1EGOA

Nmr structure of oxidized escherichia coli glutaredoxin: comparison with reduced e. coli glutaredoxin and functionally related proteins
Total Genus 28
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
28
sequence length
85
structure length
85
Chain Sequence
MQTVIFGRSGCPYCVRAKDLAEKLSNERDDFQYQYVDIRAEGITKEDLQQKAGKPVETVPQIFVDQQHIGGYTDFAAWVKENLDA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title NMR structure of oxidized Escherichia coli glutaredoxin: comparison with reduced E. coli glutaredoxin and functionally related proteins.
pubmed rcsb
molecule keywords GLUTAREDOXIN
molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
total genus 28
structure length 85
sequence length 85
ec nomenclature
pdb deposition date 1991-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1egoA00
2NDOA 3VI7A 4K1FA 2L6DA 4MZCA 2VIMA 5GSSA 1OKDA 2RUEA 1UVZA 2OBIA 3DVWA 4LLRA 2H6XA 1KNGA 4E8EA 1K3YA 4XCSA 5ABRA 2WZ9A 3HY2A 2L4CA 2WFCA 4MZBA 4K9ZA 1XBSA 4AJ8A 3QFAC 2DMMA 3IE3A 4EF0A 3RPPA 3TJJA 1TRSA 3HHVA 2FGXA 5CRHA 1FOVA 5ECRB 4YH2A 1XVWA 1WE0A 5EVOA 1MDJA 1LBKA 1YF1A 2X64A 4EO3A 2HSYA 3LGCA 4EXJA 3F6FA 4I2TA 4OD7A 2CZ3A 5G2ZA 4KCEA 3HJOA 3BCIA 4O92A 1B9XC 1YY7A 2K18A 3EURA 2A2RA 4AF2A 2B7JA 4ECJA 5IMVA 2B1KA 1TTZA 4MABA 4JZQA 4XS1A 4N0ZA 3GX8A 2FWFA 1XIYA 5HFKA 3P90A 4GWRA 2C3QA 2DLXA 4MJEA 4PGTA 4YQUA 5ECIB 3CXGA 2ON7A 1F9MA 3L9UA 3M9JA 4OCFA 1USBA 2EIOA 1ZOFA 1G7OA 5JCWA 2YZHA 1SD8A 2C0FA 1YEPA 4DSSA 2YPMA 2GVPA 3QOUA 5A4VA 3GIXA 4EE0A 5DVBA 4BWQA 2P5QA 1ZMAA 2H6ZA 3KMOA 1B9YC 2FHEA 1JFUA 1R7HA 4XIHA 5G5FA 4EC0A 1ZGNA 3EU3A 2R6KA 2H70A 4TOPA 3IDVA 3GV1A 1PMTA 1BJXA 5DALA 4KH7A 3ME7A 2MMOA 1VF2A 4FYBA 2KOKA 4MH2A 4GSNA 