1NM3A

Crystal structure of heamophilus influenza hybrid-prx5
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
237
structure length
237
Chain Sequence
SMEGKKVPQVTFRTRQGDKWVDVTTSELFDNKTVIVFSLPGAFTPTCSSSHLPRYNELAPVFKKYGVDDILVVSVNDTFVMNAWKEDEKSENISFIPDGNGEFTEGMGMLVGKEDLGFGKRSWRYSMLVKNGVVEKMFIEPNEPGDPFKVSDADTMLKYLAPQHQVQESISIFTKPGCPFCAKAKQLLHDKGLSFEEIILGHDATIVSVRAVSGRTTVPQVFIGGKHIGGSDDLEKY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Tetrameric Structure of Haemophilus influenza Hybrid Prx5 Reveals Interactions between Electron Donor and Acceptor Proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Protein HI0572
molecule tags Electron transport
source organism Haemophilus influenzae
total genus 55
structure length 237
sequence length 237
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2003-01-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1nm3A01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1nm3A02
3L4NA 3WD6A 3I6AA 4IP1A 3EE2A 1C72A 2IMFA 7GSSA 1XZOA 4K7NA 4HJ2A 1Z5YE 2F51A 2JZSA 5D9XA 2VIMA 4ACSA 1ILOA 3A2WA 5C04A 4RUVA 1F37A 5IMVA 2I81A 4OFMA 3RPNA 3I69A 2VOCA 2AAWA 5H5RA 6GSXA 1GUKA 2R37A 2DIYA 4XS4B 1EV9A 3H8QA 4ML6A 2CX4A 1ABAA 2IN3A 4PXOA 3RBTA 2K18A 3F9UA 4EC0A 1MDKA 2NPBA 1A2MA 1GTIA 5ID2A 3SBCA 3VPQA 3APOA 3DKSA 5G31A 1GSUA 5A4VA 1Z3EA 3M3MA 3AY8A 3FEUA 2ES7A 5D8IA 4WR5A 3L78A 3W6GA 3UMAA 2H0IA 3APSA 4GWRA 2OACA 5IM9A 2OBIA 1SK2A 1OC9A 3HYPA 5KEJA 2LSTA 2I1UA 3UEMA 3GL3A 3CYNA 5IOXA 3ME8A 10GSA 3ZFLA 3UL3A 4HQZA 2ON7A 2H1GA 4KUNA 1R5AA 2H0HA 3G7JA 2LRTA 2NVLA 1FVJA 1HNAA 4KDYA 4LL1B 5IO2A 3D4MA 2FWEA 3LGCA 2N5BA 1EWXA 4HDEA 2CZ3A 4GQCA 4OMVA 2YWIA 1XW9A 1YKCA 4TW5A 3FRCA 1XWAA 4MF7A 2E2MA 4GTUA 1B9XC 