1OAZA

Ige fv spe7 complexed with a recombinant thioredoxin
Total Genus 12
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
12
sequence length
122
structure length
115
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPIEESDDRRYDLVGPCKMIAPILDEILTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Antibody Multispecificity Mediated by Conformational Diversity
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN 1
molecule tags Immune system
source organism Escherichia coli
total genus 12
structure length 115
sequence length 122
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1oazA00
1GSUA 4KSOA 3GYKA 1X9SB 3BOAA 4IS0A 4X0XA 2L59A 1BG5A 3UJ1A 2LJAA 2FLSA 1TRUA 1NSWA 1BAYA 3RBTA 5FWGA 1PX7A 1KNGA 3VI7A 4NXIA 3GV1A 1M99A 6GSWA 2B5YA 2VL2A 2RUFA 1M2BA 2VCWA 3HZ4A 4MP4A 3TOTA 3MAKA 3I43A 2GSRA 3UVTA 3W8JA 4IP6A 5DJMA 3RHCA 5F06A 2K9FA 1EOHA 2PPTA 3UAPA 1WJKA 4TOPA 1GWCA 1A8LA 4CW9A 2AYTA 5AIXA 3P8WA 2VD0A 1WPIA 3IDVA 2E2GA 2FWFA 3BD2A 3IRAA 5IQYA 2KHPA 5IMAA 1O8WA 3CSJA 2H0GA 3KGKA 1TOFA 2C0GA 4MJBA 3FZ9A 1GSYA 5E59A 1NM3A 1VF4A 2IJYA 1F3BA 4P3YB 1Y25A 4G9HA 1ILOA 1T4ZA 3FHKA 1BEDA 5CRDA 2OBKA 2JL4A 3TKSC 2X8GA 5AGYA 2MMZA 3KTLA 4OD7A 4KDUA 5IO2A 1O73A 1NHYA 3LJRA 1XWCA 5ECHB 1M2AA 3ZREA 1N2AA 4TKYA 4F2IA 3ZIJA 2H6XA 4G10A 4TVEA 1K3LA 1Z6NA 1FVJA 2A2RA 3N5OA 3DKSA 2K18A 2L5OA 1DE2A 3PH9A 1VF1A 1A23A 5F0GA 2VLUA 2DMLA 3QAWA 2PBJA 3KIJA 3D22A 2PMTA 5D73A 2VL9A 5ID2B 4ECIA 3JCML 4PQ1A 1YEXA 1J9BA 1SJIA 3LORA 1MDIA 1XWBA 4I6XA 3ME8A 3CSIA 2HLSA 1YJ6A 5JWRB 3PINA 3Q6OA 2ALBA 1K0BA 1TK0B 1TU8A 2RIIA 1A2LA 2VUPA 4HOJA 1QMVA 4L0WA 4MH3A 1KTEA 1EOGA 3WGDA 2JZRA 2H8LA 1OKDA 2C1YA 1S3CA 3A5WA 4IJ3A 3D6IA 2IMKA 1ZYQB 4OO4A 2GQKA 2H1BA 1XWGA 4N30A 2LKUA 4WBRD 4MK3A 1AIUA 5DALB 1UVZA 1GUKA 1J0FA 1EGRA 5G1KA 3TJFA 1AXDA 2E2MA 2M80A 2B3SA 3J7Yk 2K8VA 2K6VA 2N5FA 6GSVA 4L0UA 22GSA 3KCMA 3FY7A 5JCUA 2HZFA 5HFKA 2E0QA 4EKZA 3A2XA 2ON7A 3G9BA 2OKAA 3ED3A 2YN1A 4F03A 2YJ7A 3KP9A 2PN8A 3ZITA 1WIKA 3TRPA 5B7CA 4WEYA 