1FO5A

Solution structure of reduced mj0307
Total Genus 16
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
16
sequence length
85
structure length
85
Chain Sequence
MSKVKIELFTSPMCPHCPAAKRVVEEVANEMPDAVEVEYINVMENPQKAMEYGIMAVPTIVINGDVEFIGAPTKEALVEAIKKRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Solution nuclear magnetic resonance structure of a protein disulfide oxidoreductase from Methanococcus jannaschii.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Methanocaldococcus jannaschii
total genus 16
structure length 85
sequence length 85
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1fo5A00
1MD3A 1YDKA 4XS4B 5J41A 1WOUA 2H1GA 2C0FA 2WGRA 1N8JA 2CVDA 5JWRB 3FK8A 2REMA 1QUWA 1B48A 1O85A 4G19A 1PL2A 3F6DA 4HS1A 2R37A 3CSJA 2C3NA 3CSIA 5KEJA 5B6NA 4K2DA 2H1BA 3M3MA 1XFLA 5DQYA 2I9HA 3VPTA 3F63A 3KIJA 1GL8A 3N9JA 2CQ9A 4O32A 5G1KA 3W6GA 3L9SA 3GYKA 3APSA 1GSSA 1YF1A 2P31A 4IJIA 2LRTA 4NPBA 5F0GA 2FNOA 4YH2A 1GUHA 3APQA 1K0DA 1TRVA 3GA4A 1KNGA 1SD8A 2VLTA 2C8UA 1O8WA 3UOMA 3N5OA 1H4OA 2CT6A 4TR0A 4F03A 3TOTA 4E8EA 2VM1A 2GZPA 3TUEA 6GSTA 2YWNA 2B7KA 2GVPA 2PUKC 4RI7A 1K3OA 1BAYA 1UC7A 2GZYA 3DYRA 4HU7A 4TOPA 1K0BA 4JZQA 1XW5A 1FAAA 4EE0A 1SKWB 2IPAA 1X5CA 2E7PA 1QXHA 2WB9A 1O81A 3APOA 1GNEA 3QAGA 1VF1A 4N11A 2ZCTA 2I4AA 1ZCPA 1I9DA 4LA1A 4LL1B 1HD2A 3ZFBA 3KEBA 2CVBA 5AGYA 2L4CA 2FCHA 3G7JA 2BMXA 3GMFA 4EDYA 4KW6A 22GSA 2H8LA 1TI3A 2QSIA 3FZ5A 4F82A 1CQGA 2EC4A 2LJKA 4HU9A 4XCSA 4BWSA 4LMVA 3D22A 2CZ3A 1TXXA 3HD5A 4MJEA 5ENUA 4V1Ag 2H75A 3BBYA 3EC3A 5G2ZA 5EVOA 5DALA 2QGVA 1GSEA 1ZGNA 3GIXA 2X64A 2J23A 1O73A 3UVTA 4GSNA 1XWCA 3BCIA 2HT9A 4PUAA 2DMMA 4K9ZA 1OC8A 2MMNA 3FZ9A 1MEKA 3GFKA 1HNCA 2JU5A 1PN9A 1G0TA 5IMAA 2KUCA 4FIWA 3UVHA 4TR1A 1ML6A 4HZ2A 3ZVJD 1YKAA 4MJCA 4KDYA 3MNGA 1M9AA 2R3XA 4N0VA 3HVSA 3ZFLA 4ECBA 4L8EA 3VWXA 3A2WA 3H1NA 1KEBA 4ZL9A 3TKPA 4IVFA 4ZIJA 5H5QA 1FOVA 1Z7PA 3GRXA 5EPFA 2X8HA 5J9CA 3U6VA 1TK5B 1RK4A 2NPBA 4L5LA 1TK0B 5LD0A 3TKQA 2NDOA 2AB6A 1R4WA 2AYTA 4WF5A 4KH7A 