1J0FA

Solution structure of the sh3 domain binding glutamic acid-rich protein like 3
Total Genus 25
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
25
sequence length
100
structure length
100
Chain Sequence
GSEGAATMSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRTLAGNPKATPPQIVNGNHYCGDYELFVEAVEQDTLQEFLKLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution Structure of the SH3 Domain Binding Glutamic Acid-rich Protein Like 3
rcsb
molecule keywords SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Mus musculus
total genus 25
structure length 100
sequence length 100
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04908 SH3BGR SH3-binding, glutamic acid-rich protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1j0fA00
2X8CA 3FR9A 2LSTA 3O6TA 1GSEA 4OCFA 2IWTA 1SL1B 3TCOA 3IE3A 4H86A 2YZHA 3ZFBA 2K8SA 1WE0A 4JZQA 2ZCTA 3UBLA 3UAPA 4G2EA 3C73A 3DVWA 1SK1A 2LJAA 4KCAA 1PA3A 5B6NA 4FYCA 1SYRA 4NAXA 5FHIA 3QAWA 1G7OA 2I1UA 3BJ5A 1MDKA 2IMIA 2YNXA 2VD0A 3UVHA 2KLXA 4BVXA 4DSRA 4RI6A 3MNGA 1AUCA 3GRXA 3L9SA 4JE1A 3UMAA 1UN2A 1ABAA 2BMXA 4XS4B 5C00A 3SWLA 1U88A 4YAPA 4N0VA 4V1Ag 2CX4A 1MEKA 1NW2A 3M8NA 12GSA 1R4WA 4V2MA 1I9DA 4FIWA 3I69A 3J7Yk 4KA0A 3BCKA 3KMNA 4K7OA 4NV2A 3TB2A 3LWAA 2M80A 4AGSA 3PINA 3L78A 1VRSD 3CSHA 2VIMA 3FZ9A 1AQWA 5A4VA 3GX0A 2VCQA 2A4VA 1F6MC 4NHZA 3HZ8A 5JCGA 1SJ6A 4BA7A 2M46A 1OC9A 2O7KA 1EV4A 3C8EA 2PGTA 1HYUA 2O89A 2NVLA 3D4MA 3EINA 4D73B 3KP9A 1ZYEA 3ZMKA 3LGCA 4TXOB 1KEBA 3D6IA 4IP6A 3DWVA 1XWGA 2YV7A 1PL2A 4O92A 4TW5A 4WETA 5EVOA 1F3AA 4WF4A 3FZ5A 4ZB6A 2JZSA 2FA4A 3TKSA 3ME8A 2OBKA 1N2AA 4DSSB 5AGYA 1BYEA 3TKPA 2DC5A 4X0XA 1TOFA 2E2GA 5CRHA 1URMA 5H5QA 5ECIB 1TRVA 1SD9A 1GNWA 4L0WA 1M9BA 3VWXA 4HDEA 3RBTA 2H19A 4MCUA 4PQ1A 5INYA 5IM9A 2FY6A 1OYJA 2I9HA 1AIUA 2GSSA 1S3AA 4BWQA 2QC7A 4JEDA 1G7EA 3MAKA 3QFAC 2CVKA 5HFKA 1XFLA 1SJZA 5DJMA 4E8EA 3GMFA 2GVPA 2WS2A 5ECNB 4JU5A 2OJLA 3E0UA 4I97A 3TRPA 5DALA 2VLTA 1R7HA 3F63A 4LL4B 2AAWA 1PKWA 2OADA 5IO0A 2OE3A 1VF2A 5H5SA 5KN1A 