1H75 | Genus

Total Genus 21

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	21
sequence length	76
structure length	76
Chain Sequence	MRITIYTRNDCVQCHATKRAMENRGFDFEMINVDRVPEAAEALRAQGFRQLPVVIAGDLSWSGFRPDMINRLHPAP

Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__388066470949426__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__388066470949426__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/1H75/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__388066470949426__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"388066470949426","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/1H75/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__388066470949426__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Electron transport
source organism	Escherichia coli
publication title	Structural Basis for the Thioredoxin-Like Activity Profile of the Glutaredoxin-Like Nrdh-Redoxin from Escherichia Coli pubmed doi rcsb
molecule keywords	GLUTAREDOXIN-LIKE PROTEIN NRDH
total genus	21
structure length	76
sequence length	76
ec nomenclature
pdb deposition date	2001-07-03

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00462	Glutaredoxin	Glutaredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1h75A00

5GAPD 5GAND 2DIYA 5IMCA 1I5GA 3QFAC 1SYRA 2HZEB 4G9HA 3GKXA 2A4VA 3GV1A 3R2QA 4K9ZA 2YNXA 3P2AA 2PMTA 1FHEA 1TDIA 4YQUA 1EOHA 2XBQA 1TK8B 3TJFA 2KUCA 5CYYA 2XC2A 1MDJA 2YANA 3UEMA 1ZL9A 3TJKA 2EIOA 2GTUA 3ZTLA 5ABRA 1YEXA 2LJKA 4KH7A 4OWYA 2JZSA 4MZCA 2IMIA 2WDUA 2AUVA 4WKWA 2YPMA 1C72A 4N10A 3D22A 3GSSA 4TKYA 1UC7A 4POBA 3LWAA 2JL4A 3VK9A 2LRNA 4MZWA 3L9VA 9GSSA 1PMTA 5A4UA 2VCXA 2K8SA 1TI3A 4IQAA 1PSQA 4IW9A 2JU5A 5H5QA 1V9WA 3VWWA 5IQYA 1PL1A 1NM3A 3VPQA 3KMNA 4WETA 5EPFA 3ERGA 1GTIA 5ECKB 5LD0A 2EC4A 3TUEA 3KP9A 2NTOA 4G10A 4OCFA 2VL3A 4HJMA 3TJJA 4DSRA 4HJ2A 2LEGA 1AAZA 3H79A 3RPPA 1B48A 3FKFA 2YOIA 2WFCA 