1M2AA

Crystal structure at 1.5 angstroms resolution of the wild type thioredoxin-like [2fe-2s] ferredoxin from aquifex aeolicus
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
103
structure length
103
Chain Sequence
AEFKHVFVCVQDRPPGHPQGSCAQRGSREVFQAFMEKIQTDPQLFMTTVITPTGCMNACMMGPVVVVYPDGVWYGQVKPEDVDEIVEKHLKGGEPVERLVISK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High-resolution crystal structures of the wild type and Cys-55-->Ser and Cys-59-->Ser variants of the thioredoxin-like [2Fe-2S] ferredoxin from Aquifex aeolicus
pubmed doi rcsb
molecule keywords [2Fe-2S] ferredoxin
molecule tags Electron transport
source organism Aquifex aeolicus
total genus 34
structure length 103
sequence length 103
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-06-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01257 2Fe-2S_thioredx Thioredoxin-like [2Fe-2S] ferredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1m2aA00
1N8JA 2GGTA 1FB0A 5F0GA 2OJLA 4NHZA 2VD1A 4YAVA 3GN3A 2C0DA 4F0CA 1TK5B 3ME8A 4HUAA 2VO4A 4OCEA 1PD21 1EGOA 3L78A 1O6JA 4KB3A 2CAIA 2MMOA 5B8AA 4PQHA 2K8SA 5D9WA 3L9VA 3E0UA 2IMIA 1TU8A 3GYKA 1WPIA 2VL9A 1J08A 3TKSC 2WGRA 3CRUA 1M2AA 1GTUA 1LJRA 5ECPB 2V1MA 4GLTA 5E59A 2GS3A 2VCVA 2GSTA 1T4ZA 2HE3A 2N5AA 4XIHA 1JZWA 1O7UA 4GSTA 1SD8A 1ZGNA 4RQXA 1ON4A 2LRNA 5ECNB 3TJKA 4OMVA 3VPTA 3MNGA 4IN0A 1OKDA 5C00A 1KEBA 1B4PA 5J3RA 3IC4A 3VLNA 5IO2A 2CX3A 5ELGA 4ZBAA 1QFNA 2V6KA 4IBPA 3GSSA 1EV4A 2DJKA 4KCAA 3PGTA 4FH8A 3GV1A 2A4VA 2FA4A 1K0BA 3M9JA 3DVWA 2GZZA 1TRSA 2WB9A 2F51A 3TKSE 4ULXA 2LEGA 4J2FA 1GWCA 3KP8A 5CAXA 2H6ZA 4TRXA 3WT2A 2TRXA 2FLSA 2EC4A 1TOFA 2VOCA 3F3RA 3P90A 3F8UA 3HZ8A 4HDEA 1OE8A 4TR1A 4IJ3A 1THOA 1O8XA 