1QFNA

Glutaredoxin-1-ribonucleotide reductase b1 mixed disulfide bond
Total Genus 24
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
24
sequence length
85
structure length
85
Chain Sequence
MQTVIFGRSGCPYSVRAKDLAEKLSNERDDFQYQYVDIRAEGITKEDLQQKAGKPVETVPQIFVDQQHIGGYTDFAAWVKENLDA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Binding specificity and mechanistic insight into glutaredoxin-catalyzed protein disulfide reduction.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (GLUTAREDOXIN 1)
molecule tags Electron transport/oxidoreductase
source organism Escherichia coli
total genus 24
structure length 85
sequence length 85
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-04-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1qfnA00
5LCZA 5F06A 2IMDA 1BQ7A 2B5XA 3CSJA 1QK8A 4O92A 1M9AA 4F0CA 1OAZA 1QMVA 1R4WA 2FUG2 1M7TA 1BYEA 2H19A 4EXJA 2A2RA 3HZ8A 5G1LA 2GZPA 2AAWA 3CYNA 2LKUA 2YP6A 2H0GA 1K0BA 1GH2A 3FKFA 3LYKA 4PQ1A 1M2BA 4KCEA 2ES7A 4NV5A 2VLVA 4KH7A 2CQ9A 4NMUA 1CQHA 2TRXA 2DC5A 1JHBA 4OD7A 1B48A 10GSA 4MJCA 2LNSA 5DAKB 1OYJA 2LNTA 3CTFA 1XWBA 4AGSA 2HNLA 4BVYA 4KUNA 4XTSA 2F8FA 5CO3A 4H86A 4TXOB 5HFKA 2GT6A 3L9VA 2BMXA 5DQSA 2OBKA 1B9YC 5ECHB 3WGEA 12GSA 4K6XA 2H1DA 4ECIA 3JCML 3UL3A 4F82A 1OC8A 4GWRA 2TIRA 3GA4A 4KB3A 5ECIB 4ILFA 4KDYA 3FZ9A 2DIYA 3F8UA 3ZMLA 3A2VA 4DEJA 2EC4A 1SD8A 4IQAA 5ECSA 4LLRA 3GRXA 3GURA 1DE2A 2C1YA 1TK8B 3ZL5A 3GUSA 3BCIA 2WS2A 3DKSA 1SJIA 3KH9A 2R5GA 1O8XA 3I9V2 5B8BA 1Y6EA 3HVSA 3VFIA 3ZFLA 3KMOA 3IXRA 1V2AA 4WF4A 1M99A 1UA5A 2PWJA 1W4VA 1SL0B 2P0GA 2H1AA 2E2GA 2HLSA 3KH7A 4DSRA 3HA9A 3H8QA 1O73A 1URMA 4NV2A 11GSA 3QAWA 1EEMA 4O5RA 3F3RA 1PQNA 2C3QA 3GH9A 4PQHA 1PA3A 2JZTA 3DEXA 3KGKA 1ZL9A 4FYCA 2GQLA 4EL1A 2HXKA 2FWEA 2WZ9A 3TKPA 3PGTA 3KP9A 1XW6A 4G19A 5F0GA 1H75A 1F9MA 1EEJA 2CX3A 1DBYA 1HQOA 1Z6NA 2WB9A 1N2AA 2C3NA 1R26A 2CA8A 2BTOT 2GDRA 2LJRA 4MJAA 4L5OA 5CREA 4TVEA 2WJUA 2M46A 1J0FA 1ERUA 3O3TA 3QFBC 3LG6A 5IMVA 3KTBA 4MPFA 3GSSA 2HRNA 6GSYA 4TR1A 1RW1A 3FZ4A 5CRGA 4D73A 