1FVJA

The 2.06 angstrom structure of the h32y mutant of the disulfide bond formation protein (dsba)
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPYCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Disulfide oxidoreductase
source organism Escherichia coli
publication title Structural analysis of three His32 mutants of DsbA: support for an electrostatic role of His32 in DsbA stability.
pubmed rcsb
molecule keywords DISULFIDE BOND FORMATION PROTEIN
total genus 66
structure length 188
sequence length 188
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1fvjA00
1EV4A 2H0GA 3I6AA 2KUCA 1BYEA 2OE1A 1OYJA 2M46A 5F07A 4XTSA 2FLSA 3G7JA 2A2RA 1PMTA 3FHKA 3C8EA 1U3AA 5ECRB 3FZ5A 2K6VA 4K0GA 4V1Ag 3U5RE 2DLXA 1T7PB 3ED3A 3UEMA 2B5YA 5IMZA 2L57A 3F4RA 4HJ2A 5IPGA 5C00A 1G6YA 1OC9B 2MMAA 2O8VB 3GL3A 3GYKA 2X99A 2IMFA 2ON5A 5EPFA 2PPTA 2WZ9A 2DJ1A 3IHQA 6GSVA 1H4OA 1X9SB 3KH9A 2YWMA 5KN0A 1MD4A 3FK8A 2VO4A 2CZ2A 1IYHA 2EIQA 4NHWA 1GWCA 2IJYA 1EEMA 4KB3A 1B4QA 4IN0A 4L8EA 1X5EA 4MZCA 2C0DA 2VCTA 1YJ6A 4XHMA 2B7KA 2FCHA 4K7NA 4TW5A 2BJXA 1Z5YE 3EE2A 1E6BA 4NAXA 1ZL9A 5ECOB 2LTKA 4ZL7A 2WCIA 3CSJA 5DAKA 1XWGA 1GSFA 1GTUA 1NHYA 2VCQA 3MSZA 3QAWA 1F6MC 4YAPA 1V2AA 1WIKA 2JSZA 2CZ3A 4EVMA 5D9TA 3APSA 1XW9A 3FYGA 3VWUA 1GTIA 3RPPA 4HS1A 2QKEA 4K9ZA 4BA7A 2IMDA 3EYTA 4F9ZA 1TW9A 1PSQA 4IVFA 2DC5A 3F8UA 2XBIA 4G9HA 4F0CA 3EMXA 6GSXA 2R2JA 1UA5A 2C0EA 3KIJA 2CAQA 1JZWA 4K2DA 3HCZA 2L4QA 3BCKA 1XVQA 4J56E 1TK5B 2CX3A 3HVVA 3KH7A 3KXOA 2DMMA 3EVIA 1NM3A 1EEJA 3LSZA 4E8EA 2CAIA 3J7Yk 8GSSA 1WOUA 3DYRA 3HXSA 1T4YA 2C4JA 4TN8A 4GSSA 2GS3A 3F63A 3WD6A 2FWEA 3VI7A 2YNXA 2C3NA 1TK8B 2XC2A 4DEJA 3UOMA 4JR6A 1XWAA 2OKAA 4ZXGA 3IC4A 1DBYA 3GMFA 4MH2A 4MDCA 2DBCA 1U3IA 5HFIA 4OO5A 4ECJA 2TIRA 5ID2A 3IE3A 3HD5A 2HLSA 2LJRA 2LQQA 3P2AA 5JCGA 3IPZA 5ECQB 4BWSA 4MZBA 2PU9C 1Z9HA 4MPFA 4CW9A 1BQ7A 4PQ1A 4IGJA 2LS5A 5F0GA 3KTLA 1EZKA 4MF6A 1JZRA 4OFTA 1RK4A 3QDNA 4PQHA 3TJGA 5GAPD 1TU7A 1G7EA 5GSSA 1FO5A 3I9V2 4GCIA 4F03A 