1ERVA

Human thioredoxin mutant with cys 73 replaced by ser (reduced form)
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPCKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDCQDVASECEVKSMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of reduced, oxidized, and mutated human thioredoxins: evidence for a regulatory homodimer.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 39
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-02-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1ervA00
8GSSA 3GMFA 1N2AA 5IPGA 1F3BA 3C8EA 3VWXA 3GH6A 1J08A 3GKMA 4V1Ap 1R7HA 4IHUA 3FR6A 1ML6A 4PUAA 3H4KA 2V41A 2VM1A 1J0FA 4RI6A 2CAIA 2ON5A 2MMOA 2X99A 2YP6A 2X8HA 2F8FA 13GSA 5CRDA 3HJMA 1GLPA 3I43A 3UVHA 5DQYA 3ME7A 2MBTA 1YKCA 2L4QA 5DDLA 1BEDA 3VURA 2M72A 1EZKA 2CAQA 3Q74A 4NAXA 1GUMA 3UIWA 3M9KA 3DKSA 4F82A 3TKSA 1XW5A 4MJEA 1A24A 2BTOT 2JU5A 4I8BA 2H1AA 4BVXA 3NZNA 1PL2A 4IVFA 1SYXA 4QL7A 2H72A 4TR3A 1O6JA 3IAM2 1A2LA 1OC8A 1FO5A 4N11A 4PUFC 1ERUA 3FRCA 4ISDA 5A4WA 5D9WA 3EMPA 5AN1A 3HVSA 3QOUA 3L4NA 5F0GA 1GTIA 2OACA 4LMVA 3IC4A 3O3TA 3EVIA 2GGTA 3GRXA 2H6XA 1JZDA 3GSSA 2DSAA 3EU3A 3SBCA 1V40A 1IYIA 4JR6A 5ECLB 5IM9A 4PXOA 2PERA 5J5NA 5D8IA 2CX3A 1Z9HA 1QFNA 1JHBA 2M46A 1OKTA 1K0NA 2I4AA 1RK4A 2JACA 3QD9A 3MSZA 2IIYA 1VF4A 2GSTA 1ZOFA 4XIHA 1O85A 1EV9A 4I97A 1O7UA 2HZFA 3FZAA 1OC9B 1ST9A 2RUEA 4BVYA 1GH2A 3W6GA 3E9JB 1EOHA 2F51A 3TRPA 3HA9A 3P2AA 1BX9A 2IMFA 1X0RA 4QQ7A 1ZL9A 3GFKA 2HSHA 18GSA 3P90A 4Q5RA 5DJLA 3RHBA 2GQKA 3GA4A 2QC7A 2LJRA 1V57A 2OBIA 3HXSA 2TIRA 3IK7A 4V2MA 3RPNA 2H1BA 3G7JA 2C0GA 5B7CA 9GSSA 1EWXA 3F4SA 5G1LA 5J9CA 4AJ6A 3ZIVA 5IO2A 2YWOA 1TKDB 1OC9A 2PN8A 3D4TA 1SJZA 4GQCA 2H66A 4MPFA 4MMMA 3ZITA 2K8VA 2CV4A 5ECSA 5HFIA 6GSWA 1S3AA 3GV1A 4XS1A 1ZYQB 4MH3A 3BBYA 2AB6A 2K18A 1GSQA 3O76A 2DC5A 2B5XA 1EEJA 4YQVA 3FZ4A 4F2IA 2R37A 1OKDA 3QPMA 3L9VA 3GH9A 3L9UA 1SU9A 1AQVA 4XHMA 5ABRA 3VWUA 4ZBBA 3W8SA 3G7YA 5H5SA 1XWBA 1Z7PA 4L8EA 4IELA 3BOAA 2REMA 2BJXA 