2HYXA 4K0NA 2TRCP 2WJUA 9GSSA 1HNCA 2A2SA 2LRCA 2R3XA 2LEGA 1YZXA 4IKHA 4OO5A 1TRSA 8GSSA 4XS6A 3IR4A 3HHVA 2GQMA 4Z7XA 3F4RA 4HZ4A 2WULA 1T1VA 4MJEA 3S9FA 4MDCA 4BWQA 2B6MA 3VPQA 5F07A 2L4QA 3HDCA 2HI7A 4ECCA 1EEMA 4DVCA 2AB6A 3HXSA 3GKMA 1JFUA 2G2QA 2N5BA 2LS5A 1GTAA 3O6TA 2PU9C 1X5EA 3J7Yb 4V2LA 1PD21 2H01A 3FR9A 5IIZA 3GMFA 4ZBBA 4ECBA 3LWAA 5EPFA 2H19A 2GSTA 3IK7A 1K0CA 2AAWA 2VM1A 1TJDA 1U88A 3D4MA 3KTBA 2H73A 1ML6A 2C4JA 2H0HA 3DD3A 1O8XA 4FYUA 2QC7A 3PGTA 2H6ZA 4ZL9A 6GSXA 6GSSA 4KGIA 2YANA 2JSZA 5HR3A 4KX4A 4KE3A 4D73A 20GSA 3TCOA 1VRSD 4IQ1A 3W8SA 2BJXA 3ZFLA 5CP1A 2LQQA 4HDEA 5CRHA 4KW6A 1TK5B 3R2QA 3WT2A 1SL2B 1T3BA 3L9UA 4AF2A 4LA1A 4BL7A 5ECIB 2JACA 1ST9A 2VCQA 1SJ6A 1THXA 3C1SA 3FZ4A 2VCVA 4K1FA 2B5EA 1FAAA 3ME7A 3WD6A 4GWRA 3EE2A 2BMXA 3C7MA 3KH7A 5G31A 3HJOA 1B9XC 3F6FA 4ZL7A 1CQGA 1HD2A 2DC5A 3EMXA 2C80A 1PRXA 4F82A 4LMWA 5D9TA 2YV9A 3BCKA 3Q74A 4NV2A 3A2VA 12GSA 2YV7A 1GSSA 3D21A 3TUEA 3FW2A 2AJQB 5CRGA 1GH2A 4N10A 4V1Ap 1G6YA 1FB6A 4HI7A 2XBIA 1XVQA 5DQYA 3GN3A 1PKWA 3CRUA 5A5KA 4N0VA 4Q5RA 4GSSA 1T4YA 4IELA 1TRWA 4BA7A 4EDYA 5JWQB 2CVDA 1JLWA 1V2AA 3L9VA 4JR4A 1ZZYA 3DGQA 4QL7A 3GH9A 2R37A 2I3YA 3RPPA 4WBJA 1ACVA 2HSYA 2JZTA 11GSA 3GKXA 1BJXA 1WOUA 3CXGA 2OACA 4KH7A 1MD3A 2DJJA 4DSSB 2X99A 3BJ5A 4JZQA 5ECRB 2AHEA 4J56E 1EWXA 5KN3A 1LJRA 4POMA 1KBNA 3IA1A 4DSRA 1ERVA 5KN2A 3QR6A 5JCGA 2IL3A 2OE0A 1LBKA 4O92A 2DIZA 2H71A 3M8NA 2ZCTA 1B4PA 2CZ2A 1B48A 1USBA 4PURA 5IPGA 1BX9A 2WS2A 3TKRA 1OC9B 3BCIA 1Q98A 1SK0A 1VF2A 4TRXA 4L5OA 4JU5A 4K9ZA 1YDKA 1A2JA 2H72A 4KA0A 3NZNA 2DSAA 1SENA 2PVOC 2HE3A 2YZHA 1ZYEA 2RM5A 4K8MA 4NV5A 3HVXA 3M9JA 4ZB9A 3HD5A 3L4NA 4GSNA 2OE3A 2DJ2A 13GSA 4NWYA 2NBSA 3F3QA 5J4UA 4FYBA 4QL9A 5LCZA 4MPFA 1MTCA 5D8IA 3F3RA 4XIHA 3VLNA 1F3AA 1AAZA 3DMLA 4MPGA 1R5PA 4IHUA 3KP8A 1AQXA 4GXZA 3HJPA 1XFLA 1SKRB 1ZMAA 2R5GA 2HRNA 3C1RA 1PKZA 2HXKA 4J57E 3WGEA 2K8SA 2V1MA 4XRDA 2FNOA 4OFMA 4RQXA 2O85A 3GSSA 4KDYA 4DSQA 5IMZA 1XVWA 2CX4A 3LG6A 2VLTA 3APOA 4G19A 2LJRA 5DQSA 