2H1DA 1M0UA 5DAKB 1BEDA 2IMKA 4XS4A 3G7IA 1GLPA 2CVBA 2KHPA 1K0DA 2C3QA 2B1LA 4D73A 3M8NA 1ZGNA 1RW1A 2H1GA 2OBIA 1YZXA 4RQXA 4TR0A 2I4AA 4HU7A 2OE3A 4P3YB 2LRNA 16GSA 19GSA 3APOA 1ERUA 4ZIJA 2GZYA 2GSTA 4YAVA 4HDEA 2FHEA 3US3A 2X64A 2WJUA 4HEA2 4KW6A 5CNWA 4TR1A 2V32A 2XPEA 4F0BA 2LKUA 2HT9A 1XWCA 1GULA 2OACA 1B4PA 1X9MB 2E2GA 5IO0A 4IJ3A 4ISDA 1V9WA 4I6XA 4HUAA 5DBQA 4L0WA 4XRDA 1F37A 4XS6A 2BTOT 3IK7A 1YKAA 5JWQB 3FW2A 1TRUA 4WEYA 1UC7A 5D96A 5AN1A 4GQCA 3GL5A 3ZITA 3UAPA 1Q98A 1UVZA 3ZFBA 2O87A 4H86A 3TRQA 5HR0A 3AY8A 1LJRA 1I9DA 1TKDB 1PGTA 4N0ZA 1ACVA 2LUSA 2G2QA 2IPAA 1OAZA 2I9HA 2RM6A 3A2VA 2JZSA 3QPMA 2C8UA 2WRTA 2H6XA 3GFKA 4O7HA 4F2IA 3ZMKA 4GSNA 5ABRA 5L71A 2V1MA 5DJLA 3FRCA 3ZIJA 5B7CA 4PNFA 2JL4A 4WF4A 3E9JB 5DDLA 5ECKB 2C0FA 2JACA 2E7PA 1B9YC 1ERWA 4HU9A 3DVXA 5A5KA 4X0XA 4XS1A 4IKHA 2CA8A 1A2JA 2VL2A 1SYRA 1EOHA 1A8LA 4HJMA 1MEKA 2C1YA 2H76A 4ID0A 3O6TA 4YQUA 4K1FA 2C0GA 2HE3A 1R7HA 1PD21 4OFMA 4MZWA 2AAWA 4ECBA 2PBJA 4OMVA 2MMNA 2P5QA 2Z9SA 2FA4A 1ST9A 2VUPA 2LQOA 3TKRA 4AGSA 4MMMA 4ML1A 2H73A 2CT6A 3CSIA 1PA3A 3BCIA 3VI5A 4XS4B 1DUGA 3HA9A 1KEBA 1JZDA 4D73B 3TKSC 4PNGA 5B8AA 1R5AA 2YZHA 3QFAC 1I5GA 3UVTA 2LV3A 2VAFA 2VCZA 3M9KA 1QK8A 2O89A 4HZ4A 3A2WA 3IXRA 5G2ZA 3DEXA 3GX0A 4POMA 3P8WA 1HQOA 1V58A 3PR8A 2LJAA 3KCMA 5IO2A 4PX1A 4TR1B 3ZTLA 3MWHA 3DWVA 2REMA 2H30A 4L0UA 3IR4A 4Q5QA 1F3AA 5ELGA 3UBKA 1VF4A 5D93A 3VWVA 2QSIA 4J2FA 1O81A 1ML6A 3HKRA 3D4MA 3FY7A 3SWLA 2VL3A 4MJBA 3VURA 3M1GA 5DALA 6GSWA 4I5QA 3D0ZA 4KSOA 1CQHA 4LMVA 3SBCA 1YY7A 3I43A 1VF2A 3E3EA 3L4NA 5ENUA 1XCCA 4AJ8A 4IQ1A 2CQ9A 4NPBA 4KX4A 2P31A 1YF0A 1A23A 4GTUA 1AC1A 3LGCA 1PX7A 1SK0A 2MYGA 4AF2A 1PKZA 1F3BA 3HDCA 4EKZA 4KGIA 5B8BA 3CXGA 3UVHA 1W89A 3H93A 4PUAA 4G19A 4MJEA 14GSA 4XIHA 2HSYA 1K0OA 5G5EA 3QMXA 1B8XA 4K7OA 2D2ZA 4IP6A 4IBPA 2FWHA 3DXBA 4OD7A 5CRDA 1V40A 4PXOA 1PL2A 4POBA 1Z7RA 4V1Ap 2VIMA 3EURA 2BMXA 5H5QA 2YPMA 1R4WA 2N5AA 1DSBA 2IWTA 3O3TA 2YANA 3Q18A 4POLA 3PH9A 4TXOA 4NXIA 2LRTA 1BJXA 3F0IA 1TRVA 