1OC9B

Tryparedoxin ii from c.fasciculata solved by mr
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
147
structure length
147
Chain Sequence
HMSGLKKFFPYSTNVLKGAAADIALPSLAGKTVFFYFSASWCPPCRAFTPQLIDFYKAHAEKKNFEVMLISWDESAEDFKDYYAKMPWLALPFEDRKGMEFLTTGFDVKSIPTLVGVEADSGNIITTQARTMVVKDPEAKDFPWPNV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Tryparedoxins from Crithidia Fasciculata and Trypanosoma Brucei: Photoreduction of the Redox Disulfide Using Synchrotron Radiation and Evidence for a Conformational Switch Implicated in Function
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPAREDOXIN II
molecule tags Electron transport
source organism Crithidia fasciculata
total genus 41
structure length 147
sequence length 147
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-02-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF13905 Thioredoxin_8 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1oc9B00
5IPGA 4ZL7A 2X8CA 1XPVA 1X0RA 1USBA 2XBQA 1YEPA 5KN0A 1O73A 3O3TA 3UIWA 3FR3A 3LYPA 1XWCA 2YP6A 2RLIA 2K8VA 5EY6A 4YQMA 1SKSB 2ZNMA 3Q74A 2FCHA 1FW1A 1VF3A 2BMXA 1EZKA 4OCFA 5D9VA 4GSNA 3US3A 4F2IA 4OCEA 5ECQB 6GSUA 1TJDA 2DLXA 5D9TA 3FW2A 3N5OA 4NWYA 4GLTA 2CZ3A 2M72A 3KMOA 3R2QA 4OWYA 10GSA 5FWGA 3DGQA 4TVEA 1OYJA 1B9XC 1N2AA 4TOPA 1SYXA 4HOJA 4IELA 1A2MA 4ZBBA 2N5FA 1XWBA 2PVQA 2DMLA 3G7IA 3GL5A 3GX8A 2H6YA 4Q5FA 1M99A 1ERVA 1K0AA 1QXHA 1AC1A 3O76A 1F6MC 1PD21 3UARA 4YAVA 2HE3A 1EWXA 2ON5A 5LD0A 2GZPA 3HY2A 2WB9A 2JSYA 1PL2A 3LG6A 2QSIA 3LYKA 2P5QA 1DSBA 3N9JA 5IQYA 5FHIA 3TKSC 3P2AA 3ZMLA 2YN1A 3TKQA 5CP1A 2H76A 1CQGA 4N10A 6GSTA 3D4MA 2H1BA 2FY6A 4WEYA 5C04A 3P8WA 1V40A 1T8EB 2K8SA 2H6XA 2EIOA 4MZWA 3F3QA 2E7PA 3DVXA 2O87A 