1NSWA

The crystal structure of the k18g mutant of the thioredoxin from alicyclobacillus acidocaldarius
Total Genus 31

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
ATMTLTDANFQQAIQGDGPVLVDFWAAWCGPCRMMAPVLEEFAEAHADKVTVAKLNVDENPETTSQFGIMSIPTLILFKGGRPVKQLIGYQPKEQLEAQLADVLQ

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
TI1 (6-9)TI6 (57-60)EMPTYTIV2 (78-81)S2 (20-25)TI5 (56-59)TI2 (26-29)TIV1 (71-74)AH2 (30-46)TI3 (46-49)TI4 (47-50)3H1 (102-104)S3 (51-56)AH3 (61-67)S4 (74-79)AH4 (93-100)S5 (82-88)S1 (3-4)AH1 (9-14)O1 (14-16)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Electron transport
source organism Alicyclobacillus acidocaldarius
publication title An integrated structural and computational study of the thermostability of two thioredoxin mutants from Alicyclobacillus acidocaldarius
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
total genus 31
structure length 105
sequence length 105
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.8.1.9: Thioredoxin-disulfide reductase.
pdb deposition date 2003-01-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1nswA00
2C80A 1ST9A 3AY8A 4QL7A 2P0GA 2CZ2A 3LQ7A 4TXVA 1YY7A 2YJ7A 2MBTA 1GTIA 3QAWA 2H1BA 5A5KA 3QAGA 3EMPA 4GQFA 4IN0A 2VL3A 5ID2B 2CV4A 2HI7A 2LRTA 3M9JA 4K7IA 4XHMA 3HJOA 1B48A 1EV9A 3CYNA 1YZXA 4MZWA 2GSSA 3HJMA 1BG5A 4DSSA 4L8EA 5JCWA 2KOKA 2PBJA 5J9CA 3N5OA 5IM9A 7GSSA 2R5GA 4JE1A 5HR1A 3M1GA 5KN2A 4E8EA 1GLPA 2K18A 3UVTA 3F0IA 1A23A 3MDKA 2REMA 2L6CA 2DIZA 3KCMA 4MH3A 4TR4A 2FWHA 3LEFA 1M9AA 2P31A 4KAEA 1B9XC 3TKSC 5JWRB 2YP6A 4QQ7A 2O7KA 2LNTA 3M3MA 4HEA2 5DJLA 2H0HA 1PQNA 1G7EA 4PUFC 5F05A 1TRSA 4FYBA 1W4VA 5HFIA 4POLA 4MZBA 2XHFA 4EUYA 2X64A 1QQ2A 4ZXGA 4EL1A 4GWRA 2P5RA 2IFQA 