1NW2A

The crystal structure of the mutant r82e of thioredoxin from alicyclobacillus acidocaldarius
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
ATMTLTDANFQQAIQGDKPVLVDFWAAWCGPCRMMAPVLEEFAEAHADKVTVAKLNVDENPETTSQFGIMSIPTLILFKGGEPVKQLIGYQPKEQLEAQLADVLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title An integrated structural and computational study of the thermostability of two thioredoxin mutants from Alicyclobacillus acidocaldarius
pubmed doi rcsb
molecule tags Electron transport
source organism Alicyclobacillus acidocaldarius
molecule keywords THIOREDOXIN
total genus 30
structure length 105
sequence length 105
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 1.8.1.9: Thioredoxin-disulfide reductase.
pdb deposition date 2003-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1nw2A00
2KHPA 1Z6MA 4MLYA 1GSDA 2LQQA 2VLVA 2HT9A 6GSYA 2VCTA 3ZRDA 3C73A 3US3A 3ERWA 1AQXA 2WB9A 5J41A 1YEXA 3DVWA 1UC7A 2QSIA 4JBBA 2HRFA 2WS2A 4MPFA 3LYPA 4DSQA 3TGZA 1F37A 4EL1A 2V2GA 5CREA 1PKZA 5ECOB 2H72A 4FYBA 2H6YA 2C0GA 1B8XA 1K0OA 4IKHA 2H6ZA 2YV7A 2DMLA 3FYGA 4G19A 1I5GA 6GSXA 5ID2B 2JADA 2H71A 1V98A 3IV4A 1B4QA 3D4TA 2VCQA 3TUEA 4HUAA 1MD3A 5A5KA 1MDKA 3ZMLA 4KDUA 1SJ6A 2ZCTA 4O7HA 3KGKA 1EP8A 3TRQA 2YP6A 1M9AA 3CMIA 1QGVA 3WYWA 2GZZA 1ZZYA 1PD21 2L5OA 2EIOA 1XWGA 2V6KA 2NDOA 3HJMA 2FWFA 1TRSA 3F6DA 1X9WB 4X43A 2IMKA 4KB3A 1K3YA 4K0NA 1DE1A 5IMZA 4DSSA 4WKWA 3DMLA 6GSWA 4PXOA 2LQOA 2CX4A 2GQKA 4J2FA 3MWHA 1SK2A 3HJPA 2AYTA 2MBSA 3P8WA 4G10A 4XRDA 2OADA 3KTLA 1UA5A 1WJKA 2FHEA 2F3MA 5G30A 3HHVA 3QFBC 2F8AA 1TRUA 2V32A 5DCGA 5GSTA 3FKFA 5ECRB 4MF7A 5ENUA 1YKCA 1MEKA 2K6VA 1IYIA 5D93A 4FYCA 4ECIA 3HVVA 4I5QA 4IVFA 