1R5PA

Crystal structure analysis of kaib from pcc7120
Total Genus 27
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
27
sequence length
90
structure length
90
Chain Sequence
TYVLKLYVAGNTPNSVRALKTLKNILEQEFQGIYALKVIDVLKNPQLAEEDKILATPTLSKILPPPVRKIIGDLSDRERVLIGLDLLYEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Anabaena circadian clock proteins KaiA and KaiB reveal a potential common binding site to their partner KaiC
pubmed doi rcsb
molecule keywords circadian oscillation regulator
molecule tags Gene regulation
source organism Nostoc sp.
total genus 27
structure length 90
sequence length 90
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-10-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07689 KaiB KaiB domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1r5pA00
4I6XA 5IOWA 3GTUA 2MYGA 2ON7A 1XCCA 2DC5A 3N5OA 3GL5A 3HVXA 2DIYA 2H66A 4LL1B 3TKSA 2WB9A 3J7Yb 2VCQA 2OBIA 2RUEA 1H75A 4TR1B 1T00A 1TRWA 2IJYA 2PBJA 1FO5A 4KSMA 2OKAA 3KXOA 3ZIVA 1Q98A 1GSFA 1SJ6A 1H4OA 4AJ6A 3RHBA 2C0GA 2OA7A 1B4QA 3LYPA 1FVKA 1FB0A 3N9JA 1T7PB 1V57A 3HXSA 2GVPA 3VI5A 3Q19A 1W4VA 2REMA 4TOPA 3HKRA 2X8GA 1EZKA 1TU7A 9GSSA 20GSA 2DMMA 2VCTA 3JCML 4BWSA 4AF2A 2JZTA 2VL2C 3GURA 1XOAA 5A4VA 1FOVA 4I5QA 2L6CA 1B9YC 1X9SB 2NPBA 2VM1A 3HDCA 1A23A 1XWKA 3WGDA 1MTCA 2GQKA 4XS4A 2DJ1A 3VK9A 3QFAC 4FH8A 6GSYA 3GTUB 3FHKA 1OVNA 4MDCA 3DMLA 2H1DA 5D93A 1KNGA 5AISA 2F9SA 4V1Ag 8GSSA 10GSA 2KHPA 3KMNA 1ILOA 1O6JA 4XIHA 2MZCA 3QD9A 3TJKA 4I2UA 3ZZXA 2B6MA 3LXTA 1XWBA 1YY7A 1WPIA 2YZUA 1PMTA 1V9WA 3D21A 1YJ6A 3GH6A 3UIWA 1Z3EA 2H30A 4HQZA 1GUHA 1A8YA 5AN1A 4OMVA 2B1LA 2YWMA 3MDKA 5E59A 2TRXA 1K3OA 2GZYA 1K0BA 3FY7A 1IYIA 2IIYA 5KN2A 3RPNA 3ZLPA 4EDYA 5IM9A 1FVJA 5ECPB 2X8HA 1PA3A 4O7HA 3UMAA 1F2EA 1NSWA 1W89A 3I69A 1N8JA 4ZBAA 5IMZA 4XS4B 3KJYA 1ZZYA 2C1YA 1PRXA 1A24A 1SU9A 2FLSA 2GSQA 4HZ2A 2YWIA 1WIKA 4MF6A 4PXOA 3US3A 2WULA 2I3YA 2VAFA 3A3TA 1J08A 4N11A 1DBYA 1NHOA 5G31A 1M2AA 4KH7A 1RQMA 1OC8A 2DSAA 5ID2A 5IMCA 1AC1A 2L57A 2HE3A 3WT1A 1EGOA 4MK3A 1ZGNA 