1QQ2A

Crystal structure of a mammalian 2-cys peroxiredoxin, hbp23.
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
173
structure length
173
Chain Sequence
SGNAKIGHPAPSFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYVVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRAEEFKKLNCQVIGASVDSHFSHLAWINTPKKQGGLGPMNIPLVSDPKRTIAQDYGVLKADEGISFRGLFIIDDKGILRQITINDLPVGRSVDEILRLVQAFQFTDKHGEVCPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a multifunctional 2-Cys peroxiredoxin heme-binding protein 23 kDa/proliferation-associated gene product.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN PEROXIDASE 2
molecule tags Oxidoreductase
source organism Rattus norvegicus
total genus 51
structure length 173
sequence length 173
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 1999-06-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1qq2A00
2YZHA 2ES7A 3HJMA 3GL3A 2X8HA 4IGJA 5HR3A 5L71A 4N0ZA 3TKQA 2AUVA 4GF0A 5GAND 1A0RP 3KH7A 3HVVA 2HT9A 2PPTA 4ZL8A 4LMVA 1Y6EA 3MDKA 2PVOC 2CQ9A 1PX6A 1EV9A 1YF0A 5A5KA 1Q4JA 5IMDA 3A3TA 1FAAA 4ZB9A 3KCMA 3GMFA 3F9UA 2HZFA 2IMEA 4ISDA 3TOTA 16GSA 4ZL9A 1HQOA 4K8MA 2LSTA 3LEFA 2N5AA 3H93A 5J41A 2TIRA 1GL8A 2FLSA 3GX0A 1IYIA 1Z7PA 2DC5A 4LL1B 2V1MA 1XW5A 1TW9A 4F9ZA 2FHEA 4MA9A 1RK4A 5IMAA 4ID0A 2OE3A 3VK9A 3RAZA 2CVBA 2FUG2 2JACA 3QCPA 2KUCA 5CRWA 3TJJA 17GSA 1QGVA 3FEUA 3FR6A 4PNGA 1AAZA 1E6BA 5CRHA 1FVJA 3F3RA 2M72A 1M0UA 2VD1A 5J9BA 5D9XA 1K0OA 2YWIA 1QMVA 2P0GA 1XZOA 1V58A 4F2IA 2L4CA 4DSRA 4HU9A 3DMLA 4D73B 4FYBA 1B8XA 3E3EA 3W8JA 3LFLA 4TOPA 5ECPB 2H6ZA 1N8JA 4KAEA 4WR5A 1TK8B 4TXOB 1JLWA 1OE7A 3ERGA 1XWBA 1AIUA 3IOSA 3A5WA 9GSSA 1O7UA 3IAM2 3VPQA 2HLSA 3IR4A 2MMZA 3F63A 1EOHA 