5HR0A 3CRTA 4ZBDA 3GYKA 14GSA 3EVIA 4OFMA 4WBJA 4F03A 2VIMA 3O3TA 5JWOB 3HZ8A 4KCAA 4G9HA 2HE3A 1J9BA 1XVWA 2HLSA 3GKNA 1RQMA 3M0FA 2CZ2A 3ZIJA 2GT6A 1OKTA 2E0QA 2VCWA 3E3EA 1XCCA 2JZRA 1GUMA 1OC3A 4GWRA 3FR6A 4YQUA 5A4UA 2E2MA 5IMFA 2IN3A 1ZGNA 4TR0A 4WF4A 3QCPA 2DJ3A 2EIQA 3ME7A 4F0BA 2HXKA 2LJAA 2YWOA 1RW1A 4NMUA 4N10A 1SK0A 1GTUA 3VURA 3IOSA 3ZTLA 1F3BA 2LJKA 1B9YC 3TOTA 2HYXA 2B1LA 1TU7A 4N0VA 1AIUA 5GZZB 4PNFA 3O6TA 4LL1B 2A2SA 4TN8A 3BD2A 16GSA 2M80A 1WOUA 3RHCA 4ECJA 1TOFA 4OCFA 2F51A 2MBTA 1G7OA 1WP0A 4N30A 1AXDA 1TI1A 3A2XA 4K7NA 5DALA 2MZCA 4IJ3A 1N2AA 1WIKA 5G2ZA 3Q6OA 2WGRA 4IJIA 2GZYA 4KW6A 3KM6A 1R7HA 3M9JA 2JU5A 2REMA 1QK8A 2J23A 4XHMA 4KGIA 1E2YA 4TRXA 1GSEA 3BCKA 4MJEA 2N5AA 5F8BA 5HQPA 4GRFA 1A8LA 1GNWA 3LQ7A 3D6IA 3KZQA 4QQ7A 4I97A 1PQNA 3WGXA 3J7Yk 1C72A 1WWJA 2N5FA 4DSRA 1VF4A 3CYNA 1GULA 3HYPA 1V58A 3LG6A 4WR4A 3D21A 2HNLA 2GSQA 1OVNA 3IE3A 2O8VB 5DJMA 3N9JA 3DEXA 3ZMKA 5D9WA 2WULA 2JZTA 1QFNA 2DSAA 1T3BA 5DJLA 4V1Ap 5JCWA 1XWCA 4F9ZA 3UIWA 2C0DA 2CAQA 2GDRA 3E9JB 3TJKA 1YQ1A 4HDEA 4RQRA 3Q18A 4LMWA 1FG4A 5KN2A 5D96A 1TU8A 1X5DA 4TVEA 3RAZA 3NIVA 1J08A 5ECPB 4EDYA 2KP1A 2IFQA 2K8VA 1GTAA 2MMZA 4LA1A 1GTBA 2OBKA 4BVXA 2RM5A 2IPAA 1A2JA 2GT5A 3A2VA 4Z7XA 5ABRA 2YZUA 1EGOA 3F8UA 2FNOA 4F2IA 3GKMA 4TR3A 3TKSE 2IMEA 3GTUA 4K0GA 3KH9A 1R4WA 1XVQA 2EIRA 4AF2A 1A2LA 3PR8A 1ACVA 3DGQA 5IPGA 5IQYA 2LS5A 2YJHA 5HFGA 1BJXA 1PL1A 2R4VA 1JZWA 4ZB6A 3GA4A 2OBIA 6GSSA 3LORA 2B7JA 4Q5FA 3F4SA 2H74A 1SKWB 4TXOA 3LEFA 1AQWA 5INYA 2X8GA 3K8NA 3I69A 4J56E 4JR4A 3Q74A 4MPGA 1PGTA 1THXA 3KD0A 1K0DA 3LFLA 3GRXA 1GLPA 5D8IA 3ZITA 1SKRB 1F9MA 3ISOA 3KCMA 4ILFA 2H0HA 4OD7A 1S3AA 3I9V2 4ECBA 4KNDA 3RDWA 1G0TA 1V2AA 4ULXA 1K0CA 