3PGTA 1OKDA 2E2GA 3WGXA 3TKPA 4IKHA 1IYHA 1R5PA 2VCZA 2C0EA 4MF5A 5IMFA 1I9DA 4PNFA 1PGTA 4GWRA 3FZAA 1OE8A 3H8QA 1M9BA 4Z7XA 2IPAA 4WKWA 5DJMA 2KLXA 1XOBA 4MPGA 2L4QA 4NV2A 4F82A 3IDVA 1OYJA 2YN1A 1ERVA 4EE0A 1GSSA 2O85A 1GNEA 1XVWA 1JZRA 2IFQA 5IOXA 4KCEA 1TK8B 3TJFA 4YQUA 5B7CA 4KSOA 4PGTA 1SJZA 2CX4A 4DEJA 1UC7A 3ME7A 4KUNA 2HSHA 4IQ1A 1B4PA 4ZL9A 4Q5QA 3GKNA 3DIEA 4GQCA 4XCSA 3D0ZA 4IP1A 4IHUA 4MLYA 3IAM2 5CREA 5CP1A 1FG4A 1S3AA 4JZQA 2H1GA 5ID2B 3DWVA 2HFDA 4G2EA 2PMTA 3Q74A 3A2XA 3VLNA 4WBRD 3FEUA 4DSQA 3QR6A 4FYBA 2LRTA 3C8EA 3HJPA 4MPFA 3U5RE 4IJ3A 3Q6OA 5EVOA 5H5SA 4NWYA 1X0RA 5DCHA 2H72A 1EGRA 2F51A 4HDEA 1DE1A 3H1NA 3HVSA 1G7OA 2GZPA 2DJJA 2QC7A 4ZL8A 3WD6A 3GKXA 3EE2A 3DVXA 2GQLA 2IFQB 5DCGA 4GF0A 4WF5A 4MCUA 1T3BA 2K8VA 4YQVA 2IWTA 2JADA 2MMNA 2JZRA 2PVOC 2YJHA 4X43A 1R5AA 4L5LA 3LQ7A 1EV4A 4G9HA 6GSSA 1SL2B 4MJEA 4IGJA 3SWLA 2I4AA 2FD3A 4E8EA 1YKCA 2MMOA 1K0NA 4OFNA 2FUG2 5DAKA 3CTFA 1KTEA 2DLXA 2OE0A 1TOFA 1AQXA 2P31A 2YPMA 5HQPA 1R26A 4OCFA 3HY2A 1GTUA 3DD3A 2FWEA 4POLA 4GXZA 5G2ZA 1XZOA 2FHEA 4YAPA 4PUFC 2H8LA 2K8SA 4JR6A 3M1GA 1SK1A 2L5OA 3M3MA 3CSIA 3GH9A 3D22A 1ZL9A 1HD2A 5HFIA 5IPGA 5ABRA 1MD4A 3TB2A 2VOCA 3LJRA 1K0OA 1PX6A 2VLTA 3NIVA 2OE1A 2V41A 2H74A 3A5WA 4K7NA 2FWHA 1VF4A 3TGZA 2YJ7A 4GCIA 4D73A 2NBSA 1GTAA 5ECLB 2CVDA 3NZNA 2C3NA 4IS0A 1WOUA 3ZYWA 3KD0A 2CQ9A 5D9XA 2L6DA 1NM3A 4J57E 1YDKA 2CT6A 1ZCPA 2AAWA 4AJ8A 1ACVA 6GSUA 4K7OA 4ULXA 2B7JA 2C3TA 1J9BA 3LORA 2J23A 5DAKB 1ABAA 5FHIA 5F06A 1XWAA 3C73A 4V2LA 1T4ZA 2PERA 1ZYEA 1TK5B 4BVXA 4MABA 1SK2A 3D6IA 2YOIA 1MDJA 3HHVA 3RDWA 4EKZA 2O89A 1AXDA 1ST9A 3D5JA 7GSSA 1Z6NA 1V58A 2E7PA 4NAXA 1TKDB 2P0GA 3MAKA 5AIXA 1GSEA 3HD5A 4ID0A 3APQA 3ZITA 2YANA 4TXVA 2C80A 3ZFLA 1SKSB 2E0QA 1G7EA 1FW1A 4D73B 4XS6A 3I6AA 2O8VB 1XXUA 1ZMAA 5H5RA 3RPPA 22GSA 3EURA 3GFKA 3QMXA 4ISDA 4MH3A 3TKRA 4RQXA 5JWRB 3L9SA 2EIRA 4HS1A 2FGXA 3L78A 4OO5A 3F6DA 2V32A 1AIUA 1EOGA 1YQ1A 2AJQB 4V2NA 4KE3A 1X9WB 3L4NA 3QAGA 4IJIA 4FO5A 2XBQA 3QDNA 1Z7PA 2JACA 3H93A 2H0GA 4X1UA 4K0NA 1SD8A 2BJXA 1SL1B 