1KEBA

Crystal structure of double mutant m37l,p40s e.coli thioredoxin
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKLIASILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Consequences of Replacement of an alpha-helical Pro Residue in E.coli Thioredoxin
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin 1
molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
total genus 31
structure length 108
sequence length 108
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1kebA00
5J9CA 2I1UA 1HD2A 3GSSA 4EUYA 4E8EA 5LD0A 3KTLA 3ZL5A 5HQPA 5B8BA 4TR3A 1K3LA 2HNLA 2H0IA 2O8VB 2NTOA 3F4TA 5EVOA 3D5JA 4MP4A 2VM2A 1FW1A 5ECIB 3CRTA 2XBIA 1ON4A 4FIWA 2A2RA 1VF1A 1A24A 1AXDA 3RPNA 4EDYA 2V41A 1R26A 4Q5QA 4F9ZA 1JFUA 2R6KA 2WFCA 4BPYA 2H0HA 1MDIA 3KM6A 1KTEA 3EMPA 1Z7RA 2CZ3A 4HZ4A 2J23A 5DQSA 2MZCA 1Z7PA 1DE1A 4K7IA 5KEJA 1V9WA 20GSA 1PN9A 1W4VA 3FR6A 2DC5A 2OBIA 2V1MA 4MF7A 1G7OA 3KCMA 3SWLA 3BCIA 4TXOA 6GSTA 2NPBA 1K0BA 4RQXA 1BX9A 1G6YA 3L9UA 4POBA 3KTBA 1WE0A 4NV2A 1JZDA 3LYKA 2VCQA 2I3YA 4PUFC 2K6VA 3IBHA 4OFNA 3HHVA 2PGTA 4PUAA 2DBCA 4MF6A 2RUFA 2X99A 2GT5A 1A23A 5ECRB 3IAM2 3M9KA 2GQKA 1WIKA 2CA8A 2X8HA 3F4SA 2H0GA 5D96A 4G10A 2BMXA 2OJLA 4TXVA 3NZNA 5GAPD 4LMVA 4V1Ap 3F63A 1OKTA 4KA0A 4OD7A 5B6MA 2HI7A 3KP9A 3QFAC 2XPDA 3TJJA 2NVLA 2H75A 1F6MC 3TKSC 2ES7A 5E59A 3WD6A 5F8BA 1ERWA 4K0NA 1GSEA 2WJUA 1YF0A 1GLQA 2WB9A 4L8EA 3APSA 4XRAA 2VUPA 5KN3A 3KEBA 1QQ2A 1K0DA 3WGXA 2BTOT 3IXRA 2CV4A 5JCGA 2P5RA 3HYPA 4NPBA 4IKHA 2N5BA 2H30A 3NIVA 2YJHA 1TXXA 2YN1A 4HU9A 4BA7A 1JHBA 1AIUA 4ZB6A 3MDKA 2VL2A 1U3AA 2H6YA 3VURA 2OKAA 3GSTA 5IO2A 4IHUA 3ZMKA 2DJ2A 2DLXA 4DSQA 2V6OA 1V98A 4I97A 4OFMA 4O32A 3BD2A 11GSA 3QD9A 4KUNA 5ECLB 2H1DA 1GH2A 1ZL9A 5IOXA 1GNWA 1H75A 3VPQA 2HSYA 4YQUA 2F8FA 4I6XA 1YF1A 2DIYA 5IMCA 1SKWB 5IMAA 3GH6A 1EGRA 1JLVA 3WGDA 4KE3A 2B5EA 2GVPA 1WRYA 1XWKA 4V2MA 5H5QA 2GSTA 4JR6A 1EV4A 3Q19A 5ECOB 3WGEA 2B5XA 2WZ9A 5GSTA 2YCDA 2VIMA 1ZMAA 3IR4A 3ZZXA 3IHQA 3DVWA 