1ERUA

Human thioredoxin (oxidized form)
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPCKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDCQDVASECEVKCMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
EMPTYS1 (2-4)S3 (52-58)TI4 (59-62)AH1 (8-18)AH3 (63-69)TII'1 (18-21)S2 (22-28)TI3 (58-61)TI1 (29-32)AH2 (33-48)TI2 (49-52)AH4 (94-104)S4 (76-81)TIV2 (73-76)S5 (84-90)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structures of reduced, oxidized, and mutated human thioredoxins: evidence for a regulatory homodimer.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
total genus 30
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-02-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1eruA00
3ZLPA 1EEJA 2CVBA 4ZB8A 3VLNA 1XWKA 1OKDA 2O87A 1OE8A 1EV4A 1ML6A 2RM6A 3LQ7A 2K6VA 4V1Ap 1FAAA 1V57A 5IMCA 2CV4A 2R2JA 4ML6A 1BYEA 14GSA 4NHWA 1HNAA 3LGCA 5ECHB 3I9V2 1HD2A 4RQXA 5G31A 3FZ4A 4TXOA 3TRQA 4WXTA 4WEYA 4XCSA 13GSA 3ZVJD 4HDEA 3IHQA 4ISDA 2OACA 1A23A 4DSSA 5HFGA 4Q5NA 1QFNA 3DVXA 2NBSA 3ZIVA 3KMOA 4NHZA 1PX6A 3TKQA 5A4VA 3Q19A 5IPGA 1G6YA 1RK4A 6GSSA 2LJAA 3HYPA 1V58A 1G6WA 2YWOA 4YH2A 1CQHA 2C3NA 1NW2A 3H79A 5HR1A 2EIOA 1OAZA 1PSQA 4DVCA 4ZBDA 1A8LA 2WCIA 3F6FA 1AIUA 4MZCA 2NDOA 2JL4A 4MMMA 1M2DA 2CAIA 3LWAA 2R3XA 4V1Ag 10GSA 5LNKe 4YQUA 3MAKA 4PQHA 3UARA 5J41A 4ZIJA 1X5CA 5JWRB 4KDYA 4EUYA 3EWLA 3F63A 2EIQA 20GSA 4F03A 3HZ4A 3C1SA 2YANA 1M2AA 4AJ7A 1OKTA 2I1UA 1XW5A 2IMDA 3F6DA 3FYGA 4EDYA 3KJYA 1V9WA 3IRAA 3N5OA 3I6AA 4JR4A 4RQRA 4K6XA 4EC0A 3O3TA 3SBCA 2X99A 4PXOA 5HR2A 3KCMA 3APQA 2A2SA 3H4KA 1XW6A 4MP4A 3ZFBA 1B8XA 3FRCA 3NOFA 1YF0A 3N9JA 3FR9A 1U88A 1TOFA 3I69A 5FWGA 1VF3A 2VLUA 3MNGA 2L4CA 3RPPA 4OCEA 4I2TA 1JFUA 3E0UA 2HNLA 4O32A 3A2VA 2LJKA 1A2MA 2LRNA 4MZWA 4FYUA 3DYRA 4TR4A 5IMZA 3FW2A 4HU9A 2CX4A 2RM5A 4IQ1A 3GFKA 2H73A 2PPTA 2IMKA 3PGTA 1HNCA 2AB6A 4K2DA 2ALBA 5ECKB 3FZ9A 4L0UA 5JCWA 3BOAA 1TKDB 4ACSA 5COHA 1A2LA 3TJGA 2FWGA 1XWCA 3IBHA 4MPFA 3GKXA 4K8MA 4L5LA 2GS3A 4E8EA 5FT3A 4K0NA 4KE3A 