1R26A

Crystal structure of thioredoxin from trypanosoma brucei brucei
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
113
structure length
113
Chain Sequence
IRMRARYPSVVDVYSVEQFRNIMSEDILTVAWFTAVWCGPCKTIERPMEKIAYEFPTVKFAKVDADNNSEIVSKCRVLQLPTFIIARSGKMLGHVIGANPGMLRQKLRDIIKD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of thioredoxin from Trypanosoma brucei brucei
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
molecule tags Electron transport
source organism Trypanosoma
total genus 32
structure length 113
sequence length 113
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1r26A00
3ERGA 3PINA 1TRVA 3VLNA 1JZOA 1J08A 2GSTA 3IRAA 2VLUA 2C3QA 4N0ZA 3ZMKA 2JSYA 1O73A 4WR4A 1OKDA 3M1GA 4Q5NA 3AY8A 2IMEA 2KOKA 1QQ2A 3RPPA 3QR6A 1BQ7A 13GSA 2IIYA 2EIOA 2CA8A 4WXTA 3N5OA 5AN1A 2YWNA 3V1WA 4BWQA 5IQYA 3TKPA 4AJ6A 1FOVA 2NPBA 3VI7A 3APQA 1GTBA 5AISA 3UJ1A 3TKRA 4K7OA 5D9VA 1SKRB 1PKZA 4IQAA 1GUHA 4BA7A 1R26A 2GGTA 4HZ2A 2E7PA 3MNGA 4XS4A 5DDLA 4IN0A 5CO3A 2BTOT 2FNOA 3BD2A 4MJCA 4ZBAA 2FY6A 1ZYEA 4L5OA 2IFQA 1Y6EA 1AC1A 2B5EA 1MDIA 4KW6A 3QAWA 4EKZA 1A24A 2JZRA 4ACSA 4GLTA 1JLWA 3QOUA 4J57E 4YAPA 2H66A 4X43A 5ECKB 2E0QA 2VOCA 1XW9A 2L4CA 1XWAA 1T4YA 2VL2A 1FW1A 1X9SB 3F3RA 1T00A 1JLVA 1T1VA 2YOIA 3F4SA 2P5RA 2CX3A 3ZFLA 1NHOA 5ELAA 3CSIA 1ML6A 3GSTA 3C1SA 1V40A 5HR1A 3EC3A 5D96A 3NZNA 2B5XA 2WRTA 3D6IA 1O7UA 1N2AA 3FYGA 2YV7A 3EVIA 3KP8A 1OAZA 3VK9A 5HFIA 2H30A 1GTAA 3ME8A 1VGLA 1O8WA 2VM2A 1V57A 4F2IA 4XCSA 2JACA 3P8WA 1ON4A 3VI5A 4N30A 2LQOA 2K18A 2DJ1A 12GSA 4MABA 2WZ9A 4V1Ag 5DAKB 1EP8A 1WJKA 3CBUA 5CRWA 4F03A 4OFMA 1QXHA 4POBA 2K8VA 2QGVA 3GL3A 3CRUA 1U87A 4ZBDA 5IMCA 3F9UA 1EV9A 3KM6A 4EC0A 2C0GA 1Q98A 3TUEA 2AJQB 1O6JA 1A0RP 3DYRA 2IMDA 2HXKA 3GNJA 5G5FA 1FB0A 2TRCP 3UL3A 3IOSA 1K3YA 2PUKC 4Q5FA 1CQGA 1XVQA 1FHEA 2B7KA 4IKHA 3Q19A 1RK4A 1NM3A 3RHBA 3F6FA 1G7EA 4G2EA 1DSBA 6GSVA 2NBSA 3HJOA 1A2MA 2FHEA 4PURA 3HVXA 3RAZA 5CYYA 3L0HA 5ECOB 5IOWA 5B8AA 1SKWB 4KDXA 3FHKA 2VLVA 3L4NA 2PMTA 