1F37A

Structure of a thioredoxin-like [2fe-2s] ferredoxin from aquifex aeolicus
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
AEFKHVFVCVQDRPPGHPQGSCAQRGSREVFQAFMEKIQTDPQLFMTTVITPTGCMNACMMGPVVVVYPDGVWYGQVKPEDVDEIVEKHLKGGEPVERLVISKGKPPGM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of a thioredoxin-like [2Fe-2S] ferredoxin from Aquifex aeolicus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FERREDOXIN [2FE-2S]
molecule tags Electron transport
source organism Aquifex aeolicus
total genus 32
structure length 109
sequence length 109
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01257 2Fe-2S_thioredx Thioredoxin-like [2Fe-2S] ferredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1f37A00
3VPQA 5KN2A 1GULA 3F6DA 3VWUA 3GX0A 3O3TA 3KZQA 2GQKA 5E59A 4NAXA 5IMAA 1ERVA 1HNAA 2FCHA 3QD9A 3BCIA 1YKCA 2L6DA 1EGOA 2MYGA 2C8UA 4PUFC 5J9BA 4XRAA 1WJKA 1YEXA 3OR5A 5IMZA 2HRFA 5IIZA 2MMNA 17GSA 5AISA 5GAPD 2IMIA 2HYXA 5J41A 4WBRD 2CZ2A 4XS4B 1NSWA 5DDLA 3US3A 3IXRA 2JU5A 2HZFA 2NVLA 1BX9A 2GZYA 5ECQB 3EMPA 4ZBAA 3TKSC 5DALB 2DIYA 4MCUA 1N2AA 1OE8A 3A2WA 2DSAA 5F07A 3UBLA 4TXOB 2GLRA 3HVSA 5ABRA 1W4VA 5DCHA 5DQYA 2E7PA 1YQ1A 4JEDA 4BVXA 4ULXA 1M2AA 2KUCA 2DJJA 3TRQA 5IOXA 2PBJA 1FW1A 2DJKA 1H75A 2G2QA 2HRNA 4Q5NA 2C0GA 4KDYA 1PRXA 3K8NA 1HD2A 3TKSA 2IMKA 1GSSA 4Z7XA 1XVQA 4OMVA 3GSTA 2H0GA 1USBA 1PKWA 4MDCA 4F0CA 3QDNA 1QQ2A 1G7OA 1U87A 4JR4A 4MPGA 5LD0A 2TRCP 4FYUA 3O76A 4JRRA 4MF6A 4IQAA 2IWTA 1WIKA 2GSQA 2R3XA 3BCKA 5INYA 2GSTA 5B8BA 4EUYA 3NIVA 5D9XA 1MTCA 4OCFA 2RUFA 2QC7A 2L5LA 5D73A 3GTUB 6GSSA 3BBYA 2ON7A 4AGSA 1T4ZA 4IP1A 4MH2A 3SWLA 3CSJA 2M46A 4ZIJA 3D21A 2X64A 4IQ1A 4AF2A 4KDXA 3LFLA 1BYEA 2CA8A 5ECKB 3VI5A 2LQOA 4N10A 2LKUA 2GZZA 4Q5QA 3ZVJD 3CYNA 4ZL7A 1KTEA 1RW1A 1SJ6A 1OC9A 3RBTA 1GUKA 5COHA 3LXZA 5H5SA 2ALBA 4WF5A 2WB9A 2LJKA 1GTAA 3RHBA 3CBUA 5E4WA 1VF4A 1M99A 3VURA 3A2XA 4MLYA 1SL2B 5C00A 11GSA 4JZQA 5G5FA 5H5RA 9GSSA 5HFIA 1IYIA 2WJUA 3M3MA 3GL3A 2H0HA 3TJBA 3GV1A 20GSA 4MJEA 4EXJA 1G6WA 3QAVA 