1FOVA

Glutaredoxin 3 from escherichia coli in the fully oxidized form
Total Genus 26
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
26
sequence length
82
structure length
82
Chain Sequence
ANVEIYTKETCPYCHRAKALLSSKGVSFQELPIDGNAAKREEMIKRSGRTTVPQIFIDAQHIGGYDDLYALDARGGLDPLLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
publication title NMR structure of oxidized glutaredoxin 3 from Escherichia coli.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAREDOXIN 3
total genus 26
structure length 82
sequence length 82
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-08-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1fovA00
4K1FA 4XS4B 3KXOA 2IMIA 5B7CA 1IYIA 4NWYA 2REMA 1K0BA 1ACVA 3W8JA 1GNWA 3HY2A 3ERWA 1PX7A 3PGTA 3RBTA 3IBHA 2LTKA 2YWMA 4PUFC 3A2WA 1FAAA 4BWQA 1HNAA 3KIJA 4WBJA 3ZZXA 2FWEA 1GSYA 5F0GA 3ZVJA 4X0XA 4I5QA 3TRPA 3J7Yk 5G30A 1XWBA 1RQMA 1XBSA 3HCZA 2O85A 3RPPA 1XW9A 2D2ZA 3VWUA 1WRYA 3GNJA 3UBKA 2X8HA 3CTGA 2JZSA 4OO5A 3KGKA 2PVOC 4N0ZA 4OFNA 2FLSA 3TDGA 3KM6A 2E7PA 2KP2A 4IQAA 2K8SA 4ZL9A 3KP9A 3WD6A 4N30A 4TR1A 5F07A 1WP0A 4N0VA 1F2EA 2OE1A 3EU4A 1LJRA 2N5BA 2O89A 3CSIA 4J2FA 3DVWA 1JLVA 3KTBA 2E2MA 5A4VA 4KAEA 3G9BA 2C3TA 2M80A 4D73A 1OAZA 3GH9A 1DE1A 2AB6A 2WS2A 2E2GA 1YF0A 1GH2A 2CVKA 1Z3EA 1GSEA 3IAM2 1XXUA 4XS6A 3QAGA 3IAS2 1G0TA 4KDYA 5JCWA 3TJKA 1O6JA 2I81A 1ILOA 3L0HA 1TI3A 3BCKA 2C1YA 4ZXGA 3F3RA 6GSXA 1XW6A 1ST9A 4Z7XA 3I9V2 3KTLA 3C1RA 5KN2A 4WF4A 2VCVA 3LYKA 2HE3A 5JWOB 2PGTA 4IS0A 1A2MA 4RQRA 1BEDA 3QCPA 2GQLA 2KLXA 1XOBA 1V2AA 2CT6A 2VLUA 1WMJA 5EVOA 2KP1A 2HSHA 2BTOT 2C0FA 2JSYA 1BX9A 2CZ2A 4HEA2 1G6WA 4K7OA 3TKPA 1FO5A 4G9HA 2GQMA 4GXZA 4KB3A 3DVXA 2YANA 3O3TA 2VCTA 3O6TA 2EIOA 3VWVA 4E8EA 3IPZA 2HT9A 2YZUA 3GURA 4KUNA 3H4KA 4BVXA 5AN1A 2PERA 5G2ZA 5JCGA 4TR1B 2JU5A 3I6AA 5JWQB 2IMKA 1SJIA 2L4QA 4XRAA 1YEXA 1JFUA 2KOKA 4O32A 4I8BA 3D6IA 1TTZA 4JEDA 3UARA 4BPYA 2WDUA 4TRXA 1USBA 4EC0A 3LGCA 3HA9A 2PVQA 4HU9A 4ILFA 3RHCA 2VUPA 4I97A 2GSSA 4IBPA 5DCHA 3DEXA 3A5WA 3Q19A 4V1Ag 5IPGA 1CQHA 1AAZA 3KMNA 4EXJA 4K6XA 5ECOB 3IC4A 3E9JB 2EIQA 3GA4A 3MNGA 3KJYA 4HZ2A 2JZRA 3NIVA 1ERVA 2RM6A 4RI6A 1XIYA 5JCUA 2VIMA 2MMOA 5ECMB 1ZL9A 4NHZA 2VAFA 1V57A 1SJZA 3UEMA 1GWCA 3F8UA 4AJ7A 1GTBA 4ECBA 5L71A 4ML6A 4FH8A 1ERWA 5F05A 2FHEA 5C00A 5INYA 2B1KA 5DJMA 3CXGA 1EGRA 1TJDA 2L6CA 3APQA 4BWSA 2P31A 3UJ1A 1E2YA 2M72A 3D21A 1FB6A 4X43A 2B5YA 3MAKA 3TKQA 1BJXA 3LYPA 1GULA 2IFQA 1Z6NA 2CV4A 4J56E 2HYXA 1T7PB 1BQ7A 3LORA 2LV3A 5IIZA 4KSMA 2WJUA 2J23A 2LQQA 3PH9A 4LA1A 4RUVA 2L59A 5LNKe 2P5QA 3LSZA 2VL3A 2YWOA 1TDIA 1K0NA 1GSDA 1OC9B 2RUFA 5D9VA 3U5RE 3VPQA 1X5DA 2LJAA 2CX3A 4F82A 3ZYWA 1YKAA 4ULXA 3V1WA 2H75A 3TRXA 2C80A 1DBYA 3MWHA 4IW9A 1NHOA 1U6TA 2AJQB 2R6KA 3TRQA 2LRCA 5HR1A 2GTUA 5DVBA 1M2BA 2C3QA 1I5GA 1NW2A 4KDXA 2AYTA 3LEFA 4Q5RA 1GUHA 1X5CA 2CVBA 3ERGA 1TK5B 1V98A 2FNOA 4TXOB 3JCML 5B6MA 1SL2B 1VGLA 3TKRA 2H1BA 2NVLA 2OE3A 4GLTA 2V6OA 2R37A 1MEKA 2LRNA 1DUGA 4KGIA 2WRTA 3FYGA 3ZVJD 1BG5A 1RK4A 3TOUA 5IMVA 4OCFA 1XW5A 2WB9A 3F3QA 2ES7A 2MMZA 2WZ9A 5IOXA 4EF0A 5CO3A 5IQYA 1GTUA 1F3AA 4PQIA 1JZWA 2NBSA 4RQXA 4GSSA 5GSTA 5GZZB 3GFKA 4DSSA 2YJHA 3WYWA 4NMUA 4HJMA 4AJ6A 5IMAA 1OYJA 1Z6MA 3PR8A 1H4OA 4CHSA 1EP8A 3S9FA 2IFQB 2VCZA 3BJ5A 3FW2A 3FEUA 4NAXA 1NM3A 2O7KA 2M46A 1C72A 3IRAA 2DIZA 1WWJA 3A3TA 4F03A 2H1AA 3UVTA 1YEPA 3KCMA 5CAXA 2H0GA 3FHKA 2F8FA 2I4AA 1XWAA 1X9SB 3D5JA 