1OC3A

Human peroxiredoxin 5
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
SAPIKVGDAIPAVEVFEGEPGNKVNLAELFKGKKGVLFGVPGAFTPGCSKTHLPGFVEQAEALKAKGVQVVACLSVNDAFVTGEWGRAHKAEGKVRLLADPTGAFGKETDLLLDDSLVSIFGNRRLKRFSMVVQDGIVKALNVEPDGTGLTCSLAPNIISQL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of a Dimeric Oxidized Form of Human Peroxiredoxin 5
pubmed doi rcsb
molecule keywords PEROXIREDOXIN 5
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 47
structure length 162
sequence length 162
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2003-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1oc3A00
4OO4A 2CVKA 5ECNB 3JCML 2I81A 3C1RA 1SJZA 4EL1A 3J7Yk 3GIXA 3HHVA 4NWYA 1K0CA 5AIVA 3KCMA 2LTKA 4OFTA 5C04A 5HR2A 5B8AA 2C80A 2GSTA 3MWHA 7GSSA 2OJLA 3UL3A 1YKAA 2FY6A 3KD0A 2HYXA 2GZYA 2YOIA 3FR6A 4HS1A 2GLRA 2DJ1A 4G9HA 3LJRA 3DKSA 2VCTA 4NV5A 2LJAA 4GSSA 4PX1A 4BWSA 3A3TA 1O7UA 5G2ZA 3VLNA 2J9HA 3IA1A 3GHAA 6GSXA 1USBA 4KNDA 3ISOA 2CVBA 2O8VB 1PRXA 1FAAA 1YF1A 2DJKA 4TW5A 4PNGA 1BAYA 1SENA 1YEXA 3ERFA 5G5EA 4EDZA 2V6OA 4ECBA 2GT6A 1MDIA 2VL9A 3NZNA 3GRXA 5IMAA 5D9WA 1M7TA 3DEXA 5AN1A 2HXKA 1JLVA 3GYKA 3ZVJD 4GSNA 3DVWA 2MBTA 1HD2A 1EP7A 2DMMA 4KH7A 1XVQA 2NVLA 1TK8B 1HNAA 3HJMA 4TR3A 4RI6A 2MBSA 2HSYA 2O87A 1HNBA 3QDNA 2WS2A 4ZBBA 3VWVA 5ECKB 3NIVA 4NMUA 2PERA 3ZFLA 3TOTA 1QXHA 2PN8A 3UVTA 1KTEA 2ZCTA 3BCIA 2LRNA 4KDYA 4X0XA 1SJIA 4N10A 5DJMA 4K0GA 3K8NA 1KNGA 3GA4A 1LBKA 1XWCA 3QR6A 4O7HA 4NHWA 1GNWA 3KMNA 3F3QA 1AAZA 1NHOA 3SBCA 3LGCA 2WCIA 2X8GA 3APSA 1YY7A 4NV2A 1Z5YE 4I8BA 2WDUA 1RW1A 2FWEA 1TDIA 2OACA 3GNJA 4OFMA 3G7IA 5C00A 3UBLA 3IXRA 3ZITA 1AXDA 2HZEB 3CRUA 5B6NA 8GSSA 2I3YA 3FZ5A 3Q18A 3IOSA 1JHBA 4MA9A 1O8XA 3C71A 2REMA 3TRXA 4IP6A 2GGTA 3FZ9A 2VCQA 4L0UA 2PMTA 5DQYA 4WXTA 2VM2A 2YV9A 1A23A 5ID2A 2G0FA 1ZL9A 4POMA 2F8FA 3KP8A 4NXIA 4ZBAA 1V58A 3L0HA 2K9FA 4IHUA 1ZZYA 1PQNA 4P3YB 4EO3A 1Y25A 1XWGA 4HQSA 3KGKA 1MDKA 3A2XA 3KTBA 4MJBA 2A2RA 2H70A 1GLQA 5GAPD 3HXSA 1BEDA 2LQQA 4Q5FA 5AISA 