1GH2A

Crystal structure of the catalytic domain of a new human thioredoxin-like protein
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
VGVKPVGSDPDFQPELSGAGSRLAVVKFTMRGCGPCLRIAPAFSSMSNKYPQAVFLEVDVHQCQGTAATNNISATPTFQFFRNKVRIDQYQGADAVGLEEKIKQHLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of the catalytic domain of a human thioredoxin-like protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN-LIKE PROTEIN
total genus 35
structure length 107
sequence length 107
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-11-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1gh2A00
5EL8A 4BWSA 2N5BA 3TOUA 1K0CA 3NIVA 1CQHA 2OJLA 7GSSA 2DLXA 2HSYA 1EWXA 3HY2A 3D6IA 3TRQA 5COHA 1OE8A 2QC7A 3WT1A 1SENA 3ZITA 3I6AA 3LYPA 1YF1A 3ZVJD 5B6NA 4DSSB 2KP2A 4I5QA 4TKYA 1A0RP 4MPGA 3BOAA 3FY7A 2XC2A 4YQUA 2WDUA 3CXGA 5CO3A 1WE0A 5CRHA 2B1LA 2R37A 1EOHA 1B48A 2HNLA 2P31A 3I43A 3VURA 1WRYA 3L9UA 2PWJA 4RI6A 1IYIA 4KH7A 2VCTA 1USBA 3KGKA 2KOKA 3W8JA 3APOA 3N5OA 4IP6A 2P5RA 2JZSA 4WR4A 2A2SA 6GSTA 3CSHA 3O3TA 4I97A 1GSFA 1LJRA 3ZVJA 2NBSA 4HQSA 3NZNA 4X0XA 4AJ6A 4K6XA 5D9TA 2V6OA 4MJCA 4QQ7A 1SL2B 1T8EB 2FD3A 3GH6A 4O7HA 2K18A 2L4CA 2H8LA 3D4MA 1O8WA 1X9WB 5FT3A 2OA7A 3GN3A 3H1NA 1T3BA 3PINA 1TJDA 2LEGA 3ZFBA 3HD5A 3EE2A 4GQCA 5KN0A 1TOFA 4DSRA 1AXDA 4JE1A 2CVDA 1A0FA 2V6KA 2TRXA 4L0WA 1K0OA 4BVYA 4YAPA 1S3AA 3QR6A 4BA7A 3D4TA 5F06A 5IMZA 4F2IA 3IK9A 3EVIA 5CREA 1GTIA 4ECCA 4KB3A 1SYXA 3ZL5A 1Z5YE 3GHAA 4K7NA 2H70A 3ZFLA 2PUKC 4V2NA 3KMNA 4AJ7A 2GSRA 2L6CA 4KDYA 4K9ZA 1NSWA 2WCIA 4EE0A 5A4VA 19GSA 2QSIA 3LEFA 1T4ZA 2DMMA 2H75A 1YJ6A 2VCXA 4ZL8A 5JWRB 2R2JA 1XXUA 2OACA 1QGVA 1ZCPA 2VLTA 4CW9A 1SKSB 2BJXA 4QL9A 2IFQA 2HRFA 2WJUA 3PGTA 3GSSA 1UA5A 4KSMA 3CBUA 2GQLA 3VWXA 4TXVA 1GWCA 3IE3A 1X9SB 13GSA 2MBTA 1FHEA 2GZZA 2WGRA 2H0GA 3WT2A 4ECBA 1SL0B 1WIKA 2NPBA 5G31A 1RQMA 4K0NA 4ZXGA 3KP9A 4WBRD 3TKSE 4JBBA 4TN8A 4MLYA 3ZLPA 2LNTA 4MF6A 4OWYA 1BQ7A 4EUYA 3RAZA 2EIOA 1GL8A 3GKNA 4Q5FA 1ZZYA 4XS4A 4G19A 1ZYEA 