4I8BA 3QAVA 3CTGA 2MYGA 2IFQA 3WD6A 1I5GA 2FY6A 3GX0A 1FO5A 1V58A 4N30A 5L71A 2GQLA 4ECJA 3GX8A 4EO3A 2L57A 2JSZA 2B5EA 5D93A 3K8NA 2PERA 5CNWA 3GUSA 1TRSA 3D21A 3MAKA 2OJLA 1WIKA 4NV5A 4PQ1A 3ME7A 3I43A 3QDNA 3TRXA 2DC5A 3IA1A 3P2AA 4XS1A 3FR6A 3ZMKA 2DJJA 4OMVA 20GSA 3ISOA 1PSQA 1E6BA 4FYCA 5G30A 2K8SA 5GZZB 2WRTA 1HQOA 3KGKA 3KTLA 3H4KA 4F0BA 3C71A 1GP1A 3E9JB 1QK8A 2CV4A 3ZRDA 2WULA 4MH3A 1SYRA 5H5SA 3A3TA 3GNJA 1OC3A 1SD9A 2HRNA 14GSA 2H71A 1W4VA 1X0RA 2YCDA 1X9SB 2F3MA 2IMIA 4YQMA 1KBNA 3GKNA 1YEXA 5J9BA 3TJJA 5CO3A 2JL4A 3BD2A 3CXGA 5DDLA 2GSTA 3VFIA 4AF2A 4HQSA 4IS0A 1ZL9A 1Z3EA 1CQHA 3VWVA 2E2GA 2H66A 3F6FA 5ID2A 3HVXA 2ON5A 1O8XA 4JR6A 3ZIVA 4IQ1A 1K0OA 1Z7RA 4AGSA 3L0HA 4FH8A 2VLUA 6GSXA 3WT1A 4GSTA 3DD3A 3PR8A 5ECPB 2AAWA 3LYPA 1QFNA 1T4YA 3HYPA 2BTOT 2FWEA 3VPQA 4ZBBA 2GQMA 3C7MA 2HI7A 4J2FA 5HFGA 1Y25A 5A4UA 3KTBA 1ABAA 1GSYA 2XHFA 1V98A 2IMEA 5ECNB 5GSSA 1NHOA 1PD21 3DVWA 4NV2A 1JZWA 3FRCA 3UBLA 3I6AA 2EIOA 5FHIA 2M80A 3IK9A 4N0ZA 4BL7A 5HR3A 1AAZA 2EIQA 3EURA 2MBTA 4TKYA 3S9FA 4OO5A 3L4NA 4K8MA 1XVQA 1A0FA 3KXOA 5D9TA 2IL3A 4BVXA 3FZAA 2PN8A 1GTUA 5IIZA 2AV4A 4MJBA 3HZ8A 3O6TA 3ZVJA 1SL0B 2X8CA 2VIMA 4HJMA 5A5KA 2RM6A 3M0FA 3V1WA 1O7UA 1A0RP 2VCTA 2TRXA 1QMVA 3DKSA 3D0ZA 1AQXA 1OE7A 2A4VA 1YF0A 4I97A 1HNBA 4EDZA 1ZYEA 4GTUA 2H70A 1R5PA 3PH9A 3EU3A 4WKWA 5ECQB 2O7KA 2VAFA 3PGTA 4ZXGA 3PINA 1OE8A 3J7Yk 1U6TA 2WCIA 1TK8B 3ZIJA 5KN3A 4MPGA 3ERWA 4GCIA 1UA5A 2Z9SA 5ECKB 4H86A 3GSTA 3CTFA 5INYA 1OVNA 2GZZA 5D9XA 4JRRA 1B9YC 3HVVA 2OACA 3KCMA 1AC1A 2MMZA 1AUCA 1M7TA 2V6KA 8GSSA 3TOUA 1BYEA 2P5QA 4BA7A 4K0NA 2IWTA 2JZSA 3CSHA 3QMXA 3ED3A 4KCAA 2YN1A 3C1SA 2MBSA 4PNGA 3ZMLA 1K0CA 5DQSA 4MP4A 3D5JA 1XBSA 2KHPA 3IDVA 2YP6A 1IYIA 3C1RA 3RHBA 2GLRA 4F9ZA 3RAZA 1M2BA 2CX4A 5CREA 4ILFA 3VWUA 1EGOA 4KX4A 2H73A 6GSVA 1AW9A 1VF4A 1PGTA 3IAS2 2RUFA 4E8HA 3ZITA 4KA0A 1K3LA 4N10A 2WZ9A 2VCXA 2P0GA 4HOJA 4DSRA 3KJYA 3W8JA 3E0UA 3IHQA 1USBA 4EKZA 4GLTA 2TRCP 5C04A 4Q5NA 1EP8A 3DVXA 5B7CA 3H8QA 1N2AA 2DMLA 4V1Ap 