5IMCA 2C0GA 5JWOB 4MH2A 1C72A 2LSTA 1T00A 4RI6A 3TJKA 4IVFA 4KX4A 2YWOA 1VF2A 2BJXA 2FWHA 2LNTA 4IHUA 1K0CA 1XW6A 3J7Yb 1B4PA 3A3TA 3ERGA 1X9SB 2KOKA 4EE0A 3MAKA 2B5YA 2E0QA 2V1MA 1ON4A 3M3MA 3GSTA 4N30A 4IKHA 4XIHA 1XOAA 2MBSA 17GSA 1S3AA 2A4VA 4D73B 1EEJA 4FYBA 3HVSA 3KTLA 2OE0A 1PSQA 2H0GA 4BVXA 3F3RA 3F6FA 3TRPA 1EEMA 5ABRA 4ZL8A 5KN3A 2HFDA 3APSA 3KH9A 4QL9A 4D73A 2V2GA 2R5GA 1ZGNA 2B7JA 3ZIVA 2LEGA 2JU5A 5ECLB 2L57A 1K3YA 2MMZA 3QFAC 5LCZA 1THOA 3UEMA 3TKPA 1A24A 1SJ6A 5ID2A 5COHA 5GAND 1NHOA 4BWSA 3ZVJA 3FK8A 1HNBA 4ZXGA 9GSSA 4OFMA 2GSTA 2NDOA 1B9YC 2WRTA 4HZ2A 2VCZA 1ZCPA 4K7IA 1V58A 2GSQA 1XZOA 3L9VA 1Q4JA 2B1KA 1K0MA 4K1FA 2GQLA 3FR9A 3F4RA 4EKZA 2IFQB 1ML6A 1M9BA 1EGRA 2CZ2A 3IBHA 4ECJA 3FR6A 4L5OA 2OE1A 5D8IA 4KDXA 3QPMA 3BOAA 3WT2A 2IMEA 4JR4A 4JZQA 5CRWA 4KA0A 3P90A 5CRDA 1GH2A 2JL4A 3VPQA 2AHEA 1ZYEA 5EVOA 3FRCA 3TB2A 1W89A 4XCSA 1R26A 1XFLA 2PBJA 2GLRA 2KP2A 4NPBA 3CBUA 3I9V2 3EWLA 2Z9SA 2P31A 1BYEA 5DBQA 2IMIA 3RPPA 1H4OA 4DSQA 6GSSA 4EDYA 3WGEA 4RI7A 2H01A 2ZUPA 2EIRA 3U6VA 2C1YA 1XWGA 1TP9A 2FWGA 5ENUA 3HXSA 2MBTA 2IWTA 4KCAA 1MDIA 1WWJA 2VL9A 5G31A 3O6TA 5GSSA 1FO5A 1AIUA 1A2JA 2HZFA 1XCCA 1VRSD 3LSZA 4E8EA 4KW6A 4HDEA 3ME8A 4CDOA 1JZOA 1XIYA 3VK9A 2YANA 5ECNB 4MCUA 1K3LA 2LV3A 1XXUA 4X43A 1BQ7A 2H1AA 4KAEA 1M9AA 4ZL9A 4POKA 11GSA 5HFGA 1V2AA 3EC3A 1AQWA 5G5EA 2XC2A 2YJHA 1S3DA 4LLRA 4TXOA 2K18A 3UJ1A 2HT9A 5DQYA 1J9BA 2V41A 4LL4B 1EOGA 5F07A 2XHFA 2I3YA 5HFKA 4HQSA 4L5LA 4V1Ag 2GS3A 5ECMB 4TRXA 1JZRA 2QGVA 4I2UA 5ELGA 1X5EA 1VGLA 3D0ZA 5F05A 1URMA 1YDKA 2CX4A 2ZCTA 2QKEA 3KJYA 4K7NA 3TGZA 2OACA 4MP4A 3EMPA 1SK2A 2YWNA 2CVBA 3LFLA 1PA3A 5DJLA 1YEXA 4GQFA 1TRSA 3GKMA 3CMIA 4PNGA 2CX3A 2IPAA 3I43A 1HYUA 4PX1A 3QDNA 4PURA 