1ILOA

Nmr structure of a thioredoxin, mth895, from the archeon methanobacterium thermoautotrophicum strain delta h.
Total Genus 14
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
14
sequence length
77
structure length
77
Chain Sequence
MMKIQIYGTGCANCQMLEKNAREAVKELGIDAEFEKIKEMDQILEAGLTALPGLAVDGELKIMGRVASKEEIKKILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Identification of a novel archaebacterial thioredoxin: determination of function through structure.
pubmed doi rcsb
molecule keywords conserved hypothetical protein MtH895
molecule tags Structural genomics
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus str. delta h
total genus 14
structure length 77
sequence length 77
ec nomenclature ec 1.8.4.8: Phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin).
pdb deposition date 2001-05-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13192 Thioredoxin_3 Thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1iloA00
3GYKA 4MPGA 3W6GA 3F3QA 2C0EA 1XOBA 2R37A 1LJRA 4KNDA 1Z9HA 2EC4A 4K0GA 3QAVA 1NW2A 3FY7A 1K0NA 3G7YA 4NV5A 2P0GA 1FAAA 4MLYA 1K0DA 2B3SA 1J08A 4XIHA 3CSIA 5F0GA 4BWSA 4K1FA 5HR2A 3EWLA 1N8JA 2AAWA 4FYBA 1O85A 5AN1A 2HE3A 4HEA2 3H93A 1E2YA 1NSWA 1S3AA 5C04A 4PQHA 11GSA 5DCHA 2H75A 2GGTA 2FA8A 4JE1A 3ZITA 1SJ6A 5D73A 1EOHA 12GSA 4N10A 2P5RA 2M46A 4TR3A 3KM6A 2V6OA 2GQLA 1XFLA 4V2NA 5IPHA 1Z6MA 1BEDA 4WKWA 2D2ZA 2FGXA 3IHQA 3I9V2 2OBIA 5D93A 1BG5A 2AV4A 6GSUA 2F9SA 2JADA 4DSQA 2V2GA 5HR1A 1M9BA 4YH2A 5EPFA 4X1UA 4EKZA 3KIJA 1E6BA 3G7IA 3KTLA 2V32A 2HT9A 1PX7A 2YCDA 2GZYA 3GH9A 5IMFA 2VD0A 5HFKA 1K3YA 5IPGA 4DSSA 2DBCA 1QFNA 2L6DA 1AXDA 1ZOFA 2CVDA 4KE3A 4E8HA 4BL7A 4HJ2A 3DIEA 5D96A 3D5JA 4MPFA 1AQWA 3F63A 2VOCA 