3KH9A 3OR5A 1ERVA 2DJ0A 2WDUA 2R2JA 1Z7PA 3WGDA 3GTUB 4OD7A 4HDEA 4QQ7A 1XWKA 3GX0A 3KCMA 3C71A 5ELGA 1RW1A 1X0RA 4ECCA 1HD2A 1JFUA 3LWAA 2BMXA 1ACVA 1WPIA 2XPDA 1PKWA 2MBSA 2PGTA 2CAIA 2GT5A 5IM9A 2OA7A 1M0UA 2WGRA 1GSFA 1SJIA 3DD3A 3ERWA 1SK2A 1GSEA 5G1KA 4F82A 4JR4A 2LRCA 4AF2A 2HRFA 5IMZA 3I6AA 4G10A 5J9CA 2EIQA 5A4UA 1Y25A 1M99A 2GQLA 5EVOA 3HZ4A 5IO2A 3VWWA 1HQOA 1K3OA 5IMAA 2X99A 4O92A 3HD5A 3F4RA 4JZQA 4IQ1A 3VFIA 2L5OA 3HCZA 1F37A 1WE0A 2QSIA 5HFGA 5HR3A 2L59A 3GHAA 3QAGA 2LKUA 1V9WA 4TOPA 2OBKA 1FVJA 1ZMAA 3LJRA 4MZCA 3QMXA 4NHZA 4BVXA 1O85A 3Q18A 1EEJA 4OMVA 2B1LA 4IGJA 3C8EA 2V1MA 1SKSB 3M9KA 2YN1A 4TXOB 2VL9A 3P90A 4K0GA 2OJLA 4POLA 5ID2B 2MMAA 2BJXA 3A2VA 3L78A 1WP0A 4GXZA 2GZPA 2H74A 5DVBA 4HJMA 4ZB8A 3GV1A 4HZ4A 1EGRA 3VPQA 2X8HA 1SK0A 2IWTA 5KN0A 1E6BA 4XRDA 3P2AA 1GSYA 1DUGA 1G0TA 5J5NA 5EPFA 2HNLA 3TRXA 1O81A 2PPTA 3K8NA 1MD4A 2EIRA 4WR5A 1MD3A 1FO5A 4PQ1A 2KP2A 4EXJA 4MPFA 1ZL9A 1F3BA 3NOFA 2H1AA 3LGCA 1HNBA 1MDKA 1U88A 1PX6A 1XWBA 2O85A 4LMVA 3DGQA 5FHIA 2VAFA 2R4VA 1HYUA 1TXXA 2LEGA 2MBTA 3F6DA 5ECMB 1BX9A 2MZCA 2LV3A 3CTFA 4KB3A 1TDIA 2YV9A 3F4TA 1SL1B 1DE1A 4N0VA 3LXTA 2H6YA 1LBKA 4TW5A 4GQCA 1B9XC 2XC2A 3DWVA 5CNWA 6GSWA 2WS2A 2N5AA 1AQVA 1VF4A 2VD1A 1GNEA 5DQYA 5HFKA 3PH9A 2C3NA 2RM5A 4GTUA 5D93A 1OYJA 4OO4A 18GSA 4EE0A 5B8BA 4IBPA 4FO5A 2H0HA 2X64A 5COHA 1WWJA 2CVKA 2LNTA 3DXBA 2VCQA 3WT1A 3KH7A 4RQXA 1B4QA 4K7IA 3GKKA 5F0GA 4F0CA 1A0FA 2H0IA 4FH8A 4IP1A 2H8LA 2O7KA 3ZVJA 3HXSA 3C73A 5D9TA 5HR2A 1CQHA 3M3MA 1ZZYA 3IAS2 3TOTA 1U6TA 20GSA 5D9WA 2ZNMA 5G30A 1TRWA 5H5SA 4CHSA 1SJ6A 3M8NA 1Z6MA 3EWLA 3Q74A 5F8BA 4GF0A 5GAND 1GUKA 4BVYA 3D22A 5C04A 3TRPA 4RI7A 3TDGA 5JWOB 1Z7RA 4IHUA 2VCWA 2FWEA 3IV4A 2F3MA 1TRUA 1URMA 2I9HA 19GSA 4MF5A 1K0AA 2NVLA 5IPGA 4OCFA 1PSQA 1K3LA 2DSAA 3HVSA 4MA9A 2LJRA 1Q4JA 4ZBBA 11GSA 3PR8A 2K6VA 2VUPA 3LQ7A 2C1YA 3L9VA 2XBIA 4DSQA 1YDKA 4O7HA 4BL7A 3QAVA 2EC4A 2V2GA 3CSJA 4JE1A 5DBQA 1BEDA 1B9YC 2YZHA 3W8JA 4GCIA 5D73A 3GH9A 6GSUA 5CREA 1IYHA 2V41A 4DSSB 