1GRXA

Structure of e. coli glutaredoxin
Total Genus 27
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
27
sequence length
85
structure length
85
Chain Sequence
MQTVIFGRSGCPYSVRAKDLAEKLSNERDDFQYQYVDIRAEGITKEDLQQKAGKPVETVPQIFVDQQHIGGYTDFAAWVKENLDA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title NMR structure of oxidized Escherichia coli glutaredoxin: comparison with reduced E. coli glutaredoxin and functionally related proteins.
pubmed rcsb
molecule keywords GLUTAREDOXIN
molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
total genus 27
structure length 85
sequence length 85
ec nomenclature
pdb deposition date 1993-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1grxA00
4FYBA 3ZFLA 2HE3A 5C04A 4G10A 1TTZA 11GSA 2QSIA 1S3DA 4E8HA 1T1VA 4KDUA 1CQGA 3I9V2 3C71A 3KCMA 5ECSA 4I8BA 2I3YA 1K0CA 2H0IA 2CVKA 3RPPA 1JFUA 3ERGA 3HZ8A 1R7HA 3H8QA 4F9ZA 2MBTA 1K3YA 4EVMA 3WT2A 3N5OA 1S3CA 1U3IA 4O5RA 1O81A 1HNCA 5FT3A 4XTSA 4HUAA 4RI7A 1SL2B 5DQYA 5CYYA 2VD1A 4PQ1A 5GSSA 3TRQA 4V2NA 1GNWA 4FH8A 2HNLA 3MAKA 2K8SA 2FCHA 5ELGA 3M9KA 1EP7A 4AGSA 4XCSA 4NWYA 1F9MA 4GXZA 3MSZA 1K0BA 4AJ8A 1MTCA 4NAXA 1ILOA 2R6KA 5ECKB 2XHFA 1M0UA 2VCXA 1XWKA 1A2MA 2MMZA 10GSA 4E8EA 5ID2A 3F63A 2A2RA 4GQCA 2VCQA 3GKXA 1O85A 4ML6A 5DALB 2ES7A 4X1UA 5DBQA 4OWYA 2DIZA 2C0FA 2E2MA 2WCIA 4HZ2A 4KNDA 4ZL9A 2TIRA 1KEBA 4TVEA 2FA4A 4MP4A 4BL7A 4KCAA 3RBTA 3FYGA 1YZXA 3M9JA 2IFQB 2LUSA 3UVHA 3W8SA 3M8NA 1ACVA 1XOBA 4WR5A 3UARA 3TKQA 1AUCA 3LSZA 1PKWA 3ERWA 4KE3A 1Z3EA 1T7PB 4G9HA 3DXBA 2NPBA 3EU3A 2YWNA 5G1KA 4ZILA 5IO2A 2LJKA 1XWCA 5ECNB 4EE0A 1SJ6A 3MNGA 1NHYA 1WRYA 3QAWA 2ZNMA 5HR1A 5LD0A 2EIOA 2RUFA 2RM5A 2DJ2A 1VRSD 3P90A 4PUFC 2YWIA 3CXGA 2H70A 2VLVA 5G5FA 3ZZXA 2H66A 2LNTA 5IMFA 5C00A 2L5OA 1GLQA 2HZEB 2GT6A 3C7MA 4OO5A 1HYUA 3KH9A 1M9BA 3GYKA 2KHPA 4XRAA 4MMMA 19GSA 2P5QA 3FR6A 2VL2C 1THOA 2RUEA 1FOVA 4WKWA 2HZFA 3EVIA 5FHIA 2R2JA 2GZZA 1GP1A 4HDEA 1Z5YE 3KGKA 2GT5A 3GL3A 1IYHA 2VM1A 6GSVA 3D4TA 2PU9C 1XBSA 2NDOA 4N10A 4K7OA 5KN2A 