1E2YA

Tryparedoxin peroxidase from crithidia fasciculata
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
167
structure length
167
Chain Sequence
GAAKLNHPAPEFDDMALMPNGTFKKVSLSSYKGKYVVLFFYPMDFTFVCPTEIIQFSDDAKRFAEINTEVISCSCDSEYSHLQWTSVDRKKGGLGPMAIPMLADKTKAIARAYGVLDEDSGVAYRGVFIIDPNGKLRQIIINDMPIGRNVEEVIRLVEALQFVEEHG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Structure of Reduced Tryparedoxin Peroxidase Reveals a Decamer and Insight Into Reactivity of 2Cys-Peroxiredoxins
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPAREDOXIN PEROXIDASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Crithidia fasciculata
total genus 46
structure length 167
sequence length 167
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1e2yA00
4TR1B 3TOUA 5AIXA 3EMXA 1GWCA 2TIRA 1XWAA 2IMIA 3E3EA 1M2BA 1RW1A 2QKEA 4DVCA 1JZWA 3FEUA 2RM5A 4V1Ap 4OFTA 3UMAA 5ID2A 4QQ7A 1K0OA 3VPTA 1TP9A 1V57A 1U3IA 4KSMA 5JWRB 1CQGA 1GUMA 3U6VA 1FAAA 4ZL8A 4XTSA 5E59A 2KOKA 4POKA 2O8VB 1QGVA 5CREA 1EGOA 2C1YA 1IYHA 4WBRD 1QK8A 4IQAA 4J56E 1BX9A 4MLYA 2WRTA 4BVXA 1SL1B 3L4NA 2HLSA 2PN8A 4OMVA 4DSSB 1OAZA 1GRXA 1HNCA 2DMLA 4EO3A 1TK5B 5IIZA 1PKWA 5ECQB 4Q5RA 2B5XA 2JACA 3TKRA 3RPNA 2WZ9A 1AQVA 3MNGA 1PX7A 2L5LA 3HHVA 1NM3A 2WJUA 3ED3A 3E0UA 2H6YA 2QC7A 3CSJA 5DJMA 3WD6A 5J9BA 4I2TA 3QPMA 1X9MB 3D0ZA 2QSIA 3UAPA 4MABA 4HU9A 2MZCA 3MSZA 1BYEA 1MTCA 2ON5A 5C00A 1EWXA 1UA5A 3EMPA 1EGRA 3HJMA 3NZNA 5B7CA 1YF1A 2OADA 1XZOA 1M2DA 2KP1A 1GP1A 2H1DA 1N2AA 3ERWA 1WOUA 1OYJA 2AYTA 3IXRA 1T8EB 1PA3A 3DYRA 2E0QA 4FO5A 4NPBA 4LA1A 1SK0A 1K3YA 2R6KA 4KA0A 4MJBA 2YNXA 1O7UA 2YWNA 3D21A 4E8HA 2GZPA 2H76A 1ERVA 1X0RA 1LU4A 1G7EA 3D22A 4EXJA 6GSUA 2VCVA 