1A0FA 2VD0A 4EF0A 4EVMA 2FCHA 1Y25A 2H70A 4IW9A 1TU8A 1EP7A 3IV4A 2M72A 4IN0A 3NIVA 4KSMA 4BL7A 1X9WB 1OE8A 2MBTA 2KP1A 2MMAA 2FHEA 4J56E 3U6VA 1FAAA 2B5EA 1TJDA 1DE1A 3W8SA 1SKSB 1GTIA 2C3TA 2ON7A 1GNEA 5KN1A 1T00A 2VD1A 1ERWA 2YZUA 1YKCA 2IMFA 1YJ6A 4ZBDA 4YAPA 1G0TA 3J7Yk 3APOA 3UVHA 3F9UA 1M9BA 1JZRA 3TKRA 5LNKe 4FIWA 5G30A 1GUMA 3UBKA 3CMIA 3GL5A 3KMNA 5AGYA 3G9BA 2I3YA 3ISOA 3ZMKA 3S9FA 4N30A 4BA7A 1ACVA 1V57A 2K8VA 2IMIA 4RI6A 2DMMA 4ECJA 5HFIA 4MDCA 4KW6A 3ZLPA 1XWKA 2GTUA 5DAKA 2KOKA 2ON5A 2RUFA 5B8AA 5DQYA 5A4WA 3IRAA 1JZWA 2VOCA 1RQMA 1GLPA 1ZYQB 2RIIA 3MSZA 4K8MA 3IHQA 1M0UA 3GX8A 2H6YA 3ZITA 3M9JA 4N0VA 3L0HA 1BG5A 3V1WA 2MMZA 1A23A 3GMFA 4AJ8A 1SJ6A 5DALA 1PN9A 2B6MA 3M1GA 3TOTA 2ZCTA 5G5EA 4GRFA 2IIYA 5AISA 5ENUA 2PUKC 3CRUA 4DSQA 3A2WA 2WCIA 5D96A 4XRDA 2LS5A 5D73A 1JZOA 1F37A 3HJMA 4OFMA 1EV4A 2I1UA 4ML1A 3NOFA 3HJPA 3LJRA 2X99A 1TTZA 2H72A 2C0FA 5H5RA 4K7OA 2OACA 2VL2C 5FT3A 1OKDA 1GSYA 4KSOA 2B5YA 5JCGA 3VPTA 4EO3A 4HJMA 3LEFA 4IGJA 1XVQA 3H93A 4JEDA 4GTUA 3I69A 5JWRB 1EGRA 2PMTA 5IMCA 1VF1A 2PERA 3KM6A 3IA1A 2EIOA 5HR3A 2N5AA 4MF7A 5HR2A 2H1GA 4JRRA 1O7UA 2IFQA 2YJ7A 2MZCA 2C0GA 1EP8A 2XHFA 2WRTA 3L9SA 2K9FA 3KP8A 3QDNA 1SU9A 2LJAA 1K0OA 3FEUA 1XW5A 3FYGA 1U3AA 1LBKA 2CT6A 5KN3A 3VWWA 3Q19A 3VI5A 3W6GA 3F63A 1UVZA 3D22A 1GNWA 1JZDA 1ZYEA 1U3IA 2KUCA 4BWSA 1LU4A 1Z6MA 4NHWA 2H6XA 3EWLA 1GTUA 1MDJA 4Q5QA 2YWNA 1X9SB 3DXBA 3EINA 4IQ1A 1TP9A 2P31A 4G9HA 1V9WA 5DVBA 2YANA 4XS1A 4GSNA 5B7CA 1T4ZA 1FOVA 2HSYA 3ME8A 2XBIA 1QUWA 4TRXA 4K9ZA 1VF3A 1MDKA 4HEA2 2YOIA 3GFKA 1O8WA 5KEJA 3HD5A 1MDIA 2L4QA 3G7JA 2CZ3A 4D73B 3FK8A 2QGVA 1F6MC 1XCCA 1XXUA 2B7KA 1BX9A 1EOGA 1K3OA 1X5DA 4WEYA 4FH8A 3GKNA 1HD2A 5ELAA 2IN3A 1TK0B 1HNBA 1I5GA 5D93A 1B9XC 2L59A 3N9JA 4WF5A 1ERTA 3HVXA 4K2DA 3PINA 1T8EB 3GV1A 2F51A 3EYTA 3PR8A 3OR5A 1BAYA 2NPBA 2L57A 1TRWA 1J08A 4JR4A 5AIVA 3LFLA 5IPGA 3TOUA 16GSA 1K0NA 2VO4A 3C1RA 1MD3A 4QL7A 1WOUA 2MYGA 4YQMA 4IP1A 2JZSA 2NDOA 4X43A 3KJYA 5AN1A 3TKSE 2DSAA 2JSYA 4PX1A 1SK2A 2FY6A 2YCDA 4XIHA 3AY8A 3UEMA 