1O8XA 2YNXA 3F9UA 3IK7A 2H70A 8GSSA 3FKFA 5ECSA 3L9SA 2I1UA 2C4JA 5GSSA 4FYBA 3QPMA 1T8EB 4MJCA 2IMDA 6GSVA 1MD4A 5DBQA 5D96A 3NOFA 5D9WA 2PMTA 2H74A 1M7TA 3HD5A 1LU4A 1ZYEA 1OE7A 2GQKA 1URMA 3DYRA 1SJ6A 3C8EA 5IMZA 1EEJA 3GIXA 3BD2A 1X9WB 2WULA 3ZITA 2N5AA 5HR2A 1FVKA 4YH2A 1XOAA 3QD9A 3QFBC 3HZ4A 4F0BA 1XCCA 1NHYA 1U87A 1SL1B 1O81A 1ML6A 2H71A 2V2GA 4GSTA 3TKSE 1T1VA 1N2AA 1M2DA 4ECJA 2H0HA 4QQ7A 3D4MA 4MLYA 4MZWA 3M3MA 4KCAA 5J5NA 2X8CA 1WJKA 1TRSA 1U3IA 2CA8A 4XS1A 5HFIA 4FYUA 5IMCA 2B7JA 2FWHA 4DSSB 2NTOA 1FW1A 5CRGA 1F6MC 4I2UA 2TIRA 4E8HA 3UMAA 4TR4A 4K9ZA 1W89A 5ELAA 2RM5A 2DC5A 1HNCA 5G1LA 3N5OA 2XPEA 5HR3A 5IO2A 4EDYA 1PKZA 4V2NA 5GAND 1M99A 4TKYA 6GSTA 3ZREA 3P2AA 1GSUA 2AUVA 3TUEA 2WFCA 3EC3A 1GNEA 1K0AA 1VF2A 2KUCA 3TOTA 2DSAA 1X5EA 3RDWA 3DXBA 5ID2A 2I3YA 2YV9A 3TJBA 1I9DA 3U6VA 3M9KA 4HDEA 1HD2A 5AIXA 1GLPA 3DD3A 4XCSA 4EKZA 1YJ6A 3IE3A 2C3NA 1THXA 3D0ZA 3F4RA 1SK1A 5ECIB 3F63A 5AGYA 3TKSA 5D9TA 1JZOA 5CREA 3IDVA 2QC7A 3AY8A 1OKTA 1K3LA 3Q6OA 3Q18A 4MA9A 2DJ1A 3D22A 2H76A 4WKWA 2FGXA 4G19A 5G5FA 1QGVA 1ZOFA 1PKWA 3VURA 4KSOA 3L78A 3RAZA 1AW9A 1TW9A 1Y25A 4F2IA 1XWCA 4NV5A 2CAIA 2RUEA 4WBRD 2LKUA 3HVXA 2WGRA 3ME8A 5ECHB 3ED3A 3EMPA 5H5QA 1EOHA 1S3AA 5G5EA 1Q98A 3WGXA 4QL7A 2IL3A 4IP6A 4WETA 2DJJA 1WE0A 3VPTA 4PQHA 2CQ9A 4HZ4A 4KE3A 2XPDA 2IPAA 4I6XA 5B8AA 2R2JA 3HHVA 3R2QA 2HXKA 5E4WA 2JL4A 2VCXA 2L5OA 5DAKA 2YPMA 1PQNA 5GAPD 2IN3A 2H1GA 5KN3A 1KNGA 2JADA 5A4UA 4DSRA 3ZL5A 5ID2B 3E3EA 3ISOA 14GSA 1R7HA 3F4SA 3QMXA 4IVFA 4CDOA 4ZBBA 2H6ZA 2LQOA 1A8LA 1RW1A 1TU8A 5IM9A 5D8IA 3EMXA 4IQ1A 1V9WA 3GUSA 1EZKA 3TKSC 5HFKA 3KH9A 5CRWA 1GTAA 4MF6A 2YJ7A 3KEBA 2HZEB 4EL1A 1B9YC 4XRDA 3APSA 1OC9A 3FR9A 2YP6A 