1O73A

Tryparedoxin from trypanosoma brucei
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
144
structure length
144
Chain Sequence
MSGLAKYLPGATNLLSKSGEVSLGSLVGKTVFLYFSASWCPPCRGFTPVLAEFYEKHHVAKNFEVVLISWDENESDFHDYYGKMPWLALPFDQRSTVSELGKTFGVESIPTLITINADTGAIIGTQARTRVIEDPDGANFPWPN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Tryparedoxins from Crithidia Fasciculata and Trypanosoma Brucei: Photoreduction of the Redox Disulfide Using Synchrotron Radiation and Evidence for a Conformational Switch Implicated in Function
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPAREDOXIN
molecule tags Electron transport
source organism Trypanosoma brucei brucei
total genus 45
structure length 144
sequence length 144
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13905 Thioredoxin_8 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1o73A00
4HJ2A 2O87A 6GSTA 1SL0B 4ZBAA 2DJ3A 3EMXA 4HZ2A 3VWWA 2GS3A 1QMVA 1YDKA 1GSUA 2NPBA 3GKXA 3QDNA 4V2NA 2O89A 3LFLA 1R7HA 3WGXA 2B7KA 3A2VA 1TRWA 4F82A 4G10A 1U88A 3R2QA 2F9SA 1RW1A 2H0IA 3TJBA 4N10A 2VLUA 1PD21 1MD3A 1UVZA 5A4WA 3TJKA 1UC7A 3LG6A 4Q5RA 5HR2A 2M46A 4PQHA 2C3QA 3EE2A 2LQQA 3CRUA 1OC8A 1VF4A 1ML6A 1BG5A 4XS1A 4XIHA 1GL8A 5H5QA 2OA7A 1M2DA 2H1AA 1Z5YE 2TRCP 2H66A 2H1BA 5D9WA 1V9WA 3HYPA 1HQOA 1R4WA 3BOAA 3GTUB 4MMMA 2FWEA 2GLRA 3L9UA 3IR4A 1YEXA 2FGXA 5DALA 5L71A 3FR3A 1SD8A 5HFIA 3DVXA 4GCIA 4V1Ag 4IP6A 2GQLA 3W8SA 1GTAA 2B7JA 1G0TA 3KTBA 5IMCA 4JZQA 1XFLA 3HZ8A 3LGCA 4P3YB 4F0CA 5CAXA 4N11A 3MWHA 5KN1A 4G2EA 1LU4A 4NHZA 1KBNA 4XS4A 2DJ2A 2REMA 2V32A 1UN2A 1GUHA 4JRRA 3EWLA 3QOUA 1B9YC 1VF1A 1U3AA 5EVOA 2C1YA 2VAFA 2QKEA 1RQMA 3Q74A 2C80A 3EC3A 3GURA 4JU5A 3KP9A 3TKSC 4HS1A 