3F4TA 2O85A 20GSA 2V41A 1GH2A 3MNGA 1EEMA 4K6XA 3UARA 3M3MA 4O92A 3KIJA 3RBTA 1XW6A 1MD4A 2PMTA 2P5RA 4WR5A 2I9HA 3V1WA 2E7PA 1SKSB 2GSTA 3IC4A 3CSJA 5H5SA 2X8CA 3GSSA 3EINA 1NHOA 5A4VA 4MF6A 3ZL5A 3F0IA 3CSHA 3HZ4A 4IHUA 4P3YB 1CQGA 2O87A 2WRTA 4MJAA 2K18A 3IA1A 4FYUA 4WXTA 2KOKA 3PINA 4GSTA 1DBYA 4DEJA 2H1GA 4O32A 3TJJA 1FVKA 2O7KA 3NOFA 4IP6A 5FT3A 3VPTA 4ZL9A 4NAXA 18GSA 2LSTA 4PQ1A 2LTKA 2GVPA 1TRWA 1SD8A 2I81A 5D9VA 2CZ3A 3VWVA 1PA3A 2C4JA 4E8HA 4DSSB 4QL9A 2H1BA 1G7EA 1A0FA 2GSRA 2XBIA 3PGTA 1GUKA 4GQCA 2VL2C 1VF1A 3R2QA 3CSIA 2J9HA 4YAPA 3KH7A 2PPTA 3GN3A 1IYHA 4FO5A 1XFLA 3VLNA 3HA9A 2PU9C 2LKUA 1THOA 3L78A 2BJXA 1G6WA 3FY7A 2LV3A 2FA4A 2DJ0A 5F0GA 2PUKC 2CVBA 2L57A 19GSA 4Q5RA 2A4VA 3D0ZA 3H93A 1HNAA 5ELGA 1FW1A 4PUFC 1EV9A 2DMMA 4BWSA 2C0FA 4GXZA 2VO4A 1EOHA 1KEBA 2BTOT 5J5NA 3TRPA 1FHEA 3TKQA 3GL5A 1RK4A 2YV9A 4MMMA 2XC2A 4G2EA 3HD5A 5DAKB 1ZOFA 4K7OA 2L6CA 1H75A 4V2LA 1XPVA 1GRXA 1QQ2A 3F3QA 1DE2A 4ML6A 2KUCA 4RUVA 4PGTA 5ECHB 2VL9A 3H1NA 2P0GA 11GSA 1YZXA 4JEDA 4I2UA 3QR6A 2GQMA 2VOCA 17GSA 3FHKA 5EVOA 3KXOA 1AAZA 3SWLA 2H30A 2JSYA 4TR1A 13GSA 2OE3A 4OWYA 1XWBA 4HEA2 4JRRA 3FW2A 5KN3A 1JLWA 2PVOC 3EMPA 5IOXA 4E8EA 4FH8A 1ML6A 1TRVA 4OFNA 5DALB 2QKEA 4L5OA 2NPBA 3GX8A 2VM1A 2YN1A 2B5XA 2XPDA 1U6TA 2P31A 4YH2A 4ZXGA 5G31A 2H1AA 1SD9A 2L6DA 4GTUA 1AUCA 3C1RA 4V2NA 3S9FA 1K0BA 1TTZA 2DJKA 4IW9A 2WJUA 2AJQB 2VCVA 4KH7A 1YY7A 4FIWA 2WCIA 1WRYA 3QAWA 3QPMA 1GWCA 4BA7A 1GTIA 1EGRA 2DJ1A 3TJFA 2CX3A 1OAZA 4KX4A 5F06A 2B3SA 2NBSA 3FZAA 4MP4A 1Z3EA 4LL4B 3FR9A 1ERWA 5ECIB 5LNKe 2VLUA 3RPNA 1XIYA 4MZWA 2R37A 4HJ2A 4AJ6A 5B6MA 1KNGA 5D9TA 2AUVA 2PWJA 3LJRA 4NHZA 1UN2A 5CNWA 3IDVA 4GF0A 4ISDA 3NZNA 3QD9A 3DVXA 2PGTA 3EYTA 