1R5PA

Crystal structure analysis of kaib from pcc7120
Total Genus 27
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
27
sequence length
90
structure length
90
Chain Sequence
TYVLKLYVAGNTPNSVRALKTLKNILEQEFQGIYALKVIDVLKNPQLAEEDKILATPTLSKILPPPVRKIIGDLSDRERVLIGLDLLYEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Anabaena circadian clock proteins KaiA and KaiB reveal a potential common binding site to their partner KaiC
pubmed doi rcsb
molecule keywords circadian oscillation regulator
molecule tags Gene regulation
source organism Nostoc sp.
total genus 27
structure length 90
sequence length 90
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-10-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07689 KaiB KaiB domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1r5pA00
1XWKA 4OO4A 1T1VA 3MNGA 4ML6A 1UC7A 3IR4A 3AY8A 4K0NA 5L71A 1GP1A 2H73A 5J3RA 2LUSA 3QAVA 1V9WA 2B7JA 2N5BA 1BYEA 2XBQA 4IBPA 2JACA 2R4VA 4AGSA 1WPIA 1QQ2A 3RDWA 1UN2A 3BD2A 1FB6A 1R5PA 4IP1A 4AJ8A 4XS6A 1BX9A 1JZDA 4HJ2A 4MH3A 4ZB6A 4ZL7A 1QUWA 4CW9A 1AIUA 3G7YA 1JFUA 4F9ZA 4MJAA 5C04A 3QDNA 3Q19A 2FD3A 3EYTA 4LMWA 1GSEA 5IMAA 2PU9C 4KA0A 6GSTA 1OC3A 2DSAA 1YF0A 2LQQA 3ZFBA 1GSUA 1J0FA 3CSIA 3N9JA 1WMJA 1O73A 3IOSA 5IMCA 1EP8A 1KTEA 2WS2A 1SU9A 1YDKA 3ZMLA 3RBTA 1RK4A 2C80A 5JWOB 2O87A 1B8XA 2P31A 3HYPA 2M46A 4ZB9A 5GSSA 5G1LA 5IMFA 2E7PA 3ZIJA 1PRXA 3QR6A 4HQSA 2FHEA 5HFKA 4G10A 3G7IA 3LORA 1TI3A 3UVHA 2AV4A 3HCZA 4POMA 2IIYA 3D22A 2YN1A 5ECNB 1BQ7A 2CQ9A 2OE0A 4NV2A 2CAIA 2HLSA 5INYA 5EL8A 1M2BA 3KH9A 2GSTA 4WXTA 1R26A 2H74A 2VCWA 4TXOA 1E6BA 1HNCA 2H72A 3H8QA 2WGRA 1PKZA 1M9BA 3VWUA 3O6TA 3UMAA 3KM6A 3VWWA 2AUVA 2DLXA 1F3AA 3IBHA 5KN2A 1EWXA 3TKQA 2WJUA 2O85A 4EXJA 2ZNMA 3F9UA 5DALB 3GHAA 3CSJA 4JRRA 3N5OA 4IS0A 3DEXA 3F4SA 3KZQA 4EDZA 3S9FA 2IL3A 2V6KA 3OR5A 2XHFA 3APQA 3F6DA 2AAWA 1DE1A 3U6VA 1GUMA 2VM2A 7GSSA 1FVJA 3UVTA 2CVBA 2C3QA 5EVOA 2TRXA 5DQYA 1DE2A 4PURA 1GSYA 2GLRA 5ECIB 4FIWA 2F8FA 3FZ5A 5B6NA 2YWNA 4HOJA 1TRUA 3DD3A 3R2QA 4BVXA 