1QK8A

Tryparedoxin-i from crithidia fasciculata
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
143
structure length
143
Chain Sequence
GLDKYLPGIEKLRRGDGEVEVKSLAGKLVFFYFSASWCPPCRGFTPQLIEFYDKFHESKNFEVVFCTWDEEEDGFAGYFAKMPWLAVPFAQSEAVQKLSKHFNVESIPTLIGVDADSGDVVTTRARATLVKDPEGEQFPWKDA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The High Resolution Crystal Structure of Recombinant Crithidia Fasciculata Tryparedoxin-I
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPAREDOXIN-I
molecule tags Tryparedoxin
source organism Crithidia fasciculata
total genus 42
structure length 143
sequence length 143
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13905 Thioredoxin_8 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1qk8A00
1MD3A 4EKZA 1T7PB 5DQSA 2RLIA 1K3OA 1V58A 4N11A 2ZCTA 2GQLA 1B48A 4OCFA 3QAGA 4QQ7A 5IIZA 1M2BA 3TKSE 2V2GA 2YV7A 3TRQA 3CXGA 3LYKA 1YY7A 4HZ2A 2K8VA 3HA9A 2YCDA 2AV4A 2HI7A 3IOSA 5B7CA 2JSYA 1KBNA 4OMVA 1B9YC 4E8HA 4K7OA 1VF1A 2V6OA 4MF6A 4DSQA 1F37A 5H5RA 3RAZA 4EL1A 1YKAA 1G6YA 4GSNA 2HRNA 3P8WA 4GSTA 4NPBA 1XW9A 5G5FA 1VRSD 3TDGA 1XVWA 1K0MA 3C8EA 4XIHA 5JWOB 3F4RA 5D9WA 3SBCA 2VL2C 1OYJA 4POBA 1O81A 4FYBA 4TN8A 5DCHA 4MPGA 2QKEA 4GXZA 3DMLA 3H1NA 2X64A 2N5FA 3WT1A 1M0UA 1WIKA 4MP4A 2GZYA 2JL4A 2XPDA 3ME7A 3GHAA 2XC2A 3FYGA 4MK3A 2YANA 4JR4A 1K0CA 4MF7A 5DAKB 3IRAA 2B6MA 2LS5A 5DJLA 5CRHA 5HFIA 2NBSA 6GSXA 1F6MC 4ACSA 2VCVA 1SJIA 1THOA 2HE3A 4PURA 3KTLA 1SYRA 3RHCA 4IGJA 3EVIA 3C1RA 2LRCA 2PGTA 3KGKA 3Q18A 12GSA 5FWGA 1RW1A 1GSFA 2P0GA 4OFNA 2REMA 2FWHA 1EV4A 2CVKA 1XWAA 1ZCPA 4KNDA 1BJXA 2JACA 1H4OA 2LEGA 2KLXA 2A2SA 1TW9A 2MYGA 2ALBA 1E6BA 1XW6A 2FA8A 1T4ZA 2R2JA 4L5OA 