1QK8A

Tryparedoxin-i from crithidia fasciculata
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
143
structure length
143
Chain Sequence
GLDKYLPGIEKLRRGDGEVEVKSLAGKLVFFYFSASWCPPCRGFTPQLIEFYDKFHESKNFEVVFCTWDEEEDGFAGYFAKMPWLAVPFAQSEAVQKLSKHFNVESIPTLIGVDADSGDVVTTRARATLVKDPEGEQFPWKDA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The High Resolution Crystal Structure of Recombinant Crithidia Fasciculata Tryparedoxin-I
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPAREDOXIN-I
molecule tags Tryparedoxin
source organism Crithidia fasciculata
total genus 42
structure length 143
sequence length 143
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13905 Thioredoxin_8 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1qk8A00
2CX4A 5DCHA 3WYWA 3GSSA 4GCIA 4HEA2 2FLSA 2YWOA 1GTIA 4Q5QA 3QFBC 4Q5RA 2R6KA 4AJ7A 4ILFA 3VWWA 4K9ZA 4D73B 2DMLA 5CRDA 2HRFA 3ERFA 1F2EA 2X8GA 4G2EA 1KNGA 2IMIA 4TKYA 4ZB6A 1MDJA 4NWYA 1YEXA 1HYUA 5J9CA 1U3AA 1ZL9A 4DSRA 5B8BA 5GZZB 4IJIA 1PN9A 4OCFA 5FWGA 1UC7A 4IGJA 3TDGA 4MZBA 4CDOA 5D8IA 2YNXA 2AB6A 1TOFA 2F8AA 1ZMAA 2BJXA 1XW5A 1IYIA 1GUMA 1GH2A 2H1BA 3D21A 4EVMA 1ZCPA 1ON4A 3CBUA 1GP1A 2REMA 3EU3A 3HZ4A 4ZL7A 4EL1A 2H70A 5F0GA 2XC2A 1A2LA 2NTOA 4GWRA 4I6XA 2JADA 5ID2B 3G7YA 2VO4A 2V6OA 2LSTA 4H86A 2FA8A 3IAM2 1THOA 1OC9B 1J0FA 2PVOC 3ZREA 4KSOA 2NVLA 3HJPA 2B7KA 3IAS2 3HZ8A 3VK9A 2OA7A 4KCEA 2V41A 3VWUA 1V57A 2JZSA 2B5XA 3VLNA 1R5AA 1ACVA 5D9XA 4EUYA 4ZILA 1JZRA 3DEXA 5KN0A 2PN8A 3KD0A 2KOKA 3ZMLA 4TXVA 1ERUA 2KP2A 3FR6A 4GQCA 2LJKA 3W8JA 3TCOA 4HOJA 5H5SA 2PVQA 2B1LA 3IR4A 3LEFA 1AW9A 4XRAA 1ERTA 1R26A 5CAXA 2RIIA 4F82A 1FOVA 2GSSA 3TOTA 4EO3A 4PUAA 3FZ4A 3GSTA 4ZIJA 