4F03A 3CTFA 5HQPA 4LMVA 1K3YA 1EP7A 1SKWB 2R4VA 3I9V2 4RI6A 1PSQA 4KE3A 5ABRA 2WRTA 5DALA 3D22A 4L5OA 1ZYEA 2IN3A 3TKSA 4ECBA 2H71A 4GSSA 3I6AA 4XS4A 5B8BA 2LRNA 2AJQB 2L6DA 1K0MA 5IIZA 3HA9A 2R6KA 5IOWA 3R2QA 4PGTA 4HU9A 3GKNA 2PWJA 1H4OA 4TXOA 3BBYA 1GTBA 4POKA 3DXBA 2LRCA 1TXXA 3ERFA 2XBQA 1B9YC 2VL2C 1F37A 1AUCA 1F3BA 1GUKA 4JR6A 4Q5NA 3HDCA 4P3YB 3I69A 2H6YA 3LJRA 2OKAA 4HUAA 1GNWA 5EY6A 1SL1B 1K0BA 2CQ9A 4QL9A 4K2DA 2AV4A 2GZPA 3GSSA 16GSA 3HZ8A 3GRXA 3JCML 1YKAA 1QXHA 2MBSA 4ECJA 4OO5A 1R5AA 1WWJA 1XOBA 4IP1A 4K6XA 2OJLA 1KEBA 3L0HA 1GUHA 1C72A 3KD0A 4V2NA 2GSRA 6GSUA 2EIOA 2A2SA 3P7XA 5CREA 5COHA 4ML6A 5D9XA 2GQKA 4KB3A 3TKPA 3UMAA 3KMOA 4TKYA 3CRUA 1TTZA 4MK3A 2I3YA 2EIRA 2E7PA 2J9HA 1SYXA 2OE3A 4IP6A 2GSTA 3TJKA 2IJYA 4TOPA 1YEPA 1JZRA 4ZB9A 3ZVJA 2H76A 4DSRA 2WFCA 2I1UA 4GF0A 2OE0A 6GSYA 4ID0A 3CMIA 4HS1A 3BJ5A 4L0UA 1UVZA 2RIIA 1AQXA 4ZBBA 1RQMA 3GTUA 2H74A 1X9SB 3DRNA 3H79A 3FR3A 4YAVA 5DAKB 3VWXA 3PGTA 2RM5A 4NMUA 4L5LA 5G1KA 5ECOB 2PMTA 2CVDA 3EE2A 4LA1A 3KP8A 4XCSA 1JLWA 2FGXA 22GSA 1K3OA 3US3A 6GSSA 5F8BA 2H73A 4KDUA 5F07A 1FG4A 2FNOA 2FA8A 3L9VA 2L4CA 2HLSA 3VI5A 5ECQB 5JWOB 3LGCA 3WGXA 2FD3A 2DJ1A 2B1LA 5JWQB 3VLNA 3GSTA 1O7UA 1T1VA 2EIQA 4TR1B 1F6MC 5CRWA 3C7MA 4K7OA 4NPBA 1GSDA 2NPBA 3KGKA 4HQSA 4J57E 4K0GA 2IPAA 5DVBA 1TK8B 4AJ7A 5ECRB 3NZNA 1E6BA 1WIKA 3MSZA 3GKXA 2ES7A 3D6IA 4OO4A 1WE0A 3C71A 3Q18A 5FT3A 4D73B 3TRXA 4YH2A 5G2ZA 3GYKA 5G30A 1A0RP 1X9WB 1UN2A 4JRRA 4MH2A 5CP1A 4MJEA 1SL0B 2AYTA 4MJAA 5D8IA 4WR5A 4GLTA 4KCEA 2TRXA 1KBNA 5H5QA 5IMDA 2H6ZA 2V32A 2CX3A 1WJKA 1XIYA 3TJFA 3ZMLA 3G7JA 1HYUA 1QUWA 1FO5A 3VWWA 1DE2A 3UVHA 5ECNB 2JSYA 1SL2B 5GAND 3IOSA 1SENA 4K9ZA 5ECPB 5AIVA 3KJYA 1XVWA 2IWTA 1OE8A 2GQLA 1U3AA 3D21A 1Q98A 3F6DA 4NWYA 