1EOGA 4ZL7A 1TRWA 3VK9A 5JWQB 1WWJA 3LJRA 2MMAA 1X9WB 1TRUA 2YPMA 3LQ7A 2FWFA 2KLXA 3TB2A 2YJHA 3DRNA 2LTKA 2LQOA 3UMAA 1ILOA 3LORA 3F4RA 3UAPA 1EGRA 2VCZA 1J0FA 4ML6A 4MLYA 3EMXA 5D73A 2GSSA 4D73B 16GSA 1SJIA 1XW9A 2C3TA 3HDCA 1FB0A 3OR5A 5KN2A 4I5QA 2YWIA 3EE2A 1TKDB 1TP9A 3GHAA 4K0GA 2DJ3A 3KZQA 1B8XA 4ZBDA 4EL1A 4KNDA 2CAQA 3TCOA 2IIYA 4YQVA 5A4VA 1A8LA 2H74A 4TRXA 3CBUA 1EZKA 3KP8A 4IQAA 1XWKA 1V9WA 1EEJA 2QC7A 2YANA 5LCZA 1YQ1A 4Q5FA 2GGTA 4KDUA 1NSWA 1K0AA 1C72A 1Q4JA 4YAPA 3UJ1A 3FR3A 4EVMA 5IM9A 1F37A 4MCUA 2V32A 3VLNA 1GTBA 6GSWA 1OC9B 3WGDA 3R2QA 3BJ5A 2FWHA 1OYJA 5H5RA 2QKEA 3LYKA 3ZREA 1A24A 5ELGA 4HI7A 3AY8A 2EIRA 3LSZA 2C80A 1M0UA 1GULA 2PU9C 2PVQA 2KOKA 4FYUA 2JACA 1R7HA 4PQHA 2H6XA 3ZLPA 4BVYA 2HZEB 2H30A 1TW9A 2NBSA 4GQCA 2C1YA 3TGZA 4EXJA 3US3A 2NTOA 3MDKA 2R2JA 1V57A 5CRWA 4G2EA 5DAKB 3BOAA 2R4VA 2OE0A 4XS4A 3C73A 4X1UA 1X5EA 1A2JA 3QCPA 4ZB6A 2HXKA 3M1GA 2ES7A 3KH9A 4XRDA 2VCWA 5B8BA 1GLQA 4GSSA 1ZOFA 5F06A 3UL3A 3UBKA 2OBKA 5ECIB 1ZYQB 2N5FA 3ZL5A 3DWVA 2DIZA 3RBTA 3LXTA 4JE1A 2DJ0A 3TRPA 1G6YA 1V40A 3GH9A 5AN1A 3A5WA 1JZRA 3VI7A 4MJAA 3J7Yb 4DSSB 2OA7A 3CMIA 4I2UA 2CX3A 3Q19A 4EUYA 1XVWA 3WGXA 1JZDA 2LJAA 5JCWA 4TR4A 2C0GA 1GSQA 4AJ7A 2L5OA 3MWHA 2YZHA 3GV1A 1XCCA 2O85A 3HY2A 1MTCA 5G5FA 4IP6A 2C0DA 4V2LA 2L5LA 1SKSB 1NHYA 3ERFA 2OBIA 6GSUA 17GSA 2RLIA 4Q5RA 1OAZA 3KMNA 1X9MB 4IGJA 1J08A 3FHKA 3GH6A 5HFIA 1FVJA 5COHA 2I81A 4IHUA 1DSBA 3CYNA 4I2TA 5AISA 5J4UA 4K7OA 2C4JA 2I1UA 4OFTA 1OC9A 5FWGA 1XOBA 3ERGA 2MZCA 3F3RA 3ZZXA 5G31A 1Q98A 3GURA 4TVEA 4AJ6A 4G10A 4ML1A 2IN3A 2VD1A 3D6IA 2ZUPA 4CHSA 2XBIA 5F05A 2IMKA 1O6JA 4NXIA 1E2YA 3TKSE 2H72A 3TJFA 1PL1A 4ZB8A 4XTSA 4POKA 4MF7A 4WETA 4KUNA 4LL4B 5HFKA 4ECIA 2AJQB 2C0EA 1YY7A 1ST9A 5F8BA 2JSYA 3F4TA 3W8SA 5G1LA 1MDIA 3WYWA 4DEJA 5DJLA 2JZTA 3I69A 2L6DA 4ACSA 1EWXA 2D2ZA 5GAND 2VOCA 2DSAA 4K7IA 3GKKA 3E3EA 1YZXA 2XC2A 1SK1A 3KP9A 4O92A 5DAKA 1A2LA 4WF4A 1ERTA 2K18A 3D4TA 1SJ6A 5DCGA 4P3YB 4O5RA 2V1MA 1GSDA 4EF0A 3VI5A 5IPHA 2IMFA 2LV3A 