1DBYA 2C8UA 4HQSA 3DGQA 2LKUA 4XS4A 2FGXA 3RHCA 2C80A 3O6TA 3LSZA 1GWCA 3KH7A 1XWKA 4XTSA 4JR6A 4IP6A 3ZZXA 1TRVA 3IC4A 1YDKA 1DUGA 2HI7A 1K0OA 2GZPA 3FKFA 2GZYA 3D0ZA 2VCQA 4KDYA 2PPTA 2HZEA 5DBQA 1MDKA 2NDOA 2GT6A 4HQZA 1T7PB 2WULA 2CZ2A 4MDCA 1T1VA 4TR3A 1K3LA 1M2BA 1VF2A 4V1Ap 4IHUA 2WRTA 2RM5A 3DMLA 5G5FA 4K0NA 3ZIVA 5CRHA 5A5KA 4MA9A 3U6VA 3FY7A 4OO5A 1ERWA 2PUKC 2G0FA 4WBJA 2QKEA 2FNOA 2CQ9A 4KSMA 2ES7A 2MBTA 1UN2A 3IXRA 6GSSA 5JCGA 1VF4A 1YEPA 2VD1A 4IJ3A 5D96A 5ECMB 2BMXA 3G9BA 4FIWA 2E7PA 3ERWA 3OR5A 5D9WA 1SK0A 1M9BA 1EP8A 2H71A 3Q19A 5IPHA 3C1SA 3HDCA 4I2TA 2DJ0A 1SL0B 5IPGA 3QOUA 19GSA 4Q5FA 1G7OA 4HJMA 3Q74A 1ZYEA 4KNDA 1T8EB 4J57E 4NAXA 3E9JB 5D73A 2L57A 1SKWB 4BVYA 1H75A 3ZFBA 4J56E 1PL1A 4LMVA 5JWRB 2I3YA 5INYA 2A4VA 3P2AA 4FYUA 1V2AA 1V58A 1BX9A 4OFNA 1OKTA 3VPTA 1JHBA 3IBHA 3O3TA 2GSQA 3E0UA 1Y25A 5HR2A 22GSA 3D6IA 1FB0A 4K0GA 4MJEA 4TXOB 4HZ2A 1LJRA 1FVJA 1ABAA 5HQPA 4E8EA 4YQMA 1XWAA 3UAPA 4X0XA 2NPBA 3UBKA 4PQ1A 1TJDA 5LD0A 1AQXA 5AGYA 3S9FA 3C71A 3LWAA 2G2QA 4F0CA 3ZVJD 2YZHA 3CTGA 3ZITA 4K7IA 2LQQA 1PMTA 3H4KA 1T4ZA 3TKSA 4F03A 1TRSA 3ERGA 3PH9A 6GSWA 1JZDA 5G5EA 1Z9HA 2JU5A 2DJKA 3ZIJA 4WR5A 3LFLA 5HR0A 4BVXA 4KW6A 4OFMA 1M0UA 2LRTA 3WGEA 1I5GA 4CHSA 1AIUA 4N11A 4V2LA 1XW6A 4WR4A 2PMTA 3F6DA 3TKRA 4TN8A 3GMFA 4HZ4A 2GGTA 3UL3A 2IMKA 3GH9A 5JCUA 14GSA 2R37A 1WIKA 2CT6A 2IWTA 2H72A 3FYGA 3IHQA 3KZQA 1K0DA 4WF5A 1MTCA 3C73A 2DBCA 1UVZA 5DCGA 3ZMKA 1N8JA 2HE3A 3ZRDA 1W89A 4AGSA 2GZZA 3HXSA 3M0FA 3L78A 4OMVA 1PL2A 2B5YA 3HY2A 2F8FA 4MJBA 20GSA 1XOBA 5LCZA 3HJMA 5IMAA 1BEDA 1SK2A 1JFUA 2WGRA 3TB2A 4F0BA 3KGKA 5F05A 3A3TA 3QR6A 1O73A 5JCWA 3VURA 5KN3A 3GTUB 5DQSA 1J9BA 1RQMA 1XVQA 5H5QA 2CAIA 