1A23A 1W89A 1GUHA 3EVIA 3ZTLA 3FW2A 4G9HA 5LD0A 1ILOA 4TR3A 2YP6A 2B7JA 3GSSA 1BQ7A 1PRXA 3ZREA 1ZZYA 1JLVA 2GS3A 3QR6A 3GFKA 4ML6A 3VWVA 4NXIA 1SK0A 2RIIA 4F03A 4OD7A 1WIKA 1A2LA 5IQYA 4IJ3A 2MBSA 2PVQA 3P2AA 3GN3A 4EE0A 1X9MB 4G19A 3ZVJA 5D73A 1K0DA 1E6BA 5IMAA 1UVZA 1IYIA 3LXZA 3LYPA 4XTSA 2V32A 1TI1A 2H1GA 1TK5B 5CP1A 2R2JA 5JWQB 2H0IA 5G30A 4OO5A 5D9TA 5DJLA 1B8XA 3VWWA 1RW1A 1FAAA 3ZRDA 2VLUA 3CXGA 1TU8A 2C4JA 2ZNMA 1PN9A 1HD2A 4L5OA 2IFQB 5AN1A 3QDNA 3APQA 5IPHA 2FGXA 3FHKA 2FCHA 4WR4A 1HNCA 2B1KA 2MMAA 3FR3A 2H73A 2AV4A 4EDYA 2ALBA 2F3MA 5HR2A 3WT1A 1TRSA 3BOAA 1WMJA 2L6CA 5ECPB 3ERFA 4GCIA 4MJEA 4WR5A 5DCGA 3TOTA 2VD1A 4NPBA 2LEGA 3KJYA 4TN8A 1M2AA 2N5AA 3N5OA 3CMIA 2YJ7A 5ECRB 5CREA 3HKRA 4DSSA 4EVMA 1QGVA 3F9UA 2TRXA 3LXTA 3UEMA 3KCMA 4MA9A 2H70A 1GSUA 4HOJA 4G10A 4IBPA 1XPVA 3HZ4A 1HNBA 2H74A 2LS5A 3GSTA 2WULA 4KNDA 4HU9A 4MF5A 4MZBA 4IW9A 1JHBA 1FG4A 2YZUA 2H30A 4GWRA 5H5RA 5HFIA 3GIXA 1GP1A 6GSVA 4GSSA 2YWMA 2XPDA 5EPFA 3ED3A 4EKZA 1QQ2A 1I5GA 3E3EA 1PKZA 5GAPD 4EO3A 2VCTA 3O3TA 2IMDA 1ERUA 3JCML 4TRXA 4KSOA 2C0FA 5DDLA 1M2DA 1GSDA 2LNTA 3DVXA 1YF0A 5HFGA 3NIVA 3KD0A 1RK4A 1EEJA 3FY7A 1FO5A 3M0FA 1OVNA 2F8FA 3QOUA 3SBCA 19GSA 3EU3A 1CQHA 4J57E 4POKA 3J7Yb 3VI7A 2B1LA 4J56E 5B7CA 1S3CA 3N9JA 3A3TA 3DRNA 5DAKA 1T1VA 3GURA 1USBA 3UIWA 1A0FA 4ZILA 1V57A 1ERTA 4PX1A 3A2WA 1KBNA 2H8LA 3IRAA 4F82A 2VM2A 2HRFA 4KUNA 1BAYA 1TW9A 2VL2C 2HI7A 1B9YC 3CTFA 4IP1A 6GSXA 1X5EA 3MDKA 3A2VA 3ERWA 1W4VA 2VUPA 2LKUA 6GSTA 2RUFA 1OKTA 2KUCA 4TR4A 3FK8A 5ELAA 2CVBA 22GSA 1PQNA 1GSQA 4LLRA 1SENA 4GRFA 2HNLA 2H6XA 5COHA 3C7MA 4IKHA 4AJ8A 3I9V2 3CRTA 5D96A 2C0EA 2GSTA 2MBTA 4ZL7A 1S3DA 3ZMLA 3FYGA 1AXDA 2BTOT 4EXJA 2FUG2 3ME7A 1YY7A 2IJYA 3G9BA 3HA9A 1THOA 2PU9C 2IMEA 4NMUA 5CYYA 4MK3A 3WYWA 1PL1A 4F0BA 2FNOA 4KDUA 5F0GA 2V41A 1XWAA 2K9FA 5KN3A 4MZCA 3GH6A 3GH9A 3US3A 2GLRA 2FWEA 2XC2A 2HSHA 3Q6OA 2PMTA 4DVCA 1EZKA 3KIJA 1Q4JA 3FR6A 2PN8A 3KEBA 3HJPA 2RUEA 5J9CA 2H01A 3DIEA 1KNGA 1SL2B 2VO4A 1A0RP 4GQFA 2IIYA 4N0ZA 1TK8B 4MF6A 1JZWA 