3GH9A 1G6WA 2GT5A 5G31A 4OCFA 2XPEA 4ECIA 3O6TA 1YQ1A 2O87A 4PQHA 4I97A 2XPDA 2I4AA 6GSTA 5ECIB 1GLQA 2VLUA 1XWBA 4F0CA 1A2LA 2YANA 3APSA 2JSZA 2ALBA 4CHSA 1MDKA 1WOUA 1GTAA 2G0FA 1ACVA 2H8LA 1PMTA 2DSAA 4FYUA 4BPYA 3KM6A 1PL2A 1SU9A 2JZTA 4J2FA 5B8AA 4OFTA 3HHVA 2IMKA 3KZQA 1VF4A 4XS6A 4F9ZA 3QD9A 1N2AA 1M7TA 4O7HA 3A2WA 2B1KA 2ON7A 3IE3A 1JZDA 2NVLA 2L59A 3EU4A 3HVVA 2R2JA 2H1DA 1R26A 4BL7A 1GULA 2QGVA 5DBQA 3ZRDA 1SKRB 1MDIA 4ZL9A 2C0EA 1QFNA 1TI1A 2CAQA 5ECSA 3GA4A 1WMJA 5CRDA 1Z7RA 5KEJA 4PQ1A 1XFLA 4LLRA 3VK9A 3DVWA 5CAXA 4KSOA 4PURA 3HKRA 2P5QA 1JFUA 1QMVA 5LNKe 3FZ4A 1SJIA 4NXIA 4WF5A 1CQHA 2VD1A 1ZCPA 1GTUA 5CRGA 1ZMAA 3W6GA 4N0VA 1EZKA 5D9TA 3CTGA 1FVJA 1HD2A 2VO4A 4TR3A 2C3QA 3KXOA 1FHEA 5GZZB 5L71A 1T3BA 3G7YA 1V2AA 1XWGA 5ID2A 2GGTA 5AN1A 1AQVA 2K9FA 3E0UA 1NSWA 2O8VB 3F3QA 4I2TA 1K3LA 2KP1A 1WPIA 2L57A 3ZZXA 5A4WA 5J9BA 1BEDA 1FB6A 4PUAA 3TKQA 3P90A 3HZ4A 3WT2A 3FRCA 1TU7A 4OWYA 4HQZA 4K0NA 4MCUA 4EDYA 2F9SA 3SWLA 4XTSA 6GSXA 4Q5FA 3A2XA 4CW9A 3WGDA 4HZ2A 3GX8A 3F3RA 3TJBA 2K8VA 1G0TA 4I5QA 1X5EA 2DLXA 3H1NA 2B3SA 3GL5A 1ILOA 4O32A 4TW5A 4OFNA 4OD7A 2DJ3A 4O92A 3WYWA 4KNDA 3UARA 2PVOC 2BMXA 3C8EA 2WJUA 1T7PB 1LBKA 4OFMA 4KX4A 4ZILA 1SK1A 1YJ6A 1K0OA 3PR8A 1PA3A 2VAFA 1ERUA 3KTBA 5HFGA 3EURA 3APOA 1YF0A 1PN9A 4TVEA 2FWGA 1CQGA 3QAVA 4ML1A 2LJRA 3ERGA 4LL1B 5CRHA 3FR6A 3UJ1A 1ZGNA 4MPGA 3LSZA 5E59A 4WR4A 4PX1A 1U88A 3ME8A 2LKUA 2NDOA 4X1UA 4POBA 2I81A 2HNLA 1URMA 3TJJA 3VI7A 1THXA 3CSIA 1TRVA 2K8SA 2MZCA 2YZHA 3MNGA 5AISA 4MZCA 1OC3A 1M99A 4EVMA 3KP9A 2DJ0A 5DDLA 1GSQA 5IOXA 2LQQA 3VWVA 2M46A 1SD9A 3ZFLA 3CSHA 5C00A 5HR3A 5C04A 1M2DA 3TJGA 4K1FA 5F0GA 1QGVA 3ERWA 2MMNA 4EO3A 4F0BA 4JZQA 2VUPA 2YCDA 5IMFA 5DCGA 3W8SA 1SYRA 4CDOA 2VL2A 5D96A 4ZB6A 4PXOA 3Q19A 