3KCMA 2E2MA 2V6KA 3K8NA 3APQA 2FD3A 1YZXA 4PQIA 2PU9C 5DALB 2R4VA 1TRVA 1PMTA 1TOFA 2YV9A 2GSSA 3J7Yb 4YAVA 2REMA 4OO4A 4N11A 2VL3A 5DBQA 4K0NA 2N5BA 4PUAA 17GSA 2L6CA 4ZILA 4EE0A 4RQRA 2P5RA 3ZVJA 4XHMA 2A4VA 3HVVA 1NHOA 2VM1A 4MH3A 4TR3A 3TGZA 1T4YA 4MP4A 2K6VA 3FR9A 4JU5A 3KIJA 3M9KA 1S3DA 3HKRA 3EURA 5J9CA 5GZZB 2M80A 1TI3A 4I2UA 1FG4A 1EWXA 2GZYA 2CAIA 3O6TA 3EE2A 1F2EA 3D0ZA 4K1FA 1C72A 4WETA 4HDEA 3TKSA 3HXSA 3TKQA 3QR6A 3VWUA 6GSVA 1TRUA 3KTLA 1QFNA 4MZWA 1E6BA 2R37A 2FWHA 3APSA 2H6ZA 1SKRB 1A24A 2RUEA 2AUVA 4MLYA 2L6DA 2IFQB 1YF0A 1GL8A 3GNJA 1GSUA 4MPGA 1RK4A 3US3A 4ZB9A 5D9XA 4GSTA 2YZHA 5FWGA 2B7JA 5AIXA 3CTGA 2OBIA 5IOXA 2YWIA 5HQPA 4KDUA 1ST9A 3KEBA 3LORA 4FYUA 3QD9A 1DUGA 2HZEB 14GSA 2PVOC 3L9UA 2FA4A 2QC7A 4KGIA 2DJ0A 4GXZA 4PURA 2VCTA 2IWTA 3QAVA 2HI7A 5CYYA 5J9BA 4Q5NA 1AC1A 1GSSA 1T3BA 2YNXA 2FWGA 3F4TA 1K0MA 1Z7RA 2AV4A 5HR0A 4ZBBA 1IYHA 2IMKA 3TUEA 1S3AA 5KN2A 3IOSA 3H4KA 4MF6A 1ON4A 3FR6A 2OJLA 3TJGA 2LUSA 1GTAA 4IKHA 4MZBA 1FVKA 1VGLA 4HJ2A 2X8HA 4J2FA 2PN8A 4ZIJA 4ZL8A 3FRCA 3EC3A 4XRAA 1OC9B 3GH6A 2HSHA 1G7OA 2MBSA 2RM6A 1ZZYA 2KHPA 3RPNA 2RM5A 4PNFA 2YJHA 5FHIA 2EIRA 2LRTA 3QCPA 3E3EA 2H8LA 3H79A 3BBYA 3GX0A 3GYKA 2JADA 5GAPD 1A8YA 2JSZA 1YEPA 4MF5A 1GTBA 2HT9A 3CBUA 1CQGA 2OE1A 5EY6A 1NHYA 2LSTA 3IR4A 4LL1B 4F0BA 1AQVA 3F6FA 1ZCPA 2C80A 1K0AA 3ERWA 5F07A 2R6KA 3TCOA 3DMLA 1AQWA 1I9DA 2H30A 4TOPA 1PL1A 3E9JB 4PNGA 1ZGNA 4HZ4A 1FO5A 3VLNA 3CXGA 4NXIA 1AW9A 2A2SA 5EPFA 3UVTA 4AF2A 4GSSA 3IK9A 2NVLA 2DLXA 3LSZA 6GSUA 4WBJA 4RQXA 3ZZXA 3UMAA 1GULA 2BJXA 2V6OA 1F3AA 5B6NA 2OE3A 3IAM2 4WXTA 1Z5YE 2JU5A 4N0ZA 2WFCA 4K7NA 4V2NA 5D9VA 2DJ1A 2NTOA 4IP6A 1Q98A 5IQYA 2H01A 3F4SA 3LXZA 3TRQA 2QSIA 1WRYA 1GUHA 1O81A 1XWGA 5F8BA 2D2ZA 2X64A 5ECNB 2DJKA 2MMNA 9GSSA 1YEXA 1TW9A 2R3XA 2X8CA 1SKWB 1EOHA 5ECOB 1M2DA 1ZOFA 3D4TA 4NWYA 5J41A 5GAND 1K0DA 4OCEA 3A5WA 2AYTA 2WULA 2H75A 1OE7A 1FVJA 2B1LA 5CP1A 6GSXA 2TRCP 4FO5A 4X1UA 1SL1B 3EVIA 2GSRA 1VF4A 4JE1A 3HJOA 4IJ3A 2FNOA 1W89A 1ABAA 2V41A 1AIUA 4G2EA 4F9ZA 3C8EA 2O87A 