5GAPD 2WS2A 2CV4A 4XTSA 4QL9A 2E7PA 5EY6A 1GSSA 3KTBA 1SK0A 4Q5QA 5G31A 1THXA 5H5RA 2CVDA 4AJ8A 4XIHA 2MYGA 1EWXA 3GV1A 5B6MA 1ZL9A 2LTKA 4X1UA 1OC9B 2YJ7A 2H0IA 2KP2A 2L59A 4TR0A 2WGRA 4GLTA 5F8BA 1S3CA 1CQGA 2QSIA 5B8AA 5HFIA 1GNWA 3UJ1A 1EV4A 1GTIA 1ST9A 2O7KA 3N9JA 2FA4A 2EIOA 2VL9A 5A4UA 1X5DA 2B3SA 1K3OA 2G2QA 4ZILA 1C72A 2C1YA 3IK7A 3S9FA 2GDRA 4ILFA 3O3TA 3P2AA 1BYEA 1U6TA 1PRXA 3DGQA 5HFKA 1GSUA 1MDKA 2BTOT 4GRFA 2VLTA 4JBBA 4JR6A 1GLPA 3ZFLA 3KGKA 3UIWA 4F0CA 2NTOA 2C4JA 1F3AA 1A0FA 3F0IA 3IXRA 1XOAA 4IQ1A 4ZXGA 3BOAA 4WF5A 4EDYA 5D9TA 3CTGA 3P90A 4PGTA 4CDOA 2H76A 1XOBA 2H8LA 1J08A 3GKMA 2G0FA 2YJHA 5FHIA 2PN8A 4QQ7A 2R6KA 2HYXA 4KH7A 1GUKA 3FYGA 4NXIA 4K7OA 3HHVA 1AQXA 1YF1A 2K8VA 5D96A 4F0BA 3TB2A 1PKWA 2PBJA 2DJ1A 2V2GA 4NPBA 18GSA 4ZL7A 4L5LA 4TXVA 5AN1A 2CX3A 1U88A 4NV5A 1T00A 2EC4A 2GQMA 5G1LA 3WGEA 5HFGA 1Z9HA 2XPDA 2RLIA 2PU9C 3GYKA 5IMZA 1LJRA 2L6DA 4DVCA 3VWXA 4RQXA 4ZBBA 2C3NA 4IW9A 1TK0B 2IMDA 5A4WA 3WGDA 2H74A 7GSSA 1SD8A 5CO3A 1TK5B 4FYCA 2H75A 3I69A 3TCOA 3IV4A 4V2MA 4TRXA 5HR1A 3H8QA 2Z9SA 1B4QA 3QFAC 4L5OA 2GGTA 1WJKA 2H30A 2N5BA 4K0GA 4D73A 4POLA 4EVMA 3RPNA 1TRWA 3TJKA 1QK8A 2KHPA 4FH8A 1QXHA 1UVZA 3UBLA 2YWMA 6GSVA 5E59A 4TXOA 2HNLA 2LNSA 1AXDA 20GSA 6GSXA 12GSA 1XWAA 2RUEA 2KLXA 4WBRD 2R4VA 1ZOFA 4JEDA 1GSEA 1GNEA 1B48A 2VO4A 1AQWA 2VL2A 1PL2A 2PVQA 4G10A 2JZSA 2EIRA 4OD7A 2LS5A 2WZ9A 2B5XA 3WYWA 1XWKA 3FZ4A 4EXJA 1YKAA 3QD9A 2FWEA 2DJKA 2K6VA 3GH9A 4NWYA 3FHKA 2RM6A 1J9BA 4YAVA 3GSSA 3BBYA 2VCQA 5IO0A 4KCEA 4TVEA 11GSA 3A2VA 1J0FA 5FWGA 1TRUA 2AYTA 2H0GA 2IFQB 3ZITA 4ZBAA 1HNCA 4N0VA 2YANA 1F6MC 3Q74A 4KDYA 4EKZA 3CRUA 1X9SB 2V41A 4MF7A 2LJRA 2A2RA 4PNFA 14GSA 3NOFA 4TR1A 3LGCA 2VUPA 2JL4A 2YV7A 