1ZOFA 2JSZA 2VOCA 5JCWA 1SENA 6GSWA 1OYJA 3GKKA 1M2BA 2EIQA 3KH9A 2IMEA 4MF5A 3WD6A 4F82A 2FA4A 4ZB9A 5ECMB 3TJGA 1WMJA 3IRAA 1MTCA 4IHUA 1VF2A 3WT2A 3F4SA 3ZMLA 3LEFA 1R5AA 1LBKA 3O6TA 2N5BA 3HD5A 1SL1B 1BQ7A 5F06A 1SYXA 1HNBA 2V6KA 3CXGA 5G5FA 2VLVA 5KN1A 4AJ8A 3ZYWA 1G7OA 4TVEA 2HZEA 3IHQA 2GZYA 1JLVA 3UOMA 1MD4A 1SKWB 5HFIA 3TJBA 3RPNA 3W8JA 2JSYA 4ISDA 5D9TA 2FHEA 1R7HA 1T4YA 3L9SA 5GZZB 3LGCA 1EZKA 4KX4A 4IBPA 2F9SA 3C1SA 1YQ1A 4I2TA 1QK8A 2FCHA 3GTUB 2C3NA 3QR6A 1M0UA 3UBLA 3ZIVA 3ZFLA 1UA5A 3N5OA 2RM5A 4GXZA 1Z6MA 3ERWA 2B1KA 5CRHA 5D9WA 1OC8A 2I81A 2LV3A 1ERWA 1S3AA 2CAQA 1K0OA 4E8EA 2P0GA 2IFQB 1GSEA 3KTLA 2J9HA 2GGTA 2C3QA 4NHWA 5IMAA 4HU7A 5G5EA 2NBSA 3KJYA 2IJYA 2QKEA 2IMKA 4GCIA 1ERUA 1OAZA 1XFLA 1KEBA 4L0UA 2C3TA 4I8BA 2CAIA 2CZ2A 4MJAA 3VI5A 5G31A 4PUFC 2LRCA 2OBKA 4TN8A 2B5YA 4MA9A 1SD9A 3DYRA 4ZBAA 4GLTA 3DRNA 3L0HA 3FR3A 2IWTA 1WIKA 2FNOA 1WP0A 1U3AA 2O7KA 3IAM2 4ZB8A 4CHSA 2AHEA 2WGRA 4KSMA 4AGSA 5KN3A 3DWVA 4LMWA 4JRRA 3UJ1A 4OFMA 3D4TA 4MF6A 3DVWA 5ECSA 4PURA 2X8CA 4ZL8A 5CO3A 1DUGA 3F8UA 1DE1A 3UVTA 3WYWA 4ZBDA 2H0IA 3IV4A 3GX8A 17GSA 4POLA 3ZVJA 4L5LA 6GSXA 2JADA 4F9ZA 5DJMA 4MF7A 4L8EA 1WJKA 1M2DA 4JU5A 3KXOA 4WR5A 1PQNA 5J3RA 1G0TA 6GSSA 2WRTA 3VWVA 2QGVA 2ZNMA 2YZHA 1ILOA 4AJ6A 2C0FA 2B1LA 3QMXA 4V1Ap 1XOAA 1M7TA 2IFQA 3U6VA 4O5RA 2BMXA 1U3IA 4WBRD 1AQVA 4K2DA 2PU9C 2H71A 4YQVA 1GLQA 1JZWA 2WS2A 1PX6A 2M80A 1Y6EA 2H74A 4RQRA 1SU9A 4MH3A 4ULXA 2NVLA 3ZITA 5JWQB 2X99A 4CW9A 3WT1A 2QSIA 4IP1A 4MZBA 4WF5A 1B9YC 1Q4JA 5B8AA 11GSA 3CYNA 5JCGA 4EDYA 2P5QA 4IGJA 1ZZYA 2WZ9A 5D9VA 4L5OA 3EWLA 5H5SA 3CTGA 1A2JA 2DSAA 1RQMA 1GRXA 2F8FA 5CRDA 1PRXA 2CX3A 6GSVA 4TR1B 1EOGA 1MEKA 1SK2A 5DQSA 1OE8A 1QFNA 2O89A 5J4UA 4FYBA 3D6IA 3SBCA 3HHVA 2GSQA 3M3MA 4GSNA 2VLTA 5ECLB 2K9FA 3A2VA 4ZB6A 5H5RA 4MPFA 5B7CA 4BWSA 3RHCA 3TKQA 3KIJA 6GSYA 1ACVA 5HR0A 2A2SA 1GWCA 1OC9B 2GZPA 3ZL5A 4MJBA 2GQMA 4GRFA 1CQHA 1PL2A 4ZXGA 4V2LA 5HR3A 1TP9A 2DC5A 2C8UA 2DIZA 4ID0A 1KBNA 1YKAA 5AN1A 5C00A 5CAXA 3F9UA 1M9AA 1K0AA 2IN3A 4FYUA 2VCZA 2WB9A 2H1BA 1VF1A 2FY6A 5GSSA 4NV5A 3EURA 2ON5A 1OKDA 2NPBA 1XWBA 1EV4A 4GSSA 1T1VA 1S3DA 2VD1A 3VFIA 1PX7A 3QAVA 2MBSA 1U87A 1F3BA 1NHOA 3N9JA 2OE3A 2KP2A 4TOPA 1V40A 3RBTA 3I6AA 4RQXA 4G19A 5EL8A 2DMMA 1M2AA 3J7Yb 3M8NA 4GQCA 1O81A 3UARA 5HFGA 2DJKA 3GNJA 2IPAA 1TRWA 3FZ4A 4GSTA 2TIRA 4ECIA 1GTBA 1QUWA 3HZ8A 1WE0A 2YV7A 3U5RE 1FOVA 4ZBBA 2F51A 2YWMA 3ZREA 2V41A 2FWEA 1GL8A 4TXOA 2M46A 4BA7A 4XCSA 5G1KA 2E2MA 3C71A 2DJ2A 5F8BA 3TB2A 4KCEA 4MP4A 1W89A 1GP1A 2HXKA 1E6BA 5DALB 2GLRA 2DBCA 4MK3A 3ZFBA 3A2WA 5IIZA 2CT6A 4KW6A 1K0MA 4TR1A 4V2NA 2H1AA 1XW6A 3E0UA 3F3QA 1TU7A 5LNKe 1RW1A 2HSHA 2YWOA 3LORA 4PGTA 1FB0A 4EVMA 2R4VA 5AIVA 5ECPB 5HQPA 3NZNA 3F4RA 4K7NA 4JR6A 2AV4A 4XIHA 1USBA 3TKPA 2VM2A 1U88A 1JFUA 3QFBC 3UBKA 4HZ2A 2X8HA 3BCIA 1NW2A 4Q5FA 3HY2A 4XS4B 2H6ZA 4HQZA 1IYHA 3GMFA 3VWUA 1GSSA 4LLRA 5JCUA 1GNWA 5ECNB 1XW9A 2TRXA 3IBHA 1A0RP 4TXVA 3L78A 1DBYA 1F37A 3GYKA 1JLWA 3C1RA 3KZQA 3Q19A 4WBJA 2B3SA 4JZQA 5D8IA 2XBIA 3HCZA 3APOA 1PKZA 2VO4A 5IO2A 2QC7A 1BX9A 4ECCA 3OR5A 4O92A 2AB6A 1VGLA 3G7JA 2KHPA 1K3LA 5D9XA 1ML6A 3TKSE 2Z9SA 1SK0A 2H76A 1F2EA 2H66A 2IIYA 22GSA 2VD0A 5ECIB 2C1YA 3TDGA 3IOSA 4BVXA 3DIEA 4G2EA 2CVKA 1TK0B 2H0HA 3GL5A 5B8BA 3WGDA 4ZL7A 3EC3A 3TOTA 1HNAA 3KD0A 3Q18A 2P5RA 2RLIA 3GIXA 5JWOB 3FZ5A 4Q5NA 3BBYA 1LU4A 2TRCP 3H93A 1AUCA 2CA8A 2YWNA 1T7PB 3W8SA 2XHFA 4I5QA 2OA7A 4PX1A 4N0ZA 2PWJA 4HQSA 1TRSA 2OJLA 5IOXA 1PGTA 3A5WA 3O76A 4D73B 4ZL9A 3FR6A 4N30A 1HNCA 3ERFA 4WEYA 4OCEA 1SJIA 1JHBA 2EIRA 2KLXA 2MMOA 1YZXA 3FEUA 1Q98A 2AJQB 3LJRA 1FVJA 4H86A 1EEMA 2DMLA 4EL1A 2MMAA 2O85A 5FT3A 1BG5A 2PVOC 4WR4A 4IKHA 1XCCA 3FZ9A 4N11A 2OACA 3CSHA 5CP1A 3TRXA 1LJRA 2LNTA 2HLSA 5G2ZA 4JEDA 2H70A 4OFNA 1K0CA 1OVNA 2LJAA 3F6DA 2L6DA 1O8WA 4EE0A 1OC3A 2OADA 2VCWA 3EINA 4NAXA 1UN2A 3LYKA 4AJ7A 1QMVA 2R2JA 3L9UA 2FLSA 3NIVA 3LSZA 3A3TA 1TTZA 3GH9A 2XPEA 4EF0A 2C0GA 3RAZA 2YP6A 19GSA 3MWHA 1Z3EA 1XWCA 3IXRA 3VWXA 1TI1A 4F03A 2KP1A 1O85A 2HE3A 1G6WA 5E59A 3HDCA 1M9BA 4F0CA 2O87A 1V2AA 1X9WB 4KUNA 1Z7RA 2IMDA 2R37A 2VLUA 1Y25A 5DCGA 1GTAA 4NXIA 2VAFA 4Q5RA 1YF1A 3GURA 3QOUA 4XRAA 1Z7PA 1BAYA 2C4JA 3CRTA 4DSSB 4KDYA 1OKTA 5DVBA 1A8LA 5ECRB 2DJ0A 3ZVJD 1V98A 2FGXA 5C04A 5DAKB 2KOKA 5FHIA 2I4AA 2WCIA 4ECBA 2RUEA 4JBBA 4IP6A 4K1FA 4I97A 3IPZA 2V32A 4NWYA 3FRCA 2MZCA 2GSRA 3A2XA 3M9JA 1A23A 4IQ1A 1A2MA 4XRDA 1X9MB 2CZ3A 2LTKA 4D73A 3F6FA 2E2GA 3BD2A 4BVYA 3F63A 2E7PA 3QAWA 3HJOA 3MDKA 2HYXA 3Q6OA 2JZTA 3ME7A 3LFLA 4O32A 3KM6A 3LG6A 4IJ3A 3GTUA 5IO0A 1XWGA 1EP7A 1A24A 2I1UA 3IE3A 2PUKC 1XOBA 2H73A 1MD3A 3H1NA 4IS0A 2LSTA 2L6CA 5ID2B 3RDWA 3WGEA 5G30A 4GTUA 4XS6A 4X0XA 3UIWA 2JACA 2ZCTA 4WF4A 5IMVA 4V1Ag 1PD21 3GSTA 4FYCA 1O7UA 1YDKA 2ZUPA 3EYTA 4MABA 1BJXA 5DQYA 2PN8A 3EU4A 5IOWA 1TKDB 1MDIA 2N5FA 4F0BA 4IJIA 4KB3A 5G1LA 2J23A 3GL3A 3F0IA 1UVZA 1KNGA 4KDUA 4GWRA 4PNGA 2G2QA 5INYA 2NDOA 3F4TA 1WOUA 3ZLPA 5IM9A 3CTFA 3QPMA 1ZMAA 1R4WA 3K8NA 1CQGA 2CVDA 2GZZA 1VF4A 4I2UA 3PR8A 1YF0A 3GUSA 1FO5A 1B9XC 1G7EA 3HJMA 5E4WA 2IMFA 1BEDA 3VLNA 20GSA 1QXHA 3I9V2 4AF2A 4MH2A 1T00A 4POMA 1K0NA 2HSYA 3P90A 4K7IA 4LL1B 5AIXA 4F2IA 3TKRA 2R5GA 3ED3A 1EP8A 4DSSA 2B7KA 3GRXA 2LUSA 4XTSA 5ENUA 2REMA 12GSA 1EWXA 4P3YB 1T8EB 5DAKA 1GSYA 4RI6A 4HOJA 5DDLA 4QL7A 1H4OA 4X43A 3CSJA 5FWGA 3FR9A 2H01A 1SJ6A 1PN9A 2PBJA 3GFKA 4OO5A 4PUAA 1SL0B 3EU3A 1URMA 2L5LA 3J7Yk 2B5EA 3KTBA 3HVSA 1GUKA 1IYIA 2ES7A 2GDRA 5ELAA 5A4VA 2OBIA 1EGRA 1YY7A 1V58A 1MDKA 4NV2A 3VURA 1JZOA 3M1GA 4L0WA 3FY7A 2LQOA 4I6XA 4JE1A 5ID2A 1ZYEA 3HKRA 1HQOA 4KNDA 3MNGA 4X1UA 5HR2A 2C0DA 3APSA 1G6YA 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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1H75A

Total Genus

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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