3WGEA 4KDUA 4TR1B 2VCXA 2MMZA 2NPBA 5IMDA 3A2WA 1MDJA 4L0WA 2C0GA 3PGTA 11GSA 1ZGNA 1ML6A 4ZBAA 1OYJA 5IO0A 2ZUPA 2OACA 2YWIA 1M2DA 2L5LA 4PGTA 4GSNA 1WOUA 3IAS2 3TJBA 5B6MA 1V57A 1F2EA 1NSWA 4WEYA 1RW1A 1AQVA 4EVMA 1H75A 1PKWA 3P8WA 4WBJA 3APSA 3C71A 3FR6A 2JSZA 4NWYA 1JZOA 3FKFA 1VF4A 3ERWA 1GLPA 2C0DA 4E8HA 4GQCA 2OA7A 1ST9A 4GF0A 3Q6OA 2C3NA 1TK0B 3FR9A 3ME7A 1PL1A 1Z5YE 2NTOA 3CRTA 4NXIA 1YZXA 2MMOA 1YQ1A 3FZAA 2BMXA 3HHVA 5KEJA 3D4TA 2L5OA 5DALA 3C1RA 3HZ4A 4YH2A 5GSTA 1F37A 6GSUA 5D9XA 3DWVA 4H86A 4DSSB 2LRNA 1HD2A 3A5WA 2GGTA 3EU4A 3TCOA 2HSHA 2REMA 1OKTA 1U3AA 2HRFA 2H71A 3NOFA 1X9MB 3F8UA 4Q5RA 1TK5B 1F3BA 3VFIA 5FT3A 3QPMA 3IK9A 4IHUA 3RPNA 1N8JA 4IQAA 4G2EA 5HR3A 1DUGA 5DJMA 3TRXA 3W8SA 4QQ7A 5F8BA 2GZPA 4K7IA 2IMKA 4NV5A 4TR1A 1XZOA 3WT2A 4I97A 3GX0A 2VL3A 2O8VB 1URMA 2F9SA 5IMZA 1T00A 3EE2A 3RHBA 4MLYA 3TKSC 3L9UA 1GNEA 19GSA 1M9AA 2NBSA 5A4UA 4WR5A 4KX4A 2G2QA 4LLRA 1PL2A 5EY6A 4ECCA 3U5RE 3M1GA 1FOVA 4MH2A 2LRCA 2GQKA 3LYPA 5IPHA 2KP2A 1QK8A 4ZL9A 3KEBA 2IMIA 5IOXA 2CV4A 2A2SA 3FZ4A 4XS4B 3F4TA 3P90A 4AJ7A 5IM9A 1IYIA 3HVVA 4RQRA 1XWBA 1TP9A 2QSIA 4F03A 4YQMA 4WETA 6GSYA 1TOFA 20GSA 4XHMA 3QAGA 4JR4A 3GMFA 3C7MA 4BPYA 2EIOA 5B7CA 12GSA 4G9HA 4N11A 5JWQB 1M99A 1EV4A 5CRHA 1SK0A 3WYWA 1WWJA 1YJ6A 3J7Yb 4MZBA 1GTBA 4IW9A 2ES7A 2YANA 2LJAA 1SJ6A 4DSSA 2GZYA 1PMTA 4EL1A 4J57E 4POLA 4EE0A 1AXDA 4POKA 1ACVA 4RUVA 1EEMA 2VL2C 3KGKA 4K0GA 1K0DA 3GNJA 2DJ1A 2VCVA 4ZBDA 3GURA 3D0ZA 2KHPA 2MZCA 3BCIA 4FYCA 5IQYA 4HEA2 3ZREA 3ZMKA 2LJKA 2VUPA 4OFMA 2I81A 4NAXA 2FA4A 4GRFA 4GXZA 4OO5A 1UVZA 4V1Ag 3L9VA 3GH9A 4RI7A 2VL9A 4I8BA 2ON7A 3LYKA 1FG4A 2B1LA 1JLVA 2MMAA 4HZ2A 1XFLA 1GUHA 1WRYA 5DQSA 1XWAA 3TKSE 3JCML 3FYGA 3F4RA 5DCGA 2H76A 3ERGA 1ILOA 4ZIJA 3ZVJD 3O3TA 2C1YA 4IJ3A 4GCIA 4NPBA 2H1GA 3MWHA 4ZBBA 5H5QA 1EGOA 1TW9A 2PWJA 1ZYEA 2M72A 4ZL8A 1FHEA 5IMVA 3HJOA 4XS4A 2I4AA 2CZ3A 1V2AA 4JR6A 3CBUA 1YEPA 5HFGA 3VLNA 1UA5A 1U3IA 2JZRA 4IELA 2OKAA 2C3TA 4GTUA 2B5XA 1HNBA 2H6ZA 2JSYA 1TK8B 2K6VA 2IMEA 4MMMA 4D73B 2R3XA 5CYYA 2PPTA 