3LSZA 3M9JA 1FB6A 4DSSA 2MMNA 3ED3A 1DE2A 4HUAA 5A5KA 7GSSA 1U6TA 1KNGA 3IK9A 1GSYA 2ALBA 4ULXA 3RDWA 4IJIA 3D4TA 1QK8A 2MMZA 3ME8A 4WBRD 5JCUA 4G19A 2R5GA 2YV7A 5D9WA 1F3BA 1J9BA 2VD1A 2WDUA 4ECBA 4JEDA 2WGRA 3UOMA 3APQA 3J7Yb 4YH2A 4IP1A 2OACA 1Z5YE 3APOA 3BJ5A 5ELGA 2EC4A 1T1VA 4GSTA 4XS4A 4AJ6A 5F07A 5IMDA 3VWUA 1GL8A 1GUMA 1K0MA 3CTGA 2CVDA 4MF5A 2RIIA 3QOUA 3BBYA 1N8JA 3MAKA 5DAKA 4ECIA 4KAEA 1GP1A 3DIEA 4WKWA 2H1AA 1TRUA 3HJPA 1XBSA 4MDCA 1O81A 3DWVA 4POKA 3IK7A 1FHEA 5HR3A 1PD21 4GLTA 2FCHA 4HI7A 4BL7A 4L0WA 2JADA 1XOAA 1EWXA 2OE3A 4KDYA 2TIRA 3ISOA 2AHEA 1PL1A 4KW6A 3TJFA 5HFIA 1HNBA 4NXIA 4TKYA 4FO5A 4RI7A 1TI3A 4FYCA 3IV4A 1THXA 2H74A 3E3EA 4X1UA 4GWRA 3HXSA 2K8SA 3HY2A 1TTZA 2GQMA 1WWJA 1BEDA 1PGTA 2IN3A 3H79A 4PXOA 4RQRA 1AC1A 1TRWA 2B7JA 3W6GA 2YWOA 4TR1B 4KDXA 3L78A 3TKPA 1GSDA 3VFIA 3F0IA 1C72A 3FZ9A 4NMUA 4ZXGA 3UARA 1RW1A 5E4WA 4PQHA 1FOVA 4K1FA 2C3QA 3TUEA 2EIQA 4IVFA 4XCSA 4AJ7A 1TW9A 5ECHB 1OC9A 2E0QA 1USBA 2FWFA 2G2QA 5DCHA 3RPPA 3IC4A 2H76A 2K8VA 2HZEA 2C0GA 4HS1A 4ZB8A 1M9BA 1SD8A 3HDCA 2CX4A 3LGCA 2G0FA 1B9XC 4X0XA 3TKRA 5G5FA 2YPMA 1SKRB 3M1GA 2F8AA 1G0TA 3KP8A 2FWEA 4IQ1A 3R2QA 5ID2B 3TB2A 2LJRA 5J41A 1MDJA 3ZITA 2V6KA 2C4JA 5CRDA 2LV3A 4HZ2A 3U5RE 3UBLA 4HQZA 1QMVA 4BWQA 3GKKA 4KH7A 4KNDA 1SKSB 3A5WA 4F82A 3P8WA 5CRWA 3UIWA 5JCWA 5ENUA 2H8LA 1SYXA 4P3YB 2LRTA 5A4UA 3EE2A 1M9AA 2AUVA 10GSA 2GSRA 2WULA 2LSTA 4XRDA 1JZWA 3W8JA 2GDRA 1Y25A 1X0RA 3EVIA 3I6AA 4N10A 4AJ8A 2LJKA 3G7IA 5L71A 5ELAA 2LQQA 1EV9A 3GTUB 1S3DA 5COHA 1SD9A 4OO5A 3FW2A 3IPZA 4XIHA 4PURA 2C3TA 1M2AA 2MBTA 3ZLPA 4KGIA 4F0BA 2PU9C 3HZ8A 4JE1A 4V1Ag 3O6TA 8GSSA 1XWGA 1Q98A 3C1RA 2N5AA 1I9DA 1VGLA 2HZFA 3ZFBA 3IAS2 4IW9A 1V57A 3F8UA 1FVJA 2YZHA 4BVXA 2GLRA 2HYXA 4ML1A 1ACVA 4N0ZA 1O8WA 3VK9A 1B9YC 1XWBA 1U88A 4YAPA 1PKZA 1T8EB 5DJLA 4EKZA 2D2ZA 1T4YA 1QFNA 5B6NA 5ECNB 2P0GA 3I43A 2YOIA 3VWXA 3BCKA 4K6XA 1XFLA 3DRNA 4BVYA 4ZIJA 1OVNA 2R37A 1OKDA 1UC7A 2H19A 1VF4A 4PQIA 1RQMA 1XW9A 5D9VA 3U6VA 