2KHPA 3ZVJD 1SD8A 2G0FA 3C71A 3LFLA 3IK9A 3ZL5A 2MMZA 2PUKC 2F8AA 2DJ3A 2HZEA 2B7KA 2C1YA 7GSSA 2CX3A 5ECMB 5CO3A 4TOPA 1GUKA 4WEYA 1B4QA 2XHFA 2R6KA 3D4TA 3GNJA 3V1WA 4OO4A 1OE7A 2I3YA 3QFBC 3CRUA 2JZRA 3TKSE 4K8MA 4MZWA 3TGZA 2TIRA 3ERGA 1YF1A 4CW9A 3C1SA 5EL8A 4FO5A 4IGJA 1WJKA 3HY2A 5ECKB 5F07A 1R5AA 3ZLPA 5ECSA 3LQ7A 2E7PA 4YQMA 3VPQA 3GKMA 3FKFA 5CRWA 5J4UA 4IJIA 2WRTA 4XIHA 4N11A 4RQXA 1ST9A 2O87A 3KM6A 1UA5A 3WGDA 2H1DA 3F8UA 3GKXA 2HXKA 1NSWA 3HVSA 1C72A 3KXOA 3S9FA 2LJKA 4IN0A 4TKYA 1NM3A 1DSBA 3FZAA 4Q5NA 4TR1A 3TOUA 2XBQA 3EU4A 2GZZA 2DMLA 4EUYA 14GSA 4BL7A 4EC0A 1EGRA 4O7HA 2FA8A 3IXRA 1DUGA 5IPGA 6GSYA 4HUAA 3GTUB 1VGLA 2X8HA 3EYTA 3HCZA 1TXXA 4CHSA 2G2QA 2GQKA 4KDXA 3IOSA 1GLQA 1YKAA 2YV9A 2WGRA 1G6WA 4IELA 3TJJA 1YKCA 2H0GA 4MF7A 2C3QA 4EL1A 3DMLA 1ERWA 1TKDB 5FWGA 2H75A 1XWBA 2YANA 1G6YA 2X99A 5IMDA 2MMOA 1PGTA 4KGIA 4V2LA 8GSSA 3OR5A 5AIVA 5CRGA 4HEA2 2AUVA 2V1MA 1XVWA 5D9XA 1B9XC 1GTIA 4ZBAA 2MMNA 2IMFA 1M9AA 5G5EA 1O85A 2YPMA 1F37A 4GSNA 3UOMA 4LL1B 2V6KA 1EP7A 1GNEA 2R37A 3HVVA 3P7XA 5D8IA 3E9JB 1U3AA 1QMVA 3H79A 1LU4A 2A2SA 3NOFA 5JCWA 3KP8A 5IMCA 1GSFA 1XIYA 2IN3A 3HD5A 3F4SA 2EIQA 4HZ4A 4MP4A 4XS4A 2ON5A 2NDOA 3UJ1A 5GAND 4GSTA 1AQXA 3ZYWA 3K8NA 5D9WA 3KTBA 4PXOA 1M0UA 4IQ1A 4I5QA 2HRNA 1ZYQB 1K0OA 1M7TA 2A2RA 2FWGA 3C1RA 3ZITA 3U6VA 1JLWA 4LA1A 1EWXA 3VK9A 1TDIA 4ZBDA 1DE2A 5HR3A 2VL3A 3RHBA 2VAFA 3FZ4A 1H75A 5DQSA 1QUWA 4NWYA 3TJFA 3HXSA 1XWCA 4ID0A 1YDKA 3IA1A 1T00A 3L4NA 2PBJA 4POBA 1GULA 3IHQA 4WF5A 2FLSA 5FT3A 3TKSC 1MD3A 3F6FA 2L4CA 3IC4A 5F8BA 2R3XA 4D73A 1PX6A 2HZFA 4KAEA 2AHEA 4TXOA 3MSZA 1YEPA 2H71A 5ID2B 2N5FA 5LCZA 2X8GA 3G7IA 1R5PA 3A2XA 4QL7A 3HYPA 2E0QA 1O8WA 5JWOB 1GTUA 1WOUA 2GDRA 3NZNA 3HHVA 4HQZA 2PWJA 2P31A 4XS6A 1T7PB 4I2UA 2H1AA 4HU7A 3P8WA 4TXVA 1ML6A 4HJMA 4PGTA 4NHWA 1EOHA 3IK7A 3RDWA 3IR4A 4WBRD 1EEMA 1FHEA 4K1FA 1YEXA 1A8YA 4KH7A 2P5QA 5DCHA 1K3LA 4YQVA 4ILFA 1TRWA 2EC4A 4Z7XA 5A4UA 1EGOA 1HQOA 4MPGA 1GTBA 3DEXA 3FEUA 3LORA 2H6YA 4POLA 3F6DA 3KH7A 3H1NA 4ECBA 1TK0B 