5J41A 2IMEA 3FZ5A 2CX3A 5HQPA 1WRYA 2WZ9A 4AJ6A 2NVLA 5AISA 17GSA 4MH2A 1F6MC 2F51A 4L8EA 3IXRA 2YWIA 1K0MA 3TRQA 2OA7A 16GSA 3F4SA 2IMDA 4HU7A 1V9WA 2I4AA 4PNFA 1SK2A 1DBYA 2CV4A 3M9KA 2LRTA 3L0HA 2LSTA 4ML6A 1GNEA 3GIXA 2LRNA 5CYYA 1XZOA 4K7NA 4MF7A 2V2GA 2YOIA 3C8EA 1I9DA 1SYXA 2I9HA 3GSTA 4L5LA 1JZDA 3F4TA 1H75A 4GSTA 1OKTA 3ZYWA 3VURA 1DUGA 2AUVA 5D9WA 3M0FA 4OCEA 4ZBAA 3H93A 5GSTA 7GSSA 4ZIJA 3AY8A 2FGXA 3TJJA 3UVHA 2WFCA 2O89A 1XWAA 2NPBA 3IE3A 1VF3A 3LFLA 4EL1A 2WB9A 2NDOA 2TRXA 1LU4A 2WCIA 1O6JA 1MD4A 2WDUA 1FG4A 4MABA 3H8QA 2P31A 3UARA 2REMA 3IAS2 5CRWA 2VIMA 2DIYA 4BPYA 1YF1A 4QQ7A 4BWSA 2L5LA 4ZB6A 4HJ2A 1Z3EA 2VCZA 2GTUA 1HYUA 3FZAA 1ZOFA 2JSYA 3O76A 2OBIA 2VAFA 4K2DA 1HNBA 2B7KA 3IAM2 1BQ7A 1EV9A 1Z9HA 2FWHA 1PMTA 2H70A 1FVKA 1SK1A 3M1GA 4YQUA 2M46A 3I69A 5ECKB 1ERTA 1B4QA 2H66A 3C73A 1F2EA 4O32A 2FA4A 3F8UA 2LNSA 1SU9A 4TR1A 4OWYA 4RQRA 1WWJA 5IPHA 1PA3A 2YCDA 3EYTA 1MEKA 3KJYA 3RHBA 1XXUA 5IO0A 1XWKA 2CA8A 1O85A 3ZTLA 2LJKA 1THOA 4NHZA 2HT9A 3NIVA 4EE0A 3GURA 5ECNB 3UBKA 4I8BA 4XCSA 1QXHA 1OC8A 2DLXA 3ERFA 1DSBA 2MZCA 1UA5A 4Q5FA 1NW2A 1HQOA 2KP2A 1A8YA 3DIEA 3A2WA 5DAKA 3LXZA 4DSSA 3CYNA 1G0TA 2LQOA 4TXOB 4ZL8A 3TKPA 2LTKA 1FO5A 4IGJA 3CBUA 5D93A 1JHBA 4WF4A 4IBPA 1ON4A 4JEDA 1R5AA 2I81A 1SYRA 3IPZA 1R26A 2D2ZA 1T7PB 2ON5A 3CRTA 1G6WA 2GDRA 1GNWA 2VL3A 3FRCA 4JE1A 3QPMA 2PERA 4POLA 2GT5A 1SD8A 5D9VA 4I5QA 5AIVA 4NAXA 1EZKA 2R6KA 1OE8A 2LV3A 2HSHA 4PX1A 3KMNA 2IWTA 2XPEA 1OC9A 4CDOA 1O81A 3QFAC 3V1WA 2GLRA 2IFQA 1M9BA 4XHMA 2MMNA 2F8FA 1N8JA 3D4TA 3QMXA 4E8EA 1K0AA 3D5JA 2DMMA 2CQ9A 2YWOA 4Q5NA 2ES7A 5G2ZA 5HFIA 4IW9A 2C0DA 3GA4A 2YNXA 4GF0A 1ZL9A 2GSQA 1VGLA 4G2EA 5EY6A 3HCZA 3GNJA 3RPNA 5LNKe 2B1KA 2IN3A 1TK8B 3MSZA 4F0BA 2QSIA 1YF0A 1ABAA 4OFTA 3EINA 4MJAA 2H1DA 4FIWA 3HZ8A 3KEBA 3U6VA 1FW1A 4GLTA 2DJ1A 2WGRA 1WMJA 6GSYA 2H6YA 3TRXA 4MZCA 3GKKA 3SBCA 1CQHA 4MMMA 4KSMA 3Q19A 4HU9A 3CTFA 3E0UA 2V32A 3VFIA 1AQWA 2H30A 5A4UA 3PR8A 4TR1B 4PUAA 2XHFA 1K0NA 3L78A 5F8BA 1TI3A 4ZXGA 4H86A 5EVOA 