2R37A 3ISOA 2DJ1A 4OWYA 1EOHA 4KGIA 3TJGA 1HYUA 5G1LA 1GSDA 2VLVA 1HD2A 3L9SA 2LTKA 1THOA 4G2EA 4NV5A 9GSSA 3GX0A 5D9TA 2XPDA 1SK1A 1O8XA 2N5AA 3IV4A 1AW9A 4KB3A 3I43A 4KDYA 4IHUA 5EY6A 2FNOA 4L0WA 3IAM2 2WFCA 1G6YA 5KN3A 2B3SA 2IFQA 2G0FA 3P8WA 2JU5A 2C3QA 1C72A 1WMJA 3GUSA 4IELA 3KXOA 1SYRA 3M1GA 4KE3A 4K9ZA 1Z6MA 4PGTA 4PQ1A 2VM2A 4V2MA 4LL4B 2L4QA 4YH2A 3HDCA 4O32A 3ZLPA 3GSSA 3QMXA 1KBNA 2HSHA 4MJAA 1GTUA 2VD0A 1T3BA 1I5GA 2H8LA 2HE3A 1QMVA 5H5QA 1YEPA 4QL9A 2B1KA 5G5FA 2YJHA 4IGJA 2V6OA 2VCXA 2KHPA 3GL3A 2V41A 4F0CA 3ZFBA 1OE8A 5DJLA 2H72A 4N11A 3LYKA 4KAEA 3VI7A 5FHIA 3A3TA 3GX8A 3US3A 5CRGA 3D4MA 2MMNA 4TKYA 1OKTA 1Z9HA 4XCSA 1ERTA 1FB0A 4EDZA 5J3RA 3HJPA 3TKPA 2BJXA 5G1KA 2EIRA 5G2ZA 1TJDA 2E2GA 3EURA 2IFQB 1B4QA 16GSA 2BMXA 2XBIA 4PUAA 4ZB6A 3KH9A 2DSAA 4JZQA 3GN3A 4IW9A 1TKDB 1XPVA 2I9HA 2H19A 4HDEA 2GQLA 3BCIA 5GAPD 1EP7A 2DJJA 1PSQA 1TXXA 1B4PA 2RIIA 4KCAA 2YWOA 4K1FA 3Q19A 4L8EA 2YOIA 1O81A 4OD7A 2O89A 3ME7A 4YQMA 3CRTA 3KTLA 3EYTA 3RPPA 3J7Yk 3QDNA 4MA9A 1FO5A 1VF4A 1B9YC 3DIEA 1M99A 1K0NA 4X43A 1ZMAA 2B7KA 4ZL9A 4JE1A 1R5PA 1F9MA 1QUWA 2N5FA 5CYYA 4HQZA 3KCMA 1F37A 4K7OA 1X5DA 3LXZA 4K7NA 1OC9B 2PBJA 4MH2A 13GSA 5ECOB 2R3XA 3E9JB 1A8LA 3VWUA 3HKRA 3TJFA 3SBCA 1MEKA 2K8VA 4N0VA 2VCZA 1WJKA 1XOAA 1ZOFA 2Z9SA 2LJKA 3ZMLA 1JZRA 1LBKA 2DJ2A 1GTIA 1XBSA 5F0GA 3IR4A 5DCHA 5H5SA 3A2XA 1MDJA 3IK7A 1GSYA 4FIWA 4G19A 2DIZA 2LKUA 4E8EA 3I6AA 1XWBA 1ILOA 5JCGA 1T7PB 4GSNA 2CZ2A 3W6GA 3FY7A 5D73A 2O7KA 3QD9A 3FZ4A 3EE2A 3Q74A 5D9WA 1YQ1A 2ON7A 4ISDA 3Q18A 3KM6A 5ECNB 2P0GA 3H79A 4POLA 1X9WB 2H71A 4EVMA 2NTOA 4PQHA 2LJAA 1AUCA 3FW2A 4RUVA 5IPHA 3M9KA 3ZITA 1PGTA 2I4AA 3GH9A 3GH6A 4K7IA 5CRHA 5KN0A 2PGTA 