9GSSA 2HSYA 4LLRA 3J7Yb 4XIHA 6GSUA 1M0UA 3FRCA 5J9BA 4TW5A 3P90A 3WGDA 3UAPA 4YAVA 1FB6A 4EXJA 2IFQB 4YQVA 3HVXA 4NV2A 2G0FA 5ECKB 1M2AA 3DYRA 1LU4A 3APSA 1B9XC 7GSSA 4K8MA 1S3CA 4ZILA 4MCUA 3RHBA 5IMCA 5IIZA 1FVJA 5E59A 2X99A 2XHFA 3C7MA 3CBUA 4AGSA 4MZCA 5B8BA 5IOWA 4WBRD 3WT1A 3VWUA 3I43A 5CRDA 1M9BA 2R5GA 2F9SA 3VWXA 2YNXA 1U3AA 4EC0A 2G2QA 4OCEA 2M72A 2MMAA 4L8EA 2VL3A 2NVLA 1GP1A 1GNEA 2B5EA 4HJMA 1R5AA 2LNSA 4XS1A 1AC1A 2AAWA 1BX9A 2H6XA 1ERTA 1MDJA 2OE0A 4TXVA 4Q5NA 1OE8A 1YDKA 2YWNA 4EDZA 2OE1A 4TOPA 5ELAA 2C1YA 1LBKA 1GSFA 1K0AA 3Q19A 3F3RA 4I2TA 3LGCA 4JZQA 4MJBA 4GLTA 1O6JA 2DIZA 2C0EA 1AQVA 2AHEA 2LJRA 5ECSA 1WMJA 1XWKA 4CDOA 3IR4A 5AISA 3TKSA 2I3YA 3GH6A 1CQHA 2FGXA 4ID0A 3H79A 5J9CA 1OC8A 2FLSA 1GSSA 2RM6A 3VI7A 2E2GA 2IL3A 2I4AA 1XXUA 3VPQA 3TRXA 5CRWA 1PMTA 4RI7A 4OFTA 4X1UA 3HKRA 2DC5A 5JWRB 1TK5B 1Q98A 4XTSA 5C04A 2VAFA 1ILOA 2CA8A 3HY2A 1O8WA 3TJBA 2L59A 1ERVA 1M2DA 1XBSA 3APQA 5JWQB 1MTCA 2M46A 1EOGA 2RLIA 3HVSA 2CAIA 2DLXA 5AN1A 3ZREA 1YF0A 2LRCA 1Z7PA 4EVMA 1KBNA 4ZBAA 2MYGA 3C71A 2LUSA 4KE3A 4V1Ag 3H8QA 5HR3A 2YWMA 2AV4A 5AIXA 2VD0A 5IMDA 5IO0A 3ED3A 1PX7A 5ECQB 2B5YA 4ZL8A 2YCDA 1XWAA 5HFKA 1T00A 1W89A 1M99A 2TRCP 2H0IA 1TI3A 4ML1A 2CV4A 3ZVJD 3L9UA 2MMNA 3N5OA 2YJ7A 3CTFA 5B8AA 1NSWA 10GSA 2OKAA 3ERFA 2OJLA 4BL7A 5GSSA 3L9SA 1XOBA 4EF0A 3BCIA 3GMFA 1YF1A 2D2ZA 3IRAA 4N11A 1O7UA 1HQOA 2K9FA 5CAXA 2HFDA 3IK7A 3IPZA 5IM9A 1K0MA 4HQSA 1ZYQB 3EWLA 3KJYA 3LXZA 1VGLA 2YWIA 3MDKA 1MDIA 5LD0A 1TDIA 3UBKA 4MABA 1Z5YE 2C8UA 1SL1B 1SENA 4MH2A 4POBA 1R5PA 2VD1A 5DQSA 1ZL9A 1Y6EA 2XBQA 2CVDA 3G7JA 1SYXA 1T8EB 3M9KA 1S3DA 3L9VA 3BBYA 2CT6A 3IK9A 3D4MA 2GGTA 1I9DA 3UBLA 1PKWA 4J57E 4TKYA 1ST9A 4TR1B 1XZOA 