2HRFA 1Z6NA 4GQFA 5IPGA 1Z9HA 2LEGA 1U87A 2LRCA 2HZFA 2F51A 1B9XC 1HNAA 3IPZA 4OO4A 1EEMA 5JCGA 4KCEA 4DSSA 1YEPA 3HA9A 1LBKA 2AHEA 3FEUA 2LJRA 2LNSA 2F8FA 4MZWA 3KD0A 3QAWA 4MF5A 1R26A 4TW5A 3QFAC 4RUVA 4POBA 4ISDA 5DBQA 1YJ6A 5JCUA 1HYUA 1XWAA 1EOHA 3HJOA 1F6MC 2O8VB 5ECLB 1WJKA 4PQIA 2GSRA 4WR5A 2H76A 1T00A 3F3QA 5F07A 2H1DA 3IXRA 1ACVA 2GT5A 3A2VA 4PX1A 1PA3A 3QFBC 3UARA 1MD4A 1XWGA 4FYBA 4DSQA 3HJMA 3RPNA 5HQPA 4L5OA 2RUEA 1LJRA 4MMMA 1BX9A 2VL9A 2KP1A 5B6MA 4IP1A 5IMDA 2M46A 3SWLA 3IE3A 1SK0A 4MPFA 1G7EA 4MZCA 3GL5A 1PX7A 5CRHA 4DVCA 1WRYA 5ECOB 2LRNA 4K7NA 2YV9A 2GT6A 3H93A 4KB3A 1S3CA 1A8YA 4OD7A 2ON7A 4YQUA 1IYHA 2GTUA 4PURA 2OE3A 2H19A 2VM2A 5J5NA 2B1KA 1DE2A 4NMUA 5E4WA 4CDOA 1F3BA 1WPIA 1GSUA 1Y6EA 3NZNA 2H0IA 1JZOA 1TU7A 1W89A 2YWMA 1F3AA 4TXVA 4WR4A 4V2NA 1SKRB 2RM5A 2DLXA 4Z7XA 1GSFA 5CRDA 2VUPA 1PQNA 5DCHA 4CW9A 4OWYA 2F8AA 3ZYWA 4EC0A 2DJ2A 2OADA 4MH2A 2K6VA 5IQYA 1MDKA 3GSSA 3H79A 1Z5YE 5DALB 1AXDA 4JU5A 1GTIA 4O7HA 5B8AA 2ALBA 3WT2A 3L9VA 3EWLA 2L4QA 3HHVA 3IRAA 3LG6A 3P8WA 1G6WA 1S3AA 4MABA 4TR1B 5GAPD 4NHZA 1FG4A 2VL2C 1XWBA 1PKWA 1EV4A 3IC4A 4IBPA 4IJ3A 4KE3A 3GN3A 3U5RE 1DBYA 3UEMA 1NW2A 2C3QA 2H0HA 3JCML 1AIUA 2GQKA 2CA8A 4QL7A 3Q18A 4K6XA 1K3YA 5KN1A 1T7PB 4ZL8A 2V2GA 1GUKA 2H6YA 3QR6A 1S3DA 4LMWA 1LU4A 1M9BA 3C8EA 2VLVA 2IFQB 5CP1A 4TXOB 2L6CA 3NOFA 13GSA 2L59A 5DJMA 2DJ1A 3TJGA 1MDJA 1FB6A 1T8EB 1FHEA 2PWJA 2WFCA 2R5GA 3CRUA 4RQRA 2LKUA 3FW2A 3QOUA 2H0GA 2X99A 2YNXA 4F0CA 2B5YA 4MDCA 4PGTA 3GL3A 2I3YA 5IMZA 1DUGA 1M2AA 2V41A 2X8GA 1F9MA 1A23A 3IK7A 1GTAA 2VL2A 3IOSA 1BEDA 4FO5A 2HSYA 1FVKA 2VCQA 5IMCA 2K8VA 2PGTA 1EP7A 3QD9A 3DMLA 3CRTA 5EY6A 2E2MA 2PBJA 3ME8A 1JLWA 4ID0A 2B1LA 4J56E 2FA4A 3G7YA 2FD3A 3D4MA 4ULXA 4LLRA 3LWAA 4MF6A 6GSSA 5HR1A 4K1FA 1GUMA 5IOXA 1GWCA 4RI6A 1GH2A 2FA8A 2H1AA 1WE0A 1XZOA 3DGQA 4JEDA 5IMFA 1B4QA 5ID2B 4BWQA 1FW1A 2DIYA 2YJ7A 1BJXA 5D9VA 3TRQA 1U3IA 4IKHA 4TR3A 2CZ2A 2GDRA 3A2XA 1QQ2A 2OKAA 3QPMA 2P5RA 4X0XA 3GKMA 2B5XA 3IR4A 2IJYA 1U3AA 2JZRA 3F4SA 