1OAZA

Ige fv spe7 complexed with a recombinant thioredoxin
Total Genus 12
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
12
sequence length
122
structure length
115
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPIEESDDRRYDLVGPCKMIAPILDEILTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Antibody Multispecificity Mediated by Conformational Diversity
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN 1
molecule tags Immune system
source organism Escherichia coli
total genus 12
structure length 115
sequence length 122
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1oazA00
4XRAA 3HXSA 2TRCP 3L4NA 4TXVA 4CDOA 2H76A 2H30A 5CRDA 1TXXA 3UVTA 5KN1A 3A3TA 1A23A 3GSSA 1GUHA 3A2XA 2LTKA 1OYJA 5F06A 3UBLA 1EV4A 16GSA 1GUMA 1K0BA 2YWIA 4LL4B 3GV1A 4NHWA 1CQGA 3VPQA 2EIQA 2YPMA 1O8XA 1MD4A 1TP9A 1GTUA 2ZCTA 2GDRA 1E2YA 4MF7A 3KCMA 3DGQA 3EU3A 3GNJA 4J56E 3CYNA 5E4WA 2KHPA 4BL7A 1PD21 2H6ZA 1EP8A 1C72A 3F3RA 3FR3A 4XS1A 5GAPD 4RQXA 1PQNA 4ECJA 4QL9A 3P8WA 5ID2B 2MBTA 1TRWA 1NW2A 1EV9A 2DBCA 1UVZA 4YH2A 2CVKA 4BVXA 1F9MA 2GS3A 4WEYA 1CQHA 4WF4A 5JWRB 1PL2A 4HOJA 2H0GA 3FZ9A 5IMZA 1J08A 4GXZA 1Z7PA 14GSA 2FD3A 4DSRA 2P5RA 5J9CA 4KH7A 3DRNA 2CX3A 3VWWA 2GGTA 2WDUA 4PQ1A 2X8CA 4EDZA 2X64A 1TOFA 3A2VA 4F0BA 1B9XC 2LQQA 3LXTA 4EE0A 4TOPA 1THXA 2I4AA 5JWQB 1G0TA 3TGZA 2L59A 1USBA 2XPDA 2ZUPA 5G1KA 4K7IA 4LMWA 1KEBA 3EVIA 2B5XA 1TK0B 2WS2A 1X9SB 3ED3A 1TK5B 4MLYA 3GIXA 5IPHA 2C0GA 1QUWA 1DBYA 1PSQA 1U88A 1NM3A 4X43A 1VGLA 1V98A 4TRXA 4MZBA 2N5AA 3BCIA 1MDIA 3P7XA 1JHBA 1M9AA 2YJ7A 4WETA 4K7NA 3DYRA 4E8HA 1SJZA 1FW1A 2WGRA 3UEMA 2KOKA 3BBYA 2B1KA 2RIIA 3F3QA 2NDOA 19GSA 3LFLA 2O89A 3NOFA 4O5RA 2A2SA 1YQ1A 1EWXA 4I97A 2HNLA 4PNGA 5IO2A 3UL3A 2GQKA 1K0OA 3TOTA 3F9UA 5CP1A 6GSWA 2BMXA 2QKEA 2I9HA 1BYEA 4WKWA 1GL8A 2FWHA 4IELA 2DC5A 2YANA 1R5AA 1O7UA 4YAPA 1HNCA 1M2AA 5CREA 3GL3A 2PBJA 1MD3A 1SKSB 5ECIB 4TW5A 3LSZA 3Q6OA 4V1Ag 1ERVA 4V2LA 1OAZA 3IHQA 1NHYA 5AIXA 4L5LA 1J0FA 1A0RP 5DAKB 3IAM2 1GNEA 3D4TA 