1HNCA 3H1NA 4I2UA 3APSA 5J5NA 1YDKA 2MMNA 3VPQA 1FVJA 2DIYA 2AB6A 3GL3A 3TRXA 1TRVA 3UVTA 2PUKC 5EVOA 1B9XC 4LLRA 3QDNA 5IMZA 4YQUA 2DC5A 2CV4A 3RBTA 5IM9A 4GXZA 3LG6A 4ZILA 2YP6A 1XWAA 2VLUA 1PN9A 5ELAA 4WBRD 4MF5A 1ZMAA 2H0HA 2CVDA 2YWIA 2MZCA 2DMLA 3C8EA 1PKWA 3KMNA 1WP0A 4WBJA 5JCUA 2M80A 3F63A 1FG4A 3QD9A 5ECOB 4DSQA 5DCGA 1PGTA 1G0TA 3LWAA 2PU9C 2M72A 5AIXA 1MDKA 4MH3A 3WGXA 1TW9A 1ABAA 2C3TA 4TR1B 5ECKB 5F06A 2GVPA 1XCCA 3ZLPA 3KM6A 5L71A 3GKNA 4GF0A 1NSWA 3EU3A 1GRXA 4MH2A 4EO3A 3ZREA 5B6NA 4JRRA 2PN8A 4O5RA 2RUEA 4BVXA 3G7IA 3HJMA 4I6XA 3RPNA 1ZZYA 5GZZB 3UOMA 5COHA 1QK8A 2HT9A 4ECJA 3FZ9A 4MK3A 1GTBA 5ID2A 4F2IA 4OCFA 4G19A 1JZOA 1SL1B 3HD5A 1X9MB 1GSYA 3BCIA 4GQCA 2GSSA 1M9BA 4I2TA 5IPGA 3M9KA 2YOIA 4Q5RA 2PMTA 3LJRA 2KUCA 3GUSA 2YZUA 3HXSA 1JHBA 1Z6NA 3DIEA 3FKFA 3I43A 3GKMA 1GTAA 4ZBBA 2R4VA 3M0FA 5H5RA 2JU5A 3TJBA 4IP6A 5A4UA 3CSIA 1SK0A 4ISDA 5IIZA 1R5AA 2HXKA 1V40A 3LXTA 2YNXA 2WRTA 2YWNA 1GH2A 3VFIA 2FWEA 2C0EA 3LQ7A 1MD3A 3WD6A 1KNGA 2PGTA 1IYHA 4MPFA 5ECRB 4I5QA 3TJGA 2B5YA 4MF6A 3ED3A 3GH6A 2DMMA 3TOUA 1R26A 2MBTA 4DEJA 5ID2B 3ZMLA 2L6CA 2YWOA 3APOA 1SKRB 4JU5A 5JCGA 1FAAA 3FK8A 4MCUA 1JLWA 4MJEA 2GZPA 3ZFBA 13GSA 1ERUA 1GSDA 1HNAA 2AJQB 1O73A 5CNWA 1QMVA 3WGDA 1XZOA 1U3AA 5KN0A 4MZBA 3I9V2 3APQA 3S9FA 3SBCA 2H72A 3CMIA 5JWOB 2FNOA 4NXIA 4FYBA 2V41A 22GSA 2B1KA 2K18A 2X99A 19GSA 2VLTA 4OFMA 3VWXA 1PRXA 5JWRB 3NOFA 2LUSA 4IS0A 2LJAA 1BAYA 4TOPA 4MZWA 5HFKA 2C80A 2G2QA 1X9SB 1M99A 4ILFA 2H8LA 5IMAA 2XPDA 2NBSA 2H01A 4XTSA 2A2RA 2PPTA 2VUPA 1OC8A 2N5BA 4TN8A 1JZDA 5IMDA 1AQVA 2HRFA 20GSA 5D93A 5DAKA 4EC0A 3US3A 4ZBDA 3KTLA 3I6AA 1XW5A 3D0ZA 1SENA 2P0GA 5JCWA 2B5EA 1JFUA 5KN3A 2BMXA 3RDWA 1MTCA 2F3MA 2HI7A 3W8JA 2CVKA 2H74A 