4K8MA 1GP1A 1OC3A 2YPMA 4GLTA 2FWHA 5D9XA 4POMA 2QSIA 5IMAA 1HNAA 4O7HA 1K0BA 1G0TA 2XPEA 5H5RA 3FKFA 1SD8A 3IHQA 4PQIA 2NPBA 5AIVA 2FWFA 3FEUA 3TKRA 5ID2B 1VGLA 2ALBA 1MDJA 4QL9A 3G9BA 1JZRA 1F6MC 1DE1A 3M0FA 1Y25A 1FB0A 2LTKA 3KTBA 3CRTA 2WRTA 2JZRA 2FWGA 3L78A 1BAYA 4ZXGA 1ZYEA 4PGTA 2GDRA 2O89A 5EVOA 4IN0A 4OFNA 3M1GA 4JBBA 3QAGA 4NHWA 5JCWA 3ERFA 1YKAA 3J7Yk 1AQWA 3I9V2 3GX0A 3V1WA 4X43A 2EC4A 1Q98A 1G6YA 4ZB8A 5B8AA 3DYRA 4F03A 1Z3EA 1MD3A 6GSUA 3D4MA 2YZHA 4IP1A 2MMNA 2YV9A 4F0CA 5ID2A 2MYGA 1VRSD 4JR4A 3D21A 1EEMA 3IV4A 3HYPA 4K7NA 4IS0A 1M2AA 4YQUA 2O87A 5HFKA 2RLIA 5DAKB 4ECCA 4OO5A 1GTUA 3HVXA 3GURA 2C4JA 1QUWA 2PU9C 3KGKA 4EDYA 2FY6A 2CZ3A 3FR9A 1XFLA 4HS1A 1MDIA 1T1VA 4EUYA 3EC3A 2AYTA 4EF0A 2YWMA 6GSVA 4Q5FA 2FD3A 2JSZA 1EP7A 2I81A 1XWCA 5G2ZA 2V32A 5A5KA 2FHEA 5A4VA 1MD4A 3VWWA 2ZCTA 3ZYWA 4GCIA 1WP0A 5ECIB 4X0XA 4KDYA 3KMOA 3LYPA 1M7TA 3UBLA 5FT3A 2L59A 3EURA 5JCGA 3SWLA 5ECPB 5DAKA 5G1KA 2H6YA 5DQSA 3PH9A 1WMJA 4KDXA 1WE0A 2RM5A 1B9XC 5JWQB 3L9SA 4AJ8A 5D73A 4YQMA 4WKWA 1WRYA 2VL3A 3M8NA 4KCEA 2K8SA 4F9ZA 4MF7A 3ZVJD 4IP6A 3TJGA 4AF2A 4L0WA 1AUCA 2AJQB 2O85A 2L4CA 1XOAA 4XRAA 1T3BA 2HT9A 1T00A 4I2UA 4NWYA 3GNJA 2EIQA 1SYRA 1T4ZA 5JWOB 2GLRA 5D93A 1BQ7A 2R4VA 3M9JA 4Q5QA 3TKSC 2Z9SA 5CNWA 1EGOA 1M9BA 4OD7A 1B8XA 2IWTA 3DIEA 4WR5A 2DJ1A 3IRAA 2NTOA 1ILOA 2J9HA 16GSA 2P5QA 1SK1A 2WCIA 1SK2A 1WPIA 1MDKA 5E4WA 4ZB9A 3IBHA 3VI5A 6GSYA 2DMLA 4IGJA 2PBJA 1PN9A 1HQOA 2XHFA 3N5OA 1SK0A 1BG5A 1R5PA 3HD5A 1HNCA 5D9VA 5E59A 2B5YA 2A4VA 4YAVA 1PX6A 5IMFA 3VFIA 5HR0A 2HE3A 4KH7A 5IMCA 2IN3A 3WT2A 3EYTA 3ZFLA 2VD0A 1A23A 1FG4A 5ECNB 3BD2A 3EU4A 5IMZA 4KSOA 3ZFBA 1X9WB 1BJXA 5IQYA 4OMVA 2WJUA 2H0IA 1GTBA 4X1UA 3ZL5A 1UA5A 3QR6A 1RW1A 2L6CA 2PVQA 4J2FA 2EIOA 2HRNA 3UVTA 1A0FA 1M99A 1AIUA 2R5GA 1S3DA 4GSNA 4G2EA 4MK3A 1C72A 5L71A 1O8XA 1GUKA 3ME8A 4DSSB 2JZTA 2H71A 3WGEA 3ZLPA 2HLSA 1O73A 5HR3A 2E0QA 1PKZA 2GSRA 5INYA 1CQHA 4XTSA 2F8AA 1I5GA 3A3TA 1TRUA 2FWEA 2LSTA 1T8EB 3LORA 4ZILA 1YY7A 