA 5D9VA 1R4WA 4HI7A 3VPQA 4V2NA 1PL1A 4K7IA 3ZRDA 3DMLA 1AW9A 5L71A 1XWCA 1K0BA 4G9HA 6GSVA 2ZNMA 3TKSE 5J5NA 4ZBBA 2JZTA 1GLPA 4K2DA 3VPTA 1DE1A 1K0OA 1GTAA 3A2XA 2GQMA 4LL1B 4POKA 2DIYA 1T00A 4WBRD 1W4VA 2EIOA 3GMFA 5DJLA 1THXA 3M8NA 3D0ZA 1XBSA 1XXUA 3VWXA 3TJBA 3FYGA 8GSSA 1SU9A 3TB2A 3ZREA 3TOUA 1OC9B 2GTUA 5G5EA 3DEXA 3DD3A 2OE3A 2NBSA 5KN3A 3DYRA 2AYTA 4D73B 5EVOA 2DBCA 2VL9A 1V58A 3KMNA 4WF5A 1ZZYA 4GWRA 1K0NA 1DUGA 4L0WA 1V57A 4HEA2 2CZ3A 4TW5A 4MPGA 4TR0A 1M9BA 3IPZA 3H79A 2C3NA 5A4UA 3VK9A 4EE0A 3A5WA 5F05A 1PGTA 2FWEA 4JRRA 1JZOA 3UBLA 3R2QA 1GH2A 2JL4A 5GSTA 2OADA 4QQ7A 2JADA 3GFKA 2L4QA 4XCSA 2H72A 2YNXA 1ZMAA 2LQOA 3I9V2 3IE3A 1PSQA 2PWJA 2FWHA 3HXSA 5IMVA 3Q19A 4DVCA 2HRNA 1K3LA 2IMKA 4L5OA 1LU4A 2C1YA 2R3XA 1GSEA 2ALBA 3U6VA 2DJ0A 1T7PB 3CBUA 3M9JA 2FUG2 1GLQA 3ME7A 3U5RE 3APSA 2GDRA 2H71A 3EC3A 2IJYA 1U3IA 5G2ZA 5IMFA 4ZBDA 3HKRA 5AN1A 3HVXA 3KP9A 4ZILA 2CQ9A 3LGCA 4DSSB 2IFQA 2HZEB 4WBJA 5ECNB 1QXHA 4IELA 4Q5FA 2R4VA 1ERTA 4K1FA 2GZYA 3D22A 2LQQA 3VFIA 3HZ8A 1NHYA 2KP2A 3DKSA 1HQOA 1XIYA 2H73A 3UIWA 1G7OA 1SKRB 4N10A 4XHMA 5KN0A 3EMPA 2H70A 2B1LA 5GAND 3GURA 2E2MA 1QUWA 3UVHA 1AUCA 5GAPD 5IMCA 1TOFA 3BBYA 4E8EA 3RBTA 2RIIA 1J0FA 2GSSA 2H30A 3JCML 3D5JA 1FO5A 2AJQB 3I6AA 2BJXA 1Y25A 3PH9A 2OACA 5D9WA 1F3AA 4K6XA 2OA7A 1PQNA 2JZSA 2CV4A 2CVBA 2PPTA 4KDXA 3IK7A 2OBKA 1MD4A 4KX4A 1ILOA 4KGIA 4D73A 3RPPA 3MWHA 2VCZA 4KSMA 4ZB6A 1SJZA 4TR4A 1A8YA 1ZOFA 3CYNA 1V98A 1X5CA 1X9WB 3F4RA 3FR3A 3CSHA 1S3DA 2H01A 2ZCTA 3ZIJA 5ECKB 2GS3A 5ABRA 3H8QA 4PGTA 1ZYQB 1JZWA 3GV1A 4O7HA 3TKPA 1X5DA 1KNGA 4HJ2A 2LSTA 1WE0A 2A2RA 3P90A 3LXZA 2M80A 1FVKA 5F8BA 4PNFA 3IDVA 2E0QA 4RQXA 3APQA 1OE8A 4CW9A 1Z3EA 3BJ5A 3QFBC 3IBHA 3ERWA 3PINA 1GTUA 1H4OA 2I1UA 2HSYA 2O7KA 4KDUA 5ECQB 1MDIA 1FG4A 4RUVA 4KW6A 2QC7A 4PX1A 3TJFA 1UC7A 1M99A 5JCWA 2HE3A 2JU5A 2E7PA 2BTOT 2EC4A 