4ISDA 5B8AA 2HT9A 3L9VA 3LEFA 4AF2A 5ELGA 4ZL8A 1MDJA 1XBSA 1SKWB 5CRDA 2WDUA 2JZTA 3HJOA 3CSIA 1GTAA 4GTUA 1M99A 3EWLA 4WXTA 2K8VA 13GSA 5AISA 5E59A 3D5JA 5JWRB 2Z9SA 1A2MA 1PX7A 3TKQA 1ACVA 2DIYA 3AY8A 2GSRA 1JFUA 3LSZA 4MPFA 1A2JA 4ACSA 4PUAA 4ZIJA 5HR1A 1Z3EA 2C0GA 1CQGA 1XZOA 4MH2A 2IMKA 3PR8A 3TUEA 3QPMA 3Q74A 2C80A 1J0FA 3G7JA 1OC8A 2GGTA 1X5CA 2ZUPA 4WBJA 1K3OA 2B6MA 2FWFA 2QGVA 4KX4A 4V2NA 2L59A 2GZPA 2D2ZA 1X9WB 1FVJA 4GF0A 1B4PA 5D93A 2MYGA 2J9HA 3TRXA 2BJXA 4GXZA 5LNKe 2IPAA 2AYTA 2YOIA 3VI5A 5IIZA 5L71A 2LRNA 1V9WA 3H8QA 16GSA 4HS1A 2LRCA 4MJAA 2PPTA 2VL9A 4DSQA 4IVFA 2P5RA 1QFNA 1TTZA 2LRTA 3IPZA 1OC9B 4L8EA 3W6GA 9GSSA 1OE8A 5F06A 1SJIA 2B5YA 2F9SA 1TJDA 1X9SB 3O76A 1FOVA 4F2IA 3TJGA 3DKSA 1AW9A 2V2GA 2IFQA 2CAQA 3ZIVA 1QXHA 1K0AA 6GSUA 2AB6A 4ZB9A 4KB3A 1MDIA 2B5EA 1ZCPA 1JZDA 5GSTA 3VLNA 3M3MA 1SYXA 2HFDA 1DE1A 2GQMA 5ECOB 4PNGA 2DMMA 1BJXA 1U87A 2DSAA 4MJBA 5IOWA 3UBKA 2H66A 2VCXA 1NHYA 4EDZA 6GSWA 2REMA 5ABRA 2XPEA 3TJBA 3TJKA 4IQAA 1R26A 4J2FA 1VF3A 2O85A 1G0TA 3F0IA 4Q5QA 4BWSA 2EIOA 1H4OA 1TP9A 2H1BA 20GSA 3KGKA 3F3QA 4XRAA 1A8LA 3IAM2 1WP0A 5G5FA 1XCCA 3QD9A 1Y25A 4ZXGA 5GZZB 4OCEA 5DALB 4XCSA 4ULXA 2WB9A 5ECHB 4IHUA 2X64A 2LQOA 2NTOA 4MH3A 3HDCA 3QCPA 1ZL9A 2YN1A 1ZMAA 3EURA 4FH8A 5CNWA 2KOKA 1GSSA 4PQHA 2AJQB 3VFIA 3H4KA 3GV1A 5A4WA 1ERVA 1T8EB 4JBBA 2WCIA 1T4ZA 2GT6A 1U6TA 3DD3A 1Z9HA 1OAZA 1QK8A 3UVTA 2V6OA 2OE0A 4V1Ap 2CA8A 5CAXA 2C3NA 1GLPA 4KDYA 1BX9A 3L0HA 2TRCP 2QKEA 3WGXA 3EE2A 1BG5A 2QSIA 2I81A 3M9KA 4X43A 1SU9A 1E2YA 5B8BA 2DJ0A 1T3BA 2JADA 1MTCA 1ON4A 3APSA 5G1KA 2OE1A 4ML1A 1GUMA 2DJKA 4XHMA 5F05A 1PSQA 3TRQA 2OA7A 3G7YA 1F9MA 1FVKA 2YWOA 1Q98A 1THXA 1GRXA 3EMPA 1O73A 1BEDA 2N5BA 5C04A 4ZL9A 1Y6EA 2LUSA 2VOCA 1VF4A 1MD4A 5EY6A 3LJRA 1Z5YE 2H6ZA 3APOA 5J41A 2I4AA 2VLVA 1XW5A 1J08A 2OBIA 3R2QA 3H93A 3RPNA 1V40A 1WRYA 5ECQB 4Q5RA 2JACA 1JZOA 2F51A 2CZ3A 3PH9A 5GSSA 3ZZXA 4IS0A 1O7UA 1B48A 1Z7RA 2H72A 2CQ9A 1K3YA 4KE3A 1V58A 4K9ZA 5DVBA 4ECIA 2HYXA 2CV4A 3WGEA 3BD2A 3DXBA 1N8JA 2H0HA 4DEJA 