1R5PA

Crystal structure analysis of kaib from pcc7120
Total Genus 27
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
27
sequence length
90
structure length
90
Chain Sequence
TYVLKLYVAGNTPNSVRALKTLKNILEQEFQGIYALKVIDVLKNPQLAEEDKILATPTLSKILPPPVRKIIGDLSDRERVLIGLDLLYEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Anabaena circadian clock proteins KaiA and KaiB reveal a potential common binding site to their partner KaiC
pubmed doi rcsb
molecule keywords circadian oscillation regulator
molecule tags Gene regulation
source organism Nostoc sp.
total genus 27
structure length 90
sequence length 90
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-10-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07689 KaiB KaiB domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1r5pA00
3GL3A 5DDLA 4HQSA 1ZYQB 5CAXA 3LSZA 4TXVA 1TI3A 3FW2A 1XW6A 1WWJA 3HJPA 1J9BA 5J41A 1BYEA 3GH9A 4ZB6A 2B5XA 3QDNA 2CV4A 1O8WA 2GSQA 2K8SA 4BVYA 2QSIA 5JCWA 4FYUA 2DIZA 1WRYA 4GSTA 4J56E 6GSWA 2CAQA 4DSQA 4EC0A 2KUCA 1B48A 9GSSA 2I1UA 2GVPA 4MH3A 2RM6A 1ZL9A 4TW5A 2C0EA 3FHKA 1VF1A 14GSA 5D8IA 5CREA 5EY6A 2F8FA 3F6FA 2L6CA 1OC9B 5B8AA 5F07A 1YEXA 2XC2A 5KN2A 4NAXA 4J2FA 4ZL9A 2CZ3A 4PURA 2HFDA 4JU5A 2YWOA 3UMAA 4ML1A 2D2ZA 4XRDA 2AJQB 3GNJA 4HQZA 3M0FA 3DYRA 2R5GA 1TW9A 1JZDA 5ECPB 3C7MA 2MMNA 1SKWB 4N10A 2H73A 3TJJA 2VIMA 3P2AA 2YWIA 2R6KA 3WD6A 2LJAA 3O76A 3MNGA 3FK8A 3TOUA 4FYBA 2ZCTA 4GSSA 1XIYA 1WPIA 5JCGA 3GFKA 4DSSB 2DJKA 3PH9A 5A5KA 5DAKB 1T8EB 5IOXA 1THXA 3QFAC 3TKPA 1TI1A 4I2UA 3HD5A 4V2LA 1SD8A 2B6MA 3KM6A 3HA9A 3BD2A 2VOCA 3DVWA 1RK4A 1Z6NA 1PL2A 3GIXA 4BPYA 2J23A 3EU4A 4WXTA 3ZMKA 2HZFA 5IPHA 2YWMA 2F8AA 3A2WA 3DD3A 3CMIA 3C71A 3TGZA 1ERUA 2O85A 3PR8A 2C0DA 1PRXA 2C3TA 4RUVA 1A2JA 1OYJA 4IN0A 3L9SA 2KHPA 4WKWA 2FD3A 1TRUA 1XBSA 3CTFA 5DCHA 4KCAA 6GSVA 3ZVJA 5CRWA 2Z9SA 4O32A 3L9VA 2YV7A 1V2AA 4N30A 4F2IA 5JWQB 2WZ9A 3CTGA 4ILFA 4JZQA 4ZB8A 2EIQA 4HI7A 1GSSA 4WF4A 2HYXA 3EURA 1AXDA 4F0CA 2AB6A 2R2JA 1O85A 2IFQB 4ZBDA 1TTZA 4EL1A 3FZ9A 3C73A 3P90A 