3LYPA 4HI7A 4K0GA 2JZTA 3ZYWA 4V2LA 3CBUA 1TDIA 2F8AA 1K0BA 3BOAA 1J9BA 4WF5A 4V2NA 2HNLA 1EV9A 1XOBA 3DVXA 1BG5A 3MDKA 3RHBA 5F8BA 1XVWA 3ERFA 4GSTA 3ZL5A 3LG6A 2WS2A 1SJ6A 5CAXA 3OR5A 4FYUA 5ECSA 1GL8A 1RK4A 4F03A 2VD1A 5IQYA 1AQXA 11GSA 1FB6A 3C73A 4BVYA 5H5RA 3HZ8A 2FWFA 2YPMA 1S3DA 4DSSA 2L4CA 1FOVA 4TW5A 1O73A 5ABRA 2DC5A 2MMAA 3TRXA 5J41A 2JADA 4V1Ag 4PX1A 4EDYA 5C04A 3F8UA 3UVHA 2CVKA 1SKWB 2M80A 3Q6OA 3QCPA 5CP1A 3F3QA 1A2MA 2L59A 1A0RP 5IMAA 2OA7A 2CT6A 1ZL9A 3HJOA 2VCTA 2HYXA 3GTUA 1TRSA 4GLTA 3VWVA 1GTBA 5GSTA 5HR0A 3M3MA 2VLTA 1AAZA 2B5EA 2KLXA 3EU3A 6GSXA 3EINA 1FW1A 5ECHB 2VL2C 2XBQA 1SD8A 3PINA 1K3OA 1I9DA 5IM9A 2PVQA 1DUGA 3HY2A 3ZVJD 4BL7A 4MZWA 1JFUA 4N30A 4EE0A 1ACVA 2H66A 3EU4A 4AGSA 3U5RE 3N9JA 8GSSA 4MJCA 4XS1A 3GSTA 4ZBAA 1KNGA 3C1RA 5G5EA 1Z3EA 4RI6A 1TK0B 3K8NA 1ZYQB 3AY8A 5ECRB 3A2WA 5ELAA 4OO4A 4CHSA 5KN2A 2H0IA 3C8EA 2CVBA 4N0ZA 1JHBA 2X8CA 3HXSA 4I5QA 4J2FA 1ZCPA 2VM1A 3KMOA 3GTUB 1AC1A 3O6TA 3FZAA 5CRWA 3IPZA 3D6IA 4N10A 3A5WA 1R26A 17GSA 2RM6A 3P7XA 2HSYA 2VIMA 1SK2A 1PL2A 2IPAA 2VL3A 3IAS2 3LFLA 4I8BA 2GGTA 1QQ2A 3G7JA 4MCUA 1Y6EA 2OKAA 4XRDA 5JCWA 4Q5QA 4NWYA 2I3YA 4K0NA 1BJXA 3KMNA 2O85A 5ECKB 2LEGA 2HT9A 5D9XA 5G30A 5D8IA 1PL1A 2I1UA 2HZEB 2CAQA 2H1AA 2YANA 1PKZA 2RUFA 2H1GA 1ZGNA 1XWGA 4DEJA 3DKSA 5DALA 2C8UA 3FKFA 3ZIJA 2HFDA 5IMDA 1YJ6A 3C7MA 3FR6A 4ECIA 2N5BA 4XHMA 4BWQA 2C0FA 2HRNA 3TKSA 3LSZA 4O5RA 1FVKA 1K0DA 1F2EA 3KP9A 1V98A 3QAGA 5HFKA 5IO2A 1EOGA 4FYCA 3L0HA 4YQUA 1X5EA 5COHA 2GQMA 3GKKA 3IBHA 2ZCTA 1WE0A 2VLUA 3PH9A 2GVPA 3M9JA 1M9AA 1HNAA 1SENA 5F07A 4O92A 1K3LA 4OCFA 1Z5YE 1G7OA 1SJZA 2CV4A 3TRPA 1A23A 2IJYA 3LQ7A 5DBQA 5INYA 4GTUA 4TR3A 1XW6A 3F9UA 3F4SA 1X5CA 2IMEA 3SWLA 4CW9A 2DMMA 2C0DA 2H74A 3CSHA 4ZB8A 2HZFA 5DALB 3DWVA 4O7HA 4JRRA 3FRCA 1GTAA 5B8BA 1WRYA 3ZTLA 5ENUA 5AIVA 3F4RA 3C71A 5F06A 1R7HA 3IDVA 1R4WA 2WULA 2ZNMA 2IN3A 5CNWA 1X9SB 4D73A 1SU9A 1O85A 1Q98A 2ES7A 3KGKA 2VL2A 4IJ3A 4PXOA 2F9SA 2TRCP 6GSTA 2YV9A 1TI3A 4ML6A 3KH7A 1T4YA 2DIYA 2XPEA 2GT6A 1ZYEA 2K9FA 4HJ2A 2FLSA 5ECIB 1A0FA 2OBIA 1SKSB 5DVBA 2MYGA 4ZBBA 4POMA 1OC9A 4JR4A 3TJBA 2GZZA 3H1NA 5CRDA 2YZHA 2IIYA 4EKZA 4F9ZA 4QL7A 2G2QA 3GURA 4JBBA 3VK9A 5HR3A 5LNKe 3EC3A 4AJ7A 3DGQA 1JLWA 1U3AA 2FA4A 4ZB9A 4WR4A 4KCEA 1Q4JA 5DCGA 3TRQA 2YWMA 2YN1A 2MBSA 2LRNA 3FYGA 4TRXA 5ELGA 4D73B 1GSEA 3TCOA 3LGCA 1FG4A 5DAKA 3F6DA 4Q5NA 3M8NA 4Q5FA 3IRAA 3QFBC 1ON4A 3J7Yb 2AJQB 3G7IA 4IJIA 2PVOC 1EEMA 4IP1A 4HJMA 1U87A 2LJRA 2GSTA 2OACA 4MF6A 4ZILA 2CA8A 3G9BA 3KIJA 1F3BA 3O76A 1T4ZA 1CQHA 2AV4A 4POBA 3CXGA 2B7JA 2C4JA 4MH3A 1K0CA 3IE3A 2H75A 4AJ8A 3ZFLA 2V32A 14GSA 1B48A 2CAIA 4DSRA 4GRFA 1BQ7A 1XW9A 1OC8A 1PN9A 4ZXGA 5EVOA 2R2JA 1XW5A 2GDRA 3WT1A 2DJ3A 5A4UA 4KW6A 4LL1B 1THXA 3HVVA 1ST9A 4FH8A 3H93A 3QAWA 2CQ9A 1Y25A 5B6NA 1LJRA 3IA1A 3WYWA 3IC4A 1F6MC 1VF2A 4HUAA 5DAKB 4WKWA 5HR1A 2K8SA 1USBA 2YP6A 4XS4A 4MK3A 2FY6A 1GULA 2OBKA 3GV1A 2LNSA 2R5GA 1SYXA 3GYKA 2M46A 2F3MA 3LEFA 2LRTA 1EEJA 3GIXA 5IMFA 2HRFA 3GKMA 4MPGA 3FHKA 1NHYA 4MZCA 1T1VA 4TXVA 2K18A 5KEJA 2R4VA 5G31A 3TKSC 5J4UA 2JSYA 2E2MA 2A4VA 4ILFA 3HZ4A 5D96A 4AF2A 4MMMA 4X1UA 2DBCA 3DVWA 5IMVA 1GLQA 5J5NA 1TK8B 3QFAC 6GSSA 5HR2A 3IK9A 1ERUA 1GUHA 2MBTA 1YKAA 3S9FA 3RBTA 2H30A 1W4VA 2NPBA 4NAXA 3BD2A 4XS4B 1FVJA 1O6JA 1H75A 1V9WA 2KUCA 1DBYA 2FWEA 5F05A 3RDWA 2H0GA 3GHAA 1XXUA 4EF0A 3UARA 4J57E 2EIQA 2MMOA 3UBLA 3WGDA 4ECBA 2H01A 4P3YB 2VUPA 3FR3A 1VF3A 