3I6AA 2HXKA 1W89A 5ECKB 2H0GA 2CA8A 2A2RA 4V1Ap 5LD0A 3VPTA 1ZMAA 3GFKA 5LCZA 4O5RA 2DIZA 6GSWA 3KMNA 2C0FA 3MAKA 4ILFA 3IK7A 1EV9A 2X8HA 5F05A 2LV3A 1EGRA 3ZVJA 2WB9A 2H19A 5H5RA 1XW5A 1V98A 4ECIA 2YPMA 2H1BA 4HQZA 5J4UA 1VF2A 3APOA 3A2VA 5A4WA 1GUKA 2OBKA 4GQFA 17GSA 5B8AA 2M80A 2IWTA 2OJLA 4EDYA 1BG5A 22GSA 3GRXA 3VI5A 2VIMA 2GT6A 4DSQA 3IC4A 3I43A 3DVXA 4X43A 1O7UA 4KCEA 4BL7A 2JU5A 5G5FA 1K0OA 2JZTA 2RM6A 3KD0A 2WZ9A 2GDRA 4GSSA 4K7OA 3TKRA 4V2LA 1FAAA 1XWGA 5CRDA 5ECQB 3C73A 5CO3A 3HJMA 4PQ1A 2J23A 4GWRA 2XBIA 3P2AA 4BWQA 2V41A 4PXOA 2VD0A 1AC1A 2L57A 4MZWA 3HDCA 2WCIA 2YZHA 4ID0A 4XRDA 1FVKA 3LEFA 4LA1A 3IE3A 4D73A 3CYNA 2H8LA 1GULA 2FWHA 1QXHA 2LS5A 2DMMA 5LNKe 2GS3A 3L78A 1ERWA 2B5YA 4N0VA 2CX4A 13GSA 3LFLA 2LTKA 1JZWA 3V1WA 2EC4A 3LG6A 4FO5A 3HZ8A 3DRNA 1O81A 1HYUA 1TKDB 3EU3A 2YNXA 3LSZA 3VPQA 2HYXA 1YY7A 2P0GA 1GRXA 1ERVA 3W8JA 1YF1A 2H66A 2HZEB 1OAZA 2H6YA 4KUNA 4K7NA 3ZL5A 4MJEA 4YQUA 3TKSA 4EF0A 1GH2A 2PMTA 1GSFA 3NIVA 4TN8A 4ECBA 2OBIA 3VI7A 2XC2A 6GSSA 2B5EA 2L6CA 2QKEA 1MTCA 2X99A 1U88A 1TU8A 5FHIA 2WDUA 5F06A 5HFIA 4KNDA 2FCHA 2PN8A 4HDEA 5ECMB 5J5NA 4J2FA 1AQWA 4TR4A 4MF7A 1Y6EA 2L4CA 4Q5FA 2RLIA 2YV9A 4TR3A 4F0BA 3IHQA 3E3EA 1SD9A 2H70A 1V40A 3F3RA 3GA4A 2ZCTA 3KJYA 4TR0A 4TXVA 3TUEA 4KB3A 1W4VA 3DKSA 2HI7A 2DMLA 3SWLA 2GSSA 3E9JB 1NM3A 1J08A 2GVPA 1K0MA 3FR3A 1MD4A 2P5RA 3KH7A 2IN3A 5ECOB 1VF1A 3UBLA 4K9ZA 3Q18A 4MP4A 1TXXA 3GV1A 1GSDA 2VL2A 4ISDA 3HA9A 3IRAA 2I9HA 4V2NA 3D5JA 1NHYA 3PR8A 2Z9SA 3GTUB 3US3A 3VWVA 3ERFA 2I1UA 1MDKA 2H0IA 1R4WA 2D2ZA 2DJ2A 2MYGA 4ML1A 1XW9A 2AB6A 3LJRA 4XCSA 3UOMA 4JEDA 4PNFA 2HZEA 2CVDA 1A8YA 1Z7PA 1A0RP 2GZZA 4EKZA 2HT9A 1THOA 3KCMA 5DAKB 1T4YA 2VOCA 5KN1A 3KXOA 3ZITA 3MDKA 3H93A 2H75A 3LGCA 2KP1A 2PERA 3DYRA 4G19A 4IKHA 1YEXA 4WF5A 1Y25A 1XVQA 2I3YA 4EUYA 4N10A 3IV4A 1LJRA 5G30A 4DVCA 2KUCA 4K1FA 5HR2A 1OE7A 2FA8A 2GTUA 1XIYA 3WGXA 3EINA 4CDOA 3E0UA 1SKSB 4ZB8A 5KN0A 2IPAA 1FB0A 4JBBA 4KDXA 16GSA 2EIRA 5DJLA 4KSOA 2IJYA 4ACSA 4I6XA 4BVYA 5ELGA 1C72A 2R2JA 1ZCPA 2DJKA 2KLXA 2H1AA 