1OC3A

Human peroxiredoxin 5
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
SAPIKVGDAIPAVEVFEGEPGNKVNLAELFKGKKGVLFGVPGAFTPGCSKTHLPGFVEQAEALKAKGVQVVACLSVNDAFVTGEWGRAHKAEGKVRLLADPTGAFGKETDLLLDDSLVSIFGNRRLKRFSMVVQDGIVKALNVEPDGTGLTCSLAPNIISQL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of a Dimeric Oxidized Form of Human Peroxiredoxin 5
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
molecule keywords PEROXIREDOXIN 5
total genus 47
structure length 162
sequence length 162
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2003-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1oc3A00
1JZDA 1X0RA 5LD0A 4TVEA 2PERA 3FR6A 3TDGA 3GNJA 3BD2A 1G6WA 3N9JA 1GSUA 1SYXA 1XWKA 4ISDA 3P8WA 1GSDA 3E3EA 4L0WA 5A4VA 1EEJA 2J9HA 4OCFA 3A5WA 1XOAA 4PUFC 4F82A 4MZWA 1XCCA 1GL8A 2N5AA 1JZOA 4WETA 2YPMA 4MH2A 3H8QA 5CRWA 1WMJA 2CV4A 4TR4A 5LNKe 3UBLA 4CW9A 2JSYA 2G2QA 3QCPA 2MMZA 4LLRA 5J5NA 5ECMB 3F3RA 3TKPA 3KGKA 1YJ6A 4GWRA 4ULXA 2V2GA 2K8VA 4N11A 2YCDA 2B1LA 2CT6A 3EE2A 3QPMA 4IELA 1QUWA 3VWWA 3FRCA 3EU3A 2YV9A 4PXOA 3U5RE 5A4UA 2YJHA 1ERTA 5B8BA 1SD8A 3KCMA 4POMA 2H1AA 4LA1A 1Z6NA 1O73A 3D4TA 3DGQA 3I9V2 3PGTA 4CDOA 1Z7PA 3TOTA 4JZQA 4X43A 3EWLA 3KP9A 2P31A 2GGTA 5KEJA 1S3DA 1VF3A 3M3MA 3TKSE 3GTUB 2PWJA 4L5LA 5B8AA 6GSWA 5D73A 4DVCA 4ILFA 1UA5A 2V6KA 2H1DA 1KTEA 1EP8A 5HR3A 4H86A 4ECBA 1FW1A 2GSRA 2WULA 1SENA 4WF4A 5ECIB 4E8HA 4DSSA 2HYXA 3QAGA 2PN8A 4PQ1A 2GSQA 3F6DA 3GKMA 4MJCA 4Q5RA 2N5BA 1THOA 2YWNA 3LXZA 4MF6A 4EE0A 3EMXA 2H6ZA 3H1NA 1R5AA 1S3CA 1TTZA 3DEXA 2WRTA 1IYHA 4IGJA 5DCHA 2HT9A 1YQ1A 4Q5QA 5DJMA 4HEA2 1AQVA 4AF2A 2E0QA 5ECHB 4DSSB 2V32A 1V9WA 1TW9A 4PNFA 3CRTA 5DBQA 4AJ6A 2HRFA 2VIMA 4I6XA 2VOCA 2C3QA 1J08A 2GZPA 1XPVA 5B6MA 4GSTA 1WRYA 1X9MB 5HFGA 4AGSA 2YANA 2DSAA 2IN3A 3GHAA 5F05A 3DRNA 2DJ1A 1FVJA 1X5DA 2L59A 1SJIA 4ZILA 1FB6A 1SYRA 18GSA 1TK5B 4IS0A 1TRVA 2MZCA 4G9HA 4PX1A 2FCHA 5J9CA 1HQOA 2NPBA 13GSA 5G1LA 12GSA 2XPEA 2H73A 1F2EA 1PRXA 3LQ7A 2C0DA 1LU4A 1T4ZA 3UJ1A 1JZWA 5IMCA 