1B9XC 3UVTA 3UEMA 2M80A 1HNBA 3FKFA 1ZZYA 3LORA 1K0OA 4MZBA 2CT6A 1XCCA 4IGJA 1VF3A 1TOFA 2F51A 5KN1A 3ZYWA 4ZBBA 3TGZA 4L0WA 1T8EB 2FD3A 4ML6A 1B48A 3BCIA 1JZRA 2B5EA 1XZOA 3VFIA 1Q98A 3M3MA 4POBA 1A2LA 1SKSB 1YEPA 2LRTA 4KSMA 2FHEA 3A2VA 4PNFA 4DEJA 4ZIJA 2IIYA 5IOXA 4OO4A 5AGYA 4O32A 4NXIA 4P3YB 4ECJA 5GAND 4I5QA 2DJJA 2TRCP 1B4QA 2B7JA 2VIMA 2ON5A 3TDGA 1RK4A 22GSA 1M0UA 2HRFA 3RHCA 1SKRB 5AIXA 5ECSA 2RM6A 4JR4A 3CSHA 3N9JA 5DDLA 2HLSA 2R4VA 1DUGA 3HJOA 1KEBA 1EGOA 3C7MA 4PNGA 4QL9A 2OBKA 2DJKA 3GKMA 4EC0A 4O5RA 1O8WA 1HQOA 4RQRA 1EGRA 1G6YA 4I97A 2YWIA 5FHIA 4KDYA 5ID2A 3OR5A 2B1KA 5KEJA 1SD9A 3GRXA 2C8UA 1FB6A 2R5GA 1TI3A 1H4OA 4H86A 4FYCA 3L4NA 3QCPA 1ERUA 1MD3A 3C71A 3IE3A 3PH9A 1DBYA 2OA7A 1XW5A 3WGXA 5COHA 3O3TA 3TKQA 4XS4A 3M9JA 1FVJA 19GSA 5JWRB 1USBA 3FEUA 1ABAA 1VGLA 2C0GA 5G2ZA 1NM3A 1PQNA 5ELGA 2CZ3A 4K6XA 1THOA 4Q5FA 2AB6A 4IBPA 4IQ1A 3SBCA 2K6VA 5DQYA 3ZL5A 5IO0A 1JHBA 2MZCA 5J41A 4GXZA 1JLVA 2I9HA 2YZUA 1I9DA 2OE1A 2VCXA 4MZCA 1S3CA 3TOUA 3TB2A 2H1BA 3GX0A 3KZQA 4HI7A 2HYXA 1C72A 3W8SA 4I6XA 5FWGA 1X9MB 2FNOA 4EXJA 4Z7XA 1K0AA 1Z7RA 1G7OA 1HD2A 3GKKA 5HFIA 3Q74A 2QKEA 3ERWA 2BJXA 2QC7A 1XXUA 2B7KA 3A5WA 1U87A 1K3LA 4TR1A 2H01A 1SJIA 4HZ4A 3AY8A 5G31A 4ID0A 1IYIA 4MJAA 2WS2A 3QAWA 1BAYA 2HFDA 5ENUA 3GH6A 3KH7A 4YAVA 2PERA 3GUSA 4HOJA 3F4SA 1BJXA 1K0MA 4NMUA 2OADA 2YNXA 4HU9A 2VL9A 3QDNA 1HNCA 2DMMA 2N5AA 1S3DA 2C80A 1LBKA 5CAXA 3P7XA 4F0BA 4O92A 4J2FA 4HQZA 1IYHA 2GLRA 2E7PA 3J7Yb 5C00A 3CMIA 2CVBA 1R7HA 1QQ2A 2ZNMA 3DRNA 2LNTA 4IJ3A 4EUYA 1SL1B 4KX4A 5CRGA 3GA4A 3IA1A 1TW9A 4KDXA 1PRXA 4PUAA 3HZ4A 4BVYA 2LQOA 4XRAA 1XOAA 2B5YA 2FWEA 3I69A 5LD0A 2JZRA 2VLUA 2J23A 3HD5A 1R4WA 4ZBAA 7GSSA 3BD2A 3APOA 2I3YA 1BQ7A 1XWCA 4OCFA 