4KW6A 4WR4A 4YAVA 1R5AA 2XC2A 4MF7A 5CRDA 2PUKC 3GKMA 4HS1A 1SYRA 1X9MB 1B8XA 4EVMA 3ERFA 2HI7A 4KH7A 1A0RP 2H1DA 2XBIA 4IN0A 2HFDA 3GRXA 2MBTA 2B5EA 4NHWA 5CYYA 3LFLA 3MDKA 1A24A 3L4NA 2JSZA 1PX6A 4MH3A 1TRUA 4HI7A 1PRXA 1SD9A 3P90A 2G2QA 3CRUA 4Q5QA 4TXOA 1SL0B 3D4TA 3APOA 3BCIA 2H72A 2OBKA 2O87A 5IPHA 3F6DA 1M2AA 3SBCA 4RI7A 2OA7A 2C0DA 4IP1A 5D93A 2VL9A 3ME7A 3HJOA 2RLIA 1O8WA 2X8GA 13GSA 2B6MA 1J0FA 5DAKB 5H5SA 1X0RA 4K0NA 1MDKA 4EDZA 5B6NA 4QL9A 4OFTA 3F4TA 2GSTA 4L8EA 2AAWA 3FZ4A 3FK8A 4YQMA 1EGOA 2B5XA 1KBNA 3VI5A 3GL5A 3QAVA 5B8BA 2V41A 1B4PA 3CTFA 3EWLA 3A2VA 4HQSA 1PSQA 4TN8A 1SKRB 3FZAA 1G6YA 2MMNA 2OACA 2F3MA 1T3BA 1OC3A 1ZMAA 2VD0A 4POBA 9GSSA 3IOSA 2X64A 3UIWA 2MBSA 1S3CA 3FZ5A 2DJ3A 3CSJA 4OD7A 2K6VA 3LG6A 4Q5NA 4GF0A 3F6FA 2H6XA 12GSA 1SYXA 1F3BA 4K7IA 3K8NA 3ZTLA 4L5OA 2HSYA 4L0UA 1GSSA 2F8AA 1VF3A 1UVZA 3CBUA 5CP1A 2B1LA 4HUAA 3KH7A 1K0DA 4WXTA 2H0IA 2FD3A 2NPBA 4MPFA 3UOMA 4GTUA 1MTCA 1VF1A 2AV4A 1M0UA 3IK9A 2OBIA 3GKNA 2A4VA 1SENA 1GRXA 1UC7A 4KDUA 1F37A 4MCUA 4F9ZA 1GUMA 4O7HA 2LEGA 4ZIJA 4MP4A 1V40A 3GV1A 4LMVA 1SKSB 2FA4A 3M8NA 1UN2A 1HQOA 2VOCA 4POMA 3W8SA 2HLSA 17GSA 2K18A 3W6GA 4CW9A 4O92A 3QAWA 4MH2A 1SK0A 3GTUA 4PGTA 2WCIA 4AJ8A 2LSTA 4K2DA 4OCEA 1EV4A 4V2LA 2L5LA 1Z9HA 1O73A 5J3RA 4NXIA 1PMTA 2GLRA 3GYKA 4FIWA 2PU9C 3GMFA 4JZQA 4OWYA 3VK9A 1B4QA 4KNDA 1G7OA 5IOWA 1QMVA 2YWIA 2JZTA 1A0FA 3F0IA 2P0GA 1YQ1A 2ZUPA 1G7EA 1GLQA 1NSWA 3ZRDA 1M9BA 1OE8A 2GGTA 1FG4A 2IIYA 2L57A 2MYGA 3ZIVA 3J7Yb 3DRNA 4IJIA 2YN1A 2LJRA 5FWGA 1R26A 4KCEA 1TRVA 4MABA 1TRWA 4BL7A 4K7NA 3L9VA 5ENUA 3RPNA 3PINA 2GT5A 2CVDA 4KA0A 4MF5A 2I9HA 6GSYA 1O85A 4MMMA 3OR5A 5ECLB 4G2EA 3DKSA 1FB0A 2R3XA 1WOUA 1DSBA 