1K3OA 3VK9A 1XIYA 2I1UA 1ERUA 2AV4A 1YY7A 2R4VA 3GX8A 2JU5A 4K7OA 4YQVA 4ZBDA 3C71A 1GTIA 1JZWA 2VOCA 1K0OA 2R2JA 3GTUB 3HY2A 3IC4A 1A0RP 1YKCA 3GX0A 3VWUA 3TDGA 4HQZA 3MNGA 5DAKB 3H4KA 3EWLA 4WETA 3UEMA 2P5RA 3FR3A 1XOBA 3EU4A 1FHEA 4ECJA 4GRFA 4MF5A 3D0ZA 2GZPA 2YP6A 3QD9A 5ELAA 2GGTA 4MLYA 5G30A 1BYEA 2G0FA 3IOSA 3CMIA 2GVPA 3EURA 5ECLB 4NHWA 2EIRA 5HR2A 1A24A 4V2MA 2C3NA 1AC1A 1PQNA 3GRXA 4RI6A 2IPAA 3I6AA 1V57A 2H74A 2IFQB 3ZFBA 18GSA 3EC3A 1X0RA 2WRTA 4K0GA 1XW5A 4XRAA 1U6TA 1URMA 3HKRA 2L6DA 4WXTA 4V1Ag 3DEXA 3QDNA 5H5QA 1ZGNA 4O5RA 6GSUA 3H79A 4FH8A 5H5SA 4RI7A 3RDWA 1Y6EA 3OR5A 3ZVJD 2O87A 3K8NA 3P2AA 2LUSA 1XW9A 4OCFA 2C3TA 5CO3A 4HJMA 3ZVJA 5B6NA 4MZBA 2O7KA 2L57A 2MMOA 4GTUA 2CZ3A 1M7TA 2J9HA 2KLXA 3MWHA 4BVYA 5IOWA 1W89A 1TRVA 5A4WA 4FYCA 5GAPD 3QCPA 5FT3A 3UMAA 3TKSA 4MCUA 1TI1A 1XBSA 2KP1A 4BVXA 3WT1A 4WKWA 5G1LA 2XBQA 3F6DA 1B8XA 1K0DA 2C8UA 3TKSE 1X5CA 4KUNA 2QGVA 3RAZA 2C0FA 2CAIA 1GSQA 3G7IA 3HYPA 5J9BA 2FUG2 2RLIA 3ZMKA 4TR0A 4EC0A 1R4WA 1RQMA 3HJMA 2VM2A 4ID0A 4NMUA 2GS3A 3QFBC 3WYWA 3ERWA 3P90A 1PX6A 2L6CA 4TXOA 4MA9A 5CAXA 1A0FA 5L71A 2RM6A 2YZUA 4XS4B 4ML1A 3GFKA 3E3EA 3EVIA 2O8VB 4YH2A 2PGTA 4MZWA 2GZZA 1QK8A 4O7HA 5G5FA 5DCHA 1GLQA 2VL2C 3LSZA 3LYPA 3GHAA 1GL8A 3KH9A 2EIQA 2F8AA 2FWGA 5C00A 5ENUA 2KUCA 2MYGA 2GT6A 2M72A 1PL2A 2N5AA 3GL5A 1OYJA 3LGCA 1F37A 2F9SA 3LEFA 4TW5A 1F9MA 1QUWA 2IMIA 1G7OA 3EU3A 4I2TA 4E8HA 3WGXA 4LL4B 2DJ3A 2YWMA 3ISOA 10GSA 3I9V2 2H76A 4KNDA 3TGZA 1Z7PA 3KD0A 4AGSA 1I5GA 5KEJA 1KEBA 4EUYA 1B9YC 4CHSA 4RUVA 4PGTA 1AQVA 19GSA 3IBHA 1UC7A 3P7XA 2IIYA 2KOKA 2QKEA 1FOVA 1X9MB 3M3MA 1SKWB 4AJ8A 4TR4A 3O3TA 1MDKA 4EO3A 1AUCA 4V2NA 2HZEA 4JRRA 3KXOA 2MMAA 3FEUA 4MF6A 3DVXA 3MDKA 2CAQA 2F3MA 5DCGA 3W6GA 4YAVA 4XS1A 3DYRA 2C0EA 1NHOA 3VWVA 2VD1A 1EP8A 4ACSA 2FWEA 1WE0A 3IHQA 4KCEA 3KM6A 1J08A 2DBCA 1OE7A 1SKSB 3APQA 2ZNMA 2MBSA 3VWWA 1YEPA 5J9CA 1W4VA 2VCXA 1IYHA 5DVBA 5KN1A 4EXJA 1V58A 3UBLA 2A4VA 3FR6A 1WP0A 2B5XA 2OADA 4YQMA 3DVWA 5CREA 3Q18A 1GSFA 5B8BA 5DBQA 3HA9A 4HQSA 3ZRDA 5CNWA 4KCAA 1Z6MA 2JADA 2X64A 1T00A 1GSEA 1GTBA 1X5DA 4DEJA 5D9XA 3L9SA 3GTUA 3N9JA 2VCTA 2HNLA 1IYIA 2MBTA 1TKDB 1JZOA 4GQCA 1JLVA 5C04A 6GSTA 1M0UA 3TOUA 2XC2A 3HVSA 4ILFA 1AW9A 1YKAA 3SWLA 2B1LA 1TP9A 1S3DA 4EDZA 1Z5YE 1K3YA 3DRNA 5IMCA 5IOXA 3F63A 5FHIA 4PQHA 4ZILA 3FKFA 1M9AA 3DWVA 3QAGA 1EEJA 4PUFC 3G7YA 4TR3A 3ZL5A 2IMFA 2L4CA 1DE1A 4KDXA 4K6XA 4TXVA 1A2MA 5IMDA 4LMVA 1V40A 2CVBA 2J23A 1MDJA 4IP1A 3QAVA 1PL1A 3IK9A 2CT6A 3VPTA 3TB2A 3UOMA 1ZCPA 4HEA2 3EMPA 2OE1A 5H5RA 1SL1B 2OJLA 5J5NA 3HVVA 1S3AA 4IQAA 1XOAA 1H4OA 3GKNA 2PWJA 1QFNA 1PN9A 2GQLA 2GSSA 2YPMA 4J2FA 4PNGA 1QGVA 5D96A 2V41A 5ECSA 3VWXA 3LXTA 1Q4JA 4JBBA 4I2UA 1U3AA 4Q5QA 4KAEA 4X1UA 5DDLA 1XW6A 5B8AA 2JZSA 5IMFA 2HZEB 2EC4A 2C3QA 2V6KA 1HNAA 1SJZA 3FYGA 5ECMB 4K7IA 5HFGA 4XTSA 4ISDA 5AN1A 3TJBA 2X8HA 3ZIVA 3TKQA 4LLRA 1O7UA 1GP1A 2TIRA 14GSA 1XPVA 4F0CA 3GH6A 2DJ0A 1FB0A 4F9ZA 3H1NA 1OAZA 1TTZA 3F0IA 2XPDA 2FCHA 3BBYA 5JWOB 2X8CA 4X43A 2PUKC 3ZMLA 3KMOA 3U5RE 5DJLA 5INYA 3G7JA 5ECQB 3US3A 1R7HA 1V98A 1SL0B 1EP7A 3ERGA 1GRXA 1QQ2A 5LD0A 5COHA 1TDIA 4ZB8A 4I97A 2H0IA 4PXOA 1PGTA 4HS1A 1C72A 4LL1B 1SD9A 1YQ1A 2HRFA 3GL3A 1Z7RA 3APSA 4HZ2A 3VI5A 1GULA 2VO4A 4IVFA 5ABRA 5KN0A 3QOUA 4JR6A 4GCIA 5GSSA 4GQFA 4IN0A 4XS4A 5HR0A 4WF5A 5IM9A 4WR4A 2P5QA 4FO5A 2HFDA 2VLVA 3TJGA 5A4VA 4EF0A 1X9WB 3LQ7A 2PVQA 2ZUPA 1JZRA 5B6MA 5ECPB 5HR1A 1E2YA 2LNTA 3TJKA 5IMVA 5ELGA 3DXBA 1EV4A 5J3RA 1OVNA 4WR5A 4ULXA 4YAPA 3F9UA 2FHEA 3A3TA 4TN8A 1GSDA 2RUEA 3ZZXA 1RK4A 1G7EA 2FA8A 3E9JB 1ERWA 3CSHA 4N0ZA 1T8EB 4MJCA 3GUSA 3ZLPA 3LYKA 2H75A 5F05A 5GAND 2YJHA 4HUAA 2GZYA 3KZQA 5E4WA 3IV4A 4OMVA 1UN2A 4IJIA 2Z9SA 2FD3A 5ID2A 3UIWA 1U87A 2V6OA 1GLPA 1M2DA 3CTGA 1U3IA 4N11A 2CVKA 1OC3A 1TXXA 5EL8A 2DJKA 1RW1A 5G5EA 2P0GA 4D73B 3UL3A 3NOFA 5GZZB 2FY6A 2YWNA 1XCCA 5ECOB 1TU7A 2BTOT 2E7PA 4NPBA 1E6BA 3FK8A 2B7JA 5JCWA 1GTUA 4POBA 1PSQA 2EIOA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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