2X99A 3UJ1A 1KEBA 14GSA 5GAPD 1ZYQB 1T1VA 4EKZA 2H1DA 3J7Yk 3CSIA 2FWHA 3F3RA 2VL2A 4ML1A 17GSA 9GSSA 4PQIA 3GFKA 2ZUPA 4G19A 1GSYA 1TK8B 3ZIVA 1FVKA 4HI7A 3F63A 1DBYA 2FY6A 3E3EA 3GX8A 3BCKA 4F2IA 1ERTA 2HXKA 2VCVA 1TRUA 5AN1A 5J5NA 2LTKA 2H0GA 3ZLPA 4TR1A 3LJRA 2GTUA 1SK0A 3A5WA 1NSWA 4K7IA 1EP7A 1NHOA 2IFQA 4IVFA 2H1GA 2YANA 1GSEA 1ERWA 4K8MA 4MJAA 1T4YA 2OJLA 1O8WA 2GSQA 2YZUA 1M2AA 3ZTLA 1A23A 4DEJA 4FH8A 3QAVA 1RK4A 5A4VA 2VD1A 3BJ5A 1BX9A 1EWXA 3TJGA 3F6DA 3PH9A 1VF3A 3EU3A 3IC4A 3QFBC 1PKWA 3LYKA 5IIZA 3FR6A 1TU8A 4MJEA 4I2UA 3RHCA 2CT6A 4KSMA 2LEGA 3IDVA 3VPTA 3F8UA 5D8IA 2IMKA 4I5QA 4V2LA 3IOSA 3TOTA 1TDIA 3LYPA 4EO3A 2K8SA 3O3TA 4KA0A 1GUMA 5B8BA 2EIRA 3H93A 3FK8A 2A2SA 3ISOA 4NMUA 5E4WA 2K9FA 5JCWA 2ALBA 2CVDA 1V98A 4G9HA 3VWUA 2ON5A 3TKQA 5KN0A 1OAZA 2VCZA 4MCUA 4PQ1A 3I69A 2FWGA 2DJKA 2LNSA 1TJDA 3WT2A 1M9BA 4ZBDA 1I9DA 4POKA 2MMOA 3C7MA 5G1LA 2LV3A 4K7OA 5D9XA 1N8JA 2GZPA 3APOA 1E6BA 4QQ7A 2ZNMA 1B4QA 1FOVA 2GDRA 2LJRA 3QFAC 5DQYA 3QCPA 1EEMA 2P31A 2IPAA 1WIKA 5A4UA 4LL4B 4KNDA 1ZOFA 1AQXA 4I8BA 3BD2A 5J3RA 2HRFA 3C8EA 3JCML 4PNGA 5F0GA 4I2TA 2YP6A 3LXZA 1PX7A 2L5OA 1HNBA 2L57A 2VM1A 2QGVA 1A24A 2C3NA 5ABRA 5ID2A 2XBQA 5DCHA 2H76A 1OYJA 4O5RA 5B8AA 4DSQA 3ERGA 3F6FA 3QR6A 4BL7A 1PQNA 3UVHA 2KUCA 3O76A 3IK7A 4NPBA 3IPZA 5IPGA 4GSNA 2HSHA 3PGTA 4RI7A 1M2BA 4X43A 4IN0A 1OKTA 2VCTA 2RM6A 5F05A 1SKRB 1GTBA 2HZEA 3J7Yb 3E9JB 1HYUA 1A2LA 4K2DA 1EGOA 3DD3A 1MTCA 1EGRA 1YJ6A 20GSA 3TRXA 1OC9A 5D96A 5FHIA 2FUG2 3A2WA 2P0GA 2MBSA 5F07A 1YQ1A 2HNLA 4ZB9A 2IJYA 2OACA 1K0OA 5IOWA 2B1LA 2GSRA 1AXDA 3Q6OA 1SK1A 4IQAA 2H8LA 5IQYA 4AJ7A 3UOMA 1GULA 1XW9A 1EOHA 4GWRA 3KMNA 5DBQA 1MEKA 2F51A 4L5LA 1FG4A 1S3AA 2V1MA 2DIZA 3TUEA 