1R26A 1XOAA 3S9FA 3GA4A 4I8BA 3ZLPA 2YWMA 1R7HA 2VM1A 5ECHB 4EUYA 1XW6A 1A0RP 3MSZA 2LQQA 3HJPA 3ZITA 3QDNA 1J08A 2HNLA 5ELGA 3ZL5A 2MBSA 5EPFA 1SJZA 2HT9A 6GSVA 4OO5A 3TGZA 3GMFA 4PGTA 4GLTA 1PD21 2AUVA 4IVFA 4MK3A 4KH7A 3J7Yb 2PVOC 2X64A 3GX0A 1Z7RA 2P5RA 2R3XA 5EY6A 3TKQA 5F05A 2VAFA 2X8CA 2ON5A 1B48A 3FY7A 3UARA 3KM6A 2TIRA 4F9ZA 1UVZA 5ECNB 1BEDA 1VF1A 3KMNA 1JLWA 1SL0B 4PQIA 1TKDB 3G7IA 1T3BA 1Q4JA 2XPDA 2YNXA 1NM3A 1OKDA 5CRDA 4LL4B 4XTSA 2PN8A 3GKNA 1BG5A 4LLRA 1G7OA 1JZWA 4K8MA 3F4SA 3F3RA 4ECCA 2V6KA 2LJRA 1YZXA 1YF1A 3MWHA 4RI6A 2H1AA 1SJIA 4N0ZA 2HXKA 5G1KA 3DYRA 2V6OA 1JZRA 3D22A 1F9MA 2J23A 3FR6A 5E4WA 5AGYA 1K0CA 2N5AA 1ERWA 3IHQA 1USBA 2WCIA 5CNWA 3E0UA 4JBBA 1F3AA 3EYTA 4JE1A 3F6FA 4XHMA 3TOTA 5G30A 5ECOB 6GSSA 5FHIA 4D73B 2G0FA 1YEPA 2IIYA 1K3YA 4ZB6A 3HKRA 4KGIA 1K0BA 1RK4A 4O32A 16GSA 2F3MA 1GULA 3UJ1A 4WF4A 4F82A 2B5EA 2KUCA 5D73A 3Q6OA 1BJXA 5DJLA 5J3RA 2C3NA 2GQKA 2H6ZA 5KN2A 4YQMA 2HZEB 1W89A 1TRUA 2LV3A 4HS1A 1FOVA 4IJIA 3WGXA 3HZ4A 1EGRA 2CX3A 2DIZA 3UVTA 4L0WA 4GCIA 1U87A 2H75A 1BYEA 4MP4A 1A2JA 3RDWA 2L5OA 2E0QA 2C0EA 2KOKA 5AIVA 2GDRA 4Q5QA 1O8WA 1XWCA 4ZXGA 1DE2A 1GRXA 5IMCA 3M1GA 4RQXA 1PKZA 5CYYA 1X5DA 4YQVA 4F0BA 2HSHA 5AIXA 1Y6EA 4EDZA 4HU7A 4E8HA 1GL8A 2B1KA 3KEBA 2GSQA 3CRUA 3KMOA 1OVNA 2OE0A 3QAGA 1GLPA 3ED3A 2L4CA 2B1LA 2LNSA 4KDUA 5IIZA 2GS3A 4L5LA 4EE0A 4TOPA 3IR4A 4ZBDA 2K9FA 2GGTA 3QMXA 1AQVA 2QKEA 4N0VA 1DE1A 2F9SA 2L4QA 2V1MA 2YANA 3IXRA 1GNWA 2JACA 4YH2A 3CSIA 4QL9A 3O3TA 2WJUA 1XCCA 3H93A 4ZL8A 3BBYA 4MZCA 2VCZA 3QOUA 2YJHA 1GSFA 2FWGA 4ZBBA 2R5GA 2WDUA 4HEA2 4AJ7A 1S3DA 3E3EA 5H5SA 1K3OA 1E6BA 1R4WA 1AQWA 2GZYA 2VCVA 4K7IA 3GFKA 2DBCA 2MMZA 4I97A 1PKWA 1HNBA 2E7PA 19GSA 2R6KA 3LSZA 3HVXA 3P90A 