3APSA 1OYJA 2K18A 4J2FA 1MEKA 4XS1A 4HUAA 3M9KA 4OMVA 3FW2A 1GSFA 1JFUA 1HNAA 2I9HA 1SKWB 5F07A 2VL2C 4P3YB 3IK9A 1XW6A 1SJIA 3GSTA 2J23A 3EVIA 4L0WA 3RBTA 1ON4A 1RQMA 3GTUB 4OCFA 3UEMA 5EPFA 3I6AA 3TKSC 4KSMA 4LLRA 1YY7A 4NV2A 3KP9A 1EP8A 4MMMA 4O32A 3ZVJD 1XPVA 3TRPA 1AC1A 3KP8A 1JZDA 1FO5A 2F3MA 2JSZA 3HCZA 2K9FA 3FKFA 3FK8A 4POMA 4YAPA 2E0QA 1FOVA 2OE0A 4BPYA 5JCUA 2DJJA 1EEJA 4IJ3A 1LU4A 1TP9A 4ZBDA 2JZRA 1SKSB 2H6YA 2FNOA 8GSSA 3UARA 4NHZA 4FIWA 4BVXA 5DQSA 4ECBA 4OO5A 3UVHA 3FR3A 5AIXA 3MAKA 2H19A 3GKNA 3KMOA 3ZRDA 1X5EA 4YQUA 4V2LA 3C7MA 3L9SA 3KJYA 4I5QA 2CX4A 5FT3A 5G5FA 3FRCA 2GT5A 2X8CA 4L8EA 5ELGA 4XHMA 6GSUA 5AGYA 3QDNA 2VIMA 1X9WB 3IPZA 1ILOA 2GT6A 1XCCA 3HZ4A 1V40A 3DVXA 2LNTA 1V2AA 1AW9A 4IP1A 4K0NA 2ALBA 1WP0A 1GSYA 3M0FA 2NDOA 1A2LA 1JZOA 3C8EA 4O92A 4EE0A 3CYNA 4G9HA 4KA0A 1XIYA 1SD9A 1TTZA 2O8VB 2VCVA 3UBKA 2KOKA 1OE8A 4KX4A 4MZCA 3E0UA 2TRXA 1V98A 1THOA 2IPAA 2FWGA 2EIQA 5KN1A 1M2DA 3TJBA 4KGIA 3KXOA 4QL7A 3KTLA 1SYRA 2IWTA 3CSHA 5CAXA 2R37A 5IOXA 5COHA 2CVKA 4LA1A 1ERUA 1GTUA 1U3IA 3F6FA 1S3DA 1I5GA 5ECLB 3K8NA 3HXSA 1KTEA 3ZIVA 1PGTA 4POBA 3ZVJA 2CT6A 2GQKA 3UAPA 1NSWA 2BMXA 3HA9A 3M8NA 2P31A 5ECNB 4I6XA 5IPGA 3BD2A 2KP1A 1R26A 1MDJA 1R4WA 2AV4A 1MD3A 2QKEA 3VI7A 2MMOA 3IRAA 2WB9A 4TW5A 5ENUA 3G7YA 1QUWA 3GHAA 4OCEA 3GTUA 2HSHA 4ECCA 1PA3A 1FB6A 1NHOA 4JZQA 2DJ0A 1O73A 5A4VA 2N5FA 5KN0A 4MJAA 4N30A 4I2TA 5DVBA 1G6YA 1TKDB 1OVNA 2LQOA 1SL2B 1GULA 4YQMA 2XBQA 4GCIA 1WWJA 3DWVA 3APOA 4IP6A 2V32A 3FR9A 5GSSA 1M2BA 1XW9A 4RQRA 1H4OA 1XWGA 5B8BA 2AHEA 3ED3A 4ECJA 2PGTA 4PQHA 2PERA 3GA4A 2H01A 3HD5A 1M9AA 1F2EA 2HI7A 3FZAA 4MLYA 2WCIA 1A23A 3GKXA 4G19A 1R5PA 5IO2A 3GIXA 2HXKA 3H79A 5F06A 5D73A 2GZPA 2HZEA 2LRTA 1GTAA 5C00A 1JZRA 4I97A 2C0FA 3DRNA 4K7IA 4AGSA 4IJIA 3IE3A 2C3QA 3N5OA 3ZREA 5B6NA 3LORA 1YQ1A 1VF3A 2C0DA 4K1FA 3CTFA 3R2QA 2GTUA 5HR0A 3GURA 3D4TA 3M1GA 1O8WA 1USBA 2PMTA 3IBHA 3C71A 3CSIA 3US3A 4HDEA 2XPEA 3RHCA 4CW9A 4ML6A 4PX1A 4KUNA 4L0UA 3LG6A 3DXBA 3D21A 5LNKe 1PKZA 2XBIA 3RDWA 2H72A 3Q19A 4PXOA 5H5SA 1W4VA 5E4WA 3L9UA 3M9JA 1GRXA 1YZXA 3HZ8A 2HSYA 5ECMB 3DEXA 3PINA 5IQYA 3VWWA 1KEBA 1PN9A 2LV3A 2DIZA 4GSSA 5ECQB 1TOFA 3KEBA 1WMJA 1PX7A 2DSAA 4XRAA 6GSWA 1V9WA 1VF1A 2O89A 4WF4A 2RUFA 4MPFA 1R7HA 2IMFA 5B7CA 1O6JA 3LYPA 2I1UA 1QQ2A 4EDZA 2A2SA 1GP1A 4HOJA 3KZQA 3F6DA 2AAWA 3ME7A 1JHBA 2YPMA 2FGXA 2O87A 4ULXA 4EO3A 5J9CA 1M7TA 4IS0A 3QAVA 1VGLA 3P7XA 5EL8A 2A4VA 3LJRA 4YH2A 4PQ1A 1T7PB 1QFNA 3C73A 4KDUA 2DJ3A 4V1Ag 4TR4A 3NZNA 1M9BA 3P8WA 1JZWA 3NIVA 1EP7A 1GSQA 4TR3A 4MZWA 5DJLA 1Q98A 1XVWA 22GSA 4JRRA 4CHSA 2WFCA 2LJAA 3DD3A 4V1Ap 1K3YA 1DE1A 2C80A 2DIYA 2C3TA 2OACA 4GTUA 1Z6MA 1F3BA 1JLVA 2X8GA 2FWFA 2M80A 1ERWA 4J56E 1A2MA 5ECIB 3EC3A 4BVYA 2YOIA 3J7Yb 3CXGA 2OBIA 1WIKA 4IHUA 6GSSA 1EGOA 4EF0A 3O6TA 5AISA 3PH9A 3RPPA 1I9DA 1AUCA 3GH6A 4IN0A 2P5RA 2MZCA 3VWVA 2GVPA 3EU4A 1OC9A 1T4ZA 1K0DA 1PL1A 5DALB 1GWCA 3GN3A 1YEXA 1GTBA 1FW1A 5G5EA 5CYYA 2QGVA 2C8UA 3VPTA 1T1VA 3IDVA 2CAQA 2H6XA 2H1BA 5G1KA 5ECSA 4AJ6A 4HU7A 1TU7A 5G30A 2F8FA 2DBCA 3QPMA 2VLUA 1BQ7A 3CSJA 5DJMA 1SK2A 2OA7A 13GSA 4JE1A 4EL1A 1AQVA 5KN2A 4MPGA 3ZZXA 4MZBA 5J4UA 1T3BA 4MH3A 2BJXA 5ECOB 2CZ2A 2IJYA 3ZLPA 2VCZA 5INYA 3M3MA 2FD3A 2VLVA 2RM5A 4MCUA 4BWSA 1YEPA 3TUEA 5CNWA 4EC0A 3L78A 3BCKA 2VCWA 1MD4A 2LUSA 2F51A 2WJUA 3IA1A 4ZB6A 1HD2A 3WT2A 3DIEA 2MMAA 5IMCA 3HY2A 1K0CA 2IMKA 3VI5A 2YWOA 4MJEA 4TKYA 2CZ3A 3TOUA 3TRXA 1U87A 3QAGA 2LJKA 1XVQA 5ABRA 3GUSA 3EMXA 5DCGA 1ZYQB 4Q5RA 3WGXA 19GSA 4MJBA 2PWJA 3RHBA 3U6VA 1SK1A 4KB3A 2B6MA 1OKTA 2GZYA 3ERWA 1ZZYA 5CP1A 1N2AA 2HE3A 3SWLA 4IBPA 2H0HA 6GSTA 2GZZA 1YJ6A 2WRTA 3HVXA 2L4QA 2O85A 3BJ5A 4E8HA 5F0GA 2JU5A 5ECHB 5ECKB 1Z6NA 1X5CA 1ABAA 1SKRB 2OBKA 1UA5A 1W89A 3TRQA 2K8SA 2C0GA 1BX9A 5GSTA 1XXUA 5CRDA 5IOWA 4OFNA 1KNGA 1ML6A 3LYKA 4HJ2A 4MK3A 10GSA 2FA8A 3EWLA 4H86A 2TRCP 3EE2A 3EU3A 3QR6A 1BEDA 3TJGA 1BJXA 2GLRA 4XS6A 1A2JA 3F4TA 3JCML 3D22A 3QAWA 5IM9A 4IVFA 5DALA 1WOUA 2AJQB 3HYPA 2XC2A 2IFQA 3F8UA 1TU8A 3L4NA 2WDUA 1LBKA 3W8SA 5J5NA 2F9SA 3DYRA 1SENA 4DEJA 3EINA 2OKAA 4GWRA 4N11A 1OKDA 2H1GA 4TN8A 3G9BA 3VLNA 5DDLA 4X0XA 3UVTA 1CQHA 1SJ6A 3D4MA 2VAFA 3LXTA 1TI3A 2YP6A 4BL7A 1ZYEA 1EOGA 4HJMA 5AIVA 2VOCA 1M2AA 3ZFBA 4OFMA 1B9XC 1K0NA 4F82A 2YZUA 4K2DA 4POKA 1FVKA 2R2JA 2D2ZA 3ZTLA 1HNBA 4HZ2A 3TJFA 3U5RE 4ACSA 2WULA 4NMUA 3KH9A 4HQSA 1TRSA 3ZMLA 2LEGA 3I43A 3TGZA 5EVOA 1K0MA 4WETA 1X0RA 2JZTA 3H1NA 4AF2A 3TKRA 2ON5A 1K0AA 1GH2A 1V57A 2H73A 3UOMA 2H1DA 3TKSE 4EUYA 4J57E 1PSQA 4O5RA 3APQA 3KM6A 2HRFA 4HEA2 5F05A 3HJOA 3PGTA 3CBUA 1Z7RA 4ECIA 5C04A 2HRNA 4OWYA 3FZ9A 4HI7A 2GSRA 2MBTA 4PUAA 1ERVA 1WPIA 2REMA 5D9WA 4NHWA 1GLQA 2CAIA 1NW2A 4MH2A 2F8AA 1VF2A 5JWQB 3A2XA 2ZCTA 3ZMKA 4HS1A 2VD0A 3LWAA 1DE2A 4GQCA 3IAS2 2H71A 4G2EA 3FY7A 3H4KA 4KSOA 1A24A 4MF6A 2L5OA 2GSTA 2PUKC 3QOUA 4XCSA 3GFKA 2DMMA 1ZCPA 4BWQA 1H75A 1DBYA 4PURA 4Q5NA 4ZIJA 1ZGNA 2YCDA 5D8IA 5IPHA 2AB6A 5ECRB 2FWHA 2NBSA 3V1WA 3L0HA 2VL3A 4N10A 4TR1B 4ZB8A 1MTCA 1XWCA 3I9V2 1A8YA 3D5JA 5DBQA 3IHQA 2V6OA 1YDKA 4I2UA 4JR4A 1OAZA 3QFBC 1T4YA 3EYTA 1PD21 3E9JB 1K0BA 2OE1A 4HZ4A 4LMWA 3W6GA 1TRVA 4XS4B 3MNGA 5JCGA 3GX8A 1FB0A 5KN3A 5DAKB 2X64A 4MABA 1S3AA 5D93A 1NHYA 2B7JA 4F03A 5LD0A 3HKRA 4I8BA 2E2MA 4GQFA 1ERTA 1URMA 2I4AA 2IN3A 3C1RA 4FO5A 2L5LA 3HJPA 4LL4B 2GSQA 1WRYA 1MDIA 4OFTA 1IYHA 2B7KA 2VM2A 2VCXA 1SL1B 3EURA 2YNXA 4IKHA 5LCZA 1XBSA 2GS3A 2HFDA 3VWUA 1B9YC 1YKCA 1F9MA 2VCTA 3Q6OA 4RUVA 1BG5A 2GSSA 1E2YA 1HYUA 5ID2B 2YV9A 3DVWA 1B4PA 1U3AA 2IIYA 3LXZA 4IQAA 1T8EB 5GZZB 4X43A 1Z3EA 5D9VA 2B1LA 3F3QA 4GSTA 2OADA 3KD0A 3WT1A 5IIZA 3MSZA 3G7JA 1WE0A 3ERFA 5G2ZA 2QC7A 2LRNA 3O76A 2FY6A 2B5EA 2M46A 3EMPA 4KW6A 3TDGA 1GUMA 3J7Yk 3ISOA 3HVSA 4GSNA 3MWHA 4KE3A 1VRSD 4KNDA 4WR4A 3C1SA 4WKWA 1PMTA 5J3RA 1G0TA 3F4SA 4DSSB 1R5AA 1Y25A 3ZIJA 1XFLA 2JADA 4KCAA 2IMIA 3VFIA 1G7OA 5HR2A 3GL5A 2ZNMA 4ML1A 4YQVA 2H1AA 3F4RA 3D6IA 2DMLA 2R3XA 1PQNA 2LRCA 4K9ZA 3BCIA 1FHEA 1SJZA 3ZL5A 3UL3A 4JU5A 5IMVA 4DSQA 1UN2A 4PQIA 2B1KA 3TKSA 3GKKA 1GUHA 2NVLA 4GXZA 3LQ7A 2YN1A 3LSZA 4MDCA 1EZKA 2L6CA 3G7IA 2ZUPA 4MJCA 2R5GA 4E8EA 4Z7XA 1X9MB 4HQZA 4BA7A 1O85A 3OR5A 1VF4A 1TJDA 2E2GA 2LKUA 4WXTA 1SU9A 2XHFA 6GSYA 2MBSA 4MP4A 1M99A 2DLXA 2H66A 3TKPA 2JSYA 3KIJA 2RIIA 1EGRA 3AY8A 3GRXA 4PUFC 4XRDA 3CRTA 5JWOB 5CRGA 2X99A 2P5QA 5ELAA 3D0ZA 2B5YA 1BAYA 4K7NA 2YWNA 1OC3A 5JCWA 3ME8A 1K3LA 1DSBA 2L57A 2J9HA 4XS4A 5IMFA 4NAXA 5DAKA 4AJ7A 3DKSA 5DCHA 3FZ5A 3CMIA 3HDCA 4IELA 4MF5A 2NPBA 3VURA 2VM1A 2GQLA 1DUGA 4RI6A 2DJ2A 3UMAA 4WBJA 2H70A 1GSDA 4O7HA 3GNJA 3SBCA 1ACVA 3Q18A 5DQYA 4K6XA 4KDXA 4Q5FA 2FCHA 4RI7A 1SYXA 5H5QA 4V2NA 1O8XA 1SL0B 5ID2A 3PR8A 2I81A 2ON7A 1G6WA 2C0EA 1O81A 4WEYA 1F37A 2IL3A 2I3YA 1KBNA 3QMXA 5CREA 2LQQA 1TXXA 4FYUA 1ZMAA 1Z5YE 3WD6A 3L9VA 1OC8A 2MMNA 2V6KA 1FG4A 1UC7A 1A8LA 1EEMA 3KMNA 1RW1A 3A2WA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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