1M2BA

Crystal structure at 1.25 angstroms resolution of the cys55ser variant of the thioredoxin-like [2fe-2s] ferredoxin from aquifex aeolicus
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
101
structure length
101
Chain Sequence
FKHVFVCVQDRPPGHPQGSCAQRGSREVFQAFMEKIQTDPQLFMTTVITPTGSMNACMMGPVVVVYPDGVWYGQVKPEDVDEIVEKHLKGGEPVERLVISK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High-resolution crystal structures of the wild type and Cys-55-->Ser and Cys-59-->Ser variants of the thioredoxin-like [2Fe-2S] ferredoxin from Aquifex aeolicus
pubmed doi rcsb
molecule keywords [2Fe-2S] ferredoxin
molecule tags Electron transport
source organism Aquifex aeolicus
total genus 33
structure length 101
sequence length 101
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-06-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01257 2Fe-2S_thioredx Thioredoxin-like [2Fe-2S] ferredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1m2bA00
5GAPD 1XFLA 2HNLA 2IFQB 1GULA 3ME7A 1OE8A 3FZ4A 2M80A 3O76A 3D0ZA 4Z7XA 1TJDA 3BOAA 1G0TA 1G7OA 1O85A 5G30A 5KN1A 1EV4A 5KN2A 2C8UA 3HD5A 5CRGA 1O81A 4K2DA 4N0ZA 3RHCA 3QFBC 2YWNA 3IHQA 3TCOA 2VCQA 2PVQA 3WGXA 4PUAA 1SL0B 4WBJA 2WDUA 4QL7A 2L4CA 4KNDA 17GSA 1JZRA 5DALB 5F8BA 2QSIA 4V2LA 3NOFA 2VCVA 4PQHA 2L4QA 1Q98A 2GQKA 1J0FA 1FB0A 5ECKB 3KD0A 1THXA 5G1LA 3V1WA 3LQ7A 3DWVA 2BMXA 5DCGA 1YEPA 5IIZA 2DJKA 3H8QA 2OE0A 4TW5A 7GSSA 4JBBA 1ERWA 3ERWA 2I9HA 1MD3A 1HYUA 4TVEA 5AISA 3H4KA 3M1GA 1MEKA 2GS3A 1F2EA 1O6JA 3HKRA 3G7JA 3GH6A 4EC0A 1ZYEA 2H71A 1Z9HA 1Z6NA 1VF2A 2PUKC 2VD0A 1K0MA 3ZYWA 2B7JA 3DVWA 4EE0A 2A2SA 4ILFA 1SK1A 3IE3A 4F0BA 4ISDA 4WETA 1USBA 1X0RA 2QC7A 2GSRA 4EDYA 1YF0A 1WWJA 6GSSA 2RUFA 1JZDA 