5D9TA 4LA1A 1SL2B 2V6KA 2MMZA 1EWXA 2MZCA 3APSA 1WWJA 4MJAA 2FWHA 2O8VB 5ELGA 4EKZA 4IN0A 4MCUA 2MYGA 1HNAA 3GKNA 2H30A 3ZVJA 2CAQA 3HVVA 4IELA 1ZGNA 2RLIA 2L5OA 5AIXA 2I1UA 1BQ7A 2V32A 1GTAA 3M8NA 4IKHA 1GSEA 4GSSA 5HR3A 3EE2A 1TK5B 1GNWA 3GH6A 2KUCA 4LMWA 2H1AA 2LNTA 2OJLA 4DSSA 1EOHA 1A0FA 1X0RA 5GSTA 4PNFA 1O85A 2VCVA 1A2JA 5B6NA 2R2JA 4HUAA 3PR8A 1Z6MA 2IFQA 3FW2A 1GNEA 1NHOA 1Y6EA 2H8LA 3GKKA 2HSYA 1SYRA 4FYBA 4F2IA 3I43A 3I6AA 5G1KA 4MK3A 2J9HA 2QGVA 2VM2A 1QK8A 2HLSA 3EWLA 1M7TA 4EDZA 3TKSC 3UBLA 3GUSA 2GQKA 1SKRB 2M72A 3TJFA 2MMNA 2RUFA 5HFIA 4KDUA 2H66A 4XHMA 1MD3A 2VIMA 4O7HA 1X5DA 1F6MC 4YQVA 2L5LA 10GSA 3DVWA 1EEJA 2OE1A 4IP1A 1YF0A 4JZQA 4X1UA 3TRXA 2GSTA 3TRPA 4RUVA 3KTLA 3CTFA 1FO5A 1R4WA 2I9HA 2I4AA 5DQYA 3CMIA 5G1LA 3TOUA 1M2DA 1BYEA 2OBKA 5DALA 4TVEA 3M9JA 1TP9A 4POMA 4EE0A 2ON7A 1TK8B 2LQOA 2H76A 4DEJA 3GA4A 3GIXA 4LL4B 1AAZA 3TJKA 3IRAA 2NBSA 4MP4A 1YJ6A 3DRNA 3VPQA 2YPMA 3SBCA 1NW2A 2C3QA 3KMNA 3KP8A 2LNSA 2CZ3A 2KHPA 3UIWA 5J5NA 5ECOB 1CQGA 1WE0A 3ME8A 3D5JA 1JLVA 2YOIA 1W4VA 4CW9A 4OFTA 3IDVA 1EGRA 4RI7A 3WT1A 5G2ZA 3IPZA 1G6YA 4EXJA 1GSUA 1ML6A 4NXIA 4BL7A 2GSRA 3DIEA 5IO0A 4BPYA 3MNGA 5KEJA 1VF1A 3NZNA 1SU9A 1F3BA 1OYJA 1A0RP 5IOWA 2LUSA 3H79A 3QD9A 2HYXA 4TR1A 3UVTA 2B3SA 3DD3A 1TK0B 4K1FA 4HU9A 3PINA 1E2YA 1K3YA 1GULA 4XS6A 3J7Yb 1PGTA 2O85A 2K8SA 3BCKA 3APOA 4MF7A 2B6MA 2XBIA 4E8HA 1B9YC 2KLXA 1T4YA 3QMXA 1Z3EA 1PRXA 3DYRA 3VI7A 5ECLB 3CSHA 2IL3A 2E2MA 4KAEA 4KX4A 2XPDA 3LORA 3ED3A 1H4OA 3DXBA 4O92A 2VUPA 1QUWA 2YN1A 1ZYQB 1PKWA 2X8HA 4ECJA 2C1YA 1XOAA 1A23A 4OD7A 4F9ZA 1SJIA 3HD5A 3GX0A 2AHEA 2VCXA 1PKZA 2LV3A 3QCPA 3DWVA 5IOXA 3HA9A 1WMJA 4IBPA 1EZKA 4D73A 1K3OA 1O7UA 1M99A 