1EZK | Genus

Total Genus 45

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	45
sequence length	149
structure length	149
Chain Sequence	SGLDKYLPGIEKLRRGDGEVEVKSLAGKLVFFYFSASWCPPCRGFTPQLIEFYDKFHESKNFEVVFCTWDEEEDGFAGYFAKMPWLAVPFAQSEAVQKLSKHFNVESIPTLIGVDADSGDVVTTRARATLVKDPEGEQFPWKDAPLEHH

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Electron transport
source organism	Crithidia fasciculata
publication title	Structures of tryparedoxins revealing interaction with trypanothione. pubmed doi rcsb
molecule keywords	TRYPAREDOXIN I
total genus	45
structure length	149
sequence length	149
ec nomenclature
pdb deposition date	2000-05-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF13905	Thioredoxin_8	Thioredoxin-like

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1ezkA00

3IK9A 3RDWA 3QR6A 1B9YC 4JR4A 2K8VA 3HVVA 4F2IA 4JU5A 2LEGA 1I9DA 2HE3A 4TR1B 2ON5A 1EP8A 5ELGA 5CO3A 1OKTA 5KEJA 4ZB6A 3IOSA 1ZGNA 19GSA 4I6XA 3VWXA 3QAWA 2GSSA 4N10A 4F0BA 4ZL9A 4HQZA 2IMKA 3Q6OA 3LGCA 3LEFA 5IMFA 2FWEA 4OFMA 1ZOFA 3APQA 2VL9A 22GSA 2HFDA 2C3NA 4Q5NA 4AGSA 1A0FA 2X8CA 1FG4A 3QFAC 3RAZA 4GQCA 2HRFA 3UBKA 1YEXA 3CRTA 5AIVA 4N0ZA 5G1LA 1PL1A 1M2DA 3TJBA 3C1RA 1FB6A 5J9CA 4XHMA 4WF4A 1EEJA 4V1Ag 3TKQA 5JWRB 3C71A 3DEXA 3ERWA 4KDUA 3IHQA 5INYA 2IMEA 1TKDB 3ISOA 3CRUA 2H0IA 1A2MA 5IMZA 3GH6A 3G7JA 5E4WA 1OC3A 1YKCA 4KAEA 3HXSA 6GSYA 1TP9A 2DIZA 5CYYA 1TU7A 2LV3A 3FZ5A 2BMXA 4K0GA 4GCIA 2LQOA 2P0GA 1WE0A 2FWFA 2GSRA 4TOPA 4E8HA 4KDXA 1X5DA 4XRDA 4HDEA 4ZL7A 5ECPB 2B5XA 4HS1A 2O87A 1PN9A 5LD0A 2YJ7A 2IFQA 1T8EB 3H8QA 4MLYA 2H0HA 1JLVA 3HYPA 3WT2A 4O7HA 3D0ZA 4PQIA 1JZRA 3FEUA 1V98A 5A4UA 3F4RA 3FZAA 4JBBA 4J2FA 5D93A 3C73A 4LL1B 3PH9A 3DKSA 