3HXSA 5A4WA 5CNWA 1ERTA 1TI1A 4JR4A 2VLTA 2BMXA 3ZLPA 2YCDA 5HR0A 1BYEA 4HU7A 5IO0A 4LL1B 1VF4A 2ALBA 3DIEA 4ZL8A 4ZB9A 7GSSA 2AHEA 3GTUB 3TCOA 4JE1A 2YV7A 3IA1A 1PL1A 3UL3A 4I2TA 4GSNA 3M1GA 3CYNA 1QK8A 4L0WA 1EV9A 1SKWB 1B48A 3DWVA 2FWFA 2H8LA 2IMEA 3DGQA 6GSUA 1Q4JA 4MJEA 20GSA 3L9UA 3TJFA 5H5RA 2VL2A 5G31A 4GRFA 2GT6A 2KHPA 3VWXA 2VM1A 4TOPA 2H73A 2PPTA 2G0FA 4DEJA 1GSFA 4HOJA 2LNTA 1J9BA 1YY7A 1J08A 1FVJA 1AXDA 4MK3A 4JBBA 1TK8B 3C1SA 2A2SA 2DJ0A 2E0QA 1ABAA 3ZFBA 4WR5A 1XVQA 3WT1A 2HZEA 5DALB 4LMWA 4MJAA 2DMLA 2IWTA 4PUAA 4GQCA 3FRCA 3HYPA 2HRFA 2DJKA 4J57E 2OKAA 5D73A 4V1Ap 1EWXA 2TRCP 2V1MA 4ML1A 4ID0A 5JWRB 1AQXA 1JHBA 4GQFA 3EINA 4X1UA 2F51A 1EP7A 3EVIA 3HVSA 1THOA 2GZPA 4F0CA 4PXOA 4TR3A 2QSIA 3GSSA 2GSQA 5LD0A 3C71A 3TB2A 3N9JA 4XTSA 4ZL7A 2VO4A 5DQYA 5ECKB 2J9HA 4ECIA 1QFNA 1GUKA 2GSRA 1A23A 3HZ8A 3P7XA 16GSA 3HVVA 5HQPA 4KX4A 5J9CA 3HJMA 4ECCA 2HRNA 4GWRA 3VFIA 2H6YA 1ZGNA 3EURA 5CRHA 5C04A 3TJGA 1DE2A 2V6KA 5ECNB 2C0EA 2OADA 5IMFA 4AF2A 1T4YA 5AIVA 2YOIA 4HJ2A 3US3A 1QXHA 1IYHA 2VL2C 3P8WA 3GH6A 1ZCPA 3IV4A 2HZFA 2H01A 2FWGA 1GTIA 1M9AA 2VLVA 1EEMA 2XBQA 3QR6A 2DJ2A 2DLXA 4PX1A 1YZXA 3LXZA 3E0UA 4Q5FA 3KD0A 2VCWA 2FA8A 1VRSD 3G7YA 3ZMLA 5IMDA 5J4UA 3M0FA 1F9MA 2FY6A 3FR3A 3SWLA 4JRRA 4PURA 2VD1A 4D73B 4MDCA 1ZYQB 3H8QA 1PD21 1AQVA 1GP1A 1AIUA 6GSWA 2H30A 1KEBA 2A2RA 2K8VA 1W4VA 1TOFA 4MJBA 3WGEA 3CRTA 1R5PA 2R5GA 4OMVA 4XIHA 5G1KA 3LQ7A 2LJKA 1N8JA 2GZYA 4BA7A 4JU5A 4P3YB 4V2MA 4N11A 4PQ1A 5COHA 4H86A 2OJLA 5LCZA 5KEJA 1XVWA 1XWKA 3H93A 3EE2A 1TKDB 4POKA 4PNGA 4TW5A 1JZRA 2IJYA 4XHMA 3H79A 2NDOA 2ON5A 3BOAA 5F06A 5DJLA 2LNSA 1A2JA 3WGDA 1JZDA 1T00A 1MD3A 2LRTA 2LUSA 1SD8A 2YWNA 1LBKA 1TXXA 