3US3A 5D9XA 1EEMA 2JSZA 3EURA 3KZQA 3QMXA 1XXUA 3P7XA 2LJRA 2EIQA 1DE2A 1PMTA 4KW6A 4IQAA 3I43A 3G9BA 2L59A 4AJ6A 4FYCA 3GFKA 3R2QA 4YAPA 2BJXA 4ID0A 1TK8B 3FY7A 1XFLA 2M72A 2R37A 3WD6A 2L6DA 4ZB8A 1XPVA 4PURA 3WT1A 1ON4A 9GSSA 1B8XA 2VL9A 5DCGA 4YAVA 1TKDB 2BTOT 2WJUA 1XW9A 3GURA 2DIYA 2LV3A 1SU9A 1LU4A 1TU8A 3M1GA 4MZWA 3CBUA 1N2AA 3EYTA 1TI3A 1WMJA 5EY6A 1VF2A 4JU5A 2PGTA 2H74A 4YH2A 4CHSA 1XWBA 4O32A 1VF1A 2C80A 1AIUA 2GSTA 1YJ6A 3UOMA 5DAKA 2IJYA 4V1Ap 1J0FA 2PVQA 4PUAA 4K7NA 2IMIA 3HD5A 4HJ2A 3L9VA 1KBNA 1GRXA 3ED3A 3F8UA 6GSSA 3CSHA 2JACA 1FO5A 16GSA 1U88A 1V9WA 4TW5A 1PRXA 3LXZA 2I1UA 1BEDA 1SK0A 3VWWA 2RIIA 1BX9A 3BBYA 3P8WA 3ZYWA 1XVQA 2OE0A 4WBRD 1JZOA 3BD2A 4BVYA 1GTUA 1NM3A 2FWEA 2L4CA 6GSYA 2E2GA 3S9FA 2K6VA 1TI1A 5GZZB 1YQ1A 3L4NA 3TDGA 3F6DA 1WIKA 4POBA 1OC8A 5IOXA 4LL1B 1SJZA 1TDIA 3LG6A 2AAWA 4L0UA 1ERTA 4OO4A 1AQVA 1PA3A 3G7IA 3GTUB 2XPEA 3ERFA 2FHEA 2YNXA 3WGDA 2VCVA 4GSSA 3H93A 4POKA 3HJOA 1O73A 2AYTA 3TOUA 1EOHA 2R5GA 3DKSA 2H76A 2YV9A 4GWRA 3RPNA 4D73B 3GIXA 2VAFA 1ERUA 3BOAA 6GSWA 5F06A 1H4OA 4JZQA 1VGLA 3ISOA 4TN8A 3AY8A 1ZL9A 1G6YA 1V2AA 3CTGA 3UAPA 4NV2A 2LTKA 3LORA 3LYPA 4ECBA 1MDKA 2PWJA 4L0WA 4KDYA 5IMCA 1K0OA 1EP8A 2BMXA 5ECPB 2I81A 1Z7PA 1T4ZA 2GTUA 3ZITA 2IMEA 4BA7A 4KAEA 4F03A 3GRXA 4NHWA 2ON7A 5J4UA 4XHMA 13GSA 1KTEA 2N5AA 1KNGA 2YOIA 4OMVA 3KIJA 1USBA 1F37A 2B5EA 2F3MA 3GNJA 3LJRA 1QFNA 1RK4A 1ZOFA 3EMXA 2F9SA 3BCIA 4GQFA 1G7OA 5ECMB 2LQQA 2AB6A 1Z6MA 4N30A 1TXXA 1VF4A 3FZ4A 4IVFA 2P5RA 1OKTA 2C1YA 1X0RA 3RAZA 1K0AA 1M2DA 4ILFA 1X5DA 2KLXA 1EGRA 1MDJA 1Y6EA 3BJ5A 1AQWA 2GDRA 3TJKA 1R26A 2MMOA 2JL4A 1GSFA 3TRPA 2R4VA 4HZ4A 1QXHA 2PMTA 3D22A 2VCWA 3QDNA 5G2ZA 2P0GA 3O3TA 2JU5A 1K0DA 4LLRA 4JRRA 3NZNA 1SENA 1MEKA 4N0ZA 2LRNA 1EV4A 3KP9A 3PR8A 4IS0A 4K8MA 2MYGA 3D4MA 4IELA 4TRXA 2O89A 2WRTA 4KGIA 2IMKA 5HFKA 4I2UA 4DSSB 5D73A 4YQMA 1Q4JA 2MZCA 3IV4A 3F3RA 1A2JA 4POLA 3LWAA 2H6YA 1SJIA 4MH3A 4I5QA 4BWSA 3WGXA 2KP1A 4EDZA 2ON5A 5J9CA 2CVBA 5DALA 2OE3A 3LXTA 4WF4A 2LSTA 2DMMA 4RI6A 2AV4A 3D0ZA 