3HHVA 3S9FA 1Z3EA 1JFUA 3KJYA 1U3IA 4OCEA 3BJ5A 4I8BA 2GZPA 3CTGA 5G31A 1F6MC 3HY2A 3UL3A 1G7EA 4FIWA 3VPTA 4EDZA 4OFTA 3LORA 3L0HA 1SKRB 2E2GA 2K9FA 1GUHA 3GKXA 1TK5B 3UARA 4KCAA 3GRXA 4ISDA 1N2AA 3QCPA 4OFNA 1Z6MA 3K8NA 5GAPD 1X5EA 4OO5A 4MZWA 3QAVA 1GUKA 4IKHA 2B3SA 5ELAA 1BEDA 1PKZA 2C0EA 2ES7A 5IOWA 4CHSA 5KN2A 3GH9A 4KSOA 4LLRA 4TR4A 4WEYA 2CAQA 1AQXA 2VIMA 1B8XA 4BWQA 2VM1A 3TB2A 3U6VA 3CXGA 1GNEA 4OCFA 4G9HA 2PVQA 2FY6A 2YANA 2HZEB 3P90A 4YAPA 4EE0A 1UN2A 2TIRA 4JE1A 1ST9A 4I2UA 3I9V2 2N5FA 3BCKA 1WWJA 2B5EA 1R7HA 4KGIA 5J41A 1IYHA 3F0IA 3DXBA 3GL5A 2AUVA 2HT9A 1U88A 5ENUA 2C1YA 2E0QA 1EP7A 1Z5YE 1PL2A 5GZZB 4TVEA 4K0NA 4XTSA 2X64A 4PUFC 2EC4A 3CMIA 3QFBC 5AGYA 5ID2A 2V32A 1E6BA 3FKFA 5HR0A 2RM6A 4EF0A 4RUVA 1K3YA 2GQKA 2YJHA 4HOJA 3IAM2 2C4JA 1X9SB 4J56E 2EIQA 2CVDA 1ZCPA 4LL4B 5ECOB 5B6NA 4I2TA 5CRDA 4NAXA 2LRCA 4HJMA 2PU9C 3P7XA 2RUFA 3UOMA 3TKSE 2JU5A 1ON4A 4WBRD 5J3RA 2YNXA 2E2MA 1SD8A 4DVCA 2C80A 2YWMA 4KH7A 5H5RA 4HEA2 2R4VA 3CSHA 1K0DA 2R5GA 3TJFA 2PVOC 1OVNA 4ZBAA 1TRUA 4OMVA 1DUGA 4IS0A 3KP9A 3DGQA 2WCIA 4MJAA 5ECNB 2LJAA 1MDJA 5CAXA 4O32A 3CYNA 2VD0A 5IIZA 2KUCA 2IJYA 2F8FA 3FYGA 1V58A 2YN1A 4XS4A 5CRHA 5B7CA 5DAKA 3R2QA 4DSSA 4GSNA 4HJ2A 2C8UA 2B1LA 3PINA 3LFLA 1SU9A 5L71A 1HNAA 1XWCA 3L4NA 2XC2A 1AUCA 2YZHA 3I69A 2LNTA 4ZXGA 2DJ3A 2CZ3A 1JZOA 1M2BA 2DJ1A 1WIKA 3TKSC 1YEPA 1T1VA 2VL2A 5H5SA 1G0TA 1ERTA 2MMZA 3EU4A 4BL7A 4PQ1A 4NHWA 1WOUA 1DE2A 3KTLA 1ABAA 5G1KA 2AV4A 2P5QA 4AJ6A 1JLWA 1N8JA 2C3QA 1YDKA 2DLXA 3D21A 3F9UA 2YPMA 4EC0A 11GSA 4MJBA 5HR3A 2YWOA 1BG5A 2WULA 4FYUA 1F2EA 2RM5A 4HQSA 1JZWA 2H73A 4IW9A 1OKDA 1NHOA 3VURA 3MDKA 3HDCA 3HA9A 2FUG2 2M46A 3ZTLA 2GVPA 3LYPA 1AW9A 5F07A 4RQXA 2YOIA 3TKRA 4EL1A 