4F2IA 5F8BA 3Q18A 3EC3A 1SK1A 2R2JA 1QUWA 3GX8A 3IBHA 4IP1A 4DSSB 2PVOC 5B6MA 2I81A 2YV7A 3QMXA 1FG4A 2GQKA 3JCML 4WETA 2YPMA 3A2WA 2C4JA 1W89A 1RW1A 4TOPA 3U6VA 1U3IA 3F6DA 2HSHA 2RIIA 1SK0A 2MMZA 4PXOA 1NHOA 2LUSA 5D9WA 2E0QA 5H5RA 1ERWA 5A4UA 3FRCA 1VRSD 3SWLA 3EYTA 3DEXA 4NV2A 2DJ2A 4J57E 2B5XA 1AQVA 3H1NA 4ECIA 1PKZA 3TKPA 2HXKA 3NOFA 2YOIA 3RBTA 5G1KA 3LG6A 1AQXA 4CHSA 1WP0A 1YKCA 3QOUA 3HZ8A 5HR3A 1ML6A 1TRUA 1N2AA 5B8AA 4MH2A 3BOAA 1K0CA 4F0CA 1RQMA 4DVCA 2F3MA 2PMTA 4GQFA 3N5OA 3WGDA 2O89A 2LQQA 4OD7A 1J0FA 3R2QA 4YQVA 5IMZA 2MMNA 1XWAA 2FLSA 5DBQA 2AJQB 4AF2A 4CDOA 2H6ZA 2PBJA 5CRDA 4N0ZA 2XBQA 1WWJA 1OAZA 4MJBA 4POKA 1BX9A 2IFQA 2B1LA 20GSA 4D73A 3ZZXA 3L9VA 1EWXA 3UL3A 4TRXA 4MJCA 5EY6A 2MBTA 4YAPA 1PL1A 1X5CA 2N5FA 3IRAA 2PVQA 5J9BA 3NZNA 1TTZA 2LRCA 3D4TA 2BTOT 3WT1A 2V6KA 2F8FA 3GL3A 3M9KA 5GSSA 5IO2A 5F06A 4OO5A 5ID2B 1F3BA 3GN3A 2JSZA 3UVHA 2FWHA 1NHYA 3WGEA 1XIYA 5H5QA 4JBBA 1PSQA 4HDEA 3ED3A 3LGCA 5J9CA 1TRVA 1XWKA 2GSQA 2ES7A 1TK0B 4XS4B 3KXOA 4DSRA 4RI7A 5ABRA 3G7JA 2WFCA 1OE7A 3H8QA 1ERTA 4TN8A 3GKNA 4RUVA 4GRFA 2VLTA 4GTUA 4G9HA 4K7OA 1ILOA 2X64A 2L5OA 3ME7A 4WBRD 3UJ1A 1GSFA 3EMXA 4GCIA 3C1RA 4IHUA 4XHMA 4HU7A 4WXTA 1QK8A 3NIVA 3WD6A 1V57A 5B6NA 4ML1A 2XBIA 4RQXA 5LNKe 4EO3A 2PU9C 1A2MA 5GSTA 2AUVA 4L5LA 4PUFC 2L57A 1F3AA 3QFBC 3MWHA 2KLXA 1JZWA 3BJ5A 1YDKA 3VWVA 2K8VA 13GSA 5CYYA 3RPNA 4TR1B 3HVVA 1K3OA 4KGIA 2VCWA 1AC1A 4TKYA 4ECCA 1EZKA 3TJBA 3ZVJD 1URMA 1EV4A 3TKRA 1KBNA 4POLA 1O73A 1TU8A 5HR0A 3LXTA 1TK5B 1GSQA 1JZOA 2E2GA 2O8VB 2RUFA 4V2LA 3G9BA 2V41A 1GTUA 1X5DA 2LTKA 1GSEA 3GSSA 1U6TA 2XC2A 3FK8A 2CX4A 3IAS2 5JCWA 2GT6A 1Z3EA 1JFUA 3IC4A 5ECKB 5G1LA 3LSZA 1ZL9A 4XS6A 2JZSA 3VURA 3UARA 4QL7A 2BMXA 2PWJA 3HDCA 