1EGOA

Nmr structure of oxidized escherichia coli glutaredoxin: comparison with reduced e. coli glutaredoxin and functionally related proteins
Total Genus 28
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
28
sequence length
85
structure length
85
Chain Sequence
MQTVIFGRSGCPYCVRAKDLAEKLSNERDDFQYQYVDIRAEGITKEDLQQKAGKPVETVPQIFVDQQHIGGYTDFAAWVKENLDA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title NMR structure of oxidized Escherichia coli glutaredoxin: comparison with reduced E. coli glutaredoxin and functionally related proteins.
pubmed rcsb
molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
molecule keywords GLUTAREDOXIN
total genus 28
structure length 85
sequence length 85
ec nomenclature
pdb deposition date 1991-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1egoA00
3N9JA 4MJBA 2YJ7A 1MDKA 4GXZA 3FZ5A 1TTZA 1MTCA 2YWNA 1YF0A 1TU8A 4HQSA 5DVBA 3TUEA 3HA9A 2JSYA 3TJGA 1X9MB 3O6TA 1T3BA 5D96A 3LWAA 3CTFA 2IMFA 3HJMA 9GSSA 1X9WB 3L9SA 1M99A 2PVOC 6GSXA 5KN3A 4PQIA 5KEJA 2GSQA 2WJUA 2LEGA 2R3XA 2QC7A 4F82A 1XW5A 4N30A 1DE1A 2QKEA 4IQ1A 1OE7A 5G2ZA 2KP1A 1GTAA 1VRSD 3IE3A 5ID2A 4IN0A 2DJ3A 2H19A 1ILOA 2HSYA 4EVMA 1Y25A 3RAZA 2WDUA 2G0FA 3OR5A 3J7Yb 18GSA 4XCSA 4IQAA 5HR2A 1TRWA 1WPIA 2PU9C 2HI7A 2VL2C 2AB6A 5C00A 2TRCP 4HU7A 3WGDA 4K7NA 5ECQB 16GSA 2MMAA 3UOMA 3I69A 1R5AA 3LFLA 1F2EA 2R5GA 2JZRA 1A8LA 2RM5A 2H1DA 3G7YA 1F6MC 5G1KA 1K3OA 4N10A 2BTOT 4O32A 4PGTA 1B4QA 3GYKA 3GKMA 3UVHA 3ZREA 4KAEA 2OADA 4ZBDA 5D8IA 2MMNA 1FW1A 3VK9A 3RHBA 5CYYA 4ZL7A 2ZCTA 3VPQA 4ACSA 4MABA 4D73B 2H1BA 2GZPA 3KMOA 3TJJA 4IP1A 4NPBA 3EMPA 1SU9A 1O7UA 22GSA 2L4CA 2KP2A 1QQ2A 2GT6A 2TRXA 3FY7A 3LJRA 2EIRA 5IMDA 1WRYA 