2H0IA 4WEYA 3DYRA 3QAVA 1E6BA 2N5FA 1BAYA 2FNOA 4QQ7A 3C71A 5IIZA 5IO2A 1A2LA 1PL1A 3TJGA 2JU5A 3VURA 4EO3A 3QFBC 3WT2A 3QAWA 1SKWB 2VO4A 2VLVA 4V1Ap 2TIRA 4G19A 5IMDA 4HQSA 2LQOA 4KNDA 4TR0A 1ML6A 2ZUPA 1GSYA 1UN2A 4OWYA 5D8IA 2VIMA 1ERUA 2XBIA 3IK9A 4FIWA 2LS5A 4ECIA 3EU4A 1EWXA 5A5KA 2BMXA 1TTZA 1SENA 1GWCA 2A4VA 3GSTA 2H01A 4NHWA 3E3EA 3UBKA 3BCIA 1R7HA 3FKFA 2C8UA 1F3AA 3TCOA 2X64A 4F0BA 1K3YA 5DVBA 4I2TA 2HRNA 4LLRA 2B5EA 1WP0A 1TI1A 4O32A 1F9MA 4IP6A 1K0DA 5ECOB 4PUAA 2MMAA 5ECSA 2FWFA 2VLUA 3FR9A 2WRTA 5JCGA 4F9ZA 5C00A 4WXTA 3HJMA 5CNWA 2J9HA 4QL9A 3IHQA 1A0RP 3IA1A 2B1KA 4KAEA 4RI6A 4JU5A 1TI3A 2WDUA 2GGTA 1MDIA 2CZ2A 3CXGA 1JFUA 4IQAA 4QL7A 3UOMA 2YCDA 2ON5A 2LNSA 5JWOB 5LNKe 4HJMA 5DALA 4HEA2 3VWWA 1K3LA 3FR3A 4ML6A 3O3TA 3KP9A 3CSHA 1GSDA 4IW9A 4GSNA 4MZWA 1VF3A 2EC4A 1JZOA 2MMZA 2HRFA 1O85A 3F9UA 2VL9A 1JZWA 4MF7A 4YQMA 4V2MA 2RUFA 4IVFA 2GTUA 2VCVA 3TKSE 1PQNA 2KOKA 3GKKA 1Z5YE 2X8CA 3F4SA 2CVBA 1WRYA 4XRDA 4WR5A 1GNWA 5G5EA 5DDLA 1MDKA 2Z9SA 2L5LA 2F8AA 2K9FA 5D9TA 3VWVA 3FZ9A 2IMIA 3HYPA 4ILFA 4JR4A 5EPFA 3TRQA 4JEDA 3ZVJA 5ECNB 4FYCA 2V6OA 1HQOA 3UBLA 1AUCA 2H6XA 1PKZA 2GDRA 4RUVA 4ZXGA 3HVVA 3IRAA 4MMMA 1HYUA 4XRAA 4ZB8A 2H0HA 1O7UA 5KEJA 4N0ZA 2HXKA 3F6FA 3GN3A 3VPTA 5DALB 1URMA 3M9JA 1PKWA 3F4TA 2M72A 1Z9HA 2PPTA 1O73A 2XPEA 1SL0B 5CRGA 3LFLA 2YWNA 1GUKA 5IMAA 3VWUA 4POMA 1SYXA 3ERWA 2JZSA 1FHEA 5HR3A 3ED3A 1ON4A 1TRSA 5KN1A 5G5FA 2GSRA 5ECMB 1JLWA 1AAZA 2K18A 4OFTA 3GUSA 4X0XA 3IPZA 1F3BA 1QK8A 1SJIA 2B5XA 4KW6A 3KEBA 3IXRA 3L0HA 6GSWA 4ZBBA 3KIJA 3KM6A 4ZB6A 2PUKC 3C7MA 3F3QA 3LSZA 3M0FA 3IAS2 2VM2A 3GKMA 5JWQB 2GZZA 2H75A 1RK4A 2VL2A 4HI7A 3TKQA 1YEXA 2LJRA 4EL1A 1T1VA 1DSBA 4GTUA 2FA8A 3A2WA 1EV9A 3HZ4A 4XTSA 4KB3A 1XIYA 2LKUA 5JCUA 2VL3A 3MSZA 3ZMLA 1DE2A 1GLPA 2MBSA 2JL4A 3GX8A 3PR8A 4MZBA 4K9ZA 2YP6A 1TW9A 3SBCA 3ZMKA 3J7Yk 3ZL5A 4WBJA 5F07A 2V2GA 1T4YA 2EIOA 3UARA 1BYEA 1G6YA 3FZ5A 4EF0A 4MH2A 1XWGA 2RM5A 3IC4A 3L9UA 5A4WA 2LRNA 3WYWA 3FK8A 5ECQB 3M9KA 2E2MA 2HYXA 3CYNA 13GSA 1ERTA 1K0CA 4K2DA 5GSTA 4K6XA 4BWQA 