5C00A 4HU9A 4PQIA 4OO5A 3QDNA 1EGOA 3EE2A 1AW9A 2A2SA 3LFLA 3LXZA 5GAPD 1TKDB 1ERWA 1N8JA 6GSTA 5A4VA 1T4ZA 3GIXA 2K8SA 2VCZA 3FZ5A 1X5EA 4MPGA 2O89A 2ON7A 1A8YA 1K0MA 5GSTA 4KAEA 5KN1A 3R2QA 4GWRA 1EEMA 1TW9A 5D9XA 2LSTA 2VL2C 1TRSA 1WRYA 2FA8A 2CAQA 3ED3A 4L8EA 2CT6A 4TVEA 4MH3A 5DAKA 4KA0A 1K0DA 1Z9HA 4D73B 2I3YA 2OE3A 4LLRA 22GSA 3ZRDA 1XW6A 4BWSA 2LNSA 1J9BA 2KP1A 4I6XA 3EINA 4PX1A 1I5GA 1K0CA 4MJEA 4H86A 1TK5B 4OFNA 1AIUA 4QL9A 2VL3A 3GYKA 3KP9A 1ABAA 1QGVA 5JWRB 2V32A 2H76A 3F8UA 5ABRA 3IA1A 4KCAA 2AYTA 1EP7A 4KDUA 3ZITA 4EDYA 3ZTLA 2B7JA 1G6WA 2YJHA 5JWQB 4L0UA 1V98A 4TR3A 2DLXA 2YNXA 4E8EA 2GSRA 3H1NA 4L5LA 5HQPA 3G7JA 3CXGA 3FEUA 5ECQB 2JADA 2IMFA 1M7TA 1GSQA 4K1FA 1M2AA 5B7CA 5IMDA 1QFNA 2IMIA 2XHFA 2FCHA 3N9JA 4MZBA 4AJ7A 2H6ZA 3GKNA 4FYCA 2CVBA 2IMKA 2FWHA 3QPMA 4KX4A 1KBNA 2YZUA 5A4WA 3BOAA 2YWIA 5L71A 4WBRD 1V2AA 2P5QA 1XPVA 2LRNA 2RUEA 3D21A 2L5LA 2CZ2A 4FIWA 5B6MA 2LTKA 4WF4A 1R5PA 1YJ6A 3FZAA 3GKMA 4QL7A 4XS1A 2RUFA 3TB2A 4RI6A 5DALB 1TU8A 4L0WA 4GRFA 3MDKA 5IMFA 2J23A 3KZQA 3NIVA 5AIVA 5A5KA 3A5WA 2C3TA 1A2LA 3VPTA 4HQSA 4ISDA 3G9BA 5JCWA 1BYEA 2V6OA 3FK8A 2C8UA 3KIJA 1OC8A 1GNWA 2GZYA 3WT2A 1QK8A 4MJBA 1B4PA 3LEFA 3FKFA 2PWJA 5INYA 5EY6A 3TGZA 3U6VA 5ECHB 4K2DA 1UN2A 3EMPA 3A3TA 1XVWA 4TKYA 5G31A 5G2ZA 4J2FA 4LL1B 4ULXA 1F6MC 3GUSA 4I97A 2OACA 3EU3A 2YJ7A 5ID2A 4JEDA 2IPAA 1PQNA 3BJ5A 1TU7A 3APSA 3KMOA 1JZRA 2F9SA 3TKSE 3FR3A 3LSZA 2ZCTA 3FW2A 1WOUA 1XBSA 1GSDA 5H5RA 3IC4A 1YF0A 2N5FA 4V2MA 2YPMA 2G0FA 2FGXA 2VCXA 1PA3A 3D0ZA 1YEXA 3D4TA 4N10A 1GTUA 3UAPA 10GSA 1EV4A 1XOAA 1ZCPA 4FYBA 3C1RA 5KN2A 4PNGA 2XBQA 1GUMA 1YF1A 1M2BA 5KN3A 3D4MA 4XS6A 5D8IA 4KUNA 5AIXA 3IBHA 3TKQA 4TR0A 2HT9A 2HRNA 3DMLA 4JRRA 2H1BA 4WF5A 1YY7A 2AHEA 3IXRA 5FWGA 2WJUA 4OFTA 1OC3A 2XPEA 4ECIA 1S3CA 1DBYA 1R7HA 4KCEA 4KDYA 3TJBA 4RQRA 3HHVA 3M9JA 3WYWA 1ZOFA 4EDZA 3F63A 1BG5A 3HYPA 4TR1B 2CZ3A 4Q5QA 4YAVA 4AJ8A 4XIHA 3QD9A 5ECLB 4CW9A 4POKA 2X8CA 1AQXA 4GSSA 5CRGA 1K0BA 2WCIA 5ECSA 1IYIA 1KEBA 3L9UA 2H71A 