4ECBA 6GSVA 1QXHA 1GLPA 2WJUA 1O7UA 4YQMA 3LFLA 3S9FA 4JEDA 2YP6A 2ON7A 2G2QA 1F9MA 3FZAA 1M7TA 2NVLA 1AAZA 4J56E 2X99A 2EIQA 5G5EA 3GIXA 1A2JA 2RLIA 2H30A 4L0UA 2EIOA 4IJIA 2DMLA 2LRNA 1TKDB 3RHBA 2FA4A 1WJKA 1ZYEA 2IMKA 3ZRDA 3ZIVA 3HHVA 1MEKA 4IP6A 2H72A 3ZMKA 3BBYA 4G2EA 3UBKA 3KMNA 3IPZA 3VI5A 4O7HA 3F4TA 5D9VA 3F9UA 1SL2B 3PGTA 4NHWA 4BWQA 2KP2A 3LWAA 1M99A 5ECPB 1Z7PA 5AIVA 2CZ2A 4MF6A 3DD3A 5KN2A 5E4WA 1ERVA 5JCGA 2WZ9A 3CRUA 3C1SA 3US3A 1YEXA 1V9WA 2OKAA 1GLQA 1UC7A 3D4MA 2DJ1A 2VCQA 1GUMA 3CSJA 3C8EA 3UIWA 1TU7A 3FZ9A 2HZFA 2JZTA 1F6MC 4BA7A 2H1DA 4IELA 2JU5A 2KP1A 1GSSA 1ST9A 5F07A 1PD21 4Q5NA 1DSBA 4V1Ap 3E0UA 4IN0A 3WYWA 3GHAA 2KUCA 1A24A 4OFNA 16GSA 3MDKA 1R5AA 1T4ZA 2IFQB 1SJZA 2NBSA 6GSWA 5GAPD 5ECMB 4GQCA 1O6JA 5B7CA 4ULXA 4D73B 1B8XA 1PL2A 5KN3A 5AISA 2YANA 2IMIA 1YZXA 1GL8A 4K2DA 5CO3A 4AJ8A 1ZMAA 5J5NA 1CQGA 2CAIA 3D21A 3VLNA 5ECIB 1EV9A 3HVXA 2NDOA 3GL5A 3E3EA 4GWRA 4ZL8A 4KB3A 1UN2A 4XTSA 3ME8A 3TRXA 1SD8A 3IK7A 4ZB9A 3TUEA 3DGQA 1A23A 4XS1A 1OE8A 1JLWA 2P31A 2WCIA 3TKSA 3TJKA 4LL4B 2H0GA 5DQSA 1ZCPA 5DAKA 1M2AA 1X9WB 3F3RA 1OC9A 3KCMA 4IS0A 1SYRA 3ZFLA 3L78A 2FUG2 5A4WA 2H74A 3QR6A 4MDCA 5FT3A 2P5QA 2GS3A 4EDZA 2H1GA 4LA1A 4NHZA 1YF0A 1TJDA 2AHEA 4HQSA 2RM5A 3J7Yk 3HJMA 4KCAA 4MF5A 2WRTA 2IMEA 4K0NA 1OKTA 1X9SB 4I2TA 5DVBA 2VM1A 4CW9A 4F03A 4MF7A 4MJEA 2XPEA 2DJ0A 1GTIA 3IDVA 4N30A 2H70A 4PURA 4JU5A 5CREA 1SK2A 2Z9SA 5L71A 3IXRA 2LJKA 2MBSA 4IW9A 3K8NA 3MAKA 2LEGA 3KTBA 5CNWA 2H66A 4GSSA 3HA9A 1O81A 3Q19A 2WDUA 1F2EA 14GSA 3ZVJA 2K8SA 4EDYA 2XPDA 3TRQA 3ERGA 1X5EA 2LJRA 3TJJA 1M2DA 2OJLA 1PX6A 2YWMA 3VPQA 3QD9A 4AGSA 4PX1A 5EVOA 2CAQA 4ZL7A 3VWWA 2DLXA 1T7PB 1GSUA 5ECHB 2IPAA 4KA0A 4V1Ag 2H0IA 3LJRA 3IK9A 5HFGA 3GURA 1WMJA 