3E0UA 1PX7A 1YDKA 4ZBAA 3TDGA 3GSTA 2Z9SA 3QMXA 3TKPA 1M2BA 2V6KA 5D9VA 1O8WA 4K0NA 4BVXA 1PN9A 2REMA 4ECIA 6GSVA 2V32A 3ZLPA 3WD6A 2X99A 4Q5QA 3IK9A 2IMKA 4MJAA 1FVKA 4TR1B 2AUVA 1SL2B 1OYJA 1K0OA 2VL3A 5CP1A 5AN1A 2WRTA 2YV7A 2CA8A 2B1LA 1JZOA 2H75A 4EDYA 1BX9A 5IM9A 1GSQA 1ZL9A 2B5XA 3WYWA 1I5GA 1TJDA 3IR4A 3FR6A 3F3QA 3TRXA 2LV3A 5IMCA 5ELAA 4MF7A 2O85A 2QGVA 4KDYA 2HLSA 4BVYA 1GTAA 2OA7A 4IVFA 3QD9A 4PUAA 2XC2A 4X1UA 1M0UA 3APOA 3R2QA 3EMXA 7GSSA 2PVQA 5HFIA 1PD21 1O73A 2L5LA 2MBTA 3F63A 1MD4A 4KGIA 2C0DA 3PGTA 2G0FA 2QC7A 4XS4A 3VPTA 3DVXA 2VLTA 4MF6A 5HR3A 2DJ0A 4PUFC 4LMWA 3MDKA 3DYRA 1F3AA 4KSMA 3G9BA 5EL8A 5A5KA 5B6MA 4MZWA 4N30A 4V2LA 4HDEA 3UAPA 4D73B 2VUPA 1S3AA 4EDZA 1PRXA 3UBLA 2FWEA 3VLNA 1HD2A 4GTUA 2L59A 1SD9A 3TJKA 2EIQA 1BYEA 2ZUPA 2H1GA 4O32A 3V1WA 1Z6NA 6GSXA 5COHA 2GQLA 4OWYA 5CREA 4XTSA 1XVQA 5HFGA 3FHKA 3HDCA 5CNWA 4IJIA 5EY6A 4HQSA 4FO5A 4PXOA 1O81A 2WCIA 4N0VA 1X9MB 2GSRA 3DIEA 2H73A 1VF4A 4HOJA 1GL8A 5H5SA 4FH8A 3EINA 1AQVA 16GSA 3FR9A 4NHZA 4IW9A 1V40A 4LL4B 3RBTA 2NPBA 2F9SA 3DXBA 3ERGA 2FA8A 2LNTA 3S9FA 1G6WA 1OE8A 5CO3A 4K0GA 2HXKA 4OFTA 3MAKA 1XPVA 2DJKA 2DMLA 4RI6A 5CRDA 5IO0A 1SK0A 3LG6A 3U6VA 1K0DA 1G6YA 3KD0A 1FVJA 4IELA 3E9JB 1TRUA 1OC8A 1HNAA 2JADA 2IMDA 1TRVA 4JU5A 3CRUA 3MSZA 3KH7A 1GTBA 3G7JA 2YJHA 2V2GA 1K0CA 5ECLB 3MNGA 1T3BA 2DJ2A 2MZCA 1XWGA 2P0GA 1TK8B 4HZ2A 1TOFA 1IYIA 3EWLA 3O76A 4P3YB 1JZRA 2LTKA 2E0QA 4QL9A 5GAPD 2IPAA 3CSJA 3D21A 4KUNA 4CW9A 2VLVA 4ZB9A 1YKCA 1Z3EA 2CX4A 3L4NA 4HEA2 3H1NA 5B7CA 4YAPA 1R5PA 5IOWA 3LXTA 3ZVJD 2H19A 5DQSA 5DQYA 3GRXA 2DJ1A 5D93A 5G31A 3GX0A 3LYPA 4KDXA 2XPEA 3LWAA 2XHFA 2IIYA 2TIRA 3ZRDA 5KEJA 2HYXA 2TRCP 2XPDA 1GWCA 3FKFA 2R37A 2PWJA 2V1MA 4HUAA 5F06A 2PN8A 1TK0B 1O6JA 4WEYA 4GQCA 2I81A 3VFIA 3C73A 5GZZB 3DKSA 2BJXA 4Q5NA 3F4SA 2PBJA 4TXVA 2FNOA 4TW5A 1OC9B 4POKA 4IJ3A 5AGYA 2H8LA 2PMTA 3IRAA 1XOBA 1U3IA 3J7Yb 3W8JA 3W6GA 3FZ5A 3HZ8A 2PVOC 1UC7A 4KW6A 8GSSA 1X5DA 4K6XA 4OO5A 4KCAA 3P7XA 1GSFA 1AC1A 1OVNA 4KB3A 3WT1A 4PURA 2LS5A 4TRXA 4ZB8A 2WJUA 1ACVA 3DMLA 1TI3A 5HR1A 1TU8A 4FYCA 1Z7PA 3NIVA 3IPZA 4L5OA 2FA4A 3L9VA 1VF1A 2PPTA 5JWOB 1GNWA 2P31A 18GSA 4CHSA 2LRCA 4MA9A 3QCPA 5AIVA 5JWQB 4K7OA 2MMAA 2C3TA 1EWXA 2DBCA 2ZCTA 3O6TA 4ZIJA 3UOMA 4IQ1A 5FWGA 6GSSA 1SJIA 1YF0A 1GSSA 2R2JA 4I2UA 2KP2A 2O87A 1X9SB 3FZ4A 3GKMA 4HU7A 2H76A 1OKTA 4WXTA 1Z5YE 1ON4A 1RK4A 1HNBA 3GFKA 4D73A 2YANA 1M99A 4G9HA 3ERFA 1IYHA 5JCGA 4QQ7A 2JACA 5J9BA 1JLWA 4KSOA 1GUHA 4O5RA 3KTBA 3A2VA 2HRNA 4YQMA 1C72A 2KHPA 5G30A 1J0FA 2CAQA 2C80A 3GUSA 3RHBA 5ECPB 3FYGA 4POBA 3F8UA 3RPNA 1TK5B 2B5EA 2L6CA 3PR8A 1YJ6A 3KH9A 4ZL9A 3E3EA 1XCCA 2GQKA 3KJYA 2LQQA 1KTEA 1SYXA 3UJ1A 1H75A 1EV9A 3UARA 2YWIA 2WS2A 4AGSA 1QMVA 1E6BA 3H93A 4F2IA 20GSA 5C00A 3BJ5A 1FG4A 3GKNA 2WDUA 1HNCA 3U5RE 1HQOA 3M0FA 1LU4A 1F6MC 5GAND 4WBRD 3CBUA 5ECMB 4NWYA 2AHEA 2N5FA 3APQA 3DGQA 4RQRA 4WKWA 3QDNA 1O85A 4GLTA 4IGJA 2J23A 4JE1A 1A2LA 3TUEA 1I9DA 1O8XA 3QAGA 1ZYEA 1A24A 2H66A 1WIKA 4KX4A 5HR2A 1Y25A 4WBJA 2LJKA 1ILOA 3BOAA 1X5EA 5ID2B 3H4KA 3HJMA 4GCIA 1QQ2A 3I43A 1MEKA 5E4WA 2JZTA 2LEGA 2RM5A 3KP8A 2JSYA 4WR5A 3DD3A 1U88A 4JRRA 5A4WA 1GLPA 1TXXA 2AJQB 3VI5A 3F9UA 4LMVA 2CV4A 3TKQA 3IC4A 1SKRB 5D9WA 5DAKA 2FWGA 2EIRA 5B8AA 14GSA 4ID0A 2RUFA 4ISDA 1SJ6A 5H5QA 2M72A 2V41A 1NHYA 2D2ZA 10GSA 1AQXA 3GH9A 3HVVA 3ZZXA 1O7UA 1U3AA 1EGRA 4TXOB 1XW6A 5FT3A 4ECBA 2MBSA 4JEDA 1EEMA 1AXDA 3G7YA 4PQ1A 2C3NA 2F8AA 2E7PA 