1KTEA 1OKDA 2F51A 4KGIA 17GSA 1DE1A 2I81A 1HNBA 4NMUA 4G9HA 3TJJA 1O8WA 3EMPA 1YKAA 5ECIB 3GX8A 2ZNMA 1FB6A 2DJJA 2JL4A 2VD0A 3IOSA 1EOGA 1VGLA 2VL9A 2GS3A 3VFIA 3US3A 5JWOB 3FK8A 2O7KA 3G7IA 4PUFC 2PU9C 3FRCA 2A2RA 4GQFA 4ZL8A 2C3TA 5IIZA 3GKMA 3F3RA 1JZOA 4N30A 2WJUA 3QAVA 1Z7PA 2AJQB 5A4UA 2H73A 2WCIA 4ID0A 1EEMA 5ID2A 3QDNA 1A8LA 1XVWA 1Z6NA 1FVKA 1G7EA 1OC9A 1S3CA 3GNJA 5EVOA 3BJ5A 3W6GA 4YAVA 3LJRA 4GRFA 2CX3A 1A8YA 2EC4A 4ZBAA 1OAZA 4WF4A 3F6FA 1HQOA 2GLRA 4XRDA 3GN3A 2C0DA 1B9XC 3WGXA 1V98A 4AJ6A 2H19A 3BOAA 4POLA 3ISOA 4JRRA 2VCTA 2DJ3A 3TJGA 3WGDA 5ECQB 5F06A 4MJCA 4JR4A 2HZFA 2DMMA 2DSAA 3ZTLA 2N5BA 3K8NA 6GSVA 1PX7A 1TTZA 2VL2A 3FEUA 2IFQB 1S3DA 4N10A 1XWGA 1XCCA 2EIRA 3DVXA 2X99A 2CA8A 3TGZA 4XCSA 1QMVA 1THXA 1SL1B 4IVFA 1KBNA 4JBBA 1OC8A 2L4CA 4KB3A 3H93A 1JZWA 3D22A 3FZ5A 5HFGA 5IQYA 3M3MA 1XWCA 3P8WA 1YF1A 2X8CA 4BWSA 3GYKA 1YZXA 1EP7A 4TRXA 6GSTA 2H1GA 5F8BA 1ILOA 1K0CA 4XIHA 2ON5A 2F9SA 2K9FA 2F3MA 2R4VA 2GT5A 4ZL9A 2DJ2A 2H0GA 4HU7A 3GRXA 1TU7A 4K2DA 2AUVA 2OACA 4HDEA 5CO3A 3UJ1A 2ZCTA 1X9MB 3KP9A 4QL9A 3CSJA 4I5QA 2WDUA 3TUEA 2BTOT 3L9VA 1EGOA 1CQHA 4O32A 5IO2A 3KH9A 4N0VA 1AQVA 4KA0A 2H0IA 1GSQA 5IMZA 3IA1A 2E0QA 2VLTA 4P3YB 3M1GA 5B8AA 4MF6A 1C72A 5AN1A 1O6JA 2L59A 3F0IA 2D2ZA 5ECRB 4TW5A 4N0ZA 6GSXA 3QFAC 4ZBBA 1TXXA 3Q6OA 4MH3A 3IV4A 5KN2A 2L6DA 3EINA 1R5PA 5EY6A 5CP1A 4J2FA 1U6TA 3C8EA 5CREA 3P90A 3A2WA 4TR0A 3UVHA 5ABRA 2GQLA 2OADA 2VAFA 2YV9A 4BWQA 2O89A 2OKAA 2PBJA 3A5WA 2ALBA 2LRCA 4WXTA 4ZBDA 4RQXA 2P0GA 1NM3A 2H1DA 3HVXA 1AC1A 2LJAA 3DKSA 1B4QA 2VL2C 2YWNA 4PX1A 2AV4A 2X64A 4OO4A 4HI7A 2VM1A 2C0EA 3ZLPA 3HYPA 4K6XA 5FHIA 1XFLA 1F9MA 3RPNA 3F3QA 2JZTA 4L8EA 4KH7A 1URMA 4XS4B 2XHFA 