1EWXA

Crystal structure of native tryparedoxin i from crithidia fasciculata
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
144
structure length
144
Chain Sequence
SGLDKYLPGIEKLRRGDGEVEVKSLAGKLVFFYFSASWCPPCRGFTPQLIEFYDKFHESKNFEVVFCTWDEEEDGFAGYFAKMPWLAVPFAQSEAVQKLSKHFNVESIPTLIGVDADSGDVVTTRARATLVKDPEGEQFPWKDA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Electron transport
publication title Structures of tryparedoxins revealing interaction with trypanothione.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPAREDOXIN I
total genus 43
structure length 144
sequence length 144
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13905 Thioredoxin_8 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1ewxA00
2R5GA 1G7EA 1Y6EA 3ZMLA 2YPMA 2CVDA 2DIYA 3C73A 3GX0A 4KA0A 2K6VA 11GSA 4YQUA 1SK1A 1XFLA 2KLXA 2ON7A 4PURA 1A2LA 2XPEA 2QGVA 1SK0A 4V2LA 2K8SA 5ECSA 3L9SA 5HFKA 1FVJA 5IMFA 2VL3A 2DJ2A 2XC2A 2F3MA 2H19A 2R6KA 1XXUA 2VCVA 2JL4A 4HDEA 17GSA 4ECBA 2YN1A 2FUG2 5ECKB 2C8UA 1IYIA 1T3BA 4K2DA 3FZ4A 5FWGA 5H5QA 22GSA 3DVWA 1WPIA 2Z9SA 1O8XA 3I6AA 1PX6A 2QSIA 3D0ZA 4ML6A 3DKSA 5F06A 1WOUA 3D6IA 5C00A 1TK5B 3U6VA 2I1UA 7GSSA 2JZRA 3IR4A 2H01A 3HHVA 1I9DA 3IK9A 3PR8A 3PH9A 4GQFA 4OO5A 1KBNA 2VL9A 4KW6A 1O81A 2GQMA 3H4KA 1XZOA 1Q4JA 4YQMA 5CO3A 4K9ZA 4MF5A 5B6MA 2PUKC 4KDYA 3APSA 4OMVA 1WRYA 1XWBA 4MLYA 4IW9A 3HXSA 2OJLA 4MZBA 3QAGA 3HZ8A 4MJAA 4QL9A 3BCKA 5GAND 4ECIA 3ZTLA 4ILFA 2PVOC 4RQXA 2YCDA 3IV4A 4HOJA 1XWCA 5F05A 2PMTA 4ID0A 1QXHA 4XS1A 4KUNA 3L4NA 3UBKA 3KP8A 3CYNA 5DQYA 6GSYA 2H8LA 3A2WA 1FVKA 4EE0A 1SJZA 4GRFA 2LV3A 5DCHA 4I6XA 5H5SA 5DAKA 3MSZA 4H86A 1F3BA 1AW9A 1JZRA 4KSOA 5B6NA 4AJ7A 1ZZYA 1SL0B 4D73B 3TKPA 1XWKA 1EP7A 3BJ5A 1S3CA 1HNAA 1O7UA 3TKSC 1MDKA 4KCEA 3Q19A 5ECLB 4EC0A 1VF2A 1TJDA 2ON5A 3DYRA 1EWXA 2E0QA 1GULA 5INYA 3F4TA 1Z3EA 4DSSB 5JWRB 1USBA 2TRCP 3NIVA 3WT2A 5G5FA 13GSA 4F82A 2VCWA 3FZAA 2GTUA 1HNBA 4TVEA 1THXA 2F9SA 1OVNA 5F0GA 1BQ7A 5COHA 4PQHA 4NWYA 5CRWA 5IOXA 2H30A 2N5BA 2MYGA 14GSA 4KDUA 