3N5OA 2DLXA 7GSSA 3MAKA 1AXDA 1SL0B 2B6MA 2H73A 5IOWA 4OFNA 3WGXA 3G7YA 4JU5A 1NSWA 2RLIA 4NHZA 4WF4A 3MWHA 2IMFA 1AQWA 1VRSD 2NVLA 3UOMA 2H6XA 1GSUA 2FWHA 1E2YA 4MJEA 1S3CA 5A4WA 4JR6A 5AISA 4L5OA 3EVIA 2GQKA 1E6BA 1OVNA 1OKDA 3ZVJA 2O87A 3KD0A 2QGVA 1GUKA 2LNTA 4TR0A 5HQPA 4K6XA 3M0FA 1A8YA 4WBJA 2OJLA 4GSSA 6GSWA 4GCIA 3ZRDA 1FHEA 3HCZA 3KEBA 20GSA 2AB6A 4ML1A 1URMA 1NHOA 2FHEA 2GS3A 2CX3A 3FR9A 1DSBA 2HZEA 2EC4A 1N8JA 2MMZA 3TDGA 4MPFA 3GKNA 3GNJA 4ECCA 2F8FA 5ECPB 1ML6A 1YZXA 4ACSA 3PGTA 4HEA2 4TXOA 2LUSA 3EWLA 1DE1A 1G0TA 2PMTA 1XCCA 3KJYA 2HXKA 3L9VA 2C0EA 12GSA 2L5OA 1TU7A 3HVXA 3QOUA 3HA9A 1GSQA 1V2AA 2KP2A 2B5YA 5EL8A 2WGRA 4KDUA 2GSQA 1V40A 1K0AA 2H1BA 3TGZA 3GMFA 2NDOA 1PD21 1SL2B 3DRNA 2V6KA 2X64A 3VI5A 1XVQA 3RAZA 5LD0A 3VURA 4FYBA 2JSZA 1PMTA 3PR8A 3HD5A 4TR4A 5IOXA 5AGYA 3TKSE 4OCEA 2GSSA 4DSQA 4Z7XA 5IPGA 5L71A 4GF0A 4ECJA 3UIWA 3UEMA 1PRXA 5ID2B 3HVSA 2LQQA 2V1MA 3TUEA 2JL4A 2NBSA 1TTZA 5B6MA 3CSIA 3GFKA 1UN2A 5A5KA 4RQXA 4HS1A 5J9CA 1EZKA 1TW9A 5HFIA 3TB2A 4TXOB 4JEDA 1GH2A 3F63A 3DEXA 3QR6A 3R2QA 4XRAA 1MD4A 4KDXA 1KEBA 2V2GA 2OE1A 5HFGA 5EPFA 2X8HA 5FWGA 2X99A 3HYPA 1J08A 1OE7A 4HQSA 5AN1A 4KSOA 2IMKA 3VWWA 2TRXA 3APSA 1M2AA 3ERGA 1T00A 2FWGA 4MZBA 2AUVA 2VOCA 1HNBA 3H4KA 5GAND 1NW2A 2FCHA 1GNWA 6GSYA 5FT3A 2IWTA 4F0BA 4I2UA 4XS6A 2GSRA 5ECMB 2PU9C 3WT2A 4G9HA 2J9HA 1YKCA 1B8XA 3C1SA 4BPYA 1YEXA 3NOFA 4F82A 2H0HA 2JZSA 4RQRA 4NHWA 4H86A 5D9VA 1SD9A 4AJ6A 1GNEA 5DQSA 3ZREA 2YWIA 2PWJA 1GSSA 4MF5A 3H8QA 5D93A 2M72A 1A2JA 2PUKC 1UC7A 4PNFA 3FZ9A 2VAFA 3F4TA 1DE2A 4LLRA 1H4OA 3UL3A 2BTOT 4HOJA 4X0XA 4TVEA 2WDUA 1VF1A 3VLNA 2H6ZA 1TU8A 1W89A 3VWXA 1OC3A 1JLVA 2DJ0A 4MP4A 3ZMKA 4IVFA 3TKQA 1AIUA 