4RI7A 3VLNA 2NBSA 3LWAA 5IMAA 1AW9A 2WULA 4KE3A 3ZVJA 1SYXA 4TKYA 3HJMA 1K3YA 2B5XA 4ZB6A 2MZCA 2YV9A 2H1AA 2VLUA 4BVXA 4X43A 1GRXA 2CX4A 2L6DA 5CP1A 1GNEA 1K0AA 3DIEA 3DRNA 2L6CA 1MD3A 1K3LA 1TRSA 3Q19A 1G0TA 1WWJA 2VL9A 3RBTA 5A4VA 3UIWA 4XCSA 4FH8A 3J7Yb 1EV9A 3F9UA 1U87A 2O85A 1B9XC 5EVOA 3GH6A 5IMFA 3WT1A 1QGVA 3UMAA 4NV2A 1DE1A 4WF5A 3H1NA 3FZAA 3GH9A 2HZEB 2VL2C 3FZ9A 1O8XA 5FT3A 3ERGA 4I2UA 4ZB9A 4DSSA 4GQFA 4MPGA 2LEGA 1HYUA 3C1RA 4OFNA 3R2QA 1QMVA 3CTFA 2ZNMA 5DALB 2HSHA 3QOUA 2B6MA 3TKQA 2N5BA 2HFDA 5DCGA 3TKSA 2C80A 4LLRA 5LD0A 3KTBA 4JU5A 1M2DA 2XPDA 2C3TA 5G1KA 1O73A 3GA4A 4KUNA 1PL1A 1SL2B 2VM1A 20GSA 9GSSA 2H74A 1TK0B 4HI7A 2EC4A 1JZOA 4J57E 4AJ7A 13GSA 4LA1A 1FVJA 3FZ4A 2L4CA 2H19A 3EMPA 1ZOFA 1AAZA 4GF0A 4IELA 4RQRA 4KCEA 2PN8A 2EIRA 4K8MA 3CMIA 2I3YA 2GQLA 2TRCP 2FUG2 3L78A 3L9SA 5ECNB 2NTOA 3V1WA 2JU5A 2AJQB 2R6KA 2LRCA 4O5RA 4F82A 2KLXA 1X0RA 4V2NA 5CO3A 3IV4A 3RAZA 3APQA 3WYWA 2ES7A 3BBYA 1FG4A 4QL7A 2DIZA 5HQPA 3L0HA 4L5OA 2E0QA 4ZL8A 4OWYA 4ECCA 3HY2A 2MBTA 1WPIA 1CQGA 2I81A 3GTUA 3GSSA 2X8GA 3TRXA 1M2BA 2LNSA 5CRGA 3N9JA 3TCOA 3TJJA 1HNBA 1NHOA 2H6ZA 4EO3A 4ULXA 2CV4A 3LJRA 1C72A 4MLYA 3LYPA 1ZYQB 3QAGA 1THXA 1SKSB 4WXTA 17GSA 2HNLA 1HNCA 5C04A 3GUSA 4ZL9A 1E2YA 4EL1A 1PRXA 2YWNA 3H79A 3EU3A 4FYUA 5H5RA 1TJDA 3LG6A 4TVEA 3ERFA 1ERTA 3ME8A 4DSSB 4PQIA 5FHIA 3CRUA 1EWXA 2HZFA 4EE0A 4K6XA 5B6MA 1YQ1A 1ERVA 5IOXA 3PGTA 3ZL5A 5J9BA 3GKKA 4EUYA 1QXHA 4OCEA 2GZPA 2GZZA 2WDUA 3WGXA 1XVWA 2L5LA 1V98A 1VF3A 1FB6A 4O32A 1ZMAA 2DJKA 3RPNA 1TU8A 2X8CA 5IMCA 3LFLA 1AIUA 5E59A 1A2LA 1XW6A 5FWGA 1FB0A 2RIIA 2DIYA 1JHBA 2B7JA 1O6JA 3RHBA 2WS2A 5KN2A 4BVYA 3QAVA 2H72A 2A2SA 4N11A 2V41A 4G10A 4IP1A 3GKNA 1SD9A 3LYKA 2ALBA 5G1LA 1TI1A 2K9FA 3M9JA 1GP1A 3TGZA 12GSA 3IK9A 1K0MA 1J9BA 1FVKA 2H70A 4NV5A 5ID2B 2IMEA 1T8EB 4ZBBA 2YWOA 3ME7A 5D73A 1KNGA 3F4SA 1OC3A 1ABAA 1OE8A 2H75A 5J4UA 1XPVA 2GDRA 5DVBA 1J0FA 1OC9A 1SD8A 3GX8A 5IM9A 2GGTA 2JZTA 5DQSA 3CBUA 5HR3A 1PN9A 2IN3A 5J41A 3IBHA 4HQZA 