2VD0A 5GZZB 1M7TA 3VFIA 3ISOA 1GL8A 5FWGA 4H86A 4NV5A 1EOHA 3F0IA 3RHCA 4EUYA 1HNAA 3KH9A 4F0CA 1ERWA 1WMJA 4POBA 3HCZA 1XW5A 1TP9A 3TOUA 3GL3A 3TKSC 1N2AA 2R4VA 3VI7A 4I8BA 4L0WA 5B8BA 3I9V2 3BCKA 5D96A 2PN8A 2FWGA 2HZEA 1B48A 3D4MA 2ZCTA 2RLIA 3FR6A 4TN8A 5HFGA 2OJLA 4WR4A 1VF1A 1YKAA 5H5QA 2V6KA 2N5BA 2YWOA 5F8BA 1QMVA 2I81A 3KZQA 2X99A 3TRXA 5EL8A 1G6WA 1O81A 2GSTA 2OADA 2EIQA 3L9VA 5C04A 3BD2A 3UAPA 3O76A 5G30A 2H6ZA 4MZCA 4GLTA 1XBSA 2JSYA 4CDOA 2M46A 1FAAA 4EDZA 3IE3A 1OC3A 3ZVJD 6GSXA 3ZREA 4OFMA 1SYRA 3DVWA 3GNJA 1QXHA 1TXXA 1M2DA 5F0GA 4NMUA 4ECJA 1A8LA 2HT9A 1F37A 2YV7A 3WGEA 5ECHB 1DUGA 1EEMA 2R6KA 5ELAA 2C3QA 5IO0A 2B3SA 2HZEB 5DBQA 2CX3A 4RQRA 2H76A 4Q5RA 3TJBA 2IMFA 4MJCA 2FA4A 3FZ4A 1JLVA 2AYTA 1Y6EA 3GMFA 5B6MA 5A4UA 4BA7A 3LXZA 5DJLA 2O87A 2HZFA 19GSA 5ENUA 3EMXA 1SK0A 1TJDA 5COHA 2H71A 3EVIA 2QSIA 4MJBA 5E4WA 2R3XA 2KP1A 4EXJA 4OCEA 1THXA 4YH2A 1G0TA 3MWHA 3LYKA 3P7XA 5HR2A 1AQVA 3H79A 1PSQA 3UJ1A 3CMIA 1GUMA 3IK7A 3ZTLA 5L71A 4I97A 4YAVA 2AB6A 1B9XC 1PX7A 3EC3A 1BQ7A 5HR1A 3P2AA 1T8EB 4JRRA 4ZIJA 1XPVA 4TXOA 4HU9A 1VRSD 1U87A 2IL3A 3GX0A 3DGQA 3C1RA 2PVQA 5B8AA 1V40A 2LRCA 2PGTA 1THOA 4KX4A 3TJJA 5EY6A 3OR5A 5CRHA 2VCWA 1X5DA 1M2BA 3CRTA 1OE7A 4OO4A 3EU3A 2C4JA 4NPBA 12GSA 3KH7A 5IMVA 4LA1A 3F63A 2QGVA 3P90A 3GV1A 3R2QA 4GSTA 3DKSA 1TU8A 1GP1A 2VD1A 3S9FA 4GQFA 3RBTA 2IN3A 3U6VA 4ECBA 1YZXA 2NVLA 4DSRA 1PN9A 3HZ8A 1A2JA 4MA9A 6GSTA 3D4TA 1YF0A 2H6YA 2PU9C 4XHMA 3EYTA 3VPQA 1FB6A 6GSVA 1LBKA 4TKYA 4J56E 4HU7A 4TXOB 5J3RA 4KCAA 2DJ3A 2AUVA 4L5OA 4ZL7A 1XWCA 2R37A 3LWAA 1OC9A 3F8UA 3GSSA 3UEMA 1GRXA 1GTIA 1QGVA 2CZ3A 11GSA 2LNTA 2VCXA 2CA8A 1U6TA 2H70A 2L4CA 2VUPA 2DBCA 4L0UA 1R4WA 4JBBA 4KDYA 1EP8A 2OE3A 5IQYA 1X5EA 4IBPA 2WCIA 2YNXA 2B5YA 2GQMA 3BJ5A 1UVZA 3QCPA 1GSUA 4GSSA 1TRUA 1M99A 2IMEA 4ZB9A 4WETA 1EEJA 5LCZA 5AIVA 2HLSA 4O92A 4HZ4A 3ZFBA 1WE0A 2LTKA 3VWXA 5D73A 16GSA 2HI7A 4P3YB 2TRCP 3TDGA 1K0MA 4EVMA 4POKA 2HNLA 1QUWA 5CYYA 3APOA 5J9BA 1TDIA 1Y25A 3P8WA 4MP4A 1A2MA 2WJUA 2KP2A 2A2SA 5ECKB 2K6VA 1VGLA 1V2AA 4NHZA 