2HFDA 4WBJA 3F3QA 5H5SA 2WS2A 2H19A 2F51A 1ERVA 3KP8A 2H75A 1LBKA 2JSYA 2TRCP 1BQ7A 3VI7A 4PQIA 1PKZA 2NTOA 2CVDA 2OJLA 2DJ1A 3TJBA 4RUVA 3EE2A 4V2MA 1EZKA 1GSSA 3N9JA 2IWTA 2M46A 3UIWA 2JZSA 5JCUA 1WP0A 3QR6A 1SL0B 5ECHB 2IFQA 4MF5A 1WE0A 4L5OA 3UMAA 4QQ7A 1PX6A 4TR3A 2H30A 2H1GA 2LJAA 2FA8A 1T00A 2B5XA 2K8VA 2AHEA 5ECRB 5G1LA 2B7KA 3VPQA 1J9BA 5J3RA 1Z9HA 4K7IA 2VM2A 2N5BA 5EVOA 6GSXA 2H71A 3ZMKA 2MBSA 2FWGA 1OYJA 4I97A 4MJAA 5H5QA 3CSJA 4IGJA 3SBCA 4CW9A 3EINA 4OD7A 3A2XA 1EV9A 4ULXA 2DLXA 5D93A 5E4WA 4ZBBA 1BYEA 2RM6A 2FY6A 3GV1A 1A24A 2AJQB 1K3OA 3FZAA 1XIYA 3DIEA 5AGYA 3L9UA 3IC4A 4V2LA 3QCPA 5GAPD 2Z9SA 1TRUA 2L6CA 3J7Yb 4JR4A 4MH2A 4MPFA 1OC3A 4EF0A 2CZ2A 3HJMA 1TRSA 4TOPA 3HDCA 2L5LA 1XW6A 3QFAC 5ID2B 2YANA 2WDUA 4YQUA 1PGTA 4K9ZA 1U3AA 4IHUA 4F0BA 3GX8A 1HQOA 3K8NA 4I2TA 2REMA 1PD21 3KTBA 3LGCA 2B3SA 3C8EA 3FK8A 3ME8A 5B6MA 4IBPA 3KM6A 4KX4A 1LJRA 3FR3A 1JHBA 5D9WA 3J7Yk 2HLSA 1NW2A 3HXSA 1FB6A 4XIHA 2ALBA 12GSA 4G19A 3PGTA 4LA1A 3HA9A 1WOUA 4ZL8A 2M80A 3GN3A 1HNAA 5IM9A 2YWMA 3ZMLA 3VPTA 3MWHA 1FVKA 4N0VA 3ZVJA 3FKFA 3DGQA 2KOKA 4L8EA 3CTFA 4F2IA 3JCML 5ELAA 1AC1A 2GVPA 2CX3A 4WEYA 4EL1A 5KN1A 2IMFA 3IBHA 3TGZA 3A2VA 2P31A 4GSTA 1FVJA 4MDCA 5GAND 4OCEA 3KMNA 1F3AA 1J08A 3CYNA 2YN1A 3GA4A 4FO5A 1B4QA 1JLVA 5IO0A 1SL1B 4HEA2 1TRWA 3HHVA 1SYXA 2R3XA 1G6WA 1URMA 3L78A 4MF7A 3BCKA 3HVXA 3CSIA 1X5CA 1B48A 1T3BA 4IP6A 4Q5QA 4K0GA 2FWFA 1SYRA 4ECCA 5DCHA 1YY7A 4O7HA 5AISA 5IMDA 2LKUA 2GGTA 4ECIA 1C72A 4ECJA 2EC4A 3TCOA 3ZTLA 1A0RP 3DWVA 2GSQA 18GSA 2GQLA 3UEMA 2C0EA 5HQPA 2IPAA 1M99A 3F9UA 1YKCA 5H5RA 2HI7A 4PNGA 2DBCA 1V58A 5B7CA 4ZL7A 3KTLA 2B5YA 2FD3A 4X0XA 5LCZA 3IXRA 4MCUA 2EIRA 3IRAA 2H1AA 3F4RA 4TXOB 4L5LA 2LNSA 4MZBA 3DMLA 2D2ZA 2OBKA 4EDYA 2AUVA 3ZLPA 5HFGA 5B8BA 2YZUA 3VWVA 4JBBA 4IP1A 1NHOA 2X64A 1F6MC 3O76A 4MPGA 1TW9A 3KJYA 1M7TA 3TKRA 3FR9A 3GKNA 2HSYA 2A2SA 3ZFBA 4H86A 1M9AA 1WJKA 3IAS2 4MJCA 4XS4A 1EGOA 1MD4A 3TKSE 3IAM2 1GULA 1Z7RA 1JLWA 2HT9A 3ZREA 5DAKB 20GSA 5LNKe 4ISDA 4MZCA 4MLYA 2E7PA 2DJKA 4NXIA 4AJ7A 3GL5A 5D9TA 1TRVA 3F4SA 4XS1A 1Y25A 5CRHA 1PX7A 3ZIVA 3KEBA 1A8LA 1GL8A 2I9HA 3HCZA 1UA5A 5DDLA 1T8EB 2DSAA 2RLIA 1S3AA 1ZZYA 2GZYA 1OAZA 3APSA 2B7JA 3FEUA 1WWJA 1F2EA 2E0QA 3M3MA 2GLRA 3ZIJA 5ECLB 1AW9A 4K2DA 5GSTA 1XW5A 5A5KA 14GSA 2WULA 1M2AA 3GSTA 3TOTA 2CAIA 2O8VB 3GKMA 4JR6A 3G7YA 5CO3A 4EUYA 4GCIA 5D8IA 4EO3A 2YP6A 2CX4A 2GSRA 1K3LA 3D6IA 3UL3A 1FG4A 4DEJA 3DD3A 3UBLA 3LEFA 5DJMA 2WFCA 4TKYA 2G2QA 2NVLA 4G2EA 4HU7A 1O6JA 4WR4A 1GSYA 4IN0A 5IMVA 4YQVA 1OKDA 1GTBA 4HJMA 2VL3A 1UVZA 1EWXA 1XOAA 1TP9A 1THXA 3C1RA 3EU4A 1YEXA 4DVCA 2OBIA 3H4KA 4KUNA 1A2LA 2YCDA 2VO4A 2MMNA 4TXVA 5EPFA 4GSNA 3ZVJD 2X99A 4ZXGA 3IPZA 4MJBA 5KEJA 1PSQA 3CMIA 1X9WB 1QGVA 3TJJA 3Q6OA 4EC0A 4Q5NA 4QL9A 3GSSA 3EMPA 1AAZA 5J9BA 3UBKA 1ZGNA 2C3NA 1RW1A 1SD9A 2F8FA 4MJEA 3H79A 4KSMA 4OCFA 4ZIJA 2HRNA 1QK8A 1TU7A 2FNOA 4GTUA 1OC9B 1GNEA 2H72A 2H01A 3QAVA 1B9XC 3DVWA 2VLTA 4LMVA 1R5PA 2H6XA 2PBJA 1SKWB 3Q74A 2YPMA 4TR1B 5AN1A 1E6BA 3CRUA 4MABA 2X8GA 5D96A 1I5GA 3IDVA 1ZYEA 3QPMA 4IJIA 2X8CA 5DQSA 1M2BA 2WZ9A 3O6TA 4IQ1A 5AIVA 5COHA 1DBYA 1A8YA 4RQXA 1X5EA 5IPHA 2GSSA 3Q18A 3WGEA 1PL2A 3FRCA 2VIMA 2H0GA 5DVBA 5EL8A 1DSBA 2YWOA 4KCEA 4LL4B 5IIZA 2X8HA 1XWGA 3VI5A 4XS6A 17GSA 2V32A 3QD9A 3MDKA 5CRGA 1G0TA 1PL1A 5A4UA 3TJFA 3F6FA 1R4WA 4ZBAA 2KUCA 1DUGA 3ZRDA 1BJXA 3G7JA 3C73A 4KDXA 4XRDA 1DE1A 1AQXA 4OFMA 2O85A 3RHBA 1XCCA 4Q5FA 2PUKC 3IK9A 2H1DA 4DSRA 2DJJA 4F0CA 3SWLA 3IK7A 3NOFA 2DJ3A 2JZTA 2O7KA 2DC5A 1W89A 2JADA 2V6KA 4PXOA 1ML6A 5D9VA 1FW1A 3GHAA 2LRCA 2JZRA 1FB0A 1V40A 5J5NA 1RQMA 4I6XA 1ZCPA 3PINA 4IW9A 2H6ZA 5IMZA 3FZ9A 1XWAA 2QC7A 4KB3A 5FWGA 2V1MA 1GTIA 2YZHA 1X9SB 1QQ2A 2OE1A 3LYKA 1HD2A 3GH9A 2FLSA 3ME7A 4ML1A 4NMUA 4CDOA 2B6MA 2C3TA 4GLTA 4P3YB 3F4TA 4AF2A 3TJGA 2A4VA 3U5RE 1A23A 3IE3A 1Q98A 2HZEA 2IIYA 5L71A 2K18A 5IQYA 2V41A 3VLNA 3V1WA 4RQRA 1CQHA 3QAGA 2OACA 2FGXA 1O8WA 3GKKA 3DRNA 4BPYA 3CRTA 4K1FA 4FIWA 5F8BA 5CRDA 2LEGA 2FWHA 4GRFA 2B1LA 5A4VA 1YF0A 2VOCA 2C3QA 2CAQA 3LFLA 1GLPA 1PN9A 2ZUPA 1GSQA 3C1SA 2PN8A 2F8AA 1YEPA 3Q19A 4WF5A 3I69A 3KH7A 3L0HA 1GWCA 4PX1A 5IOWA 4NV5A 1W4VA 4K6XA 2MMAA 4X43A 4FYUA 3D5JA 4BVXA 4MK3A 4WXTA 2CZ3A 3U6VA 1BG5A 2C8UA 2VD0A 4JE1A 3OR5A 3VK9A 3VWXA 5IMAA 4Q5RA 3TKSA 1JZRA 4OFTA 4QL7A 5ABRA 5B6NA 4J56E 5ECQB 2GZPA 5G30A 2CA8A 1Z6NA 4POMA 5A4WA 3ZL5A 1R5AA 1UC7A 4JEDA 5HR0A 1O8XA 3DVXA 1GUMA 2H0HA 3FW2A 3IR4A 3PH9A 5JWOB 2HXKA 1SD8A 2CV4A 3E0UA 1FHEA 2XBQA 1K0MA 3TKPA 1JZWA 2LQOA 1ERWA 3UVTA 1NSWA 4GF0A 4J2FA 4ACSA 3E9JB 3RDWA 1TJDA 1GUHA 1OE8A 4PNFA 3I6AA 1TK0B 5CP1A 1GSDA 5KN0A 4V1Ag 1SKSB 3EWLA 2XBIA 3RHCA 2H1BA 2C0GA 4LMWA 4TXOA 1WPIA 5B8AA 2V2GA 3VURA 1MDIA 1VF3A 3L9SA 5JWRB 1F3BA 5F0GA 3GMFA 4MA9A 3P2AA 2HSHA 3GUSA 4HU9A 3A3TA 3KMOA 3LQ7A 3QFBC 1OVNA 3HVSA 5HR2A 4ZBDA 2GQMA 1GH2A 1YDKA 3DEXA 4TR4A 5JCWA 3H1NA 4NPBA 2G0FA 3TRXA 4PQHA 5E59A 3F0IA 3FHKA 4IKHA 3KD0A 4IJ3A 3GTUA 1GSUA 2VLUA 2OADA 1N8JA 3FZ5A 2XPDA 3HJPA 3A2WA 1BAYA 1OE7A 6GSUA 2B1KA 4ZB9A 2IMDA 5KN3A 3IHQA 1T4YA 1O7UA 2IL3A 3VFIA 2WB9A 3TB2A 2K9FA 2LRTA 2PERA 4DSQA 1UN2A 2OA7A 2CT6A 4HI7A 8GSSA 4D73A 1B9YC 1H75A 2HYXA 5J41A 2VUPA 2HRFA 1HNBA 4K0NA 4TR0A 1U6TA 7GSSA 4KH7A 2J23A 1GTAA 1E2YA 3A5WA 4HS1A 5CNWA 2ZCTA 4N11A 4KA0A 3NIVA 1MD3A 3HKRA 1TOFA 4J57E 4HOJA 1SK2A 4WETA 5CREA 1ST9A 1YKAA 1IYIA 4EKZA 2VCZA 1SK1A 2CQ9A 5F05A 3KXOA 4OFNA 3DYRA 5JCGA 2KP2A 1ABAA 1ZMAA 5JWQB 3VWUA 4HQZA 3WYWA 3QOUA 2H8LA 1EOGA 2DMLA 5HFIA 1JZDA 1QUWA 2V6OA 1A0FA 4XS4B 5INYA 1XVWA 2GS3A 5G5EA 1V57A 6GSTA 3APQA 2FUG2 4Z7XA 5AIXA 1I9DA 2PVOC 22GSA 2VL2A 3E3EA 2NBSA 4MF6A 1GSEA 5CRWA 2TRXA 3HYPA 4O92A 2C4JA 2H73A 2VCTA 5ENUA 1XZOA 2LS5A 1ZYQB 1QMVA 5CAXA 1OC9A 2I4AA 5DJLA 5ECIB 4BWQA 4HQSA 5ECOB 2J9HA 5HR3A 2N5FA 3D21A 2C0DA 3HY2A 1TK5B 3IA1A 1EEJA 5G31A 2YJ7A 5F07A 3HZ4A 3UJ1A 1YF1A 4TR1A 3TUEA 1AXDA 3M0FA 3IOSA 3APOA 1X9MB 2L4QA 2IN3A 2WGRA 4PGTA 3GH6A 2YV7A 4DSSA 1SKRB 2PPTA 1B4PA 3EC3A 3W8JA 2QKEA 1V98A 1U87A 2L57A 1K0NA 2O87A 4ZB6A 2GQKA 1PQNA 3GX0A 3W6GA 4EXJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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