5CAXA 5KN0A 2CVDA 2K8SA 1ZYQB 3SBCA 4EKZA 3F4RA 4AJ6A 3LEFA 3TRQA 2KUCA 4ZBBA 2VL2C 4LL1B 2K6VA 4XS6A 3TJGA 1QFNA 1NSWA 3D4TA 1PQNA 5D8IA 5F07A 1MTCA 4NMUA 4MH3A 2X8GA 5C04A 2OE1A 6GSYA 1NM3A 4OCEA 5F05A 1BAYA 1N2AA 5H5RA 2HZEB 6GSUA 4Q5RA 5DDLA 1QXHA 5F0GA 3TOUA 2FLSA 3DEXA 1X0RA 3CMIA 5E59A 2CQ9A 2FY6A 2P5RA 4OFNA 4BWSA 2GSSA 4HQZA 3GMFA 4PNGA 4F82A 3DWVA 1GSYA 3TJFA 2KLXA 1B8XA 3NOFA 2IMIA 2VCZA 1AQWA 4F0CA 3BBYA 4K8MA 4WR4A 2VD1A 2GSTA 3GKXA 5ECOB 1ERTA 2OADA 1A0RP 4V1Ap 4WETA 4WF4A 1QK8A 1V2AA 6GSWA 5DBQA 2VM2A 2JL4A 3LQ7A 4MP4A 1TDIA 4CDOA 3GYKA 2IWTA 3ISOA 2B5YA 3VWWA 1R5AA 1MDKA 2VAFA 2DIYA 3K8NA 4K7NA 3F0IA 4FIWA 5IPGA 1XWCA 2GGTA 4IN0A 3IAS2 1Q98A 5D73A 1W89A 2CAIA 1FAAA 3TOTA 2BTOT 4V2NA 2LRTA 3FW2A 1VF3A 3GURA 1SK2A 3HCZA 1WRYA 1JZWA 4HZ4A 1K0NA 2AAWA 2HSHA 5IMFA 4NHWA 3KM6A 4KDUA 1YZXA 5ECQB 2B6MA 2H74A 4MCUA 2YWOA 3EC3A 2G2QA 4DSSB 2JU5A 2OACA 2LNSA 1FW1A 2H1DA 2VM1A 3ZIVA 2B3SA 3EYTA 4BA7A 4AJ7A 1A8LA 3RAZA 1EZKA 3EU4A 3GL5A 1TP9A 2F8FA 2HNLA 3L9SA 4EL1A 5KN2A 3IOSA 1A2MA 4RUVA 3TCOA 1TU7A 2YV9A 5IMZA 3GTUB 2JZRA 2I3YA 4TR4A 1F3BA 3P8WA 3ZFBA 5DCHA 19GSA 4OFMA 3GN3A 4XHMA 4BPYA 1T8EB 4K7IA 4ZBDA 2A4VA 4KA0A 4I6XA 12GSA 3ZITA 1QGVA 3EVIA 3FEUA 2O7KA 3ZL5A 3WGXA 3IXRA 4ILFA 2XBQA 1ZZYA 1N8JA 4POLA 4N11A 5J4UA 2CX3A 1SU9A 3RHCA 1PA3A 2H6YA 4H86A 17GSA 2QKEA 1SKSB 2RM6A 1R26A 3ZMLA 3LXZA 2GLRA 5AIXA 3HZ4A 3FY7A 1CQHA 4BL7A 5ID2A 3CSIA 3GH6A 1XZOA 2GT6A 1F37A 1AUCA 3F4TA 3C1SA 1GUMA 5B6NA 3ZREA 3EMPA 3FZ9A 3QAVA 3VWXA 4WF5A 4NV2A 1LJRA 3TB2A 5D96A 4DSRA 3C1RA 1B4QA 2N5AA 3CTGA 3HKRA 5G1LA 4ZXGA 1URMA 1ML6A 2C1YA 3KCMA 3L0HA 4NPBA 5HR0A 4I8BA 3CSHA 2YN1A 4TR1A 2PUKC 1PKZA 2FCHA 4TXOA 1XXUA 4IBPA 4XS4B 3J7Yk 2X8HA 