4K9ZA 4RI6A 5JCWA 2H1DA 3GIXA 2LRCA 3VLNA 19GSA 1F9MA 1YY7A 1M2DA 2GT6A 3EU3A 2X8HA 3VWXA 4WBJA 3N9JA 4LL4B 1FG4A 5H5QA 1TK0B 4HJMA 1GSEA 2JSZA 1UA5A 4GF0A 4HQZA 1YEPA 1SD8A 1SKRB 2JZSA 3M8NA 4POMA 2V2GA 1N8JA 1F3AA 1V40A 1THXA 4N0ZA 2L59A 14GSA 5ECRB 3TOUA 4FH8A 1X0RA 1X9WB 3RPPA 1XXUA 1HNCA 1Y25A 1OVNA 3TKRA 1GWCA 1PL1A 4NPBA 1M7TA 2B5YA 3TGZA 1FB0A 4G10A 1U88A 2O85A 1FO5A 3HKRA 1WE0A 2G0FA 4TR3A 1SK2A 3QFAC 5F0GA 1TK5B 3F63A 3GURA 3VI7A 4KE3A 3GKKA 2XPDA 4KCEA 3UVHA 2PN8A 4MA9A 3GKNA 5GAND 3VFIA 2CX3A 4POKA 3MAKA 2ON5A 5JWOB 2O8VB 2OA7A 2YN1A 2C0EA 4MP4A 12GSA 2VL2C 3ME7A 4YH2A 3G7IA 2C1YA 3ZITA 4F2IA 1OKTA 5IPGA 3CRTA 3GSSA 4BWSA 1Q98A 3MSZA 3ZVJA 2OBIA 2K18A 1M2BA 2H73A 4D73A 2P0GA 3ZZXA 3P7XA 4KA0A 2VL2A 4JU5A 1A2LA 3MNGA 4XCSA 1LU4A 2C0DA 3LORA 1HQOA 5FT3A 2HXKA 3EU4A 4KAEA 1JLWA 1ZMAA 1A24A 1XWCA 2LJAA 4PGTA 4XHMA 1ON4A 4LMWA 1K3YA 2YWIA 2VLUA 1I5GA 1DSBA 1XWBA 1DE1A 1XIYA 3UL3A 4ZL9A 1R7HA 1FAAA 2FA8A 3DYRA 2H0IA 3FZAA 1J9BA 3GMFA 1SK1A 4OFNA 1GRXA 1GP1A 2L5OA 2P5QA 2GGTA 2FWFA 3I9V2 5ECNB 4IHUA 3L9VA 2B5XA 4V1Ap 3KP9A 2E2MA 3LYKA 2RUEA 4FIWA 2M72A 3L78A 3APQA 4IN0A 2H1BA 4HS1A 3FZ9A 1EGRA 3S9FA 5CO3A 4V1Ag 2CT6A 1YKAA 1TTZA 2GZPA 4GSSA 1PA3A 4GLTA 4ISDA 5HFGA 4I8BA 1WPIA 3DIEA 3L9UA 1K0OA 3GRXA 1ZCPA 3TJJA 3TUEA 3D4MA 1JZRA 1PD21 4N11A 3N5OA 2F8AA 1QUWA 1BJXA 3APOA 2VCQA 5B7CA 5J9CA 3PH9A 1Y6EA 4K2DA 1B8XA 1SENA 5A4UA 5IMCA 1AIUA 4F82A 5LCZA 3I6AA 4XS4A 2YP6A 2JL4A 3UMAA 4JR6A 1PGTA 2PU9C 2LUSA 2KP1A 4GRFA 2M80A 4MABA 1V2AA 2O87A 2H1GA 5DALA 4WF4A 2AUVA 2JACA 1FB6A 1O73A 4TXOA 4L5OA 1V9WA 2YOIA 3KXOA 2IPAA 4K7OA 2B7KA 1R5PA 1Z6NA 2LV3A 3KH7A 2B1KA 2QGVA 2HE3A 1T00A 3H8QA 2HZEB 1O85A 2BMXA 4LA1A 2OE3A 4V2NA 4FO5A 2B6MA 1WRYA 4ZXGA 1AXDA 1GTUA 2XHFA 4BL7A 4ECIA 5JWQB 1Z7RA 2A4VA 1G6YA 5IQYA 1TRSA 2BTOT 4EF0A 3ZLPA 3E0UA 4WKWA 2ES7A 3GN3A 1CQGA 1PSQA 5IMVA 3F3QA 3FYGA 3EURA 1J0FA 1T4YA 3LWAA 2FA4A 5CRWA 1R5AA 1GLPA 2R2JA 3HCZA 4IKHA 3GTUA 4ZL8A 5GSTA 2I1UA 3UJ1A 1SJIA 2VCTA 3LQ7A 4E8HA 2P31A 5DAKB 1K0DA 1A23A 1S3CA 