5J3RA 2LTKA 2A2RA 2YWOA 2WS2A 3GYKA 2HZEB 3KP8A 1F6MC 3NIVA 2B5EA 5FHIA 1Q4JA 2HNLA 4BVXA 4HOJA 4MH3A 1W89A 1EV9A 4G2EA 4EVMA 3QD9A 5ECSA 2H0GA 4KDXA 4YQVA 1N8JA 4EF0A 4YQMA 1XWCA 2CZ3A 1MD4A 3TRXA 3FY7A 4IP6A 2AB6A 3IPZA 3A2XA 3G7IA 3DKSA 4JRRA 4OO4A 3ZYWA 5HFKA 1YKCA 1OKDA 5J41A 2F51A 1O7UA 4EUYA 5A5KA 5ENUA 5AIXA 3DWVA 2NDOA 2FA8A 5CRGA 3HZ4A 4FYBA 5CYYA 5IO2A 3RPNA 2QGVA 4KDUA 3EC3A 2AUVA 1OC8A 19GSA 2LEGA 2YNXA 1PL1A 5INYA 4XTSA 2VL9A 4GTUA 3ZTLA 4TOPA 2H76A 1ST9A 1E2YA 3J7Yk 3HYPA 4DSQA 1TU7A 1OKTA 2B5XA 1O85A 1XFLA 2KP2A 4OMVA 3TJBA 4O32A 3G9BA 3UAPA 1VF4A 3VURA 2H8LA 16GSA 8GSSA 2FNOA 2DJJA 4Q5FA 4J56E 5J4UA 2CVKA 3M0FA 3HZ8A 3TJJA 4XRDA 6GSXA 3D6IA 4MPGA 3WGDA 5IMFA 4TW5A 3ERWA 3O6TA 3CXGA 3EU4A 3ISOA 2LQOA 3BBYA 2MMAA 3UVHA 4GQCA 3Q19A 4RQRA 5ELAA 3VK9A 1PKWA 1NHYA 4HQZA 1G0TA 5ECRB 1J9BA 1T8EB 2WCIA 3ZMKA 2PVOC 2O87A 4WEYA 2ON7A 9GSSA 1GSFA 3GSSA 4WXTA 2IMIA 1YEPA 3KTBA 1K0BA 4GLTA 3CBUA 2FY6A 2E2GA 1M9AA 5CRHA 1AAZA 2JACA 1HNAA 1GWCA 3GH9A 3PINA 4I2UA 4QQ7A 1M2DA 4I8BA 5AISA 3K8NA 1OAZA 4BA7A 3KM6A 3TCOA 1B4QA 2G0FA 2IIYA 3Q6OA 2C1YA 4V2LA 1LBKA 1FHEA 4WBJA 2K9FA 2TIRA 1SKSB 4ZL8A 2VL3A 3F8UA 2R4VA 3LSZA 3MSZA 4GSSA 1XVWA 1R26A 3M1GA 2LUSA 2VD1A 4OCEA 4ZXGA 4IP1A 1V57A 1Z3EA 1OE8A 3ZITA 1OE7A 3LXTA 3BCKA 2VAFA 5AIVA 2YN1A 3CMIA 2A4VA 1KEBA 1XWAA 5JWRB 1PN9A 2L5LA 1ERWA 5KN2A 4OO5A 3GKXA 2L4CA 4IBPA 2AJQB 1YKAA 3GKKA 3IA1A 2VL2C 3APQA 3ME8A 2LV3A 4XCSA 5HR1A 1TP9A 2FHEA 4MDCA 3F6FA 4KSOA 3KEBA 2H66A 1A2JA 1ZZYA 1TXXA 2E7PA 5DVBA 4O7HA 1USBA 1YY7A 2VCZA 1G7OA 4MJBA 1URMA 4POKA 1SK0A 1CQHA 1U88A 2VCVA 3L9VA 4ECCA 1SL1B 4LMWA 2K8SA 1OC9A 4RQXA 1F3BA 1MD3A 5IMAA 3GKNA 1ZGNA 5GAND 2ALBA 3M9KA 2IPAA 1G7EA 2DJ2A 4D73A 1LJRA 3IAS2 4IN0A 3TB2A 4F9ZA 2JZSA 3TJKA 1H75A 5ID2B 4ECIA 3C73A 3QAVA 2ZNMA 2F8AA 4ZL7A 1X5CA 5CO3A 1TKDB 2IMEA 5JCUA 3D4MA 5G31A 1K3OA 3H79A 2HRNA 1X9WB 1KNGA 3QFBC 4POBA 2JU5A 1MDIA 4D73B 3HHVA 1XW9A 1A24A 5L71A 2GQKA 3UARA 2F8FA 3N5OA 4MABA 5LCZA 1Z5YE 2XPDA 4L0UA 1K0MA 2I1UA 2GS3A 3WGEA 3HJMA 2C4JA 4IW9A 1MDKA 5D96A 2H74A 11GSA 3G7YA 5IQYA 4PQHA 2OJLA 2GQLA 3U6VA 3CSJA 4X0XA 1Z6MA 3ERFA 3E0UA 1T1VA 3US3A 5AGYA 1TI3A 1XZOA 2H1GA 5JWOB 3CTGA 4V2MA 1NHOA 5IMZA 4QL9A 4IVFA 4MPFA 1U3AA 4XS4A 5DCGA 5JCGA 4MZCA 2CVBA 4IJ3A 4HZ4A 1A8YA 1K0DA 5J9BA 1RW1A 4K0NA 1M7TA 3GN3A 1AIUA 2QC7A 3DMLA 2F3MA 3ZRDA 3SBCA 4K9ZA 3ZFBA 3IBHA 3HVXA 2FLSA 4XS4B 1MDJA 5DQSA 2FWGA 3GTUA 1ZL9A 4GCIA 2KUCA 2WB9A 5FWGA 1B8XA 3M8NA 2NTOA 3IRAA 3DIEA 2GZZA 3A3TA 1DBYA 2IWTA 5CREA 4K2DA 1EV4A 1XIYA 2FGXA 1DE2A 3GRXA 1TJDA 4PURA 3I43A 2DIYA 3TGZA 5HQPA 1XXUA 2KHPA 3H93A 1WPIA 2DBCA 17GSA 3L78A 3C8EA 1F3AA 1K0NA 4MA9A 5G30A 4BWSA 3KJYA 4RI6A 5G5EA 4IJIA 4HJMA 1GNEA 3V1WA 5CRDA 1GTIA 1SKWB 1MTCA 5CP1A 4NMUA 3MDKA 4MP4A 5CAXA 4IQ1A 3EVIA 1VGLA 4JBBA 2H30A 4FYCA 3FZ5A 3QR6A 1DUGA 3L0HA 4BVYA 4EDZA 4OFMA 4KSMA 3GH6A 1GRXA 2H71A 1SJ6A 4N0ZA 2BJXA 1JHBA 5JCWA 3FZAA 4MK3A 3KMOA 2YZUA 2RIIA 2HZEA 5F8BA 3ZMLA 7GSSA 3L9UA 3IXRA 3F4TA 5IM9A 4DSRA 4Z7XA 3RPPA 4N30A 3RHBA 2HSYA 3HKRA 3SWLA 1M0UA 3LFLA 20GSA 2B1KA 2DJKA 2RUEA 4KE3A 3Q18A 2R2JA 3I69A 1BQ7A 3MNGA 2KP1A 2O7KA 3GL5A 3LYPA 4YAPA 3I6AA 2OE0A 4V2NA 3AY8A 3GX0A 3W6GA 3BJ5A 1GSQA 4F0BA 5D9VA 5B6NA 4O5RA 4ZB8A 2L6DA 1XW5A 2C8UA 3EURA 4HU9A 2R37A 2CQ9A 3ZFLA 1PSQA 3FR9A 4JR6A 2HI7A 2M72A 1XWGA 3UEMA 2XBQA 2B5YA 3HJOA 4GXZA 3WGXA 5ECKB 3A2WA 2GTUA 2OACA 2R6KA 1GTAA 5GAPD 5IMDA 1PKZA 4ZL9A 3LWAA 3TKSC 3BOAA 5G1KA 3KIJA 4K7OA 2VLUA 1NM3A 1Y6EA 3R2QA 3VWUA 4ECJA 4ZB9A 2CA8A 4HU7A 2OADA 2HFDA 2H01A 2GSSA 2I9HA 3DD3A 2NBSA 5ELGA 2GSTA 1GLPA 2MBSA 1WIKA 1SK1A 1JLWA 2OBIA 4G19A 3GSTA 2H19A 2JZTA 2FD3A 4E8EA 4WBRD 4ML1A 4MZBA 4JR4A 2V1MA 2EIRA 3WT2A 4TXOA 3TUEA 1GULA 4NV5A 1FO5A 3ZVJA 4KCAA 4L8EA 4ZBAA 1HNBA 3D5JA 3L9SA 2KLXA 4KX4A 3P90A 2HXKA 2XC2A 4TXOB 4JEDA 2YZHA 5CNWA 4FIWA 4HJ2A 1T00A 1OVNA 4J2FA 3FHKA 2GDRA 1V98A 1ZOFA 2XBIA 5AN1A 3TOUA 1YF0A 3HD5A 4I2TA 3KH9A 4LL1B 2LRCA 5ECLB 1OYJA 1TK0B 3ZLPA 1AUCA 4EKZA 1M99A 1TU8A 3VI7A 2IMFA 1EOGA 5ECOB 1C72A 1K0CA 3FW2A 4AJ8A 3ZIJA 2F9SA 5ECPB 3FKFA 4OD7A 2PBJA 1VF1A 3H4KA 1ILOA 3HXSA 4PUAA 2OE3A 3CTFA 5E4WA 4POLA 3APOA 3GUSA 2TRXA 1RK4A 1UN2A 1HYUA 1PL2A 2FWHA 4RUVA 5IOXA 4MF5A 3DVXA 2J23A 3ZIVA 2M80A 2X99A 4HZ2A 2JL4A 3PR8A 3O3TA 2O89A 3P2AA 1SKRB 2B7KA 1R7HA 2MYGA 3IC4A 1A0FA 3EYTA 2IMKA 4N0VA 4TR0A 1NSWA 2DJ3A 2JADA 4NXIA 3HDCA 5EVOA 1XOBA 3IK9A 3RHCA 1M2AA 2B7JA 1WP0A 1GUHA 1A0RP 2JZRA 2P5QA 1DSBA 1E6BA 5IMVA 2LSTA 2RUFA 1QXHA 1O8XA 2OA7A 1I5GA 5D9XA 1YZXA 5ID2A 2VLTA 1XVQA 2WDUA 3NOFA 1WJKA 3NZNA 4XIHA 4EC0A 2O85A 3F3QA 2C3TA 3UOMA 2GVPA 1TRSA 2IL3A 4K6XA 1EZKA 4V1Ap 1BG5A 5D93A 4K8MA 4K0GA 3IK7A 2LS5A 3ZREA 4WKWA 2C0GA 1AQWA 4MJAA 2LRTA 3M9JA 5H5QA 4I97A 2AV4A 5KN0A 5JWQB 2GZYA 3HY2A 1S3AA 4QL7A 1K0AA 1SK2A 1VRSD 3D22A 3HJPA 2AAWA 4JU5A 1VF2A 3RBTA 1O6JA 2YP6A 1ZYEA 4KDYA 3UMAA 3CSIA 1IYIA 1HNCA 4L5OA 4EO3A 5DAKA 1GSEA 1O8WA 1PGTA 2DC5A 3UL3A 5DALB 2BMXA 4N10A 4BPYA 1ZMAA 3CYNA 3P7XA 4EDYA 1W4VA 2XHFA 1QQ2A 2X8GA 2HLSA 3CRUA 1WE0A 2FWEA 5A4WA 2H6XA 5DAKB 2OKAA 5H5SA 2MMOA 3FZ4A 5D9WA 2IFQA 6GSSA 5DDLA 2WGRA 1FG4A 1TDIA 5ECNB 3UVTA 2JSZA 10GSA 2VD0A 1B4PA 3FYGA 1U87A 2H70A 3CSHA 3QAWA 5GSSA 1OC3A 1AQXA 2H0IA 1EWXA 1I9DA 3IE3A 2YOIA 1R5PA 3ZL5A 1PA3A 5HFIA 2V6OA 3EINA 3FK8A 2IFQB 2R3XA 4AJ7A 3S9FA 3WYWA 2LNTA 2VL2A 1EEMA 3LEFA 3KMNA 3GL3A 2I4AA 1A2LA 1ERVA 1JLVA 1AW9A 3QDNA 1GSSA 1ERUA 2CAIA 2VO4A 3QOUA 4NWYA 3TJFA 3TKRA 3HVSA 3L4NA 4TXVA 1BEDA 4KA0A 2MBTA 1V40A 2REMA 1FAAA 2PMTA 2VCQA 5E59A 2HE3A 1SL2B 6GSYA 5IPGA 2ZUPA 3GMFA 1EP7A 4ZBBA 2OE1A 5FT3A 4GSNA 4NPBA 4NV2A 5COHA 3F0IA 2PVQA 1T7PB 5D8IA 1JFUA 1ABAA 2LKUA 2L6CA 1Y25A 4IKHA 5IPHA 3KD0A 2ZCTA 2GT6A 4PGTA 4HI7A 3RDWA 1BX9A 22GSA 2DIZA 2FWFA 5GSTA 2V41A 3IR4A 3APSA 4K7IA 2C0EA 4XRAA 2EC4A 4XHMA 4F03A 1Q98A 1YEXA 4Q5NA 4XS1A 2RM6A 4HDEA 4ZB6A 2H75A 5EL8A 5C00A 2MMNA 2EIQA 1PX6A 3KH7A 1A2MA 2DLXA 3GA4A 3ED3A 4TKYA 3FR3A 1F37A 2WZ9A 2LJKA 3RAZA 2C3NA 2I3YA 4TR3A 4XS6A 2WJUA 4IHUA 2HSHA 2O8VB 4KCEA 4O92A 4OFNA 3C71A 1M2BA 3WT1A 4IQAA 5HR2A 1GNWA 2L5OA 2BTOT 2B3SA 2AHEA 1V58A 4K1FA 1NW2A 3HCZA 4TR1A 1T3BA 5KN3A 2PPTA 5DQYA 5IOWA 4HUAA 4JE1A 2CX3A 2FA4A 3UBKA 3IV4A 2H1BA 1MEKA 2LRNA 3GFKA 1M9BA 2GLRA 1TRUA 1K0OA 1EGOA 3IOSA 4TR1B 1GUMA 4EL1A 1GLQA 1T4YA 3ERGA 1U6TA 5G5FA 1BYEA 6GSTA 3PH9A 3EMPA 1GTBA 4I5QA 3VPTA 3F4SA 1B9XC 3O76A 3C1RA 5EPFA 1FVKA 3TRPA 4WR4A 3TKQA 4GRFA 5F0GA 2CZ2A 2YWMA 4MJEA 1YF1A 3TRQA 3VPQA 1J0FA 2X8CA 2Z9SA 1RQMA 1N2AA 3VWVA 2IMDA 5B7CA 3F9UA 4X1UA 2GT5A 3KZQA 2N5FA 2LJRA 2YV7A 3F4RA 1AXDA 4NHZA 1K3YA 4FYUA 1ML6A 3W8SA 4V1Ag 1R4WA 4WF5A 4J57E 4GF0A 3IHQA 1THXA 4KNDA 2CAQA 5GZZB 2YWIA 2VLVA 3VLNA 3IAM2 4KGIA 4WR5A 4HQSA 3QMXA 2A2SA 2GQMA 4KW6A 3VI5A 1Z9HA 4GQFA 4HS1A 1GH2A 4TRXA 2E2MA 1AC1A 1X5EA 1U3IA 1PQNA 3C7MA 4PQIA 1FB0A 14GSA 3E9JB 3UIWA 3JCML 1GTUA 2FUG2 3F63A 4KUNA 1TK8B 2RLIA 3LYKA 3DXBA 2DJ0A 1A23A 1SL0B 3Q74A 5G2ZA 3TJGA 2LQQA 1ON4A 4FH8A 2CX4A 1BAYA 1WOUA 3D0ZA 2CVDA 1HD2A 1XWBA 3KXOA 3C1SA 1TI1A 4LMVA 4ML6A 1WWJA 3FEUA 1XW6A 1JZRA 2OBKA 4P3YB 4MMMA 3DVWA 4EXJA 4OFTA 3LJRA 3J7Yb 4MCUA 1YDKA 1ZCPA 1CQGA 1KBNA 4F2IA 4CHSA 6GSVA 2B6MA 6GSUA 2IJYA 4DEJA 4ID0A 5F07A 3MAKA 1K3LA 4MLYA 2H6YA 5KN1A 2QSIA 4KH7A 3GIXA 3QFAC 2C80A 5IIZA 1O81A 1QGVA 4BL7A 3WD6A 2L57A 4PNGA 4F0CA 2VCXA 2KOKA 2LJAA 5ABRA 2I81A 4OWYA 2D2ZA 1GSYA 3HVVA 5D9TA 3TKSA 4NHWA 2H0HA 2QKEA 2TRCP 3DYRA 4KAEA 2K6VA 4ACSA 2AYTA 3ME7A 3MWHA 1A8LA 2ON5A 2PU9C 1BJXA 1SD9A 4RI7A 3LORA 5DJLA 3LGCA 2DMLA 1H4OA 4YH2A 3FZ9A 2PUKC 2X8HA 2VCTA 5C04A 3VFIA 1QFNA 5F06A 1SJZA 4BWQA 1ACVA 1QK8A 3D21A 1V2AA 1FOVA 1UVZA 2H72A 1PD21 4G10A 4FO5A 2X64A 3ZVJD 4MF7A 3A2VA 5HR0A 2EIOA 2HZFA 4K7NA 3W8JA 2M46A 4KB3A 4ZBDA 1TRWA 2C0FA 1X9SB 3GV1A 2WFCA 5H5RA 2P5RA 4NAXA 2RM5A 3VWXA 1B48A 1B9YC 2LNSA 1F9MA 2K18A 1GUKA 3BCIA 5EY6A 4ZIJA 2R5GA 1XBSA 2PGTA 1PMTA 2NVLA 4YAVA 1UC7A 2DMMA 2VM1A 2L4QA 3GX8A 2VCWA 1ZYQB 1G6YA 3GURA 5DALA 2VUPA 4YQUA 4TN8A 4LL4B 1EOHA 1SU9A 1PX7A 2ES7A 5ECQB 1EGRA 3ZZXA 3OR5A 2YJ7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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