2C4JA 4MZWA 4ULXA 5C04A 1Z7RA 3F4SA 4PNGA 1OE7A 2WZ9A 3MAKA 2FHEA 5HR1A 5AIVA 4AF2A 5DAKA 1DSBA 1GLPA 1I9DA 3UOMA 1OVNA 3SWLA 4Q5NA 2Z9SA 5CNWA 1RW1A 2YWIA 2JACA 2HZEB 1WP0A 2FWGA 1KEBA 1FW1A 5IMVA 5DDLA 4L5OA 5IMDA 3BBYA 2VLVA 4MMMA 1HD2A 2H0HA 2H6XA 3LXTA 4PXOA 3KMOA 5IMCA 2C3NA 1TKDB 1BJXA 1T00A 1QXHA 1XW9A 5A4VA 2GVPA 2JSZA 3CSIA 4K7OA 5DVBA 4MF5A 1X5CA 2YWMA 3EURA 1SD8A 3C7MA 5J4UA 3QPMA 4Z7XA 4WEYA 3A2VA 2CV4A 2L6CA 18GSA 4NV5A 3BD2A 5ECSA 2M80A 2P5RA 1LBKA 2OBIA 7GSSA 5IMFA 5GAND 4ZB8A 3LYPA 4PQHA 3GL3A 2P31A 1YY7A 5JWQB 2FY6A 2H01A 2C0GA 3IE3A 2VL3A 1GUHA 1SD9A 4V2NA 2PWJA 3GTUA 3HVSA 1ST9A 2HNLA 2FA4A 3NOFA 4OWYA 5C00A 1J08A 3H1NA 3CRTA 11GSA 4YAPA 1USBA 1K0BA 3FR3A 6GSUA 3TJBA 1TRUA 2IMEA 4GXZA 2CVKA 2YP6A 1SYXA 3GL5A 1F3AA 4GTUA 1M9AA 2FWFA 4V2MA 3APQA 3WT2A 2AYTA 1U87A 1K0MA 4IQAA 5CRGA 4NV2A 3KM6A 1SK1A 2XPEA 1TI1A 4V1Ag 2IN3A 5E4WA 3W8SA 6GSYA 2WFCA 4YH2A 3VWXA 1G6WA 1R7HA 3EU4A 5E59A 4KUNA 1WOUA 5HFKA 1AQWA 2CVBA 2KP1A 13GSA 2CVDA 4ML6A 4ISDA 2MMOA 1M2AA 4GF0A 1PQNA 4KDXA 3IK7A 5DJLA 3ZFLA 2K8VA 2PGTA 4ZXGA 4KE3A 1TW9A 2TRXA 4XS1A 4ECCA 3TRQA 4L5LA 1JLWA 4PGTA 1SENA 3FR9A 4DVCA 1OC3A 3EMXA 3CRUA 3RHBA 5ECHB 1TRWA 2VOCA 5ENUA 3LG6A 1NHYA 2OE3A 1N2AA 4MLYA 1GSDA 4BA7A 1FG4A 1XBSA 3H8QA 3FZ9A 2DC5A 2GQMA 2VLUA 3QAGA 4K7NA 1S3AA 1QQ2A 3GFKA 4L0WA 2XBQA 4O5RA 5GAPD 2YJHA 2H74A 5GSSA 4K8MA 12GSA 4JEDA 3MWHA 4KCAA 1WJKA 3KEBA 2GTUA 2HFDA 4IS0A 2MBSA 1VF3A 1MDIA 4EC0A 4ECIA 1O81A 4POKA 1XPVA 4RQRA 3TKSE 3GKXA 3TKQA 2GDRA 1XWBA 3N9JA 1PA3A 2HXKA 4MZCA 3KIJA 4QL7A 3L9UA 1FAAA 2IMDA 2N5FA 1BG5A 4ZB9A 2FUG2 1GSFA 1GSYA 5CYYA 4ACSA 4I8BA 2R5GA 5B6MA 4PQIA 1PD21 4GSTA 1T3BA 1TU8A 2B5EA 3RPPA 3FZAA 2YJ7A 2EIQA 