3C1SA 3M9JA 1ERUA 4HZ4A 2VM1A 4OO4A 4I2TA 1DE2A 3R2QA 1GSDA 3HJOA 2FLSA 2H6YA 5HR0A 3LSZA 1TK8B 1T1VA 4J57E 1PQNA 2QSIA 2MMAA 4GWRA 2FUG2 2VIMA 2R37A 1OC3A 1PMTA 6GSVA 1XZOA 2KLXA 2RLIA 2QKEA 3IRAA 1R26A 2N5AA 4IJ3A 3VPTA 2MBTA 5HQPA 2OBKA 5EVOA 4V2LA 1A2JA 4E8EA 2GSRA 3H1NA 5D8IA 2YNXA 3UAPA 3HHVA 1OE7A 4MJCA 3RPNA 2LNTA 3TJKA 5CNWA 1O8WA 1QFNA 1GNWA 2LJRA 2KP2A 4G19A 1BG5A 4HOJA 1K0MA 3D0ZA 3Q6OA 2I81A 5AIVA 1SK0A 2A2RA 1PX7A 4ILFA 1EEJA 4HQSA 5B6NA 3UOMA 2JZRA 1MDJA 2VL3A 3RAZA 2JZTA 2LEGA 3E3EA 5A4VA 1XOAA 2PUKC 4CDOA 1B4PA 1YZXA 4YAPA 3ERFA 2L4QA 3DKSA 2B5EA 2OACA 3IPZA 1XVWA 2CAIA 1JFUA 3D5JA 1J08A 3FY7A 4TN8A 1A8YA 2NDOA 2K6VA 3DMLA 4LL1B 2YJ7A 2Z9SA 1Z5YE 4O5RA 1OYJA 1SKWB 2LNSA 4K6XA 5KEJA 3ZYWA 3IAS2 4POBA 4Q5FA 5G1KA 5CP1A 3KMNA 5DVBA 3GNJA 3GX8A 3C7MA 2AHEA 2VLVA 2VCZA 3ERWA 4TR1B 5G31A 2IMEA 3F6FA 2VCVA 3ZFBA 3P8WA 1AC1A 1XWAA 1K0BA 1UC7A 4YQUA 4PNGA 3F4TA 1GL8A 4HDEA 1ZOFA 2AV4A 4ECCA 2PERA 3EVIA 1GUHA 2BJXA 1F3BA 1EEMA 2PWJA 3A5WA 5J3RA 4MPFA 2P5RA 2H76A 1XFLA 2NBSA 1WP0A 3ED3A 1SKSB 3ME8A 1TOFA 5HR2A 3WT2A 2F8FA 1O6JA 4CHSA 2GQLA 2FGXA 2V6KA 2I4AA 3U6VA 2J23A 5ELAA 3WYWA 4FYBA 1Z6MA 1OKDA 3CRUA 1BAYA 3C73A 2H6ZA 4RQRA 1T8EB 3P2AA 1OAZA 2VLTA 3CMIA 2H19A 1TRVA 1A8LA 2LQQA 3D4TA 5D9VA 4X43A 2WDUA 3DGQA 3Q19A 4YQMA 4DEJA 3MWHA 2L6CA 2XC2A 3IAM2 4IP6A 5AIXA 2GS3A 4JBBA 1V58A 1Q4JA 1TDIA 3F4RA 3KMOA 4O32A 4BPYA 2CQ9A 3GL5A 2LS5A 2B1LA 2REMA 2VAFA 1FVJA 1WOUA 5B8AA 2DJ2A 2H8LA 4XS1A 4RI7A 5A4WA 5IOWA 1Z9HA 1THOA 2GDRA 3CTGA 1XBSA 2R4VA 4QQ7A 3ZIJA 3ZTLA 1LBKA 3IHQA 2VOCA 3RHCA 1CQHA 1GNEA 3QPMA 3TKSE 1NHYA 4EKZA 4PX1A 16GSA 3LYPA 3NOFA 1G7EA 3IOSA 2IMDA 2YV7A 4QL7A 1B48A 4XIHA 3HD5A 3G7YA 3EYTA 4EVMA 1K3OA 1JHBA 4NMUA 4L0UA 1U3AA 3UEMA 3EC3A 1NHOA 1O7UA 6GSTA 2CX4A 2IFQA 2WCIA 1X9SB 1PN9A 5CRHA 2V1MA 3HYPA 3CTFA 3ZREA 1MD3A 2YZHA 2B7JA 2H74A 1VF2A 4WEYA 4GXZA 22GSA 4WR5A 4OWYA 3ZL5A 4PUAA 1ERWA 1PKZA 2HZEA 3HDCA 1B9XC 4I97A 3ERGA 5IM9A 2L4CA 1SL1B 2CAQA 2DLXA 3A3TA 2HLSA 3HVVA 3GFKA 5GSSA 1HNBA 3DVXA 1OC9B 4IW9A 1A0FA 