1JZWA 3FZ4A 2YNXA 2GQMA 3GTUB 2PPTA 3ZMLA 2CX3A 4JRRA 2K8SA 3LXTA 5IMDA 1O6JA 3A3TA 1WP0A 5IMFA 2AJQB 2F51A 4PQHA 9GSSA 2P0GA 4J2FA 3C1RA 4D73A 1FVJA 3Q74A 1F3BA 3TOTA 5ECSA 4V2MA 4OCEA 2M46A 3CSIA 5DQSA 4WEYA 2JU5A 3CRUA 2H71A 3L0HA 1R7HA 2WS2A 4HU7A 2H1BA 11GSA 3LYKA 2HT9A 4OFNA 3FR6A 2IMDA 1MD4A 1G6WA 2O89A 3DXBA 2GZPA 1W4VA 2ZNMA 4E8HA 3WYWA 4ZB8A 5ID2A 1X9MB 3A2WA 3G7JA 4PNGA 1GLQA 1GTBA 2BMXA 5JWQB 4ZBDA 4K8MA 4PNFA 1EZKA 1SL1B 1QMVA 1V57A 1J9BA 3IC4A 4PUAA 1TRWA 5DDLA 4TR0A 5G1KA 4G9HA 5HFIA 3WGXA 2VD1A 1AQXA 5DALB 4ZILA 2KP1A 1DE2A 3VK9A 3UIWA 1R5PA 5F07A 3LG6A 5D73A 1I5GA 3E9JB 5KEJA 4K2DA 2CX4A 2FWFA 3HA9A 3GX8A 2I9HA 1S3CA 3HZ8A 3W8SA 2B7JA 4TR3A 4GWRA 3PR8A 1ERWA 2B5EA 5ECRB 1QQ2A 3G7YA 4TVEA 5HR0A 1K0BA 2E7PA 2Z9SA 1XFLA 3C8EA 4JU5A 2V2GA 3UBLA 2GQKA 2PBJA 5A4WA 2LRNA 3APQA 4TR1A 3VWVA 3EURA 5D9VA 2GDRA 2HE3A 3QFBC 3W6GA 3UVTA 2GSQA 2DJ2A 4KNDA 4OO5A 3M8NA 1G6YA 3TKPA 2P5QA 2AUVA 3ERWA 3GV1A 3ZREA 4HQZA 1JZRA 4JR4A 1AUCA 4IELA 3HJOA 4IQAA 3QFAC 2VCZA 1WOUA 1ZYQB 1YKAA 1R4WA 3EC3A 2VLVA 2PU9C 3APSA 3FK8A 4G2EA 1X5EA 2K6VA 2DJJA 3DWVA 1AIUA 3VI5A 4LLRA 1K3OA 2H01A 1K3LA 4YAVA 3GNJA 1RK4A 2CVBA 2CVKA 4XRDA 1JHBA 2YP6A 2VL9A 1V58A 5J9BA 4ZL7A 3S9FA 5D96A 3QMXA 1QXHA 3N9JA 2C0FA 3DIEA 4ML1A 1ZOFA 4AGSA 4I2UA 5ELGA 1TK0B 2H74A 4MABA 2CV4A 4KE3A 4I2TA 3TJGA 5ECNB 4TW5A 4TXOB 1YF0A 2X8CA 2TIRA 2F9SA 1VF2A 5GSSA 2NDOA 4IJIA 1YEXA 3HCZA 5ECHB 1TP9A 2OKAA 1FO5A 4NHWA 2VCQA 3D22A 2H0HA 3GURA 2B1KA 1A24A 3VPQA 1PSQA 4H86A 3F3QA 3D21A 3ZTLA 3A2VA 4OMVA 2IIYA 1SKRB 1HNAA 3UMAA 1EP8A 4Z7XA 1XW6A 4KAEA 4NAXA 1SJIA 3EWLA 5JCWA 1H75A 2X64A 2YPMA 5B6MA 3TGZA 3UARA 2X8GA 4MZCA 4POBA 2E0QA 4N0VA 2AAWA 3CTGA 2E2MA 1GSDA 2YANA 2R3XA 3ZRDA 5H5QA 2DJ0A 1NHYA 5IOWA 3FZAA 4ML6A 2B6MA 4F0CA 3HDCA 1IYHA 3LFLA 5DVBA 4ZBAA 4OFTA 4KGIA 1O85A 2FUG2 1A23A 2PN8A 1HQOA 3TKSC 4GLTA 1N8JA 4NMUA 1M9AA 3KXOA 2LRCA 1HNCA 1MDIA 3UAPA 3DRNA 4ECJA 1OVNA 5B7CA 1THXA 1H4OA 1X0RA 1KEBA 2DJKA 1HNBA 1F37A 2QKEA 3F8UA 1TRUA 3QAWA 2CZ3A 2B5XA 