4MH2A 1GTIA 4K8MA 4IJ3A 13GSA 1I9DA 3C73A 3CTGA 4HQZA 4JR4A 5G2ZA 3FHKA 4K0NA 3FR9A 2C3NA 4FYUA 2MMNA 6GSXA 5L71A 4G9HA 4BVYA 2MMAA 4ID0A 5ECQB 1V40A 1YDKA 1Q4JA 2V2GA 3RAZA 2H8LA 2PMTA 1Y6EA 1PMTA 1U6TA 2VCWA 4KSOA 3VI7A 3R2QA 3TB2A 5CAXA 2AYTA 1GSUA 3U6VA 1Z6NA 3C1SA 1T7PB 2VLUA 2MZCA 2V32A 1T1VA 3ZMKA 1Y25A 3IBHA 2LSTA 3Q74A 3IE3A 5D96A 4OO5A 4WF5A 5F0GA 1PA3A 3GFKA 2V6KA 2EIRA 4KB3A 2OADA 4GLTA 4TVEA 4WR5A 1K3OA 1HNAA 1SJIA 2D2ZA 2R4VA 4MZWA 3F4RA 3GL5A 1V57A 4FH8A 3HCZA 1GUKA 2CZ2A 4LL1B 3WYWA 2ZNMA 1QK8A 3ZFBA 5GZZB 4TR4A 3F4TA 2DIYA 2GQLA 3IR4A 5HQPA 4YAVA 1O81A 4MJEA 1HYUA 4XRDA 2CVBA 3GH9A 5GSSA 3TOUA 3TCOA 1SJ6A 5C04A 2NBSA 2HXKA 2F8AA 4TR0A 3CRTA 4ML6A 1H4OA 4IKHA 1AXDA 3EWLA 5HFKA 2IMIA 2L5OA 3TJKA 4EL1A 2JSZA 5ECMB 5ECOB 3ZREA 1DE1A 1UC7A 1NSWA 2LV3A 4MMMA 5GSTA 2V1MA 1BQ7A 2VM2A 3P90A 3J7Yk 5J5NA 2C4JA 5IOWA 5B6MA 2VCZA 4MPGA 3UARA 4HS1A 1M7TA 4ECCA 1UN2A 1VF3A 5C00A 3GKXA 3F63A 3ZFLA 4HQSA 2PGTA 4PXOA 3GN3A 3QOUA 1RK4A 1MTCA 4DSSA 1B4QA 3SBCA 3BJ5A 2K9FA 4TXOA 2NPBA 4MJAA 2AJQB 4TKYA 3KMNA 2VCVA 2QGVA 5B7CA 5AN1A 2OKAA 3H4KA 5ELGA 3KMOA 3G7YA 2B5EA 2LQOA 2P5QA 2CZ3A 5D93A 4AF2A 4LLRA 3EC3A 2ON5A 5AISA 4ZL7A 1T4YA 3DKSA 4IN0A 4ML1A 2G0FA 5D9XA 4JRRA 3NIVA 5HFGA 3WGDA 5KN2A 3F6DA 2OJLA 3KJYA 1N8JA 3KEBA 2VIMA 3DMLA 3FYGA 2C0DA 5A4UA 1K0NA 5HR3A 2YN1A 2CQ9A 5ABRA 1LBKA 5DQYA 3LXZA 1FVJA 2R37A 2PWJA 3KM6A 2H66A 3I43A 5INYA 3GKNA 2I3YA 3LGCA 4ZB8A 2QC7A 2YZUA 3ZITA 1FO5A 4NPBA 1ERTA 3QR6A 2PERA 1ZZYA 2OE0A 1PX7A 4BPYA 6GSUA 4D73A 4EF0A 3P2AA 4EXJA 2RUFA 4KW6A 4WBJA 3GURA 1GRXA 1HD2A 2X99A 1JZDA 5DALA 2HLSA 2FY6A 4EC0A 2MYGA 5EL8A 4IS0A 1SENA 1IYHA 4PGTA 2FWEA 4KA0A 4OMVA 4MH3A 5CRGA 3TKPA 3IDVA 1JLWA 1EEMA 1F6MC 3VWXA 1GSYA 5DJLA 2AB6A 5LNKe 1GP1A 4ISDA 3QDNA 1S3DA 2WRTA 4IVFA 3ZVJA 2OACA 4LMVA 2KP1A 3EE2A 4ECIA 1YEXA 1YJ6A 2IFQA 4KAEA 5HR2A 1SK0A 1GH2A 3UAPA 1ZOFA 3ERFA 2JL4A 5CRHA 1PKZA 3LYKA 3LYPA 1U3AA 1SL1B 2DJ1A 1M0UA 4IQAA 5JWOB 3UOMA 1VRSD 2DJ2A 3FZAA 1WMJA 1X5CA 2YWNA 1URMA 3IK7A 