4RQRA 2F8FA 1YJ6A 4NV5A 4RUVA 3VWXA 4AF2A 3ED3A 3GH6A 5DVBA 4KGIA 1SJIA 2XPDA 5IPGA 3I69A 1OKDA 1A0FA 4CW9A 5G2ZA 2RLIA 3L0HA 3IOSA 3QDNA 4K7OA 3L78A 2CVBA 5IM9A 2VO4A 3KMOA 1XOBA 2HRFA 1GWCA 2G2QA 2KUCA 1R26A 5IMZA 3GTUB 4EVMA 4JR6A 4NAXA 2H0GA 2GDRA 3IDVA 3BD2A 3ZVJD 3E0UA 2P5QA 5AIXA 3U5RE 1XVQA 1OYJA 3DEXA 3GX8A 1F3AA 1M99A 2O8VB 3ZIVA 2LJKA 12GSA 2IMIA 5ECOB 2WRTA 5DCGA 4K1FA 3FHKA 3KIJA 3TKSE 3GV1A 4KDXA 3LXTA 1URMA 2LKUA 1T4ZA 2R4VA 2BJXA 4HQSA 3IRAA 3C1SA 2F51A 2PN8A 1FB6A 3W8SA 1XVWA 2LEGA 1U88A 3CSJA 3KH7A 4KB3A 2YV7A 2O85A 2CVKA 3GUSA 4LMVA 1VF4A 1A24A 4POKA 2XBQA 1GSFA 3ZRDA 2GVPA 6GSSA 1XPVA 2M46A 1PKWA 2C4JA 4ECJA 1TP9A 4P3YB 2X8CA 1YY7A 3I43A 2AJQB 4O5RA 1YDKA 1EV4A 2R3XA 2C0EA 4WF4A 4FYBA 4DEJA 3EURA 2B5XA 3G7IA 5J41A 1GH2A 4KNDA 2AYTA 1S3DA 3KGKA 4DSQA 3E9JB 4TW5A 1TI1A 1A23A 1WE0A 4HI7A 1A2MA 1GUMA 1M0UA 3PGTA 4OFTA 4FIWA 4TXOA 1MD3A 3ZMKA 1EGOA 1OAZA 1M2BA 3QOUA 3G7YA 4TXVA 1T1VA 1V9WA 2M72A 4F03A 1NHYA 4HZ4A 4OCFA 4TR3A 3FR3A 5JWOB 4MF7A 1SENA 3C71A 1G6YA 3O3TA 3DMLA 5D9TA 2YOIA 3ZYWA 1H75A 3KXOA 3Q6OA 3VURA 2B1LA 4IKHA 4TR0A 1X0RA 4AJ6A 3TJBA 3ERWA 3HJMA 2KOKA 4GSNA 4IQAA 1SL2B 4MH2A 1FG4A 4JU5A 3WGXA 3UBLA 2LRTA 3EWLA 4GTUA 3CRTA 4X43A 3D22A 1FAAA 2GT6A 1TU7A 3WGEA 2V2GA 3GNJA 2EIRA 1IYHA 2R37A 1A8LA 1AQWA 2QKEA 4ZBAA 3M9KA 4V1Ag 1OC9B 3KTLA 2X99A 2AV4A 3QFAC 5AISA 1ON4A 4POMA 4F2IA 1X9MB 3F6FA 4MP4A 5J9CA 5J5NA 2YWOA 1ERUA 3WD6A 5HQPA 3L9VA 2A2RA 1SKWB 3HA9A 4AJ8A 6GSUA 1HD2A 3ZITA 2K9FA 3RBTA 3KM6A 2DBCA 2WZ9A 4L0WA 1AIUA 1O8WA 4OO4A 6GSTA 5ID2A 2FD3A 2HSHA 3ERGA 1M9AA 4MJBA 3UJ1A 2I3YA 3DGQA 2VD1A 4O7HA 5KN3A 4G2EA 3TJKA 2REMA 4EDYA 1TK0B 2B7JA 4HS1A 3W8JA 1TOFA 1AXDA 5LNKe 2LRCA 2YWIA 3GMFA 3QCPA 1GLPA 3EMPA 5CRGA 1ERVA 3UMAA 5EVOA 4MABA 3FYGA 4MZWA 5HR1A 5G1KA 2I4AA 5D9VA 1SD8A 1V98A 1YZXA 2JSZA 4IJ3A 3MWHA 2GSTA 4PXOA 4WF5A 2H0HA 2YWMA 4K0GA 1XIYA 2VM1A 1I5GA 1EOGA 2YP6A 1VRSD 1QK8A 2VD0A 5IMVA 2B1KA 2FNOA 1Z9HA 3FEUA 1SYXA 2L4QA 1OC3A 5D96A 2C0DA 2WCIA 2OE1A 5ECPB 3A3TA 4XS4B 3F6DA 1OKTA 4HJMA 1JZDA 