4NAXA 2DJJA 2VCWA 1K0NA 3GH9A 4ZL7A 1R5PA 3EINA 2VL2A 3HY2A 2YWOA 1GLQA 4Q5FA 3KGKA 1BX9A 1GSEA 3TCOA 1ZOFA 4GQFA 3LYPA 2FY6A 2YV7A 2K8VA 3G7YA 1WIKA 2DC5A 4TR1B 2VL9A 1V58A 1VGLA 5AN1A 3GTUA 3GN3A 2JL4A 4LMVA 4LA1A 5KN1A 2YOIA 3EURA 4XIHA 1ZGNA 4KNDA 2WRTA 2HRFA 3H4KA 4J2FA 1GH2A 5JCUA 8GSSA 5ECLB 4WF5A 2OJLA 3TKPA 4PUFC 5B8AA 5FWGA 2IPAA 2O85A 2YV9A 3KH9A 2HSYA 5G2ZA 2OE3A 2GSRA 2IMEA 3RHBA 4ID0A 2P5QA 2PWJA 4X0XA 4QL7A 5ECQB 2IMDA 3ME7A 4FYBA 3FZ4A 5CO3A 2IWTA 1HD2A 3KD0A 2B7JA 4AF2A 4TR0A 4AGSA 1EGOA 1G6YA 1OYJA 3HZ8A 1SD9A 3DXBA 1M99A 2JZRA 4WR4A 3F4TA 4MLYA 2LEGA 3C1SA 1QFNA 1SK0A 4KE3A 4O7HA 3R2QA 5FT3A 1FVKA 1YY7A 2H01A 1FO5A 4L5OA 4HZ2A 2JSZA 4KDXA 3TJJA 4BL7A 3QAVA 1K0MA 3CMIA 4HQSA 4MDCA 4CHSA 4ZILA 2J9HA 4Q5NA 3LXTA 2O7KA 5DBQA 2PGTA 1V9WA 3QPMA 1XWBA 3RPPA 2GQLA 4JEDA 2NDOA 3UOMA 1QQ2A 3CBUA 1WRYA 5ECMB 4IGJA 3U5RE 1U88A 1AQXA 1JZOA 2CVKA 3GX8A 1GSDA 3ERWA 4JZQA 2MMAA 5C00A 3UAPA 1EOGA 5D9TA 3HVVA 3LWAA 3PINA 3VWWA 1G6WA 1RQMA 2WS2A 3PR8A 2OKAA 20GSA 2H74A 2DSAA 1AIUA 2CZ2A 4K9ZA 2YP6A 2CV4A 1T00A 2VCTA 1M2BA 4OWYA 4TN8A 4DVCA 1T1VA 2HYXA 2DJ2A 2XHFA 1FB6A 1SD8A 3LORA 4TR1A 1I5GA 3ZMLA 3VWVA 2IL3A 3DGQA 5GSSA 3ZMKA 1XPVA 1QK8A 1TI1A 2VL3A 1XWKA 1ZMAA 2CVBA 3HA9A 3FZAA 5G5FA 3H1NA 2A2SA 4PQHA 2JSYA 4EKZA 3HHVA 1B9YC 2H72A 5F0GA 2QGVA 3TKSE 3FKFA 3IAS2 2DJ1A 1VRSD 3VK9A 3SWLA 2BTOT 1K0DA 3DWVA 2ZNMA 2VLTA 4K0GA 4EXJA 4GSTA 3M9JA 2EIRA 2IMKA 1V2AA 3KZQA 4MJCA 3LJRA 3ERFA 3FZ9A 3EU4A 3QFAC 1LU4A 1X9SB 3I9V2 2HI7A 1THOA 2V41A 2GZZA 2R2JA 1TDIA 2VL2C 4MA9A 1KEBA 3TJKA 2QC7A 4KB3A 4WETA 3RAZA 4CDOA 3L9SA 4G9HA 3NOFA 3IBHA 1AW9A 3GURA 4PQ1A 1Z6NA 3F0IA 3TJBA 3HVSA 1GNEA 5ECSA 4NPBA 1S3CA 4EO3A 1N2AA 1T4ZA 5CRWA 3KXOA 2D2ZA 2MMNA 5LD0A 