1CQGA 5ELGA 2LQQA 2R5GA 1NW2A 2LJKA 1OC9B 3UVHA 3ERGA 2DJ0A 5ECIB 3GHAA 5INYA 1JHBA 4IN0A 1I5GA 3GRXA 3V1WA 3G7YA 5GAND 1B8XA 3DRNA 3C1SA 4NXIA 2ES7A 4TW5A 14GSA 1MEKA 1BJXA 1SKRB 3KCMA 2LV3A 3TUEA 1S3CA 3W6GA 4EC0A 4CHSA 1WJKA 2NDOA 4AJ7A 4PNGA 2YV9A 2CVKA 1OAZA 2OBKA 2H1BA 2XC2A 4F2IA 4K0GA 3EINA 3M8NA 4BL7A 1X9MB 3W8JA 3G7IA 4O5RA 2GT5A 2NTOA 2F8FA 2OACA 5JCWA 3K8NA 3MNGA 1QQ2A 1O8WA 3ERFA 2CV4A 3ME8A 2G2QA 3ZRDA 3HA9A 4PQHA 1JZDA 3LEFA 5CRWA 1ZYQB 1XW6A 4ZBDA 3PH9A 4HUAA 2C0DA 2WZ9A 4JE1A 5J41A 4CW9A 1ZOFA 1GH2A 1TRVA 2V1MA 3Q18A 2WS2A 3APSA 1A0FA 3QPMA 2F3MA 3PINA 3EMPA 1YF1A 2G0FA 3BBYA 5D9WA 5HR0A 2GT6A 4L8EA 2AHEA 1M9AA 1UA5A 3HJOA 4WF4A 1KEBA 3FRCA 1KBNA 4G10A 5J4UA 4N0VA 2DMLA 4N30A 5CO3A 1Q4JA 2C0FA 4MJAA 2AV4A 3NOFA 5G1KA 4ZILA 3CRUA 1GTBA 2GS3A 2WFCA 18GSA 2MBTA 4K8MA 4XS1A 4TRXA 4HJ2A 1GULA 2LJAA 4DVCA 3TOTA 4OD7A 5ECRB 4E8HA 4PQ1A 4RI7A 5G1LA 1XW9A 1AQWA 2O7KA 3DXBA 3KTBA 3KP8A 5HFKA 5LD0A 2XHFA 5CAXA 1X5CA 2RIIA 1GSQA 1O8XA 1S3DA 5J9CA 3GA4A 4FYUA 4GRFA 5GSSA 2I9HA 5IPHA 1CQHA 2FCHA 2L59A 2H1AA 1NHYA 5CRDA 2H73A 1BEDA 1U3AA 1HNBA 5GAPD 2P5RA 2P5QA 2D2ZA 1HNCA 4TR3A 3GYKA 4KA0A 3F3RA 3FW2A 5F05A 1V98A 2N5AA 4BPYA 5B6NA 3EWLA 4ECCA 2DJ2A 1BX9A 2HSYA 3G7JA 1LJRA 1WWJA 1XVQA 3IV4A 4K7IA 4DSSA 1TK0B 3G9BA 3IOSA 1EP7A 1E2YA 2LSTA 2ALBA 1USBA 1LU4A 3KTLA 3LG6A 3CSJA 2IMKA 4HOJA 3IR4A 2LUSA 3W8SA 3E0UA 1GLQA 1SD9A 3CTGA 1Z7RA 4KGIA 3F4RA 4ACSA 3E9JB 4J2FA 5D9VA 1MD3A 2JSZA 4PX1A 4KDUA 2PWJA 5AGYA 2WGRA 2DJKA 4KDXA 3AY8A 1C72A 1AW9A 1VF2A 4TR4A 1QFNA 4BVYA 4F03A 3QOUA 2GLRA 2FY6A 1F6MC 1PL2A 1U3IA 3KMOA 1M0UA 4Q5FA 3LGCA 3KGKA 4N10A 3I43A 4PURA 2XPDA 2ZNMA 3FYGA 2GSSA 5KN0A 2B7KA 2DIZA 4AGSA 4LL4B 4TR1A 1K0AA 3DEXA 4Q5NA 1J0FA 3O6TA 1BG5A 2A2RA 4DSSB 3TRPA 2BTOT 3A2VA 3BOAA 4LMVA 4LMWA 2R2JA 1PD21 2IMDA 4IELA 1RW1A 3ZIJA 4PQIA 1Z6MA 3CBUA 2QKEA 2LEGA 3UVTA 1U88A 17GSA 5DQSA 2M80A 1YEPA 3IBHA 4K1FA 5FT3A 2I1UA 2CAQA 5KN3A 3GIXA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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