1J9BA 1XVWA 3H4KA 3ZTLA 3UJ1A 1JZRA 3F3RA 2XPEA 3KM6A 2GT5A 6GSYA 1O8XA 3A3TA 2TIRA 3G9BA 2WGRA 4PXOA 4D73A 1W4VA 3U5RE 1ERVA 1Z7PA 1Z7RA 3ME8A 2AHEA 5J3RA 4TW5A 4HUAA 1XWCA 1GLQA 4LMVA 1J08A 1OAZA 3VFIA 1A8YA 1ERWA 5A4UA 2R37A 2KHPA 2VM1A 1X9SB 5AIVA 2M46A 4PNGA 5J41A 4IGJA 3L9UA 4JR4A 2Z9SA 1PKWA 2ES7A 20GSA 2LJRA 3DYRA 2DJ2A 1YKAA 3TGZA 2C0DA 4HI7A 4G9HA 1JZDA 1TDIA 1U3AA 3DMLA 4GQFA 1OC9B 2H0IA 1G7EA 4GLTA 3UBKA 3MAKA 3CSHA 2VL3A 4NMUA 2DJKA 2PBJA 2ZUPA 5A5KA 1IYHA 4RQRA 1XWAA 4OCFA 1NHYA 1ZMAA 5EY6A 2VCWA 1YF1A 3TJKA 3GURA 3F8UA 2CA8A 3KTLA 4X43A 4I2TA 5DJMA 2GSTA 2I81A 5J5NA 1GH2A 4ZL8A 4G19A 5G31A 3CYNA 1OC9A 1QMVA 4MPFA 3GNJA 2WFCA 3GA4A 1U87A 3VWUA 2H76A 4J56E 3I43A 3IV4A 2I9HA 2K8SA 1OC8A 4K0NA 2H6XA 3RDWA 4EO3A 1FHEA 2IWTA 1SKWB 3VLNA 3UIWA 3HY2A 1XOAA 3TKRA 2YWOA 3F4TA 1SENA 3KCMA 1O6JA 1K0BA 4LA1A 2LNSA 2OA7A 1YEXA 1PRXA 1FB6A 3FZ4A 1S3CA 2C3NA 3QFAC 5JWQB 2NTOA 4F2IA 1OYJA 1I5GA 4LLRA 4X1UA 3EURA 2DSAA 4Z7XA 4N11A 4ECCA 4GSSA 1SL1B 5AISA 1GP1A 3VURA 1YEPA 1THXA 1GNWA 2PVQA 1ERUA 5GSSA 2YV7A 3QOUA 2YV9A 1EWXA 1WE0A 1TRSA 4GCIA 3D0ZA 2CZ3A 3G7IA 5HR1A 3IHQA 4GTUA 2RUFA 4Q5FA 5D9TA 2OBIA 3VWXA 3UVTA 5AGYA 1VF3A 5CO3A 4F9ZA 4XTSA 3TRPA 3CRUA 3S9FA 3UAPA 4V2NA 4XIHA 5B8BA 3KH9A 2KUCA 4WBJA 4K9ZA 5LNKe 3ZFBA 4TR0A 4IHUA 3CSJA 3ERFA 1XWGA 1TJDA 3DVXA 1Y6EA 2FNOA 3NOFA 1T4ZA 4DSSB 2HZEB 2CVKA 1HNCA 2V41A 5IO0A 4MF6A 1J0FA 5GAPD 5DAKB 3H8QA 3RPPA 3HVSA 1A0RP 2LS5A 1Z6NA 1SK0A 3LG6A 3KP9A 4OMVA 2EIQA 1DSBA 4XS1A 1M2DA 1FO5A 4CDOA 1USBA 4XS4B 1WWJA 4HZ4A 1FVKA 1XXUA 3QR6A 2WS2A 2HZEA 4IBPA 2MBTA 5GZZB 3ZITA 4DSSA 1Z5YE 1LBKA 5LCZA 4JZQA 1PMTA 2C0EA 4PX1A 4ZXGA 1NM3A 4TOPA 5DAKA 3H93A 4ZL9A 2CV4A 4MP4A 1GUHA 4OO5A 