1EGRA

Sequence-specific 1h n.m.r. assignments and determination of the three-dimensional structure of reduced escherichia coli glutaredoxin
Total Genus 25
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
25
sequence length
85
structure length
85
Chain Sequence
MQTVIFGRSGCPYCVRAKDLAEKLSNERDDFQYQYVDIRAEGITKEDLQQKAGKPVETVPQIFVDQQHIGGYTDFAAWVKENLDA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Sequence-specific 1H n.m.r. assignments and determination of the three-dimensional structure of reduced Escherichia coli glutaredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAREDOXIN
molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
total genus 25
structure length 85
sequence length 85
ec nomenclature
pdb deposition date 1991-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1egrA00
3QAWA 2YZUA 4X43A 5EPFA 2AB6A 4ZBAA 1MEKA 1NHOA 6GSSA 4WF4A 2PVOC 5DJMA 4Q5FA 3NOFA 4Q5QA 2X8CA 3LWAA 1HNBA 3WT2A 2H1DA 2LJKA 2YPMA 4FYCA 3F4RA 3IDVA 1GUKA 4MZBA 2B7JA 2VD1A 4K0GA 3M1GA 3C73A 1M2BA 3HCZA 1B9XC 3Q19A 4BA7A 5ECNB 3CRTA 5C04A 1TI1A 2LV3A 1FG4A 2GSRA 2H6XA 5IMDA 5B8BA 1NM3A 1OYJA 5GAND 2KHPA 4HEA2 4WF5A 4IS0A 4L0UA 1O7UA 6GSUA 1K0MA 4K1FA 5CREA 3KJYA 1YJ6A 3IHQA 2FA8A 1K0NA 4POBA 1Z6NA 4ZL8A 4GQCA 2AUVA 4Q5RA 1MD4A 5IOXA 3FYGA 3LJRA 5AIXA 2R5GA 1QUWA 4GTUA 2V6KA 3IV4A 1WWJA 1XWAA 4DEJA 2FNOA 5ECHB 19GSA 3ZVJD 2JACA 1K3LA 3D5JA 5IO2A 2LTKA 3KCMA 4GRFA 3DIEA 2WULA 2H19A 2H01A 3EC3A 4ZILA 1M99A 5J9CA 5HR1A 4IQAA 1X9WB 4YQVA 5D9TA 12GSA 2IPAA 5DAKB 4HS1A 2CA8A 3J7Yk 16GSA 1O85A 4POKA 3U5RE 1GTIA 1JHBA 5J41A 2C1YA 4XS6A 5ID2B 2H0HA 3EMXA 4BPYA 2B7KA 2IFQB 1U6TA 3ERFA 4V1Ap 4HI7A 4EF0A 4MA9A 1G6YA 2FWFA 2YV9A 1M0UA 2B5EA 3JCML 1B9YC 5F07A 1A23A 4MH3A 3EMPA 1O81A 3GSTA 3C1SA 1R5PA 1K0DA 1OC9A 2LJRA 1MDJA 2H0IA 4YAPA 4I2TA 4DSSB 4KUNA 3KMOA 3HJOA 4DSRA 4TXVA 3HHVA 3VWVA 2OA7A 1SK1A 2JSZA 3CBUA 6GSWA 4MZCA 1FO5A 2BJXA 2YN1A 3UJ1A 2WZ9A 1G7EA 4F82A 3L9SA 4LLRA 4PXOA 3IRAA 3TOTA 2IMIA 4MJEA 1PA3A 4ZXGA 1EV9A 4IP1A 3KH9A 1YDKA 2HSHA 4K6XA 1T7PB 2X8GA 4IELA 3Q74A 1CQGA 3A2VA 2GZPA 5IPGA 4J57E 3C1RA 2C0GA 1T00A 3DRNA 3D4TA 4HU9A 2R6KA 4L5OA 2GZZA 2PUKC 2X99A 5D96A 4ECIA 4F0BA 4NHWA 2FGXA 3F8UA 2H73A 3TKQA 4ECCA 4EUYA 2M46A 3GIXA 1AC1A 1TW9A 4JU5A 1Y25A 2ZCTA 3IXRA 5KN3A 3QDNA 1SJZA 2OE1A 5H5RA 3LGCA 5G31A 1GUHA 1JZOA 1TRWA 1SKSB 18GSA 1RQMA 1IYIA 2DSAA 1VF1A 4KA0A 3HVSA 1B4PA 2VCWA 1XVQA 1SJ6A 3HXSA 1GNWA 3F3RA 3F4SA 3I43A 3KGKA 3UMAA 1LU4A 2N5FA 3TJBA 1Z9HA 3IC4A 4MCUA 1DUGA 1A0FA 1GTUA 3TKPA 2ES7A 4V2LA 6GSTA 2N5AA 4JBBA 2HNLA 4RQXA 5B6MA 3GRXA 1XZOA 1T4YA 4ZIJA 2H76A 2MMNA 1TK8B 1OKDA 4N0VA 1H75A 2HFDA 2L5LA 3Q6OA 5G5EA 1A0RP 1T4ZA 4ML1A 3D4MA 1TU8A 3HD5A 4K0NA 3D21A 2VAFA 2H74A 1HD2A 2YWOA 2GT6A 5DQYA 2O8VB 1H4OA 6GSXA 2FUG2 2LJAA 5G2ZA 1M9BA 5J4UA 1F3BA 2CX4A 4Q5NA 2L6DA 4XTSA 3M8NA 2DJ1A 1XCCA 2OBIA 4O32A 1AW9A 1PGTA 4WBRD 2O87A 2H8LA 1WOUA 2WB9A 2N5BA 1BEDA 1U3IA 3IR4A 2E7PA 1XWGA 2C8UA 1EEJA 2H70A 4TRXA 4CHSA 3WGXA 2PU9C 1QQ2A 1M2AA 1ACVA 2KP2A 1R26A 2O85A 2V6OA 2CZ2A 1ON4A 3GL5A 3UBKA 2LQOA 2XBQA 2AYTA 4MP4A 3RBTA 1O73A 3GH6A 1F3AA 4XRAA 3A2WA 4QL9A 3QAVA 1ST9A 1N8JA 4QL7A 2CX3A 2FWGA 1OKTA 3GSSA 1EWXA 1XPVA 4I2UA 2H1AA 5HR2A 2RIIA 2IN3A 2AJQB 1XWCA 5F05A 5GSTA 2I1UA 1V40A 4HDEA 1DBYA 3FZ9A 2LUSA 3LXZA 4IVFA 1J9BA 5ABRA 1GWCA 5A4VA 1MDKA 4XS4B 2QGVA 5IOWA 4GSNA 1Z3EA 2WFCA 2WGRA 3UVTA 5JWQB 2F8AA 1ZYQB 4BVXA 4ZL9A 2E0QA 2KP1A 2V32A 4JRRA 3ED3A 4HZ2A 5KEJA 2H72A 1TRVA 5ECIB 1XWKA 1OC9B 3O6TA 3TDGA 3BCKA 4LL4B 2GS3A 3LFLA 2OACA 4BVYA 3VWUA 3TRPA 1G7OA 2DMLA 4IN0A 3H93A 1T3BA 1ZOFA 4BWSA 5HQPA 1X5DA 3DXBA 4NWYA 1VRSD 1ZMAA 6GSYA 1I9DA 3TB2A 1GULA 1JZRA 4EDYA 3L0HA 4G10A 4AGSA 2WCIA 1GTBA 5AN1A 1C72A 2HE3A 4KE3A 4MF6A 5IIZA 2HI7A 2L59A 2X8HA 3FY7A 3IK7A 3IK9A 2H71A 1GSYA 3EU3A 3G7IA 3W8JA 3MSZA 4O92A 3PH9A 3C8EA 3PR8A 4O5RA 3O3TA 3TJKA 2K8VA 1V57A 3TCOA 5IMVA 1KEBA 1PQNA 2FY6A 4H86A 3DEXA 2PERA 2YWIA 5G1LA 3HKRA 5D9XA 1XWBA 2HXKA 1FB0A 5G5FA 3KM6A 4OFTA 3ME7A 3TRXA 1M7TA 1Q98A 4OO5A 1EGRA 5ECQB 1A24A 1VF2A 3UOMA 1TK5B 4YAVA 3V1WA 4TXOA 5L71A 2CZ3A 2C3NA 2DJ3A 3CMIA 1EZKA 2HZFA 1MDIA 2K18A 2YJ7A 3ME8A 5IQYA 2QSIA 4KDYA 1U88A 3ISOA 4OCEA 2LRNA 4HUAA 3CSHA 3QCPA 1QGVA 3VI7A 4DSQA 4NPBA 5CYYA 5ECSA 2XBIA 2GQMA 4F9ZA 20GSA 5GZZB 2IMDA 1AUCA 4G9HA 1SD8A 2HSYA 3EURA 1EP7A 3M0FA 3WT1A 4PGTA 1FVKA 4O7HA 5EVOA 2EIQA 2H0GA 3W8SA 3WGDA 1BJXA 4MDCA 4KH7A 4EXJA 1BX9A 2DBCA 1HNCA 2RLIA 3LORA 1ZL9A 4WXTA 2KLXA 1FW1A 2H1GA 4ECJA 3WYWA 5J3RA 1URMA 4ACSA 3IAM2 2I3YA 1B4QA 4ZBBA 3L9VA 2M80A 3DD3A 2IL3A 1KTEA 2A2RA 4GLTA 1M2DA 5D73A 2OADA 1KBNA 1XXUA 3D22A 1SL0B 1EOHA 2NTOA 2ALBA 5LCZA 1SL1B 4LMVA 3IOSA 4LMWA 1SYRA 2B1LA 4IQ1A 5A4UA 4K9ZA 4XHMA 4XS4A 4WEYA 4LL1B 2HZEB 1R5AA 2PN8A 3F6DA 5CRWA 3QMXA 1DE1A 4JR4A 4YQUA 2DC5A 1OE7A 4JE1A 4AF2A 3TKSC 3VLNA 4V2MA 1I5GA 2YNXA 4PNFA 2IIYA 1K0CA 1AQWA 4E8HA 3CYNA 2JZTA 1THOA 1SL2B 1TJDA 2H6YA 4K7IA 3GKMA 2C0DA 3CTGA 4EE0A 2VCQA 5HFKA 2MBTA 4KSMA 3KD0A 5HFIA 3KZQA 4CW9A 4OFNA 5ENUA 4RI6A 2VLVA 3HY2A 1QMVA 3C7MA 1X9SB 1GL8A 3MNGA 3LQ7A 1TK0B 3KEBA 2IMEA 4JZQA 4TVEA 1NSWA 1WMJA 2P5RA 4MF7A 3LG6A 1YY7A 2H75A 1ERWA 1S3AA 2OE3A 4ILFA 3TJJA 2DJ0A 1PL2A 1Z5YE 1SK0A 5H5SA 2MYGA 1PL1A 1PKWA 3PGTA 3KP8A 4KDUA 3FEUA 4N11A 2CVBA 2LQQA 3FK8A 1AAZA 2OBKA 3ZYWA 1A2LA 1PSQA 2VL9A 4MLYA 1AIUA 2BTOT 2B5XA 2Z9SA 5G1KA 1K0BA 5JCWA 3TGZA 4NAXA 1E2YA 4IGJA 1V2AA 3LEFA 4AJ7A 4KSOA 3TKRA 1T8EB 2OKAA 3UIWA 1TRSA 4I5QA 4V1Ag 3ZITA 2JZSA 4HQSA 3ZMLA 4EDZA 2PBJA 4TR3A 5FHIA 4IJIA 2PGTA 2B6MA 3GYKA 4N10A 4RQRA 5HR0A 2YWMA 1HYUA 2VCVA 5CNWA 4MJBA 5AISA 2MMOA 3QFAC 3CXGA 1TTZA 3F63A 2TRCP 3M9KA 3ZVJA 3KH7A 2GZYA 4K2DA 4KCEA 3GH9A 5E59A 1G0TA 3H8QA 1BG5A 5EL8A 5FT3A 3BCIA 3ZL5A 5C00A 4YH2A 5CRHA 4FIWA 4HOJA 2H66A 4FH8A 4TXOB 1ZZYA 2YJHA 2FHEA 3RHBA 5J9BA 5DCHA 3M9JA 1RW1A 4IKHA 1ILOA 2HRFA 4ZB9A 2KUCA 1GRXA 2GSQA 4XRDA 2B3SA 2BMXA 1J08A 4AJ8A 1OVNA 4L8EA 2DJKA 1SU9A 4OD7A 1N2AA 1XFLA 2YANA 2L4CA 2C0EA 1IYHA 4TKYA 3ZMKA 3G9BA 5A5KA 3UEMA 4FYBA 3HJPA 3DKSA 3F0IA 5H5QA 5LD0A 1XW5A 5DCGA 1PMTA 3RPNA 3GX8A 1XIYA 1SK2A 3EU4A 1EOGA 5F06A 2RM5A 3HA9A 2VL3A 1TP9A 1YQ1A 2IJYA 2DMMA 1ERUA 4OFMA 4L0WA 2XC2A 2EIOA 1JFUA 5HR3A 4TR1A 3KTBA 1TU7A 