1SKWB 2O8VB 4WR5A 5KEJA 1UA5A 1EV4A 1XW9A 4MF6A 1ZMAA 2DJ1A 3F9UA 2AAWA 3GKKA 3A5WA 4OFNA 4I8BA 1IYHA 4NHWA 4TR4A 1M2BA 1SD9A 1F9MA 2VOCA 2B5XA 5IMZA 1SYRA 4AGSA 4WKWA 2PERA 3CRUA 2O85A 1MDJA 4IQAA 2DJKA 4BA7A 1KBNA 2K9FA 1JLVA 4NHZA 5H5SA 1V9WA 3L0HA 4PQIA 4MMMA 3EU3A 5E59A 4TR1B 3KMNA 3EINA 1HQOA 3L4NA 2JZRA 2FD3A 3S9FA 4WBJA 4HJMA 1M2AA 3LWAA 4O7HA 4TR1A 2WFCA 2H19A 4I5QA 3IR4A 6GSXA 1PKZA 4PNFA 1TTZA 3EURA 2MZCA 3IC4A 1K0NA 3IPZA 3QAWA 5JCUA 4F9ZA 5A5KA 3GYKA 1BG5A 5ECPB 4WBRD 4HUAA 3HJOA 2MMAA 2YZHA 1A2LA 3DXBA 2V6OA 2MYGA 1N8JA 1VF1A 2YWIA 4ZB9A 5DJMA 2VLVA 3FHKA 2A2SA 2DMMA 2XPDA 4V2NA 1R4WA 5J4UA 4G2EA 3ED3A 3TRQA 2VL2C 3QOUA 3KTBA 4K6XA 2FA4A 4I2TA 2I9HA 3CTGA 1F3AA 3DVWA 2HXKA 1LJRA 1UC7A 1ST9A 2YPMA 2RM6A 3A2VA 1X9MB 1TXXA 2GTUA 3Q6OA 4LMWA 1ERWA 5D73A 4ECCA 4WR4A 3M9KA 3H93A 4WXTA 4K8MA 2GQMA 2HLSA 1UVZA 5CRGA 1HNCA 19GSA 3RHBA 2RUFA 2J9HA 3ME7A 1R5PA 3VFIA 3IK7A 4EC0A 1FHEA 2VAFA 3WD6A 3EMXA 2JZTA 2WS2A 5CREA 3C71A 4ECBA 4L8EA 5ECHB 2LJKA 2C0FA 4IN0A 1FB6A 2H74A 5IPHA 1A8LA 4POMA 1O8WA 2VLUA 3FKFA 3DRNA 1PN9A 4EDZA 1TU7A 4IJIA 4PQ1A 5ECRB 3KIJA 3LGCA 3D6IA 1JZDA 6GSWA 1GLPA 5ECIB 2JACA 5DALB 2IMDA 3FEUA 5CO3A 3SBCA 2H30A 1JHBA 3ZREA 3VLNA 3U5RE 2CQ9A 3HKRA 2BTOT 2YOIA 1X5DA 3G7YA 2J23A 3NOFA 2L4QA 1PGTA 4HEA2 1QFNA 1A0RP 4RUVA 1OE7A 5G5FA 4V2MA 1T3BA 2R4VA 2C3TA 3A2WA 4OO5A 1U3IA 2WULA 3F8UA 3ZZXA 3IRAA 5GSTA 1TK8B 1O8XA 1SK0A 1TU8A 4J57E 3C73A 3BCKA 5C00A 3QCPA 5G30A 1TKDB 1WIKA 1Y25A 1JFUA 5DCGA 3TKRA 5HR1A 4NV2A 5D96A 4JEDA 4K2DA 2VM1A 3QFBC 1V57A 3CXGA 5ECSA 4EF0A 3EE2A 1AUCA 1O7UA 2LS5A 3MNGA 3HA9A 2B7KA 1ERUA 3HJPA 2B5EA 3GNJA 5ELAA 2LJRA 3E9JB 5CAXA 2FGXA 4TR0A 5IOXA 3GKNA 1ABAA 1E2YA 2LQOA 4GSTA 1OKTA 2YV7A 3TJJA 