2HLSA 1EV9A 4MZBA 2OKAA 1H75A 2OE3A 1A23A 1GSQA 2D2ZA 2R2JA 3EU4A 1OVNA 4WBRD 1GSSA 4YH2A 4XRAA 2CX3A 2H0GA 2O7KA 3GV1A 2FA4A 2H70A 2MMZA 1AQWA 5D73A 2WB9A 4BWSA 2I4AA 1JFUA 2AAWA 3HZ8A 1K0NA 3FR6A 5COHA 5ECKB 2PN8A 2L6CA 3IAS2 1EP7A 3DEXA 1EGOA 4E8EA 1ZYQB 2E2GA 3L78A 4GSTA 4IKHA 5ECNB 4V1Ap 3CBUA 3HHVA 2VLUA 4P3YB 4KDUA 1WJKA 2QSIA 2YP6A 3TKSE 5FT3A 2F51A 1TRVA 2J23A 2VD1A 3TKQA 2L4QA 3RHCA 3ISOA 3EC3A 2YCDA 1TU7A 2N5AA 4MJAA 4RI6A 4OFMA 5ECHB 3ZMLA 3IK7A 1S3DA 3WYWA 2ON5A 4ECIA 4QQ7A 4LL1B 3A2VA 2NBSA 1GULA 6GSWA 3IDVA 2IIYA 3FR3A 1K0CA 4WKWA 2NPBA 3C1SA 3LXZA 3F4RA 4KSMA 4G10A 2LKUA 5G1LA 1R4WA 3VWVA 2FA8A 2C3QA 5DJLA 4NV2A 4L0UA 4EL1A 2L5LA 5CRHA 2K9FA 1YQ1A 4NV5A 4AF2A 4IJIA 4K8MA 3BJ5A 1WOUA 3ZIVA 1XWBA 1T1VA 5ABRA 1TKDB 2H73A 1G6WA 1O85A 4IP6A 2V1MA 4MDCA 1PL1A 1BQ7A 2L59A 3QCPA 5EPFA 4ID0A 3MWHA 4TR1B 3ZRDA 2C8UA 1VGLA 1M9BA 2GQLA 5ECLB 3MNGA 3ZFLA 1SKSB 2DC5A 3TKPA 3K8NA 7GSSA 4KX4A 4GWRA 2YZHA 1CQGA 2H71A 6GSUA 1LU4A 1U3IA 4ZB9A 2DIYA 3TOUA 4POBA 3GFKA 1ST9A 3GRXA 5IOXA 1T4YA 3C8EA 1NW2A 4JR6A 2VOCA 4TR1A 4WF5A 1XIYA 4F03A 6GSVA 4FYCA 4OD7A 4WR5A 3GKXA 3TOTA 4K0GA 3Q19A 1TP9A 1A0FA 4Q5RA 13GSA 4NAXA 3LXTA 4KDXA 1TRUA 1MEKA 2IFQB 4RUVA 2P5RA 3PGTA 1UVZA 1UN2A 4OWYA 3FKFA 1HD2A 4HS1A 2E7PA 1XVQA 2LRCA 1K0MA 6GSSA 5F0GA 3QMXA 1PN9A 3W6GA 1K3LA 3BD2A 4HJMA 2P0GA 1RK4A 2H74A 1B4PA 1TK0B 4ZB8A 8GSSA 1O73A 1B9XC 5H5QA 2IFQA 1HNAA 2ON7A 2IL3A 3F4SA 2DIZA 3ZVJD 2FUG2 3WGEA 4DVCA 1PX6A 2VIMA 4MJEA 3UL3A 2ALBA 4POMA 2CQ9A 1V58A 5CNWA 2RUEA 1ZCPA 4HU9A 1MD4A 2M80A 3RBTA 1GRXA 2WULA 2XHFA 1X5EA 3FZ9A 5G5FA 1QXHA 4GRFA 1DUGA 1XW9A 1LJRA 3M9JA 3NIVA 4MLYA 1V57A 1G7OA 1SJIA 3DKSA 2O8VB 2H30A 1FOVA 2C0FA 1M7TA 3GL3A 3MSZA 