1A2MA 3HVXA 3SWLA 5EVOA 5JWRB 2CT6A 1PKWA 2YWNA 3F63A 2B7JA 3IAS2 4KB3A 3QAGA 3HZ4A 4CDOA 5D96A 5D73A 2CQ9A 4F0BA 2TRXA 1X9WB 3ZVJA 2P5RA 3ZIVA 5HR0A 1GUHA 3VPQA 2B3SA 1JZDA 3LXZA 5E4WA 4YQVA 1GRXA 4F2IA 4Q5RA 4F03A 2ALBA 1H75A 2RLIA 1XIYA 1CQGA 4HQZA 3D0ZA 6GSYA 5G1KA 2OE0A 1GSEA 2JSZA 2FHEA 4DEJA 3ME8A 4V1Ap 3O3TA 4GTUA 1TP9A 2H1GA 3ZMLA 4D73A 1SL2B 3S9FA 5CRGA 2WZ9A 2EIQA 2ON5A 2C3TA 3APOA 1OE7A 5E59A 2PBJA 4WKWA 1A0FA 1TRWA 3CYNA 5IPGA 4EE0A 1Z9HA 4YH2A 1A8LA 2F3MA 3TKSA 2H73A 3MAKA 2HE3A 2YP6A 3ZTLA 3EYTA 5ECPB 3GTUB 4IKHA 2GDRA 4LL1B 4HU9A 5CAXA 2H76A 4PUFC 3UEMA 1R26A 4TXOA 3EE2A 3GX8A 5KN2A 1XPVA 3EVIA 3O76A 3C73A 2V2GA 2H1DA 3EURA 1TJDA 4YQMA 3GKKA 1R7HA 2NDOA 3G9BA 4WF4A 1XZOA 3TUEA 4IGJA 3V1WA 1M9AA 5ELGA 1M9BA 1QMVA 2HI7A 3UOMA 2E2GA 3LEFA 4NHZA 1LU4A 1PX7A 3P90A 4KUNA 4EDYA 2OE1A 2BMXA 2V1MA 3W8JA 5F06A 3E3EA 4HZ2A 3CTGA 6GSVA 3HDCA 1WPIA 3H1NA 3US3A 5D9VA 2CX3A 1VF2A 2QKEA 2LRCA 2IWTA 2G2QA 3GV1A 1YEPA 2C3QA 1GNEA 1YJ6A 4GF0A 11GSA 1ZGNA 1CQHA 3HY2A 1JLWA 3TJJA 2K18A 1TRVA 1W4VA 1SK2A 4O92A 4V2NA 3LG6A 5CYYA 1GL8A 4HZ4A 4F9ZA 1AC1A 3L4NA 4OCEA 2AV4A 3L9VA 3M9JA 4JRRA 2LJKA 2VAFA 4GQCA 4HJ2A 3EMXA 5G5FA 2B1KA 1M2BA 3LYPA 1QGVA 4PURA 4AF2A 3IRAA 1FHEA 1X5CA 1R5AA 2H66A 2JL4A 5B7CA 3UMAA 2DIYA 2FWGA 3VWUA 4ZBDA 2NTOA 5LCZA 4K7OA 3IBHA 1OKTA 1PMTA 2LQOA 5LD0A 4AJ7A 1X9SB 3BOAA 2OADA 4V2MA 3U6VA 2VLVA 2GVPA 5EL8A 1NSWA 3RHCA 5DAKB 1YZXA 4FYUA 4K2DA 2LNSA 3O6TA 4G10A 3L78A 2BTOT 4F82A 5IMVA 3KH9A 5ECOB 3RBTA 3ZMKA 4MDCA 2DIZA 1ML6A 5DAKA 5IMZA 2R37A 4TR1A 4K8MA 2LRTA 2C4JA 2IN3A 1I5GA 3QPMA 1BG5A 3H79A 2XC2A 2WGRA 2C0FA 3ZIJA 1EEJA 17GSA 2PUKC 1BJXA 2PWJA 4RQXA 2F8AA 4KSOA 3N5OA 4GXZA 4I5QA 3GL3A 5KN0A 1YQ1A 3FKFA 2JADA 1A24A 2CAQA 1O6JA 2AHEA 3LQ7A 4K1FA 3IR4A 5IMFA 5ECMB 4YAPA 1B9YC 1FVJA 2VLTA 2OE3A 4PGTA 2H8LA 3FEUA 2N5BA 2K6VA 3RHBA 1O85A 2AYTA 4WBJA 3PR8A 4IJIA 4LMVA 2V32A 5ENUA 4WETA 5GSSA 1J08A 4MF5A 3M3MA 4IW9A 2VL2A 2KUCA 4N0VA 1TRUA 2H71A 1URMA 4GCIA 4CHSA 3HCZA 2OKAA 2L5LA 3RDWA 5DCHA 