2VCWA 4O7HA 2NTOA 3VWVA 1EP7A 5F8BA 3WT2A 3CTFA 3VURA 1XFLA 4TN8A 2VOCA 3M1GA 2LKUA 1SKWB 2GQMA 3O3TA 3LJRA 1EGOA 4L8EA 5A4UA 3ERWA 1Z9HA 2GDRA 2HFDA 3PINA 2HI7A 1AAZA 2M46A 1VGLA 1ERUA 4PX1A 1Z7RA 5D9TA 3KTLA 5IMDA 3LFLA 1PSQA 1K0AA 2L4QA 2VO4A 3A2XA 4EUYA 1AW9A 3QR6A 1SENA 3FR3A 2YCDA 3A3TA 2C0GA 1YEXA 1V9WA 2HZEA 1K3LA 1PL1A 1T7PB 4IP6A 5JWRB 2LJAA 4X0XA 4JBBA 9GSSA 3A2WA 3G7IA 4KAEA 2FUG2 1WOUA 1PL2A 3KZQA 5ECSA 3ZMKA 5KN1A 4MPGA 3US3A 4TKYA 5B8BA 2M80A 1THOA 4MJBA 2VL2A 2I1UA 2XBIA 1WPIA 3BCKA 4XRAA 1T00A 2F3MA 5IOXA 1UN2A 1RQMA 2F51A 3HVSA 1F2EA 5DJLA 5J3RA 2IN3A 3HXSA 3WGDA 1XWBA 4OMVA 1MDIA 4MPFA 1R4WA 1CQGA 2E2GA 1EOGA 2MMZA 1WWJA 2LJRA 1FHEA 3P2AA 1EOHA 2J9HA 5ECKB 3ZIJA 1DUGA 4YAVA 1FB6A 4I97A 2I4AA 5J9CA 2WB9A 1Q4JA 2H71A 4L0WA 3SWLA 3HA9A 2RIIA 3N9JA 1AIUA 1SL0B 1XWAA 3UEMA 4LA1A 4MJCA 2KP1A 1GUKA 2H30A 2PGTA 5ECNB 1SK1A 1V98A 5IPHA 2ALBA 1U87A 3ZFLA 2HE3A 3UL3A 4HS1A 4N10A 5ECHB 3UIWA 4HI7A 2GS3A 3I6AA 1A23A 1GLQA 2K9FA 3GL3A 3KEBA 3LORA 2RLIA 3ZTLA 3H79A 1EP8A 2VL9A 1Y6EA 4ZB6A 3IHQA 4TVEA 3C71A 2CVBA 3TKSC 3KIJA 1NW2A 2GZPA 1K0BA 4G10A 1SYRA 5ENUA 4J2FA 2WGRA 2PU9C 3Q18A 3TJBA 3GKKA 3GTUA 4IKHA 1ERWA 1VRSD 3GNJA 2R5GA 3JCML 5G1KA 3I9V2 4HJ2A 1DE1A 4E8HA 1G7EA 2OE0A 1T1VA 3KXOA 3W8SA 3ED3A 3CYNA 1DBYA 2LUSA 5KN3A 3KP9A 1TRWA 2DJ3A 1U6TA 1W4VA 3GSSA 4J57E 4MK3A 1A2JA 1J08A 3VWUA 1EV4A 1B4PA 3C8EA 2BMXA 2ZNMA 1FO5A 2LRNA 1KEBA 4ML1A 2VCQA 5DCGA 3QPMA 1GP1A 4IP1A 2VCXA 2IFQB 2YWNA 2VCTA 4HU9A 4G19A 1EEJA 1Z6MA 1WP0A 4PQHA 2OKAA 3LSZA 1DE2A 4IHUA 4F03A 5LNKe 4PNFA 2ON5A 3MWHA 3Q74A 5CRGA 1ZCPA 3ME8A 3H8QA 1OC9A 1YQ1A 4IS0A 2GTUA 2H0IA 3UBKA 3C7MA 1TI1A 4YQVA 1SJZA 2L5OA 1OC3A 2QSIA 4NXIA 5EPFA 3TKSE 4KE3A 