2NDOA 4EDYA 4PUAA 4MZCA 2ZNMA 4FIWA 2FD3A 3R2QA 1VF4A 2OE1A 3CMIA 4TN8A 1FB0A 4J2FA 4AJ6A 3BCIA 3EINA 2AJQB 1NSWA 4FO5A 4O5RA 3DIEA 1EOHA 1X0RA 2HYXA 4L8EA 1XFLA 3W8JA 4ML6A 3HKRA 4MH2A 3F3QA 2HSHA 5AN1A 1O8WA 4L0WA 1AC1A 4TXVA 4GQCA 5ELAA 1H4OA 3L9VA 5LD0A 2DLXA 1TW9A 2HXKA 1E6BA 3ZL5A 2JADA 3UMAA 3QDNA 4OCEA 4NWYA 1A2LA 4K7OA 4RI7A 4MF7A 5ECMB 2KLXA 2RLIA 2CZ2A 2H6YA 5JWRB 3QD9A 2MYGA 4JBBA 1SJ6A 3GH9A 3GMFA 5AIXA 1HQOA 4ZBAA 4ECJA 4G2EA 1GL8A 4WETA 1R5PA 2X99A 2IJYA 1Z6MA 3BCKA 4PQHA 4QL7A 1SL0B 4HOJA 4EUYA 5IOWA 5B7CA 2DJ1A 5ECPB 2C0GA 1AIUA 3LQ7A 2XC2A 3M8NA 4F0BA 4YQMA 1XZOA 4NHZA 3IBHA 2PMTA 4JU5A 1V9WA 3EE2A 1C72A 4ZBBA 3WGXA 3PR8A 4V2MA 5FHIA 5A4WA 5B6NA 1MD3A 1GSEA 1KBNA 4K1FA 1M2BA 2VCTA 4MK3A 1W89A 2AYTA 2LV3A 4O7HA 1F3BA 1ON4A 1SK1A 1EGRA 2VCQA 1X5CA 3IR4A 1EZKA 1K0OA 1RQMA 3LORA 3A5WA 4LMWA 1JLWA 3I9V2 3TJFA 4QL9A 1GTBA 4HQZA 4L5LA 1EEMA 3HCZA 1U6TA 4ML1A 2PERA 3GH6A 5DDLA 1URMA 2GQKA 5IMFA 5HQPA 3KMNA 2GTUA 1ZL9A 3FW2A 2CT6A 3UEMA 2OE0A 2V32A 1B8XA 3O3TA 1T8EB 5D93A 1PKZA 5B8AA 3IA1A 2B7JA 1OE8A 5KN0A 3VPTA 3I6AA 5L71A 3CRTA 2CAIA 1IYIA 1K3YA 4EDZA 1BYEA 5IM9A 4MPGA 1F3AA 1ML6A 3FK8A 5CAXA 3US3A 5HR3A 4TR3A 3P2AA 1Q98A 4GSNA 5ECSA 5J9BA 3QAWA 14GSA 1Z3EA 4HDEA 3H79A 3KIJA 3TB2A 2AV4A 3FHKA 4K6XA 3J7Yk 1K0DA 2DMLA 4EF0A 2A4VA 2J9HA 2C3TA 3DXBA 2LTKA 5F06A 5ECOB 2R4VA 3M1GA 5IO2A 1QGVA 5J9CA 4MF5A 4MJCA 5JCWA 4Q5NA 2B5XA 2FWEA 3E9JB 5DALB 2A2RA 2GSRA 1N8JA 1TK8B 3A2XA 2YWMA 4KW6A 5ENUA 2MZCA 2GS3A 4MA9A 3Q74A 2DBCA 2VLVA 3F63A 2I1UA 1QUWA 1BJXA 4X0XA 3QPMA 3GSTA 2X8GA 1SD8A 5HR0A 4DEJA 1DE2A 2RM6A 5DALA 3GX8A 2CAQA 2V6KA 2VCZA 4V2LA 1ZOFA 2K6VA 5G30A 2IMKA 5DQSA 3GTUB 4XS4A 4DSRA 1THOA 5F05A 1T00A 19GSA 2HNLA 