2I3YA 1VGLA 2NTOA 2F8FA 4F9ZA 2DJ2A 3FRCA 3E9JB 4BWSA 2K6VA 1AQVA 4ILFA 4J2FA 5AIXA 1SJ6A 4FO5A 1OKTA 1YKCA 1WPIA 4G9HA 4MZCA 2OE0A 1SYXA 1EWXA 5B6NA 1GUKA 3GRXA 3Q19A 2HZEA 1ILOA 4V2MA 2QSIA 4JR6A 1UC7A 1Z3EA 1JZOA 4IS0A 5G2ZA 2XBIA 2VCQA 1N2AA 4HUAA 4I8BA 3M1GA 1XZOA 3IA1A 3M8NA 3GX8A 1T8EB 4K6XA 1WJKA 3FZ4A 1JZWA 3KD0A 3U6VA 1SK0A 3L9UA 1DSBA 2AUVA 2JZRA 2VCZA 2DLXA 4OFMA 3ZRDA 3HJPA 1SKWB 2VIMA 1K0OA 4K7IA 2IFQB 3H93A 3CTGA 3U5RE 2MMAA 1F9MA 5EY6A 3C71A 4ZL9A 4KSOA 3ERWA 2J23A 1JFUA 3EINA 1PD21 1T3BA 1GSDA 4F2IA 3UBLA 1NHYA 2YOIA 4IQ1A 1TJDA 2CX4A 2LNSA 2VCTA 11GSA 5D9TA 3GL5A 6GSYA 1OC9B 2I81A 2EIQA 1KTEA 3MSZA 4X0XA 2FLSA 4WXTA 4ECIA 1DUGA 2OE1A 3GNJA 3W8SA 3GKXA 1G7EA 2PN8A 1VF2A 3DKSA 4PUAA 4WR4A 2R3XA 1FAAA 4L5LA 2OACA 1PN9A 1JLWA 5A4UA 5DALB 2DIYA 3BD2A 3D0ZA 2K18A 2H1BA 3E0UA 2YJ7A 4X1UA 5J4UA 2LKUA 5G31A 4KAEA 20GSA 1ZYQB 4IVFA 3GX0A 3TRXA 2FD3A 3APOA 2X8HA 5DVBA 3ZIVA 4TXOA 3CYNA 2MBTA 3NIVA 1PX7A 3TJFA 2ES7A 2GSQA 2E0QA 2WJUA 2L59A 4LL1B 1XWBA 1U3AA 2C0GA 3H8QA 4I6XA 14GSA 1TRVA 4ZB6A 5ECSA 1J0FA 2DC5A 3ERFA 1TK5B 3C1SA 3S9FA 1HYUA 5ECKB 5J5NA 3IHQA 3CRTA 4IJ3A 5ECIB 5F07A 5A4WA 5IPGA 1JZRA 3BJ5A 2C0FA 4GF0A 4MZWA 1RQMA 1GTBA 3HD5A 2YZHA 1KNGA 2O87A 3ED3A 3IR4A 4DEJA 3ZFLA 1SD9A 3APSA 2HT9A 1X9WB 3IAS2 4K9ZA 2LQQA 3KP9A 5F0GA 4V1Ap 3D22A 4FYCA 3KXOA 1U6TA 1U88A 2VD1A 4D73A 3L78A 4EVMA 2MMNA 1AC1A 1DE2A 4L0UA 3UIWA 1X5CA 2A2RA 6GSSA 4ZBBA 3HY2A 3GKMA 4MZBA 3LEFA 2WS2A 2YN1A 2OBKA 1XPVA 3TGZA 5F05A 5CRWA 4YAVA 2PUKC 1Z6MA 4TR3A 1HQOA 2B5YA 3MAKA 5IOXA 2PERA 4EO3A 1J9BA 2H66A 1EP8A 1G0TA 4Q5FA 3EC3A 4F82A 2H01A 2DBCA 3KCMA 2GZPA 2CV4A 4OD7A 2CAIA 5AGYA 1FB0A 5ECPB 4XHMA 5CAXA 3G7JA 3HYPA 3KTBA 2GT5A 