2NTOA 3CTGA 1UN2A 3KTBA 4GF0A 2BMXA 4KA0A 4HOJA 1TTZA 3TUEA 1XXUA 4LMWA 4K6XA 5A4UA 3BCIA 2DJ0A 2N5FA 2H71A 2H6YA 4H86A 2YJ7A 3TRQA 2G2QA 1OE8A 2I3YA 2P31A 3C73A 3TKSC 5HR0A 3LG6A 4BWSA 1ON4A 3GKKA 1TU7A 1DBYA 4G2EA 5D96A 3ZIVA 4MABA 4MCUA 3EMXA 1O85A 1X9MB 2I9HA 2VO4A 2FLSA 2CAQA 1SU9A 2PERA 1ML6A 3DEXA 3QR6A 1O7UA 4TR3A 1HQOA 2B7KA 2VLUA 5INYA 1EEJA 1BAYA 2H76A 4WBRD 3DRNA 2FWHA 4YAPA 4NWYA 5ABRA 4XRDA 4PUAA 1F2EA 2HE3A 2O87A 3M9KA 3QD9A 3CSHA 3US3A 2B3SA 3N5OA 4MJBA 1IYIA 2GLRA 2L6DA 4MPFA 4FH8A 2MYGA 3PH9A 3GHAA 5E59A 5CP1A 1MTCA 1TU8A 1LBKA 2DLXA 3KTLA 3F8UA 4RI7A 1JHBA 3GTUB 6GSWA 3F6DA 5G5EA 1U3AA 1X0RA 3VFIA 2LS5A 4HUAA 4N30A 1ZYEA 4HI7A 3HDCA 22GSA 3TJFA 1AXDA 2H19A 4FIWA 3KIJA 4IN0A 2GT5A 5JWQB 1TI3A 3KP8A 3APQA 1B4PA 3J7Yk 4XRAA 3VI7A 5HFIA 1DUGA 1T7PB 1MEKA 1GSQA 5G1LA 4F0CA 1AAZA 1GUHA 1O6JA 1WWJA 4ILFA 1QMVA 2JU5A 4XCSA 5DAKB 1SL1B 1X9WB 1TRSA 5B6MA 1K0OA 4EF0A 3TB2A 1PL2A 2H0GA 2QSIA 1PGTA 3CXGA 1SKRB 4OCEA 2C4JA 2K8SA 3KH7A 2Z9SA 3TRPA 4V2LA 4BVYA 5IMDA 3VLNA 2HFDA 1K3LA 3BCKA 2RIIA 5HR2A 5HQPA 2X8GA 3WT1A 2AJQB 3FR9A 2PBJA 4WKWA 4IJ3A 4ECJA 5IPGA 3IC4A 3LEFA 2KP2A 2RM6A 4QQ7A 1WP0A 3ISOA 4KSOA 3D4TA 1EOHA 3W8SA 3TDGA 1VF4A 2OE1A 4E8EA 2LJKA 4J57E 3ZVJA 1SYXA 3QCPA 2WFCA 4MJAA 1G0TA 1SYRA 5JCWA 2YZUA 1WPIA 4TXOA 2WGRA 1M9AA 3A2VA 1THXA 3A5WA 2H1DA 1OE7A 1FG4A 4F03A 4EL1A 4IELA 3WYWA 3VI5A 2XBIA 4HU9A 2WB9A 5F8BA 5A5KA 1TOFA 1WJKA 2C3QA 1PL1A 3F4RA 2IJYA 4IBPA 4K1FA 1UC7A 1SKSB 2PPTA 3GYKA 4WBJA 2B5YA 3CSJA 3IAM2 5J9BA 1K0AA 1O8XA 4POLA 3GH6A 1DSBA 4L0UA 1GWCA 2C0FA 4ML1A 5HR3A 4DSSB 2YWNA 3HD5A 4XS6A 2GQMA 4I6XA 2CAIA 5DALA 3I43A 1F6MC 1J9BA 2F8AA 2JADA 2LKUA 4OCFA 3HXSA 4ECBA 4O5RA 2LRCA 3P8WA 2LUSA 5KN3A 3TKSA 2H73A 4L8EA 1ERUA 4NXIA 3EC3A 1B8XA 4XS1A 2X99A 3DVWA 3F3QA 3EVIA 2LJAA 3BD2A 5CRHA 1V57A 2PU9C 5DDLA 1FHEA 5F06A 3MDKA 5ENUA 2LNTA 1CQHA 1PSQA 2L57A 4TKYA 1XWGA 2LRNA 3HJOA 4BWQA 2RM5A 5DAKA 5ECKB 5D9VA 2HZFA 2OBKA 2A4VA 2MMOA 3GNJA 4PNGA 1GTUA 5IMAA 4POKA 4MPGA 1UA5A 2P0GA 5H5QA 4Q5RA 4ZIJA 1NHOA 4Z7XA 1ERTA 2FNOA 2ZCTA 3BJ5A 4PURA 4G19A 4I2UA 18GSA 3DVXA 5B8BA 3UBLA 5J9CA 1FAAA 1TK0B 3ZYWA 6GSUA 4JRRA 2YN1A 1TK8B 5HFKA 5EVOA 2GSSA 4IP6A 4MZWA 1XIYA 2RLIA 2ZUPA 4TR4A 3NZNA 11GSA 1OC8A 3TKRA 1V40A 2E2GA 3FZ5A 1NW2A 3UVHA 4POMA 2FA4A 4KX4A 2XPEA 1JFUA 4KCEA 4KSMA 3IE3A 5ECPB 1VF3A 5DVBA 3IDVA 3G9BA 1NHYA 2YPMA 5GAPD 2GTUA 2K6VA 3IK7A 2H8LA 4TRXA 2V32A 5GZZB 2B6MA 3GSTA 1GTAA 3ZREA 5CRGA 3KP9A 2YZHA 4IQ1A 17GSA 1TRVA 4BA7A 2MBTA 4V1Ap 3WT2A 4K7OA 3FYGA 4IS0A 3ZIJA 1PRXA 4MH2A 4CW9A 1YEXA 4BVXA 1TW9A 2FHEA 4N10A 2CQ9A 2PMTA 4DSSA 2XBQA 2FGXA 1O81A 1IYHA 3TJGA 1XVWA 4MJEA 3K8NA 3EMPA 3UBKA 3C71A 1HYUA 2FWFA 1SJ6A 3LQ7A 3W8JA 3VPTA 3ZVJD 3DMLA 6GSYA 5ECRB 3Q19A 4PX1A 3ZRDA 1PX7A 2R4VA 2C1YA 1PN9A 3GIXA 5CREA 3WGDA 2FD3A 1ZYQB 1GSYA 4K0NA 2H1BA 2O89A 4I5QA 4KCAA 3P2AA 2GVPA 3LXZA 1T8EB 1SENA 1I9DA 2FA8A 3D21A 2KLXA 3GUSA 1S3AA 1N8JA 3RHCA 3FR3A 2C3TA 2H70A 4TXVA 3O76A 2C0DA 5JWRB 5LNKe 5DCHA 1QGVA 3ZZXA 3EU3A 1MD4A 4IQAA 4OFTA 9GSSA 1NSWA 4V2MA 4WXTA 1KTEA 1ST9A 5CAXA 5A4WA 1H75A 2VCQA 4MZBA 3D5JA 2YCDA 1M2DA 4X1UA 2M72A 4ECIA 3DIEA 3HCZA 3GKMA 1ZL9A 4DEJA 4IKHA 3OR5A 1ACVA 3A2XA 1J0FA 3BOAA 3Q74A 3VWUA 1M9BA 1WOUA 1KNGA 5IOWA 3O6TA 1XW5A 4MH3A 4EDYA 12GSA 3MAKA 2L5LA 1TJDA 4OD7A 5IPHA 1GSSA 4IW9A 1ZCPA 3WGEA 2A2RA 1PX6A 2AYTA 4OFNA 5IMZA 2CVDA 1LJRA 4F2IA 5JCGA 3NIVA 2M46A 1FB0A 5IMFA 4GSNA 3Q18A 1ZZYA 4TXOB 4BPYA 2DMLA 5JWOB 13GSA 1KBNA 4XS4A 1GP1A 3L9VA 