4PUFC 1K0AA 4I97A 1EP8A 4ULXA 3EWLA 1GNEA 11GSA 2QGVA 4EC0A 2OACA 3QAGA 2YPMA 3G7JA 3V1WA 3F6FA 2C4JA 4BVYA 2VLTA 5ECRB 1ZYEA 3DD3A 3APSA 1R26A 1GSFA 2GGTA 5IMZA 3N5OA 3M9KA 1PQNA 3C73A 2B7KA 2K8VA 3FZAA 2PGTA 5G5EA 3P7XA 2B5EA 4YQUA 1PGTA 5IMAA 1G6YA 2H66A 1VF2A 4I8BA 1Z9HA 4YAVA 2CX4A 1Q4JA 4AJ8A 2FY6A 6GSTA 3L0HA 3P8WA 5ELGA 2EC4A 4IJ3A 3IAM2 2HRFA 4KNDA 3LEFA 4ISDA 3GN3A 4PQ1A 4EE0A 2LQQA 1BEDA 4YQVA 1ERTA 2NVLA 1GWCA 1JLVA 2B1KA 1VF1A 4OFNA 1BG5A 3W8SA 4LL4B 1AUCA 2P5QA 5F8BA 3ERWA 3C7MA 4E8HA 1N2AA 2IMIA 4XHMA 1GUMA 3D5JA 3M0FA 3KXOA 4FYUA 1ACVA 5GAND 3FYGA 4I5QA 3WT2A 4JEDA 10GSA 3P90A 2HT9A 3DWVA 3LGCA 2DJJA 1GSUA 2LNTA 2PWJA 5IPGA 1B9YC 2KOKA 1A2JA 2JZTA 1A24A 1JZOA 5ID2B 3GSSA 1SJZA 2HZFA 2C1YA 3VWWA 4V1Ag 3ME7A 1SKRB 1OKTA 3RPNA 2VAFA 2LRNA 3DGQA 2GLRA 2B1LA 1PL2A 1KEBA 3HZ4A 4H86A 4PURA 4KA0A 5FWGA 4MZWA 2N5FA 5F07A 3KGKA 5DCHA 3BBYA 3VI5A 2REMA 3HDCA 4WXTA 1MDIA 1XOBA 2JU5A 2BJXA 5CRWA 3EMXA 4KCEA 1M9AA 4ZILA 3TRXA 4F0CA 4RQXA 3ZZXA 1GLPA 4XRDA 1GSYA 4N0ZA 3DVWA 2GSSA 2IN3A 3GHAA 3KP8A 2G2QA 3HVVA 1FVJA 3A2WA 5IIZA 2JL4A 1WMJA 3IC4A 4WF4A 2LQOA 3KEBA 4TVEA 4CW9A 3TJBA 3F6DA 2YNXA 4ECBA 3FEUA 4EXJA 2E0QA 3KTBA 3TDGA 2JZSA 1ABAA 1JZWA 4ILFA 4OFTA 2YANA 1M2AA 2F3MA 3VI7A 1PX7A 2IMEA 3HYPA 2X64A 5J4UA 3GIXA 1SK2A 4MCUA 5B6MA 2CVBA 4TRXA 2L6DA 2LUSA 3U6VA 5CREA 2FWHA 4TXOB 5EVOA 4TKYA 2H75A 2XPDA 3TRQA 2IPAA 4AJ7A 3ZIJA 1BAYA 3KZQA 1KNGA 4POKA 2WRTA 4WR4A 2MMOA 3LSZA 3SBCA 2OJLA 2MBSA 2A2SA 4Q5QA 5CRDA 1UC7A 2H1AA 3FRCA 4HEA2 1GUKA 1AQVA 5CRGA 2DJ0A 2H01A 4K7IA 2VL9A 1TK5B 5INYA 3WT1A 4TXOA 3C71A 4POLA 1HYUA 3BOAA 4EKZA 2DMMA 1V40A 1CQHA 2GZZA 1GTIA 3APOA 2FWFA 5H5SA 1A2MA 3ZLPA 2HFDA 2B3SA 4IELA 3KJYA 2EIOA 