3HVSA 2ZCTA 1XW6A 3H1NA 3FR9A 2CQ9A 1ZL9A 4MF6A 1M9BA 4EO3A 2HE3A 3KZQA 4XCSA 3ZLPA 4EKZA 2C80A 2K8VA 4I5QA 2MMOA 1PMTA 2L5LA 2PU9C 2IFQB 3F9UA 1W89A 1JZOA 4IP6A 3GH9A 1PRXA 1T8EB 4TKYA 2JACA 4I8BA 1T00A 2ES7A 5GZZB 3QPMA 3QMXA 4GXZA 2OKAA 2IMKA 2A4VA 1QQ2A 3EU4A 1YF0A 3OR5A 5LD0A 3IXRA 4ZILA 2GQKA 4N0ZA 3DRNA 2DJJA 3F0IA 1M7TA 1GSQA 3GHAA 3FKFA 2VOCA 2WB9A 5IO2A 3TOUA 1V58A 3ME7A 5F8BA 2WS2A 2IIYA 4N30A 3LWAA 4WBJA 3LQ7A 2OBKA 4PUFC 1NHOA 2YJ7A 4TOPA 2WULA 4ZXGA 2B5EA 2FWHA 4FO5A 1PX7A 1JLWA 2VM2A 1SU9A 2V6OA 4E8EA 2C3QA 1TRSA 4ZL8A 1PSQA 3LORA 5J3RA 5IO0A 1F6MC 1YKAA 8GSSA 2A2SA 4CHSA 2CZ2A 1GLQA 4LMWA 2HI7A 5IOWA 2NPBA 2TIRA 1O85A 4MZCA 3ZL5A 4PQ1A 2DIZA 2HNLA 1GL8A 1JZWA 4IBPA 5JCWA 1AQXA 3F8UA 1GUHA 1G7OA 3VPQA 1R4WA 5A4UA 4OFMA 2H0IA 2LSTA 3GA4A 5E59A 3TUEA 3CMIA 6GSVA 1PD21 4TN8A 3VLNA 1EEMA 3I9V2 10GSA 4IHUA 1VF1A 2XHFA 1XWAA 3DIEA 1C72A 3FY7A 1B4QA 2P31A 1JLVA 4KH7A 4WR5A 2C3NA 2IPAA 20GSA 2AUVA 4L5LA 3KJYA 2H71A 1NM3A 1BEDA 3D5JA 3K8NA 2LRNA 3DWVA 4MMMA 2V1MA 4ZBBA 2IMEA 1PN9A 3CTGA 2CV4A 2CZ3A 2C0FA 3GKXA 2YANA 2LUSA 1A0RP 3M1GA 3TJFA 3D21A 1FW1A 4BVYA 5ECHB 4FYCA 2MZCA 3RAZA 1T7PB 4YAVA 1SD9A 2C1YA 3RDWA 1YEXA 1VGLA 1B8XA 3M8NA 5HFIA 1TI3A 2AHEA 2B3SA 2E2GA 3VFIA 1SL1B 2EIQA 3MDKA 2D2ZA 3QAVA 4MDCA 1U3IA 4IGJA 3S9FA 1KTEA 5C04A 2HZEA 2J9HA 1K3YA 2VCXA 1XW5A 3UAPA 4BWQA 3LXZA 3H79A 2LQOA 4N11A 1UA5A 1XWGA 4G9HA 5CNWA 3F3QA 5JCGA 2GS3A 1GTAA 2F8AA 2PERA 4YAPA 5DALA 2LNSA 4RI6A 3GSSA 4XIHA 3A5WA 2HXKA 3VI5A 4HZ2A 3KP9A 3GL5A 2C3TA 2GLRA 9GSSA 5L71A 4IP1A 3O6TA 1YQ1A 3EINA 4ZB9A 2JSYA 5AGYA 3J7Yb 3LJRA 3DVXA 1WIKA 2B7KA 4PNFA 5EL8A 1GSSA 3TB2A 2E7PA 4IN0A 1PA3A 4F0BA 5G30A 4TR4A 5DAKB 2VL2A 2YJHA 4NHWA 2PVQA 5FHIA 1E6BA 1NSWA 4K8MA 4Q5FA 1SK2A 5IIZA 2J23A 2VCZA 1AAZA 4L0UA 3DXBA 4LA1A 3GRXA 4MJCA 3KEBA 4JE1A 5A4WA 2JADA 3A2XA 4WBRD 5IPHA 3VPTA 3VWWA 4MH3A 1ZGNA 5A4VA 5ECQB 1THOA 1K0BA 2X64A 1F9MA 3NOFA 3TRXA 5ECMB 3UL3A 2VL2C 4TR1A 2YZHA 4ZBDA 2X8HA 4RI7A 1KNGA 1V2AA 4ML1A 1HYUA 1ERWA 2XBIA 1E2YA 4WEYA 1ZYQB 4NHZA 1F2EA 3IK7A 3CSHA 3CBUA 2BMXA 5DBQA 1BX9A 1MEKA 2CAQA 4HU9A 2PWJA 3TOTA 2VIMA 3TRQA 1Z7PA 4BL7A 3L9UA 5J4UA 4GQCA 2OADA 3CXGA 2HSYA 4V2MA 4OFNA 1OC8A 4GSSA 4I97A 3MAKA 4J2FA 2PBJA 3M3MA 1TTZA 2LJAA 2N5FA 2H6ZA 2B5YA 3V1WA 4MK3A 3H8QA 4WR4A 3HY2A 2L6DA 1UC7A 5LCZA 1DBYA 1GNWA 1YKCA 2H75A 2EIOA 1J0FA 3IE3A 1T4YA 4I2TA 3UIWA 4MPGA 2H1GA 4WETA 4XS6A 3D4TA 2RM5A 4WKWA 1G6WA 3IC4A 2VLTA 2GZYA 3VWUA 4PNGA 2FWFA 3GKNA 1J9BA 1LJRA 4OCEA 1VF3A 4DSRA 1EV9A 3ZFLA 3VI7A 2FGXA 1ACVA 2H6XA 2HT9A 3BOAA 5DJMA 2CX3A 2O7KA 3F4RA 3FRCA 3Q18A 4JZQA 2IMFA 1XCCA 1HQOA 1SYRA 4PUAA 2MBSA 4J56E 2V6KA 1FHEA 3ZREA 3KMNA 1PQNA 4G10A 3WYWA 1EP8A 4YH2A 2H72A 1ML6A 5ABRA 2MBTA 3ZVJA 2IL3A 3HJPA 16GSA 2H1BA 1V57A 2PPTA 3P8WA 2DJ0A 5DDLA 2DC5A 2L57A 3RHCA 2DLXA 1DSBA 2IMDA 1R7HA 4Q5NA 5KN1A 3M9JA 3FZ9A 5KN0A 3HDCA 2H1DA 2L6CA 3HJOA 1CQHA 1N2AA 5B8AA 3IHQA 1PGTA 2RUEA 5GSTA 4OWYA 1TXXA 1FO5A 4TXOB 2HLSA 1WP0A 3EE2A 4ZB6A 1X5CA 1OE8A 3FZ5A 1MDJA 1ABAA 3HKRA 2OE3A 4MJEA 1QGVA 3ZZXA 2NBSA 1O73A 4JEDA 4BA7A 2R2JA 4ZL7A 4D73A 1Y25A 2H73A 3IAS2 1RQMA 4IQ1A 4QL7A 3GKMA 2RIIA 5HFGA 4OD7A 3UVHA 3WGDA 2WFCA 1V40A 1TKDB 4NXIA 2WDUA 3UVTA 1BG5A 4LLRA 4JBBA 4DSSA 1X5EA 3KTBA 4GCIA 2CT6A 2OA7A 5G1LA 2JU5A 3CTFA 4HU7A 3HVVA 4PQIA 5IQYA 4ECCA 1WWJA 1BYEA 2GSQA 3F4SA 4HJ2A 5J9BA 4EUYA 3NZNA 4L8EA 6GSXA 3SWLA 2V41A 3HVXA 3QD9A 5F07A 2P0GA 2WGRA 2H74A 2RUFA 3LEFA 4X1UA 2WJUA 2MMNA 4EF0A 3HZ4A 3ERFA 1U6TA 5D73A 5IMCA 3SBCA 4IJIA 1F37A 1TU8A 2AAWA 2V32A 1EEJA 3VWVA 1YEPA 3GTUA 1DE1A 2H1AA 2VLVA 5ELGA 3TJGA 5AN1A 2OBIA 4Q5QA 3HD5A 1ZCPA 5ID2B 1TRVA 4NMUA 3EYTA 4WXTA 1K0CA 2LTKA 4XHMA 1J08A 3O76A 3P7XA 3RPNA 2DJ1A 3IPZA 1S3AA 4LL1B 1GSDA 2FWGA 2I81A 3GFKA 19GSA 4NPBA 3HYPA 3Q74A 1K3OA 4CDOA 1PL2A 3HCZA 2YWNA 4Q5RA 3IAM2 3G7JA 2PGTA 2P5RA 4F0CA 1B48A 3RPPA 4QQ7A 2MMAA 1PKZA 4ZL9A 3TKSA 3P90A 3N5OA 3KH9A 5HR0A 3EVIA 1TDIA 2QC7A 4KX4A 3TGZA 4K0NA 2FA8A 2IWTA 1ZOFA 2YZUA 5CRDA 1B9YC 1AC1A 2L4CA 2NDOA 1JFUA 1MDIA 3QFBC 1ERTA 4K6XA 3TCOA 1LBKA 2GT5A 2NTOA 2VCQA 3H93A 1Z6MA 4EL1A 4IS0A 1FOVA 2VCTA 1SKRB 4MCUA 1MD4A 3LGCA 1M2AA 4KSMA 1B9XC 1QUWA 4O92A 1QMVA 2CAIA 3LFLA 4BWSA 3TKQA 3TJJA 5HR2A 1GTBA 3KCMA 1Q98A 4X0XA 3QR6A 2YNXA 1EOHA 5GSSA 1GP1A 2NVLA 1GTUA 3ZIJA 3GN3A 1QFNA 3AY8A 2KP1A 4KCAA 4GSTA 2VUPA 4V1Ap 5DJLA 4JR4A 3GYKA 2H6YA 1DE2A 5JWQB 3M0FA 4I2UA 6GSWA 4TRXA 3TKRA 1BAYA 5CP1A 1AQVA 4KE3A 2FCHA 1A2JA 4BVXA 1X9WB 2KP2A 1TW9A 1R5AA 5ELAA 2JZSA 4EXJA 1BJXA 3TDGA 3J7Yk 1Z5YE 2GGTA 2FHEA 2GSRA 2YV9A 3C8EA 5H5RA 2FWEA 2VLUA 2GQLA 3BBYA 3IA1A 5DQSA 3EC3A 2G0FA 2OACA 5B7CA 2M80A 3IBHA 3GURA 3LG6A 4DVCA 4ULXA 1OC9A 1NW2A 2FY6A 4MA9A 5D9WA 5GAPD 1YF1A 2FA4A 2DMLA 2ZNMA 1UVZA 2DMMA 2HZFA 5FT3A 5D8IA 3KD0A 4J57E 3MNGA 2GZPA 18GSA 4MPFA 3F63A 1SJ6A 5KN2A 4XRDA 3N9JA 4FH8A 5EPFA 3ME8A 5EY6A 1TRUA 3VK9A 4KAEA 5AIVA 2I9HA 1Z6NA 1K0AA 2LS5A 1ZMAA 3JCML 1CQGA 1ST9A 4NV2A 5ECIB 1H4OA 3UARA 3GSTA 5JCUA 1Z7RA 3US3A 4Z7XA 1EGRA 2H66A 3RHBA 2LJRA 4ISDA 5IMAA 2CA8A 1X5DA 4PX1A 3C7MA 1EZKA 4POLA 1GRXA 1XOAA 1RW1A 3CRUA 2H76A 1K0MA 1WMJA 2GSSA 1GUKA 4BPYA 1AUCA 1XBSA 5KEJA 1WJKA 2H70A 1N8JA 2KHPA 3GL3A 4HEA2 4IVFA 4GLTA 3UEMA 2HYXA 2B6MA 1A8YA 2OE0A 4YQVA 3DD3A 3GKKA 3QAWA 2JZTA 3FK8A 5G5EA 3LSZA 2MMZA 3C1RA 1UN2A 3UOMA 1K0DA 5D93A 4PGTA 1TRWA 4ZIJA 2FLSA 5CAXA 1ILOA 4XS4A 5ECNB 5D9XA 4FYUA 1KEBA 1JHBA 3APQA 1GSEA 1RK4A 5CYYA 2DSAA 2AB6A 2IJYA 4LL4B 1X9SB 1OE7A 3F3RA 5G31A 1M2DA 1TK8B 1G0TA 2HZEB 2IFQA 3P2AA 3PINA 3LYPA 4HQZA 1O6JA 3CSIA 4EDZA 4AGSA 1U3AA 2LQQA 2DJ3A 3BCIA 2E2MA 4G19A 4ACSA 2IN3A 5B8BA 1R5PA 5DALB 5CREA 2HRNA 1GSUA 3EU3A 2VAFA 3WT1A 4K7NA 5A5KA 3ISOA 2DJKA 4L5OA 1DUGA 2O89A 3FR6A 1B4PA 2HFDA 1W4VA 2BTOT 2TRXA 5ECRB 5IMDA 5E4WA 1GTIA 5CRHA 3ZFBA 2GZZA 4GF0A 2CX4A 4POBA 2EC4A 1LU4A 1GSYA 3A2VA 4V2NA 2N5AA 3R2QA 3E3EA 1SKSB 3FW2A 4E8HA 2L59A 3TRPA 3APOA 4N0VA 4XRAA 4IELA 4F9ZA 1GNEA 5ENUA 3D4MA 4O32A 2ZUPA 2K18A 2L5OA 2RM6A 2C0GA 2O87A 5HR3A 2ALBA 4GWRA 4K7IA 2X8GA 1K3LA 4HUAA 1K0OA 4TR1B 4JRRA 1HNCA 1ZYEA 2LNTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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