4YH2A 4IQAA 3UAPA 3E9JB 6GSSA 6GSVA 4G19A 2O89A 2GDRA 2AAWA 1R5AA 2R2JA 1Z7RA 5EY6A 2IMFA 2WGRA 3MSZA 4KX4A 2HYXA 3FK8A 3TRPA 1XXUA 4PXOA 4IN0A 2VCWA 2DIYA 1GSUA 3I43A 1URMA 3WT1A 2IIYA 2JSYA 2OE0A 3EVIA 3G7IA 2RLIA 2VAFA 1M0UA 5ECSA 2DC5A 2K8SA 2FCHA 4HZ2A 4TKYA 1ERVA 2H71A 1XIYA 4POLA 2K6VA 1Q4JA 2G2QA 1K3LA 3GTUA 2HSHA 2CX4A 2PBJA 4BPYA 2VO4A 4MF7A 2FA4A 4XCSA 1MDIA 4KW6A 4HI7A 3FZ4A 2F3MA 1R26A 4QL9A 3KM6A 4RQRA 4E8EA 3NIVA 2H1AA 2E7PA 5AISA 2H30A 3CSIA 3M8NA 1SYRA 3IXRA 3A2XA 3G7YA 2D2ZA 2F9SA 3TUEA 2PUKC 2H0GA 3HJPA 2N5AA 4ZILA 3WYWA 1T4ZA 3LSZA 2WZ9A 1J0FA 1PGTA 3SWLA 2OE1A 2VOCA 3ERFA 2MBSA 4I97A 4NMUA 1TI3A 2YP6A 2N5BA 2VUPA 2HSYA 4YQUA 2GLRA 6GSWA 1S3CA 4CDOA 2BJXA 2LJRA 2PN8A 3VPQA 1WMJA 2FD3A 2VCXA 1X0RA 5AN1A 4TRXA 3DRNA 2MMAA 4WR4A 3TJKA 4Q5QA 1ZL9A 1THXA 3GKNA 3KP8A 2L5OA 3DVWA 3CTFA 1LJRA 2V2GA 4MDCA 4MMMA 1PA3A 1EV9A 4PNFA 2H01A 2GZYA 3FR3A 3GSTA 5A4WA 2C3TA 3MWHA 3ZVJA 4D73B 4GSTA 1PSQA 3F6FA 1TK8B 1EGOA 4AF2A 3TOTA 4HZ4A 3I6AA 4L0WA 3M1GA 1QGVA 5COHA 1GLPA 2H19A 4PUAA 3BCIA 4OD7A 2GSQA 1UVZA 4TXOB 3FW2A 2H70A 3D6IA 3HVSA 1TRSA 4MJEA 1ZYEA 2GQLA 4MF6A 5F0GA 1ERUA 2MBTA 4FYCA 3ED3A 2M72A 1R5PA 1FB0A 2L6DA 2H1BA 4MF5A 4MP4A 4XS1A 4ZBDA 3A3TA 1T3BA 2ALBA 3EMXA 3ZL5A 2IWTA 2CA8A 3EWLA 5HFGA 2XHFA 1B9XC 3EU3A 1HNCA 5D8IA 4PGTA 20GSA 2V41A 4IP6A 4K7OA 4LMWA 5G30A 2KLXA 3HZ4A 2NTOA 4PX1A 3FY7A 3GFKA 5LCZA 4K9ZA 1TJDA 2DJ0A 2H6XA 3ZITA 2XBQA 2X8HA 4V1Ap 1KBNA 3QPMA 5F06A 1K0MA 3GA4A 4GSSA 4ZB9A 5CRGA 4K7NA 1XOBA 3F6DA 4N0VA 1K0BA 4MH3A 3WD6A 4HU7A 1GL8A 1EOHA 5HFKA 1SYXA 2OBIA 1OC9A 2IL3A 5HR1A 1VF2A 2K18A 5KN1A 3TGZA 2JZSA 2I9HA 13GSA 3GURA 4GQFA 2FWHA 3GKMA 3OR5A 1QK8A 3FZ9A 1O7UA 3IR4A 4RI7A 1OAZA 2DMMA 3VWUA 1QUWA 1O8WA 2BTOT 2KP2A 3IC4A 3APSA 4H86A 2WB9A 3M3MA 4WXTA 3M9JA 1GSSA 5IO0A 2H6YA 1GSFA 2YV7A 5GAND 3A5WA 4ECIA 1ACVA 1PX6A 3TJJA 4AJ8A 3KD0A 1A8YA 2GTUA 2KP1A 3F3QA 3TDGA 4P3YB 1O85A 4EKZA 5DQSA 5J4UA 4CW9A 3F4SA 1GRXA 1GTAA 5DVBA 1KEBA 2WS2A 4Q5FA 4NHZA 2VCVA 4DEJA 3CBUA 4KUNA 4JZQA 3GUSA 3ZIVA 3TKSA 5HFIA 1YJ6A 2F8AA 1XW5A 4ID0A 1FAAA 5DALA 4L5OA 2JZTA 2GQMA 2DJ2A 1ERWA 5CREA 1SL0B 5HR2A 1LU4A 2A2RA 1PQNA 1TOFA 5EL8A 1SJIA 2NBSA 4TW5A 2IFQB 3UVHA 2L4CA 4K6XA 1S3AA 2C0GA 1SJZA 3LXTA 3DYRA 4I5QA 1SL1B 4NWYA 2EIRA 4K7IA 4GLTA 2VLVA 1J9BA 1YZXA 2QSIA 5F05A 1F37A 1DBYA 1S3DA 3ZRDA 5HQPA 3HKRA 1J08A 1Q98A 1W89A 4ZB8A 2YWIA 5CRWA 1MD3A 2XPDA 3MNGA 4K1FA 4ECBA 4WR5A 3SBCA 1SK0A 2HXKA 4BVYA 5ECQB 4O92A 2YWNA 2VCTA 1U3AA 4L8EA 1RQMA 1M2AA 10GSA 2X8GA 3IPZA 1EOGA 2H76A 2JL4A 2H75A 2IMDA 1XBSA 4MABA 1WP0A 2JZRA 4POBA 2CV4A 3IK7A 1GTBA 4WBJA 1QFNA 4TR1A 2AYTA 2HLSA 4HUAA 3IE3A 4GRFA 1NSWA 2A4VA 5J5NA 2AJQB 3F8UA 4BVXA 3ZZXA 3LJRA 3FHKA 3GMFA 1B4QA 4IP1A 4PQHA 2B6MA 4IHUA 2DMLA 4F9ZA 1GNWA 4TR3A 2LTKA 2V6OA 1AQVA 5ECLB 2NVLA 3W8JA 3IDVA 3NZNA 2OE3A 2WDUA 1SK1A 1JZDA 5DQYA 4EUYA 1QQ2A 1M7TA 5IO2A 3LQ7A 3AY8A 2L57A 1HNBA 2ZCTA 2KOKA 4RI6A 1OE8A 5JWQB 1HQOA 4QQ7A 1U6TA 2OJLA 1XVWA 2B5YA 2QKEA 4MZBA 2TRXA 1FHEA 3CSJA 3M0FA 3IBHA 5ID2B 4EVMA 1GSDA 3GSSA 1XWAA 7GSSA 3VI7A 3A2WA 4IBPA 1GSQA 4POMA 1X5CA 1USBA 1V2AA 3DD3A 1ZYQB 1KTEA 3V1WA 1VF4A 3L9UA 1THOA 2LSTA 3N9JA 1PD21 2R6KA 4TXVA 1K0OA 1OC8A 1A24A 3QMXA 2I4AA 1ZMAA 1OYJA 1YQ1A 2OADA 4K8MA 4KCEA 16GSA 5B8BA 4MPFA 2JADA 2YV9A 2I81A 5JWOB 4F03A 1BJXA 5GSSA 2TRCP 3PGTA 3ZFBA 4WKWA 3APOA 2B1KA 2VL3A 4ACSA 2YCDA 2CT6A 1TK0B 3QOUA 1BYEA 3GN3A 3P2AA 4L5LA 1GLQA 4BA7A 5IMAA 1NW2A 1A23A 3WGEA 5C00A 3BOAA 4ZIJA 1TXXA 1ML6A 1B4PA 2J9HA 1GSEA 4F82A 2ZNMA 5ECHB 3C8EA 2MYGA 4XS4B 5IMVA 2VLUA 4DSRA 2R3XA 5DAKB 1QXHA 4DSSB 1UA5A 2MZCA 3P8WA 4G10A 2PWJA 5LNKe 2VL2C 4BWSA 4EDYA 3J7Yb 3QD9A 2DJKA 4XRAA 4V2MA 4ML1A 1BX9A 1XZOA 3Q19A 1NHYA 4IVFA 4TR0A 4FYBA 4YAVA 3U5RE 5H5QA 2C0DA 3GL3A 5JCUA 2CVBA 4X1UA 2O8VB 2CQ9A 1FW1A 4POKA 4IJIA 2QGVA 3RHCA 5IMCA 2VD1A 1GULA 3KIJA 1QMVA 1UC7A 2IMIA 5F8BA 5D96A 3KH9A 2LNSA 14GSA 2X99A 2L4QA 1EEMA 3ME8A 3D4MA 1VRSD 3VWWA 3LWAA 5CNWA 6GSUA 3M9KA 1GP1A 1YKAA 2PMTA 3TRQA 2B7JA 1HYUA 3Q18A 4Z7XA 5DJLA 2PGTA 4MZCA 3QDNA 4TN8A 2A2SA 1Z7PA 5ECMB 3LYKA 4F0CA 4GF0A 3UIWA 3A2VA 1CQGA 1CQHA 6GSTA 3RPNA 2DJJA 1X9MB 5KN0A 2HZEA 3IRAA 3ZLPA 1EGRA 2LS5A 4N30A 1MEKA 18GSA 5DDLA 1XW6A 3TKPA 2DBCA 2L59A 4PNGA 1G7OA 1T00A 3TRXA 4ULXA 2LRTA 2O7KA 3W8SA 5IOXA 2GGTA 2I3YA 2GT6A 3VK9A 2H8LA 4IQ1A 5D9VA 3EMPA 2IN3A 1V40A 1PX7A 4NPBA 4IELA 2FA8A 1A8LA 3BD2A 1M99A 4EO3A 2CX3A 1SK2A 4NXIA 3PR8A 2J23A 1ZZYA 1EWXA 1IYIA 2GS3A 1F9MA 3C1SA 4KA0A 1AXDA 4X43A 3GTUB 3LXZA 1SKWB 4MJCA 1A2LA 5G5FA 1GH2A 5G5EA 5B8AA 3IA1A 5FT3A 4NV5A 3H93A 3F4TA 3GX8A 1XPVA 2CAIA 3RPPA 2KHPA 3F3RA 1SENA 2EIOA 4OO4A 3E3EA 1PRXA 3TOUA 3FR9A 3IV4A 4MCUA 3UEMA 1PMTA 2RUEA 3UVTA 1AQWA 2H1GA 2LUSA 4Q5RA 1SJ6A 3HD5A 1BQ7A 1MDKA 2CZ2A 5EPFA 5FWGA 3KMNA 3GV1A 5D73A 1OE7A 1F3BA 3ZREA 2Z9SA 1YF1A 4EXJA 5DJMA 3DWVA 3KZQA 4GWRA 4ZBBA 4KNDA 1G6YA 1TDIA 1EZKA 1GUMA 3GKKA 2F51A 5DCGA 2V1MA 1MTCA 1K0AA 1F3AA 1LBKA 4DSQA 1E2YA 1U87A 3Q74A 1I5GA 5A5KA 2MMOA 1VGLA 2CVKA 2WRTA 3HJMA 3HZ8A 1XWKA 2M80A 2P31A 4AJ7A 3WGXA 4IJ3A 2LJKA 3US3A 3ZMKA 1R4WA 4GXZA 4JEDA 4WF5A 4V2LA 3FR6A 5DBQA 4KDYA 1FOVA 1HD2A 3L9VA 1FVKA 2HI7A 3L9SA 1K0CA 2L6CA 5ECIB 1O73A 3EINA 3UBLA 5IQYA 1VF1A 2VLTA 4FO5A 1TTZA 2RIIA 2IPAA 4G2EA 3TJGA 1YF0A 5DCHA 5ECRB 1AIUA 4NV2A 5GSTA 1FVJA 3HJOA 3NOFA 3J7Yk 1Y25A 3F63A 3H1NA 3RBTA 4O5RA 3N5OA 4WETA 1XWBA 1SD9A 5IPHA 3D22A 5ECKB 1O8XA 5JCGA 5E59A 3O76A 3D5JA 3L78A 4FH8A 3EURA 1XWGA 2DSAA 9GSSA 3QAGA 4ZL8A 4ML6A 4ECJA 2OACA 2ON7A 1TRVA 2GSTA 4KB3A 3RHBA 1WPIA 4MPGA 3VWVA 1K3OA 2VM2A 3O3TA 4JRRA 4N11A 1M9BA 3GIXA 2L5LA 1T7PB 4V2NA 3G9BA 1Z9HA 2GZZA 3H79A 3GHAA 4IGJA 2FHEA 3EYTA 1TW9A 4OWYA 3KXOA 1XCCA 5CP1A 1B48A 4ECCA 1SL2B 3DVXA 1M9AA 5ABRA 1OC9B 1O6JA 1RW1A 2LRNA 5EVOA 2V6KA 2XBIA 12GSA 1X9WB 3D4TA 5D9XA 2O85A 5IM9A 2P5RA 2HZFA 5A4VA 3HVXA 5D9TA 3EE2A 1V9WA 5IPGA 3ME7A 1K0NA 2H74A 1WJKA 2MMNA 2FGXA 2HRNA 2JSZA 3KH7A 2LQQA 1H4OA 3KCMA 4PURA 1AC1A 1XVQA 1TU8A 2YZUA 1GTIA 1JHBA 1GTUA 1XFLA 4QL7A 2B7KA 1T4YA 3KGKA 3ERGA 1W4VA 1SKSB 1BAYA 1ILOA 4LMVA 3KTBA 2FNOA 2AHEA 2FWGA 3KMOA 1NM3A 4JR6A 3GX0A 3E0UA 2H72A 4MK3A 1GSYA 2VCQA 4YQMA 5D9WA 3ZMLA 5G2ZA 1G6WA 1Z6NA 3HCZA 1O81A 3BBYA 2OBKA 4HU9A 5IMDA 3ZFLA 17GSA 5AIXA 3UJ1A 5J9BA 8GSSA 4LA1A 3ZIJA 1C72A 2XPEA 2VCZA 1DSBA 5FHIA 2HNLA 3VLNA 1WRYA 4J57E 2JACA 5JCWA 2QC7A 4X0XA 1A2JA 3LG6A 3IAS2 2GT5A 3VFIA 1XW9A 2NPBA 4XIHA 2REMA 2WFCA 4MA9A 4KE3A 4D73A 5DALB 2G0FA 2H66A 3DIEA 4L0UA 1FO5A 3GYKA 2OA7A 3O6TA 1TI1A 3ZVJD 4ILFA 1Y6EA 3W6GA 3H4KA 4TXOA 2I1UA 2AB6A 1PKWA 1MD4A 3EC3A 4K2DA 1GWCA 2H6ZA 1XOAA 1RK4A 4YQVA 2FLSA 3UMAA 2R37A 3ZYWA 5B6MA 1EV4A 1A0RP 3MAKA 2PERA 3C7MA 3WGDA 6GSXA 3VI5A 1V57A 3JCML 5KN3A 3GNJA 2PPTA 5C04A 1H75A 1DE1A 1KNGA 3DMLA 2NDOA 2WJUA 2ZUPA 2C0FA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1EZKA

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Chain Sequence

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