3KH7A 3IPZA 4KDYA 17GSA 2YN1A 2YWIA 5IPHA 3JCML 4BL7A 4KB3A 1B48A 2FGXA 2YOIA 3ZYWA 5D9XA 2LJAA 3Q18A 2K18A 4KSOA 2H6ZA 4NXIA 2GVPA 2X8CA 3QFBC 1F37A 2FLSA 4KH7A 3TKSA 2AUVA 3UBLA 1YZXA 1MDJA 1PD21 4I6XA 3FR9A 5E59A 1SL2B 2F9SA 2FHEA 3AY8A 4PNFA 3ED3A 3KD0A 3O76A 4XS6A 1EEJA 1AQXA 1U88A 3WD6A 3IRAA 5C04A 3D4TA 1QFNA 2OBKA 1SYRA 2N5BA 3F0IA 2O87A 5KN1A 2PPTA 5HFKA 3L4NA 4BWQA 3M3MA 3GUSA 3DRNA 2P31A 5EL8A 1TXXA 3HXSA 4FYBA 2FCHA 2JSZA 3LYKA 1KTEA 4GF0A 4O92A 1R7HA 3C1RA 3CXGA 5DCGA 1YDKA 4IVFA 3D4MA 2VO4A 3GKKA 3SWLA 1FG4A 3TCOA 4N0VA 1XPVA 2VD0A 4DSQA 2L57A 5KN2A 3E0UA 3GL5A 3D6IA 5H5RA 5D9VA 1BX9A 4L5OA 5GSTA 4ZB6A 5E4WA 1SYXA 2LRTA 3F9UA 3NZNA 2VCVA 1O81A 2LJKA 5JCUA 3HD5A 3ZMKA 2H8LA 4AGSA 1ZGNA 1AAZA 1AW9A 2GQMA 3Q6OA 1V98A 4I2UA 4JRRA 1S3AA 5HFIA 1WIKA 2BMXA 5CP1A 4IS0A 1XWKA 3HVXA 2VM2A 5IMVA 3EYTA 2B5YA 4HJ2A 3PH9A 2X8HA 1PSQA 1OKDA 4KGIA 1XBSA 2LSTA 1NHOA 4FH8A 4BVXA 5JCGA 3CSIA 3IK9A 3APQA 3CTGA 1AXDA 2RIIA 4MH3A 1DBYA 1G0TA 3TKSC 3IOSA 1T7PB 1UA5A 2H0HA 3HJOA 1TOFA 5IMCA 1YY7A 2L5OA 3MDKA 2I3YA 1HNBA 2V6OA 3E3EA 1M0UA 4WEYA 5DQYA 3LYPA 4KUNA 2C80A 3UARA 5HFGA 4KE3A 2PUKC 2CVDA 2F8AA 1GSDA 3ZVJA 5IQYA 1TI3A 1TI1A 4KCAA 3HJPA 4BPYA 5ECIB 4ZIJA 2XBIA 4YAPA 2JACA 1X5DA 2XBQA 3H1NA 4TR4A 5DBQA 1YKCA 3GX0A 1QK8A 2VCXA 2FWGA 1OC3A 2R6KA 2WCIA 1JHBA 5D9WA 5JWOB 2HRNA 4CHSA 1RW1A 2VUPA 2GDRA 3EVIA 3PINA 2VL2A 2E2MA 2WZ9A 1EOGA 1YJ6A 12GSA 1V2AA 1PA3A 2GZYA 1E2YA 3GKNA 2YJHA 4MMMA 3GTUA 4IW9A 2IMDA 5A4VA 4BA7A 2YZUA 2B6MA 3D21A 1XCCA 4J57E 1I9DA 3QAVA 3IXRA 4OO4A 1FAAA 1F9MA 3D22A 2H72A 4JE1A 4K2DA 4HZ2A 2M72A 3EU3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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