1SK0A 3GX8A 1WPIA 5ECMB 2FY6A 1A2JA 1ERVA 1O8XA 3N9JA 1YKCA 2CZ2A 2H72A 3IDVA 2IMKA 2GGTA 2RLIA 2REMA 3ZREA 3N5OA 1JZRA 3QMXA 3G7JA 4KSOA 2KP2A 1B4PA 2V32A 4J57E 3A2WA 5IMVA 4LLRA 1XZOA 2LNSA 1MD4A 1XOBA 3UAPA 2LQOA 4ZL8A 2YP6A 1YEPA 4HU7A 5FWGA 2R2JA 4MA9A 5DVBA 4K7OA 5D9TA 4F2IA 5ECKB 3EU3A 1GUHA 5C00A 5IOWA 4G2EA 1R7HA 1F9MA 3GV1A 4IJ3A 3Q6OA 1V2AA 3ZTLA 6GSYA 2FA8A 4ZBDA 2AB6A 3KH9A 3P7XA 1I5GA 2GSSA 4PNGA 1ML6A 1BYEA 3GH9A 2H1BA 1X9MB 5D9XA 2M46A 4K7NA 1W89A 1AUCA 3CRUA 2LKUA 2GT6A 4ZL7A 2IIYA 1OE8A 1ZYEA 4L5LA 14GSA 2IFQA 2YV9A 2L5LA 4WBJA 2PMTA 1EOGA 1E2YA 1BG5A 1V40A 3L0HA 1V58A 4D73A 3DEXA 3MNGA 2XC2A 3A3TA 2HXKA 2F9SA 3I9V2 2KP1A 2LUSA 6GSVA 5KN0A 1XW5A 1PA3A 5A4VA 2YWMA 2CVBA 2QC7A 2ZNMA 4JU5A 1Y6EA 3VPTA 2P31A 3TKSE 2MMAA 3IA1A 3TJKA 3A2VA 3F3QA 5HR2A 3LJRA 2DSAA 3UVHA 1B4QA 2FLSA 5CP1A 4HQSA 4EDZA 2K9FA 2DJ1A 1S3AA 3I69A 2VLTA 2YWNA 1ABAA 1DUGA 4AF2A 2M80A 3F6FA 4NHZA 3FZ5A 1X5DA 2AJQB 2LNTA 1CQGA 1O85A 3KMNA 4CW9A 5JWQB 1EOHA 2RUEA 4TN8A 2H1GA 3F6DA 4GXZA 5FHIA 5HFGA 1B8XA 1LJRA 1BAYA 2L59A 3FYGA 3L9VA 1TI1A 3LFLA 3PR8A 1QUWA 1M2BA 3LORA 1EP8A 2IWTA 4Z7XA 5CNWA 2R3XA 1ZZYA 2OADA 1GRXA 3ZFLA 1M99A 1Z9HA 2VOCA 2B5YA 4JBBA 4MK3A 2FNOA 2HRFA 1SK2A 2BJXA 3IOSA 2F51A 2H66A 4XS1A 3VWWA 2YNXA 3MWHA 4HDEA 1DSBA 1WP0A 12GSA 2GZZA 5CAXA 2V2GA 4DVCA 5HFKA 1DBYA 1XVQA 1FG4A 1MTCA 4ID0A 2OE1A 3IRAA 3ZMLA 4L0UA 1HNAA 3FR9A 3ZYWA 2HLSA 1IYHA 5JWOB 5AISA 3GKXA 3M8NA 2RM5A 3US3A 1O7UA 1GSUA 1G7EA 5DQYA 1ZYQB 5IO0A 2YWIA 5A4WA 5IPGA 1KEBA 1BQ7A 4GRFA 2PN8A 5IMFA 4MJEA 3IE3A 4LL1B 2E2MA 4RUVA 4V2LA 2E7PA 3EU4A 4XS6A 1A2MA 1A8LA 2PVQA 1NHOA 1FB0A 6GSWA 3TOTA 5G1LA 2VL2C 1AW9A 2DJJA 3J7Yk 4MJAA 2A2SA 5AN1A 3KMOA 5GSSA 2HT9A 3DKSA 4NAXA 3OR5A 5IMZA 1CQHA 3HA9A 3KIJA 1XVWA 5DALA 2X8GA 1F2EA 1X9WB 1EEMA 4PQ1A 5B8AA 1X9SB 2GZPA 3CSHA 5DJMA 4ZL9A 5LCZA 1SYRA 6GSUA 4EO3A 4ISDA 4FYBA 1SL1B 5G1KA 2WS2A 4TR1A 1NW2A 1S3CA 1Z3EA 2CT6A 2C8UA 4AGSA 2HRNA 4WF4A 2DMLA 2B6MA 1PRXA 1ILOA 1AAZA 2VCTA 1ERTA 