3U5RE 1O81A 3GUSA 3ISOA 3CSJA 2LNSA 5HQPA 2IL3A 4BPYA 3EC3A 4I2TA 2GZYA 4HI7A 1V98A 1XOBA 4TVEA 5KN0A 4RI7A 4ECCA 3LYKA 3IAS2 4I8BA 4Q5FA 3VURA 1K0BA 3D21A 3DGQA 4K7NA 4AJ7A 4WKWA 2YWNA 1WWJA 1YJ6A 3GL5A 3UARA 1IYHA 5J3RA 1ZOFA 3MWHA 4MDCA 1WPIA 3GYKA 4KSMA 3HJMA 5ECLB 3VPTA 3ZIJA 4JR6A 1LJRA 3RAZA 1Z7PA 3GKNA 5DQYA 5G31A 1AQVA 2LQQA 3A5WA 4ZBBA 1SKSB 4PNFA 3ZFLA 2VCVA 2L57A 1XXUA 4JR4A 3F4TA 2L6DA 2PVOC 2YCDA 5KN2A 2GQLA 2OACA 2VM1A 3P90A 3GKKA 2C0DA 3IBHA 4RUVA 5B6MA 4F9ZA 2VCWA 4MLYA 3HVXA 3CTGA 4XRDA 4O5RA 3BBYA 5DAKB 2LV3A 4PQIA 4K0GA 1K0CA 2R4VA 4TR0A 1SK2A 3F3RA 1K0NA 1AC1A 1Z6NA 2H76A 2YJHA 3GA4A 3RHCA 4RQRA 1Z6MA 1FB6A 2K6VA 2HLSA 2DIZA 5E4WA 1JZRA 1X5DA 5J9BA 4N10A 2DBCA 5D9VA 1SL0B 1J9BA 3Q19A 3LG6A 2VL2A 4I6XA 5IMFA 3KZQA 1EV9A 1RQMA 2VCZA 5G1LA 4OFNA 3GTUA 5IMVA 1TI3A 4P3YB 1EP8A 5ENUA 4LMVA 4ZB8A 1KTEA 2GTUA 2O8VB 4GQCA 1K0MA 2R5GA 3M1GA 1GL8A 3QAGA 4FYUA 2CVDA 2B5XA 1U3IA 3GL3A 2P0GA 1HNAA 2EIRA 3Q18A 1GH2A 4KW6A 2J23A 2L4QA 4K6XA 4K7IA 2PERA 1YQ1A 1F3BA 3D0ZA 2DJ1A 2C8UA 4QQ7A 4X1UA 3WT2A 1TU7A 5KEJA 2FHEA 4POMA 4MABA 3I6AA 4OFMA 4OWYA 3M9JA 5IMZA 2RLIA 1GWCA 5JCUA 1LBKA 2B3SA 2NBSA 11GSA 1ZGNA 4LMWA 3RPPA 1AAZA 4L0UA 2LTKA 4N30A 2K18A 3KMOA 5J5NA 2HZEB 4PUFC 3CBUA 5G2ZA 2YWIA 2NPBA 2CZ2A 1FW1A 1XW9A 1XWKA 1OC3A 4HZ2A 4KCEA 1XOAA 2WJUA 2FD3A 4MJCA 2CT6A 4K2DA 3GHAA 3KH9A 4NV5A 1XVQA 2FWHA 3WD6A 4HJ2A 3EMXA 1OKDA 3TKRA 2HSYA 1A24A 4ECJA 1EOGA 4OMVA 2ON7A 3D22A 4EF0A 2KP2A 4K0NA 4XS1A 18GSA 1PD21 4GLTA 1O8XA 4AJ6A 4CDOA 5A5KA 2DJJA 2RM6A 10GSA 1PMTA 4FYBA 4PURA 3QAVA 4BVYA 3TDGA 2M72A 3IDVA 1FB0A 5IOXA 3VWUA 4YQUA 2C3TA 2DJ2A 2L5OA 1VF1A 17GSA 4TR1B 2L5LA 3GX8A 2JSZA 3UL3A 2DLXA 1XW6A 5IO2A 3BCIA 4QL9A 2CAIA 2ES7A 2HE3A 3KTLA 1V2AA 2GT5A 1SKRB 1F2EA 2WZ9A 3PGTA 2OKAA 1UC7A 4L5LA 3F4RA 5ID2A 3DYRA 2GSQA 1DBYA 2JSYA 3IV4A 3W8JA 2RM5A 5AIXA 1M2BA 4YH2A 1T4YA 2JL4A 4HQSA 3CYNA 1O6JA 2JU5A 1GSYA 2MZCA 2XBIA 4O32A 4JRRA 4MMMA 1TRUA 2KP1A 3W8SA 1X0RA 3L9UA 3QMXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite