1LU4A

1.1 angstrom resolution crystal structure of a secreted mycobacterium tuberculosis disulfide oxidoreductase homologous to e. coli dsbe: implications for functions
Total Genus 40

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
134
structure length
134
Chain Sequence
ADERLQFTATTLSGAPFDGASLQGKPAVLWFWTPWCPFCNAEAPSLSQVAAANPAVTFVGIATRADVGAMQSFVSKYNLNFTNLNDADGVIWARYNVPWQPAFVFYRADGTSTFVNNPTAAMSQDELSGRVAAL

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis
publication title Gram-positive DsbE Proteins Function Differently from Gram-negative DsbE Homologs: A STRUCTURE TO FUNCTION ANALYSIS OF DsbE FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SOLUBLE SECRETED ANTIGEN MPT53
total genus 40
structure length 134
sequence length 134
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-05-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1lu4A00
3TB2A 3LFLA 5EY6A 1WPIA 3QMXA 2ALBA 3KH9A 4PQHA 2R37A 4I2TA 1QMVA 5CP1A 2N5BA 3WGXA 1RQMA 3ZLPA 4ILFA 6GSSA 3TOUA 1JLWA 4FYBA 2BMXA 4IJ3A 2IFQB 3I43A 1SKRB 4Q5NA 2GVPA 4I2UA 3DXBA 1DE1A 3GHAA 4GSNA 4OWYA 5IMZA 2AUVA 1YDKA 1SL0B 9GSSA 1USBA 1T4YA 4ZB8A 1OC3A 2JSYA 1KTEA 3IBHA 4JEDA 2L57A 1HNBA 2YNXA 3J7Yk 1JZWA 3TJFA 2MMOA 2NTOA 2YWMA 3WT2A 3LORA 3GX0A 4LMVA 5IM9A 5DBQA 5CRDA 1TKDB 2ON5A 5IQYA 1NM3A 2YP6A 1A2LA 5A5KA 1VRSD 6GSWA 4MJBA 5ECIB 2LKUA 4DSSB 2OE0A 3L9SA 1YF0A 1YY7A 1HNAA 1Z3EA 4ZB9A 3MDKA 1V2AA 1ACVA 3P2AA 4I5QA 1A0FA 4XHMA 3CSIA 2CVDA 2HYXA 4N0VA 2H01A 3QAGA 1M9BA 4LA1A 3HA9A 3UARA 1YZXA 4F0BA 3IE3A 2H74A 2H1BA 3Q6OA 3FEUA 1A8LA 4MK3A 3KXOA 3MWHA 3RDWA 4XRDA 5ECNB 2DJKA 2LV3A 4BWSA 3ZIVA 3EC3A 1FAAA 2X99A 3WGEA 1Z7PA 3FZAA 2R6KA 3KCMA 2P5QA 2HNLA 2L6DA 2WJUA 1OKTA 3LQ7A 3ZFLA 1ZZYA 3TRQA 2C8UA 4KDUA 2WZ9A 3NZNA 3DD3A 1AIUA 2O85A 1QQ2A 3ZVJA 1QXHA 2CX3A 1XWAA 3DVWA 4K8MA 3C8EA 3WT1A 2F3MA 1SK1A 1GRXA 3FKFA 2GTUA 5J41A 3TKSC 2HRNA 1VF3A 4OD7A 2OE1A 3QR6A 4AJ8A 5A4VA 1X5CA 2HRFA 2HZEA 3IHQA 4WEYA 2B5YA 3F6FA 3IAM2 1AQXA 2B7JA 5DDLA 1EP8A 3VURA 3IK7A 2DC5A 1OE7A 4D73A 3CMIA 4XS4A 1WWJA 1XFLA 1X9SB 3KJYA 5H5RA 1PQNA 3VPTA 2VLVA 5D96A 4F2IA 2RIIA 11GSA 3EU4A 3TKQA 2R3XA 3GV1A 3Q19A 1JZDA 2HLSA 3H79A 1OAZA 2DJ2A 4GLTA 5B8BA 1B8XA 2I81A 4IQ1A 2MMAA 3D22A 1TRUA 3UL3A 3GNJA 2Z9SA 3N9JA 4K7IA 1I9DA 4KE3A 3I9V2 1B4PA 1O6JA 1AXDA 3QDNA 3U5RE 1X9MB 4F9ZA 5GAPD 3CTGA 5KN1A 1ZL9A 2PPTA 1SD9A 2TIRA 1EV9A 1GSDA 2L4QA 1O7UA 1BAYA 1XOBA 2YANA 2VCQA 4IVFA 1XW9A 3MSZA 1K0BA 5J9CA 3TJJA 2OACA 3A3TA 4ZXGA 5IMCA 1JLVA 3EURA 3VK9A 5GSTA 3VWVA 3LJRA 4ZBDA 5D9WA 3TOTA 2BJXA 4XTSA 2FWFA 1TXXA 3EMPA 2H0IA 1OC8A 3KM6A 3ERGA 3LSZA 5INYA 2FHEA 3GTUB 5AN1A 5IPGA 2IFQA 4N30A 1GSYA 1HD2A 1BG5A 4JRRA 5F06A 3CYNA 1ZYQB 2LJRA 5ELAA 5DQSA 2X8CA 2VAFA 2VL9A 1W4VA 2IWTA 2H0GA 2VD1A 1M2DA 4MZCA 1MDJA 2V6OA 12GSA 2F8AA 5JCWA 3PR8A 5G30A 2F9SA 1MDKA 2AV4A 4KSOA 4AGSA 2NBSA 3C1SA 2H66A 2OBKA 2VD0A 2RM5A 5ABRA 2RUFA 1GH2A 4WBRD 4POMA 4DSSA 1Z9HA 1AQVA 4IELA 1KBNA 2HSHA 1ERTA 2E2MA 1VF1A 5IO2A 4IGJA 2J9HA 19GSA 5FHIA 4ULXA 2N5FA 3LWAA 2NDOA 2WB9A 1KEBA 5D9XA 2XBIA 3C71A 3GIXA 2ZUPA 1Z6MA 4TXVA 1K3YA 3GH6A 4K1FA 2ZNMA 4MA9A 2GSRA 1J9BA 3KP9A 1F6MC 3KMNA 2GLRA 2GSTA 4XS6A 3TCOA 2WRTA 4TOPA 1I5GA 4G10A 2GT5A 2OBIA 5D9TA 1BQ7A 1OKDA 3S9FA 2CA8A 1ERVA 5CRWA 2PMTA 1HYUA 3GSTA 2L5OA 2JU5A 3N5OA 4GWRA 5F0GA 1FOVA 1F3BA 4BVXA 4HUAA 3WGDA 1BX9A 2C0FA 3M3MA 1M7TA 4HOJA 2C0DA 4GXZA 2VCZA 2LQOA 1EP7A 1ML6A 1Z5YE 4GSSA 4TR0A 3KZQA 4NPBA 5B6NA 1ST9A 2YZUA 5GSSA 4GTUA 22GSA 