3HCZA 4O7HA 2VCXA 2VO4A 4WR4A 3Q74A 1GNEA 4QQ7A 4MLYA 4J56E 18GSA 1GSQA 1ST9A 3CBUA 1A0RP 4KCAA 3VLNA 1TK0B 3RHCA 3QPMA 1T4ZA 1PSQA 1UVZA 3TJGA 2IJYA 4ZBAA 3NOFA 3FK8A 1ERUA 4IGJA 1N2AA 3GHAA 3ZRDA 1Z6MA 1EZKA 5ID2A 5CO3A 1THOA 1LU4A 4Q5NA 2B1KA 4HJ2A 3HD5A 2WCIA 16GSA 2PBJA 1TU8A 3C1SA 3H93A 3F9UA 3RBTA 2JZTA 1F37A 2GQLA 4G9HA 1K0NA 4QL7A 4GQCA 4FH8A 3TRQA 1R5AA 4CHSA 2ZUPA 3HVXA 4YQVA 4LA1A 1K0AA 2CAIA 2FUG2 3P90A 2XPEA 1Q4JA 3D22A 1PX6A 3O76A 2AV4A 2C0EA 3FR3A 4ML6A 1GTAA 1NM3A 5DBQA 2PWJA 4I5QA 1WOUA 2C1YA 4I8BA 4KX4A 2H6ZA 3DD3A 3GTUA 3FRCA 3MSZA 1TK8B 1NHYA 2R4VA 2GS3A 2FHEA 2H70A 2K18A 3LEFA 2EIOA 1K0CA 4IP6A 4ILFA 3D0ZA 5G31A 1YJ6A 2C3NA 1TOFA 1QXHA 1GSSA 3HJOA 1A2LA 1RK4A 3ME7A 3FY7A 1J0FA 2VLVA 3GYKA 4KB3A 5INYA 2FWGA 4MPFA 3TKSA 3TDGA 2VD0A 2YJ7A 4I2TA 4TR0A 4J2FA 2I81A 2H71A 2QSIA 2H6XA 4ECJA 1YDKA 1ZGNA 2KLXA 2FD3A 3F3RA 5EY6A 3HVSA 2I4AA 4I2UA 3VI7A 1SU9A 1U3IA 5IIZA 4F03A 3ZIVA 3TGZA 1GULA 1PKWA 1XCCA 1UA5A 2VAFA 3GX0A 5DCGA 4TOPA 3KJYA 5B7CA 2GZYA 5EPFA 4WF5A 2ZCTA 4MABA 1K0OA 2GSQA 2VCWA 4OMVA 5HR0A 4MPGA 2JSYA 3FHKA 3M3MA 2TRXA 1YZXA 2L6CA 1J08A 2HSHA 1OYJA 1GTBA 3A2XA 3BOAA 4IS0A 1HYUA 5ABRA 2PUKC 1XWCA 3RAZA 2IMIA 3GKNA 5GZZB 4EVMA 2Z9SA 2FA4A 3UBKA 4MCUA 3UJ1A 1TDIA 2GTUA 2CX3A 4ECCA 4POMA 4PGTA 1T3BA 1GWCA 4ACSA 4WETA 3TJBA 1PL2A 1TU7A 2YZUA 1AQWA 2O7KA 2PERA 3GUSA 5C04A 3DXBA 1YY7A 3FKFA 3K8NA 3DYRA 3QR6A 3GURA 1FO5A 2M72A 2IL3A 2FWHA 3E9JB 4K9ZA 2I9HA 3ZIJA 2O85A 3QFBC 5J9BA 3WT2A 4GQFA 5ECSA 2DMMA 4TXOB 4OCEA 1G6WA 3FZAA 3GIXA 1YQ1A 4PNFA 2PPTA 1GUKA 3GMFA 4QL9A 4GSNA 3QCPA 1NSWA 2VLUA 2VCVA 3D6IA 2C0FA 2JACA 2O89A 1YEXA 4JRRA 4TVEA 3EYTA 1BJXA 1EGOA 1OE7A 1E6BA 2P5QA 4EF0A 1TK5B 13GSA 4BWSA 1M2DA 2LRCA 5H5RA 5F0GA 1SJZA 4OCFA 3E0UA 1PMTA 3UVTA 1R5PA 3UL3A 1JLWA 2OBKA 5LNKe 3C8EA 3GFKA 2LRNA 3QAGA 2F3MA 1YKAA 3ERFA 1O6JA 1PX7A 1MEKA 1R4WA 4OO4A 4DSRA 1HQOA 2FGXA 4MH3A 3L4NA 1UN2A 1A8YA 4O92A 1O73A 2JU5A 3EC3A 4IELA 2IFQB 5DDLA 4DEJA 3Q18A 19GSA 2QKEA 2E2GA 