2LQQA 3C7MA 3LEFA 1SJ6A 2X8GA 3APOA 2H01A 1TW9A 4L5OA 2MBSA 2BMXA 1OE7A 4PX1A 5ECQB 5JWRB 3M3MA 5ECKB 2CVKA 3QAWA 4I2TA 3LSZA 4HU7A 2V2GA 2M80A 3BJ5A 4DSSA 1V9WA 3APSA 2H74A 2AAWA 2HFDA 2KP1A 1XWAA 3LXZA 2HYXA 1JFUA 4D73B 2IPAA 1XZOA 1SKRB 5ELGA 1TU8A 4FH8A 1ON4A 5G5EA 3GL5A 2XC2A 1LU4A 2IMDA 4G10A 3TRXA 5ECOB 4MCUA 4AJ7A 3TJJA 3MAKA 2P0GA 1SL2B 1N8JA 2VCWA 4IKHA 1XWKA 1KTEA 4GRFA 4NHZA 1X9SB 2H70A 2OADA 4ECJA 2G2QA 4ECBA 1FHEA 4KDUA 2GT5A 1ERVA 5DALB 4FYUA 4DSQA 5C00A 3VPQA 3F4RA 4MJCA 2ES7A 1G7OA 3F3RA 4D73A 3HJOA 4K7OA 2MMZA 4FIWA 1NHYA 2OE1A 3LGCA 4I5QA 1R26A 5HQPA 2I3YA 3HVVA 1Z7RA 2YANA 1UN2A 5IIZA 1HYUA 3MDKA 4N0VA 4GSSA 1V2AA 2OE0A 4G9HA 2VL2A 2B1LA 4GTUA 1FB6A 1OAZA 1YF0A 3EWLA 10GSA 1F2EA 3QFBC 2WS2A 1XIYA 2GSSA 5DALA 4IQAA 2D2ZA 3GX8A 3KTLA 2DJ3A 1LBKA 2YWIA 3U6VA 2VD1A 3RHCA 2L5LA 4ZL9A 4DVCA 2F9SA 3CSIA 3UJ1A 5KEJA 1SKSB 3DD3A 2XPDA 4NXIA 1F3AA 4KUNA 4XS4B 1VF3A 4GQFA 2IMEA 3LQ7A 1EOGA 3LJRA 5IOXA 1TI1A 1TP9A 1E6BA 4FO5A 11GSA 22GSA 3CXGA 1K0OA 1XWGA 2L57A 4P3YB 2H19A 4ZL8A 5CRGA 4LMWA 4MABA 4NPBA 2LV3A 3KEBA 2RIIA 3CTGA 3R2QA 4GXZA 1GSFA 1H75A 3GL3A 3TB2A 4PNFA 4PQHA 3GSTA 3TJFA 1DUGA 1TRVA 4IBPA 4NMUA 1AC1A 2X64A 4WF5A 1DBYA 1FW1A 4LL1B 4GWRA 4XS4A 5DCHA 2IMIA 4AGSA 2CVBA 2RUFA 2NDOA 3VPTA 2VCVA 4RI7A 2GS3A 1EGRA 3TKPA 4HU9A 4MA9A 4MF6A 3P7XA 1TDIA 4EO3A 5GAPD 1VF1A 3UBKA 2IFQB 1SL0B 5FHIA 1TJDA 4G19A 1XVQA 1RQMA 5GAND 1TTZA 5IPHA 3RAZA 4WF4A 2HXKA 3C1SA 4JEDA 3TKQA 1EP8A 2E2MA 4O92A 1ZGNA 2C0FA 5ECRB 4KCAA 1U3IA 3H8QA 1W89A 2YJ7A 4XCSA 4PURA 1GSDA 2WDUA 1KBNA 3ZIJA 1AAZA 4OWYA 5KN3A 4O5RA 12GSA 5HR1A 3FYGA 3TOTA 2GQMA 4LA1A 1K0MA 3Q6OA 3DMLA 2FNOA 2IFQA 3MNGA 3ZTLA 14GSA 4MP4A 3Q19A 2R3XA 3GN3A 1MEKA 4HQSA 2B7JA 3LWAA 1XVWA 1M2BA 1JLWA 1TI3A 4HJMA 2PWJA 2RM6A 5DBQA 2LJKA 2C8UA 2C3QA 2F3MA 4ULXA 2FLSA 3APQA 3HJPA 2I1UA 2VIMA 3GYKA 3K8NA 4EDZA 1GUHA 2OBKA 1LJRA 4ECIA 3A2XA 3NOFA 4N0ZA 3IR4A 4OFMA 2LKUA 1XCCA 4WXTA 5AGYA 2OA7A 1G6WA 2TRCP 5B8BA 4IW9A 1YQ1A 5CAXA 3L0HA 1XW9A 2IMKA 4TXVA 4E8EA 1USBA 3E3EA 2YN1A 2A2SA 1PSQA 3IAS2 2DJ2A 2FCHA 4MJBA 4HJ2A 4L0UA 1AXDA 2LQOA 3H93A 1GTAA 2K6VA 2LJAA 2KHPA 1K3YA 4POLA 3TRQA 2OE3A 4MLYA 3IK9A 1PMTA 4YAPA 2QKEA 3ERGA 3CSHA 5IO0A 3ED3A 1Z6NA 4MZWA 4DSRA 1PA3A 2MMAA 1K0DA 2FA8A 1OYJA 1B48A 5CYYA 3DGQA 2DIZA 4RQRA 1JZOA 2K9FA 3ZRDA 1ZMAA 4MJAA 5F06A 2LEGA 2X8CA 4MH2A 2KOKA 4WBJA 3ZZXA 3GKNA 3F6DA 3KP8A 3W8JA 2YCDA 5F05A 4ACSA 1A2MA 3A5WA 4MF5A 4EVMA 1B9YC 3ZVJA 5LNKe 3O6TA 3H1NA 3IE3A 2LNSA 4Q5NA 5J4UA 2WULA 3QAVA 3F3QA 1QGVA 5F07A 1R5AA 1O8WA 1DSBA 1PQNA 4V2LA 4TXOB 2PGTA 2PMTA 4POKA 5EL8A 2PUKC 5J3RA 3FW2A 3PR8A 3KH9A 4PNGA 2NBSA 1M9AA 1MTCA 3EMXA 3KIJA 4GF0A 2TRXA 3UL3A 1EV4A 4KX4A 3E0UA 3DEXA 4YH2A 3TDGA 4CHSA 4HQZA 5COHA 3Q18A 3IDVA 3TJKA 1KNGA 2L6DA 1QMVA 2LRTA 1F9MA 4CW9A 2CX4A 1FVKA 3TKSE 3A2WA 2C1YA 2C3TA 1YEXA 4H86A 3CYNA 3MWHA 4TVEA 5B6MA 1XXUA 2VLVA 4WBRD 2H73A 2DMMA 4TW5A 4TXOA 4V1Ag 1V98A 4FYCA 7GSSA 4KNDA 2LRNA 4HZ2A 2VL2C 2VL9A 2C80A 4WETA 4EL1A 1U3AA 4GSTA 3CRUA 2KLXA 1B4PA 2GSQA 3DWVA 3C71A 1THOA 2GZPA 1KEBA 5HFGA 2C0EA 1A0RP 3WYWA 4LLRA 2N5BA 4FYBA 3VLNA 5C04A 2VCZA 2DJ0A 1O81A 2LS5A 2PVOC 3I69A 3VWVA 2YWNA 2FGXA 3KXOA 1JLVA 2B6MA 4K2DA 1XPVA 1HNBA 5D9TA 1BYEA 1PKWA 4CDOA 3LG6A 5JCUA 2VCTA 1YZXA 3C1RA 3GIXA 4RUVA 3GUSA 2GQLA 3G7IA 4JU5A 2DJKA 4KW6A 2VCQA 2GZYA 3EE2A 2H76A 4ML6A 1FOVA 4NV2A 1PX7A 3VK9A 4N30A 5G30A 1A8LA 3IPZA 1TXXA 3UAPA 4BL7A 1K0CA 2B5EA 3WGXA 2HSYA 5ECHB 4JRRA 4TN8A 5DCGA 2ZUPA 3DXBA 2LUSA 3I6AA 2YV7A 1GNEA 5CRHA 5CO3A 4JE1A 2JADA 4BWQA 2DIYA 1W4VA 4MPGA 4WR4A 5CREA 3QCPA 2R2JA 2FA4A 5ELAA 4V2NA 1XW6A 5G5FA 2VOCA 3D6IA 3F9UA 2JSYA 3GTUB 5LD0A 4N10A 1F37A 1X5CA 3J7Yb 4EXJA 3IOSA 3FHKA 1GL8A 3D5JA 3PGTA 1GLQA 1TK0B 1NM3A 5GZZB 5AISA 2H1GA 4ILFA 2ZNMA 4KA0A 2V6OA 2CQ9A 1K3LA 1FVJA 1XBSA 3P8WA 3D0ZA 4J56E 4K0GA 2XBQA 17GSA 3KP9A 2KUCA 4TR1B 4EC0A 4TR0A 2V6KA 5A4UA 1K3OA 3IXRA 4TOPA 3PINA 1WWJA 3H79A 2OKAA 3F8UA 3QDNA 1Z6MA 3GTUA 1YDKA 4HI7A 1J9BA 2R6KA 2JZSA 4J57E 1ERTA 1ACVA 1U88A 