3GA4A 3CTFA 5ECQB 2IJYA 4MDCA 2DSAA 3LORA 3GSTA 1E2YA 3LGCA 4PQ1A 4YH2A 4POKA 2ON7A 3MDKA 4MA9A 1VRSD 3OR5A 1UC7A 1PA3A 3QD9A 3KZQA 1ST9A 5CNWA 4IS0A 3TB2A 5HR1A 3TJKA 4KCEA 3KCMA 1G0TA 1YQ1A 3GKMA 1AW9A 5ECMB 2L57A 1PL2A 2MZCA 1SD8A 1ZL9A 3P7XA 4NWYA 2FA8A 2XBIA 2LV3A 3KH7A 4KW6A 3IV4A 1Z7RA 3F63A 5A5KA 2HZFA 1MDJA 3HXSA 1B4QA 1Q98A 3M1GA 3A2XA 4WXTA 2GSSA 1SYRA 4RI7A 4XS4B 5LNKe 2J9HA 3FKFA 2ON5A 2LJAA 3FW2A 3RHBA 3MSZA 4NHZA 4DSQA 1E6BA 2IWTA 4ACSA 5HQPA 2L4QA 4KDXA 2L59A 3IRAA 1GSQA 1TI3A 4TR4A 4F9ZA 1ABAA 2VCWA 4D73B 4NV2A 3L4NA 3FHKA 3ME7A 5AIXA 4DEJA 1A8YA 2AHEA 3KTLA 2F8AA 1U3AA 3MWHA 1SK2A 1XWBA 2YCDA 2MMZA 3O76A 2K9FA 4IVFA 2VLUA 4I8BA 3TKSA 5JWOB 2LNSA 1SK0A 2YWNA 1PRXA 2JSZA 4HOJA 5JCUA 4L0UA 1GSSA 2VL3A 4IKHA 3WD6A 4K7IA 1OKDA 1B9YC 1U3IA 2FCHA 1WJKA 4OFMA 3ZZXA 4XHMA 1THOA 2RIIA 3F6DA 1KNGA 2C3NA 3VI7A 5D9XA 2HZEA 3HJMA 1J08A 2C3QA 5ECLB 1EV4A 3DMLA 2BTOT 3ERFA 3LQ7A 3TRXA 3H8QA 1BJXA 1DUGA 5H5SA 3CMIA 1EOGA 2EIQA 2H72A 3HZ4A 3M9JA 4GTUA 4GSSA 5CYYA 6GSXA 3L9VA 3SWLA 4ISDA 2DBCA 2R4VA 3GFKA 4N0ZA 2X8HA 1G7OA 1SJ6A 4IHUA 3NOFA 2GLRA 1GULA 3FR3A 3CRTA 1MDKA 2LS5A 3HKRA 2IL3A 1GSUA 3C7MA 2V32A 3IXRA 4EKZA 3KD0A 5F0GA 2ZUPA 1V2AA 2H0IA 3BJ5A 2JL4A 1JFUA 2KUCA 2C80A 3KP8A 2I81A 4X43A 5IOXA 1M9BA 2FWGA 4TR1B 3QAGA 3LJRA 2GTUA 4MP4A 1DE1A 1F6MC 2WB9A 5D9WA 2RLIA 2E2GA 20GSA 2H6ZA 3VWWA 1XW5A 1EGRA 4PURA 3J7Yk 2HFDA 3TDGA 3HYPA 1FB6A 1I9DA 1BG5A 3KH9A 3VPTA 1SD9A 4X1UA 2PVQA 2KHPA 4ZBBA 3VWUA 1XWAA 5HFGA 1XIYA 4ID0A 5EY6A 2YZUA 3Q18A 2JZRA 3L9SA 4GF0A 4HU9A 1ACVA 4FIWA 5KN3A 2YV7A 1GTAA 4OO4A 5IIZA 2VCVA 4O5RA 4RQXA 5DBQA 4BVXA 4BL7A 2C8UA 2IMIA 4KCAA 1SKWB 4V2LA 3UOMA 2VM1A 1GUKA 2FWHA 3U6VA 4EC0A 4NV5A 2YV9A 1O81A 4MJEA 5AISA 2AB6A 1A2JA 4MK3A 1F2EA 3Q19A 4FYBA 2GGTA 1Z9HA 1KBNA 4LL4B 2FLSA 2R6KA 1VF1A 3GTUA 3IR4A 1NHOA 2YJHA 3IHQA 4I6XA 2FNOA 4GRFA 6GSUA 1BX9A 3C71A 4KA0A 1VGLA 1WWJA 1NM3A 1EEMA 1U88A 4MPFA 1TKDB 3J7Yb 1OC9A 4IW9A 1W89A 3F4RA 2O7KA 1OKTA 5DCGA 1M2AA 2RM6A 3I69A 4E8EA 3BD2A 1U87A 2KLXA 3TCOA 1YDKA 3KJYA 17GSA 4P3YB 1O7UA 1Z6NA 2LJRA 3IAS2 4XRAA 2OE1A 3G9BA 3RPNA 2DIZA 4GSNA 1MTCA 3IOSA 3WGEA 1G7EA 3ZMKA 4L8EA 1GRXA 4FH8A 3UEMA 5AGYA 5IMVA 2GS3A 1TU7A 2HI7A 2REMA 5F05A 3GH9A 3FR9A 5IM9A 3GRXA 3IAM2 3GKXA 3V1WA 4GQFA 4N30A 3TRPA 2H1DA 2M72A 1PX6A 5DCHA 4HZ4A 4EF0A 2LJKA 4MF5A 5J4UA 1Y6EA 5DAKA 2H1AA 2G2QA 2RUEA 1HYUA 3GYKA 3WGDA 2ES7A 1Z3EA 1SJZA 4Q5QA 1A2LA 1TRSA 4ZB6A 2CAIA 3RPPA 5KN1A 2YWMA 4AF2A 1X5DA 3QAVA 2MMAA 2MYGA 1ERTA 2FWEA 2PMTA 2FA4A 4MJAA 2H1GA 1K0AA 4EXJA 1XVQA 5D8IA 3UVHA 2M80A 14GSA 1ZMAA 1AQVA 4QL7A 1B4PA 5B8AA 5IPGA 3SBCA 1JLWA 4CDOA 5CP1A 3HVVA 4YQVA 2EC4A 4K1FA 1XOAA 1XPVA 2H19A 4O92A 3C1SA 3DVXA 4XCSA 1Z6MA 2H6XA 3VFIA 5J5NA 1U6TA 1OYJA 2YOIA 2C4JA 1Q4JA 1KTEA 1F3AA 3IA1A 3M9KA 1EP7A 4KX4A 2HRNA 2I4AA 1XBSA 4NPBA 3GL3A 3DD3A 2MMNA 3H4KA 3FEUA 1OC8A 5C04A 4WETA 1EEJA 3QOUA 5J41A 3UBKA 2AV4A 3R2QA 4WBJA 3IDVA 1XW9A 5A4UA 1V98A 1FB0A 4WKWA 2GT6A 4BWQA 1PGTA 2C0GA 2JACA 2O85A 5H5RA 1CQGA 3IBHA 4ECIA 1SK1A 4MZBA 5FWGA 2R5GA 2X99A 2YZHA 3BCIA 2EIRA 3BBYA 2A4VA 1JZOA 3AY8A 5IPHA 3TKQA 2IMEA 4TRXA 2L5LA 1OC3A 1ZGNA 4HJ2A 2VO4A 3FZ5A 3TJFA 1M2DA 2LSTA 1M99A 3QPMA 1M0UA 4JEDA 2IFQB 4HEA2 1YEPA 3EINA 3VLNA 1BYEA 3RDWA 1GSEA 5ABRA 1BAYA 4OCFA 16GSA 2VUPA 4G10A 4TXOA 2XBQA 5CRDA 3EYTA 4TOPA 2IMFA 2HYXA 2H73A 4GSTA 4WF4A 4F03A 4PXOA 1YZXA 2CAQA 3Q6OA 2B3SA 1FAAA 3ZYWA 1B9XC 2HZEB 2PVOC 3K8NA 1WMJA 1LU4A 2YWOA 3F9UA 1XCCA 3DEXA 1J0FA 3KEBA 4EL1A 1BEDA 3F3RA 4IN0A 4IGJA 2HXKA 1GUMA 2FHEA 1T4YA 3KMOA 3KTBA 2MBSA 3ISOA 3DVWA 1QUWA 4ZIJA 4F82A 4EO3A 1MD3A 1V9WA 3ZIJA 2OBIA 4PUFC 1EV9A 5CRGA 4O32A 5IO0A 1UN2A 5DJLA 4ULXA 1M2BA 4OD7A 1C72A 2NVLA 2OADA 2F8FA 4IJ3A 1LBKA 5ECIB 3M3MA 2DJ1A 3EU3A 4DSSA 5GZZB 1PL1A 1VF4A 3CSJA 3IK7A 3H79A 1GH2A 3GUSA 2VL2C 4XIHA 1VF3A 4V1Ag 3DGQA 4K7OA 1PX7A 2F3MA 2JZTA 3O6TA 1F9MA 4XS6A 1AQWA 1K0NA 2OE0A 4JZQA 3GIXA 5ID2B 1WPIA 2XPEA 5J3RA 1TW9A 1PMTA 5IMCA 1K3YA 4WF5A 1K0MA 4HZ2A 5HFKA 4F0BA 2DJ3A 5GSTA 2CZ2A 1PN9A 1TU8A 5F8BA 4EDZA 4J56E 4KUNA 2L5OA 4PX1A 1K0DA 2N5AA 3TJBA 4V1Ap 2TRCP 1TRVA 2ALBA 2JADA 3D0ZA 1JLVA 3LXZA 4N11A 2DIYA 4RUVA 2VM2A 2H76A 3BCKA 2V1MA 1GUHA 1PKWA 1B8XA 3U5RE 2CA8A 2YWIA 5FHIA 2VOCA 2B5YA 1TDIA 4PGTA 1T7PB 3H93A 1DBYA 4CHSA 3RHCA 3JCML 1XZOA 4HS1A 1OAZA 4DVCA 4GXZA 2GSTA 1QFNA 3TJJA 3P90A 1A8LA 3HVSA 1Z7PA 4POLA 2V41A 2D2ZA 2FY6A 1JZDA 2YJ7A 2VAFA 3P2AA 2FGXA 1XWGA 1PQNA 5ECPB 1OC9B 3RBTA 4EDYA 3QDNA 3EMPA 2NTOA 2ZCTA 4EVMA 4IBPA 1SU9A 3MNGA 1QK8A 1O8XA 1XWKA 5AN1A 4K0GA 6GSYA 1XOBA 3FYGA 5G30A 2VL2A 4KDUA 2VIMA 2I3YA 3HVXA 1RW1A 12GSA 3EU4A 1ML6A 4L5OA 3TUEA 2L6DA 1FOVA 4ZL9A 5ECOB 3US3A 2YN1A 3P8WA 1A2MA 1T00A 5IMAA 4HDEA 3L78A 3LWAA 2LTKA 1O73A 2IN3A 4ILFA 6GSVA 5JCGA 4MF7A 2H66A 4NXIA 5CAXA 3TKRA 3HHVA 1GLPA 4FO5A 2XHFA 5DJMA 2XPDA 2WFCA 2RM5A 1URMA 2B7KA 5GAND 2DC5A 1TK5B 1GSYA 5DAKB 1AC1A 3GMFA 5G5EA 4ZB9A 1S3DA 4MJBA 4RQRA 3ME8A 4GCIA 5D93A 3MAKA 4XS1A 2WULA 1DSBA 1YY7A 3HJPA 2G0FA 5DQYA 3ED3A 1YKCA 2C0DA 1V40A 4KSOA 2WZ9A 1OE7A 5ELAA 2DMLA 3E0UA 3IPZA 2GVPA 4XTSA 5LD0A 2LRTA 4MZWA 5L71A 3F4SA 5EPFA 3GL5A 2H6YA 5J9CA 1N2AA 4WR5A 3F4TA 3KIJA 2OBKA 2O8VB 5INYA 3UL3A 4FYUA 3ERGA 3FRCA 4HI7A 3FZ9A 2LQQA 1Y25A 18GSA 1R26A 3F6FA 5CRWA 5KN2A 1M7TA 2HLSA 3M0FA 2IMKA 2H30A 3UJ1A 3E3EA 2O87A 1GNWA 2IPAA 2A2RA 5IO2A 3I9V2 4YQMA 3C73A 1TTZA 1FG4A 2AYTA 3DKSA 2C3TA 3LSZA 1T1VA 5E59A 4MH2A 1GTUA 4POMA 1X5CA 4MH3A 3GKKA 3G7IA 1HD2A 5E4WA 5EVOA 5DALA 1NW2A 1GNEA 1ERUA 2LUSA 2VD0A 3A5WA 5LCZA 2I1UA 1MEKA 1ERVA 1FVKA 1ILOA 2GZYA 5GAPD 4LMWA 2CT6A 2PGTA 5G1LA 2WRTA 3ZIVA 4LA1A 1TK8B 2LQOA 8GSSA 2HSHA 2OE3A 4L5LA 4MCUA 2LKUA 5B8BA 1PD21 2RUFA 1FW1A 2CQ9A 1AAZA 3CYNA 5HR3A 6GSSA 4IP1A 4IQ1A 4BPYA 2QGVA 4Q5NA 5IQYA 5ECKB 2J23A 4LMVA 1ON4A 1EGOA 3D5JA 4JR6A 1GP1A 4AJ8A 2C0EA 5HR2A 10GSA 2PERA 4PQIA 3KM6A 2JSYA 2GT5A 4LL1B 4FYCA 3F0IA 1TI1A 5G5FA 4Q5RA 1PKZA 3QCPA 3EMXA 22GSA 2C1YA 6GSWA 2N5FA 3PH9A 3GX0A 1R5AA 5G2ZA 2K8VA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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