5KN2A 2L5LA 2GTUA 5B8AA 3UL3A 4CDOA 2QSIA 4F0CA 1QGVA 1YF1A 4EKZA 4KDUA 2B1LA 5JCGA 3KH7A 2GGTA 3VPTA 3KH9A 4KSMA 4GF0A 1WE0A 2NTOA 4V2MA 1SKRB 2OADA 4K1FA 5CREA 1OC9A 1M0UA 2RIIA 3CYNA 3VFIA 1WJKA 3UAPA 1N2AA 1E2YA 2OE3A 1K0NA 1EV9A 1SK2A 2DJ1A 4PUFC 4I8BA 1SU9A 5EVOA 5H5SA 5INYA 3F4TA 2H1AA 3F3QA 2VAFA 3GTUB 5D9XA 1XBSA 2P5RA 3DMLA 1GSDA 3FKFA 4N30A 1XIYA 2JADA 2REMA 2H72A 3LYPA 2XHFA 2CT6A 3F4RA 2JU5A 2E2GA 2HZEB 3IK9A 5F8BA 2WB9A 1QQ2A 1TJDA 2L5OA 2VOCA 3IPZA 1K0BA 4ZILA 2XPEA 1MTCA 2YWNA 4K7NA 4HZ2A 2BTOT 3CXGA 4BVXA 3Q74A 3GNJA 2LUSA 2HXKA 1RQMA 2ZUPA 1EWXA 5AN1A 3Q18A 1B9XC 2YCDA 5B7CA 1U6TA 2J23A 2YN1A 4IGJA 3EVIA 2GDRA 2P5QA 4ZL8A 4MABA 1M9BA 4G2EA 4NAXA 1THXA 1AQXA 2CA8A 7GSSA 2L6DA 2VCZA 2R6KA 2GSTA 1PMTA 18GSA 1SL1B 3OR5A 2YPMA 4ZL9A 2IMEA 1V2AA 4O92A 1K3OA 2VCTA 3LEFA 2Z9SA 3IOSA 3VURA 3ISOA 4WKWA 3TRPA 4IQAA 4ILFA 4NV2A 3WGDA 4POKA 3BD2A 4E8HA 1SK0A 1ON4A 1QK8A 3F0IA 1WMJA 4MJAA 1TRUA 4TKYA 2IWTA 3WD6A 2C1YA 1XZOA 4X0XA 2E7PA 1XWGA 4GQCA 4TRXA 2N5FA 3LYKA 3VWVA 2MBSA 4P3YB 1TU8A 3UIWA 1XW9A 2XBQA 2ZNMA 3TKSC 5G1LA 3M0FA 3MWHA 3ZITA 1PL2A 2JZSA 1Q98A 1OVNA 4G19A 3APOA 3A3TA 4HU7A 1GTUA 2VL2A 4HOJA 4HS1A 3HKRA 1F9MA 2OBKA 2N5AA 2LV3A 1DBYA 4HQZA 2FY6A 3TKPA 1YZXA 4AF2A 4GTUA 1YKCA 1OC3A 3CSJA 3FHKA 4IP6A 5A5KA 4TR3A 4WR5A 5DJMA 5ECOB 4WBRD 2IPAA 2RUEA 1XVWA 2RUFA 5B6MA 1GLQA 2H1BA 4MDCA 2LRCA 2MBTA 1PKWA 5GSTA 5IO0A 4PURA 1ILOA 2H8LA 19GSA 1KTEA 4PQIA 4OWYA 1NHYA 4MH2A 2GT5A 2C3TA 4G10A 2CZ3A 2LTKA 4J2FA 1PL1A 4J56E 4OO4A 11GSA 1OE7A 3WGXA 3C73A 4MA9A 3S9FA 4AJ6A 5F0GA 5ID2B 1U3IA 2YNXA 1M2BA 3EU4A 2K18A 2YWMA 3KM6A 1YQ1A 4IP1A 1RW1A 1A2JA 1R4WA 4KAEA 4ID0A 5IMFA 4O5RA 2GZPA 3ERWA 1FG4A 4JBBA 1EP8A 3FEUA 3GA4A 5E59A 4XHMA 5L71A 1JZDA 1Z9HA 4H86A 4F9ZA 4MK3A 2H1DA 1TU7A 3MSZA 5G1KA 4MLYA 1FHEA 2DC5A 1ZYQB 4IS0A 2N5BA 5J9CA 2WGRA 4LA1A 2H01A 2HSYA 1X9MB 1ZCPA 3GURA 2H19A 2DJJA 4TOPA 3UVTA 3G9BA 1TK5B 2OJLA 1MD3A 3LJRA 3A2XA 2VM1A 2VL3A 1PD21 1XCCA 2GSSA 2H30A 3PH9A 2IJYA 4F82A 1SYRA 2LRTA 3H1NA 5CRWA 1K0DA 2F8AA 