5AIVA 3TJFA 2DC5A 1LBKA 1EV9A 2MBTA 1S3CA 1AQWA 1V2AA 4K1FA 3GRXA 4IKHA 4X0XA 3LWAA 5HFGA 2LUSA 2M80A 4XCSA 4F0BA 11GSA 4Q5FA 2LQOA 1LJRA 4FIWA 1BEDA 4MH3A 3G7JA 3UBKA 2YJHA 4V1Ap 4ZIJA 3KD0A 5B6MA 5J9BA 1GLPA 3ME7A 2JZRA 4POBA 16GSA 4KDUA 2IWTA 3Q19A 4WEYA 3EVIA 4HJMA 1G7OA 1R5PA 5J4UA 4XRAA 5CYYA 4E8HA 2WZ9A 1K0BA 4OFMA 4YAVA 2HE3A 1SL1B 3GH9A 1G7EA 3TKSA 3W6GA 1AAZA 1GNWA 2FHEA 4OCEA 1J9BA 3APSA 1F6MC 1TP9A 1XBSA 3ZRDA 3KEBA 4TXVA 1O81A 2C4JA 1SU9A 2GVPA 3GL5A 2FA8A 4POLA 3ZVJD 2GQMA 1ON4A 3EINA 4N0VA 3FHKA 4L8EA 4EVMA 2H6ZA 2DJ0A 1XPVA 3QD9A 3SBCA 4PX1A 1QUWA 3D6IA 2EIQA 1TRVA 3QAWA 1EZKA 1PGTA 3CTFA 3KMOA 4MJCA 1S3DA 4AJ8A 5J41A 3APQA 4ZILA 3KJYA 4E8EA 3US3A 3M3MA 3VLNA 2FD3A 1VGLA 4L0WA 1PMTA 2DSAA 2DMMA 4LMVA 4LLRA 3UARA 1YF0A 2WGRA 1WWJA 1JLVA 2YPMA 3FR9A 3DIEA 2VOCA 1WMJA 3ZZXA 5ECPB 4BPYA 1ZMAA 3PINA 2TIRA 4I6XA 4OFNA 4D73A 5IO2A 3HDCA 2AYTA 1PRXA 4HQSA 4GRFA 5CNWA 4KDXA 4FO5A 5EPFA 3CYNA 1PKZA 3ERFA 3HZ4A 1GH2A 2E2MA 3M9JA 4JBBA 2HLSA 2WDUA 3A3TA 2L4CA 2N5AA 6GSXA 1U6TA 5LNKe 1WOUA 4NAXA 4I97A 4N30A 5EL8A 1F37A 3WT1A 3TKPA 3GYKA 3VI5A 4N0ZA 3GKKA 3QMXA 1AQVA 3NOFA 4JEDA 2OKAA 1MDKA 2B5XA 4BVXA 4DSSA 2C0GA 3DYRA 19GSA 5CRHA 1X5CA 1TI1A 1GSSA 4KAEA 1YY7A 2D2ZA 4TXOA 5ECSA 2JU5A 1GRXA 1V58A 3TOUA 1FB0A 5IO0A 4XS4B 4WR4A 1B8XA 3KH7A 1TK5B 4MF5A 2J23A 2OBKA 2H74A 2HYXA 1I5GA 1U3IA 3H4KA 1THXA 2O85A 1FHEA 1Q4JA 3L9VA 5ECQB 2RUFA 1M0UA 3ME8A 4JR4A 3ZREA 2TRXA 1Z7RA 2H75A 2EIOA 4GTUA 4OD7A 2GQKA 1CQGA 4X1UA 2CVBA 2I4AA 2J9HA 1A2JA 1TTZA 4DSRA 2AAWA 4WBJA 3WD6A 4O32A 1SKWB 1XZOA 2OE3A 4XS6A 2XBIA 2B5EA 2I9HA 1E2YA 3CSHA 5JCGA 2R5GA 2GZZA 4ECCA 1JLWA 1MD4A 2VM2A 1Q98A 1EEJA 6GSYA 3FYGA 5IMAA 2JZTA 3DVWA 1J08A 5GSTA 2VL3A 1M99A 