5COHA 3P7XA 3N5OA 1YEPA 2KOKA 2VCVA 3W8SA 2FWFA 4KSMA 1O85A 1M2AA 1A0RP 2DSAA 5J3RA 2HRNA 1T4ZA 5ECIB 1X5CA 2ZUPA 4I8BA 5ECMB 1NSWA 3LORA 1AQXA 1XWKA 5B6NA 2R4VA 2VCXA 2YV7A 1TI3A 2J9HA 3IA1A 1F9MA 4ZBAA 3ZLPA 4WBJA 3F6DA 2NDOA 2FA8A 2OE0A 3UARA 1LBKA 3TJFA 1Z7PA 2VOCA 2B3SA 3HZ8A 1FHEA 3RDWA 2IMIA 1RQMA 4JZQA 5G31A 1OVNA 4BPYA 1XZOA 4MA9A 3RHCA 1UN2A 4EDZA 2MMZA 1ZZYA 4KCAA 1N8JA 2PVQA 2K8VA 2V6OA 4I2TA 2F8AA 2H0IA 4WKWA 4O92A 4N0VA 4IW9A 3IAS2 5HFKA 5F06A 4DVCA 1WP0A 1Y25A 2EIOA 2GQMA 4ECIA 3DVWA 1PX6A 2L5OA 2F3MA 4JR4A 3OR5A 5IOWA 1ZCPA 2LSTA 3C73A 1GTBA 3GNJA 4X1UA 1K0CA 2V6KA 4HQSA 3JCML 1F2EA 3FR3A 2ON7A 1SK1A 2FNOA 3TRPA 6GSYA 4JE1A 3CYNA 1O8WA 4YH2A 1S3AA 1XBSA 2PWJA 2VM2A 3G7YA 4XRAA 4OO4A 3QCPA 4TR4A 1K3OA 5IPHA 5DJMA 1NW2A 2HRFA 2F8FA 4V2LA 1AQWA 4KDYA 4N30A 4CDOA 1O7UA 3ZVJD 3EINA 3UJ1A 3KD0A 3D6IA 1XOAA 2QGVA 3VFIA 3Q6OA 3EU4A 2K18A 3TOUA 3KJYA 2MBSA 4CHSA 1SU9A 3FR6A 2R5GA 2VLTA 2JSYA 3H8QA 1MTCA 3D22A 1AQVA 3C7MA 3IDVA 5KN1A 4NMUA 4WR5A 1A0FA 1GSEA 2GSSA 5D8IA 2JADA 2RLIA 4GRFA 3ZRDA 4KDXA 3KP8A 1FAAA 1GSUA 5AISA 2XHFA 4Q5FA 4OCFA 1PQNA 1TDIA 1GL8A 3L9VA 3E0UA 2GTUA 2YJHA 3ISOA 1HD2A 5E4WA 3ZZXA 1WRYA 1KBNA 5ECSA 1BX9A 2DMLA 3KP9A 4Q5RA 1X9WB 5G5FA 1ZYEA 4K0NA 5CAXA 4TOPA 2PUKC 3KMOA 4MP4A 2H8LA 2H1BA 1XWBA 5H5SA 2N5FA 3F6FA 1XFLA 3C71A 4MK3A 2DJ3A 1K0BA 1W4VA 2IIYA 1VRSD 3F4TA 3ZYWA 2HI7A 5JCWA 3VK9A 3WGEA 2DJ2A 2H0HA 3HVXA 2OA7A 1PKWA 1OKTA 1IYIA 4K7IA 5EL8A 4JBBA 3I69A 1V57A 2OJLA 1SJIA 2AHEA 4MCUA 5LNKe 2KP2A 2YWIA 2PGTA 5DQYA 2RUFA 1BAYA 2JZRA 1Q4JA 5GAND 1VGLA 4LL4B 3HJPA 2LJKA 2HXKA 4FO5A 2B1KA 2F51A 4NHZA 1YEXA 3K8NA 1GTAA 3NIVA 4EF0A 4ZBDA 1AUCA 1OE7A 3F3QA 1M99A 2G0FA 3G9BA 1J08A 1A8YA 3DKSA 1QUWA 2DJJA 3LQ7A 3P90A 5CYYA 2HYXA 1WE0A 3HVSA 3ZMLA 2FWGA 3GIXA 2YP6A 4GLTA 1XXUA 2GT5A 4MABA 4HZ2A 3KM6A 6GSTA 1KTEA 5A4UA 10GSA 1DE2A 4E8HA 3BD2A 1R26A 2QC7A 3KMNA 2H01A 4KNDA 5AIVA 5J9CA 1GSYA 1SL0B 1JLWA 2PERA 2VD0A 3F3RA 2DJ0A 2VD1A 2AV4A 3HZ4A 3VPTA 4DSQA 1GNWA 2GVPA 3UBLA 4WETA 4TXOB 3QR6A 2LNTA 3GN3A 3LEFA 2RM5A 1GSQA 1TP9A 3TJBA 4BWQA 2WFCA 5F05A 5D9WA 2CVKA 1T3BA 1QFNA 3A5WA 4KAEA 2A4VA 1SKRB 4QQ7A 3TJKA 4EXJA 4KH7A 2WB9A 3DGQA 1SK2A 4IJIA 3O76A 2NVLA 2H66A 4BL7A 2GT6A 5G30A 6GSUA 5IMVA 2IL3A 4PURA 2H6YA 5IMDA 4PGTA 1MDKA 3DMLA 3U6VA 4GXZA 2AUVA 1GH2A 3CRTA 3D4TA 2AB6A 4ILFA 2GLRA 11GSA 1FOVA 5JCUA 1LU4A 2YZUA 2TRXA 2E2MA 3ERWA 2CVDA 2X8HA 3GURA 1MDJA 3TUEA 5AIXA 22GSA 1X5DA 6GSSA 1SL1B 4IQAA 3D21A 1M7TA 1Z6NA 2M80A 3WT2A 4DSRA 1EOGA 2M72A 4YQMA 4AJ6A 4ZILA 3CSHA 2OBKA 4JRRA 4IS0A 4TRXA 4FIWA 1MDIA 3TB2A 1QQ2A 3CTGA 2KP1A 3DD3A 5KN3A 3W8JA 2WGRA 4GWRA 2B5EA 1TRWA 2PVOC 5ECPB 1B48A 2GQKA 1H75A 5DCHA 3A2XA 4HOJA 4JEDA 1GUMA 3GHAA 7GSSA 4MH3A 4FYCA 1USBA 2XBQA 1BG5A 4G2EA 3ZREA 3TOTA 3LXTA 1HNAA 1S3CA 2AYTA 2VCWA 3WGDA 1TTZA 3HJOA 5IQYA 4I97A 5HFGA 5HR2A 1GSSA 1R5PA 2R3XA 5A4WA 5D9VA 2L59A 3TDGA 4MF5A 3NZNA 5JWRB 4TR3A 1M9AA 2YCDA 1G7OA 1N2AA 18GSA 1GSDA 3IOSA 4NWYA 1GLQA 3EWLA 4Q5NA 2VLVA 2YOIA 5GSTA 2NPBA 1GUHA 4POKA 4MF7A 5AGYA 2IFQA 2P5RA 2PMTA 4FYBA 1THOA 2I1UA 4RUVA 1TOFA 1FW1A 1Y6EA 1AXDA 2ZCTA 2K8SA 3FKFA 3W6GA 3GSTA 5INYA 1EP8A 1G6WA 3MAKA 1A24A 5CREA 2J23A 1OKDA 5D9XA 3VPQA 2V2GA 5ELAA 3TKPA 3C1SA 1YDKA 1U6TA 4N10A 1SJZA 2FD3A 4KDUA 1S3DA 3IAM2 2O7KA 3VWWA 3QD9A 3MDKA 2H71A 3M3MA 1SJ6A 2MMOA 4ACSA 2P0GA 1SENA 1T1VA 1T00A 5EY6A 3Q74A 2FY6A 3GTUB 3TKSE 3FEUA 3GRXA 4ML6A 5JWOB 1XIYA 3QFBC 5J5NA 1ILOA 3ZFLA 2FGXA 4TXVA 3VWXA 3EC3A 2YN1A 5CRHA 5F8BA 3MNGA 5ECLB 3M0FA 1ON4A 3KEBA 1EGRA 2OADA 5ECHB 1Z6MA 3HYPA 4PUFC 3GV1A 2YJ7A 3BJ5A 1Z3EA 2GSRA 3NOFA 1VF1A 3GKXA 3GKMA 4LL1B 1A2MA 4LMWA 1EP7A 1YF1A 4WR4A 3UL3A 3D5JA 4V2MA 3KZQA 1EGOA 1OC8A 4EC0A 1JFUA 1XOBA 2RUEA 4MJCA 4EDYA 1SKWB 4IHUA 3L9UA 3S9FA 2GSQA 1K0NA 4WBRD 5IIZA 4L5LA 3KGKA 5CRWA 3LXZA 3PINA 4GSTA 3A3TA 1GUKA 2F9SA 4Z7XA 2HZEA 3ZIVA 4RI6A 5HR1A 5KEJA 1YKCA 3FR9A 1URMA 1U88A 3IRAA 1M9BA 1TXXA 4QL9A 5GZZB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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