3M3MA 2LKUA 2DSAA 1NHOA 5ECRB 1T8EB 4JE1A 3HZ8A 5CO3A 4ZBAA 5G31A 4FYBA 2K18A 2L5LA 5FHIA 2DLXA 3ZMLA 4EO3A 1X0RA 1XWKA 4TR3A 4LA1A 1M2BA 4YQUA 4K0GA 1WIKA 2H0IA 4O7HA 4PQIA 3EMPA 2VO4A 1XOBA 4OFTA 5IMFA 3WT2A 3GMFA 1ERWA 1M9BA 4ACSA 3DXBA 4IQ1A 3HJOA 3TRPA 1LJRA 2EC4A 3ZZXA 2FCHA 3KGKA 1M99A 3ME8A 4G19A 5GAND 3ZIVA 2JU5A 5G30A 1JZOA 1Z6MA 5H5RA 4FIWA 2H70A 5IIZA 4F03A 4GQFA 2KP2A 4G2EA 1WE0A 3AY8A 4ZBDA 2A2RA 1FAAA 1GULA 1MDKA 2F8FA 4ZL8A 3D21A 2VAFA 2GZYA 4HZ2A 3KZQA 3GYKA 1TDIA 3ISOA 3IAS2 4NXIA 3HA9A 1BG5A 3KIJA 1W89A 3EYTA 3GX8A 4MCUA 1ZL9A 2TRXA 1XWAA 3KP9A 4DSSB 4N0ZA 1E6BA 1R7HA 3A5WA 3FY7A 4TXOB 3ZLPA 4V2NA 3C1RA 4PURA 2YJHA 4K2DA 2REMA 2VM1A 4Z7XA 4P3YB 1XFLA 2B7KA 2H73A 1X5EA 2OA7A 2FGXA 3WGEA 1QGVA 3M9KA 3F8UA 2PN8A 2FLSA 1KNGA 4JEDA 1O85A 1EGOA 4FO5A 2VL9A 1SD9A 4K1FA 1XCCA 3HDCA 2GLRA 2ALBA 1X9WB 1VF2A 3SWLA 2L4QA 3E0UA 3K8NA 1G7EA 2X8HA 4KX4A 4GSNA 2VD1A 3WT1A 3TRXA 2BTOT 1BEDA 3HHVA 3ZRDA 4PUFC 3QAVA 1SYXA 3C71A 3US3A 3EMXA 4DVCA 5J3RA 4HEA2 2PVOC 2CAIA 3G7IA 2XPEA 4HJ2A 4POLA 2IIYA 8GSSA 5B8AA 4GWRA 3S9FA 2F51A 4L0WA 1JZWA 2JZTA 3BOAA 3TKQA 2B6MA 5IMDA 5KN3A 4OWYA 2V41A 4D73B 5F8BA 2C8UA 2IWTA 3E3EA 4IW9A 5CRWA 2WZ9A 2FNOA 2B3SA 2BJXA 3MAKA 4JR6A 4GSSA 2H01A 1T00A 4MF5A 1OKDA 5DALB 4POBA 3TJFA 4TN8A 1ZMAA 3UIWA 3LEFA 2YV7A 2VCXA 2WCIA 2WFCA 5DQSA 2DMMA 4PNFA 4DEJA 3HZ4A 1WRYA 3W6GA 2YZHA 4KE3A 4JZQA 3EU4A 2IMKA 4YQVA 3ZL5A 2H75A 4F9ZA 3D0ZA 2N5FA 2DIZA 5EVOA 1YKAA 3CTFA 5J4UA 2YP6A 1A2LA 4X0XA 6GSVA 2Z9SA 1EOGA 3DVXA 3CSHA 3IPZA 4OO4A 2FUG2 1FB0A 3UMAA 4WR4A 2PVQA 1A2JA 2IFQB 1PN9A 5HR1A 2JACA 2PPTA 3RBTA 5KEJA 3RDWA 4IGJA 2E7PA 1K0DA 1TU8A 5ENUA 2C3QA 1K3YA 5JCWA 1O73A 1TTZA 1QXHA 5ECSA 4XIHA 4WXTA 1XVWA 4NV5A 5DCHA 1DSBA 3HYPA 3LJRA 2B5YA 1ZCPA 2GSTA 1AUCA 5DVBA 3PH9A 2YWMA 3ZYWA 4IJIA 2B1LA 4XTSA 1T3BA 4MJBA 2HZEA 4MA9A 2DJKA 3MWHA 1N2AA 4JU5A 4PX1A 2LRTA 2HYXA 1OC8A 4RQRA 2KUCA 1A0FA 7GSSA 2FWGA 3M9JA 3IA1A 3ERGA 4NMUA 2RLIA 4MZCA 4ZILA 3LWAA 4DSQA 3HJMA 3GHAA 1FVKA 4AGSA 3FEUA 