3QFBC 2C4JA 4NWYA 4MJAA 4E8HA 3O76A 2CVDA 4KH7A 2KUCA 3US3A 3D5JA 4JBBA 3W8SA 1OE7A 3DEXA 4K8MA 2R37A 3UEMA 4ZL8A 4O5RA 3TKSA 1AAZA 1ZGNA 4ECJA 2HLSA 3E0UA 5J3RA 2IN3A 1Z6NA 3KTBA 2GVPA 1FG4A 4NPBA 3U5RE 3S9FA 5HR0A 2PBJA 4IJ3A 2H1DA 2H6XA 3O3TA 3MSZA 3IAM2 1Z3EA 5ECPB 5LNKe 4TN8A 1MDJA 5AGYA 2DJ3A 5DQSA 2JZSA 3QFAC 2IL3A 2G2QA 4EVMA 3TRQA 4NXIA 4NHWA 17GSA 4I8BA 5E4WA 2FUG2 3EYTA 5EL8A 3M0FA 5IIZA 2DMMA 2QC7A 8GSSA 1XZOA 4WETA 4ZL9A 3GRXA 5G5EA 2DJKA 1NHYA 4GQFA 1W89A 2REMA 4TR4A 2VCVA 3TCOA 2LJKA 1SL2B 4PUAA 2YWMA 2HZEB 3P7XA 4KSOA 4NV2A 2PVOC 2E2MA 4K7NA 2PERA 1GSSA 2VCTA 3ISOA 2O8VB 4KGIA 4DSSA 4MP4A 4V2NA 1EZKA 5ECIB 3DRNA 3CTGA 3W6GA 2NDOA 1OC9B 3HY2A 5ECRB 2F8FA 1FVKA 2ZUPA 5F07A 3TJKA 2J9HA 4ILFA 4MF6A 5E59A 4LL4B 4DSRA 4KNDA 1B8XA 2X8GA 3TOUA 2HYXA 1ST9A 1B48A 4IVFA 4NV5A 1GH2A 4K6XA 1X5DA 3TJJA 2C0DA 1G7OA 2DJJA 4EF0A 2I81A 3KXOA 4I2UA 4XRAA 4YQMA 5CRDA 2IJYA 3KTLA 2RM6A 3DIEA 3GMFA 3ZIJA 2LS5A 3PGTA 4K9ZA 5ENUA 1BJXA 1R4WA 3ZIVA 4ZXGA 6GSYA 4WKWA 4HOJA 4K0NA 1GWCA 4WBJA 2DIYA 1QUWA 4I2TA 2JL4A 2GTUA 3G7YA 4DEJA 2PU9C 1HNAA 4IW9A 4MLYA 5J41A 3H4KA 1EOGA 4D73A 2WB9A 1YKAA 2L6DA 4FYUA 3F0IA 1SL0B 1TK0B 3IE3A 2PVQA 4ZILA 3RBTA 2GQKA 2CX4A 1A2JA 2OE1A 2H19A 1PL2A 2YCDA 1LU4A 4PUFC 4HQZA 2HSYA 4EO3A 4HEA2 3ZFBA 4LMWA 1H4OA 2AUVA 3BBYA 1USBA 4V1Ap 2DMLA 2GT6A 2C80A 3KMNA 3LG6A 3ZYWA 2VD0A 1X9MB 3IHQA 2AB6A 4RUVA 2MMNA 1XXUA 2RIIA 3ERFA 3GX8A 4G9HA 2Z9SA 1X5CA 3HKRA 5FT3A 5F06A 2K9FA 3LYKA 1KNGA 3GSSA 4YQVA 3H93A 1HNCA 3DVXA 4OWYA 2YANA 2GQMA 4X1UA 3LORA 2MYGA 1WMJA 2GZZA 4HU7A 4J56E 1F2EA 1DE2A 3ZL5A 1SYRA 4XS4B 4MDCA 5DCHA 3IR4A 5KEJA 2HSHA 3IDVA 4KE3A 2IFQB 4MH2A 1T8EB 1W4VA 2FLSA 2KHPA 3RPNA 6GSXA 5J9BA 1G6YA 4HS1A 2HI7A 9GSSA 4ZIJA 3E9JB 2KLXA 1S3DA 4IS0A 1TI1A 5JCUA 3UOMA 3LYPA 3VWVA 2DIZA 3A2XA 1O8XA 1MTCA 5J4UA 4X0XA 5DALA 3JCML 1UA5A 3ZREA 1SJZA 3IK9A 3GTUA 5IMVA 4LA1A 3A2WA 3UBKA 1GTIA 1KTEA 2A2RA 4ML6A 2LRTA 1GL8A 3UIWA 2TIRA 1TI3A 1R5AA 2I1UA 1MEKA 2DC5A 2C0EA 1VF3A 1AUCA 1SU9A 2C0FA 2R6KA 14GSA 2VLTA 2H01A 1GRXA 1J0FA 2JSZA 3UBLA 1X9WB 2MMZA 1JZWA 2R5GA 1NW2A 1LJRA 6GSSA 4O32A 4TRXA 1TJDA 1GSUA 3ZZXA 3KGKA 5DJLA 1T3BA 5IPHA 1I9DA 3CRTA 1PD21 1VF2A 2F51A 4Q5RA 1YKCA 3APOA 3TJGA 3FZ9A 4HJ2A 1THOA 3I9V2 4P3YB 1Z5YE 3RHCA 3WGXA 3KD0A 4HUAA 5DJMA 1OE8A 2ALBA 3WGEA 2F8AA 3EURA 5IO0A 2LUSA 4F0BA 3H79A 1PMTA 2H70A 4ML1A 2E2GA 1NSWA 1SYXA 3UVTA 4TXOA 4IJIA 1YQ1A 3F3QA 4OCEA 3ZLPA 4DVCA 2WFCA 4BPYA 3EU4A 2ON5A 3ZMLA 1S3AA 2L4QA 2WULA 3FR9A 1K0NA 3FY7A 3CYNA 2OADA 2M46A 2FWFA 1M2DA 5B6NA 3VURA 5F05A 2H75A 1UC7A 3TJFA 2TRXA 4KSMA 4ZB6A 1PL1A 3HJPA 3HDCA 2HZFA 4TR1A 3GA4A 1EOHA 1A23A 4N11A 7GSSA 3UMAA 1AXDA 3GURA 1VF1A 1M9BA 1TK8B 1THXA 1JHBA 1XWGA 4PQHA 4TXVA 2VO4A 2H0GA 5CP1A 3RDWA 2OBIA 3BCIA 3UVHA 1PRXA 2YWOA 4MZWA 3GKXA 4MCUA 1ERUA 4MMMA 4IP6A 1OKTA 1RQMA 1SD8A 1K0OA 1FB6A 5LD0A 4F9ZA 3ME7A 3FRCA 1U3IA 2AAWA 2OE0A 4JU5A 16GSA 2D2ZA 3DKSA 4NMUA 5IOXA 3KJYA 4ZL7A 4XTSA 3I43A 2B1KA 1TOFA 2ES7A 5G1LA 1JZDA 4MK3A 2FD3A 2B6MA 3FR6A 3HVVA 1VRSD 4ID0A 2LQQA 3CMIA 2GDRA 2O87A 2FA4A 1GLQA 3TKSC 4EL1A 1M9AA 4PGTA 3IK7A 2GS3A 5ECNB 4ZB9A 2YP6A 4EUYA 1E2YA 2PN8A 2VIMA 1C72A 4YH2A 1QMVA 2I4AA 3FZ4A 1A8LA 1XCCA 2L6CA 1GLPA 3SBCA 1XOBA 1V58A 4V2LA 3J7Yb 1SD9A 3CSHA 4MF7A 3IPZA 1XW5A 2HE3A 1OVNA 4ECBA 2B3SA 3GFKA 1ZYQB 5H5QA 1PN9A 5JCGA 3I69A 2AV4A 2HZEA 3HZ8A 2DBCA 3MWHA 4GSNA 3J7Yk 1TP9A 1AQWA 1XWCA 1H75A 4YQUA 3UARA 2CV4A 4GSTA 3H8QA 2MMOA 1GULA 4PXOA 5CAXA 2M72A 1TTZA 1OC9A 3WD6A 3EMXA 1U3AA 2VM1A 1PGTA 3C7MA 4WEYA 1SK1A 1XFLA 1XIYA 2P31A 5GSSA 3HJMA 1F3AA 2NTOA 2H72A 4PNFA 3ZVJD 1EWXA 2P0GA 2FWGA 4CDOA 3HA9A 3DVWA 2M80A 3Q6OA 3VWUA 2JU5A 2QKEA 3E3EA 2GSSA 2A4VA 2N5BA 2H1GA 3KEBA 3SWLA 2LJAA 1ERTA 2GSQA 2R3XA 1F9MA 2JZTA 3QCPA 2H73A 1SENA 2HFDA 3GH6A 5GZZB 1FAAA 4XHMA 1BAYA 4JR6A 2V6KA 5DCGA 4Z7XA 1UVZA 5LCZA 4IELA 4POMA 1T7PB 4AGSA 4I5QA 4G19A 1YZXA 4NAXA 1WIKA 3MAKA 5CRHA 2GLRA 1ILOA 3L9SA 3VWXA 2B5YA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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