11GSA 2OJLA 2HZFA 4FYUA 4I5QA 1A0FA 2YOIA 5L71A 3DRNA 5LD0A 4NV5A 2FD3A 2NVLA 4ZILA 3I69A 4GF0A 4J56E 2H01A 2LQOA 1BEDA 1M9AA 2EC4A 4F0BA 3BD2A 1HYUA 1V58A 4K2DA 4XRDA 2A2SA 2MMNA 3WGEA 3HVXA 3LYKA 3QFBC 1NHOA 3F3RA 4G2EA 2YP6A 4QL7A 3A5WA 3KMNA 2C8UA 2V6OA 4TR3A 3HD5A 5FHIA 5G5EA 4DVCA 3IBHA 3UMAA 2GT5A 1FB0A 1THXA 5INYA 3FK8A 1TW9A 1XW9A 2O8VB 2B7KA 1JHBA 3OR5A 4GQFA 3IAM2 2H72A 2GZZA 5HQPA 4EVMA 4V2MA 4GSTA 4DSQA 2LSTA 4ZL8A 1PGTA 4POMA 2MYGA 3FZAA 4OO4A 2VD0A 2H1BA 1GH2A 1E2YA 1XW5A 3PH9A 3TGZA 3N5OA 5IMAA 3D6IA 2AB6A 4JR4A 4GXZA 2CZ2A 1GNEA 4TR0A 2PERA 4MMMA 4L5LA 1QUWA 1X9WB 2CVKA 1M9BA 3VK9A 1XOAA 1V57A 3CRTA 3M8NA 1RW1A 1OAZA 4ECCA 2H0HA 2YWMA 4IQAA 5DJMA 1SL1B 2H0GA 2C4JA 3RDWA 5IIZA 2CT6A 3D22A 3Q19A 2N5BA 4ML6A 5D9XA 3TKRA 1X5CA 5DALB 2NBSA 3QAWA 4GRFA 3D4MA 4ACSA 1GSUA 3NZNA 3M3MA 2YJ7A 2I9HA 3IK7A 5ELGA 1GSEA 1JZDA 4Q5FA 4RQXA 13GSA 4JR6A 1S3CA 2HRFA 1JLVA 1GULA 5DAKB 1GSDA 2AV4A 3ZYWA 4ULXA 2C0EA 3AY8A 2AYTA 1OE7A 2YNXA 22GSA 1DSBA 2TRXA 2HT9A 2E2MA 5J5NA 1M2AA 1UA5A 3ZVJA 1WJKA 1ST9A 3HYPA 2DIZA 4MLYA 3D0ZA 4ZL7A 1MD3A 1B48A 2OE3A 1A8YA 2O89A 5CYYA 3TRPA 3GA4A 3IV4A 1PKWA 3F6DA 2R4VA 3M9KA 3UVTA 1S3DA 4RI7A 3GHAA 2OBKA 2IL3A 5LCZA 4KNDA 2VCVA 3HJPA 3D5JA 6GSTA 2VLUA 1BG5A 4NAXA 2WULA 2JSZA 5IQYA 4Z7XA 3FRCA 3IA1A 4L0UA 1T4ZA 2ES7A 5AISA 2L57A 2H1AA 2JZSA 2K8VA 4V1Ag 2IMFA 1WMJA 3L78A 1TKDB 1M7TA 1KBNA 1ERVA 4MF5A 2IFQA 1K0MA 1K3OA 5CRWA 4HJMA 3TKSA 4F9ZA 3KGKA 2GZYA 1XWKA 2X8CA 3EE2A 2DC5A 3APSA 1H4OA 1BQ7A 4GSSA 5IO2A 4DEJA 1PX6A 1G0TA 2R3XA 1YKAA 2DJJA 3VPQA 2IMEA 1M2DA 1GTUA 2DSAA 1GTIA 3UVHA 5GSTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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