3HVXA 3WD6A 1GH2A 2DC5A 3J7Yb 4KUNA 1PL1A 5FHIA 5A4VA 2LUSA 2N5BA 5KN0A 2V6OA 1M2BA 4PQIA 3P2AA 2AHEA 1AW9A 2VCWA 4JBBA 3IV4A 3IA1A 4X0XA 1AXDA 4AJ6A 1E2YA 3E9JB 3NIVA 17GSA 4KW6A 4FIWA 4ACSA 4YQVA 3OR5A 4BVYA 1BJXA 2M80A 2H70A 1R7HA 3GH6A 4JEDA 2HZEB 1XVQA 1M2AA 3GTUB 2VM1A 3F6FA 2PPTA 3DGQA 3KIJA 3TKRA 3KH9A 3E3EA 4AGSA 4AF2A 1HNAA 1SJ6A 1LU4A 1AC1A 4PNGA 3HJPA 4GTUA 3F4RA 5ECHB 2YV9A 3UL3A 3M0FA 1MEKA 2OADA 3DYRA 1XCCA 4KDYA 2V2GA 2H6XA 4G2EA 2VCVA 1XZOA 1BAYA 2C8UA 1SD8A 4IKHA 1J08A 2RUEA 3EU3A 2FHEA 3A2VA 1V58A 2GZZA 4ZB8A 1LJRA 2IMEA 2X8HA 4IVFA 2IMIA 3V1WA 3IK9A 2OA7A 3QOUA 2VCQA 4JR4A 1TRWA 3ED3A 1EGRA 1NHYA 3GKKA 2VL9A 2HZFA 2BTOT 2VOCA 1HNCA 5DAKA 4F2IA 5D93A 5INYA 1DSBA 3GX0A 3GFKA 2B5EA 3VURA 1GWCA 2FWFA 2FCHA 5ELAA 1JZOA 1A8YA 1Z6MA 1Y6EA 3QMXA 5CYYA 2N5AA 3H8QA 4J56E 3DEXA 4IJ3A 3TDGA 3QPMA 3FY7A 1OC9A 3UBKA 4KDXA 2GDRA 4F82A 2KUCA 4IHUA 4NHWA 1ABAA 4ISDA 1EEMA 2KP2A 3U5RE 2DJ2A 1GRXA 2QC7A 3LYKA 2YWOA 4TR1A 2YJHA 1OE7A 2YV7A 1DBYA 5EVOA 1OVNA 5B7CA 2JU5A 2CA8A 1EWXA 3D4TA 2VCTA 2GSQA 2MMZA 1IYIA 5J4UA 2FY6A 1S3DA 3GUSA 1F3AA 3L4NA 2DIYA 2ZCTA 4D73A 1N8JA 4G10A 4TN8A 5E4WA 5IMZA 3EC3A 1ERTA 3FK8A 4V2LA 1TP9A 1U87A 1XWKA 1PKWA 3ZITA 3G7IA 1SK2A 1O6JA 1VRSD 4ZIJA 2J23A 2JZSA 4H86A 1EOHA 2D2ZA 2YPMA 4ILFA 4YAPA 2C3NA 4ECCA 5G5FA 3LYPA 4BWQA 1O85A 1SJZA 2JADA 1XW6A 2RLIA 1EGOA 3LORA 4MF7A 4MLYA 4XRDA 1ERVA 1FAAA 3F9UA 2NBSA 3Q74A 4MP4A 2B7JA 1TK0B 1XOAA 4PNFA 2VIMA 5J3RA 2OACA 1OKDA 2LEGA 2XC2A 3ZYWA 6GSVA 1GNEA 3ZIJA 3ZTLA 1V98A 4IW9A 1TDIA 2B6MA 2A2RA 3EVIA 4WBJA 5IPGA 4WKWA 4O5RA 5D73A 3BOAA 1F2EA 3LG6A 2WS2A 1SKSB 3KEBA 1DE1A 3LXTA 1TK5B 1BQ7A 1O73A 3VWUA 1TKDB 1ML6A 4RQXA 3ZIVA 5IQYA 1RW1A 3QR6A 3WGEA 3RPNA 1AIUA 1AQWA 3TCOA 9GSSA 4EE0A 2NTOA 5EPFA 3GL3A 