2DBCA 1EOGA 4TR0A 5ABRA 2ON7A 3NZNA 1T4ZA 4DVCA 2C8UA 1YKCA 1K0MA 3GHAA 3MSZA 5DCGA 4TXVA 5EPFA 2PBJA 3WT2A 3QFAC 1S3DA 4TVEA 3EYTA 1Z7RA 1GSQA 3FY7A 3KZQA 5AISA 5A5KA 5ECQB 1PGTA 1TP9A 2Z9SA 1PA3A 2X99A 5FHIA 2QKEA 3GN3A 2JACA 3CMIA 3ZFLA 2EIRA 1XWGA 1SK2A 1B9XC 2OE0A 4IHUA 2H19A 2CX4A 1FHEA 3M9JA 4FYCA 5ECRB 2L4CA 2L6DA 4N10A 1K0CA 4G10A 3GKKA 1K3YA 2GZZA 3BBYA 1QUWA 2VM2A 4YQUA 3GKXA 2ZNMA 19GSA 3C7MA 5KN1A 1H75A 1ZZYA 5DDLA 2FUG2 3I69A 2B3SA 2PWJA 1MDJA 1ON4A 2QGVA 2B7KA 2CAQA 1TK0B 3LXTA 2V32A 5EY6A 2LS5A 1PL2A 5FT3A 2XHFA 5J41A 5KN0A 1OC8A 10GSA 4DSQA 4GCIA 3GSTA 1HNBA 1FOVA 4ZBDA 3Q74A 3FR6A 4NV2A 4YQVA 3CSHA 2DMMA 4O5RA 1AUCA 11GSA 3KP8A 2FCHA 4HQZA 4MPGA 2MMAA 2PN8A 3TGZA 4LL4B 4OO4A 3IR4A 3VI7A 4NPBA 4EO3A 3ZMKA 3RHBA 1U88A 3UBLA 4L5LA 3IHQA 5F8BA 3FZ9A 2BJXA 1KTEA 3A2XA 3IXRA 4WEYA 4XS4A 5HFGA 4EUYA 2GDRA 4IELA 1TU7A 1XFLA 5DQSA 1XZOA 3GX0A 1PN9A 3DMLA 1UA5A 3KMOA 4IJ3A 1YDKA 3UVHA 1E6BA 6GSSA 1HYUA 4MZBA 1XPVA 4JR6A 2MZCA 1A8YA 4POLA 3VLNA 1QQ2A 3ZIJA 1SU9A 3QDNA 4WF5A 1OVNA 5E59A 2H66A 1V58A 1WIKA 1Z7PA 22GSA 2RIIA 2IMFA 1K3OA 2GS3A 2CZ3A 4ZB8A 4ZBAA 4ISDA 2GVPA 4MZCA 3HJPA 4FO5A 5ECPB 4PNFA 3QOUA 4OFMA 4BVYA 5J9BA 2DIYA 1BAYA 5D9XA 3TJJA 18GSA 2F9SA 5DALA 1WPIA 1AQWA 3I43A 4AGSA 4IGJA 1K0OA 1A2LA 3HDCA 2R4VA 5EL8A 3G7JA 1Z5YE 1YF1A 3VWWA 4ZILA 3H1NA 3LJRA 4YAPA 1AC1A 3O76A 2YZHA 3HKRA 1U3AA 2EC4A 4K0GA 2VCQA 4K8MA 2ZCTA 3LWAA 2P5RA 3G7IA 1R4WA 1JLWA 3C73A 1CQGA 5ELGA 3GL3A 1ERUA 1GL8A 3EU3A 2TRXA 4ZB6A 2HNLA 4ACSA 3UAPA 1OKDA 2O8VB 1Y6EA 4IKHA 4EE0A 2K9FA 2C0GA 1MDIA 4LLRA 1O7UA 2N5FA 3GX8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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