3ZTLA 4NHWA 2AV4A 1OAZA 3IA1A 3HJMA 5J5NA 2FUG2 1YF0A 2VUPA 5J4UA 3PGTA 1U6TA 2NBSA 3IV4A 2L6CA 2RUEA 2XC2A 4ZB8A 3KCMA 2VLVA 2RUFA 3DD3A 2AHEA 3D6IA 1T4YA 1OC3A 1GUMA 3FW2A 1MDJA 3C8EA 4AJ8A 4I2TA 3M0FA 4ISDA 5DALB 2TRCP 2MZCA 4KAEA 1MDIA 1A23A 1EP7A 2REMA 1A24A 2PVQA 1H4OA 1OKTA 1EEMA 1QUWA 2DJKA 3TOUA 1W4VA 2DJ3A 5COHA 5GAND 2O8VB 2GSTA 3KJYA 1PA3A 3JCML 5B7CA 3FHKA 2CT6A 3VWXA 5D93A 2WULA 1WMJA 3C7MA 4JR6A 4ZB9A 4KW6A 1EV4A 2OA7A 2I4AA 3IK9A 1QXHA 2H66A 4HZ4A 2HRNA 2V2GA 2X8HA 4RQRA 4ULXA 1SK1A 4DSQA 4G10A 4EVMA 4GRFA 2IFQB 1A2LA 5EL8A 2EIQA 1XFLA 1XVQA 4MF6A 2AB6A 3ZFBA 4IHUA 4NMUA 3IOSA 4OO4A 1Z7PA 14GSA 3A3TA 3M8NA 2VD1A 2VM2A 5GSTA 4YQUA 1PMTA 1MD3A 5DQSA 4K2DA 5DJMA 1SL2B 3IPZA 4P3YB 3VURA 5F07A 4NHZA 3CRTA 1EP8A 2C80A 3FK8A 2VCXA 4NV2A 3IRAA 1M2AA 4NV5A 3EWLA 1AUCA 2F8FA 4PNFA 4POBA 1XBSA 1JLVA 2ALBA 3U6VA 2IMIA 1A8LA 3D0ZA 4V1Ag 5DCGA 5J41A 2B5XA 4ZL9A 2KHPA 2OADA 4O92A 3F63A 3TRXA 4D73A 5ID2B 2EC4A 3GV1A 1TP9A 1CQGA 2C8UA 1V98A 1Q98A 1URMA 4N11A 1YDKA 4YAVA 3QFBC 1TK5B 2PUKC 2H6XA 6GSTA 1SKWB 5IO0A 1OC9B 1XOBA 1A8YA 1O73A 3ERGA 2FCHA 4J56E 3MNGA 3LFLA 5DQYA 2M80A 1EZKA 2BJXA 2HZEA 1HNCA 3C1RA 2HLSA 3UIWA 1B4QA 1TRWA 3E9JB 3LYKA 1E2YA 5LCZA 1AC1A 5L71A 2TRXA 3QAWA 1BQ7A 2VD0A 2DMMA 2JZTA 3N9JA 4FO5A 2KP1A 5AISA 1YKAA 1YJ6A 3CTFA 4JR4A 5IQYA 4TVEA 1ERVA 1G7EA 4FYUA 2C0GA 1X5CA 2H30A 5ECIB 5KN0A 1JZDA 4AJ6A 1VF2A 1PQNA 1Z9HA 1M7TA 3L0HA 1WE0A 4GSSA 2EIOA 3GL5A 1YQ1A 5HR1A 2IFQA 4FYCA 4ZBAA 2WZ9A 1U3IA 4DSRA 3H79A 3P7XA 3L9UA 5B6NA 4V2NA 1GTBA 4GXZA 1Z6MA 2L59A 3V1WA 2LTKA 1Y25A 3GRXA 3GSSA 2GZPA 1FW1A 4MF5A 1X5EA 4JU5A 5HFGA 1F3BA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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