2FUG2 5CREA 1A24A 5AIXA 4HU7A 4TKYA 3ME8A 4XRAA 5CNWA 2F8AA 2B1KA 5ECHB 3BCKA 2FWGA 1FO5A 5ECRB 1ERTA 1RQMA 1X5DA 1B48A 2RUFA 2LNSA 2WULA 3QMXA 4WBRD 2YJ7A 2FNOA 2O7KA 4HI7A 2CX3A 2DIYA 4WF4A 3LWAA 1BEDA 1B9XC 1BJXA 1Z3EA 2HZFA 3KTLA 3LQ7A 3A2XA 1HQOA 1XPVA 1OC8A 2E2GA 4RQXA 2H1DA 4FH8A 2JL4A 3DIEA 1G0TA 5JCUA 1U6TA 4PQIA 5D8IA 3LXZA 4P3YB 5DAKA 1A0FA 1LU4A 1TRWA 1G6YA 2V1MA 1AQXA 2L4QA 3GN3A 4O7HA 4JU5A 4F0CA 1ERUA 1A2MA 2YP6A 3NZNA 2DJ3A 2WFCA 3ZYWA 4TRXA 3P7XA 3GKKA 3TRQA 4J56E 4K2DA 5DVBA 3UIWA 5D96A 4I2UA 3L4NA 1T8EB 3VURA 1TU7A 1GWCA 3VK9A 1K0AA 4HZ4A 1WE0A 5D9WA 2EIQA 5A5KA 3L9SA 3QFBC 2KOKA 1A2LA 3PH9A 1ZOFA 3TKPA 5H5SA 4IGJA 2LRTA 5ECLB 4L5OA 3H79A 5IPGA 3GL5A 3M0FA 1NHOA 1H4OA 2DBCA 4Z7XA 3HD5A 2J9HA 1SL1B 5IOWA 1WP0A 3TJJA 1XCCA 2BJXA 4BWSA 1U87A 2K9FA 3PINA 4HS1A 3CRUA 4MABA 3ZFLA 5AISA 1THXA 1I9DA 1S3DA 3DXBA 5HR0A 1SENA 3D21A 1Z6NA 5ELAA 2MBSA 1K3YA 3FW2A 1AAZA 2V32A 1B4QA 4OCEA 3IXRA 2C8UA 4I2TA 5CRGA 3RPPA 4EO3A 1J9BA 2JZSA 5AGYA 2H01A 3EVIA 2HRNA 1ABAA 1XBSA 4ZILA 3GSTA 5HQPA 2CAQA 1BAYA 3KP8A 1I5GA 4MZCA 1VRSD 3O76A 3TGZA 3QFAC 4LL4B 1TI1A 3FHKA 1DSBA 1N2AA 4ULXA 2PGTA 1Q98A 4PQHA 1VGLA 2V6OA 1PSQA 2YZUA 5ENUA 1SJIA 2RIIA 1KBNA 2PBJA 1XXUA 2HE3A 3GH6A 5DDLA 1GLQA 1K3OA 3KP9A 2XPEA 1MDIA 3KMOA 5D9VA 4CHSA 4HU9A 1A8LA 1XOAA 4TOPA 4V2MA 4O92A 3CSHA 4XTSA 2A4VA 1S3AA 3IDVA 3EC3A 1OC9B 4WR4A 1SKWB 4YAVA 1EOHA 2H6XA 3EMPA 1ON4A 2E0QA 3EMXA 2TIRA 3BJ5A 4X1UA 1V58A 4YAPA 2H30A 3F0IA 1JHBA 1XW6A 4X0XA 2ON5A 3QCPA 1XOBA 5IIZA 1PQNA 1KNGA 1S3CA 3VWXA 5F0GA 2VM1A 1GTIA 3I9V2 3TOUA 1SL2B 2TRCP 1GL8A 2GSQA 4L8EA 1GNWA 3HXSA 1OVNA 4TVEA 1TTZA 3UAPA 1WJKA 4NHZA 1OKDA 4MPGA 5J9CA 2LJRA 2BTOT 2VLUA 4OFNA 3HVSA 1X0RA 3H1NA 3QOUA 1PA3A 2L59A 3CXGA 5AN1A 2YWMA 3ISOA 3GX8A 5ID2B 3TJFA 4PX1A 2VLVA 2N5FA 2K8VA 2MBTA 1GSSA 2PVOC 5GAPD 1OE8A 1EEJA 1PD21 1TDIA 4LMVA 3C8EA 3CTFA 2F3MA 1SYRA 3TDGA 1SJZA 2DC5A 2PUKC 2RM5A 3WD6A 2HFDA 1F9MA 5F07A 3BBYA 1GSQA 1M0UA 3KTBA 1ZYQB 4LL1B 3D6IA 2CZ2A 2AYTA 3D4MA 5ECPB 3WGDA 1M2AA 3Q74A 3ZTLA 1OC9A 