3KGKA 2A2SA 1RK4A 3E3EA 3M9KA 4N10A 3FZ4A 4FYCA 3TUEA 3WYWA 4CDOA 3GRXA 3LGCA 1K0NA 2V1MA 5DJMA 3UBKA 1O73A 4BWQA 4CHSA 4V2MA 2IMIA 4NHWA 4PQIA 1THOA 4X0XA 3CSHA 3ZITA 1XVWA 1AUCA 4O32A 1M0UA 5G1KA 4MPGA 5LNKe 1MEKA 4K9ZA 2O8VB 1T8EB 8GSSA 3ERWA 3NOFA 3GKMA 3H1NA 5ECQB 4ML6A 2MMZA 3EWLA 4IN0A 2GSQA 1T1VA 4JR4A 2LJKA 2VOCA 4MJEA 2M80A 1X0RA 3TKSE 2PBJA 2L4CA 4PUFC 2B5EA 1BJXA 5CO3A 4ML1A 3IXRA 2DJ0A 1PX6A 4KW6A 1XWCA 4IBPA 1K3LA 3EU3A 4GSTA 3UVTA 2H30A 1GTBA 2L59A 3D5JA 3HJMA 3BD2A 2XBQA 4ISDA 5G31A 4OCEA 1RW1A 4HZ4A 3D4MA 3ISOA 3F3RA 3F4SA 4NWYA 4Q5QA 3EMXA 3P8WA 3UMAA 1YQ1A 1PRXA 2EIOA 3ZL5A 3LXTA 1R5AA 1WOUA 3GTUA 4O5RA 1Y6EA 1V57A 4L0WA 2IMEA 2O7KA 3A2WA 2TRCP 4J56E 3F4TA 2O87A 1EOHA 2LUSA 3O76A 3GN3A 2G0FA 2L5LA 4GF0A 4KH7A 1W89A 1PL2A 3DIEA 5ECMB 4IHUA 4IP6A 5F8BA 1XBSA 3KH7A 6GSUA 3HYPA 1EEJA 1VF2A 3TJGA 2FLSA 3ME8A 5HR1A 2B7KA 1PD21 5FT3A 1XWKA 5J9BA 1ERUA 2H6ZA 1G6WA 3HVSA 2LEGA 5IO0A 3TKRA 1XXUA 3ED3A 4JU5A 2K8SA 3TJBA 2FA8A 2H1GA 1TJDA 5JWOB 1U87A 2FUG2 3G7JA 4ZL7A 2CVKA 1T7PB 1V40A 3W6GA 5DCHA 3L78A 3UOMA 1EZKA 2FCHA 3IAS2 1GSSA 2KHPA 3DRNA 4X43A 2WULA 3D21A 1MD3A 4TRXA 1TRVA 5HR2A 1X5EA 4TVEA 4MF7A 2IMFA 3LYPA 1TRSA 2GDRA 1Q4JA 13GSA 1EGRA 3G9BA 5DVBA 1U3AA 1SYRA 1OE8A 4K0GA 3EYTA 2V41A 4WETA 3FW2A 4WKWA 20GSA 3CRTA 5ECSA 1YEPA 1E2YA 4OFMA 4HDEA 2YJ7A 4LL1B 3AY8A 4BVYA 2YN1A 2DSAA 1EV4A 18GSA 1SU9A 4Q5FA 4K2DA 3PINA 2EIRA 1DSBA 2MMNA 3UEMA 2OA7A 2RM6A 2R4VA 1A24A 1EGOA 2PWJA 3C1RA 3FY7A 4XRAA 3RPPA 2LSTA 2C3QA 1U6TA 4JR6A 1YF1A 3U6VA 1K0DA 2VL2C 3L9VA 3GUSA 3ZZXA 4MABA 1GLQA 5JCGA 1S3CA 2GS3A 4ACSA 2CV4A 3GX8A 2K8VA 3HJPA 2YWOA 5DAKB 1O85A 2GZYA 1YKCA 2PN8A 5IMVA 3FZ5A 1GSQA 2M46A 1UN2A 4MH3A 1GNWA 4ID0A 1NSWA 3ZIJA 1B4QA 2H0HA 4ECCA 1B48A 1SL2B 3IDVA 2GT6A 2AYTA 3GURA 2H75A 1TK8B 4CW9A 4OMVA 1T00A 1O81A 3C7MA 4YAPA 4Q5RA 4J57E 4L8EA 5ECHB 1QGVA 3GMFA 3FR9A 4HI7A 4XS1A 2P31A 3J7Yb 1Z6NA 4KDXA 2H71A 2WS2A 5DALB 1GUMA 2XHFA 1FB0A 2LRTA 2DMMA 3K8NA 2X64A 1FHEA 2LQQA 4AJ7A 2HI7A 2X8HA 1BYEA 3RHCA 2B3SA 5G5EA 3W8SA 17GSA 2IMKA 4GRFA 3DYRA 3O6TA 1GSFA 2V32A 4RI7A 2C3NA 2KP2A 2VCTA 4TW5A 1XVQA 3ZMKA 5ECOB 1S3AA 4WBJA 4PQ1A 4EUYA 1O8XA 2VUPA 1ZYEA 2JZSA 1R7HA 3KMOA 4KDYA 1G7EA 1O8WA 5GAND 3IK9A 3H93A 3PH9A 1FG4A 1OYJA 4RI6A 2C1YA 3TKSA 3TKPA 3KTLA 4FIWA 5IIZA 4HJMA 1TDIA 5LCZA 2HT9A 2HZFA 1JZOA 2I1UA 1XZOA 3HZ4A 4G2EA 5ELGA 1M2BA 5IMDA 2F51A 2MYGA 5ECPB 4MP4A 2JSZA 3BCIA 3VFIA 4TR1B 5J4UA 3A2XA 2IPAA 4OCFA 3UAPA 5CYYA 3F4RA 4NHZA 1SL1B 1GSEA 3D4TA 4ZBBA 3M1GA 3DGQA 2DMLA 1PSQA 1MDIA 2YJHA 1V58A 3QAVA 4KAEA 2IJYA 3VPQA 7GSSA 5HFKA 3A2VA 1WRYA 1PN9A 2FGXA 4K0NA 4KCAA 5COHA 2H70A 5ECKB 4RQXA 4I97A 2YPMA 2HXKA 1J08A 3KD0A 4WR5A 4WF4A 2PGTA 1A2JA 3CXGA 4MJCA 2K6VA 1ABAA 2DJ3A 2VO4A 1AAZA 2CZ2A 3C73A 2B5XA 2L6CA 3FHKA 2DJ1A 3GH9A 4Z7XA 3GSSA 3HHVA 5B8AA 3MNGA 3IC4A 1NHYA 1LJRA 2LTKA 3TRPA 3W8JA 5J3RA 3LG6A 3L9UA 4RUVA 2RLIA 4AJ6A 4EXJA 4N11A 1XPVA 4HJ2A 3ZMLA 1T3BA 1V98A 5EL8A 5AGYA 5H5SA 4KNDA 3QOUA 4NV5A 4X1UA 3I69A 1AQWA 1R5PA 1FVKA 3WD6A 1V9WA 4YQMA 2N5AA 4GCIA 3VWXA 2DIZA 2WGRA 1GNEA 1EEMA 4MZBA 2NVLA 3HJOA 3ERFA 5A4WA 3TGZA 3UVHA 1F37A 1G6YA 2CQ9A 5IMAA 1QFNA 3DEXA 3F0IA 1J0FA 4F82A 3TRXA 4PXOA 1IYHA 1K0CA 3EINA 4L0UA 1X5DA 5ENUA 3HVVA 4HU7A 5C00A 4WXTA 3EE2A 2R5GA 2V6KA 2XPDA 2HZEB 3M0FA 2FY6A 3V1WA 2GQMA 3MAKA 5LD0A 3IR4A 2YOIA 1DBYA 4DSRA 3DWVA 1LU4A 2C80A 2YV7A 4XS4B 5HR3A 1FW1A 4WR4A 1GP1A 3HVXA 2H73A 1C72A 4V1Ap 4KCEA 5G5FA 4HQZA 3CBUA 2GZPA 2AAWA 3RPNA 5DALA 2E7PA 2B1LA 