3M8NA 2CT6A 1BX9A 1KEBA 3LXTA 2IN3A 3D22A 2HRFA 2NTOA 3KZQA 3DKSA 1FG4A 2O89A 3RPNA 1EGOA 2HNLA 1K3OA 3KD0A 1A0FA 2AV4A 2DJ0A 5GAPD 4KUNA 4RQXA 1G6YA 1YZXA 5J5NA 4IS0A 1QGVA 3ZFBA 2FNOA 2P0GA 1SENA 3CTFA 4YAPA 3ZITA 4AJ7A 3FZ4A 5G1LA 5HR0A 1M2DA 1DE2A 2GT6A 3VI7A 5JCGA 1PKWA 1SKRB 2IFQA 2YJ7A 2GSSA 4BPYA 2E2GA 3WYWA 1EP8A 4N0VA 5EPFA 2PN8A 5J41A 3H1NA 2V6KA 3GRXA 2VLTA 3A2XA 1SL2B 5H5RA 4IJ3A 1OC8A 4MLYA 4IP6A 4V2LA 4Q5NA 1GSQA 3F0IA 4MF5A 3GSSA 3PINA 1B48A 3QD9A 1YKCA 1PRXA 3IE3A 4YH2A 1Z7RA 3ISOA 4GXZA 1TW9A 5B8AA 2X8GA 3F4TA 3KGKA 3E0UA 2ON7A 5D9WA 1WP0A 2DSAA 4MABA 2RM5A 3ZIJA 3IOSA 1EOHA 3DMLA 1A23A 2OADA 3DYRA 4F03A 3GN3A 1GTBA 1K0OA 3EVIA 3LQ7A 1W4VA 3BJ5A 1I5GA 2GZYA 4Q5RA 3HZ8A 1YJ6A 4KDYA 5DAKB 3UOMA 3M9JA 5D9XA 1WOUA 1TDIA 2C0EA 1QMVA 5DVBA 5DAKA 1G0TA 1DUGA 1G7OA 2HSYA 3HHVA 2LKUA 3ZTLA 4N0ZA 3RHCA 3FZ5A 5JWRB 1TK5B 4MPFA 3SWLA 5FT3A 1X9WB 4DEJA 3ZVJD 2JZSA 6GSYA 1GLQA 4G9HA 6GSVA 3L9SA 2PVOC 4K0NA 1FOVA 1LU4A 3UBKA 1GP1A 1QK8A 1NW2A 1E6BA 2PU9C 1F37A 1Z7PA 3CRTA 2VL2A 2DBCA 3GX0A 2K6VA 1T1VA 1SL1B 2LRTA 3UBLA 1TRVA 4NMUA 4PXOA 2TIRA 3W8SA 3QAGA 2DJ2A 1AXDA 3ZL5A 1H75A 3RDWA 1TRWA 2OBIA 1NSWA 2L4CA 1GL8A 5L71A 1THXA 2LUSA 3TOTA 1DE1A 4FYCA 2OJLA 4HU9A 4LA1A 4PUFC 5B8BA 1ZOFA 2REMA 4QQ7A 2F8FA 3VWXA 1U3AA 3WGDA 3C8EA 4MDCA 12GSA 2B6MA 3CSIA 5H5QA 4FH8A 4ISDA 5IMVA 3MWHA 5J9CA 2R2JA 2WGRA 4WF4A 3IK9A 2L59A 3IA1A 4KGIA 3ZFLA 4RQRA 1SL0B 1KNGA 3GA4A 1GWCA 2OKAA 4ACSA 1UN2A 3IXRA 1SJIA 3KP9A 3D4TA 3TKSA 3UMAA 1GSEA 4JU5A 1TI3A 3MDKA 3UL3A 4F82A 2HYXA 3LJRA 5ECOB 1Z6MA 4MH3A 5IOWA 1WMJA 2M80A 4FIWA 5D93A 1MEKA 1FB0A 1GNWA 4CHSA 3PGTA 3GH6A 1PX7A 2CAQA 4QL7A 2VD1A 4ML1A 4XS1A 3UVHA 8GSSA 1MTCA 1JZWA 1EP7A 3EYTA 4Z7XA 2PWJA 4XHMA 4OO4A 