2QC7A 3G7JA 4EDYA 5ECNB 1PSQA 3J7Yk 5EL8A 2OE0A 3ZYWA 1YKCA 3F4TA 3LGCA 2V2GA 2IIYA 1VRSD 1EV9A 5J3RA 3L0HA 2L4QA 4TOPA 3JCML 2N5AA 1NSWA 5DJMA 1GRXA 5IM9A 4JU5A 1X9WB 2TIRA 3EC3A 3UARA 1MEKA 3U5RE 2FWEA 4LL1B 5J41A 4EF0A 3D4MA 4FH8A 3F63A 1GTUA 1SKSB 4WETA 2H75A 1Z5YE 3EVIA 3CYNA 1O8XA 2QSIA 1A24A 2C0FA 3R2QA 2O87A 1WRYA 3BCIA 1Q98A 3WD6A 2IMFA 4X43A 1XIYA 3P7XA 1XXUA 1K0AA 2EIOA 1HNCA 3C1RA 2FD3A 1G0TA 3KCMA 4DSSB 2DIZA 1AXDA 2HT9A 4HS1A 5LNKe 3TKPA 2E2GA 1UA5A 1F37A 2J23A 2JZRA 1GSSA 3HCZA 2YZUA 3I69A 3VI5A 2HSHA 1Q4JA 4LLRA 4YQUA 3L9SA 3EYTA 3I9V2 2FCHA 3Q18A 1ERVA 1MD4A 2A2SA 9GSSA 1K0NA 1WPIA 4FO5A 4FYCA 1X5EA 4G10A 3NIVA 1XZOA 1QGVA 5FT3A 2M46A 2LRNA 1GLQA 1GTBA 4NPBA 5DAKB 2MMAA 4RI6A 2VCWA 3LYKA 2LJRA 3GURA 1YQ1A 4MPFA 3MSZA 2K6VA 4QQ7A 4IQ1A 5G31A 3ME7A 3V1WA 2TRCP 3CXGA 1SJ6A 3F4RA 2DIYA 4OCEA 5ELAA 2PERA 4AJ8A 1GL8A 1ZZYA 4POBA 1ZOFA 1B4PA 3GV1A 5L71A 4WBRD 1RK4A 2ZUPA 3RAZA 5B7CA 3HJOA 1V9WA 5DALB 1BAYA 2R3XA 3HKRA 2K18A 4TR4A 3N5OA 5F07A 5H5RA 1V40A 3IK9A 4IW9A 4L0UA 3LQ7A 1SJZA 4GLTA 1OE8A 3E3EA 1A2MA 2B7JA 4NHWA 2LTKA 3O76A 4HJ2A 1LU4A 3FHKA 2DLXA 5A4WA 2IPAA 2YV7A 3UMAA 4ECBA 5D9VA 1FHEA 5ECKB 5J9BA 4JE1A 4I2UA 8GSSA 4GSNA 3ZL5A 2V1MA 3PGTA 1E6BA 2HRNA 5CRWA 2VCZA 1B8XA 4I97A 5AISA 3KXOA 5D93A 16GSA 1B48A 2AAWA 3KTBA 5EPFA 2IJYA 3GHAA 5COHA 3KJYA 2DJ1A 4MABA 1GUKA 4TXOA 4NHZA 2WB9A 3A2XA 3L4NA 4DSQA 3D4TA 5G30A 3HHVA 3LXZA 3UEMA 4WKWA 1TI3A 3AY8A 2YCDA 4G19A 4TR1B 3QAWA 2LS5A 1EV4A 2P5QA 3M9KA 3F8UA 2RM6A 2LEGA 1U3IA 1AUCA 3MDKA 1X9SB 1IYHA 1QFNA 2H6YA 1DE2A 2JSYA 2RUEA 2H6ZA 3F9UA 2YANA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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