5GSSA 2GZZA 2OJLA 1FW1A 4OFMA 4OMVA 3VI7A 4KNDA 3IA1A 4DSSA 4EF0A 2GQKA 1YDKA 2HZEA 2R5GA 3J7Yk 3C7MA 4KUNA 5IMZA 1YF1A 5AISA 2MYGA 3M9KA 4IJIA 4RI6A 4OWYA 4GSNA 1BQ7A 2V32A 2H74A 5A4VA 3GTUB 2YWMA 2I3YA 1AQVA 3GHAA 2I4AA 3GH9A 2H0GA 2RUFA 4IHUA 2YV9A 4MA9A 4EKZA 2CT6A 4IN0A 4IGJA 1O81A 1QK8A 1GL8A 1A8LA 1M7TA 5JWQB 4GQCA 4J56E 1ERUA 3MDKA 4ECJA 1ABAA 3CXGA 3ZVJD 1B48A 4POBA 4BWQA 1VF4A 4X0XA 4WF4A 1QGVA 5HR3A 4LLRA 3KTBA 3A3TA 7GSSA 2HZFA 3HVVA 1B9YC 1V2AA 4I2UA 1JLVA 2C4JA 4ZBAA 5LD0A 5ECIB 1SL0B 3WT1A 1JZDA 4J2FA 2YWNA 1AXDA 3I43A 2C3QA 2F51A 4BA7A 3QAGA 4MP4A 1SL2B 5FT3A 4PNGA 1XVQA 3RPNA 1G6YA 4N0VA 3SBCA 4JR6A 2GQLA 3ZFBA 5DAKB 1M0UA 1YZXA 3WGDA 1PA3A 2M72A 1GNEA 3TKSC 1JLWA 3EU4A 1O85A 2L5LA 1GSUA 1N8JA 4V2LA 2K6VA 13GSA 5G1LA 1SYXA 4G10A 3RDWA 4JZQA 3LG6A 2C0FA 1TK5B 4JU5A 5AIXA 1O7UA 2V2GA 4WXTA 22GSA 2L6CA 4EVMA 4NV2A 1AQXA 3KGKA 5G5FA 4L5LA 2H76A 2AB6A 4P3YB 2MBTA 4YAPA 5DQYA 2VAFA 4KE3A 4BVYA 5FHIA 3LXTA 3KEBA 2A2SA 3O6TA 4ECCA 3IRAA 1BYEA 4ULXA 1SK0A 4OFTA 3VI5A 1TDIA 3KM6A 3QMXA 1PRXA 2FA8A 4EDZA 4OO4A 1U6TA 3K8NA 2L5OA 1GSSA 3NIVA 16GSA 1Z7PA 4HQSA 1HYUA 1MD3A 2JZRA 2N5BA 2LNSA 1SD8A 1J9BA 1U88A 4WEYA 5J9BA 1V9WA 1TKDB 3GX8A 4ML1A 2PN8A 3GSTA 2WZ9A 3IV4A 3ZIVA 5H5QA 1ST9A 3F9UA 5J41A 3EYTA 3FZAA 3ZYWA 1FOVA 3TKRA 1PX7A 4YQUA 2RUEA 1K3OA 4ID0A 4MDCA 2X8HA 2XBQA 3ED3A 5DDLA 2VIMA 4K8MA 1EGOA 2YJHA 3PGTA 1NM3A 3GKXA 1ACVA 1AAZA 2AHEA 2LJRA 2FY6A 5GZZB 4ZB8A 5DAKA 2GZPA 2NTOA 2VCWA 2DJJA 1QQ2A 4XS4A 1CQHA 1O8WA 4K9ZA 5B6MA 2ES7A 1T4ZA 3G7JA 5ELGA 2VLUA 5A4WA 2FWFA 1FVJA 2H19A 4NAXA 2F8AA 4NWYA 3GYKA 1GSDA 1BEDA 2N5AA 4I8BA 1OC8A 4WETA 3DXBA 1K0CA 4HS1A 5ECOB 2XBIA 1F3BA 4V1Ap 3C73A 1GRXA 1XWAA 2NVLA 1G6WA 3C71A 4Z7XA 5CNWA 4F2IA 5JCGA 2WDUA 1SJ6A 1SK1A 3Q74A 1YJ6A 3BD2A 2E2GA 1RQMA 4DSRA 2IL3A 3EWLA 1WWJA 5D9TA 2CAQA 3LEFA 4RI7A 2V41A 11GSA 3D4TA 