3PINA 4LMWA 2CVBA 1GSFA 4RUVA 2DJJA 4KA0A 1PGTA 1NHOA 2ZNMA 1R5PA 4HZ4A 3TKSE 2PVQA 1XW9A 3FZAA 4EDZA 1OKTA 4HI7A 2TIRA 3U6VA 1V40A 2WDUA 5DQSA 1XPVA 4NAXA 4MABA 3RBTA 2V1MA 3C73A 2C3TA 2C1YA 1VF1A 4YQUA 3GURA 2R37A 2OBKA 5J41A 4RI7A 3DMLA 4OCEA 3DD3A 2VCZA 2L5LA 4DSSB 1VF3A 3IAS2 5IO0A 14GSA 2X8CA 1VGLA 3IBHA 5IPHA 4XIHA 2MMOA 4V1Ap 2CX4A 3HCZA 1BX9A 3EWLA 1O81A 5HFKA 11GSA 1WP0A 2B5XA 2PN8A 1YKCA 2FA4A 3KH7A 2YWNA 4BVXA 3K8NA 4HJMA 3DWVA 4LL4B 2YWIA 3VPQA 1GSEA 3IPZA 3G9BA 1PX6A 2WB9A 1PRXA 4KH7A 2F8AA 5KN3A 1T00A 4XS1A 1PD21 3TRQA 4EXJA 2E2GA 1ON4A 3C1RA 1XXUA 3HYPA 4MF6A 4EC0A 1HNBA 4E8HA 2IIYA 2QSIA 1GSYA 2JZRA 2H30A 2GS3A 3FR9A 5IO2A 4IQAA 2A4VA 4KSMA 1Q4JA 5GSSA 1G6YA 3L78A 4BWSA 1QK8A 3FW2A 2IFQB 4EF0A 2HFDA 3MAKA 3M9KA 3QDNA 2C0GA 3F4SA 4FH8A 3SBCA 2ON5A 3ZMKA 5DALB 5ECMB 4BA7A 2GQMA 3KTLA 4AJ8A 2C4JA 4XS4B 2L4QA 2LNSA 4IBPA 4MMMA 2IMFA 4DSQA 2DBCA 1PKZA 5G1LA 1JZWA 1VF2A 4TXOB 5A4UA 3HVSA 4V2MA 4ULXA 18GSA 3GKMA 1G7OA 1J0FA 2CZ3A 2KLXA 1S3AA 1YF1A 1X9MB 3N9JA 1A0FA 5H5RA 4GSTA 5GSTA 5F06A 3ZL5A 1KTEA 4TR0A 4G9HA 1GL8A 5D9WA 2H1GA 2AAWA 4JU5A 4N0ZA 1O8XA 3D5JA 2WCIA 2R3XA 4X43A 1HQOA 4XRAA 1M9BA 1OAZA 5EL8A 4Q5QA 2V41A 1K0AA 10GSA 4DVCA 5ECKB 1BYEA 5JCUA 1JLVA 3CSJA 3RHBA 3CXGA 3ZLPA 1ERWA 3C1SA 3GV1A 2VM2A 1Z7PA 1TU8A 1YEXA 2OBIA 3ZREA 5IMAA 1EEJA 3APQA 4N10A 3L9SA 2CVKA 2HE3A 3H93A 3VPTA 4I6XA 2AB6A 3HD5A 1UA5A 5AGYA 4IGJA 1T8EB 3DIEA 4HU7A 3QCPA 3TGZA 1XBSA 3LXZA 3TB2A 2B5YA 4MPFA 1EV4A 3UOMA 1V9WA 2MMAA 3BCKA 4WETA 3BCIA 1ZOFA 2HT9A 4HOJA 2HSHA 2YNXA 2RUFA 3EINA 1KNGA 3IDVA 2I9HA 5HR2A 2LV3A 2AUVA 4MJCA 4L0WA 1SK0A 5LD0A 1XWAA 2GT6A 3D0ZA 2DMMA 2FLSA 4MA9A 3A5WA 2HRNA 2WZ9A 5GAPD 2GVPA 1UC7A 1DUGA 2QKEA 3IR4A 3GIXA 5G5EA 2X8GA 3TOUA 4GSNA 4WBRD 3RAZA 2YOIA 1MD3A 3BD2A 1O8WA 3RDWA 1J9BA 4I2UA 2YZUA 3WT1A 3LWAA 1Z5YE 2HXKA 1Y25A 2PU9C 2H66A 4WF4A 2GZYA 4EKZA 2BJXA 5ENUA 4N11A 2E0QA 2ZUPA 1AAZA 2GTUA 2L5OA 1MD4A 1H75A 4GRFA 1TW9A 1FB0A 4NV5A 4Q5RA 1GSSA 3S9FA 5B6NA 2HZEA 1X0RA 4KGIA 2JACA 3Q6OA 5CO3A 2XBIA 3HXSA 1K0DA 1B4QA 3VFIA 3DKSA 1XWCA 4RQRA 2O85A 3IHQA 2TRCP 4GCIA 3GN3A 5FWGA 3FEUA 3L9UA 8GSSA 3P8WA 2N5FA 4I8BA 1TI3A 5CNWA 2EC4A 4FYCA 3ZFBA 2H0GA 5KN1A 2O89A 2Z9SA 5J5NA 1FVKA 4NHZA 3ME7A 1Z6NA 2PGTA 1OC9B 4ZL8A 19GSA 3EMXA 1A24A 5ECLB 1T4ZA 4IQ1A 4ZBDA 4HDEA 5DJMA 3GMFA 4N30A 4ZBAA 3PH9A 3MWHA 3QFAC 1EP8A 2LSTA 3J7Yk 4MDCA 3IK7A 1RK4A 4POMA 2YN1A 1A2JA 1USBA 3UAPA 4MJBA 1TRUA 3FHKA 3GNJA 1EOGA 2LS5A 3TRPA 2B7KA 5DQYA 2H1AA 2M72A 2G2QA 1ZYQB 5H5SA 2C0FA 4G19A 4GQCA 3IXRA 3RPPA 4TRXA 3RHCA 3TUEA 3FYGA 4K7NA 1FOVA 4OMVA 13GSA 3O76A 5IMVA 2JL4A 1R4WA 1A2MA 2LJKA 2DMLA 1K0CA 2IL3A 1U3IA 2FUG2 3FKFA 2LQOA 5JCGA 3H4KA 2HSYA 1XW5A 1GP1A 1U6TA 2CAIA 1Z3EA 3UBLA 5ELGA 5AIXA 1I9DA 1TOFA 1FW1A 1MTCA 2H01A 1X5CA 3TOTA 4NV2A 3FZ9A 2E2MA 5DCHA 4GXZA 2VD0A 2LTKA 2X99A 3HY2A 2WULA 3FZ5A 4MF5A 3M8NA 1A8LA 2LJAA 2VCXA 1K0NA 3A3TA 12GSA 3KMNA 3NOFA 4IELA 2RM6A 4K8MA 1B4PA 1ZZYA 4DEJA 4ZL7A 1B8XA 5B6MA 5HR0A 4FO5A 1Z9HA 2YWMA 3UEMA 2KHPA 2PUKC 2H75A 1JHBA 1GUMA 4HJ2A 3IC4A 1THOA 4KCAA 1NW2A 3DVXA 1OC8A 1S3CA 1M0UA 3D4MA 2FWEA 1W89A 3F8UA 5IMCA 3LFLA 1TJDA 4Z7XA 5LCZA 2F3MA 1X5DA 3CRTA 2H72A 2OE1A 4V1Ag 2WGRA 2H19A 3O3TA 1IYHA 3I43A 2HRFA 2PERA 3QFBC 3CBUA 5D9VA 2IMDA 2VLTA 3UIWA 1WRYA 3ZVJD 3F63A 3W8JA 2VLVA 1YDKA 4IJIA 2V6KA 4IS0A 1GSUA 1ZL9A 3EYTA 1F9MA 2CT6A 2GLRA 1MDJA 1OYJA 1PX7A 1V57A 3F4TA 2F8FA 2H0IA 4YQMA 20GSA 2C0DA 2HYXA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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