1JLVA 4GCIA 2P5RA 2YZUA 4IW9A 4XS6A 3VWUA 19GSA 3VWWA 5H5SA 1BG5A 3HVVA 5EPFA 4HQSA 5GAND 3PGTA 4K1FA 3VFIA 3WGXA 3ZLPA 3UL3A 5AIVA 4O32A 3BCKA 1SKSB 3ERGA 2M72A 3O76A 4HS1A 3F9UA 2MBSA 4MABA 1AUCA 1EEMA 1PX6A 3GSTA 3UOMA 2BMXA 2B1LA 2ON7A 3GIXA 5CYYA 2C3QA 2VLTA 2WRTA 2DJ0A 2DIZA 3HDCA 5IO2A 1ZOFA 4TR4A 4G10A 1GSYA 4Q5QA 3L9VA 4L0WA 4GQCA 8GSSA 4PUFC 1XW5A 4AJ8A 4N0ZA 3CRUA 1XOBA 1EOGA 1F3BA 4TR1A 2H6XA 5HFKA 3TB2A 4PGTA 2F3MA 2CAQA 4MJEA 4XS1A 2CX3A 1XIYA 2GSRA 4FH8A 2GGTA 5KN2A 1GL8A 1USBA 4PNFA 3IK9A 5C04A 4EE0A 2EC4A 2LUSA 1HNBA 2FUG2 2GSSA 2H8LA 1PMTA 4FIWA 3HCZA 4PQ1A 3QDNA 2H76A 1XCCA 1CQHA 1R4WA 4XS4A 1PA3A 2XBQA 3VPQA 1OAZA 2HXKA 2L5LA 3BCIA 2YNXA 5KN3A 4MPFA 1OKDA 3G7YA 2JZTA 5COHA 2KP1A 4EF0A 2N5AA 2YWMA 2P31A 1A8YA 3K8NA 3RPNA 2VM2A 3EU4A 4KA0A 3KH9A 2F51A 2H74A 2YJHA 1NM3A 2H71A 2LJRA 2OKAA 1A24A 3UVTA 3WD6A 1EEJA 5HFGA 2M80A 2QC7A 3HHVA 2WCIA 2GVPA 4L8EA 4ECCA 3LG6A 2V1MA 3GSSA 3LYPA 2N5BA 2HZFA 3TJJA 3ZREA 1QXHA 4LL4B 3HZ8A 1M9BA 1ABAA 5A5KA 1HNAA 2HSYA 1AAZA 1SKRB 4OWYA 2LSTA 1IYHA 3CMIA 1UA5A 4OO4A 4TVEA 2K9FA 5IO0A 4F0CA 2OA7A 1SL2B 4K0NA 4GLTA 4GRFA 4PNGA 3M3MA 5HQPA 3P7XA 3FR3A 3CSJA 3CTFA 4MH3A 1Z9HA 1Z6NA 2E2GA 4IP6A 4NV5A 2MMOA 1GLQA 2JSZA 1Z5YE 2O85A 1MDKA 1ACVA 3CBUA 3DGQA 3VWXA 5IMCA 3M0FA 2IMEA 3QMXA 2XHFA 4HJ2A 5ID2B 4YH2A 1YEXA 5GZZB 5A4VA 5DBQA 4IHUA 5GSSA 2XPEA 3ZITA 2IPAA 4DSSB 5GSTA 3PH9A 1G7OA 1ZYEA 5CP1A 2H70A 1OC3A 3ZVJA 3P2AA 1V57A 2CZ2A 3J7Yk 1QUWA 4GWRA 1AXDA 1YJ6A 1CQGA 1UN2A 4Q5RA 2F8AA 5F06A 2DJ1A 5HR2A 3ZMLA 1O8WA 3IBHA 4XCSA 5G5EA 1GTUA 4MLYA 4J57E 3GKNA 4MCUA 3FK8A 3HXSA 2OE3A 4NHZA 2VD0A 2C0EA 1LU4A 5IM9A 2X8CA 1J08A 3D4TA 5LD0A 3V1WA 2A4VA 1H75A 1R5PA 1S3AA 1I9DA 1OE8A 1NHOA 1IYIA 2OADA 4PQIA 1GRXA 1I5GA 1EZKA 4ISDA 3EU3A 5H5QA 2C0DA 2TRXA 1Y25A 5IMZA 1V9WA 1X5DA 1K0DA 5AN1A 3GTUB 4DSRA 3TCOA 3TKSC 1B4QA 2X99A 3CSIA 3GA4A 2B7JA 2CVBA 3UAPA 3ISOA 2Z9SA 4ZIJA 5G1LA 2RUFA 5JCUA 5IMFA 1XWCA 1WMJA 3NZNA 4NHWA 2FHEA 3D5JA 2E2MA 3F8UA 4I2UA 2PVQA 4JU5A 1GUHA 4WBJA 3LXZA 1W4VA 4PX1A 1TRSA 4KH7A 1RK4A 5JWQB 3GFKA 4ECBA 4K2DA 3LQ7A 1TXXA 2JADA 1PKZA 2M46A 3O6TA 2R4VA 3GV1A 2GTUA 4MJCA 3WGEA 4LLRA 3VWVA 5ECMB 17GSA 4IJIA 4TXVA 1O8XA 3VURA 3M9KA 3VLNA 3C73A 2H19A 3MDKA 1TDIA 4NV2A 2DJKA 2ZNMA 3NOFA 4HU9A 4MF5A 3ZL5A 1ERWA 5IQYA 3J7Yb 1Q4JA 1FB6A 2WZ9A 1R26A 2F9SA 4HOJA 1R5AA 4ZL8A 3KP8A 1TK8B 4LMWA 2WB9A 1TI1A 3H79A 1GNWA 4GQFA 2O89A 1B8XA 3O3TA 3GN3A 4POMA 2IL3A 4J56E 1ML6A 5LNKe 1O85A 5IMVA 3F3QA 7GSSA 4NMUA 2GSTA 2TIRA 3KH7A 2WFCA 3KIJA 2J9HA 1FW1A 2FWFA 1AQWA 4POKA 1V40A 5DAKA 2CZ3A 2LRNA 4KSMA 3I69A 4ZXGA 2VLVA 3H4KA 4POLA 1BEDA 1X0RA 2LTKA 1Z7PA 3A2XA 22GSA 4JE1A 2KOKA 4V1Ag 3HZ4A 2BJXA 4FYUA 2KUCA 4EDYA 5ECOB 2B7KA 2NDOA 1TRWA 4ZBDA 2VUPA 1A2MA 4IN0A 4YAPA 5D73A 1X9MB 3QAVA 4ULXA 2K8SA 4IKHA 2I4AA 3LORA 2CQ9A 2FNOA 4JRRA 4OO5A 2RIIA 5ABRA 1FVJA 4HU7A 2YWIA 6GSTA 5D93A 5B6MA 1T1VA 3FZAA 1ST9A 3IXRA 3ZTLA 2GS3A 3F4SA 1C72A 5IOWA 1ZL9A 1GSSA 1A8LA 3GMFA 4O92A 3A3TA 4WR5A 1XWGA 4AJ7A 2VCXA 3QAWA 1K0AA 3F3RA 2RM5A 4DVCA 1A0FA 5ECNB 3F6DA 2GDRA 2R5GA 2GZZA 3VI7A 2FY6A 1YEPA 1VF3A 1SL0B 2PMTA 3UMAA 2LRTA 4LA1A 5HR0A 2L57A 4O7HA 1GLPA 2CVDA 5KEJA 2IMDA 4JZQA 5IMDA 2V41A 2B3SA 3WGDA 1A2LA 4GTUA 4P3YB 1TTZA 3QCPA 4WBRD 1GSUA 2H6ZA 4RQRA 5G1KA 1QK8A 4JBBA 1FHEA 4EUYA 3ZZXA 2B1KA 2VL2A 1TRUA 1EP7A 4ML1A 2TRCP 3IE3A 2HZEB 1AIUA 3HKRA 18GSA 1XOAA 2H6YA 4YQUA 1TKDB 2IFQA 5FT3A 4N10A 2VCWA 4OCEA 2C3TA 3LXTA 5ELAA 4CDOA 2H1DA 1MTCA 2HSHA 1KEBA 2EIOA 2YPMA 3KJYA 4CW9A 4TRXA 3DVXA 3HJMA 4N30A 3ZMKA 2AB6A 2AHEA 1SL1B 1ON4A 1OC9A 3D6IA 3FR9A 1E2YA 2HYXA 4KE3A 2VM1A 4KDYA 4ID0A 4RUVA 1O73A 1U3IA 1NW2A 2GQMA 3BOAA 1MDJA 5CO3A 1M99A 5DALA 5DCGA 2I1UA 4ECJA 1OVNA 2G0FA 5J9BA 1TK0B 3RPPA 1A0RP 3C7MA 3W6GA 1N8JA 1F3AA 1PGTA 1AW9A 2KP2A 3F0IA 3IC4A 2YP6A 2VL3A 5EVOA 2DMLA 5KN1A 3TRPA 4KCEA 3QR6A 2VAFA 10GSA 2H0GA 4TW5A 2OBIA 4MMMA 3EE2A 3QPMA 2MZCA 4IQAA 1S3CA 3GURA 1XVQA 1HD2A 3ZFBA 2B5XA 5ELGA 4WKWA 4G2EA 2JZSA 3LFLA 13GSA 2H73A 1WE0A 4ZB9A 4TXOB 3N5OA 1SU9A 3M9JA 3TKSA 5GAPD 2VOCA 5J3RA 1WOUA 2GQKA 3RHBA 2NPBA 1EGOA 1OC8A 5FHIA 3FR6A 1M2AA 2MMZA 3DEXA 2L4QA 1ERVA 3L4NA 5ECQB 1EGRA 4HDEA 3KMNA 1XWKA 2DSAA 4MA9A 3UVHA 1HNCA 2B5EA 4CHSA 3FHKA 3IDVA 3GKKA 2ZUPA 4TOPA 1JZDA 5D8IA 3LSZA 3TUEA 3G9BA 3TOUA 4IP1A 3TJKA 6GSUA 1GSQA 2YV9A 4D73B 4QL7A 3FEUA 4KDUA 3KEBA 3FZ9A 3FKFA 3ZVJD 3E3EA 1B4PA 2LJKA 6GSWA 3DRNA 3L0HA 5ECLB 5D9VA 1OE7A 1ERTA 3HVSA 3QOUA 5E4WA 3DIEA 2D2ZA 2PPTA 2VLUA 4Q5NA 5D9XA 5EL8A 4KDXA 1JHBA 5D96A 2LQOA 6GSVA 4BL7A 1PL2A 4ML6A 1SENA 4F03A 2C1YA 1W89A 2FWEA 4HQZA 3G7IA 2X8GA 1MEKA 4BA7A 1PKWA 4BVYA 4TKYA 16GSA 4I5QA 1G6WA 2HRFA 2H30A 1URMA 1BX9A 1S3DA 2H72A 5IMAA 5DJMA 1V2AA 1SJZA 5JCWA 1M9AA 4I2TA 2WULA 4KUNA 5J41A 3WYWA 3F4TA 3R2QA 3GL3A 5KN0A 3EYTA 5B8BA 3D4MA 5JWRB 3PR8A 5G30A 2FGXA 4O5RA 2BTOT 2IN3A 2O8VB 3US3A 5C00A 1B9XC 4BPYA 1XBSA 4EXJA 4YQMA 1M2DA 4V2NA 3TKPA 2RUEA 2P5QA 3IPZA 1YZXA 2OJLA 1PQNA 1THXA 3VI5A 4KX4A 5CREA 1AQXA 4GSSA 5JCGA 2YWNA 3LGCA 4N0VA 1MDIA 3ZIJA 5L71A 2C80A 3MWHA 1BAYA 1ZMAA 1O6JA 1QQ2A 2IMKA 3OR5A 3UJ1A 1GP1A 1TI3A 4TR1B 4QL9A 1ZZYA 3DWVA 3LJRA 5B8AA 3UBKA 1M7TA 1F2EA 4RI6A 3QD9A 4PXOA 2V32A 4MDCA 3I9V2 3EMPA 4X43A 5J9CA 1TP9A 2R6KA 2H1GA 4WF4A 2GLRA 3FY7A 2C4JA 4BWQA 3QFBC 1WRYA 2JU5A 2PVOC 3I6AA 5INYA 2WGRA 4IELA 3IK7A 4XS4B 2NVLA 1XFLA 2H0HA 2DMMA 4HI7A 2WDUA 5DDLA 1FOVA 4ZILA 2IIYA 2H75A 5ENUA 4AJ6A 1ZGNA 4Z7XA 1QGVA 4ZB8A 4K0GA 3GUSA 2EIRA 3W8JA 2IJYA 2DJJA 1PRXA 3LWAA 4G19A 2IMIA 4EDZA 1TOFA 2DJ3A 1GWCA 1Y6EA 1YDKA 2I9HA 2QGVA 1Q98A 1LJRA 3RBTA 2VO4A 3F63A 5F8BA 1ERUA 2L6CA 3Q6OA 4ZL7A 3APQA 1T4YA 4RI7A 1BYEA 2C8UA 1O7UA 4PQHA 2AJQB 4LMVA 5E59A 4HEA2 1BQ7A 2PWJA 2AAWA 5ID2A 2PU9C 3RDWA 3L9SA 1GNEA 3WT2A 4DSSA 1TU8A 4YQVA 2V6KA 1EV9A 4NXIA 4AGSA 1SK2A 4XRDA 2IWTA 3ME8A 1GUMA 1SK1A 3N9JA 4K8MA 4NAXA 3GYKA 3EMXA 4IBPA 4HZ4A 3QFAC 3VK9A 3EURA 4RQXA 1V98A 4K7NA 1YF0A 2FA4A 4BVXA 2KHPA 4KW6A 1SD8A 1UVZA 2CA8A 3TJGA 3A2VA 5ECRB 1K3LA 3KZQA 3TJBA 1EOHA 5CRDA 2ON5A 2LV3A 1FVKA 3DD3A 4AF2A 1WWJA 4OFTA 2CT6A 2E7PA 2H0IA 2HNLA 2L6DA 5IPHA 1GTIA 1TU7A 9GSSA 4WF5A 1WP0A 2L5OA 2LJAA 4V2LA 3TOTA 2R37A 1R7HA 3F6FA 1VF4A 3HVXA 3BBYA 3CSHA 2H1AA 3HJOA 1FO5A 4WETA 4KGIA 4XRAA 2G2QA 4I97A 5AISA 2C3NA 3GTUA 4HJMA 3TKRA 2FWGA 3A2WA 4F0BA 4EC0A 2IMFA 4NWYA 3P90A 3DVWA 4MJAA 4KB3A 4TR0A 1GH2A 1PL1A 4E8EA 1NSWA 4JEDA 2FCHA 1DE1A 2HLSA 2HFDA 4WEYA 1MD4A 1X5EA 1Z7RA 3UEMA 1QMVA 1GSEA 3I43A 3DXBA 3IV4A 1GTAA 3ZYWA 3UARA 1GULA 1FG4A 1U87A 2VL9A 3AY8A 2RM6A 3FW2A 2AYTA 3A5WA 4H86A 3KM6A 3JCML 1YF1A 3TKQA 2YWOA 3EWLA 3IAM2 2O7KA 1QFNA 2L4CA 3GH6A 4MJBA 3SWLA 1DBYA 3PINA 1T00A 3DYRA 3FZ5A 3D21A 5CRGA 2PBJA 1YQ1A 5HR3A 5ECHB 1K3YA 5DQYA 1A23A 2GT6A 5HR1A 3Q74A 1XXUA 1K0NA 4XTSA 3MNGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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