3WGEA 4ZL7A 2ON5A 3FZ5A 3KCMA 2X8CA 3NZNA 1OKDA 2YZHA 2HFDA 3RHBA 2AUVA 2MMAA 3HDCA 4EL1A 4TRXA 2B5XA 5DBQA 4IS0A 3IK9A 3A2WA 2YP6A 2CA8A 4OD7A 3FZ9A 3ISOA 2MZCA 5G30A 2H0IA 2H6ZA 3CRUA 4PQIA 3FZ4A 5CRDA 3MNGA 4QL7A 4ILFA 3FRCA 2REMA 2DC5A 1BX9A 6GSSA 1O6JA 1GULA 4AF2A 1NSWA 3UAPA 2R6KA 4MF6A 1B4QA 4FH8A 1X0RA 3EVIA 3VLNA 4OFNA 4ZB9A 4NHZA 2LS5A 6GSXA 2VUPA 3C8EA 4GLTA 1T3BA 2VM2A 3WYWA 2OE0A 3IAM2 2FNOA 4PQHA 5EL8A 2WS2A 4HU9A 1E6BA 3HHVA 2NPBA 4K0NA 1HD2A 3GIXA 3F4SA 3E9JB 1UVZA 5FWGA 4KSOA 2YV7A 3E0UA 5F06A 1TI3A 4F03A 3FY7A 2AV4A 2K18A 5HR1A 5HFIA 1RK4A 3HZ4A 3PR8A 4IW9A 2ZUPA 5ECSA 6GSWA 5ECPB 3ZFLA 1OC9A 2HLSA 1Z7RA 4V2MA 1WP0A 1EZKA 2OKAA 4KDYA 1UN2A 1XWGA 3GUSA 5ECHB 1TI1A 1TRVA 1O8XA 1PD21 3D4MA 1EOGA 1DSBA 3TOTA 5E4WA 1XFLA 3M0FA 1TJDA 1A0RP 2RM5A 3FR6A 2TRXA 1PKZA 1R5AA 2PGTA 3LQ7A 5KEJA 4HUAA 4K7OA 2B1KA 1YQ1A 4F82A 1WPIA 1LBKA 5D93A 2KP1A 2R37A 2FCHA 5CYYA 3ZZXA 3IXRA 1TTZA 5IMDA 1GP1A 1YY7A 2WGRA 4XRAA 12GSA 2QSIA 5ELAA 3CSJA 1EV9A 3KD0A 3TKQA 3GNJA 1A2JA 2VL3A 4HZ4A 4K0GA 2GT5A 3FR9A 3QDNA 3NOFA 5H5SA 4IKHA 3F4TA 2GT6A 2O87A 2LTKA 1GSFA 2A4VA 3G7IA 1KBNA 3IC4A 1PN9A 2YJ7A 3ZITA 1WIKA 3UOMA 4I6XA 2GGTA 1USBA 4YQVA 2R2JA 3GKKA 4POMA 1PMTA 4MJCA 4JEDA 5H5RA 3O3TA 2YWIA 3Q6OA 1SK2A 3FKFA 4ML6A 1I9DA 5J4UA 1ML6A 1HNAA 5HFGA 3TRQA 2BMXA 3G9BA 1OVNA 1TRSA 4FYUA 3UVTA 1EP7A 5JWRB 5G31A 2JACA 3QFAC 5D9XA 2O85A 1F2EA 10GSA 4Q5QA 2KOKA 1FHEA 4TR3A 1ZGNA 3L4NA 2P5QA 3LFLA 3WT2A 2L57A 5B8BA 5CO3A 2MMNA 4TXOB 2H0HA 3W8SA 3HVSA 4Q5RA 2D2ZA 2VCTA 4BWSA 2PERA 3ERGA 3TKSA 1SKSB 1TP9A 4AJ6A 5HQPA 1GUKA 2DJ2A 1S3AA 5CAXA 2OBIA 3M1GA 2G2QA 4MABA 3HY2A 1XWKA 2I81A 1G0TA 1YF0A 3TRPA 2IMFA 2K9FA 1J08A 5AIVA 2CZ2A 4KA0A 2J9HA 3KH9A 2V6KA 1A2MA 3GKNA 3I69A 1IYIA 3WGXA 1Q4JA 4POLA 3KJYA 2HYXA 2CX4A 1A2LA 5CREA 2XPEA 1XW5A 1VF1A 2XPDA 3UMAA 3RHCA 5A5KA 2YANA 2EIRA 4EO3A 2GLRA 3GA4A 1OAZA 2LRTA 1K3YA 2YWOA 3EE2A 1TRUA 2FD3A 2MMOA 2J23A 3KH7A 3CTFA 2IMDA 1ERVA 2KUCA 1YEXA 4IJ3A 4NMUA 3KIJA 2O8VB 5EY6A 4WR5A 1K0DA 1DBYA 4L0UA 2B6MA 3OR5A 2DMLA 2HT9A 3HYPA 4NXIA 4N30A 2GVPA 1SL1B 2O89A 5DJMA 5KN1A 4I2TA 4TKYA 1M2AA 4TN8A 3GKMA 3QAVA 4ACSA 2M46A 3L9UA 6GSYA 3ZMLA 4MJAA 2RM6A 1A23A 2Z9SA 3AY8A 4AJ7A 1OE7A 6GSTA 2CVDA 3MAKA 4MF7A 1CQGA 2WFCA 2DJ3A 3N5OA 4MLYA 1WJKA 3GTUA 1R5PA 2LNTA 4GSSA 3M3MA 14GSA 2IWTA 4FIWA 4LL4B 4PUAA 3V1WA 1QMVA 1XOBA 3L0HA 1VF2A 3SWLA 3H1NA 2VD0A 2H66A 4TXOA 1WMJA 4O5RA 3QOUA 2LV3A 4G2EA 4G19A 2H6YA 2I9HA 4IQAA 4ZL8A 3TJJA 1BAYA 2C0EA 4IQ1A 1EWXA 1T4YA 1SKWB 1GNWA 1ON4A 2P0GA 3QCPA 1WOUA 2IMEA 2B5YA 2CAIA 19GSA 3VWWA 1X9SB 4KCEA 4V1Ag 1M9AA 1IYHA 1OKTA 4BPYA 2HXKA 1K0AA 5IOWA 1MDKA 2WULA 4H86A 3HCZA 4WR4A 4BVXA 17GSA 1GWCA 1JFUA 1B4PA 4HZ2A 4XS1A 3LORA 4EXJA 2LRCA 5ECLB 1S3CA 1BG5A 5COHA 3CSIA 2QKEA 3EURA 3QD9A 2C3TA 2C0GA 2V6OA 2HSHA 1AQWA 4KH7A 4JR4A 2NDOA 1F6MC 4MK3A 2TIRA 1YEPA 4X1UA 1F37A 3ZVJA 3ZLPA 2FLSA 1SJIA 3F0IA 3LSZA 1OC3A 5KN2A 1EGRA 4FYBA 4MZCA 2RLIA 5ECRB 2YPMA 1YKAA 3FEUA 1X5EA 1GSYA 2HRFA 3LYPA 5E59A 5CRHA 2MMZA 3G7YA 3F6DA 4YQMA 3DVXA 3IHQA 4TVEA 1XPVA 3UL3A 5DQSA 4GTUA 5IO2A 3HD5A 4GSTA 5HR2A 2HNLA 1AIUA 4IP6A 1A0FA 2WJUA 2MBSA 1HNCA 4TXVA 4ZIJA 4DEJA 4EUYA 3IAS2 4FYCA 4I97A 4XTSA 1EOHA 4TR1B 4ECIA 2FA4A 1BJXA 1U87A 2VCQA 2P31A 2H1GA 20GSA 1RW1A 2F9SA 1XZOA 4XS6A 1T1VA 5DALB 4YAVA 3TGZA 5DCGA 4Q5NA 2LKUA 3US3A 4GCIA 1U3AA 4YH2A 2GSTA 3GH6A 3P7XA 1H75A 4MPFA 1KTEA 2YOIA 1WRYA 1GTBA 4IP1A 1B8XA 18GSA 4F0CA 4XRDA 2X8GA 2YN1A 3TJKA 1M2BA 2VD1A 3C1SA 4MF5A 2X99A 2KHPA 3LJRA 2PVQA 5DVBA 3EMXA 4HJMA 1MTCA 2B7KA 5IQYA 1Y6EA 4N11A 3GL3A 1OYJA 5CRGA 2FWGA 2KLXA 1B9XC 3QPMA 3FHKA 2K8SA 2DJ1A 4KB3A 3HJMA 3D21A 2TRCP 4O92A 1R26A 3L9SA 1F9MA 4AJ8A 3ERFA 2DMMA 1FAAA 4OCEA 1XWBA 2IN3A 4NHWA 3A2VA 3VWVA 1FB6A 6GSUA 5HFKA 1EP8A 1Z5YE 3QAWA 2WCIA 3DWVA 2H8LA 2VLVA 1TW9A 2G0FA 4MJEA 2GSRA 1ZCPA 3KP8A 5C00A 2PVOC 1QFNA 1GTIA 5AGYA 1I5GA 3F63A 5B7CA 1V40A 3GN3A 3L9VA 2IIYA 3GRXA 1YKCA 4PUFC 1W89A 2QGVA 4MCUA 2VO4A 1XCCA 5LNKe 5IPHA 3EU3A 3W8JA 3TUEA 4CDOA 3EINA 3ZL5A 4GQFA 1X9MB 2JSYA 4HQZA 3GL5A 5INYA 3TDGA 3FK8A 4AGSA 2PU9C 4KCAA 4F0BA 3CMIA 2PMTA 1E2YA 1Z6MA 1NHOA 4XIHA 4ZXGA 1Q98A 4PXOA 5F0GA 3BOAA 1XW9A 3BCKA 4TR1A 2H1DA 2VM1A 1NW2A 3F3RA 2C8UA 2JSZA 4QL9A 2B3SA 2K8VA 1TU7A 2B7JA 2H1AA 1MDJA 5DALA 1A24A 5HR0A 2PUKC 5CRWA 1VRSD 5ID2B 3IR4A 1TK0B 1XOAA 2B5EA 1N2AA 5ENUA 1HNBA 1EV4A 1Z9HA 1EEMA 4MH3A 2IPAA 4DSQA 5D8IA 4FO5A 2EIQA 4TOPA 4ECBA 5ECMB 4N0ZA 1O73A 4LMWA 4E8HA 2DSAA 1LJRA 4BL7A 5J9CA 3ZTLA 2CX3A 1TRWA 4OCFA 3HJOA 3ME8A 3RAZA 2L6DA 3HA9A 3F3QA 4GRFA 3DIEA 2F3MA 4I5QA 2VCVA 1URMA 3UBKA 1PX6A 2V1MA 4JBBA 2H6XA 2GSQA 3H4KA 3P2AA 2XC2A 3GX0A 4NPBA 1XVWA 3KMOA 4NV5A 1EEJA 4MH2A 4ISDA 4J57E 1SENA 1UA5A 2C0DA 5IMAA 5D96A 5IPGA 5LCZA 3L78A 5C04A 4GXZA 4HU7A 2C80A 3DRNA 2IMIA 1KEBA 2PBJA 4MJBA 3P8WA 2LUSA 4MZWA 4CHSA 2N5FA 2X64A 1PKWA 3DVWA 1TU8A 1JHBA 2WRTA 1M2DA 3VWUA 1C72A 1PL2A 2XHFA 3FW2A 2VL2A 4O32A 2LRNA 4EC0A 1FB0A 5IOXA 2YCDA 3WD6A 4HOJA 3IOSA 5IM9A 3TCOA 4XS4B 4JE1A 4HDEA 4PURA 3APOA 4PQ1A 2DIZA 1THOA 2FGXA 1ZL9A 4LMVA 2AAWA 3W6GA 1Z6NA 2H1BA 4F9ZA 1SD9A 5CP1A 3GSSA 1MEKA 1VGLA 2DJKA 4LA1A 4KAEA 4RQRA 5JCUA 2LJAA 2L59A 4IBPA 3TRXA 3UJ1A 2VL2C 3E3EA 5B6NA 2VLTA 1G7EA 1AC1A 1ZYEA 2OE1A 9GSSA 3Q18A 2H75A 5JWOB 5ID2A 3KZQA 3CRTA 2HI7A 3F6FA 4GF0A 4X43A 1TXXA 2YZUA 4ZL9A 3LWAA 2ON7A 5D73A 2CVKA 3BCIA 3C1RA 1JZRA 3J7Yb 4WKWA 5IO0A 5F07A 5B8AA 3ZMKA 2LEGA 1VF3A 3F8UA 4IVFA 5DCHA 2VOCA 1SYRA 2L4CA 3KXOA 1R7HA 1K0MA 3S9FA 3MSZA 2P5RA 5G1KA 3DGQA 1T8EB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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