2VLTA 5IPHA 4E8HA 1XZOA 1VRSD 1WE0A 3DVWA 3LWAA 2B3SA 3DYRA 4LL4B 4PGTA 4IELA 1TXXA 3TRXA 5DJLA 1PRXA 4MJEA 4HU7A 4KE3A 1ML6A 4MA9A 3HHVA 2I9HA 2MMOA 2YN1A 3ZIJA 4POBA 1WWJA 2HFDA 4V1Ag 4Q5FA 2PBJA 2L5OA 3BJ5A 2N5FA 4WBRD 2HZEA 3TJJA 3ZVJD 1PX7A 2DJJA 4X0XA 5DJMA 1WJKA 1FB6A 2WGRA 3RBTA 2LRNA 4ULXA 5COHA 1THOA 1ILOA 4DVCA 4POKA 4O7HA 5G2ZA 3Q74A 3WD6A 4ZXGA 1XWCA 5KN0A 3UARA 3M3MA 2XBQA 2F8AA 1V58A 3UOMA 2GGTA 3GSTA 2E0QA 3VK9A 2CZ2A 1IYIA 5IOWA 4KA0A 1MD4A 5JWQB 1T1VA 4E8EA 3BCKA 4POLA 3IDVA 4HI7A 2GQMA 3TRPA 5IO2A 1WP0A 2V32A 4XS4A 4N10A 1PKZA 3LXTA 2VAFA 3FR3A 3L78A 3FW2A 1VF2A 3FZAA 2IPAA 1OC9A 3FHKA 3MDKA 4MH2A 1MTCA 4L5LA 5IMDA 4JR6A 3I6AA 2YWMA 3EU4A 2OA7A 1FW1A 1AQXA 3ZTLA 1XW9A 2YV7A 1JFUA 5IM9A 4Q5RA 2VIMA 1Z9HA 2GZZA 3ZREA 1TKDB 2L4CA 5G5FA 4IBPA 4ECBA 4V1Ap 1M2AA 1E2YA 3MAKA 4TN8A 1EZKA 3P90A 2CVKA 4YH2A 4CDOA 1SK0A 3NZNA 4TR0A 3A2XA 1Z7PA 4I6XA 4GCIA 1PX6A 4F03A 4I97A 4L8EA 5H5QA 2JL4A 4OWYA 2GSTA 3RHBA 3IE3A 2H73A 3ZIVA 4LMVA 1XBSA 4HOJA 4Z7XA 3Q18A 3SWLA 3R2QA 1UC7A 5DDLA 4NAXA 1PD21 5CAXA 4OFNA 13GSA 2IL3A 2PPTA 4PXOA 3HY2A 3IK7A 4MCUA 1A2MA 2EIQA 5IMFA 4CW9A 4BPYA 2JACA 3H1NA 2GQKA 3G7IA 4QQ7A 5D9TA 2O85A 4L0UA 2GT5A 1U87A 1YKAA 3ZYWA 4GQCA 4ZB8A 4ML6A 1KTEA 3WT1A 2VL2A 3KD0A 2DJ3A 3IBHA 3IAS2 5C00A 1U6TA 3LYPA 1USBA 2ALBA 3C73A 3GKKA 2X8GA 2GLRA 2LRCA 1KBNA 5ECQB 2O89A 1G6WA 1AUCA 20GSA 4MMMA 1UN2A 3RAZA 5C04A 1KEBA 1AAZA 3ZRDA 2V2GA 2OADA 2H66A 5F05A 1K3LA 1LJRA 3ED3A 1OC3A 3GKMA 5A5KA 4G10A 2LTKA 4HS1A 3G7YA 4ZBAA 5EVOA 2G2QA 2XPDA 3M0FA 2K8SA 1G6YA 3DD3A 1TDIA 4V2LA 5A4VA 1A2LA 4DSSB 2LQQA 3IC4A 5ECMB 1Q4JA 4JBBA 1QXHA 2E7PA 2VL9A 4GLTA 3HCZA 1N8JA 5B6MA 1A8LA 4OMVA 3N5OA 3PH9A 3QFAC 3MWHA 5H5SA 5GSTA 4MABA 3GTUB 3RDWA 7GSSA 3D4MA 3M8NA 3LQ7A 2VCZA 3QOUA 2Z9SA 4IJIA 3W8JA 4K7IA 3ERGA 3HDCA 4EC0A 1TU7A 5J4UA 2IJYA 5ECRB 5ECPB 3O76A 5IMAA 1YY7A 2J9HA 2GS3A 3VI7A 3UJ1A 5ECKB 4WR5A 4QL9A 1XOBA 1HYUA 2VLUA 19GSA 1SYRA 4OCFA 4O32A 4F2IA 5ECLB 4KX4A 3L4NA 1OKTA 2H74A 4I5QA 3F0IA 1YDKA 4ZL9A 2G0FA 3ERFA 2PVQA 1XFLA 3F3QA 