4PUFC 2OE1A 3G7YA 2BJXA 1K0MA 2IFQB 3O6TA 4KCAA 3S9FA 2DMLA 3K8NA 1A0RP 2AB6A 2LNTA 3IE3A 1PA3A 1F9MA 3QAGA 1HNCA 4NV2A 1OKDA 2FWFA 2KHPA 2IIYA 2L6DA 1NW2A 4F03A 2XPEA 3BBYA 3Q18A 1F3AA 2GSTA 8GSSA 2HZFA 1XWAA 1XW6A 4MF6A 2JADA 4HU9A 3ED3A 1J0FA 1X9WB 2R2JA 2PERA 5E59A 4WKWA 2BTOT 4NV5A 3HJMA 4F9ZA 2QC7A 4ECIA 4OO4A 4ZL7A 5D9VA 4CDOA 4MH2A 2LJAA 1X9SB 3C71A 2CX4A 2AV4A 1JZDA 2VO4A 4KX4A 1JZRA 2FNOA 1ACVA 2YV7A 3D0ZA 3ZYWA 4GXZA 2YZHA 2LRTA 3LORA 2VD0A 3GHAA 2GSSA 3CBUA 5DQSA 5INYA 4OMVA 2IL3A 4OO5A 2DBCA 3F4TA 3HJOA 2F8AA 2YV9A 6GSUA 2L5LA 2G0FA 5GAND 5DVBA 2K6VA 2IMEA 4K7NA 4KH7A 4MZWA 4V2MA 2X8CA 1XWCA 4GQFA 1TXXA 5F06A 3TCOA 4BVYA 4PNFA 1ILOA 3CTGA 2LSTA 3TRPA 3F0IA 4AF2A 2Z9SA 1K0CA 5DAKB 1TOFA 4NHWA 3TGZA 3M9KA 1Y6EA 3HVXA 3FKFA 2CA8A 3IV4A 4EUYA 5ECOB 4MF7A 3ZMLA 5FT3A 1HNAA 1SD9A 3DEXA 4NXIA 4AJ6A 1PN9A 2NTOA 1MDIA 3L4NA 4MZBA 1W89A 2FA4A 2LRCA 2KLXA 4IP1A 1GTIA 1GUKA 3KIJA 5IMFA 2AJQB 4ACSA 5HR3A 5DJLA 1AUCA 5FWGA 3C73A 4O92A 3IAM2 4KB3A 3HJPA 4H86A 6GSVA 2RIIA 3EU4A 4J2FA 7GSSA 3UVTA 4KE3A 3ZFBA 2MMAA 2FLSA 4PURA 4ZBBA 3OR5A 2PUKC 3L0HA 1G6YA 1OC9B 2KP1A 4HQZA 2RM5A 1OE8A 4ISDA 1DSBA 3UIWA 3DWVA 5GZZB 4NWYA 3L78A 4WR5A 1W4VA 2QSIA 3MDKA 5CREA 2E0QA 2K8VA 3D5JA 5CRDA 2PPTA 12GSA 3CSJA 1WJKA 3PR8A 3P8WA 1T4ZA 1XWGA 1O6JA 3GMFA 4YQUA 3M8NA 1G6WA 3U6VA 2CVKA 2GZYA 5DJMA 1K3OA 1SKSB 3VWXA 3ZIJA 1XW5A 3FW2A 1Z9HA 2H01A 3HCZA 5IM9A 3E0UA 3H8QA 5G30A 4GSSA 3KP8A 5C04A 3FZAA 2G2QA 1F3BA 1T00A 3FZ5A 1DE1A 1EV4A 1GTUA 1ST9A 1ERUA 1JZOA 4MJBA 4EL1A 2H73A 3RBTA 3NIVA 1YKCA 4IBPA 2YJ7A 3RHBA 2H19A 2P5RA 5G5FA 1GP1A 4KDYA 4KUNA 5KEJA 3RAZA 2V2GA 3GNJA 4CW9A 1T8EB 3F3QA 1N2AA 3VFIA 4CHSA 3HVVA 2B1KA 1V57A 3N5OA 2A2RA 2CAQA 4MABA 2HI7A 