2B3SA 1YF0A 2CV4A 3D5JA 4ZIJA 1AQVA 3ERFA 4O92A 3LORA 4EVMA 4MJAA 1LBKA 2GGTA 5E4WA 3FYGA 4XRDA 4N11A 18GSA 2L6CA 3KH7A 3VI5A 1GTAA 4NAXA 2C8UA 1R5AA 1QUWA 3ZMKA 2LRCA 4POLA 3TOUA 4ZB8A 1YKAA 3GL3A 2CA8A 3ZRDA 3H4KA 4ILFA 1RK4A 4AJ8A 1XWKA 2OE3A 1KTEA 2VL3A 5G2ZA 3GURA 4IGJA 4KNDA 4OFTA 5JCWA 4P3YB 5J3RA 2CAIA 2WDUA 3LXZA 2VCTA 2OA7A 4X1UA 4O5RA 4MJCA 2H75A 1NM3A 2GDRA 2LQQA 2WJUA 3APOA 4MA9A 1S3CA 1F2EA 1HD2A 4MZCA 4HI7A 2CVDA 3Q18A 2YNXA 1GUHA 3L9UA 4BL7A 4PGTA 3VWWA 1AQXA 1FVJA 4HQZA 1SK1A 3GIXA 3IV4A 3EU4A 1K0DA 2VCWA 1Q98A 5AIVA 3KXOA 4ID0A 1O81A 5J9BA 2KHPA 2FWEA 1MD3A 2XPEA 4F0BA 4HS1A 1XBSA 2YV9A 2NBSA 1SU9A 3M1GA 3V1WA 3HVXA 1G7EA 2P5RA 3VURA 2GZZA 4MPGA 4E8HA 5IMDA 3HYPA 3KP8A 4DSSB 5AN1A 3IHQA 1XVWA 5B6NA 4BVYA 3OR5A 3C7MA 1FAAA 2DC5A 2HI7A 2C0DA 1GSSA 4TR3A 4K9ZA 2EIQA 13GSA 4DSSA 2AB6A 4X0XA 2B1LA 4MZBA 2VD0A 3LEFA 5DALA 2FA8A 2LJAA 4EL1A 2M46A 1J08A 2AJQB 4WF5A 1MDKA 3Q19A 3AY8A 20GSA 5IM9A 3UAPA 3FZ9A 1FVKA 3TJFA 1ACVA 1Z6NA 2GSRA 3FZAA 2YZUA 2E2MA 2PUKC 4MJEA 2PMTA 4V1Ap 2IIYA 1IYIA 1YY7A 2V32A 3CSHA 3UVTA 4Q5QA 3L78A 4YQUA 4J2FA 5A4VA 2YWMA 4KB3A 4KSMA 1BAYA 4EXJA 4DSRA 4GWRA 2VIMA 3ZYWA 4FO5A 2YCDA 3GFKA 5EL8A 1F3BA 4KSOA 3GMFA 1O85A 1GSUA 1ZL9A 5CRHA 3CSJA 3GH9A 3C1SA 4OD7A 3ZLPA 5ECKB 3PR8A 1TRUA 4KCEA 4AJ6A 2IL3A 2N5AA 2WCIA 5F06A 14GSA 2H73A 4NV5A 1AAZA 4FYUA 4O32A 1V98A 2VCQA 1YF1A 3BBYA 4ULXA 1TK0B 1U87A 1OAZA 3GHAA 3IDVA 4IBPA 2H6ZA 5G1KA 4IQ1A 2I1UA 2TRXA 2WZ9A 4I97A 2L5LA 1J0FA 3MSZA 2QC7A 1Z9HA 1GSFA 3BD2A 1K0BA 5ID2B 3F6DA 4HJ2A 3K8NA 1OVNA 1U88A 2H0HA 3DIEA 3H8QA 4IW9A 1OC3A 3HDCA 4MJBA 2H71A 5IO2A 3KCMA 2H72A 3D21A 4HU7A 1OC9B 3ERWA 4I6XA 1HNAA 3TKSE 4TW5A 2EC4A 1BJXA 1OKDA 3VPTA 7GSSA 5B7CA 4K0GA 2KP1A 2JSZA 