3KGKA 3UMAA 1SJ6A 2JZRA 3KXOA 4L5OA 1TJDA 4D73B 5G2ZA 4XTSA 4Q5FA 5D93A 2N5FA 2VL9A 4MZCA 5D8IA 5F05A 4OWYA 2KOKA 1SL2B 2DIZA 4FYUA 1JZOA 4TRXA 3CXGA 3GL3A 4MJBA 3TRPA 2NDOA 3LG6A 4KDUA 2EIRA 3EURA 3DGQA 3AY8A 1SENA 4GTUA 5J4UA 2C0DA 5F06A 2AYTA 3LYPA 3H1NA 3ZVJD 22GSA 5KN2A 1FVKA 2VCZA 5KN1A 2LJAA 3VI5A 3TKQA 2TRCP 1MDKA 1OAZA 1XIYA 4JZQA 1T00A 1X5CA 4MZBA 5AIVA 3CSIA 5J3RA 4EXJA 2QGVA 3TCOA 4KSMA 1ZCPA 3C73A 3G9BA 4HEA2 3HZ4A 4X43A 2C80A 5H5SA 1VRSD 2H01A 3DVXA 1GLPA 4DSSB 2L4QA 1K3YA 1AQVA 3ERGA 1LBKA 4JR4A 2IMFA 4KCEA 5AGYA 3JCML 3UEMA 3M0FA 4TW5A 4NWYA 3S9FA 2VM1A 1WJKA 4MZWA 4N11A 2PVOC 4K0GA 3SBCA 4NHWA 3LXTA 4IQAA 3KD0A 4GF0A 3CSJA 3L9SA 1PQNA 3H4KA 2IPAA 1SJIA 2XBQA 3QAVA 1XW6A 3V1WA 4IBPA 2IMDA 3D21A 2ON7A 3C7MA 3FEUA 5J5NA 2O87A 5HR1A 3LXZA 5JWRB 3CTFA 2KUCA 4MMMA 4ZILA 4H86A 3EWLA 2JL4A 5IM9A 1U87A 2B1LA 2L4CA 3TRXA 3EINA 4XS4B 4WXTA 1EP7A 2VL3A 3HKRA 4V2NA 1B48A 2DJ0A 5D73A 4ZBBA 2HE3A 1KBNA 2HFDA 1TKDB 5CYYA 1SL0B 1GTUA 4EC0A 1XWAA 1IYIA 1K3OA 2MBSA 3HVVA 2LTKA 5DAKB 1VF3A 3GL5A 3KZQA 2L6DA 3LWAA 3EMXA 4GCIA 5CRHA 2LEGA 3F4RA 3QDNA 5ECQB 3CYNA 5G30A 1MD3A 2MYGA 1F3AA 6GSXA 5AIXA 2X8CA 4O5RA 9GSSA 3GN3A 2JZSA 1SK1A 1GSFA 5DALB 4CDOA 3O3TA 4GSSA 3C71A 3PGTA 2MMOA 1M7TA 2WRTA 2J9HA 2CAQA 4IN0A 3FZ4A 4RI6A 3ZVJA 3P2AA 1OC3A 5IQYA 1M0UA 17GSA 1XPVA 4XHMA 2JSZA 3H8QA 1T7PB 4NV5A 1TRVA 5CREA 1X5EA 2OE0A 4EE0A 4POLA 3ERWA 1WMJA 2B3SA 4HJMA 4OFTA 1VF2A 4YAVA 3WYWA 4LMWA 1ZOFA 1URMA 2XHFA 3W8SA 3D4MA 3WT1A 5IPHA 2L5OA 3TOUA 4MJCA 5GAND 1AQXA 2X64A 2YANA 3DMLA 2B7KA 2RM6A 2CVKA 4E8HA 3HJMA 4TR4A 1TRSA 1Z6NA 4K2DA 2A4VA 2DJKA 5ECPB 5EL8A 2KHPA 1FAAA 3VWVA 1OC9B 5G5EA 5FT3A 4ZB9A 4WR5A 4PX1A 1EEJA 2IMEA 2DJ3A 2HZEB 4WEYA 4YQMA 3GKMA 1QGVA 2NBSA 3CMIA 1H4OA 2OA7A 4MH2A 1OC8A 3RHBA 2L57A 5CRGA 4HOJA 1A0FA 6GSSA 1TP9A 4LL4B 2AAWA 4EL1A 3KH7A 4K8MA 4F0CA 2CQ9A 1GTIA 3GA4A 3PH9A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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