3TJBA 3GSTA 5IQYA 4DSQA 4RI6A 4JRRA 3NIVA 2GQLA 4AGSA 1SKSB 4IW9A 2DJ2A 3GIXA 1M7TA 3D4TA 1TRVA 4POLA 1MDIA 1GSYA 4HJ2A 3BBYA 3QAVA 4GRFA 3ZVJA 3HVVA 4XS4B 2AJQB 5FHIA 1GTAA 3HVSA 4IHUA 1EEMA 3KEBA 3QOUA 2B5EA 1U87A 5F05A 5KN3A 5G5EA 3ZMLA 4JZQA 2DMMA 3VWUA 2HYXA 1EOHA 2XPDA 5ECNB 4ECBA 4GSSA 1F6MC 3L9UA 3HJPA 5AIVA 2XBIA 3GX0A 5DBQA 2IN3A 2JZTA 1F37A 4MJEA 3L9SA 4KB3A 3WT1A 4ZBAA 2J9HA 3O6TA 5D9TA 3GTUA 5F06A 2FWHA 5HFIA 1F2EA 3CSHA 4NPBA 4MCUA 1ZMAA 2FD3A 2TIRA 2L4QA 2WDUA 3IC4A 2IMFA 2HZEA 2E0QA 4MH3A 4GSNA 2C8UA 2H6ZA 1IYHA 2PVQA 4RUVA 1J0FA 2FNOA 2L6CA 2WZ9A 3ME8A 1A8YA 2CAQA 2GLRA 4Z7XA 4F0BA 4OCFA 2LKUA 2WULA 2VUPA 5CYYA 5D73A 2GSQA 1XXUA 1TXXA 1Z6NA 3C1RA 1TTZA 3EC3A 2MMAA 3EURA 3L0HA 3P8WA 3G7YA 3TJFA 3TKSE 3GL3A 1FB0A 1CQGA 1SYXA 1DE2A 2TRXA 2VCXA 3DRNA 3FZAA 4GXZA 4IBPA 1GTIA 2GSRA 4Q5RA 1T4YA 1E6BA 3RAZA 4YQVA 5ECLB 2YZUA 2HRFA 2M46A 2KOKA 1SL2B 2ES7A 3QAGA 2VO4A 5IMVA 1FB6A 1WPIA 2C0FA 2LNTA 5LD0A 1SD9A 4JR6A 5J9BA 2MZCA 3IK7A 2FWFA 2IMIA 3UEMA 4ECCA 3EMXA 3CRUA 2HLSA 5CRDA 3W8JA 4BWQA 3CMIA 4PX1A 1GNEA 6GSYA 4NV5A 1UA5A 4FIWA 2PERA 3HXSA 2DSAA 1VF4A 4MJBA 3RDWA 4IN0A 1AC1A 3HZ8A 1K0MA 1T1VA 3UJ1A 1F3BA 2PN8A 2KHPA 4G9HA 4OFTA 1EGOA 4LL1B 5B8BA 4WR4A 1TI3A 6GSUA 4PNFA 2FGXA 1JLWA 5ECRB 3UOMA 5F07A 4JU5A 3IXRA 1X5DA 2HI7A 2WRTA 2VLVA 3VI7A 1XPVA 22GSA 3HHVA 1MEKA 5CO3A 1QMVA 5AIXA 4BA7A 2OE0A 3DVWA 4N10A 3G7JA 2VLTA 3L4NA 1WRYA 1PGTA 1V98A 3TRXA 4TW5A 1FW1A 2B6MA 2CVDA 4GLTA 1F3AA 2IIYA 5EY6A 2TRCP 2DLXA 2YOIA 1QXHA 3ERGA 1J9BA 4IKHA 4ZXGA 1O8XA 1JHBA 3KTLA 1ZZYA 2GQKA 2VD0A 2YZHA 2DBCA 4IELA 2C0DA 4GCIA 1R26A 5DAKB 5DDLA 1SENA 1MDJA 3IAS2 2PMTA 3UBLA 3RPNA 1GSQA 1TDIA 2EC4A 4LMWA 5B6NA 5D9VA 5DQYA 3EMPA 4F2IA 3FK8A 2B7JA 4BL7A 2CVKA 1M99A 1X5EA 2O85A 17GSA 2L59A 2GT6A 1THOA 5ABRA 4XRDA 1VRSD 5KN0A 5ID2A 3VI5A 1EOGA 3TB2A 4OFNA 2V1MA 1Q4JA 3TCOA 3HD5A 2NPBA 3IE3A 4EXJA 2HT9A 3HA9A 2PGTA 9GSSA 4XS6A 2HSHA 5IOXA 1JLVA 3ZIJA 2HZFA 4FO5A 2IL3A 5D96A 4XS1A 1YY7A 3D21A 4K7IA 2F8FA 1ZYEA 4EVMA 1K0OA 4L0WA 3W6GA 1UC7A 4KGIA 2V6OA 4LMVA 1OC8A 1WWJA 1GULA 5D93A 1A0FA 4NWYA 5ECPB 1O81A 2B5XA 3E3EA 2BJXA 3MDKA 1FO5A 2H0HA 2H74A 1S3CA 3ZL5A 3M8NA 3EU3A 1TI1A 4JEDA 1VF2A 5IPHA 1USBA 2VL2C 4FYCA 2I81A 1Z5YE 5A4UA 4EDZA 2O89A 16GSA 3IDVA 2HRNA 1EZKA 1JZOA 1LU4A 4IVFA 2PVOC 1GWCA 3QCPA 1BAYA 1YJ6A 5GZZB 3GH9A 5D9WA 3TDGA 4KUNA 2PBJA 4KX4A 2LQOA 2H71A 1TRSA 3J7Yb 4XS4A 6GSWA 2KP2A 1QUWA 4XIHA 2VCWA 2V41A 3BCKA 3RHBA 2H66A 3ZRDA 3D5JA 5CAXA 2YJ7A 3FR3A 1UVZA 1Z6MA 1R5AA 3R2QA 1URMA 1SL0B 3GL5A 3KGKA 6GSXA 3CTFA 2OBIA 4Q5QA 5AGYA 1BJXA 3KTBA 4KDXA 1VF1A 2YV9A 2AYTA 1GTBA 5CNWA 4DEJA 1B9YC 1AQVA 1PKZA 1FOVA 1T7PB 4PQ1A 3UMAA 1Z3EA 2LNSA 4ZBBA 2R5GA 1KNGA 4K9ZA 1W4VA 5EPFA 4OO5A 2WFCA 5GSSA 1G7EA 3RBTA 4HQSA 4EL1A 3GHAA 4KA0A 4LLRA 2MMZA 2VD1A 3CBUA 1MD4A 8GSSA 4L8EA 4GSTA 1ERUA 2I3YA 1K3LA 1HYUA 4N11A 4ML1A 2MMOA 3GYKA 2XC2A 3ZFLA 3QDNA 4I6XA 2FCHA 1ZGNA 2JSYA 3ED3A 1GSSA 2B5YA 3JCML 2FA8A 3QR6A 2X64A 1Z7RA 1B4QA 2DJ3A 4NXIA 4GWRA 1ACVA 3O76A 1T00A 4IJ3A 4I5QA 4TXVA 2GZZA 3LG6A 3ZREA 1S3DA 1G0TA 1Y6EA 3ZMKA 3GV1A 3TOTA 6GSVA 6GSTA 2R37A 3HJOA 3ERFA 2WJUA 2PWJA 4WBJA 4TR1B 2K8SA 3C8EA 1XWAA 3IA1A 4ULXA 5DCGA 1GSEA 2MMNA 4NMUA 5DJLA 3LORA 4D73B 1M9AA 3M9KA 2IFQB 1KEBA 1XFLA 3HJMA 1N8JA 5CP1A 4RI7A 1NHOA 5CRHA 3GH6A 3GX8A 1DUGA 3M3MA 3CSIA 2H70A 1NM3A 2V6KA 5IMAA 3LFLA 3C71A 2D2ZA 5ENUA 2JZRA 3CRTA 4EE0A 5G30A 3IR4A 1IYIA 2A2RA 2KLXA 4YAVA 4OFMA 2QGVA 5G5FA 1AW9A 3WYWA 3VPQA 1DSBA 3KMNA 4KH7A 2GQMA 5C04A 1BG5A 2JSZA 3KZQA 2VIMA 5H5RA 5GAND 3LXZA 5ELGA 1MDKA 4HJMA 1LBKA 2H76A 5JWOB 1SKWB 3HDCA 1H75A 2LEGA 1O85A 2M80A 2ZCTA 3A5WA 2VCVA 5ECQB 5JCUA 1R7HA 1T8EB 3GN3A 2P31A 1W89A 5C00A 2I9HA 3APSA 3EINA 2ON5A 2C0EA 4HUAA 5J5NA 3PINA 1EGRA 2H6XA 4DSRA 2O7KA 2H1GA 5CRGA 5G2ZA 4V2LA 3GMFA 4OD7A 4XRAA 3TJKA 1SJZA 2GZYA 2FWEA 5ELAA 1S3AA 4MJCA 2VL9A 4N0VA 5DAKA 2DMLA 2ON7A 3F4SA 3UVHA 3QD9A 3DXBA 2DIYA 5DALB 5EL8A 3F9UA 3HY2A 1PN9A 2HE3A 1DE1A 2BMXA 2OA7A 3TOUA 3TKRA 3M9JA 4YAPA 4I97A 4MF6A 4Q5FA 4KNDA 2F3MA 5HQPA 2P0GA 2K9FA 3QFBC 2LSTA 1XOAA 4K7OA 4WETA 2K8VA 3DEXA 