2G0FA 2A2RA 1AW9A 1WRYA 4ML6A 1OC9A 2HRNA 3DEXA 2GVPA 3TJGA 4KDUA 2ALBA 4HZ4A 4LL1B 1PX6A 2CVKA 3WT1A 4L0WA 3GKXA 2F3MA 1JLWA 2L6DA 2LRNA 2XBIA 5AGYA 3NIVA 2LNSA 1GUKA 1GUMA 1XVQA 2X8HA 2IMFA 5HFIA 2C3QA 2MMNA 1GSYA 5F8BA 4AF2A 1OE8A 1M7TA 4XS6A 3GUSA 3JCML 1WJKA 1R7HA 4GF0A 1M0UA 4K7OA 5A4UA 3TUEA 1WE0A 3IAS2 2GT5A 2X99A 2R3XA 4GTUA 4LMVA 3QR6A 5A4WA 2VCVA 4EO3A 1Y6EA 3BCIA 1TOFA 1GTIA 4GQCA 1NHYA 1T7PB 2H0IA 2IJYA 4OMVA 5IMFA 1BEDA 4TXVA 3J7Yk 4G19A 1MD4A 2HZEB 4WETA 3TCOA 3P7XA 1YQ1A 1GRXA 2FLSA 2AUVA 3NZNA 2D2ZA 2H8LA 2F51A 2H66A 5B6MA 22GSA 2LTKA 3QMXA 1U6TA 2VM2A 4GSSA 2DJ3A 5DCHA 3HCZA 2HZEA 4EUYA 2C80A 4MF7A 5F0GA 2RUEA 4ZILA 4TXOB 1T4ZA 1ZZYA 3GV1A 4ZB6A 5JWQB 2MMOA 5IIZA 2O7KA 1Z3EA 3G9BA 2DJJA 4ECIA 5CNWA 3KM6A 2NVLA 5IO0A 5DDLA 1Z5YE 2FWFA 1PMTA 3IAM2 3CYNA 5DQSA 4J56E 2C3NA 4ZBAA 3VWVA 2TRCP 2HSHA 4XRAA 3TDGA 3E3EA 2R6KA 3KEBA 1A8YA 5KN2A 5AISA 3W8JA 4NXIA 3WGXA 3VWUA 4KH7A 2DIZA 3H79A 2VUPA 4JRRA 2IMKA 1VF4A 4JBBA 2N5BA 3RBTA 2KLXA 3M0FA 1DBYA 4JR6A 3QAVA 1X5CA 1XOBA 2F9SA 1XW5A 16GSA 1GSDA 3GTUB 4IP1A 4G10A 3HD5A 2F8AA 4PUAA 4MK3A 3TRXA 1SJZA 1QQ2A 1SD8A 2JADA 4XS4B 1G6WA 1B8XA 2H70A 3GTUA 3HZ4A 2X64A 5IMAA 2H1DA 2PPTA 2RIIA 5LNKe 5INYA 3DD3A 3FY7A 3C1RA 3F63A 2FHEA 4XS4A 1RQMA 2NPBA 5KN1A 2ES7A 4CW9A 2H1GA 4TN8A 1B4QA 1ERTA 4GCIA 4L0UA 2OBKA 4GRFA 1GULA 5GZZB 4BWQA 2KUCA 5CYYA 2PGTA 5AIXA 1CQHA 4XTSA 4JE1A 1I9DA 4TKYA 2L5OA 1PL1A 1XWAA 3RAZA 3W6GA 2R37A 4YQVA 4PQHA 5HR3A 2GQKA 1WPIA 1ILOA 2I4AA 1O6JA 3TJBA 1TI1A 3APQA 1GTUA 4DVCA 4KE3A 2I81A 2VCXA 3G7JA 1GNEA 3I69A 2C4JA 2G2QA 1EV9A 3F4SA 3I6AA 1PQNA 4F0CA 2FUG2 3DWVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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