2V2GA 1XW5A 2ES7A 1CQGA 1K3OA 1F2EA 1NHOA 2H19A 3FR3A 1A23A 1GL8A 4DSQA 3DKSA 2IL3A 3KIJA 4IW9A 4ZILA 3CTFA 3E9JB 1SJZA 2YV9A 1K0OA 1WJKA 1GSUA 3HXSA 2KUCA 1GUKA 1TU7A 2E0QA 14GSA 1XCCA 3SBCA 3GKKA 1G0TA 1EOGA 2KLXA 1M2AA 1YEXA 5FWGA 3GL3A 2ZCTA 1LBKA 2A2RA 5DJLA 1HNCA 1Z7RA 2XC2A 2YCDA 1X9WB 2IMDA 2VCXA 1TI1A 2HFDA 4ECJA 2C0EA 1KNGA 1ZMAA 4ECIA 4HZ2A 1U88A 4V1Ag 2H76A 5KN2A 1TOFA 3GYKA 3VWUA 4E8HA 3Q74A 4YH2A 4JBBA 1MTCA 1TK0B 4POBA 1ZCPA 2OE3A 2H1AA 3Q18A 3TDGA 2I3YA 2GQLA 4TR1A 4MDCA 5JWRB 2H6YA 2LNTA 5IMFA 4MJAA 2FWEA 4EE0A 4POKA 1QK8A 3IRAA 3IOSA 1GUHA 4L5LA 3H4KA 3FK8A 1N2AA 4FH8A 4HQSA 2FWHA 3VI7A 4LL4B 1TK5B 1U3IA 2KP1A 4QL7A 4KGIA 4PNGA 3APSA 2VL3A 2R2JA 5JCUA 2GSSA 2OJLA 3O3TA 4EL1A 3QCPA 3FR6A 16GSA 5B6MA 2VCVA 1GTAA 3APOA 2ON7A 4OFTA 1F9MA 3FYGA 2C4JA 2VLTA 1OC9B 2HE3A 2REMA 2BTOT 1XIYA 1AW9A 5B7CA 3GKXA 3ZVJD 5AIVA 3LEFA 5J5NA 2WDUA 4F03A 4PNFA 3F3QA 3RHBA 2MBTA 6GSVA 2CT6A 1GTIA 1S3DA 4QQ7A 1WIKA 1Q98A 3DVXA 3QPMA 1TTZA 4EKZA 2LRNA 4MZWA 2G2QA 3HZ8A 3JCML 1ZOFA 5C04A 1PMTA 1UVZA 4I8BA 3CRUA 3I6AA 4PUAA 3G7YA 1THXA 3GKNA 4MCUA 5ID2B 4GQFA 1A8YA 3P7XA 3ZREA 3OR5A 1NW2A 1T4ZA 2P0GA 3ZTLA 2AB6A 5EPFA 3CSJA 4PGTA 5JWQB 3IV4A 1HQOA 1K0MA 1WE0A 4YQVA 2HSYA 2FA4A 4V2NA 3L0HA 4V2LA 2B6MA 4ZIJA 4K7NA 2OKAA 2PERA 4MF5A 1M9AA 1PX7A 3KEBA 5IPHA 4K6XA 4JE1A 1N8JA 2H8LA 4EF0A 2QGVA 3PGTA 2WFCA 5D73A 3R2QA 2J23A 2K18A 3RAZA 1TI3A 2MZCA 2D2ZA 4F0CA 4J2FA 2C3TA 2AJQB 3EVIA 3NIVA 1JZRA 3QFAC 1FO5A 1UA5A 5HFIA 5CNWA 5IOXA 1GTUA 2DBCA 4EDYA 1TW9A 3BBYA 2F8FA 5HR0A 3HY2A 4KX4A 1GLPA 5D93A 1WMJA 5AIXA 4EC0A 5IOWA 3M9JA 4P3YB 2JADA 4KA0A 3KTBA 1PKZA 6GSYA 6GSTA 3APQA 1TRWA 5CRGA 4WF5A 1SKWB 4MLYA 4IS0A 4IJIA 4LMWA 2VM1A 3QFBC 3UIWA 1ILOA 1E6BA 1AC1A 3VWWA 