4IQAA 1T8EB 2C0EA 1GWCA 3CBUA 1VF1A 4HI7A 1X9MB 4HJMA 1DUGA 4JU5A 3P2AA 1EP7A 4EL1A 2CX3A 4HU9A 1XWAA 1U6TA 3MWHA 4RI7A 2PVOC 5GAND 3WYWA 3APOA 5ECHB 3UBKA 3F3RA 2L59A 2FNOA 4IJ3A 1TTZA 2L5LA 3GA4A 2HE3A 3J7Yb 3VWXA 5DBQA 22GSA 1R26A 4GSNA 3F4TA 1A8LA 4K7NA 4GLTA 3L9UA 2VM2A 1T3BA 2M72A 4OFMA 5A4WA 3ED3A 1S3DA 3K8NA 1FG4A 2KHPA 2K8VA 3GRXA 1V98A 4PURA 1TKDB 1R7HA 3BCIA 3IR4A 3GN3A 3IOSA 3IDVA 1FB6A 1O7UA 3KP8A 4IELA 2F8FA 2X8HA 2B6MA 1TI1A 4K6XA 4PNFA 4K0NA 1PRXA 2FGXA 5DDLA 2LS5A 2H1GA 5H5SA 2LTKA 4Q5RA 2K8SA 2C3NA 1PX6A 2YWMA 3W8JA 5ECSA 5H5QA 5IQYA 2ZNMA 4IJIA 4MPGA 5IPGA 4POMA 3HVSA 3EU4A 4YQUA 1K3YA 3CSIA 1O8WA 1F37A 4NXIA 2XC2A 4FYBA 3LFLA 1UVZA 2YZHA 3TDGA 3EE2A 4GXZA 1SKWB 4XCSA 4KAEA 3KZQA 3HJMA 4I2UA 3S9FA 1RQMA 4MF5A 3U5RE 3VURA 4HZ2A 1BEDA 5IO2A 1B9XC 4WXTA 1V9WA 3ME8A 2VD1A 3WT2A 1OKDA 4BWSA 4ZL9A 2ES7A 5HFKA 2CVKA 3UJ1A 4TR0A 3R2QA 1TRSA 3DVXA 6GSYA 4GQCA 4ZILA 1M7TA 1WPIA 5ECNB 5JWRB 2CQ9A 2GSSA 3KM6A 1AC1A 5CNWA 2GQLA 2VLTA 1JLVA 5CYYA 4WR4A 4AJ7A 4I2TA 1G6YA 4G19A 1PN9A 4XHMA 2GSQA 2H72A 5EY6A 3J7Yk 1MDIA 1PD21 4TR3A 1OVNA 2DIZA 3HVVA 5G5EA 5ABRA 5EVOA 2IJYA 1JHBA 2OA7A 4CHSA 3FW2A 3TRXA 5ECPB 2LQOA 2K6VA 2GLRA 4NMUA 2E7PA 4OO4A 4YAVA 3D22A 1B48A 1F9MA 3VI7A 3C1RA 3I6AA 3TUEA 3TKQA 4FIWA 3HZ4A 1A24A 2J23A 3TKPA 1GSUA 2FWFA 3FY7A 4NV2A 4HQSA 2IMKA 3KTLA 4Q5FA 5J9BA 1M2DA 1WMJA 5CREA 1DE2A 2FCHA 2IWTA 2CZ3A 1EP8A 3ZIJA 2H73A 4L0WA 2CV4A 1HNCA 3GHAA 3HXSA 2P5RA 2GGTA 4IS0A 2WJUA 4ECCA 3IAS2 2JSYA 4TR1A 5ECQB 2H76A 5DQSA 1GRXA 1TRUA 2VUPA 3GTUA 3GSSA 1N2AA 1EEJA 4IVFA 2AYTA 2YV7A 4KGIA 4KDXA 3TJFA 1PX7A 2VCWA 1KBNA 3DKSA 1WE0A 3TJGA 4KUNA 3GL5A 2YV9A 1GSQA 1ML6A 4F2IA 3KJYA 1FAAA 1RW1A 4IN0A 3QFAC 4D73B 1GSYA 2GVPA 5DQYA 6GSUA 2REMA 