2H74A 3LXTA 1S3CA 1TTZA 3QFAC 4HOJA 2DLXA 1ZCPA 1TK5B 3IPZA 4IELA 1EOHA 4IVFA 3P2AA 3WD6A 3A2VA 5ECSA 2H0IA 1F2EA 3CTFA 3E0UA 3RPNA 2WFCA 1GTUA 1Z6NA 3CSHA 5HFKA 4K7NA 1M0UA 1T4YA 2R3XA 1K0NA 2RM6A 4H86A 5DDLA 2DMLA 1NM3A 4MLYA 2YANA 1O81A 5B6MA 1FW1A 1TI3A 1XOBA 2K8VA 4WR4A 4HDEA 1O8WA 5IMCA 2I4AA 5ECRB 1WRYA 3G7JA 4L8EA 2MMOA 4PQ1A 1G6YA 4O5RA 4BPYA 1UN2A 2IMFA 4ZB8A 5JCUA 3BJ5A 5JWOB 2PVOC 2C3NA 3UVHA 4DVCA 3TCOA 1EEMA 3F0IA 5H5RA 5CRHA 3ZRDA 4N30A 1R4WA 1XWAA 4IJ3A 3RPPA 5DBQA 3F3RA 3H4KA 2DJ0A 1ERTA 4L5LA 3UAPA 1J9BA 2HRNA 5D9XA 1WIKA 2B6MA 2H75A 3ZYWA 3LORA 1H4OA 1Y6EA 1FB6A 4QL9A 3D4TA 5ECHB 4ACSA 2LEGA 3D6IA 5JCGA 1U3IA 2HLSA 3TRQA 3TKPA 3FYGA 4MK3A 1SD9A 2OBIA 4E8HA 3TKQA 3ERGA 4N11A 4ZIJA 1WMJA 3I9V2 2VCVA 5ID2B 3C8EA 1B9XC 1PL2A 3I43A 5DVBA 1XW5A 3WGXA 2GT5A 3TGZA 3LSZA 1X5EA 2H72A 12GSA 2LSTA 5ECQB 5A4UA 5DJLA 4K6XA 5ECLB 1YDKA 4IBPA 5EY6A 2X8HA 1DE1A 2YNXA 3P8WA 5G30A 4Q5NA 1N8JA 3VPTA 1AQXA 3DVXA 2C0DA 2CVDA 2HZFA 3QFBC 3GX0A 3TJBA 4DSSA 1OAZA 1PD21 2R4VA 5FWGA 2YJHA 2C0GA 4ML6A 2CA8A 1K0AA 1PN9A 1OVNA 2V41A 4TVEA 1VGLA 3TJGA 4JZQA 2E7PA 2N5FA 2LS5A 2H01A 3L9UA 1XXUA 4MMMA 4J57E 3Q6OA 2K8SA 1ERWA 1JFUA 2CAIA 4JE1A 4O32A 2ES7A 1UA5A 3ZREA 4IS0A 4XS4B 3UJ1A 2IFQA 2WRTA 2MMNA 4KCAA 2LKUA 1U88A 4ZB6A 2P31A 5GSTA 6GSTA 2DJ3A 4WEYA 3W8SA 2RM5A 4D73B 2YJ7A 3FK8A 3UARA 5CNWA 1GSDA 1ERUA 4AJ8A 2YZUA 14GSA 3ED3A 3QAWA 4XS4A 3HVVA 2PPTA 1BQ7A 3PH9A 3F9UA 4JEDA 4K9ZA 3DGQA 2GSRA 2FA4A 3GUSA 1AQVA 2I9HA 2VCZA 4OFNA 3FR9A 2L6CA 1Z7RA 4MH3A 1NHYA 4I6XA 4ID0A 1EV9A 2XPDA 2LV3A 4TRXA 1FO5A 2R2JA 5EPFA 4TXOB 2KHPA 3TKSC 4FIWA 2TIRA 22GSA 3F6DA 2ON7A 3D21A 1I9DA 3GH9A 3EINA 3GKNA 3H93A 5L71A 2HSHA 1XWBA 1QQ2A 1PSQA 3IV4A 4GSTA 1EP8A 4PNFA 2H6ZA 3HKRA 1S3DA 4JR4A 1GSFA 4BVXA 3QMXA 1GLPA 1A2LA 4MABA 4FYCA 4AGSA 4ZILA 1NW2A 1Z6MA 4WF5A 4K7IA 4YQUA 3Q19A 2OA7A 2VIMA 18GSA 2FGXA 1T8EB 1K3YA 2C8UA 1V2AA 1K0DA 1GTIA 3VWWA 1RQMA 4MF6A 5LNKe 1F3AA 1ACVA 1WWJA 2B5XA 3CMIA 5HQPA 1MTCA 3P7XA 1U3AA 3HD5A 4ULXA 3E9JB 5IPHA 