1ZL9A 3DGQA 2X64A 2LKUA 2OE3A 3A3TA 4JZQA 1TRVA 4KSMA 4N30A 3ZRDA 1B4PA 2L6DA 3FZ9A 3J7Yk 1O85A 2YWOA 3TOTA 2NVLA 1G7OA 4RI6A 1T3BA 2QC7A 3L0HA 4HUAA 4MPFA 5G5EA 2O89A 6GSVA 2HNLA 1JZRA 2PVQA 3M9KA 1F6MC 3M3MA 2WRTA 4IJIA 4ZXGA 5CP1A 3FRCA 2IMFA 4WKWA 1SL0B 4KE3A 1ZZYA 5JWRB 5E59A 5J41A 2K8SA 5D93A 1WIKA 1FW1A 3CMIA 3KIJA 5HR1A 2GQMA 1SK1A 1Z7RA 2B7KA 1M7TA 4MA9A 4TW5A 4MF5A 1SK2A 2VCTA 3GKNA 3IA1A 1CQGA 4K6XA 3IPZA 4MF6A 3RAZA 1E2YA 2AHEA 2VAFA 1EP7A 3FY7A 4FYUA 2FWFA 4IVFA 2H0HA 5IO2A 5ID2A 2N5AA 4AF2A 1G6WA 2B6MA 2VCQA 3QD9A 4K8MA 2IMDA 3H4KA 2VCZA 2VD1A 1B9YC 2GQLA 3GIXA 1K0CA 4BA7A 1O6JA 1VF3A 1A2JA 5D9TA 1YKAA 4NHWA 1SYXA 3ZZXA 3HY2A 14GSA 2YJHA 3GSSA 2K18A 1KEBA 1QFNA 2QGVA 4KH7A 1X9SB 5A4VA 4DEJA 3C1SA 3F63A 3HJPA 4GLTA 1YKCA 4Q5QA 4FYBA 2AJQB 1A23A 2LEGA 5ABRA 5G31A 1PX6A 3UJ1A 2P5QA 4PUFC 1QGVA 5FWGA 3LXTA 1K0BA 5EPFA 1PN9A 1K0NA 1Z9HA 4YQVA 4ECJA 1TJDA 1X5EA 2CVKA 3UL3A 4MDCA 4N0ZA 1JLWA 2G0FA 4POBA 5D73A 18GSA 1TRSA 4KW6A 4L5LA 3UBKA 1SKRB 4PNGA 1G7EA 4O32A 3GTUA 3FEUA 3F6FA 5E4WA 1Q4JA 3W6GA 2NDOA 4PUAA 4KGIA 3I69A 5GZZB 3DVWA 4NMUA 4DSRA 2C0EA 3M9JA 2IFQB 2CT6A 3GUSA 4I5QA 1USBA 4XS1A 1R5AA 4QL7A 8GSSA 1DBYA 2LQOA 5JCGA 5G2ZA 4OFTA 2E2MA 3MSZA 5G1KA 3HKRA 4MK3A 5COHA 3WT1A 1PX7A 1SD8A 3RHCA 3TJKA 3GYKA 3QAWA 3G7JA 4AJ6A 2OADA 3ZIVA 2MMNA 1XVWA 5J9BA 5KN3A 1X9WB 3ED3A 2X8CA 4L0UA 5DBQA 3HVXA 2FLSA 2OE1A 3DMLA 1GTUA 4IN0A 4OCFA 2R37A 2GSRA 3EURA 2VLTA 4OWYA 1EOGA 9GSSA 3CTGA 3EWLA 3GKXA 5DCHA 1CQHA 6GSXA 5CRWA 5C00A 5JCWA 4OMVA 2VO4A 1K3LA 3FK8A 2LSTA 3IAM2 2YCDA 2C4JA 2YOIA 4JE1A 3SBCA 2F51A 4IQ1A 2JADA 1NW2A 2X8GA 1O8WA 2V2GA 5ECSA 1PGTA 1LBKA 4MJCA 5GAND 3TJGA 4GSTA 4Q5NA 4OD7A 3UARA 2ALBA 4EC0A 2R6KA 3TB2A 1IYHA 1Z6MA 3TRPA 3F3QA 4HJMA 1QMVA 2R5GA 2LNTA 4E8EA 1AUCA 1XWCA 1O8XA 4KAEA 5B8BA 4F2IA 2IFQA 1T4ZA 4QL9A 2FGXA 2B3SA 2YV7A 3ZLPA 1MEKA 1MD3A 4MJBA 3M8NA 1X5CA 1GTAA 5AIVA 3BOAA 1EZKA 3UEMA 2DJJA 2FY6A 2RUEA 4XIHA 3K8NA 4F82A 1AW9A 4MCUA 2DJ0A 2HSYA 4KCAA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite