1DBYA

Nmr structures of chloroplast thioredoxin m ch2 from the green alga chlamydomonas reinhardtii
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
MEAGAVNDDTFKNVVLESSVPVLVDFWAPWCGPCRIIAPVVDEIAGEYKDKLKCVKLNTDESPNVASEYGIRSIPTIMVFKGGKKCETIIGAVPKATIVQTVEKYLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title NMR structures of thioredoxin m from the green alga Chlamydomonas reinhardtii.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHLOROPLAST THIOREDOXIN M CH2
molecule tags Oxidoreductase
source organism Chlamydomonas reinhardtii
total genus 36
structure length 107
sequence length 107
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1dbyA00
2OJLA 2KUCA 1KBNA 2I3YA 2H73A 4PUFC 5J9BA 4FYUA 3LG6A 5DALB 2H75A 4G10A 1GSUA 3QAGA 2C3NA 4K7NA 2BTOT 3QFAC 2DMMA 1TRVA 2WULA 3A3TA 2ALBA 2V6OA 1JZOA 4JR6A 3VWVA 1TKDB 1AQVA 4LL1B 1XW9A 3CSHA 2L4CA 4ZL9A 1PRXA 1SK0A 4J2FA 1GNEA 4IGJA 3VPTA 3S9FA 4IBPA 6GSUA 4G9HA 2VLTA 5F07A 17GSA 3IK7A 2LRCA 3C1RA 3SWLA 1WMJA 4XTSA 5ECOB 4ULXA 3ZVJD 4TVEA 3QFBC 4Q5RA 4K0NA 3GH6A 3ZZXA 4TXVA 1PSQA 2E0QA 3IPZA 3IA1A 2YANA 2VL9A 2VD1A 5HR0A 1M7TA 4MF5A 4PXOA 5F06A 4I2TA 4MCUA 4OCFA 3RHCA 5ECIB 1C72A 5ECSA 2JZSA 3GYKA 13GSA 4J56E 5J41A 4MZBA 1OVNA 4G2EA 4DVCA 3M0FA 3GX8A 4P3YB 4BL7A 5CRDA 2X8HA 3U5RE 3W8JA 3DRNA 2NPBA 2Z9SA 4MH2A 2E2GA 2V32A 1M0UA 5EPFA 3FR3A 2DC5A 1OC3A 2H66A 3FKFA 4LLRA 4F9ZA 2H6ZA 1A8YA 2VLUA 3L9UA 1RK4A 1TTZA 3DXBA 6GSWA 2B1LA 5IM9A 10GSA 3SBCA 2FLSA 2HZEA 1FVKA 1XOAA 3LGCA 5H5QA 2YP6A 3GKKA 5A5KA 1EOGA 4AJ7A 2O8VB 4KE3A 3H8QA 4PURA 2CVDA 2QSIA 5DJMA 3ZREA 3GNJA 1X9SB 1RQMA 1VGLA 2WDUA 3FZ5A 5JCWA 1KNGA 2PU9C 1ERTA 1GUMA 4HJ2A 2CX4A 1WP0A 1GUKA 2HXKA 1SK1A 3ISOA 1VF4A 1UC7A 1PL2A 5COHA 2DJJA 3QPMA 4FO5A 3PINA 1SKRB 4ZBAA 2N5AA 3A2VA 2FA8A 2H01A 4V2MA 2IFQA 5CRGA 4F03A 3A2WA 1UVZA 1RW1A 2K8VA 4FYBA 1NHOA 3EURA 4TXOA 4JZQA 4K0GA 4TOPA 3TGZA 2IPAA 1XWBA 2C0FA 2E2MA 5EVOA 3G7IA 2I81A 2VL2A 4E8EA 4HQSA 1BQ7A 4NHWA 3UVHA 1F37A 3EVIA 4RQRA 4QQ7A 1AUCA 2XPDA 4POKA 2AHEA 2VCXA 3D5JA 3L78A 5C00A 2FWEA 2GS3A 3DD3A 1ZL9A 2VL3A 4IELA 2FWHA 4GQFA 2CAIA 2B7JA 4WR4A 5ID2B 2R37A 4F0CA 1U6TA 1MTCA 1GL8A 1R5PA 2DJ0A 2OBIA 5DCHA 2DJKA 1MD3A 3E0UA 2LEGA 2VOCA 14GSA 4I8BA 3LORA 4OFMA 4MA9A 4JU5A 1T4ZA 5J5NA 2OA7A 1XWCA 2HZFA 4TR1B 3DYRA 4X0XA 4GWRA 3IXRA 1JLVA 4MMMA 2GSQA 1YY7A 2P31A 4HJMA 4MJAA 2GQLA 4HUAA 3KMOA 3CTGA 2I4AA 2MMOA 3F0IA 2R3XA 4PQ1A 5IO2A 4KGIA 3TOTA 1EP8A 3C71A 2ES7A 5J4UA 2PVOC 3LXTA 3EINA 1EGOA 2CT6A 3F4TA 1O81A 1F3AA 1NM3A 1YDKA 2FUG2 2JADA 5LNKe 4N10A 3L0HA 2H1AA 2CQ9A 2JACA 2L57A 3KXOA 5CRWA 3F4RA 2CA8A 3IAM2 4ZBBA 2H1BA 3CYNA 4O7HA 4NMUA 2IWTA 5G5FA 1T1VA 5EL8A 3DWVA 1FVJA 3L9SA 2H72A 3KCMA 2FWFA 1URMA 4MPGA 4POLA 2HNLA 4LL4B 4WEYA 3TB2A 1TK0B 2VL2C 1HNCA 4K2DA 3RBTA 4DSRA 3F4SA 2HFDA 1A23A 2HE3A 2A2RA 4X43A 3I9V2 3KEBA 2M46A 3UVTA 5CAXA 3VWWA 1X5EA 3APOA 1M99A 4MLYA 3HHVA 4ZB9A 4HEA2 1Z3EA 1ACVA 1JZRA 3HDCA 12GSA 1B8XA 4ILFA 2KOKA 2VAFA 4XHMA 1PQNA 2FWGA 4V1Ag 5D9VA 5ECPB 4HI7A 1O7UA 2LTKA 4EC0A 2A2SA 1G6YA 5L71A 1OE7A 2C3QA 3QAVA 1EWXA 2DJ3A 3VI7A 2H30A 1DE1A 3W6GA 3ZFLA 3N9JA 3BCKA 1X5CA 4ECIA 1G7EA 2GZPA 4HU7A 3CSIA 5G1LA 5ECQB 5DQYA 2B5YA 2YN1A 3OR5A 1G6WA 1JLWA 2B1KA 2C3TA 4MP4A 2YWNA 3WD6A 3M9KA 2HYXA 3MAKA 1SL2B 3DVXA 2WCIA 4NAXA 2H0GA 2R2JA 2R6KA 3P7XA 6GSVA 1GTUA 1O85A 1S3DA 1O6JA 1K0MA 3KP8A 1PN9A 3TKQA 4I6XA 3P90A 1HNAA 1XVWA 4JRRA 3IRAA 2HI7A 4J57E 1PMTA 5CO3A 1SKWB 5IQYA 3KJYA 4ML6A 5JWRB 3V1WA 3TKPA 5HFGA 5F05A 1JZDA 3G7YA 2IMFA 4WF5A 3VI5A 1JZWA 2I9HA 2F8FA 3J7Yb 1GSQA 4GRFA 2B5XA 3HXSA 4TRXA 2C80A 1DBYA 3GV1A 3VPQA 3ME8A 5ECHB 2FHEA 5KEJA 2A4VA 4IP1A 4YH2A 4L8EA 1GP1A 4IJ3A 4KCAA 4IN0A 4K7OA 1G7OA 1ZMAA 3HVVA 3NZNA 5JCUA 1OC8A 1EOHA 3WT1A 2QC7A 4HU9A 3H93A 1GSDA 1K0DA 1H75A 4IP6A 4KH7A 2VCZA 2VCWA 1PKZA 1QXHA 3CBUA 1ZYQB 4K1FA 1GTIA 4O5RA 4AJ6A 1K0BA 1FOVA 1E2YA 3IC4A 3QAWA 1IYIA 3UARA 2VUPA 2LRNA 1XW6A 4EDZA 4BA7A 2RM6A 5D93A 1TU7A 3EE2A 1Q4JA 2MMZA 2YCDA 2DBCA 1VF1A 3A2XA 2H70A 2F8AA 3RPNA 5IMZA 1GWCA 3GKNA 1M2DA 3FYGA 3LWAA 1BAYA 4WF4A 5ELAA 4L0UA 2NVLA 2P0GA 5GZZB 2IJYA 3VWUA 4O32A 5IMVA 1SK2A 5HR3A 1JHBA 2GZYA 5KN3A 2X8CA 3ZIVA 1M2BA 3M9JA 1Y25A 5GAPD 2GVPA 4OCEA 5DDLA 1I9DA 3FR6A 4TW5A 3O6TA 2CVBA 2XC2A 5B6NA 4BVXA 1SL1B 3UJ1A 3GX0A 3KMNA 4ACSA 3KTLA 3GTUB 4YQUA 2RM5A 2CV4A 1PGTA 3L9VA 5J3RA 4TKYA 3C8EA 1TW9A 5CP1A 4EL1A 4XS6A 1USBA 2GSTA 4AJ8A 2JZRA 3HVXA 4MH3A 5FWGA 2VM2A 1NSWA 1K0AA 4FYCA 1KEBA 1A0RP 3TDGA 4YAVA 4AGSA 3QMXA 2LKUA 4XRDA 9GSSA 1X9MB 3VURA 5GSTA 2FD3A 1R5AA 2X8GA 1OAZA 5D9XA 2C4JA 3C73A 1ZZYA 5H5RA 1OYJA 4NV5A 4OO4A 2PBJA 4KX4A 1UN2A 19GSA 5IMCA 3UL3A 5ID2A 5CREA 2R4VA 4DEJA 4XIHA 3APQA 4Q5FA 4XCSA 2GT5A 2CZ3A 3P8WA 2YNXA 3RAZA 2MBSA 4PNGA 1VF2A 1XBSA 4NXIA 1YQ1A 3WGXA 5G2ZA 3HCZA 2MYGA 2XBQA 2H0IA 4NHZA 4WBRD 5HQPA 2GLRA 3LXZA 2GT6A 2OACA 1GLQA 3F6DA 1M9BA 2LS5A 3FRCA 4E8HA 3KIJA 3KZQA 3GUSA 2EC4A 1R7HA 2MZCA 1WJKA 5AIVA 2K18A 4MJEA 4KB3A 6GSSA 1X0RA 3GKXA 4F82A 2VCVA 2TRCP 5E59A 1R26A 4KA0A 2EIOA 3ERGA 3DMLA 5ABRA 2CX3A 1BYEA 4KUNA 4KSOA 4D73B 1ERWA 1KTEA 5E4WA 2DJ2A 3ZL5A 4F2IA 2PN8A 1BG5A 3TRXA 1Z9HA 2LV3A 2LNTA 1EGRA 4EXJA 2C1YA 4TN8A 2B5EA 4ZB8A 4V2LA 3D6IA 3GN3A 1PKWA 3TKRA 4YQVA 1ST9A 2BJXA 1VF3A 4GCIA 4OD7A 4AF2A 4K9ZA 6GSXA 2GSRA 2VM1A 3TUEA 3F8UA 4MZWA 2DIYA 2JL4A 5ECNB 3IE3A 4HDEA 2PPTA 2IN3A 2WFCA 2OE3A 1O8XA 2LQOA 1AQWA 2MBTA 3ZRDA 5B6MA 4MJBA 4RQXA 3LYPA 2XHFA 2HRFA 1THOA 4MABA 3UMAA 1S3AA 4PQIA 1ABAA 2M72A 1DSBA 1H4OA 1BX9A 1SD8A 5ECKB 1LJRA 2VLVA 5FHIA 4ZIJA 5INYA 5ECMB 1ON4A 1B48A 4KDYA 1XIYA 5G31A 3KD0A 2YJ7A 3WT2A 3FW2A 2ON7A 4ZILA 11GSA 2PUKC 4I2UA 4ZL7A 3CSJA 3ZFBA 3P2AA 1QGVA 4JR4A 1XXUA 3GMFA 4H86A 3NIVA 3LQ7A 2FGXA 1VRSD 3UIWA 4TR4A 4JE1A 4BWSA 3DIEA 5ECRB 2OE1A 2AB6A 2JU5A 4QL9A 1PX7A 1TDIA 2L59A 4ECJA 3HJPA 2AUVA 1M2AA 5DAKB 1ERUA 2YZHA 4BVYA 4GQCA 3D0ZA 3FY7A 5AIXA 2YWOA 1F2EA 5A4UA 5G5EA 1OKTA 3H79A 1EEMA 1SJZA 1ILOA 4BWQA 5B7CA 4DSSA 4NPBA 3ZLPA 3LJRA 5AN1A 4ZL8A 1MD4A 1SENA 2IMEA 1E6BA 2OBKA 2G0FA 3ZITA 2FNOA 4ZXGA 1XW5A 2IL3A 4PQHA 1FO5A 4ZBDA 3C1SA 1TRUA 3QR6A 1K3YA 3IAS2 1Z6MA 3GA4A 2B7KA 2H6YA 2JSZA 1T4YA 1QFNA 2WJUA 4ECCA 3EU3A 3KGKA 2H74A 3VLNA 2WGRA 1R4WA 4XRAA 3H1NA 1ZYEA 2N5FA 5AGYA 4MK3A 4KW6A 1X9WB 4DSQA 5D8IA 1K0OA 3H4KA 4K7IA 3F3QA 5H5SA 4IJIA 2LQQA 4WXTA 2GDRA 4KAEA 1J08A 2LRTA 3APSA 2GQKA 1EV9A 2RLIA 4TR3A 4IKHA 1XZOA 4MZCA 1SU9A 4V2NA 1HD2A 1XPVA 5EY6A 1AXDA 3HJMA 4RUVA 3PGTA 2DMLA 1FB0A 1SJIA 4CDOA 3ZMKA 1B4PA 2YOIA 4EF0A 4IS0A 3TJGA 5B8AA 3HZ8A 5DALA 2HSHA 2H0HA 3D4TA 1GSSA 3BJ5A 5JWQB 1FB6A 3TCOA 4KCEA 1TU8A 1A2MA 1GLPA 3ZIJA 3HZ4A 2H1DA 2YWMA 1WOUA 1XWKA 1V57A 1OKDA 1U87A 2FY6A 2V1MA 3EYTA 4OFNA 3ERWA 4G19A 4L5LA 1PA3A 3QD9A 4I5QA 1A8LA 3KH9A 1YEXA 2YJHA 3KP9A 5G1KA 3DEXA 2OADA 1A24A 3FZ4A 5CNWA 1B9XC 3GIXA 1XFLA 4O92A 3AY8A 4N0ZA 2LJRA 3GKMA 4PGTA 4K6XA 2REMA 1A0FA 1AC1A 4GSNA 4N30A 3ME7A 5D9WA 2VD0A 4RI7A 3WYWA 5IPHA 1TK5B 3RHBA 2NTOA 3EU4A 3QDNA 4IQ1A 1GSFA 1GRXA 3FK8A 5HR2A 1M9AA 3O76A 5IOWA 5DBQA 1W4VA 2QKEA 3TJBA 3FR9A 3GL5A 1S3CA 2F3MA 2K9FA 4WETA 5J9CA 2C0DA 2PMTA 4HQZA 4XS1A 3E9JB 1ZOFA 4FH8A 5HR1A 2VCTA 2P5RA 3TJKA 1WIKA 2HLSA 2OKAA 2AV4A 1TK8B 4ML1A 1SYRA 1TI3A 1NW2A 1YJ6A 2HRNA 2C0EA 2I1UA 2IMIA 2PVQA 4PNFA 1FHEA 2NBSA 5HFKA 4NV2A 1AQXA 8GSSA 2M80A 4HOJA 3Q6OA 1Z6NA 1Q98A 1UA5A 3IBHA 3FZAA 3BOAA 1AAZA 1MEKA 1F3BA 4OWYA 5F8BA 1SJ6A 2JSYA 3VWXA 1K0CA 1ZCPA 1QMVA 2L5LA 4PUAA 3BBYA 1QUWA 2C8UA 2WS2A 1U88A 2KP2A 2V6KA 2CZ2A 4LA1A 4XS4B 2H6XA 1GTBA 1TOFA 1N2AA 4N0VA 2HSYA 4GLTA 4I97A 5FT3A 2IMKA 3HD5A 1YF1A 2YV7A 3TKSE 4EKZA 3N5OA 6GSTA 4KDUA 2XBIA 2O87A 4D73A 5G30A 1SL0B 2O85A 2GGTA 1YKCA 4YQMA 3TOUA 4V1Ap 1T00A 3MNGA 4KNDA 3CXGA 1OC9B 3EC3A 4ISDA 4MJCA 3D21A 3LEFA 1EZKA 4K8MA 1I5GA 4F0BA 1PL1A 4ID0A 1XOBA 3PH9A 1K3OA 2RIIA 3Q74A 4MDCA 4IVFA 1Z5YE 3FZ9A 1XWGA 4TR0A 2K8SA 3ERFA 1THXA 4N11A 1OE8A 2KHPA 4RI6A 4HZ4A 4HS1A 2GZZA 1EP7A 1U3IA 4BPYA 3HKRA 1O8WA 4EUYA 2O89A 1CQGA 5IMAA 4EVMA 1T3BA 1T7PB 2N5BA 5KN0A 3RPPA 1V9WA 2B3SA 4TR1A 3US3A 1WRYA 4L5OA 1U3AA 2L4QA 1O73A 1PX6A 2GQMA 3EMXA 1HYUA 2K6VA 2H71A 2E7PA 3CRUA 3M3MA 2QGVA 3F9UA 1LBKA 3D22A 4ZB6A 2VCQA 2ZCTA 1ZGNA 4Q5NA 5IPGA 2DJ1A 2JZTA 1YF0A 2P5QA 2DIZA 3IK9A 2F9SA 4JBBA 3GSTA 4EDYA 2DLXA 2ZNMA 5CYYA 3LFLA 3Q19A 4POBA 1FW1A 1HQOA 3A5WA 4WR5A 1TRWA 3DKSA 4JEDA 5JCGA 5DAKA 1MDJA 2WB9A 5ENUA 2R5GA 1XVQA 3UAPA 3GHAA 1XCCA 5IMDA 1QQ2A 2VO4A 18GSA 3F63A 4LMWA 1TXXA 1YZXA 1GULA 2PGTA 4MF6A 2C0GA 2HZEB 4LMVA 2IIYA 1V98A 4NWYA 3IHQA 3CRTA 20GSA 2H19A 2TRXA 2WZ9A 3ZMLA 5HFIA 3HVSA 3TKSA 5D9TA 3IV4A 16GSA 2G2QA 2IMDA 1G0TA 2EIQA 1FAAA 1FG4A 3IR4A 3C7MA 4L0WA 5A4VA 1YKAA 1TP9A 3GH9A 5F0GA 2AYTA 3WGEA 2AAWA 3VK9A 4POMA 4OFTA 2L5OA 5IIZA 2NDOA 3R2QA 4GF0A 5B8BA 4ECBA 2YPMA 5GAND 7GSSA 2WRTA 1AW9A 2L6CA 1JFUA 3GSSA 4Z7XA 3ZVJA 3D4MA 4MF7A 4PX1A 1T8EB 3IDVA 2IFQB 3Q18A 3G7JA 3L4NA 3BD2A 4GTUA 1SKSB 3TRPA 4CHSA 2FA4A 2X64A 2GSSA 3GL3A 1F6MC 1WWJA 5KN1A 4TXOB 2F51A 1GH2A 2HT9A 1PD21 4HZ2A 1ML6A 5D73A 4YAPA 1EV4A 4IHUA 3LYKA 2O7KA 1X5DA 3CMIA 2RUEA 5C04A 3CTFA 5IO0A 1TRSA 2D2ZA 5DJLA 3TRQA 3ZYWA 1Z7RA 2J23A 1J9BA 4IQAA 1MDKA 1V2AA 5JWOB 1GNWA 3GURA 3UBKA 3MDKA 5LCZA 2LJAA 3HJOA 3M8NA 4WKWA 1DE2A 3I43A 3KM6A 3GFKA 1Y6EA 3O3TA 2VIMA 4X1UA 2XPEA 2ZUPA 2OE0A 3ED3A 3FEUA 4CW9A 1LU4A 1J0FA 4GXZA 2LSTA 3LSZA 1WE0A 2LJKA 5IMFA 2LUSA 1SD9A 2FCHA 4IW9A 1ERVA 1AIUA 1V40A 1N8JA 1B9YC 2TIRA 3ZTLA 5IOXA 3K8NA 3TKSC 2YWIA 2H8LA 3F6FA 2YV9A 1WPIA 3HA9A 3W8SA 1SYXA 2H76A 3UEMA 1MDIA 2CAQA 5KN2A 3I69A 2GTUA 2PWJA 1EEJA 2KLXA 4QL7A 5D96A 3JCML 3UOMA 2EIRA 3GRXA 3VFIA 4MPFA 1NHYA 3RDWA 5A4WA 2V2GA 2L6DA 1Z7PA 2LNSA 3F3RA 5DVBA 5ELGA 1CQHA 3IOSA 3BCIA 5CRHA 3KTBA 4OMVA 1QK8A 1HNBA 2B6MA 1K3LA 4DSSB 3I6AA 2KP1A 5DQSA 3J7Yk 4EE0A 3QOUA 3MWHA 5LD0A 3EMPA 2AJQB 1V58A 2H1GA 3DVWA 2RUFA 3HY2A 3UBLA 1GTAA 3EWLA 4OO5A 3E3EA 1GSEA 3WGDA 3M1GA 5DCGA 1GUHA 1K0NA 5GSSA 5AISA 3MSZA 4Q5QA 4FIWA 4KDXA 1TI1A 1TJDA 1W89A 1BJXA 3DGQA 3QCPA 4KSMA 3NOFA 4XS4A 6GSYA 1XWAA 3TJJA 3TJFA 3U6VA 2J9HA 3KH7A 2YZUA 2V41A 1GSYA 4GSSA 2CVKA 2DSAA 3FHKA 3GTUA 4EO3A 2X99A 1A2LA 3PR8A 22GSA 1YEPA 1DUGA 3G9BA 2BMXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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