3WT1A 2R4VA 4L5LA 5JWRB 2OADA 4D73B 3UBLA 3ZMLA 4LA1A 1XPVA 5G5EA 4GF0A 3IE3A 6GSXA 1HYUA 1U87A 3APSA 1K0OA 2DJ3A 4V2NA 1KTEA 2B7KA 3KP9A 1X5CA 5DQYA 1GLPA 1GSFA 4IVFA 4QL9A 2R37A 2LS5A 1SJZA 2WJUA 3GYKA 2HT9A 5DALB 2AAWA 4JR4A 2P5QA 3F4SA 2OKAA 1BG5A 1EP8A 4I6XA 1HNCA 1JZWA 3EU3A 4CDOA 3KP8A 2XPEA 5INYA 4MJBA 4EDZA 4WR4A 4PX1A 1PN9A 4F9ZA 4FIWA 1QUWA 1XWBA 3IPZA 5H5RA 1AC1A 1BEDA 4GCIA 3M9KA 4WF5A 1M9BA 2C0GA 4MMMA 3TJKA 4OD7A 3BOAA 2DBCA 2FLSA 1URMA 4N0ZA 1NW2A 2VAFA 5FWGA 4IGJA 11GSA 1XVQA 5B6NA 3CRTA 8GSSA 2A4VA 2WB9A 1QK8A 3AY8A 4MPFA 2HZEB 1DUGA 1AAZA 3D6IA 3DKSA 4H86A 3I69A 3QD9A 1M9AA 4K2DA 2PVQA 4IBPA 3IOSA 5DJMA 3I9V2 4Q5QA 4LMVA 1BJXA 5D9TA 3UIWA 5F8BA 3TJGA 4XS1A 1OC9A 5GZZB 1K0BA 2VD0A 1PKWA 3GL5A 3KD0A 1PL1A 4ZBBA 4PUFC 3HZ4A 2WRTA 5E4WA 5F0GA 1SU9A 4EVMA 4G10A 1ZCPA 3D0ZA 4TRXA 1ZOFA 1NHOA 1Q4JA 2HSYA 4JBBA 5D9XA 3UL3A 4TVEA 1TRVA 5J4UA 4N11A 2JSZA 2M80A 4QQ7A 1Q98A 4HJ2A 4KB3A 5H5QA 3EMPA 3HYPA 3LXTA 3LYKA 4EO3A 1AIUA 3L0HA 3OR5A 3CBUA 4TN8A 2VCZA 4DSSA 2R3XA 2YJHA 5DAKA 3EWLA 2H1DA 4ML6A 2MZCA 2HSHA 2X99A 1A2MA 3KZQA 3K8NA 1V9WA 1EEMA 1A23A 3HJOA 4IS0A 4ZL7A 1OC8A 1WP0A 3TUEA 2VM2A 3HXSA 4PQHA 2KOKA 4TR0A 4KCEA 3H8QA 2IMEA 2RUEA 2F51A 1K3YA 2PPTA 3DXBA 3FEUA 4LMWA 2JADA 2DLXA 2X8CA 5EPFA 2DMMA 1DE1A 2L4CA 3QPMA 1GNWA 1G7EA 1OC3A 2TIRA 3ISOA 4PNGA 2PMTA 3FZAA 1CQHA 2PBJA 1B9YC 2XHFA 5ECMB 2HLSA 1T7PB 3LORA 4K1FA 1FOVA 3UAPA 1GSEA 1EV9A 2MBSA 4HU7A 1U3AA 2I81A 2VO4A 3KMNA 3A3TA 3FR6A 3QMXA 3GKKA 5ELAA 1I5GA 1ZMAA 3KH9A 4POKA 3DIEA 3LEFA 2TRXA 6GSSA 4L5OA 1T00A 2RIIA 3FZ4A 4GWRA 2YZUA 2JL4A 1M0UA 1EP7A 3HKRA 1G6WA 5A4WA 5ECOB 4ZBAA 2YPMA 4ECCA 2NVLA 3ZITA 5A4UA 3IAM2 3GKXA 4TR3A 1OE7A 4YQMA 3ZRDA 1WOUA 3H1NA 2B1LA 2L5OA 1GWCA 5LCZA 3EYTA 2YV9A 2H1GA 3E9JB 1PSQA 1XFLA 4POMA 4WR5A 2C0FA 3C8EA 5G5FA 3DGQA 2GQKA 5IMDA 3IK7A 2OE0A 2GZZA 4BL7A 4LL4B 4QL7A 2GZPA 4AGSA 5DALA 5ELGA 1K0NA 2L59A 1E2YA 1S3AA 1TDIA 1JLVA 2PGTA 2H71A 5AN1A 4OCEA 1X0RA 4G19A 3TCOA 3ED3A 3APOA 2F9SA 2IMFA 1FW1A 2YCDA 1K3LA 3EC3A 2IN3A 5D73A 3H79A 3IBHA 3DVXA 