1FW1A 4ECJA 2HT9A 4MZCA 3TB2A 5HFKA 2C0DA 3KTLA 4HU7A 4JE1A 1WE0A 3CXGA 4TOPA 5CRGA 4ULXA 3DGQA 4YH2A 2DJJA 3M1GA 10GSA 2CAIA 4ZB8A 3WGDA 2YCDA 1GSDA 4WF5A 1AIUA 3DKSA 3GL3A 1GSQA 2AUVA 2M72A 3UMAA 1GNEA 4RI6A 1OE7A 2OBIA 5KN2A 2ES7A 1QQ2A 1TKDB 1OC3A 1R26A 2MYGA 2B3SA 2N5FA 3W8JA 3ZVJA 3CRTA 4GSTA 3KGKA 4HDEA 1FVJA 2VL9A 1USBA 2IN3A 4IQ1A 2A4VA 1ZYEA 1SYXA 3F9UA 3UEMA 1H75A 1A8YA 1NHYA 1MDJA 4BA7A 2VLVA 4HOJA 5ELAA 4PGTA 3VURA 1THOA 2MMNA 4KCEA 5CRWA 1ABAA 1UA5A 1XVQA 4MK3A 2LS5A 2B6MA 2H71A 1QK8A 1AC1A 5CO3A 3WGEA 2PGTA 2JACA 4D73B 1BYEA 2XHFA 2N5BA 4RQRA 2PN8A 2H70A 3HD5A 3KXOA 4YAPA 3DXBA 1SJIA 2H72A 5H5RA 2YWNA 4TVEA 4EE0A 1SYRA 4RQXA 4WBRD 3I43A 1GWCA 3ERWA 4MPFA 4K0NA 4FYBA 4WXTA 5ECRB 4Q5NA 4PUAA 5CP1A 1Z6MA 1K0DA 4K6XA 1K0NA 4L5OA 5DALB 2WS2A 4WF4A 3GTUA 4GLTA 3TJJA 3HHVA 3SWLA 3G7IA 2CQ9A 1PL1A 4TKYA 1BJXA 4DSSB 1ZGNA 2PBJA 3D22A 5AIXA 5G1KA 4XHMA 3DRNA 3GV1A 4PXOA 3GKNA 2H6XA 2GT6A 3GH6A 5F8BA 4TXOB 1VRSD 3KZQA 1A0FA 4KW6A 4RUVA 2H0HA 2X64A 1QFNA 2PVOC 1OVNA 1XVWA 4K9ZA 2BMXA 5G31A 5GSSA 4OCFA 4BWSA 4TR3A 1K3YA 1IYIA 1ZZYA 1CQHA 2NVLA 2L6CA 3FEUA 2V6OA 4YQMA 3A2XA 2HRNA 3C1RA 2ZCTA 5D9TA 1X9MB 2XC2A 1YEPA 1XWKA 3GSTA 1F2EA 1DUGA 4KGIA 4FYCA 3D4TA 1VF2A 4ID0A 2VCXA 1O85A 3N9JA 1T7PB 2H30A 2WB9A 2JL4A 3KH9A 1KNGA 1K0AA 3IK9A 3HVSA 5ECKB 1JHBA 2VCQA 4TR1B 1ERVA 1TRSA 3F4SA 4MPGA 1QGVA 1H4OA 3BCIA 2C8UA 4ZXGA 3EMPA 3GUSA 2PMTA 2WFCA 3EURA 2I1UA 2K18A 3VK9A 5DCGA 2WRTA 3HKRA 5J9CA 2JSZA 5A5KA 18GSA 3LXTA 5ELGA 1SJZA 1PL2A 4TN8A 4TR0A 4XRDA 2B5YA 5HR1A 4J56E 2KP2A 4IGJA 3GSSA 1EP8A 2YWOA 4ZL9A 3H79A 2HFDA 5D93A 3ZL5A 4K0GA 2VUPA 3HY2A 2XPDA 3G9BA 2VIMA 4TRXA 1QXHA 1YF1A 4MP4A 5AISA 3IHQA 3RPPA 3IBHA 3ZMKA 4OFTA 4BWQA 2DLXA 