2GSSA 3VWWA 2ALBA 3AY8A 1GLQA 2H76A 4IS0A 2YPMA 1HNCA 3GV1A 4MK3A 2GTUA 4MJCA 2ON7A 4BPYA 3I6AA 1O85A 4EKZA 6GSTA 3EMXA 1EP7A 2FA8A 2FY6A 1VF2A 2PBJA 3H4KA 1FB0A 2I1UA 1KTEA 4OMVA 1GSUA 2DJJA 2HZEA 4POLA 4ZB9A 2RUEA 2LRTA 1ON4A 3IAS2 4X0XA 5IO2A 2FD3A 4H86A 1YKAA 3M1GA 5FHIA 3IAM2 2F8FA 4OO5A 2B6MA 3TDGA 1ERUA 3TCOA 4AJ7A 1A8YA 1V57A 1M7TA 3EU4A 5EPFA 2DBCA 4PURA 4D73A 3WD6A 1A23A 1TP9A 4XS6A 3FZ9A 1HYUA 3GSTA 1SU9A 1EWXA 3CRUA 3UL3A 3KMOA 3ZYWA 4I8BA 4F82A 2GQLA 1OC9A 4XCSA 3LYKA 2WZ9A 1K3LA 2X64A 1WE0A 3GIXA 4BWQA 2XPEA 4K7IA 4IELA 3DKSA 3L4NA 6GSVA 2O89A 4IP1A 2L4QA 4KSMA 1DSBA 5D9XA 4XS4A 3A3TA 3SBCA 4RI6A 1Z9HA 3QFAC 1NHYA 1UVZA 2B1KA 5F07A 4NWYA 4HQZA 4KDYA 3QMXA 3APOA 1X9SB 3MSZA 3HCZA 1V9WA 1K3OA 4NV5A 2FWGA 2L5LA 4CW9A 1GUHA 4IGJA 2H0GA 1Z6NA 2H01A 2C3QA 2H19A 3DXBA 1SYRA 4KAEA 5HR1A 3PH9A 1SJIA 3EE2A 1XW5A 1TW9A 2HI7A 3O76A 1QMVA 2FCHA 4MDCA 5DVBA 2VLTA 1URMA 5LCZA 5A4WA 5C00A 1JZOA 2Z9SA 5ECNB 2JSZA 1JHBA 2IMIA 1HD2A 5ID2A 3GKXA 4O5RA 5ECMB 5GAND 2PERA 1B4PA 1X9MB 5H5QA 2BMXA 1JLVA 2AB6A 4WETA 2JACA 4QL7A 3UOMA 3ZZXA 3W8SA 5B7CA 3HJOA 1SJZA 5DAKA 5HR2A 2HRNA 2C3TA 5KN0A 1ZMAA 1SK1A 1U88A 2VUPA 4HZ4A 4MZBA 5G5FA 1GSYA 5CRHA 3EU3A 3GNJA 5HFIA 3FZ5A 1O73A 3D5JA 1N8JA 3L0HA 2LRNA 3BJ5A 5KN1A 12GSA 4HI7A 1GSQA 3M8NA 1BEDA 1JZDA 2N5BA 1BAYA 1SL0B 1HNBA 2LEGA 2V1MA 3QDNA 1K0NA 1G6YA 5H5RA 1Z7RA 4WEYA 2H73A 4Q5QA 3C1SA 3WT2A 5EL8A 3F6FA 4IQAA 1O81A 2CVKA 1TK8B 4PQHA 2ES7A 5AGYA 1BQ7A 1F3AA 3KP8A 4MF5A 4K1FA 1X5CA 3F63A 3G9BA 5DBQA 3ZVJA 2P5QA 5G1LA 2GS3A 5G1KA 5JCUA 4K9ZA 3TJGA 3ME8A 2YOIA 3KP9A 3D22A 3DRNA 3CXGA 1PL2A 3OR5A 2C3NA 2H66A 3GTUB 4KSOA 4L0UA 1T1VA 5CP1A 1FAAA 2L4CA 4PX1A 2PN8A 3G7IA 3LWAA 2DIYA 2ON5A 3ZLPA 