3GHAA 4K6XA 1XOAA 5D93A 1EGRA 1B8XA 3QR6A 5HR2A 3W6GA 1UVZA 4TR4A 2CQ9A 2HZEA 2H01A 4KH7A 2YWNA 4TOPA 1AQXA 3VURA 1JHBA 2OJLA 1F3AA 5D96A 2DC5A 4E8EA 2H30A 4PXOA 5J3RA 4O7HA 1UA5A 1B4QA 3GN3A 3R2QA 2A2SA 3ME7A 2QC7A 4TR1A 3QAGA 2E0QA 1T3BA 3IAS2 2XBIA 3SWLA 5IMVA 1YJ6A 4MCUA 1G6YA 2VL3A 4KA0A 4XS6A 4OWYA 5HFKA 5KN1A 2NBSA 3TB2A 1SYXA 2O8VB 1X5EA 2P5RA 2FY6A 2VM1A 1A0RP 4YAPA 1GL8A 5ECSA 2B5EA 3D5JA 2H0IA 4OO4A 3TDGA 1VF2A 4XCSA 3WT2A 2CZ2A 1R26A 4I8BA 4BVXA 4V2MA 1F9MA 2E2MA 1ML6A 1T4YA 3HZ8A 2L6DA 4RQRA 2GQMA 1B4PA 5CRGA 5KN0A 2IPAA 2OE1A 4G9HA 5C04A 4ECBA 1WMJA 1THOA 2EIRA 4FO5A 1M2BA 2DJ2A 4MK3A 3WGXA 1MD3A 2HE3A 1ZZYA 1HNAA 1ILOA 2BTOT 4GXZA 2N5FA 5DVBA 2VLTA 2IMDA 3ZFBA 3GTUB 1EOHA 3LQ7A 3CSHA 3GA4A 2L5LA 3F4TA 4MABA 1SENA 18GSA 1E6BA 3LGCA 1PX6A 1Z7RA 1XWAA 2C80A 1O81A 5ECRB 4DEJA 4AJ8A 5B8BA 3N5OA 3Q74A 4OFMA 4GTUA 5ECLB 2REMA 22GSA 3KMOA 3CXGA 3HVXA 3N9JA 1K0AA 2FUG2 4OO5A 3RAZA 4P3YB 3RHBA 1U88A 4RI6A 2O7KA 3HHVA 4IQ1A 1Z3EA 3O3TA 3GKNA 3QFBC 1UC7A 1GTAA 3H93A 1U3IA 3VWWA 3L4NA 4MJEA 1PA3A 4J57E 3KGKA 3M1GA 2CX3A 3RDWA 1O73A 1TOFA 4L0WA 1R7HA 5JCUA 4NWYA 3EVIA 5IPGA 1EOGA 2BJXA 3S9FA 2LV3A 20GSA 4MZCA 4EKZA 1OAZA 1N2AA 5C00A 3F0IA 1XW9A 5LD0A 3E3EA 2B1KA 3DMLA 1SJIA 5EL8A 1SK2A 1QMVA 3F3QA 3UARA 3UEMA 2X8HA 1AW9A 5G1KA 1PMTA 2NPBA 3FR3A 2ES7A 1G0TA 1GSYA 2JZSA 3I43A 3D22A 5HFGA 1X9WB 4IKHA 2WCIA 1VF3A 1WIKA 5D9WA 3CRUA 5CRDA 2V2GA 4IP6A 3UJ1A 3NIVA 4NV2A 4XRAA 1FVKA 1KBNA 5IMFA 2GQLA 1YDKA 2V41A 3TRXA 3ZLPA 4EDYA 3CYNA 4G2EA 1SKSB 3J7Yk 5HFIA 2EC4A 3VPTA 1XXUA 5CO3A 3D4MA 4EUYA 1VRSD 1Y6EA 1GP1A 1ZYEA 2IMKA 2LTKA 2C3NA 2IIYA 3CSJA 4TR1B 1XCCA 3VLNA 4MDCA 5IOWA 2CX4A 2B7JA 4F82A 2M46A 2V6OA 2H6XA 6GSUA 5G1LA 1A8YA 3E0UA 4V1Ag 1GUHA 2I9HA 4IP1A 1W89A 1USBA 4IELA 2FWGA 2V32A 4EXJA 4MZWA 4AJ6A 1XVWA 3MSZA 3FRCA 2LUSA 4DSRA 1ERWA 1B9XC 1AUCA 4E8HA 2H8LA 4DVCA 3U5RE 1J08A 1Z5YE 5AISA 4LLRA 2IJYA 3IHQA 2H0HA 3MWHA 1A24A 4XTSA 4MLYA 5B7CA 1GRXA 5ENUA 4WBRD 3FZ5A 4KSMA 1TKDB 3ZREA 1H4OA 5E59A 2LQQA 2LRTA 3KTBA 3J7Yb 1ON4A 2JZRA 1VGLA 3D21A 1PGTA 2RUFA 1J0FA 4TXOA 3LFLA 4KAEA 2OBKA 1Z6MA 2WDUA 4F03A 3KJYA 3QCPA 4NV5A 1MTCA 2PUKC 2V1MA 1ERTA 2O87A 1TJDA 6GSYA 5LNKe 2VL9A 1TU7A 2GLRA 3P8WA 4HJMA 1NSWA 3V1WA 1RW1A 2V6KA 1FG4A 3A2VA 1DSBA 2OE3A 4POBA 4Q5FA 3DEXA 5CRHA 4GRFA 2CVKA 3IXRA 1JZRA 4K0GA 1ZGNA 2A2RA 4JE1A 2C8UA 3HJMA 2FNOA 2LNSA 3ERGA 5GAPD 3IV4A 3FKFA 4HUAA 1M7TA 1YY7A 4FYCA 2HXKA 3GTUA 3WGDA 4OMVA 2H75A 2X64A 1R5AA 2VCVA 4MJAA 1DE2A 4EE0A 2L4QA 1M99A 4XS4B 4JEDA 1SKRB 2HRNA 2AUVA 1Z7PA 1OVNA 5IO0A 4KDXA 4KUNA 1OKTA 3TKSC 2FHEA 1ABAA 1JLWA 2LKUA 1EZKA 2K9FA 2N5BA 5FHIA 3GV1A 4WBJA 3JCML 3HVSA 4LL1B 2GDRA 2L57A 4MF7A 1HNBA 1FAAA 3Q6OA 1YKAA 4K7NA 1S3CA 2MYGA 2VD1A 3Q19A 3ZYWA 2JACA 2CVBA 4GQCA 3CSIA 4MP4A 4O5RA 4MPGA 4ZIJA 2DJJA 2J9HA 2PVOC 10GSA 4KE3A 2H1AA 2VCXA 2H6ZA 5G2ZA 3ZL5A 3QAVA 5IMAA 3ZIJA 1K0MA 4KW6A 3LYPA 1M2AA 3VWUA 2YJ7A 4Q5RA 4ECIA 4KSOA 5IO2A 1UN2A 4OFNA 3VWVA 5AGYA 1QGVA 4PQIA 1GUMA 1TXXA 2OBIA 2JSYA 3QAWA 1VF4A 3G7IA 2IL3A 3GH6A 2YN1A 3P7XA 5F06A 3TJFA 3F8UA 1GSQA 3W8SA 1MEKA 4CHSA 3SBCA 4NPBA 2GSRA 4ZL8A 3Q18A 1GNEA 3TRQA 4KGIA 3VPQA 4Z7XA 5ECHB 1AQVA 3MDKA 3IA1A 2XBQA 2AYTA 1BQ7A 5J5NA 2WGRA 5COHA 4Q5NA 2CAIA 4HZ4A 1N8JA 1A2LA 3KXOA 4YQVA 4WEYA 4IQAA 1O8XA 2C4JA 4ID0A 3VK9A 5IMZA 2ZNMA 4K7OA 1SYRA 3GX8A 3ZVJD 4ISDA 3F9UA 3GMFA 3WGEA 4TKYA 2VUPA 1BX9A 1OE8A 1PQNA 1MDIA 1ST9A 3GKMA 4KDUA 4HU9A 1BAYA 4RQXA 3GUSA 1HQOA 2E2GA 1Y25A 1MD4A 1FO5A 2VCQA 4YAVA 2H76A 3KH7A 4I97A 1YEPA 3IK9A 4NHZA 2XPDA 2VL2A 1RQMA 3G7YA 3A5WA 3TKSE 3US3A 3HY2A 2G0FA 2I3YA 2GZYA 4CW9A 1JZOA 2MBTA 3F4RA 3NOFA 3ERWA 4V1Ap 2O89A 2DIYA 5DJLA 2ON7A 3GX0A 3PGTA 1JFUA 2PERA 3BJ5A 2RM5A 3WYWA 4N0VA 1F6MC 4IW9A 4TXOB 2WULA 1R4WA 3MAKA 1U6TA 1QFNA 4PUAA 2G2QA 4ZXGA 3BBYA 4X0XA 2NTOA 5HR0A 3L9UA 5H5SA 1TRWA 4KDYA 5B6MA 1NHYA 1TP9A 2DMLA 1W4VA 1TRSA 1O6JA 1PD21 1KNGA 5G31A 2YANA 2EIOA 4YQUA 4AJ7A 2MMAA 3IR4A 4GQFA 3IRAA 2BMXA 1HD2A 2PU9C 2RLIA 4FH8A 4ULXA 2FA4A 2VCWA 4L0UA 4ACSA 1X9MB 4X43A 5HR3A 1S3DA 1O7UA 3UBKA 2LEGA 4NHWA 2C1YA 4XHMA 1PX7A 2LQOA 1WJKA 3IDVA 2NDOA 1IYHA 1FB0A 4HZ2A 1K0DA 1SD9A 4MJCA 2JZTA 2H74A 3D4TA 3VI5A 2B5YA 2H72A 3U6VA 1XOBA 3IC4A 2WFCA 2VL2C 5ID2A 3C1RA 5CNWA 5IMCA 1EV4A 1XWGA 2GT6A 3RHCA 5ECQB 4I2TA 1FHEA 1GTUA 4I5QA 1MDKA 1TK5B 3H4KA 4MH2A 4HEA2 5GSTA 4MF5A 1M2DA 3GSTA 4XIHA 4MZBA 4XS4A 1EGOA 2DJ0A 17GSA 4IJ3A 2FWFA 2YP6A 3TKQA 3VI7A 2FA8A 4OCFA 1LBKA 1XWKA 2AHEA 2H19A 2X8GA 2PWJA 1GSUA 2LSTA 2HRFA 2KLXA 1SL0B 5A4VA 5HQPA 4IHUA 5JWOB 1GLQA 2I4AA 3O6TA 1A8LA 3RPNA 3M8NA 4AF2A 5ECIB 5J9CA 4K8MA 5IIZA 5J9BA 3TJBA 1WE0A 4PNFA 2DJ1A 2PN8A 1OKDA 1Z9HA 5L71A 3ZFLA 1V58A 4POLA 4K9ZA 5GSSA 5FT3A 2MMZA 4GLTA 3VFIA 1YQ1A 4K0NA 3C1SA 2GS3A 1LJRA 4JR6A 1TK0B 1K0CA 1H75A 2CT6A 5KN3A 4PQ1A 4ZB9A 3HCZA 3M9JA 5ABRA 1AQWA 3G7JA 2HNLA 2VCTA 5AIVA 3LWAA 3FY7A 4ZILA 5DBQA 2ON5A 2IWTA 2K8VA 3UVTA 2VLUA 1I9DA 1DBYA 1GSDA 3ZZXA 3TKRA 2C3QA 2ALBA 3FR9A 3A2XA 1TU8A 1K3OA 5ECNB 1V40A 1EWXA 5DCGA 2H66A 5HR1A 1G7OA 2LRCA 2K6VA 2K18A 4WETA 2H0GA 3GRXA 1GUKA 3GSSA 2IMIA 3KCMA 5AIXA 1YF0A 19GSA 2GTUA 1ACVA 4EF0A 7GSSA 4MA9A 2TRCP 3ERFA 4NMUA 2KP1A 5IQYA 2N5AA 2B3SA 3HDCA 1V57A 3LXZA 1PKZA 1X5DA 3TKSA 5IM9A 13GSA 4ECJA 2QGVA 3RPPA 1F3BA 3ZTLA 1V98A 3BCIA 1TK8B 2MMOA 1XZOA 2CVDA 2FWHA 3KTLA 2P31A 2P0GA 2ZUPA 3RBTA 3PINA 2FCHA 2GSTA 1YF1A 3ZIVA 1SL2B 1IYIA 4YH2A 1T4ZA 2KP2A 3DWVA 4PGTA 1XW5A 2YOIA 3L78A 2H70A 1A0FA 3GURA 16GSA 1GTBA 5EVOA 1FB6A 5CP1A 4IJIA 2GGTA 2HI7A 4NXIA 2QKEA 4KX4A 4HOJA 2F3MA 4JRRA 3G9BA 1F37A 4BWSA 1T1VA 1MDJA 3QOUA 5D9VA 1CQGA 3F63A 2VLVA 5ID2B 2FGXA 4BA7A 4OFTA 1SK0A 1GULA 3TOTA 3APQA 1QQ2A 1XWCA 2YNXA 2LNTA 3HVVA 5KEJA 1GH2A 2OACA 3VWXA 3FYGA 3UVHA 1FVJA 3DRNA 4L8EA 2OA7A 3I6AA 2LJKA 3EMXA 2JU5A 1SK1A 3LJRA 5GAND 1YKCA 4RI7A 3EINA 1SJ6A 2DSAA 3F3RA 2LRNA 4O92A 4KNDA 2YZHA 3KEBA 2E7PA 4X1UA 3F6DA 1YZXA 2FWEA 1GTIA 3BCKA 4HS1A 2CA8A 3UOMA 2WS2A 3ME8A 1ERVA 4BWQA 2AV4A 2IFQA 1X9SB 2GT5A 5CYYA 5F05A 1LU4A 6GSTA 4K7IA 4GSNA 3TRPA 3KIJA 1NM3A 2H6YA 3LG6A 1R5PA 1C72A 2LJRA 4D73A 1KEBA 5DQSA 12GSA 2H1BA 1QXHA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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