2ALBA 3O6TA 1GH2A 2JL4A 4IHUA 3L78A 5J4UA 5ECRB 2GT6A 3QAGA 4OCEA 3KH9A 2X8GA 3N5OA 1S3CA 1Z3EA 1M9AA 4ML6A 5IPHA 4V2NA 1H75A 3ERGA 2FD3A 10GSA 4MZCA 4LL1B 5IO0A 2XPDA 3G9BA 4TR4A 3LGCA 2VIMA 5F0GA 3Q19A 1A8YA 6GSVA 5AIVA 1WRYA 3ZMKA 4KA0A 2DJ3A 5D93A 1DE1A 2DMLA 3HJOA 1OE7A 2VO4A 3DMLA 1V2AA 3UEMA 1W4VA 2RM6A 1ZMAA 4WF5A 3WGEA 3IA1A 1X9SB 1AQVA 3TOTA 2OE1A 2HSYA 1XBSA 2VLUA 2HZFA 2HSHA 3RPNA 4PQ1A 1RK4A 1K0OA 4GF0A 1TP9A 4MF7A 4XS6A 2YWIA 3DRNA 3N9JA 4E8HA 3M8NA 3O3TA 3RBTA 1XWBA 1N8JA 3MSZA 4LL4B 2QGVA 4ZXGA 4MLYA 2VAFA 2AAWA 2XHFA 2AV4A 5D9WA 3TJJA 5E4WA 2LRCA 3G7IA 4IBPA 2ZCTA 4CW9A 1A0FA 1PL2A 5CO3A 1GNEA 2LJAA 4HU7A 1OKTA 3L4NA 3HJPA 3IC4A 3PGTA 3CXGA 4K1FA 3E0UA 2OADA 3QOUA 2PPTA 4TKYA 2OKAA 1F3AA 2YANA 1AIUA 3KMOA 2FY6A 4YAPA 2V1MA 4I5QA 5E59A 3TRQA 3VPTA 5G5FA 5J3RA 1OC9A 2PGTA 1BAYA 2V41A 4PUFC 4XRAA 3CMIA 2PWJA 5DAKB 1SD8A 1TXXA 3F6DA 4DSSA 4KSMA 2KUCA 3UL3A 1MDJA 5F05A 1EV9A 2YJHA 2DJ0A 5IOXA 4MCUA 2P0GA 1SJIA 2L57A 5F06A 1GTAA 1AQWA 2V6OA 2E0QA 3DIEA 2HZEA 1T4YA 2HLSA 4LA1A 4DEJA 1DBYA 20GSA 4JR6A 3EC3A 1ZYQB 3BCKA 1SD9A 1XPVA 2K9FA 2MMOA 1C72A 4HQZA 2PBJA 2IIYA 3KIJA 2R37A 2IMDA 2HRNA 2LKUA 3P8WA 2CAIA 5IMZA 4BVYA 5ELGA 1GUMA 1PQNA 1U87A 2LEGA 1B4PA 2JADA 2LQQA 4GQFA 5ECLB 2GZPA 4HZ4A 3VLNA 3EU3A 4P3YB 1VRSD 1XOBA 3QAWA 1GSDA 4O92A 1PKWA 1M2BA 4DSQA 3IV4A 4HUAA 1O73A 4F9ZA 1QQ2A 5CRHA 1TI3A 2DMMA 2AUVA 5KEJA 2H6YA 1A23A 2HRFA 1B9YC 16GSA 4DSSB 2B3SA 5L71A 1U3IA 2H30A 3UIWA 2H70A 1AW9A 1Z6MA 2I1UA 2Z9SA 5GSSA 3I43A 1G7EA 5ECOB 3WT1A 3HCZA 3GKNA 3L0HA 5KN0A 4AGSA 3C8EA 3LWAA 3TB2A 4ZBBA 2P31A 3QR6A 2IMEA 5IMAA 2C3TA 2H19A 4WKWA 3FEUA 1AAZA 2OACA 1J9BA 2VCZA 4I8BA 2I3YA 3GSTA 2WZ9A 5J9CA 2K18A 1X5EA 5CRDA 2H1AA 2YNXA 3ZMLA 1ACVA 