1TKDB 1X0RA 2IMFA 1VRSD 5G5EA 3E0UA 4ZB8A 3A5WA 3C8EA 1T7PB 1LJRA 5GAPD 2FWEA 1JFUA 1PSQA 1T4ZA 2RUFA 3MAKA 1BG5A 3EC3A 1W4VA 1ZCPA 4MH3A 4TXOB 4MA9A 2KLXA 2V6OA 3UJ1A 1PX6A 4XRAA 1U3IA 1USBA 4BVYA 2PVQA 5COHA 5DDLA 2HZFA 3HXSA 2WFCA 3VI5A 3CTGA 3VFIA 1F2EA 3LSZA 1X5EA 3GX0A 1YJ6A 3FK8A 2X8HA 4N0ZA 3RPPA 3JCML 4IQ1A 2EC4A 4IBPA 4KCEA 1A2MA 3WGEA 3FEUA 4PNGA 5DQYA 4DVCA 4KA0A 1BYEA 3UEMA 2VCZA 1FOVA 3QAGA 4ZL7A 4OO4A 1J0FA 2H70A 1TJDA 3A2WA 2KP2A 4RQXA 1OE7A 4L5LA 3GKKA 3DIEA 5CO3A 5F05A 2FUG2 3GH9A 2IWTA 4JE1A 5J3RA 2A2RA 2R3XA 4JU5A 5ECLB 3F9UA 2B7KA 3P7XA 1A24A 5IMAA 5L71A 3KEBA 4IN0A 1SL2B 22GSA 1TXXA 4NPBA 2FWHA 3GURA 3IXRA 2GZPA 2C80A 3W8JA 1B48A 1E6BA 1R26A 4GSNA 3UVHA 3IBHA 4POMA 1AW9A 4AJ8A 1OYJA 3P2AA 3DD3A 5B6NA 2IMDA 2OACA 4EO3A 3TKRA 1PN9A 3TKPA 5EY6A 1DUGA 2TRXA 2H75A 1XW9A 5J4UA 4L0WA 1Y25A 4HU7A 3GFKA 2TIRA 4NXIA 4ACSA 3DWVA 1ABAA 1O8XA 1QUWA 1YEPA 1EEJA 3BOAA 2DJ2A 8GSSA 3VK9A 3QAVA 3UMAA 2IJYA 5KEJA 2ZUPA 3GHAA 4PQIA 3G7YA 4WF5A 4ZIJA 2YANA 2RIIA 2JL4A 3QOUA 1XOAA 4JR6A 5E4WA 3FR3A 4NHWA 4HU9A 2NTOA 3U5RE 3F4RA 4KDXA 3UVTA 2WDUA 4ZBBA 1Q4JA 3FZ4A 5IMVA 2YZHA 1QXHA 4KUNA 2QGVA 1T4YA 4HS1A 3TKSC 2LNTA 3ZFBA 3KMNA 1TK0B 2VL2A 2HZEB 2R2JA 5DCHA 4CHSA 5CRGA 3ZFLA 1F6MC 4GQFA 4V2MA 2ZNMA 4EUYA 1JZRA 3W6GA 1VF3A 1ZYEA 1OKDA 2HSHA 2JZSA 2K8SA 1FO5A 2IIYA 1NM3A 1A0RP 3ERGA 3TB2A 1U87A 4HZ2A 4D73B 1NW2A 3IHQA 4K2DA 1EV4A 2CQ9A 3KTBA 3ZIVA 4GSSA 5D73A 5IPHA 4F0CA 3GL3A 2H8LA 2GLRA 2VCXA 2R6KA 4I6XA 4PUAA 1PRXA 2H1DA 1H4OA 3TOUA 1WPIA 3U6VA 4HOJA 2OA7A 1OC9B 4YQMA 4TR4A 4POKA 2VM2A 1M2BA 3EURA 3GUSA 5CYYA 1GL8A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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