1KBNA 3KXOA 3J7Yk 4ECIA 1PRXA 5IMDA 2CQ9A 2G2QA 4HEA2 4XTSA 5A4WA 4YQMA 1WIKA 1HNBA 3DIEA 3D6IA 1GP1A 1K0AA 3BCIA 5IM9A 4V2NA 3LXTA 3P90A 2AAWA 1X9WB 3FR6A 4IJIA 2L57A 3L9VA 4BPYA 5LCZA 2H6YA 4TR0A 5D8IA 2VCQA 5J3RA 4TXOB 4HZ4A 3HCZA 2YWIA 5JWQB 4ZB9A 4LL4B 1AXDA 2X8GA 1T4ZA 3BJ5A 4DSSB 5IO2A 2X8HA 5DVBA 1JZRA 3FY7A 1ERVA 3FZ5A 2H75A 3ME7A 2R4VA 2F51A 3DD3A 3AY8A 1YEXA 1X9SB 2CZ2A 4HI7A 1AQWA 4QQ7A 2DJKA 2VM2A 3F3RA 2LS5A 1OYJA 1GH2A 4OMVA 1YDKA 2MYGA 2FA4A 1VGLA 3SWLA 3H93A 4KCAA 1B4PA 1GUKA 1WOUA 2RLIA 1GSFA 4X1UA 4PNGA 1WP0A 2LQQA 2YP6A 2EIRA 3G7IA 2B1KA 4K0GA 1O7UA 3TJJA 4ZL7A 1K3YA 3GUSA 1V40A 4CW9A 3C7MA 2OE1A 1R5PA 3IV4A 2O8VB 1PX7A 1AAZA 1H4OA 1XWBA 2H0GA 3A2WA 2QKEA 1ST9A 3VWXA 1TRWA 1ERTA 5IOWA 2FLSA 2WS2A 3QAWA 1U3AA 1A0RP 1BX9A 2JACA 4KW6A 1O73A 1PA3A 5KN1A 3EYTA 3GKNA 1FVJA 3V1WA 1XVQA 3GSSA 3DGQA 2OKAA 1BEDA 3LSZA 3D0ZA 3QMXA 1JZWA 3IAM2 4FYBA 3F8UA 4AJ8A 1TK8B 2LJRA 1XOBA 1A24A 3GKMA 2PUKC 5GAPD 2HFDA 1GSUA 1O8WA 2DIZA 3L78A 2M72A 4MF5A 3ZZXA 4QL9A 5HFKA 2C3QA 2PU9C 2F9SA 1AUCA 1I9DA 5DCHA 3I43A 4N0ZA 2KP1A 1Y25A 1EP7A 2I4AA 4QL7A 3U6VA 1NSWA 1GUMA 4PUAA 2FHEA 3ZTLA 2A4VA 1PQNA 4L5OA 3PR8A 5J4UA 12GSA 3TGZA 4ECJA 3KD0A 5DQSA 3QFAC 5H5QA 2X8CA 1O6JA 3K8NA 1K0CA 1BQ7A 4TR1A 3NZNA 5HR0A 2QC7A 3WGEA 3GRXA 4KCEA 1FVKA 2NVLA 2B3SA 3CTGA 3GKKA 4D73A 1C72A 1GRXA 2IFQA 3HVXA 3KIJA 3P2AA 4MZBA 5HR3A 2B7KA 4POBA 1HQOA 2GVPA 1J08A 4BVYA 1ZOFA 3ZYWA 4WF5A 3US3A 4EO3A 1SD8A 1T3BA 1TK0B 3M1GA 1SJIA 1TP9A 1YEPA 3UBKA 2AV4A 1UN2A 4GQFA 1ZL9A 3KP8A 1OC9B 1ABAA 4PGTA 3DWVA 4POMA 4I2UA 2G0FA 3QPMA 3D4MA 4MPGA 4J57E 3TUEA 2V32A 2C80A 5E4WA 4BWSA 3KP9A 1SK1A 4KSOA 5KEJA 3E9JB 2YJHA 1GL8A 3W8SA 1Z7PA 2CX3A 1ERWA 3TKSA 1X0RA 3P7XA 4JE1A 3Q6OA 1G7OA 2C0GA 5AISA 1GUHA 4MF7A 2V2GA 4TN8A 3VK9A 3U5RE 1I5GA 2KUCA 4WF4A 1LJRA 4TVEA 4ZB6A 3WT2A 3VWWA 4X43A 3D22A 5ECIB 2FUG2 3DKSA 2C4JA 4O7HA 5DALA 1GNWA 1B48A 2YV7A 5ECMB 3EE2A 1TW9A 2H0IA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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