3APOA 4ID0A 2GTUA 1MDIA 2A2SA 4YAPA 6GSVA 1F3AA 2E7PA 3I9V2 2WB9A 1YDKA 4WXTA 2AHEA 2ALBA 4L5LA 2H70A 2FUG2 4IS0A 4PQIA 3F3RA 4OO5A 4OFMA 4ULXA 4F2IA 4L0UA 3UJ1A 1A2LA 2JZRA 1JZOA 1MD3A 2YV7A 1Z7PA 2YZUA 3GKXA 2P5RA 3F0IA 1YF0A 1WPIA 3BJ5A 2LV3A 2F51A 2L6CA 1BAYA 3ZIVA 4MF7A 5DDLA 5JWQB 1PX6A 2B1LA 18GSA 4ZIJA 2RUEA 4RI7A 4WEYA 3NIVA 3GA4A 1XWKA 19GSA 4GXZA 4G10A 1ABAA 3IOSA 4HU7A 1K0MA 3ME8A 1S3AA 4LMWA 2CX4A 4KX4A 4NXIA 1J0FA 2CVDA 1TRWA 1VGLA 5GZZB 1QXHA 1WWJA 5LCZA 1KTEA 3GL5A 1XFLA 3KZQA 4NMUA 1G6WA 1EV4A 4IKHA 4GQFA 1XIYA 4GWRA 5JWOB 4LMVA 3LWAA 3TJKA 3CRUA 2HI7A 3D5JA 2XC2A 3P2AA 1GSFA 2WCIA 2LRCA 3IHQA 1GLPA 2VCQA 1O8WA 4KUNA 4NV2A 5DQYA 4IQ1A 2C3TA 3LJRA 3P90A 2REMA 1V58A 4TN8A 2C80A 3DMLA 4KH7A 3FK8A 4I97A 1ZZYA 2C0GA 4PURA 3TOTA 5E4WA 1WP0A 4EL1A 3CTGA 1U88A 4YAVA 1TOFA 2OE3A 1QFNA 1R5AA 1U6TA 3DD3A 2AAWA 4BA7A 1SKRB 2X8GA 1EP8A 5IMZA 3CYNA 3GRXA 4HZ2A 3LXTA 4IN0A 1M7TA 2GLRA 4IP6A 3F6FA 2VL9A 3LORA 2DJKA 4CDOA 4HZ4A 4YQVA 4PNGA 4K2DA 3W8SA 3UBKA 3RHCA 2LQOA 1JZDA 3I69A 4IBPA 3V1WA 2YJ7A 5IMCA 5IO0A 2CZ3A 3DXBA 2IMDA 1IYIA 1BEDA 3APQA 22GSA 3ZZXA 1Z7RA 4TOPA 3UVTA 2ZUPA 1UVZA 5ECLB 10GSA 1M0UA 1SJIA 4ZL7A 3VFIA 5KN1A 2VO4A 1XWCA 5CO3A 4TR1A 1MDKA 2I81A 4WR5A 4BWSA 2J23A 2EIOA 3FZ5A 4WETA 3KP8A 3QAVA 2D2ZA 3L78A 1TRUA 2IL3A 2OE0A 4KNDA 1A24A 2YCDA 3VPQA 2P31A 1Z6NA 5JCUA 4EUYA 2LS5A 3CTFA 1PQNA 2PPTA 3JCML 2LSTA 1ERWA 3BCKA 3O3TA 3BBYA 3TJJA 2GZYA 1HQOA 3D4TA 2FD3A 4EC0A 4MDCA 4PUFC 2K6VA 2P5QA 3WGEA 2GT5A 4K8MA 5B8AA 1RQMA 2FGXA 4ZBDA 2FA8A 3A2VA 5A4VA 1TRVA 2L6DA 3L9UA 1M9BA 2XHFA 2VCWA 5GSSA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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