1WJKA 2I81A 4HJ2A 2H73A 5B7CA 5ECIB 2F9SA 4RQRA 1V9WA 3CSHA 5DALA 1SYXA 1B8XA 3EVIA 3GMFA 5IQYA 4GRFA 1F37A 2WCIA 1TP9A 2HFDA 4TR0A 3PR8A 1EP8A 1VGLA 5J41A 4GSSA 1RQMA 2RLIA 4RI7A 2V32A 2X8GA 1UA5A 5ECSA 4KSOA 3TRQA 1UVZA 3DYRA 1X0RA 1S3AA 2EIRA 2KP2A 3NZNA 2R3XA 1A24A 1Z6MA 1Z9HA 1OC3A 1R7HA 1DUGA 1AXDA 3QPMA 3HVVA 2H70A 4TR4A 5F05A 4D73B 1T3BA 4V2MA 4PNGA 4HEA2 3FRCA 2HNLA 3W8SA 3FEUA 1V98A 3EMXA 3V1WA 4MP4A 4EE0A 4ML1A 3F4RA 5CREA 2LTKA 1OYJA 4K6XA 1R5PA 5DVBA 1XFLA 3SWLA 1GSFA 3LYKA 5DALB 1U88A 2H6XA 2H1AA 2K6VA 4XS1A 3UMAA 4I97A 4O7HA 1FB6A 3IAM2 1GNWA 4WR4A 2GQLA 1WMJA 3IK7A 3VURA 4AJ7A 4ZB8A 3G7JA 3E9JB 16GSA 3NIVA 1M0UA 2H1BA 2O8VB 2YWMA 4TKYA 5J9CA 2WULA 2FA8A 1FHEA 4ECCA 4TXOB 5E4WA 1GNEA 4AJ8A 3DKSA 3W6GA 3ERGA 3TDGA 3L4NA 4IHUA 4WR5A 1A0FA 1SD9A 3J7Yb 1F6MC 2HZEA 2H76A 2EIQA 3R2QA 2LJRA 4QL9A 4K1FA 4LA1A 5ABRA 5D8IA 4YAPA 4GQFA 4EVMA 3CTFA 1PX6A 3QFBC 2ON5A 2H66A 2H71A 2GTUA 1HYUA 4MPGA 4AGSA 4KW6A 3DD3A 2M46A 1AW9A 2O89A 2XC2A 4KGIA 4GCIA 1AQWA 4ZL8A 3LXZA 3ERWA 4NHWA 1OE7A 4PX1A 1OKTA 1SJZA 1GLQA 1VF2A 3KXOA 3DVXA 3P2AA 3I69A 2LNTA 3HYPA 4ECBA 1SYRA 2P31A 4KA0A 1BEDA 4N10A 1TI1A 1GSEA 4JR6A 1DSBA 3D4MA 3KCMA 5ENUA 1JLVA 3CBUA 4V1Ag 1MDIA 5G2ZA 1ZYQB 5CRWA 5KEJA 2JZTA 4HOJA 3Q18A 2GQMA 3KZQA 4BVYA 2OA7A 1TTZA 1GSSA 3FYGA 3HKRA 3IRAA 1YY7A 1AIUA 3BCKA 4O92A 2VAFA 1K3LA 1U87A 1OC9A 3C1RA 1WRYA 4EL1A 2A2SA 4FO5A 2VL2C 2HZEB 1B9YC 2VM2A 1G6YA 2H75A 6GSWA 2CVBA 1XBSA 3LGCA 1QXHA 2H0GA 1PKZA 2JZSA 4I8BA 1Z5YE 3EYTA 3WYWA 3CSJA 3EWLA 4L8EA 4OO5A 5C04A 5FHIA 2B3SA 4HZ4A 1HQOA 1XWGA 2ZCTA 1K0AA 3DEXA 1GSUA 4HU7A 2NTOA 1V2AA 2HSYA 4GTUA 4EXJA 3FHKA 1XOBA 2GDRA 2E2MA 2B7KA 4HZ2A 4KCEA 1GP1A 1T4YA 3EINA 1THXA 2EIOA 3ZIVA 1I5GA 2L5LA 5IMVA 4FYCA 2BTOT 3HZ4A 3FZ5A 4PUAA 4V2LA 4CW9A 2RUFA 2MMZA 4CDOA 2YV7A 4JR4A 3HHVA 3TJJA 3QMXA 1AC1A 5A5KA 2H0IA 3TOTA 2CA8A 4TVEA 2KHPA 1YEPA 3UAPA 4FIWA 3QOUA 3G9BA 4OFTA 6GSXA 2LRCA 2AHEA 2PVOC 1OC9B 3ZZXA 10GSA 5D9TA 4WF5A 1U3IA 1O8WA 2LRTA 2ES7A 2WZ9A 2C4JA 1A2JA 4ZL7A 3JCML 1S3DA 3FR3A 2IN3A 1XWCA 3EMPA 3ZYWA 2I9HA 1DE1A 5JWQB 1WE0A 3HVSA 2I4AA 4NWYA 3ZMKA 1TK8B 3IA1A 2LNSA 1YF1A 2YN1A 5AIVA 1MD4A 3FW2A 2C1YA 1M9AA 4MDCA 1EOGA 3IK9A 4L0UA 1GUMA 5G31A 5HFIA 1YKCA 5GAND 2C3NA 5G30A 4JBBA 2VD0A 2XHFA 4V1Ap 2RM5A 1SK1A 3L9SA 3KIJA 1SL2B 5IMCA 4PQ1A 3TKRA 1GULA 3EU4A 4F0BA 3D21A 2WS2A 3PINA 4TR3A 4OWYA 2E7PA 1QUWA 4CHSA 4DSRA 2IJYA 1K3OA 4ZB6A 3M3MA 1NHOA 2CZ3A 2TIRA 3RAZA 1A2MA 2PERA 2OE0A 1ST9A 4GSNA 5DJLA 2C0FA 1NHYA 2HYXA 2L4QA 5G1LA 2F8FA 2YJ7A 1HNBA 3MWHA 5D9VA 4BA7A 3QFAC 3GKXA 2CAQA 3GURA 4OO4A 4EUYA 1BQ7A 2R37A 5DQYA 2O87A 1YZXA 2WDUA 5J4UA 1X5EA 5HQPA 1OVNA 1EV9A 2OE3A 3F0IA 4POBA 3UVHA 4JEDA 2BJXA 4K0NA 3D22A 4HS1A 5D73A 5EY6A 3F4TA 4PQIA 1USBA 5HR3A 4KSMA 4POKA 3ZFLA 1KTEA 2FGXA 1VF1A 2TRCP 3VWVA 4QL7A 3KJYA 4K7IA 5DJMA 3F6FA 2B1LA 5INYA 1GLPA 5HR1A 1FVKA 2AV4A 2ON7A 2K8VA 5KN1A 18GSA 4JZQA 3C71A 2P5RA 2IMKA 1SK2A 1B48A 5ECLB 3L0HA 2K9FA 1AUCA 1UN2A 4NMUA 3GTUA 4GWRA 1X5DA 4XRDA 3D4TA 1K0DA 4MJAA 4ACSA 2O85A 3VWUA 3UEMA 2OKAA 6GSSA 3UARA 1SU9A 3N5OA 1NM3A 1XWKA 2CT6A 1S3CA 1RK4A 3TKPA 2IMDA 3LSZA 2MYGA 3GSTA 4F03A 2B7JA 3K8NA 3AY8A 2DBCA 2QC7A 1GL8A 4BPYA 4JE1A 6GSVA 3LORA 4HQSA 5LD0A 4F9ZA 4MZCA 2RM6A 4N11A 2YV9A 4PGTA 1YJ6A 4IGJA 5DDLA 2GT5A 2DJ3A 4L5OA 1ZOFA 2YPMA 1OAZA 1YQ1A 2JSZA 1ERVA 4MABA 4N30A 7GSSA 3M8NA 4F82A 1EWXA 5HR0A 4ZL9A 4IKHA 4LMWA 4EF0A 4G10A 4YH2A 2E0QA 3UIWA 1MEKA 1E2YA 1B4QA 1Y25A 2C0GA 2FWHA 1TKDB 1A8LA 1PQNA 2H1GA 9GSSA 3GTUB 4KH7A 12GSA 4LMVA 5LCZA 1F2EA 4WF4A 2X64A 3M1GA 3QAWA 1PX7A 3FR9A 1PSQA 3TUEA 5IPHA 4ECIA 3GHAA 2REMA 1CQGA 1WWJA 2Z9SA 3Q74A 2H30A 2JADA 1N2AA 3IDVA 4K9ZA 4Q5NA 5HR2A 5HFGA 2OACA 3HJOA 3CRTA 1XPVA 2J9HA 3MSZA 5DAKB 4NPBA 4DSSA 1K0OA 3O76A 2VLVA 3N9JA 2PBJA 4O32A 1BG5A 2AUVA 3CTGA 5ECHB 2FY6A 1URMA 4RUVA 1C72A 3WT1A 3HY2A 4FYUA 2C8UA 3ZTLA 2AAWA 3H4KA 2OE1A 1FOVA 2PVQA 1F3BA 1PL1A 3TGZA 2JSYA 1YF0A 3KH9A 5EPFA 2VIMA 4QQ7A 17GSA 3MDKA 1NW2A 3A2XA 2FWFA 1BYEA 3HVXA 3ZITA 1U6TA 1CQHA 1GUHA 2OBKA 2HRNA 4HJMA 3O3TA 4EDYA 5D9XA 3J7Yk 1M2BA 2V6OA 3VK9A 1SJIA 1ERWA 3GRXA 5CRHA 4G2EA 3IBHA 4DSSB 2DSAA 1A0RP 4K2DA 2V2GA 4LL4B 2CQ9A 2JACA 4YQVA 5F07A 4ZIJA 4XHMA 2X8CA 4KNDA 1Q98A 4X43A 1BX9A 3H79A 1GTIA 4POLA 5ECMB 3GFKA 2IIYA 3F4SA 2LV3A 2I1UA 2HZFA 2YZHA 1LBKA 2LSTA 3TRPA 3UBLA 5FT3A 3QAVA 3KTBA 4WXTA 2DIZA 2XPEA 2WFCA 3KH7A 1EP7A 3H8QA 3ZVJA 3ZVJD 5KN2A 5CO3A 1V57A 2GZYA 3FR6A 3TCOA 1FO5A 3IV4A 5D96A 2XBQA 2VL3A 1K0CA 5EL8A 3EURA 2FCHA 4ZXGA 4J57E 1M7TA 3DWVA 3IAS2 5H5SA 4RI6A 4KDYA 4WETA 4ZB9A 2ZNMA 4K8MA 4V2NA 2JL4A 2DLXA 2R6KA 1H75A 4OD7A 4IQAA 1KBNA 2LJKA 3LFLA 1WOUA 1MDJA 2NVLA 3CYNA 3QR6A 4ID0A 4KE3A 3U6VA 3UBKA 1V58A 1DE2A 4IW9A 3RPPA 2MBSA 2C3QA 5CP1A 1ZYEA 5IOXA 1I9DA 2IMFA 1TJDA 4L5LA 2B6MA 1O81A 1Z7PA 4G9HA 3IXRA 4K0GA 6GSYA 1EGRA 2DJ2A 5GSTA 2LS5A 3KD0A 4Z7XA 1R4WA 4NV2A 1Z7RA 2FUG2 1T00A 3ERFA 3GX0A 2GT6A 3A2WA 2GLRA 3IOSA 4AF2A 5G1KA 2VCXA 1TDIA 3KP9A 2DJJA 2KP1A 11GSA 1SKSB 1GUKA 4EDZA 2ALBA 3KMOA 5IO0A 1E6BA 3ZL5A 1XW6A 2YCDA 4PNFA 1T8EB 2CZ2A 1DBYA 2YJHA 3DMLA 1XWBA 3ZRDA 5F8BA 4HU9A 3KGKA 4E8HA 3GH9A 4TXVA 4MJBA 4BL7A 3MAKA 2QSIA 1H4OA 3GX8A 4KDUA 4DVCA 4J56E 5AGYA 3LYPA 3ZIJA 2H1DA 4Q5FA 3UJ1A 3ISOA 3QAGA 5A4WA 2D2ZA 3IE3A 2VCTA 3DGQA 1SL0B 1JZRA 1K3YA 3FZAA 2NPBA 4Q5QA 1F3AA 4WKWA 5GSSA 5DQSA 1RW1A 1UC7A 4HQZA 2IMEA 3F9UA 2L59A 3GA4A 3IHQA 2N5FA 2LKUA 5G5EA 3UL3A 3VI7A 5CRGA 2L4CA 4IQ1A 4XS4A 1X9WB 5B8BA 1EEJA 3RHBA 1Z3EA 3TB2A 1TRUA 3TKSA 1O85A 4ML6A 3BD2A 2PWJA 4KDXA 2GSRA 1WIKA 4KUNA 4X0XA 2FD3A 2IL3A 3O6TA 3IPZA 4NAXA 1VF4A 3FY7A 2OADA 4N0VA 3D6IA 3Q19A 1AAZA 4IJIA 1J9BA 4KX4A 4NV5A 6GSTA 4AJ6A 2GSQA 1SJ6A 1X5CA 2WJUA 1G6WA 4POMA 2O7KA 5CRDA 6GSUA 4BWQA 3F3QA 2B5XA 3HDCA 1TRWA 5H5QA 5DBQA 1F9MA 5FWGA 14GSA 4BWSA 4PUFC 3A3TA 2AYTA 1ACVA 2NDOA 5IOWA 3A2VA 4MMMA 1EOHA 1J0FA 4L0WA 1AQXA 3D5JA 3BBYA 3RHCA 4KAEA 2LQOA 1T1VA 1ILOA 4E8EA 1A23A 4XS4B 5CYYA 3KEBA 2G0FA 3ME7A 2JZRA 1ML6A 1G7OA 1QGVA 4IP1A 5GAPD 3GNJA 4TW5A 2L5OA 2F8AA 3PH9A 3BOAA 2XBIA 4MA9A 1TI3A 1EEMA 1XOAA 5G5FA 3F6DA 3P7XA 3VWWA 1Y6EA 4OFNA 1W4VA 4PURA 4LL1B 2FWGA 2VM1A 3GIXA 2HLSA 2YANA 2VL2A 3LEFA 1PL2A 2VCZA 3FZ4A 4HI7A 1YEXA 2ZUPA 1T7PB 1FW1A 3DRNA 2IWTA 3C1SA 5AISA 3GKKA 3OR5A 1ZCPA 3QCPA 2L57A 3P8WA 3CXGA 2FHEA 5IMFA 2IFQA 1K0NA 1VF3A 1EZKA 1A8YA 1M2DA 4D73A 3G7YA 1G7EA 2H19A 2J23A 2LQQA 2QGVA 4H86A 3L9UA 1K0MA 2E2GA 2OBIA 1W89A 4PXOA 4P3YB 5B6MA 3DXBA 3EC3A 2MMAA 2R2JA 3IR4A 3VI5A 3H93A 3BJ5A 5ECQB 2RIIA 2R5GA 4XS6A 4IELA 1BJXA 4MJCA 2P5QA 1TK0B 1HD2A 3GL5A 2IPAA 4EKZA 1XVWA 1YKAA 2X8HA 4WEYA 3HA9A 4K7OA 4X1UA 1SKWB 2VCWA 1ERTA 3HCZA 3HJPA 2H6YA 2CX4A 4XCSA 1XIYA 2QKEA 5J9BA 4XRAA 1VRSD 1QQ2A 1GSQA 2KOKA 5DCHA 3EE2A 1XW9A 4TXOA 5A4VA 1A2LA 3A5WA 1PMTA 1PA3A 3TJFA 1Q4JA 3U5RE 2L6DA 2DJ0A 4MF7A 3WGEA 3C73A 1XXUA 2IFQB 1XVQA 2HSHA 2VCQA 4N0ZA 4IVFA 8GSSA 2GQKA 1TU7A 1ZL9A 3TKQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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