3LG6A 4HUAA 1K3LA 1GLPA 4AJ7A 4Q5NA 3GRXA 2HFDA 4ZIJA 2WULA 4MABA 3L0HA 3TUEA 3DIEA 1B4PA 3MDKA 3WD6A 3IRAA 2R3XA 4TR1A 4HU7A 5EY6A 5E59A 17GSA 3RPNA 4EDYA 3HJPA 4POMA 1V2AA 4H86A 3H93A 4NAXA 5HFIA 1V9WA 2HRFA 4HZ4A 1VF4A 2L57A 2LNSA 2LJKA 1X9MB 3L9VA 1G7OA 4FYCA 2VLTA 2L6CA 2VUPA 4GF0A 2IPAA 2VCQA 3FW2A 3GKKA 1OKTA 2C3TA 1R5PA 2AHEA 1JLVA 1S3AA 2LEGA 1SK1A 3IOSA 3FR6A 2JSYA 2IN3A 4IP1A 2P31A 3H79A 1KTEA 1OC9A 4Q5FA 3RHCA 2CX4A 2FHEA 1XZOA 18GSA 1JZRA 1XW5A 2LRNA 1ERUA 4BWQA 3DEXA 2CAQA 2B7JA 2AV4A 4N0VA 1EP7A 1WWJA 2O87A 3HVVA 3HY2A 4HJMA 4ULXA 1F3AA 5D8IA 1TI3A 2IMDA 4GCIA 4JBBA 1A24A 2QSIA 1X5DA 1TKDB 5CYYA 3RPPA 5DDLA 3QCPA 1DE2A 1K0AA 4XS4A 1SK2A 1SKWB 1GNWA 1SYRA 1WJKA 1H75A 1IYIA 4HU9A 3DD3A 1PX6A 3DWVA 1MDJA 1XWBA 3GH6A 5D73A 4CHSA 3VWUA 2RM5A 1GSFA 1YZXA 1XBSA 3VFIA 3FZ4A 1QQ2A 3QPMA 2RM6A 1XOAA 2HT9A 5J9BA 2CVDA 1RW1A 1A8YA 3FZ5A 3KTLA 1PKWA 4ZBBA 2K8VA 1GSSA 4IHUA 5D9WA 2PUKC 4OD7A 1F3BA 5IMVA 3TDGA 2MBSA 1GTAA 6GSYA 2M72A 3JCML 1O6JA 4OCEA 4F0CA 1OC3A 3KH7A 2F3MA 1QMVA 4F2IA 3KTBA 4MK3A 1TJDA 2MMOA 3IXRA 5ECPB 2MMZA 3TKSE 2ES7A 1OE7A 2J9HA 5LD0A 4L5OA 2VL2C 4XCSA 1B8XA 1S3CA 6GSTA 3F6FA 2H1BA 2LNTA 2O7KA 1M2DA 3C8EA 4G10A 3H8QA 4J57E 4K9ZA 4EUYA 3VPTA 3I69A 5LCZA 1AW9A 2GT6A 2IMEA 4KCEA 1ML6A 2L6DA 3I6AA 4J2FA 3GTUA 4MDCA 1SL2B 2P0GA 2H6YA 3GX0A 1JFUA 1FB6A 5DBQA 2VL3A 1PRXA 3UJ1A 5G1LA 1TK8B 1XWCA 4AJ6A 4L8EA 2CT6A 2LJAA 4N10A 1R26A 1DUGA 4MP4A 2CV4A 3QAGA 5B8BA 1TRUA 5A4VA 3HVSA 3BCKA 3CSJA 3CSIA 3CXGA 2M80A 3A2WA 2K8SA 2C0EA 4KUNA 4EKZA 4ILFA 3Q18A 2IMFA 3VLNA 3IK9A 3OR5A 4X1UA 3QFBC 2HRNA 2V6OA 1THOA 2FA8A 5D9TA 2XHFA 2HZEB 3H1NA 2H1DA 4YQMA 1ST9A 3TRQA 3EURA 2DJJA 2H1GA 3O76A 4KDUA 1XIYA 1AQXA 2YV9A 3D4MA 2HSHA 1Z9HA 1YF1A 2XBQA 5FWGA 4GQCA 4CW9A 1YEPA 4ZL9A 1I5GA 3HD5A 3TKSC 4TR1B 4KSMA 2I81A 3L9SA 1SU9A 3HVXA 4K7OA 1BJXA 2OBKA 2JZSA 2GSRA 3GSTA 2LUSA 1YF0A 2YOIA 3BD2A 4MF6A 3NZNA 1KBNA 3VI5A 4BA7A 2DJ0A 3WGXA 2H6XA 3I9V2 4L0UA 4Q5RA 5F07A 3FK8A 4V2MA 3APSA 4NHZA 2GQMA 4ZB6A 4EVMA 3IC4A 4MPFA 2DJ3A 3EINA 1MEKA 3F0IA 3PINA 1ZYEA 9GSSA 2NTOA 5J41A 3DVWA 5ECHB 2FWFA 3J7Yb 1OC9B 1K0MA 1XVQA 2ON7A 1Z7RA 4OCFA 1RQMA 2LRCA 4OFMA 1B48A 4MJCA 2OE1A 2GSSA 1R4WA 2A4VA 5DJMA 3CMIA 4PUAA 1GTBA 1XPVA 4N11A 5G5FA 3V1WA 2KLXA 1G6WA 4O32A 1PL1A 1XWGA 4RI7A 1AQVA 4I2TA 4Q5QA 4V1Ap 4BWSA 5HR0A 2E0QA 3CRUA 5JCUA 2GTUA 5IPGA 2HE3A 4HDEA 1U87A 4QL7A 4XS4B 2H72A 1TRSA 3PGTA 4GTUA 3TJGA 1AC1A 3D6IA 5IM9A 3G7JA 2GSQA 3APQA 4ZB9A 3QD9A 1J9BA 5H5SA 5IO0A 11GSA 3O6TA 2G2QA 4O92A 3QFAC 3F4SA 1OE8A 4I5QA 4QQ7A 1SL0B 1U3IA 2YCDA 4K6XA 1G6YA 4N30A 5B6NA 4IBPA 3Q19A 1EZKA 5JCGA 2DMLA 1F2EA 2OBIA 2E2MA 5AIVA 1XW9A 2XBIA 5COHA 3D5JA 5IQYA 4ZXGA 1FHEA 5A5KA 5ECKB 1AQWA 3TJBA 1ON4A 3W8SA 5EPFA 2GZZA 3L78A 5KN0A 3GKMA 4KDXA 3VWVA 22GSA 5ID2A 2C0FA 2GZPA 2O85A 2VL2A 3LORA 3UBKA 1TI1A 5IMCA 2VCTA 5A4WA 1XXUA 1GSDA 1GSQA 1TU7A 2IJYA 3VK9A 2H19A 1Z3EA 1SD8A 3KP8A 5IOXA 3VURA 2LS5A 3GA4A 2H74A 4KNDA 2H1AA 2H71A 2L4CA 2R6KA 3GTUB 1TRVA 2X8GA 4IP6A 5IMAA 2C80A 2YWOA 4I6XA 4NV2A 2YNXA 4XS6A 4ECBA 1Z5YE 3W8JA 4GRFA 2AUVA 3TKRA 1ZYQB 3L9UA 4I2UA 1WPIA 1QFNA 2NVLA 3QAWA 4I8BA 1GLQA 2XC2A 4KCAA 1ILOA 4KGIA 3RHBA 1EOHA 4POKA 4RUVA 2TIRA 2VLVA 2AAWA 1B9YC 3LQ7A 5G5EA 10GSA 1EEJA 3FKFA 5AGYA 5ELAA 3U5RE 1ZGNA 1XW6A 2I1UA 3FRCA 3C7MA 2F9SA 1FG4A 3APOA 1GWCA 1HNBA 5ECNB 2R5GA 2N5BA 4XHMA 1UA5A 2HI7A 2J23A 2OE3A 5FT3A 2R2JA 1GSEA 3PR8A 3TJJA 3TKSA 2FA4A 3MNGA 5H5QA 1AIUA 1Q98A 3D22A 1W4VA 3IV4A 2M46A 4AJ8A 2HSYA 2VD0A 1WOUA 2HZFA 2H0HA 3CBUA 3UVHA 2WB9A 3ZVJD 1VF1A 1ACVA 2E2GA 4GSTA 3ME7A 4NWYA 3O3TA 3N9JA 4PQHA 3G9BA 3KXOA 3ZTLA 1ABAA 3MSZA 1V58A 3N5OA 1WP0A 1O8WA 5CNWA 1SKRB 4HI7A 4OFNA 4WBRD 2JADA 1LU4A 1TW9A 1T4ZA 2JZRA 3KD0A 4F82A 4KDYA 4RI6A 5DAKA 1A8LA 5D9VA 5F05A 2CA8A 2EIOA 6GSSA 2O8VB 5ECLB 1BAYA 2GVPA 12GSA 1EGRA 1AAZA 1OVNA 2IL3A 1A2MA 4E8EA 3E9JB 5DCGA 3M0FA 2K6VA 1YKCA 3M1GA 2WJUA 3M8NA 2LJRA 3KH9A 20GSA 1FOVA 2C1YA 2GT5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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