2G0FA 4L5LA 3A2VA 5H5QA 1GWCA 4ML1A 3FR3A 2H75A 2AUVA 2H30A 2GTUA 2IJYA 1DE2A 2DLXA 4ZBDA 1VF2A 2CVDA 1M2DA 1G7EA 4Z7XA 4ZIJA 1AW9A 4ID0A 4BPYA 2P5RA 1Y6EA 2O8VB 3BCKA 2H8LA 1B4QA 3WT1A 2C3NA 4TR1A 4DEJA 2O7KA 2VM2A 2YZUA 5EY6A 4TRXA 5CP1A 4XS6A 1GULA 4I6XA 1SD9A 3C73A 3KM6A 5GSSA 1GSEA 4HUAA 1NSWA 3HY2A 3KD0A 3NIVA 1IYHA 1GNWA 1THXA 4OFTA 4O32A 5EPFA 1A8YA 4OCFA 3JCML 1TOFA 2LRCA 3ERWA 4OO4A 5D96A 1WJKA 3CMIA 3RPPA 2N5FA 5F8BA 1Z5YE 3KJYA 1SENA 3FK8A 4TKYA 4K1FA 5B6NA 5CRWA 2FUG2 20GSA 3HHVA 2GVPA 3FY7A 4NV5A 5G31A 2B1KA 5HR2A 3US3A 2NVLA 3HZ4A 3VI7A 1T4YA 5IMVA 4KSMA 1E2YA 2HI7A 2ON7A 1UC7A 1OE8A 3TJBA 2EIRA 3KZQA 2OJLA 4WEYA 2GZZA 2QGVA 3TUEA 2WGRA 1UVZA 5J9BA 6GSXA 1TRSA 1ERWA 2HRFA 4BA7A 1H4OA 1T7PB 4TR4A 2PPTA 1TK5B 4IQ1A 4KE3A 1HD2A 3CBUA 2VLUA 2A2RA 3DRNA 19GSA 1GSSA 1A2JA 1XOBA 5KN1A 4KB3A 2VUPA 2VLTA 2CZ2A 1QQ2A 2AV4A 2GT6A 3KH7A 3ZMLA 1X9MB 2YNXA 3TGZA 2P31A 1PL1A 2WB9A 3U5RE 4K6XA 2B3SA 1GSUA 1V58A 4K9ZA 5AIXA 1PRXA 3DVWA 2DBCA 1CQGA 2XBIA 2WZ9A 5KN0A 2H1DA 4EE0A 2DJJA 3ZMKA 1SL1B 3OR5A 4PQ1A 6GSTA 4HOJA 4ZBAA 2MZCA 5IMDA 1U87A 1X5DA 2E7PA 3RBTA 3FZ9A 1QK8A 3HCZA 4KGIA 1X5EA 1TRWA 3GKKA 4LL4B 1JZWA 1FAAA 2JL4A 5DJMA 2C0DA 3IA1A 5GSTA 3QFAC 1PGTA 2YJHA 1NW2A 3CTFA 1ABAA 1OVNA 3HKRA 1YJ6A 3QMXA 1Q4JA 3F6FA 4IJIA 4OCEA 3UOMA 2VO4A 3LXTA 3WD6A 1YF1A 3DVXA 3S9FA 2H0HA 1URMA 3KCMA 1U6TA 3TOUA 1WOUA 2L5OA 2HZEB 4POBA 2H0GA 2VCXA 1NHOA 5KN2A 3F0IA 4HEA2 4BWSA 3WGDA 1S3CA 2LNTA 4MZBA 4XRDA 2WFCA 3HZ8A 1SKWB 5IOWA 2E2GA 6GSSA 2V1MA 1I9DA 3CSJA 4ZL7A 3D22A 3GHAA 1GRXA 5DVBA 3N9JA 3LFLA 3RDWA 2J23A 1TU7A 3UARA 4F0BA 2IL3A 4KAEA 3UMAA 1WIKA 2AHEA 5LCZA 2HZEA 3F63A 5J41A 4HZ4A 1K0AA 4HDEA 2VAFA 1R4WA 2I9HA 1QXHA 3EINA 1TK8B 2B7KA 4MDCA 3KMNA 3FZ5A 3GKXA 5FWGA 4EKZA 4E8HA 4K7IA 1YEPA 4K0NA 1M0UA 4ZB6A 3ISOA 2KP2A 1AQXA 2CA8A 1ZZYA 4IJ3A 4MZCA 5ECMB 5ENUA 3F4TA 4JZQA 3BCIA 1SJIA 4RQXA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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