5KN3A 5HQPA 2YWNA 2M72A 1FVJA 1WP0A 1PA3A 1DE2A 2DLXA 4KSMA 5L71A 3QD9A 2CVBA 2FNOA 4HEA2 2P5RA 4ZBAA 3LYKA 4NMUA 2VCWA 1JFUA 5A4UA 1GWCA 1B9XC 4TXOB 3LXZA 2QC7A 2A4VA 1TU8A 2VIMA 3HD5A 3ZFBA 3RBTA 1R26A 3F63A 4HS1A 3HDCA 10GSA 3UBLA 3D0ZA 3IA1A 1VGLA 3A5WA 4FO5A 4GQCA 5E59A 4AF2A 5EVOA 2JZTA 2I9HA 1JHBA 4YQUA 2VM2A 4XCSA 4KUNA 4H86A 2NPBA 2PVOC 4EVMA 4LLRA 3H8QA 1R4WA 5ECRB 6GSXA 5HFGA 1SJIA 3TJKA 4ZB6A 1XWGA 2VL2A 4DEJA 1XOAA 1FB6A 3F8UA 4KB3A 2XPEA 1YKAA 1CQHA 3GA4A 4K7OA 4POLA 4QL9A 2YZHA 1A2MA 2CZ3A 2DIYA 1B9YC 1XWBA 3VLNA 2QKEA 1URMA 1OVNA 4MF6A 4TN8A 2WCIA 5KEJA 4IKHA 4OO5A 2I4AA 2QSIA 1SKSB 5D9VA 4IP1A 1OC9A 4NAXA 5KN0A 4TR3A 4ZL8A 1IYIA 1F3AA 2LRCA 3DMLA 2H6XA 2EC4A 4MMMA 1TP9A 2MBSA 1SJ6A 2KOKA 4I6XA 2VLUA 4MPFA 5F05A 1PL1A 2LS5A 2JZRA 4EO3A 1MD4A 2CAIA 2E2GA 3F6DA 3GFKA 3E0UA 1UC7A 3VI5A 3M8NA 5E4WA 2O89A 2H72A 2DJJA 2AHEA 1ERWA 5ID2A 5G1LA 2FD3A 5F07A 5CREA 5AISA 2X8GA 4G9HA 4TKYA 3SWLA 3D6IA 3KP8A 3HKRA 2OADA 4N0ZA 2K9FA 4O7HA 4NV2A 5DCGA 2C0GA 1SD8A 4OO4A 1GULA 5DAKA 2EIQA 1M99A 4MH2A 3IPZA 4ZL9A 4PURA 2FWGA 2JL4A 3FRCA 1SK0A 1SYXA 2IN3A 3P90A 1YJ6A 4XIHA 1SENA 4JZQA 2RUEA 2GQKA 2GGTA 3G7IA 5CAXA 4HU9A 5G2ZA 1Y25A 4PX1A 1ON4A 3QAWA 5D8IA 1G7OA 5GZZB 4BL7A 3GL5A 4OFNA 2TRXA 4O92A 4BA7A 4TR4A 1K0AA 4IQAA 1PGTA 4D73B 4RQRA 1H75A 2YWIA 3UJ1A 1VF4A 1XW6A 3F9UA 4L5OA 1H4OA 4ECBA 2LNSA 3US3A 2IIYA 2PUKC 2PVQA 1QUWA 5DQYA 3L4NA 2H1DA 4DVCA 1PKWA 1A0RP 1BEDA 4E8EA 2CAQA 5H5QA 2GZZA 3FZ9A 3BJ5A 2B1KA 1DUGA 4G19A 5CRHA 3HCZA 4FYUA 2LJAA 4BPYA 1ZGNA 4TXOA 3BOAA 1SK2A 2PU9C 3BCKA 4NXIA 4EDZA 3ZRDA 5ECLB 2CX4A 3ZYWA 4YAVA 3ME7A 1EWXA 2JACA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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