5IMVA 1XW6A 3HXSA 4E8EA 2MYGA 5H5SA 1ZYQB 2JL4A 2H6YA 2LJAA 3FR9A 4MP4A 3F0IA 2GSTA 2FCHA 3EU4A 4TXVA 4EL1A 2CQ9A 2JSYA 4MZWA 2WULA 4NAXA 2F8AA 5DJLA 1SU9A 1GTAA 3RDWA 1A0RP 1J9BA 3I43A 5IQYA 4LMVA 2IJYA 4ZILA 4TW5A 3IOSA 3HCZA 2PGTA 3IR4A 3E9JB 3EE2A 1X0RA 1O8XA 2DC5A 5D9XA 1XW9A 4HUAA 1XWBA 3KJYA 3LEFA 4KSOA 3MNGA 3VPTA 4WBJA 3A3TA 4HS1A 1KNGA 4ZB6A 6GSTA 4YQUA 3DYRA 3RAZA 1UA5A 1V2AA 3CBUA 1YY7A 1M2BA 1K0BA 3APQA 2GT5A 4GLTA 4N0VA 3GKXA 2C0FA 4MMMA 5GZZB 2H8LA 2PN8A 3HVSA 2TRXA 5DALA 1EEJA 4X0XA 1AW9A 5CRWA 4X43A 3BCKA 4K9ZA 5IMAA 2VO4A 3KEBA 5CP1A 3ZIJA 3FZ4A 4JR6A 4MK3A 2LS5A 2FY6A 4OCEA 4L5OA 4OMVA 1FHEA 3CRTA 5IMDA 1MTCA 2TIRA 3GMFA 1XBSA 1Y6EA 4LL1B 3M1GA 2DIYA 2H19A 2NTOA 1GULA 2I1UA 2VL2C 1MDJA 4JRRA 1A8LA 4OFTA 3DVXA 9GSSA 1Q4JA 1ON4A 3EINA 5B8BA 3H4KA 6GSSA 2QGVA 1GSDA 2I4AA 4WF5A 3P8WA 2X8CA 4I8BA 5JWOB 4EVMA 1OVNA 1XVQA 3GTUA 1B4PA 1Y25A 5G30A 1PMTA 5A4VA 4G19A 3ISOA 3L9SA 1H75A 4IVFA 4LLRA 2B6MA 1FB0A 3CTGA 4FO5A 4FH8A 5A5KA 2GSSA 3QFAC 3H79A 2ZUPA 2IWTA 3TJFA 3PR8A 2H71A 1SYXA 2H76A 4TR0A 3ERFA 3TKSC 1VF1A 1PA3A 3L0HA 1U88A 3GV1A 2IN3A 4MABA 3LXZA 3QPMA 2VM2A 2GTUA 5DCGA 4EE0A 1YKAA 4NWYA 3DMLA 2OE3A 5LCZA 3PINA 1AUCA 1R5PA 1M9AA 2CA8A 3WT2A 5DAKB 4XRDA 1OC9B 1SL0B 1PKWA 4PQIA 1TRWA 2GZZA 1XWGA 1DE1A 2MMAA 4EF0A 2X8HA 1THXA 1EEMA 4KUNA 2ZCTA 1VF4A 1U3AA 1F37A 2V1MA 3KMOA 2E2MA 5INYA 2G0FA 3Q6OA 3ZMLA 2VCZA 2VUPA 1KTEA 2YWNA 4KH7A 3GSTA 3TCOA 2JACA 1GRXA 2EIRA 3ZFBA 5ECOB 2YWOA 4OWYA 1SENA 1MD4A 2DIZA 4WF4A 1GH2A 3TJGA 5E59A 3DWVA 2WGRA 2DJ3A 5ECNB 2HNLA 3LQ7A 2HI7A 17GSA 4G10A 5ELAA 2GVPA 3HKRA 3DKSA 1QMVA 4V2MA 2FWGA 2NPBA 1YQ1A 1A8YA 4WR4A 2H6XA 2CVKA 3FR3A 6GSXA 3HJPA 3F4RA 1AIUA 2HSYA 1Z5YE 2RUEA 5CRHA 1Z6NA 3VI7A 3D22A 