2H6XA 4PX1A 1ILOA 2A4VA 2VL9A 2H8LA 4POKA 1ST9A 2N5BA 1V57A 2EIOA 5IMVA 3C1SA 2C3QA 1SU9A 1GUKA 3DD3A 4MZBA 1PKZA 2PN8A 4WR5A 4FYCA 1R5PA 1HNAA 1XXUA 2IMFA 4JRRA 2B5XA 2EIQA 4I6XA 4QQ7A 11GSA 4WF4A 1XWGA 9GSSA 2RUEA 4KB3A 2LNTA 4NHZA 5DVBA 1K0AA 2GT5A 4L0UA 2IPAA 5INYA 2ZUPA 5H5RA 4BWQA 1XW9A 3F3QA 1KEBA 4OMVA 2PERA 3OR5A 19GSA 2LSTA 3H1NA 4LLRA 5D96A 3GURA 2H1DA 2E2MA 12GSA 3JCML 2GSTA 5JWQB 2DBCA 5A5KA 4L8EA 4X0XA 1CQGA 1YEXA 2O87A 4GWRA 2L6DA 5D9TA 4ZB8A 2NPBA 2OBKA 3EMXA 1TDIA 5ELAA 4GCIA 2VL2C 2DJJA 2CZ2A 5LD0A 4L5LA 1SJ6A 4OWYA 1OYJA 1QMVA 1A0RP 4MA9A 2LUSA 4K7IA 2LRNA 4QL9A 1EZKA 1U3AA 2WULA 5ECMB 3RHBA 4YQMA 3GMFA 4MMMA 3FZ5A 5JCWA 1I5GA 3QCPA 3HHVA 2NTOA 2KLXA 2VL2A 4ACSA 6GSTA 2DJ1A 1BJXA 2JZRA 3GH9A 4Q5QA 2DIYA 3SBCA 1ZL9A 3W6GA 2MMNA 2LJRA 3ISOA 3FRCA 2OJLA 1CQHA 3EWLA 1KTEA 4JZQA 2LJKA 3ZVJA 4IP6A 1URMA 1T00A 5D73A 3KP9A 4XS1A 1WP0A 3RAZA 4ECIA 2HFDA 5GZZB 2DSAA 2NDOA 4GSSA 5IMDA 2DLXA 1F3BA 3VWWA 4O5RA 2GZZA 5J41A 1GLQA 1GTIA 5F07A 2C80A 1XW5A 4XIHA 2PMTA 3M3MA 3Q74A 3WGDA 1ON4A 1EEMA 5HR2A 1FVKA 4TOPA 2NBSA 4OFTA 2TIRA 2AJQB 4O32A 3CRUA 4MJCA 3UVHA 3VK9A 3HYPA 3D4MA 4AJ8A 3DGQA 1FO5A 3D5JA 2ON5A 3ZFLA 1B4QA 2DJ2A 2V2GA 4YQVA 3QAVA 2IL3A 1MDKA 3CRTA 4KW6A 1Y25A 4H86A 1PSQA 1K0CA 1UA5A 4JR4A 2QKEA 2GZYA 1KNGA 2H6ZA 2G2QA 4KDYA 1NW2A 4J56E 4BPYA 4CDOA 4G9HA 2YZUA 4MZWA 4IW9A 4ZB6A 1YY7A 1ERTA 1F6MC 2MMAA 5IOWA 2LRTA 2DC5A 4K7OA 2X64A 1XWCA 1Z7RA 4XS4A 1YDKA 5EPFA 3FKFA 4MJBA 1ZCPA 1TK0B 5G2ZA 2B5EA 4OO5A 1GTUA 2IFQA 1XIYA 2FUG2 5DCHA 3F9UA 2R5GA 3GKKA 1AUCA 4MABA 5COHA 1TU7A 3LXZA 2HI7A 2M46A 5G31A 3A5WA 3VWUA 4TR1B 4EVMA 6GSXA 3APQA 4K0GA 4MPFA 2B7KA 3NIVA 2VLVA 3ZRDA 2FWEA 4ZB9A 1XVQA 3GTUB 2F3MA 4TRXA 1B8XA 1EOGA 3GKMA 3LJRA 2YN1A 