3I43A 2ZNMA 2LEGA 3DIEA 3TJKA 4CHSA 5DCGA 3P2AA 4XS4B 4P3YB 3GN3A 3D6IA 2H76A 2LJKA 2WDUA 2VM2A 4XS6A 1NSWA 2VCVA 5E4WA 22GSA 4OO5A 2XPEA 4J57E 4LA1A 1NW2A 2YWOA 2FGXA 2H1BA 2F3MA 1NM3A 2VCQA 3Q6OA 5ID2B 4ZB6A 1HNAA 3F4RA 3WGDA 3DGQA 1F3BA 4TW5A 1PKWA 2F9SA 4KCAA 4XCSA 3UAPA 1V40A 1BEDA 2AHEA 4YQUA 5ABRA 1JLVA 2FWFA 1GLQA 5JCWA 3MNGA 2CV4A 4L0WA 3C7MA 1YF1A 3F6DA 1ERVA 5CRDA 1R7HA 18GSA 1PGTA 2CVDA 5IIZA 1R5PA 1TK5B 4LMWA 2C8UA 3DWVA 4KDXA 1FHEA 1GSFA 3GHAA 1GUKA 1A0RP 1PL2A 1XWAA 2OE0A 5ELGA 2O7KA 4ZL7A 6GSWA 1SL2B 1SENA 1WIKA 3EU3A 1JLWA 1B8XA 1R5AA 4RI7A 2IMEA 2R2JA 2I4AA 3GL3A 3P8WA 2HRFA 4TXOA 2B1KA 2I81A 1SK1A 4POMA 3WGXA 3HYPA 3GIXA 1K3YA 3UIWA 1GWCA 5IMZA 4ISDA 1B4PA 5J3RA 4MJBA 1EGOA 1FB0A 1SJZA 1EV9A 3FZ5A 4ID0A 1A2JA 4WKWA 5G1KA 3TDGA 3CSHA 2OKAA 2VCWA 3EMPA 4BVXA 2KP2A 1J9BA 1X5CA 2H0HA 1S3CA 2C0EA 1WPIA 4AJ6A 2GVPA 4NHZA 5D9WA 4K0GA 1GRXA 4RUVA 4EDZA 3WYWA 2QKEA 4I2TA 1G7EA 3QMXA 1O6JA 1PSQA 3D21A 3WT2A 4HUAA 1Z3EA 2O8VB 3QPMA 2CAQA 4DSSA 3EMXA 1T7PB 5G31A 1THXA 4MZCA 4OFTA 2FLSA 3TJFA 1XPVA 4AJ7A 4MK3A 4IS0A 5JCUA 4KNDA 1AXDA 1GSQA 3D5JA 2DBCA 1BJXA 2GSQA 1GSDA 5JWOB 3GTUA 4HQZA 1XIYA 2C0DA 2CX4A 2FA8A 1TI1A 1OVNA 5CNWA 2AJQB 2AB6A 5E59A 6GSTA 4TR4A 3KZQA 3FY7A 3C1SA 1HNCA 5EL8A 2DMLA 5LD0A 3TKSC 3U5RE 2VUPA 3BD2A 5J5NA 4TKYA 3LGCA 3QAGA 2C4JA 5L71A 4EUYA 3ZFBA 1GP1A 5CRHA 2KLXA 2LV3A 1KNGA 3GKXA 1GSEA 5CRWA 3RPPA 1XOAA 1SYXA 1B4QA 4HU9A 1QGVA 5HR1A 2RLIA 2XC2A 4HQSA 3P7XA 4YQVA 3KXOA 3VWVA 4JZQA 3SBCA 5GSSA 2H71A 1QQ2A 4ACSA 5A4UA 3TJBA 6GSSA 2DIZA 3ME7A 1X0RA 3RHCA 4PUFC 4BWQA 4IVFA 4GF0A 3UBLA 1YQ1A 3DVXA 4ECCA 3CSIA 3IPZA 2P5QA 2JZRA 5IO0A 2L5LA 1X5EA 2YPMA 8GSSA 1U88A 4EDYA 4NPBA 4TR1B 1V98A 3CRTA 4WR4A 2H0IA 2J23A 2VCXA 3E0UA 1SD9A 2K18A 3A3TA 1H4OA 5HFGA 2CVBA 2DJ2A 5ID2A 1TRSA 1K0CA 4GQFA 1X9MB 3BOAA 2V1MA 1WMJA 2LQOA 2NBSA 3C71A 4V2MA 3DRNA 4IHUA 3VPQA 4KAEA 4FYBA 2HYXA 4I8BA 5D8IA 3TB2A 4HZ2A 3HZ4A 1DSBA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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