1JFUA 5AIXA 1PRXA 1URMA 4MA9A 5ABRA 4HUAA 4QL9A 3DXBA 4ECCA 4PNFA 3GTUB 2WJUA 2GS3A 2XPDA 4POMA 4NHWA 3DEXA 2OE1A 2IMDA 3NIVA 1JLVA 2KP2A 4RQXA 4XIHA 4L0WA 2DJKA 2MMOA 4GXZA 19GSA 1OKDA 3WGEA 4WBRD 2M72A 1KTEA 1U88A 4D73A 2BJXA 5IOWA 1OKTA 2YWOA 1B4PA 4JR4A 4OCFA 4NWYA 5CRGA 3IAM2 4OFNA 5LNKe 2CVKA 3L78A 1TU8A 5IO2A 2VCVA 5JWOB 4TXOA 5GSTA 2FGXA 3EVIA 2A2SA 9GSSA 3GKXA 1RW1A 3P90A 4J57E 3TJKA 4QQ7A 1M99A 3Q74A 1PKZA 4WXTA 2N5AA 3EU4A 2CAIA 1T1VA 2HLSA 4MZBA 2FLSA 2HNLA 1THOA 3FR9A 3TDGA 5DVBA 2WS2A 4X43A 3EINA 5AIVA 2FUG2 3TKSC 5A4WA 3O76A 2G0FA 3HJPA 1VGLA 1J9BA 3LGCA 3FKFA 1VF3A 3IV4A 3HXSA 3M8NA 4KAEA 5E59A 1WP0A 1BQ7A 3FYGA 3M9KA 3LEFA 1X5DA 4PXOA 4KGIA 2WDUA 3RDWA 5ECRB 5HR2A 1GLPA 4HJ2A 5HR0A 1RQMA 2FHEA 2RIIA 1SJZA 5ECMB 2R6KA 2AUVA 4NAXA 3LFLA 2LQQA 3F0IA 1AQVA 3HKRA 3RPPA 1T3BA 2PMTA 2HFDA 1SL1B 2LSTA 5C00A 4OFMA 1ZMAA 2HZEA 2PPTA 4XS6A 1TTZA 3SBCA 5ECSA 1QGVA 10GSA 3G9BA 5D8IA 1YKCA 1SL2B 1PX6A 2YZUA 2LUSA 1GNWA 3EMPA 1H75A 1XIYA 2HE3A 3TKSA 5KN0A 4MK3A 4KDXA 1SU9A 2H6ZA 1M2DA 1SENA 2TIRA 1BG5A 4ZILA 1GRXA 3KM6A 5ECHB 4TN8A 3FY7A 3UIWA 4PUFC 5D9WA 3GTUA 2HSHA 2PVOC 1XW6A 2DBCA 4GWRA 1A2MA 3FZ4A 2LNTA 4GRFA 3TKRA 3Q6OA 5FT3A 4OCEA 4V2MA 3O3TA 2N5BA 1K0MA 1UVZA 5IMVA 4JBBA 3VWWA 5D96A 1TDIA 4ZBAA 2V6OA 4WEYA 2B6MA 1G7OA 4ZB9A 4IW9A 2JADA 3KH7A 1ON4A 4HDEA 5EL8A 2ZNMA 3ZTLA 1VRSD 5J3RA 2VL3A 1K0NA 2NVLA 3L9UA 1PMTA 3F9UA 2K9FA 2GSQA 2VO4A 4IELA 1Z6MA 4I6XA 4Q5QA 4POLA 1THXA 1AQWA 3TJBA 1SYXA 1SK2A 2A2RA 4WBJA 2B3SA 3I9V2 2O89A 4XRAA 3HCZA 4KSMA 3VURA 1XPVA 1TOFA 12GSA 4YAVA 1ERUA 4XHMA 1NM3A 4IN0A 5ELAA 3F8UA 4L0UA 1VF2A 5CAXA 1ERVA 6GSYA 2B7JA 4HZ4A 5IO0A 2O87A 3IBHA 2YOIA 11GSA 1V2AA 1EV9A 1T4ZA 1ERWA 4G9HA 4GF0A 4KSOA 4HEA2 2H01A 3P7XA 1DE1A 2G2QA 4F2IA 2XBQA 1ZZYA 3LXZA 3G7IA 7GSSA 2J9HA 3BCKA 3HZ4A 2YV7A 5CYYA 2HYXA 4BPYA 2XPEA 4AJ8A 2LS5A 1XOAA 5G5EA 1TJDA 1UN2A 3MSZA 3DIEA 18GSA 2VD0A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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