2E2MA 2MMZA 2M80A 2VM1A 2H30A 2WULA 1XFLA 3UBKA 5F8BA 2GZPA 3ZZXA 1SU9A 2AUVA 4KE3A 2L57A 3UIWA 1XW6A 4MPFA 1JZRA 3FW2A 1AUCA 3H8QA 4OMVA 1SK1A 2PGTA 4PXOA 1IYHA 3M8NA 1E2YA 5DALA 2IMKA 1A0RP 3KTLA 2YZHA 2IJYA 4HU7A 2HNLA 3CRTA 3MNGA 1X9MB 2E0QA 3KM6A 2KP1A 3W6GA 4MPGA 1OC8A 4WBRD 5GAND 1GP1A 4GRFA 1ST9A 2LJRA 3ZLPA 4MZWA 1HQOA 1TRSA 1MD4A 2AB6A 5F05A 1PX6A 4GWRA 1XBSA 2L6DA 1V57A 1GSSA 2DJJA 4FO5A 3GSTA 3J7Yb 4I2UA 4ZXGA 5ABRA 5F0GA 1O73A 4BVYA 4ZL7A 1ZYEA 3Q74A 3TKRA 3MSZA 5A4VA 3A5WA 4LA1A 4K0NA 2PVQA 2FA8A 3I69A 3TB2A 1PL1A 3CSJA 4TR1B 3TDGA 1G6WA 2D2ZA 2IPAA 2I1UA 5COHA 5D9TA 4E8EA 2FWFA 3G7YA 4IN0A 1Z7PA 2CZ2A 3WT2A 4RQRA 2RIIA 3GMFA 1GSQA 2F9SA 3D5JA 4JU5A 1SKSB 4CW9A 5IMDA 1HNCA 4MJEA 1TOFA 2HT9A 2NPBA 5CP1A 4FH8A 2YWOA 2H6XA 1GTAA 1T3BA 4PUAA 1F9MA 4GLTA 4ECCA 1ERVA 1T1VA 5FT3A 1TKDB 5JCWA 3HJOA 1GUMA 1MDJA 1G7OA 1M2AA 2H6YA 4XHMA 3TOUA 5J3RA 3KP9A 5ECIB 4PQHA 1K0MA 4PQIA 4EXJA 4MZCA 2JZSA 3OR5A 1OC9A 2FCHA 3LWAA 4XRAA 4ISDA 6GSSA 3M9KA 2GZZA 2VL2C 1C72A 3HVSA 4LL4B 1JZOA 1S3AA 1B4QA 3IC4A 5G31A 4AJ6A 4Q5QA 4MJAA 4JR6A 2HRFA 5A5KA 2R5GA 4I97A 3WT1A 2VD0A 3HZ8A 3TJFA 2VD1A 2KOKA 4TR0A 4ZL8A 3VI5A 1GH2A 4ML1A 3KEBA 2RUEA 2A2SA 2GS3A 1BYEA 4KW6A 2M46A 1F6MC 1W89A 2Z9SA 3EU3A 2VCXA 4XIHA 3QOUA 2L59A 1Z3EA 3BD2A 4IQ1A 5IO0A 1MEKA 1U87A 2VLUA 4J56E 5D8IA 2V6KA 3I6AA 4HI7A 3EWLA 3VFIA 2DBCA 2HFDA 2WB9A 1OC3A 2YWMA 5ELAA 2B5YA 1TK0B 4XCSA 2N5AA 3ZL5A 5KEJA 1B4PA 3R2QA 1ZOFA 1DBYA 2JACA 3HJPA 4G19A 5J41A 1SL1B 2X64A 2GSSA 5J5NA 1UC7A 2H1BA 3WGDA 3FZAA 4L0WA 1T7PB 4ECIA 2L4CA 4IP1A 1AIUA 3DXBA 1FB0A 3IHQA 1JZWA 5CO3A 3F4SA 5IOWA 3GFKA 3IK7A 5DCGA 2IMDA 3KJYA 5A4WA 4Z7XA 1XWKA 3FRCA 2FWHA 5G1LA 3DWVA 4WR5A 2O7KA 3IDVA 1EGRA 3M0FA 4KDUA 10GSA 3IK9A 2XBQA 3BCKA 1GUKA 1SD8A 4POBA 4N0ZA 5HFGA 1SJ6A 3NOFA 3PGTA 4KSMA 5IO2A 5J4UA 5AIXA 2DC5A 2P0GA 1K3OA 4X43A 4ILFA 2GQMA 4BL7A 3QCPA 1K0OA 2YCDA 5GZZB 4BWQA 4HJMA 1T00A 5D93A 4KCEA 4LLRA 3N9JA 1ON4A 3C1SA 1DUGA 1YF0A 1K3LA 3GH6A 1F3BA 1SL0B 4DSSB 1BX9A 2JZTA 1ABAA 3KZQA 2VO4A 5H5SA 1PKZA 1GSYA 2M72A 4F0CA 1TI1A 2ZUPA 2YPMA 1TXXA 1G7EA 2EC4A 4XRDA 3EU4A 1UVZA 2OBKA 2LUSA 2TRCP 2XHFA 1KBNA 2NBSA 5CRWA 2EIRA 2HZEA 1VRSD 1K0BA 4POLA 5B8BA 3VK9A 5CREA 1SKRB 6GSUA 4HEA2 19GSA 1ZYQB 1B48A 3QD9A 4RUVA 5JWQB 4XS6A 1G0TA 3DD3A 1OE8A 1Q98A 2CZ3A 1SKWB 3DMLA 2IFQB 1GTBA 3TRPA 3CBUA 4ZB9A 1VF3A 1ZMAA 5IIZA 3DIEA 3IAM2 4EVMA 2VOCA 2VCWA 5F07A 3GKXA 1EZKA 3MDKA 2VL3A 4DSQA 2GQKA 1J0FA 4DSRA 4OO5A 1F37A 3F4RA 2O85A 5J9CA 2FLSA 2DSAA 3D22A 1PGTA 2FUG2 3AY8A 4EC0A 2X8CA 1XCCA 4MP4A 2FNOA 3EC3A 4GQFA 3GKMA 1DE2A 1DSBA 4KX4A 1QK8A 3EMPA 4TOPA 2XBIA 2WJUA 4JBBA 2F51A 2AJQB 5IM9A 5IQYA 2VUPA 13GSA 1N2AA 4XTSA 2BJXA 1GWCA 2GQLA 5INYA 4G2EA 3F6FA 2O89A 3VI7A 2B1LA 4XS1A 5KN1A 3GURA 3TJKA 1SYRA 2P5QA 4MF7A 1THXA 1AW9A 1T4ZA 3IE3A 4TN8A 1AQWA 20GSA 1EWXA 1QUWA 2R6KA 2C1YA 1VF4A 4OCFA 4J2FA 2KP2A 4LMWA 2H1AA 5HR3A 1XOAA 2CV4A 5HR1A 3WYWA 3ERWA 3TKSE 4TKYA 3RAZA 2YWIA 2IL3A 2C0EA 2KLXA 1B8XA 4IQAA 4V1Ag 4MJCA 3DRNA 3FHKA 2A4VA 3A2WA 1EOGA 1GSUA 4ECJA 2PU9C 2JSYA 3GTUA 1KEBA 1A2JA 4QQ7A 1FOVA 1PA3A 3BBYA 2IIYA 5DALB 1YKCA 2YN1A 2QSIA 3APQA 2H0HA 2ZNMA 1V98A 2IMIA 2B5EA 4EF0A 4EUYA 6GSWA 1IYIA 2GTUA 1OKDA 4RI7A 4NAXA 4I2TA 3FY7A 3KMOA 1LJRA 3F4TA 3U5RE 1EGOA 2QC7A 1XVWA 3CXGA 1X5DA 3HYPA 5HFIA 3WGEA 2H0GA 2DJ2A 4KGIA 4NPBA 2H19A 1TU8A 3CSIA 2MMAA 2MZCA 3M1GA 2LNTA 9GSSA 5DQSA 1E6BA 3GL5A 5KN3A 3FZ4A 4OD7A 3LYKA 1A8YA 4EKZA 4KA0A 5FHIA 1R5PA 2L4QA 2QGVA 4POKA 3C7MA 4FYBA 1FG4A 3FR3A 1M99A 4MCUA 2EIOA 5H5QA 3HA9A 2YV7A 4BA7A 3L9SA 3DYRA 3VURA 1TU7A 3LFLA 3QAVA 1SK0A 5CRDA 4YAVA 4TR4A 1EV4A 16GSA 1XW9A 1WJKA 2MYGA 1FVKA 2GSQA 4QL7A 2CX4A 1WP0A 3D4MA 3F8UA 2J23A 2X99A 1GULA 3KXOA 5J9BA 1WOUA 1SYXA 3PINA 3VWXA 1HYUA 2JZRA 4ZL9A 1TW9A 4TXVA 1WE0A 3KH7A 1THOA 2RUFA 1V40A 4V2LA 1Q4JA 2AAWA 4MZBA 3GN3A 1QFNA 2FD3A 1MD3A 1U6TA 1OC9B 2JU5A 4OWYA 4X1UA 2IMEA 2L5OA 1ILOA 1VF1A 1X0RA 2XPEA 4HUAA 4KAEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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