4X0XA 5ELAA 3IAS2 1A8YA 4HJMA 1OE8A 3ZIJA 3P7XA 4ULXA 3FR3A 3CTFA 2MMZA 2VCTA 1A2MA 1Z6MA 2HZEA 3DGQA 1PX7A 5E4WA 4POLA 3BBYA 4OMVA 3HYPA 1MTCA 3GUSA 5DBQA 3EWLA 3VI5A 1HQOA 3ERGA 1GLPA 2C3TA 2F9SA 1B8XA 2F8FA 3HZ4A 4QQ7A 2YZHA 1V58A 2PMTA 4KGIA 1FAAA 2REMA 2CQ9A 2O7KA 3TKSA 4GCIA 4EKZA 5DALA 2GT5A 3M3MA 3HDCA 5DQSA 3UL3A 3GHAA 4XS1A 2YCDA 4ECBA 2LKUA 1GTAA 2GLRA 1PN9A 4ZB8A 1GSFA 4TW5A 3VURA 4NXIA 10GSA 4MABA 3SWLA 2CAQA 2FA4A 1WE0A 1F6MC 4XIHA 3EVIA 4ZL7A 2C3QA 4KNDA 1M9AA 5B8AA 4PQIA 1G6WA 4WR4A 4MF5A 3QR6A 3GKNA 3TUEA 4HQZA 1DE2A 3GTUA 3APSA 3W6GA 1O6JA 3UARA 4AJ6A 2VLTA 2FWHA 3HVVA 1JLVA 2K6VA 1YKAA 2JZRA 3K8NA 3HJMA 1YEPA 1R4WA 2GQKA 2VL2C 2AHEA 1QXHA 4KCAA 2P31A 3I69A 1GSQA 2AAWA 1FOVA 2FWEA 3HZ8A 5DDLA 1ZGNA 3VFIA 1TOFA 11GSA 4PX1A 4YQMA 2GSTA 4GQFA 2RUFA 2O89A 4BL7A 6GSVA 2GSSA 4HZ4A 4WETA 1PKZA 1GLQA 5KN1A 4TR0A 3J7Yb 2FLSA 1F37A 2L5OA 5CRGA 1EEMA 3G7YA 4J2FA 2J9HA 1JLWA 1MD3A 4PQ1A 4ID0A 3GX0A 3FZ5A 1XW6A 2TRXA 4IJ3A 3ZFBA 1X5EA 3ERWA 2XHFA 5LNKe 2CT6A 4N30A 2R2JA 5CAXA 1OC8A 3BOAA 1K0OA 2X64A 3SBCA 3RPPA 1CQHA 2DLXA 2R3XA 5IPHA 22GSA 2RM6A 2GDRA 1NHYA 1YKCA 4I97A 5DVBA 5ECMB 3CRUA 4MPFA 2IWTA 1W89A 2ZUPA 3EE2A 3CSJA 5IMFA 3VK9A 2G2QA 1XW9A 2HT9A 2EC4A 3GN3A 5D93A 3ZZXA 3PINA 5AIVA 5ECPB 1ML6A 2P0GA 3MWHA 5D9WA 2IMFA 3FKFA 3TJGA 5A4WA 4ISDA 2C4JA 3P8WA 2VOCA 5EY6A 5F8BA 4JR6A 1ABAA 5JCGA 1EP8A 2A4VA 4RUVA 3US3A 2ON7A 3DYRA 4I8BA 2QKEA 1DSBA 5IMAA 5CO3A 3DVWA 2H30A 4J56E 2YOIA 4K7NA 5B7CA 1QFNA 1SYXA 4E8EA 2R4VA 3BJ5A 4G19A 1TKDB 1PRXA 4MH2A 3GV1A 4OO4A 5IMZA 1S3DA 2I4AA 1XOBA 5ECRB 5J5NA 1ERVA 3EINA 2L4QA 3TJFA 1AQXA 4TR1B 1K0AA 1TXXA 4IP6A 4MK3A 1VF3A 3E3EA 1BAYA 3ZFLA 1BYEA 3UAPA 3QFBC 1B48A 1VF4A 1V98A 4PURA 1GSDA 4ZBDA 2FD3A 3S9FA 2DIYA 4LA1A 2HLSA 1FB6A 4XCSA 2GTUA 3A5WA 4RI7A 3H1NA 1NW2A 5GSSA 4V2NA 1VGLA 3LSZA 1UN2A 3AY8A 3FZAA 5DALB 2LEGA 2DIZA 1Q4JA 1TI3A 1V9WA 5DJLA 1K3OA 4F0CA 1SD9A 1GSUA 3ZIVA 3IA1A 1JZDA 3U6VA 1EV4A 1LJRA 2XPEA 3QPMA 4D73A 1A8LA 2FCHA 4GSTA 4BWQA 2DJJA 3VPQA 2PVQA 4WKWA 2VO4A 1XOAA 2MZCA 2EIRA 2QC7A 2VIMA 4G2EA 4IBPA 5KN0A 1U87A 3H4KA 3QD9A 1WRYA 4MPGA 4ZB6A 3GTUB 2PWJA 3N9JA 3APQA 9GSSA 3GNJA 2VL2A 4Z7XA 3KTLA 3GL3A 3KXOA 3ZREA 2JU5A 3F3QA 4DVCA 2P5QA 1OAZA 2LS5A 3H79A 1GP1A 3F4TA 4K8MA 3G7JA 1R7HA 1SENA 4PUFC 4GSSA 1FVJA 2NBSA 1LBKA 1A2JA 3FR9A 5IMCA 2B1KA 4FYUA 5COHA 2LRCA 2V2GA 5AGYA 3VWXA 3L4NA 4POMA 2ZNMA 2A2SA 1X9MB 2CVKA 4OCFA 1GSEA 3DVXA 1J0FA 2D2ZA 5G30A 2LNSA 4PNGA 7GSSA 1E6BA 1YEXA 14GSA 3KP9A 3APOA 2TIRA 13GSA 5D8IA 1XBSA 3QOUA 4EVMA 3WD6A 1WPIA 2F51A 3IE3A 2K8SA 3ZTLA 1WIKA 2LRTA 1O8WA 2OJLA 1F9MA 4EO3A 1UA5A 2GGTA 2NDOA 1USBA 3Q18A 4TN8A 3P2AA 1Y6EA 3NZNA 5HFGA 3MDKA 5CRDA 3FR6A 2WJUA 1Z7RA 5ECOB 3I9V2 3VPTA 1YZXA 3CSIA 3ZLPA 3DMLA 3GURA 4NV2A 3LYKA 2J23A 2YWNA 2VUPA 4X1UA 1FHEA 3LYPA 3BD2A 1ZCPA 3A3TA 3UBLA 4KW6A 1SKWB 3L78A 4KB3A 1S3CA 4I6XA 5INYA 1U3AA 1GUMA 4KAEA 3GMFA 3O76A 2VM2A 2R37A 5JWOB 1O8XA 1GSSA 1SJIA 2H1BA 2V41A 1JZWA 1GH2A 1TDIA 4NV5A 3LXTA 4NMUA 17GSA 2L6CA 1WP0A 2I9HA 2VD0A 3TKSE 3FZ4A 2NVLA 3IBHA 5F0GA 3GA4A 4CDOA 2G0FA 5DAKA 2L57A 3KMNA 3QAGA 3N5OA 4WBJA 4EC0A 2H6ZA 3FW2A 4K7OA 2VCZA 5CP1A 1PD21 3WGEA 2ON5A 5KN2A 3P90A 5ID2A 2PPTA 5D9VA 2CAIA 4WR5A 4L5LA 1HNAA 5B6NA 4IW9A 1EGOA 3OR5A 3ZRDA 1WJKA 2IFQA 3GFKA 2YP6A 4TR4A 1TRUA 1RK4A 3UVHA 4GWRA 2E2GA 5IO0A 2CV4A 5FWGA 5IM9A 3DWVA 2JSYA 2LSTA 4JEDA 3IPZA 2KOKA 3TOUA 3R2QA 3GKKA 2CVDA 5ECKB 1AXDA 4MMMA 1F2EA 3F9UA 2JL4A 1SKRB 2WDUA 4ML6A 2WS2A 3L9UA 1UVZA 2V1MA 1W4VA 3HVXA 1K3YA 4HU7A 4DSSA 2WRTA 2NPBA 3RAZA 4IHUA 4PUAA 4F2IA 4NHZA 2K9FA 3C71A 3RHCA 2DJ2A 4KX4A 3FHKA 2I81A 4MJCA 8GSSA 3D6IA 4EL1A 3FRCA 1ZYEA 2HRNA 2JADA 2XPDA 1X5CA 2VLUA 3A2XA 3EYTA 1XVWA 4N0ZA 4OWYA 2LNTA 1PX6A 4TOPA 5JCUA 2C0FA 5JWRB 1OC3A 1YF0A 2E2MA 4GXZA 1QK8A 2IMKA 2VCXA 3RDWA 3KIJA 2YV7A 5GAPD 1YF1A 2RUEA 4D73B 2OE0A 2M72A 3GKXA 4KDXA 1Z7PA 1T1VA 3I6AA 4P3YB 1X0RA 1AQVA 4GF0A 1KNGA 4PQHA 2VM1A 3TRQA 2GVPA 2B5YA 3VWWA 3NIVA 5ELGA 5ECLB 1GNEA 2C80A 4FO5A 1UC7A 4HJ2A 2MBSA 3D0ZA 2AV4A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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