2C0FA 1SL2B 3FZ9A 3GA4A 3TKSE 2YWIA 3TKRA 1B4PA 2YNXA 4POMA 5IMDA 1O8XA 6GSWA 1TI3A 4MA9A 1TU7A 2R3XA 3ZITA 2R6KA 4Q5QA 1Z6NA 3FY7A 3IA1A 5JCUA 1JZWA 2PVQA 2P5QA 3P90A 5KN3A 4FYUA 1A8LA 3WYWA 4KSOA 1SJ6A 2I3YA 5IOXA 4IHUA 3QPMA 4TR4A 2ON7A 1O7UA 4HEA2 13GSA 3I6AA 2LRNA 2X8HA 1PX6A 4EXJA 1YZXA 1WRYA 3H1NA 2L4QA 4DVCA 2JZSA 3F4RA 1Y25A 5DAKA 4IW9A 1ZCPA 5D73A 1K3LA 3IRAA 1GLQA 2FCHA 2IMIA 2O8VB 3CMIA 4HZ4A 2I81A 5DDLA 2H6YA 5ID2B 3GX0A 4MLYA 4IELA 3VI7A 1X0RA 3DMLA 2C3TA 1XXUA 1B9XC 4IJIA 2KOKA 3IAS2 5ECIB 4WETA 3RDWA 4JR6A 1XOAA 4L0UA 2GT5A 3I9V2 2VL2C 4EDZA 5B6NA 1T3BA 2E2GA 3LSZA 4XTSA 1YKAA 4IS0A 3L9SA 2OE0A 2HZEB 5G5EA 5COHA 5IPHA 2CV4A 1X5DA 4EF0A 3FZ4A 5ECHB 2PWJA 5H5SA 2X8GA 4IJ3A 5HR0A 5IMVA 4ILFA 3D4MA 1KTEA 5IMZA 5HQPA 4ZL8A 2WULA 4OWYA 1U87A 1WP0A 3KM6A 2HSYA 3V1WA 1FB6A 3LEFA 2E7PA 3UBLA 1SK2A 3MSZA 6GSSA 5B7CA 2VLTA 1PSQA 1URMA 3U5RE 1GSFA 5JWOB 2MZCA 1IYHA 22GSA 4ZB6A 5C00A 4QL7A 1O73A 2JSYA 5ENUA 3P2AA 1XCCA 5JWQB 1FO5A 2F3MA 4ECBA 2YN1A 3KCMA 4ML6A 3NZNA 5ECLB 2CZ3A 2RLIA 4AGSA 1EOGA 1DE2A 4HUAA 4LA1A 4YQVA 3EYTA 3RPNA 3HXSA 1R5AA 5G2ZA 2VCWA 1HD2A 1NM3A 3GKMA 4GQCA 4LMWA 4Z7XA 1X5EA 2AHEA 2LJKA 2YOIA 2R37A 1XWBA 1AW9A 1XOBA 2YWMA 1ZL9A 3M0FA 3TDGA 3IXRA 3MAKA 4EC0A 1JFUA 1Z3EA 3UAPA 3D21A 2WCIA 3GN3A 5ECNB 1M7TA 3LQ7A 2DIYA 2DJ1A 2IMDA 4EDYA 1BAYA 3P7XA 2NBSA 3VWVA 1A2MA 1XIYA 4O7HA 3VPQA 1BQ7A 1Z7PA 2PU9C 5LCZA 3ZFLA 1TK0B 2CZ2A 2C0EA 2F8FA 1WPIA 4GF0A 3MNGA 2NDOA 2V6KA 1TW9A 3AY8A 5LD0A 5AGYA 3FRCA 2IMFA 5EY6A 3GIXA 2O7KA 3TRQA 3C1SA 4TW5A 2R4VA 3HA9A 2RUEA 1SENA 4MDCA 4J57E 4LL1B 1M9AA 2CX3A 2LKUA 2L59A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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