4ISDA 5J3RA 4TXOA 1T00A 4K7IA 2N5BA 5ECLB 2O85A 3IAM2 5IIZA 1HYUA 3DXBA 1A0FA 5DJMA 3FYGA 2L4CA 1TI1A 1GNWA 1PN9A 2IMFA 2PUKC 5ECRB 2O7KA 3V1WA 4ZL9A 3ZLPA 5JWQB 4KCEA 2K18A 1MDIA 4F82A 5F05A 3F6FA 3UBLA 2VLVA 3EMPA 4IQAA 3VWUA 4FYUA 3LYKA 4BPYA 3F8UA 3KP9A 2REMA 1CQHA 3M0FA 1HNAA 4RI6A 3VWXA 1XPVA 1GWCA 3HYPA 2R3XA 5G5FA 3L9UA 1V98A 3RPPA 3KH9A 2H73A 2QSIA 3GNJA 2ALBA 3GFKA 18GSA 4HZ2A 4L8EA 4AJ7A 1TRSA 1T1VA 4GSTA 4HJMA 2GDRA 4WEYA 1FW1A 4KDUA 2WB9A 3UMAA 5KN0A 4Q5RA 2VL2A 4K7NA 2A4VA 1G0TA 4QQ7A 4GF0A 4AJ6A 2L59A 4IKHA 2HZEB 3FHKA 3TRPA 3MSZA 3UOMA 2YJ7A 1ACVA 2HRNA 3ZREA 2X8GA 2IL3A 5DALB 3KGKA 3QAGA 2H0HA 4MH3A 1WE0A 3O6TA 1TP9A 3O76A 5D9TA 2LKUA 3P90A 2VCTA 1PGTA 2YZHA 2GQMA 1UVZA 4ZB8A 2VCVA 2K9FA 5IMCA 4I2UA 4WR5A 1V40A 1R26A 2VD1A 3EURA 1YF1A 1LU4A 4XCSA 1FOVA 1W4VA 2DSAA 2VL3A 2J9HA 2L6CA 2OE0A 1GSYA 4MA9A 3D6IA 1XVWA 5D8IA 1YJ6A 2LSTA 1TK8B 2L5LA 3GTUB 1I5GA 1GNEA 4Q5QA 2OACA 4PQ1A 3DVWA 4TR4A 2GZPA 10GSA 2KOKA 2XHFA 3FZ5A 3VK9A 3UAPA 5IM9A 3A2XA 1SKWB 2VAFA 1WPIA 2C0DA 3CXGA 2LNSA 2PPTA 1B9YC 2KHPA 4ZBDA 4TVEA 1GTBA 4GSNA 3FW2A 3KD0A 2L4QA 1T3BA 1EP8A 1V58A 4BVXA 4ILFA 1OC3A 3TOTA 2FWFA 3ZTLA 4ACSA 3P2AA 3I6AA 8GSSA 1FVKA 2CV4A 3KP8A 2C3NA 1MDKA 1G7EA 3HY2A 1TDIA 3W8JA 1GUHA 2M72A 1WRYA 2LV3A 3D0ZA 1EP7A 2H1AA 6GSYA 4F9ZA 1OC8A 3CTFA 4NPBA 3IV4A 2R6KA 1FO5A 2C1YA 1EOGA 3TKSE 1ZGNA 5EL8A 3M8NA 4KW6A 4FIWA 1VF2A 4ZXGA 3CYNA 3U5RE 3LYPA 2IMDA 4MCUA 2C3TA 1BYEA 2A2SA 3EU3A 1OKDA 1GUKA 4POMA 2CX3A 1OYJA 4N11A 1QGVA 1G6WA 1JZDA 5J4UA 4PGTA 5HQPA 2YJHA 1DE2A 2AYTA 3FR6A 1TXXA 2YV9A 1WIKA 1WOUA 2C3QA 2YN1A 3C73A 5IOWA 2GSRA 4JZQA 2A2RA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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