1Y6EA 1T1VA 5DALA 2FWHA 2R3XA 1SL1B 4OCFA 1V40A 4NHWA 1HQOA 4GRFA 1A2MA 4ZL7A 5IMFA 4FH8A 2OBIA 2MBTA 3EVIA 5JWOB 2JZSA 2CX4A 2VOCA 3F4SA 1FW1A 2N5AA 3UMAA 4F03A 1FHEA 3HY2A 1THOA 4XS4B 3EURA 5A4UA 3U6VA 4MDCA 4RQXA 3LXTA 2WCIA 5JCGA 5FT3A 4ULXA 4TN8A 3GV1A 3LEFA 2A2RA 3APSA 2O85A 4ECBA 3CTGA 3DYRA 4E8EA 2OE3A 4V1Ag 1VF4A 5CRWA 2HXKA 4ZIJA 2IN3A 4OFNA 3US3A 1M9BA 3Q6OA 4JEDA 1TOFA 1QXHA 1SL2B 1PGTA 3CSHA 3CTFA 2BJXA 3P90A 3QDNA 2KP1A 1MD4A 1BYEA 2C0GA 4ECJA 2V32A 2VL3A 1YKAA 1SK0A 4FO5A 4RUVA 2C1YA 3KH7A 5B8BA 2E2GA 2L6CA 2PU9C 1ERVA 2O8VB 2JACA 14GSA 4GTUA 1R5AA 4TXVA 1J08A 2VM1A 3TJKA 1M99A 4O7HA 4G2EA 5EL8A 2H75A 2GTUA 3M9KA 2TRXA 4WEYA 4HJ2A 2FLSA 3UARA 2LNSA 1FOVA 1EOHA 5AGYA 2YCDA 2HYXA 3GKXA 4KCEA 5HR0A 3ZFBA 1OC8A 4ZBDA 3FR6A 1AQXA 3MNGA 2H0IA 3QD9A 1Q4JA 3F8UA 4POBA 2F8AA 3UOMA 2XBIA 3FK8A 1Z7PA 1HD2A 2P5QA 3Q18A 4IP1A 5GSTA 3D6IA 5B7CA 1IYIA 1BQ7A 3F4RA 2C0DA 5FHIA 2R6KA 2FA8A 4EXJA 2YWOA 1K3OA 1OC9B 2H01A 4ML1A 1BG5A 3EMPA 2CVDA 3IRAA 1TU8A 2LV3A 4ZL8A 5G1KA 5HFIA 1OAZA 3C71A 3C7MA 3GFKA 4AF2A 5ENUA 4PGTA 2WFCA 5ECIB 2CVBA 3FR9A 3F6FA 3GIXA 4MK3A 4DVCA 1PA3A 8GSSA 1XVWA 4KCAA 4TXOA 3GNJA 3TGZA 3UVTA 2H74A 2JZTA 2C0FA 2HZEB 1S3AA 2L5OA 3PR8A 1SYRA 1GSEA 2H0GA 2F51A 5D8IA 2XPEA 4X43A 4BA7A 1NSWA 4RQRA 2X8CA 2KP2A 3FZAA 2G0FA 3E3EA 4KX4A 6GSWA 1ZOFA 3VI5A 2KOKA 4KH7A 4KE3A 3RPPA 1SENA 1GL8A 4JE1A 1K0DA 1E6BA 1ZZYA 4NPBA 3AY8A 1PMTA 5C00A 2MBSA 3D4TA 4HEA2 4EKZA 3IK7A 3EYTA 3HZ8A 3I9V2 4K8MA 1EGOA 3ZIVA 3CYNA 1SYXA 3FR3A 1TW9A 1SK2A 2JU5A 4MF6A 1QFNA 1JZOA 3GL3A 1O8XA 5J5NA 1GNWA 3G7YA 5B6MA 5B8AA 1X5DA 1G6WA 3TJBA 2H66A 1JLWA 1VGLA 5AN1A 5LCZA 3UBLA 4G10A 1A2LA 2R4VA 4IKHA 3NZNA 4K9ZA 1XW6A 3VFIA 5FWGA 4TXOB 2WB9A 3KMNA 3LORA 1XWKA 4DSRA 1UN2A 3QPMA 2EC4A 3LG6A 1LU4A 5D9VA 1TK8B 2NVLA 1ABAA 1WIKA 3IAM2 1M0UA 3GUSA 3LYPA 4PQIA 3A2XA 3D21A 2FA4A 2FWGA 1T7PB 2IMIA 2YPMA 3CSJA 4HS1A 3TKRA 2R2JA 3ZTLA 1YQ1A 5HR3A 4IGJA 4IQ1A 1W89A 2B1KA 3WD6A 2HT9A 2H0HA 4LMWA 2MZCA 2N5FA 5D9XA 1OC3A 5IMCA 4NV5A 1JZWA 1I9DA 2H1BA 2J9HA 1X9WB 1NM3A 2C4JA 4N11A 2O89A 3L9SA 1QGVA 2MYGA 2GDRA 3ERFA 5AIXA 3GYKA 2WRTA 1R4WA 1X5CA 4HDEA 2RLIA 5DJMA 1K0NA 2B1LA 3H93A 3GX0A 3HVXA 4BVXA 3KGKA 3ZZXA 2JSZA 3LSZA 1LJRA 3W8SA 4YH2A 5HFGA 2X99A 4HOJA 1ERUA 1EGRA 1GUHA 4D73A 1DSBA 1GSFA 2EIRA 4RI6A 4LMVA 2D2ZA 3M9JA 1LBKA 2ON7A 2TRCP 3IXRA 3GX8A 2CAQA 1Z5YE 4F82A 1VF3A 3L9VA 1A2JA 1E2YA 1FVJA 4EF0A 1AXDA 5ID2A 5CP1A 3DEXA 1YZXA 4AJ6A 3ZLPA 4N30A 4XRDA 1HNBA 3IBHA 1M2AA 4KDUA 3I69A 2RM5A 3EINA 4PNGA 3SWLA 1WOUA 4J2FA 1TK5B 1T4ZA 1PL1A 1QUWA 5CAXA 3F63A 3ZVJD 5A4VA 1SKSB 4V1Ap 4I97A 1YKCA 4WBRD 4EDZA 4X1UA 3H79A 4PXOA 2B5YA 1GP1A 3ZITA 3DXBA 5HR1A 5JCUA 3KXOA 2YOIA 4L5OA 1WJKA 3LYKA 2YP6A 1K3LA 3F0IA 3UAPA 1IYHA 2CA8A 1MTCA 4MH2A 1XOAA 2WS2A 4NWYA 4N0VA 4EO3A 3BBYA 1H4OA 1SKRB 1TRWA 3KTBA 3FHKA 2RIIA 3VWVA 4KSOA 1TRVA 3TRPA 5B6NA 5HQPA 2CT6A 4F0CA 1NHOA 3FYGA 3PINA 4Q5NA 2AHEA 3TKSE 2FHEA 4NAXA 3TOUA 1SJZA 4MP4A 3TKSC 3P7XA 3KCMA 5KN3A 3A2WA 4FYUA 2WGRA 4MJAA 3M0FA 3KEBA 2AB6A 3E9JB 4ZBAA 5ID2B 4MJEA 5LNKe 3QMXA 1YJ6A 3ZL5A 13GSA 2MMZA 1GSSA 1ZGNA 1GLPA 1XCCA 2VCXA 3FZ9A 5C04A 18GSA 2XBQA 4N10A 3PH9A 3TKSA 2VCTA 3HA9A 1U88A 3BJ5A 1BX9A 2F9SA 1EWXA 1YF1A 3RDWA 3MAKA 4POLA 4J57E 1NHYA 5DAKA 1JFUA 2V6KA 2YJ7A 1UC7A 3A2VA 4EUYA 3VPQA 3ZREA 5IM9A 3BD2A 1V58A 4GSTA 4BL7A 4V2MA 3C73A 1QK8A 2O7KA 3HDCA 2BTOT 1K0BA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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