1HYUA 1GTIA 3WT1A 2E0QA 4KW6A 4K0NA 2HSYA 3FR3A 1JZWA 4DSSB 4J2FA 5DAKA 3DVWA 3GKMA 4X0XA 4GTUA 1ZZYA 2HI7A 5F8BA 2F9SA 1B9YC 1ST9A 5B6MA 4MJBA 4ECBA 3HJPA 2VCXA 1AQXA 1QMVA 5ECSA 2V6OA 4LMVA 2AJQB 1EWXA 3BJ5A 3RDWA 1SL0B 2DBCA 1XOBA 3UVTA 2CVBA 4TR0A 2EC4A 3TDGA 1ZL9A 5AGYA 3IR4A 3L4NA 4P3YB 1TI1A 4MJAA 1W89A 1EOGA 1K0CA 4MZBA 1AUCA 5G1LA 2JADA 4XS6A 3IK9A 1GSUA 4PXOA 1G0TA 3Q74A 3ZRDA 1T3BA 6GSUA 3UBKA 1XW9A 1A2MA 3BOAA 5DBQA 4O7HA 2DC5A 2H6XA 4ZB6A 2FY6A 2EIQA 4IVFA 2J9HA 1X5CA 3TOTA 4KDUA 3Q18A 4ML1A 2VD0A 1ABAA 2C80A 4OD7A 4ZB8A 2VCWA 3ISOA 1DBYA 3P90A 2K9FA 4AJ7A 2N5BA 5EPFA 5DJLA 5J4UA 4GCIA 2WZ9A 2X8GA 1LJRA 2JSYA 3IE3A 4IGJA 3QFBC 4MZCA 3WGDA 3GH6A 3GA4A 4G2EA 1DUGA 5JCGA 2CV4A 4DSQA 1EV9A 5D93A 1VGLA 3KP8A 2H71A 3FW2A 4N30A 6GSXA 2XPEA 2A2SA 4H86A 3H4KA 3DD3A 3QCPA 2PPTA 3IDVA 7GSSA 2YV9A 1QK8A 4TXVA 4TR1A 3TCOA 3KD0A 1X9MB 2YWOA 4F9ZA 3C71A 2MMOA 5G30A 3GHAA 1E6BA 2IMFA 3E9JB 4KH7A 3CXGA 1SD9A 2XBQA 3J7Yb 1XWKA 1NW2A 2HSHA 3AY8A 3HA9A 3QAGA 4I5QA 3M1GA 4HEA2 1I9DA 1FOVA 1YJ6A 5G5EA 5HR3A 1TW9A 2H1AA 3F0IA 1ML6A 4ACSA 2CZ3A 4K7NA 3KGKA 1AQWA 5CAXA 4MH3A 1F37A 2C4JA 5DQSA 4IELA 2YWNA 4I2UA 5HFKA 4ID0A 3GKXA 3WGXA 4YQVA 1TJDA 5G2ZA 3TKQA 4WR4A 2WGRA 4J56E 6GSYA 3F3RA 3HXSA 3M0FA 4F0BA 2RM5A 3G7JA 2WRTA 2IIYA 1KBNA 4PQ1A 4GSNA 4DSRA 3CSHA 3QMXA 4ZILA 4K7IA 4KSMA 1JLVA 3HZ8A 3F4SA 4MZWA 3TJGA 4HUAA 5IO0A 4KB3A 4BA7A 3IC4A 2WFCA 2RM6A 2OKAA 3VWWA 3W8SA 3NZNA 3F9UA 1TP9A 1GH2A 4PQIA 4GSTA 1FVKA 3APSA 2EIOA 1ZGNA 2IJYA 5GZZB 2F3MA 3HJMA 4OFMA 4HU9A 1V98A 3HZ4A 2R6KA 1XW5A 4FYCA 2LTKA 1EP8A 3FRCA 2DJ3A 4PNFA 3HVXA 3L0HA 3KTBA 1V57A 5HR1A 3FR6A 4WETA 2H72A 1UN2A 4L5LA 1VRSD 5EY6A 4F03A 1SYRA 2YPMA 1GSFA 5IMFA 5CREA 2D2ZA 3ZIVA 2LSTA 4G9HA 1MD4A 4YAVA 1EOHA 3WGEA 5ECPB 4HZ2A 4IS0A 5EL8A 3FR9A 2H70A 1XCCA 5KN1A 2LRTA 3FKFA 2FWHA 5J5NA 1TXXA 2ZUPA 2VM2A 3ZMKA 4I6XA 1RQMA 1Z3EA 1EZKA 2R5GA 3SBCA 3DWVA 2O89A 1MEKA 4NHZA 3FZ4A 5ID2B 2IN3A 5DCGA 2YWMA 1AAZA 2X99A 1FHEA 1TRWA 4HI7A 3W6GA 3TRPA 2GTUA 4EL1A 4K1FA 1TU7A 1M9AA 3KCMA 2E2GA 1VF1A 1O81A 1WMJA 1M9BA 2FWGA 5D96A 1EV4A 4AJ6A 3IBHA 1UVZA 4N0VA 2YCDA 3EMXA 2GVPA 3F8UA 1XPVA 4OO5A 4XTSA 2MMZA 4RUVA 1URMA 3FK8A 3M9KA 18GSA 4DSSA 2IL3A 4KUNA 1XWGA 2PVQA 2N5FA 2WULA 5ECMB 4ZBBA 4K8MA 4L8EA 4ZBDA 2X8CA 3HY2A 3DXBA 1TKDB 3D22A 2DJ0A 4WXTA 4GQCA 3UIWA 2GSSA 3ZMLA 2FHEA 1SU9A 2MBSA 3H79A 2C3TA 3UARA 2V32A 4KGIA 1O8XA 2DMLA 2EIRA 4NV5A 3C1RA 2OE1A 2ZNMA 1X5EA 5ECOB 2AAWA 3KTLA 1U3IA 4MF5A 4IJIA 5ENUA 4O92A 2WS2A 2PGTA 3G9BA 3EE2A 1PL2A 4ML6A 3TRXA 1Z7PA 4HU7A 5ECIB 2CVKA 5C04A 1MDIA 4DVCA 1GSQA 4TW5A 3BD2A 2TRXA 2TIRA 3LXTA 3TKPA 1ACVA 3LJRA 4MF7A 1TI3A 3PGTA 5KN0A 1B4QA 2AYTA 5IPHA 2DJ1A 3ZFLA 4BWQA 3FZ5A 2LRNA 1KEBA 4MMMA 2FD3A 5KN3A 2VD1A 4TOPA 4POLA 5IO2A 1A0RP 2MZCA 2H66A 1GLQA 1C72A 5A5KA 2I9HA 5FHIA 1TU8A 3FHKA 2VO4A 3VK9A 3LGCA 1GSYA 4EDYA 2C0FA 2VUPA 3QAWA 4CW9A 5D9WA 3KEBA 4EE0A 13GSA 1VF3A 1ZYEA 4EC0A 1TRUA 3WD6A 2HFDA 4ZB9A 2CVDA 1IYHA 1S3DA 1BEDA 2F51A 1AQVA 4AJ8A 5ECHB 3EWLA 1JZOA 3D6IA 3KM6A 2C3QA 3MDKA 2KHPA 4QL9A 4NHWA 5ECLB 2NTOA 2GQMA 4NV2A 1RK4A 2YZUA 4X1UA 4KSOA 4KX4A 3TJFA 2GT5A 3IA1A 5JWRB 5F06A 4IBPA 1F6MC 3KJYA 1U6TA 1F2EA 4XRDA 4PURA 3IK7A 3I43A 3KH9A 2OADA 2I3YA 5AN1A 3GUSA 4K0GA 3FEUA 4GQFA 3GYKA 2K8SA 3EINA 3VWVA 4TR4A 4L0WA 1E2YA 2H75A 1GUMA 1YDKA 4MK3A 5F05A 2PVOC 1GTBA 2HT9A 4NXIA 5CRGA 6GSWA 4TRXA 4TKYA 2YANA 2RIIA 2ZCTA 4KCAA 5LNKe 2C3NA 1XW6A 1EP7A 1X5DA 1K0NA 4BVYA 4KNDA 3PR8A 4HJ2A 2DMMA 2HNLA 1BQ7A 2V41A 1SJZA 1WWJA 3O6TA 2DIZA 1R4WA 4OFTA 3DRNA 5JCUA 5FWGA 4Q5RA 1MDKA 2IFQB 1NM3A 3TB2A 1ERTA 1T7PB 3JCML 5L71A 3J7Yk 3IV4A 1OC8A 2PMTA 4ECJA 1ZYQB 2KOKA 1PX6A 3L9SA 1K3LA 4D73B 1H4OA 4V2MA 8GSSA 2H30A 3W8JA 3U5RE 3CSIA 1KNGA 2K8VA 1SYXA 4RQXA 4JE1A 4TVEA 2XBIA 3QR6A 5D9TA 3A2VA 10GSA 1M0UA 1YF1A 3V1WA 5ELGA 2NPBA 2OJLA 2AB6A 2FWEA 3DEXA 4OCEA 3I69A 3H93A 5CYYA 4LLRA 1K0AA 1QXHA 3LEFA 2FNOA 2YJHA 3LG6A 5ID2A 2H01A 1S3AA 1AW9A 3PINA 3QOUA 2L57A 3C8EA 5CRDA 2OE0A 4EO3A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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